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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003672 | Chr6 | 25819606 | 25826849 | - | CRC domain-containing protein TSO1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003672.m1 | 336 | 371 | PF03638.18 | TCR | Domain | 45.7 | 6.60E-12 |
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>LITCHI003672.m1 ATGGACACTCCTGACAAGACCCACGTCGCTGCCACTTCTTCTCTCTCCAAATTTGAGGAT TCTCCGGTTTTCAATTACATCAACAGTCTTTCGCCCATTGAACCAGTTAAGTTTGGACAG GCAGATCGTTCATTTAACTCGCCGACTTTTGCTTCCCCTTCGTCTCTGTTTGCTTCACCG CAGATCGTTTCACTTAGGGAATCTAGACTTAAAAGTAATCTGTCTCCAGATCCATTGAAG CCCGAGCTCCCTCTCTTTAGAAGTGGGAACAAGGCGAGTAAAGTGGATTTAGAAACTGTT CGAGTATCCGATCAGTGCGCTGAACAACTGGGAGGACTTAGTTCGAGAAGTGCAACTAGA CAGTTCACTGCTGAGATACCAAATGAACCCTTGGGCAAATATGATTGTGGAAGCCTGGCC AGGAATTGGGTGTCTTCTGAATCGATAGAAAAAAGCAGGGTGCTGGAAGGGGCTGGTTTA CAATCATCATTTGCTCAATCCAGTAAGGTCAACTGGAGAGAAAGACAACATTTCAAGAAT GAAGTAAATTTGCGGAATATCTGTCGAATTGAGCAAACTGAAGAAGCAGCAGGATGCAAC TGGGTCTCATTGATTTCTGATGCTGCTGATCTAAATGCTAATTCTTCCGTTGTTGAGAAT AATTCTGGGGAGCAGGATCAGGAGACAGTAGATCCTGGGACAATAAATTTTGTCTCAACA GTCCTACAGCTACCACAAGATAATGGCAATGATTTAGTGAACATGGCATCTATTGGTCCT AGTGGCTCTTGCAAACTAAGTGAAATAAGAGAAACTGCAACTGAATCAGGAGAAATTGGG GACTTGCAAGATAAGGATCAGGCACATGATATCCTTTCTAGCAGTCTACAGGATAAGCTA GTTGTTAGTGATGCAAGAGCAAAAGTGGGTGAGAAGGGAGAAAAGTGTGGCCAATCTAGC TGCAAGGATGAAACCAACAAGACTCCTGCTTCAGCCAGGCATAAGAGAGGATGCAACTGT AGAAAATCAAGCTGCTTGAAAAAATACTGTGAATGCTTTCAGGGTGGCGTCGGATGCTCT GTAAGCTGCAGATGCGAAGGATGTCAAAATGCTTTTGGAAGAAAGGATGGATTTGAAGAA ATCGAATACAAGGGTGAAGAATCAGAAGCCTGTGAAAAGAATGAATCATCAGACACAATC AAGAAGGATGAAGATGAACATCCAGATGTTCCGTTAATACGTCCTTCTATCATTGCCAGG CCCTCAAGGGGAAAGCGCTTAGGACCTTCTCTTCTTGATGTCAGCCCTTATCCTAGGTCG TGTATCGTCCTAAAACCAAAAACCTCTGATATCTCCAATCAGCCCAACTCTCAGACACAG CTTCTGGTGATTCCAGAAGACGAAACTCCCAAGAATCTCAAAAGCATTTCCTCACCAACT AACGGTGTGAGACCAACCTCTCCAAACTCCAAGAGGTTGTCACCTCCTCACGACATCAGA TCATCGACAACCAAGTACAGCAGCAGGAAGTTGATTGTGAGATCTATCCGTCCGTTCCCG TCTGTCACGCCACTTCAAGAGCAGTGA
