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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003661 | Chr6 | 25742083 | 25749387 | + | Serine/threonine-protein kinase Nek1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003661.m1 | 2 | 206 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 171.5 | 2.40E-50 |
LITCHI003661.m1 | 2 | 203 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 112.9 | 1.60E-32 |
LITCHI003661.m1 | 39 | 193 | PF14531.9 | Kinase-like | Family | 25.5 | 7.90E-06 |
LITCHI003661.m2 | 2 | 143 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 134.3 | 5.30E-39 |
LITCHI003661.m2 | 2 | 140 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 82.3 | 3.60E-23 |
LITCHI003661.m3 | 4 | 257 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 215.6 | 8.40E-64 |
LITCHI003661.m3 | 6 | 254 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 134.8 | 3.50E-39 |
LITCHI003661.m3 | 90 | 244 | PF14531.9 | Kinase-like | Family | 25.4 | 8.60E-06 |
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>LITCHI003661.m1 ATGGAGCTCATTTCAAGAATACGAAATCCATTTATTGTGGAATACAAAGATTCTTGGGTA GAGAAGGGTTGTTATGTATGCATAATTATAGGTTATTGTGAAGGAGGAGACATGGCAGAA GCTATAAAGAAAGCCAATAGCACTCTCTTTGCTGAAGAGAAACTCTGTAAATGGCTTGTT CAGCTACTGATGGCACTTGACTACTTGCATGCAAATCATATTCTTCATCGTGATGTCAAG TGTTCTAATATCTTCTTGACAAAAGATCATGACATTCGCCTAGGTGATTTTGGGCTTGCC AAAATTTTGACTTCTCATGATCTTGCTTCCTCCGTTGTGGGAACTCCCAGCTACATGTGT CCTGAGCTTCTTGCTGACATACCTTATGGTTCAAAGTCAGATATATGGTCTTTAGGATGC TGTATATATGAAATGACTTCACTTAAGCCTGCCTTTAAAGCGTTTGATATGCAAGCACTC ATAAACAAAATAAATAAATCAATAGTGGCTCCGCTTCCAACAAAATATTCTGGTGCTTTT CGAGGGCTTGTTAAAAGCATGCTGCGGAAAAATCCAGAACTTAGGCCAAGTGCTGCAGAA CTTCTTAGGCACCCGCATCTTCAGCCTTACGTTCTAAAAGTTTATCTGAAAATCAATAGC CCTCGGCGCAATTCTTTACCAGTCCATTGGCCTGAATCCAATTACATAAGGAAAACAAGA TTTTCAGAGCCAGATGATGTTCCCATCCCTTATAGGCAGAAGCGACACTCTTTCAGCAAT GACAGAAATTTGAATCCAAGTATATCAGGAGCTGACCAAGATTCTGTGTGTTCTACTAAA GGAATACATAGTAACCCAGGTTATTTGAGTCGAAAGCTATCAGCATTGTCAATAGATAGC AGCGATCAAGGAACCGTTATCTGTAAGCCTATTGCTTCAAAAACTGCAAATGTTGCCAAG 