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>LITCHI003672.m1 ACGAGCAACAAAATTGCAGACAAAAACAAAATCTCTCTGAATCGCTGATCATCATCCAAA CATTGTTATCAACCACTACTTTATGAGCGATCTTGGTCCCCCAAGTGAAATCTTGGACCT CATAGACATGCACGATCTGATCATCTTCAACCTTCTATCTTCTTCGATTCGTCGTTTGAA ATCTTTGTTGTATTCTTTCCTATCAGCAATACTAGATACAACATCAAGCAAAGTTTCCTT CAGCCCCACTTGATTAGAACTAGTATCCACATTCGATTTCAAAGCTTCTTTCGAGTCCTT GATTGGTGCTTGTATTGGCTCATGATTGTGATTATCATCGACAGTAGAAAACAAGAAAGA GTAGTCCCTTGCATACTTGATTTTCTCTATTTTGTCTCTCCAAGCTGCTTCTGGGATGGC AATTCTTCTTCCCTTCTTGGTAATTATTTTGCTCTTCTTCCATTTCCGTTCACTTCTCCG TTTCCTTGGCACGTAAAGAATACCTTCCGTGGTCGTCTGATGGTCTCTCCGTGTCTCATC ATCTCTCCTGAGGGCTGCAGTGGAACTTAGAGTTGGTGCGTGTCACGACTCCCTTGCCCA CTTCTAAAGAGTATGTGGCAGTTGGCAGGTTCGAGCTCTAGAGGTCTCTAGCTTGTGAGA CAATTTTCCCACTTATCATGTGAGTTGACCTTTCTTGTTCTAAGAGTAATAATCTGGGCC GCACGCTAAAGTCCCATGCTAGGTAGGTTATAGTAGTTATCCGACATATAATTGGAGGGT AAAAAGAAGAGTAAAAATCCAATTTAGGTTCTAAGCCCATTTAATTGTTTTCAAGGCCCA TTAACTCTGCTCCGAGGCCCATCAACGCAAAAGCAAAAACATTTTCCCGCCATGGTGTCT CTCTATCAAAATAAACAAAAGTCTACTTGTTTAGAAGAATGTGAAGTTGTGGTGGGGCTT GACAGAAGAAGACATACTACTCACTCTCTTGGAGGAGCAGGAGCTGCTCTCACTACTCAG GCATGGACACTCCTGACAAGACCCACGTCGCTGCCACTTCTTCTCTCTCCAAATTTGAGG ATTCTCCGGTTTTCAATTACATCAACAGTCTTTCGCCCATTGAACCAGTTAAGTTTGGAC AGGCAGATCGTTCATTTAACTCGCCGACTTTTGCTTCCCCTTCGTCTCTGTTTGCTTCAC CGCAGATCGTTTCACTTAGGGAATCTAGACTTAAAAGTAATCTGTCTCCAGATCCATTGA AGCCCGAGCTCCCTCTCTTTAGAAGTGGGAACAAGGCGAGTAAAGTGGATTTAGAAACTG TTCGAGTATCCGATCAGTGCGCTGAACAACTGGGAGGACTTAGTTCGAGAAGTGCAACTA GACAGTTCACTGCTGAGATACCAAATGAACCCTTGGGCAAATATGATTGTGGAAGCCTGG CCAGGAATTGGGTGTCTTCTGAATCGATAGAAAAAAGCAGGGTGCTGGAAGGGGCTGGTT TACAATCATCATTTGCTCAATCCAGTAAGGTCAACTGGAGAGAAAGACAACATTTCAAGA ATGAAGTAAATTTGCGGAATATCTGTCGAATTGAGCAAACTGAAGAAGCAGCAGGATGCA ACTGGGTCTCATTGATTTCTGATGCTGCTGATCTAAATGCTAATTCTTCCGTTGTTGAGA ATAATTCTGGGGAGCAGGATCAGGAGACAGTAGATCCTGGGACAATAAATTTTGTCTCAA CAGTCCTACAGCTACCACAAGATAATGGCAATGATTTAGTGAACATGGCATCTATTGGTC CTAGTGGCTCTTGCAAACTAAGTGAAATAAGAGAAACTGCAACTGAATCAGGAGAAATTG GGGACTTGCAAGATAAGGATCAGGCACATGATATCCTTTCTAGCAGTCTACAGGATAAGC TAGTTGTTAGTGATGCAAGAGCAAAAGTGGGTGAGAAGGGAGAAAAGTGTGGCCAATCTA GCTGCAAGGATGAAACCAACAAGACTCCTGCTTCAGCCAGGCATAAGAGAGGATGCAACT GTAGAAAATCAAGCTGCTTGAAAAAATACTGTGAATGCTTTCAGGGTGGCGTCGGATGCT CTGTAAGCTGCAGATGCGAAGGATGTCAAAATGCTTTTGGAAGAAAGGATGGATTTGAAG AAATCGAATACAAGGGTGAAGAATCAGAAGCCTGTGAAAAGAATGAATCATCAGACACAA TCAAGAAGGATGAAGATGAACATCCAGATGTTCCGTTAATACGTCCTTCTATCATTGCCA GGCCCTCAAGGGGAAAGCGCTTAGGACCTTCTCTTCTTGATGTCAGCCCTTATCCTAGGT CGTGTATCGTCCTAAAACCAAAAACCTCTGATATCTCCAATCAGCCCAACTCTCAGACAC AGCTTCTGGTGATTCCAGAAGACGAAACTCCCAAGAATCTCAAAAGCATTTCCTCACCAA CTAACGGTGTGAGACCAACCTCTCCAAACTCCAAGAGGTTGTCACCTCCTCACGACATCA GATCATCGACAACCAAGTACAGCAGCAGGAAGTTGATTGTGAGATCTATCCGTCCGTTCC CGTCTGTCACGCCACTTCAAGAGCAGTGATTTTCAGGAGGAGAAGCTTTAGTGCAATACT GAAAGATTATAACATGTACTATCGTCCTGCTTGTCTATTAGAAGTCTAATGTATAAAGCC ATAATATGCATGCAGTGCTGGTAAAACATGATATCTTTGGGTCTCCCAACCCCAAAGTTG TGAAGAAGTCCATAAAAGCACAAATGTGTATCTTATTATGTCTTCTGTTTGTACAAGTCG AAGGAAATCATGTGATTTTAGTATTATTTTTTGACAATATGCTGTCTCTCACAGATTTAT TGATCTGTAAGAATTCCCAACTCGTCCCTCATTAAAATCGTTTTCTTCCCAAAACTGTAC ACAAATTCGAGCAGAGTCCATCATGAAAGTAGATACATATGTTGTTTCCGTGGATGCAAC AAGGGTCCAAACGTAGAAACGTATTGTCTATGTACTCACATTTTGG
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>LITCHI003672.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTGATCATCATCCAAACATTGTTATCAACCACTACTTTATGAGCGATCTTGGTCCCCCAA GTGAAATCTTGGACCTCATAGACATGCACGATCTGATCATCTTCAACCTTCTATCTTCTT CGATTCGTCGTTTGAAATCTTTGTTGTATTCTTTCCTATCAGCAATACTAGATACAACAT CAAGCAAAGTTTCCTTCAGCCCCACTTGATTAGAACTAGTATCCACATTCGATTTCAAAG CTTCTTTCGAGTCCTTGATTGGTGCTTGTATTGGCTCATGATTGTGATTATCATCGACAG TAGAAAACAAGAAAGAGTAGTCCCTTGCATACTTGATTTTCTCTATTTTGTCTCTCCAAG CTGCTTCTGGGATGGCAATTCTTCTTCCCTTCTTGGTAATTATTTTGCTCTTCTTCCATT TCCGTTCACTTCTCCGTTTCCTTGGCACGTAAAGAATACCTTCCGTGGTCGTCTGATGGT CTCTCCGTGTCTCATCATCTCTCCTGAGGGCTGCAGGTATCTTTATTACGATTTTGAAAA CCATTGTTGGGGCACTGTGTTTACTTCCAGGGCAAGTTAACAAAGATTGTGTTGTCTGTA CAAACAATAACGATAACGTTGTTTGCACATAAAAGTATGACAACATTGAGTGTCTATATA TAATAAAACGTTGATTAAGTTTCCTAATTTGGATGGGATTGTTTTCTTTTCCTAGTCAAA CTCCAATTGATGTCAAAAATCCATTTAGATTTCACTCGAGATATAAGGTAACTTTATGAT ATCCTAAATTACATAAAAATCCACTAAATTTTATGGCAGTAGGATTGTATGAAATCATCA AAATCCACCACATTTTAAAGACAATATAATTGTATGAAATCGTAAAACTCATTTTTATAA TCAAATGATTGAATGAAATTGTAAAAATCCGCTTAAATTTATGAGCGAATGATTACATAT