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CTTGCTGACATACCTTATGGTTCAAAGTCAGATATATGGTCTTTAGGATGCTGTATATAT GAAATGACTTCACTTAAGCCTGCCTTTAAAGCGTTTGATATGCAAGCACTCATAAACAAA ATAAATAAATCAATAGTGGCTCCGCTTCCAACAAAATATTCTGGTGCTTTTCGAGGGCTT GTTAAAAGCATGCTGCGGAAAAATCCAGAACTTAGGCCAAGTGCTGCAGAACTTCTTAGG CACCCGCATCTTCAGCCTTACGTTCTAAAAGTTTATCTGAAAATCAATAGCCCTCGGCGC AATTCTTTACCAGTCCATTGGCCTGAATCCAATTACATAAGGAAAACAAGATTTTCAGAG CCAGATGATGTTCCCATCCCTTATAGGCAGAAGCGACACTCTTTCAGCAATGACAGAAAT TTGAATCCAAGTATATCAGGAGCTGACCAAGATTCTGTGTGTTCTACTAAAGGAATACAT AGTAACCCAGGTTATTTGAGTCGAAAGCTATCAGCATTGTCAATAGATAGCAGCGATCAA GGAACCGTTATCTGTAAGCCTATTGCTTCAAAAACTGCAAATGTTGCCAAGACTTCAAAA CTTACTCCACTAAAAACTGCTGCTACTCATAGGAGACAGACAGATGCTGTGAAAAATCAT GAATATCATCCTACGTCACACACTCCAATAAAAAAAGCTGTCACGGCAACTCGCAGAGCA TCTTTGCCATTGCCGAAAAAAGCTGCAGTTCAGAACTCCCCTTGCAAGCCTAATATTGGT ATCCTTCACCATGTAAAATCTCCAGATGTTTCTGTTAATGAGCCTCGAATTGACAAAATA GCAGAATTCCCATTAGCTTCATACGAGGATGCTTTCTTTCCAATTTGTAAAAATTCACCA ACCTCAGCAAAAGGCTCATCTAGCTCACCACGATATGGTGATCGTTCGATCACAAAAGAC AAGTGTACAGTTCAGATATTCGATAAAGCCTCTGCCAATCCCACATTTACTGATGCATGG CAGGGAATTCAATGTAGCATGTTTCAGGTGAATGAAGGGGATGGAAGCAACTTGTCTGAT CAAAATGCAACTGCAGGGGCGTCAAGCCACACCTCATCAGACACAAGACGTCGCAGGTTT GATCCCTCATCATACCAGCAGCGGGCCGAAGCTTTGGAAGGGTTGCTTGAATTTAGTGCA AAATTGCTGCAACAGGAAAGGTATGATGAGCTTGGAGTGCTACTAAAGCCATTTGGACCC GGAAAAGTTTCACCAAGAGAAACTGCAATCTGGTTGACTAAGAGCTTCAAGGAGAACACT GCTAAGCAAGAAGATTGA >LITCHI003661.m3 ATGGAGCAGTATGAAATATTGGAGCAAATTGGGAAGGGATCTTTCGGTTCAGCTCTTCTC GTGAGGCATAAACATGAAAAGAAGAGGTATGTGTTGAAAAAAATACGTCTTGCCCGCCAA ACTGATAGGTCGCGGAGATCTGCACATCAGGAGATGGAGCTCATTTCAAGAATACGAAAT CCATTTATTGTGGAATACAAAGATTCTTGGGTAGAGAAGGGTTGTTATGTATGCATAATT ATAGGTTATTGTGAAGGAGGAGACATGGCAGAAGCTATAAAGAAAGCCAATAGCACTCTC TTTGCTGAAGAGAAACTCTGTAAATGGCTTGTTCAGCTACTGATGGCACTTGACTACTTG CATGCAAATCATATTCTTCATCGTGATGTCAAGTGTTCTAATATCTTCTTGACAAAAGAT CATGACATTCGCCTAGGTGATTTTGGGCTTGCCAAAATTTTGACTTCTCATGATCTTGCT TCCTCCGTTGTGGGAACTCCCAGCTACATGTGTCCTGAGCTTCTTGCTGACATACCTTAT 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>LITCHI003661.m1 MELISRIRNPFIVEYKDSWVEKGCYVCIIIGYCEGGDMAEAIKKANSTLFAEEKLCKWLV