TGATTTTTGGTCAAAATTAAGTGAGTTATATTATTATTATTATTAGGAGAATTCTCTTTA ATTAATAAGCTAGGTCTATCAAATTATTAATTAATTGATTTTGCTTATTGTATTTGTTTC CTAAGTGGTGGCATAATCCAAAACCATATGATTTTCATCACTTTTATGTCAATTTCAGTT ATTATTATTATTTTTTTATCAAATTATTAATGAATTGGTCTGCTGGTTTATTACATTTCT TTCCTACTTAGATAACTACTAAATAATTTTTAAAACCACACGATTCATTTCAATTTCGAT CAAACTTAATAGAAAATTCTTTTGTTCATTTCGAAAATACCCTGTAATTAACAAGACATG TTTATTACAAAATTAATCGATCAATCCAGTTCATAAACTTGTTTCCTAATTTATTTACAA CTAATATGATTTCCAAAATAATATTGATTGTACTTCCATTTCATTTTATTAAAGTTTTAT CTCCAATTAATAACTTAGGCTTTTATTAAATTAGTTTCCTAATATGATTATGACTAATAT AATTTCAAATATTGTCTAAAACAAAATTCCAAATTAAGTGGAACTTAGAGTTGGTGCGTG TCACGACTCCCTTGCCCACTTCTAAAGAGTATGTGGCAGTTGGCAGGTTCGAGCTCTAGA GGTCTCTAGCTTGTGAGACAATTTTCCCACTTATCATGTGAGTTGACCTTTCTTGTTCTA AGAGTAATAATCTGGGCCGCACGCTAAAGTCCCATGCTAGGTAGGTTATAGTAGTTATCC GACATATAATTGGAGGGTAAAAAGAAGAGTAAAAATCCAATTTAGGTTCTAAGCCCATTT AATTGTTTTCAAGGCCCATTAACTCTGCTCCGAGGCCCATCAACGCAAAAGCAAAAACAT TTTCCCGCCATGGTGTCTCTCTATCAAAATAAACAAAAGTCTACTTGTTTAGAAGAATGT GAAGTTGTGGTGGGGCTTGACAGAAGAAGACATACTACTCACTCTCTTGGAGGAGCAGGA GCTGCTCTCACTACTCAGGC
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>LITCHI003672.m1 GenomeSequence - ACGAGCAACAAAATTGCAGACAAAAACAAAATCTCTCTGAATCGCTGATCATCATCCAAA CATTGTTATCAACCACTACTTTATGAGCGATCTTGGTCCCCCAAGTGAAATCTTGGACCT CATAGACATGCACGATCTGATCATCTTCAACCTTCTATCTTCTTCGATTCGTCGTTTGAA ATCTTTGTTGTATTCTTTCCTATCAGCAATACTAGATACAACATCAAGCAAAGTTTCCTT CAGCCCCACTTGATTAGAACTAGTATCCACATTCGATTTCAAAGCTTCTTTCGAGTCCTT GATTGGTGCTTGTATTGGCTCATGATTGTGATTATCATCGACAGTAGAAAACAAGAAAGA GTAGTCCCTTGCATACTTGATTTTCTCTATTTTGTCTCTCCAAGCTGCTTCTGGGATGGC AATTCTTCTTCCCTTCTTGGTAATTATTTTGCTCTTCTTCCATTTCCGTTCACTTCTCCG TTTCCTTGGCACGTAAAGAATACCTTCCGTGGTCGTCTGATGGTCTCTCCGTGTCTCATC ATCTCTCCTGAGGGCTGCAGGTATCTTTATTACGATTTTGAAAACCATTGTTGGGGCACT GTGTTTACTTCCAGGGCAAGTTAACAAAGATTGTGTTGTCTGTACAAACAATAACGATAA CGTTGTTTGCACATAAAAGTATGACAACATTGAGTGTCTATATATAATAAAACGTTGATT AAGTTTCCTAATTTGGATGGGATTGTTTTCTTTTCCTAGTCAAACTCCAATTGATGTCAA AAATCCATTTAGATTTCACTCGAGATATAAGGTAACTTTATGATATCCTAAATTACATAA AAATCCACTAAATTTTATGGCAGTAGGATTGTATGAAATCATCAAAATCCACCACATTTT 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