QLLMALDYLHANHILHRDVKCSNIFLTKDHDIRLGDFGLAKILTSHDLASSVVGTPSYMC PELLADIPYGSKSDIWSLGCCIYEMTSLKPAFKAFDMQALINKINKSIVAPLPTKYSGAF RGLVKSMLRKNPELRPSAAELLRHPHLQPYVLKVYLKINSPRRNSLPVHWPESNYIRKTR FSEPDDVPIPYRQKRHSFSNDRNLNPSISGADQDSVCSTKGIHSNPGYLSRKLSALSIDS SDQGTVICKPIASKTANVAKTSKLTPLKTAATHRRQTDAVKNHEYHPTSHTPIKKAVTAT RRASLPLPKKAAVQNSPCKPNIGILHHVKSPDVSVNEPRIDKIAEFPLASYEDAFFPICK NSPTSAKGSSSSPRYGDRSITKDKCTVQIFDKASANPTFTDAWQGIQCSMFQVNEGDGSN LSDQNATAGASSHTSSDTRRRRFDPSSYQQRAEALEGLLEFSAKLLQQERYDELGVLLKP FGPGKVSPRETAIWLTKSFKENTAKQED. >LITCHI003661.m2 MALDYLHANHILHRDVKCSNIFLTKDHDIRLGDFGLAKILTSHDLASSVVGTPSYMCPEL LADIPYGSKSDIWSLGCCIYEMTSLKPAFKAFDMQALINKINKSIVAPLPTKYSGAFRGL VKSMLRKNPELRPSAAELLRHPHLQPYVLKVYLKINSPRRNSLPVHWPESNYIRKTRFSE PDDVPIPYRQKRHSFSNDRNLNPSISGADQDSVCSTKGIHSNPGYLSRKLSALSIDSSDQ GTVICKPIASKTANVAKTSKLTPLKTAATHRRQTDAVKNHEYHPTSHTPIKKAVTATRRA SLPLPKKAAVQNSPCKPNIGILHHVKSPDVSVNEPRIDKIAEFPLASYEDAFFPICKNSP TSAKGSSSSPRYGDRSITKDKCTVQIFDKASANPTFTDAWQGIQCSMFQVNEGDGSNLSD QNATAGASSHTSSDTRRRRFDPSSYQQRAEALEGLLEFSAKLLQQERYDELGVLLKPFGP GKVSPRETAIWLTKSFKENTAKQED. >LITCHI003661.m3 MEQYEILEQIGKGSFGSALLVRHKHEKKRYVLKKIRLARQTDRSRRSAHQEMELISRIRN PFIVEYKDSWVEKGCYVCIIIGYCEGGDMAEAIKKANSTLFAEEKLCKWLVQLLMALDYL HANHILHRDVKCSNIFLTKDHDIRLGDFGLAKILTSHDLASSVVGTPSYMCPELLADIPY GSKSDIWSLGCCIYEMTSLKPAFKAFDMQALINKINKSIVAPLPTKYSGAFRGLVKSMLR KNPELRPSAAELLRHPHLQPYVLKVYLKINSPRRNSLPVHWPESNYIRKTRFSEPDDVPI PYRQKRHSFSNDRNLNPSISGADQDSVCSTKGIHSNPGYLSRKLSALSIDSSDQGTVICK PIASKTANVAKTSKLTPLKTAATHRRQTDAVKNHEYHPTSHTPIKKAVTATRRASLPLPK KAAVQNSPCKPNIGILHHVKSPDVSVNEPRIDKIAEFPLASYEDAFFPICKNSPTSAKGS SSSPRYGDRSITKDKCTVQIFDKASANPTFTDAWQGIQCSMFQVNEGDGSNLSDQNATAG ASSHTSSDTRRRRFDPSSYQQRAEALEGLLEFSAKLLQQERYDELGVLLKPFGPGKVSPR ETAIWLTKSFKENTAKQED.
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>LITCHI003661.m1 AGTCTATCTCATCAAATACATGATCCCATTTTCTCTTCAAACACATAAATGTTTCCTTTT TGTTTACCTCTCCCTGCATAATTAACCACCATAATTAAATCACCAAGTCCGAAATCCAAT CTAGCCTTTGTTTCTTCCTCCAACACTTCGTAATAAATAAAAAAACATATCCACCTTCCC ATCCCACTCCACACCCCCACACTCCCCCACACAAAAACATAAACAAACCACTTCCCCTCT CTCTCTCCATTCACTTGAAAATCTTTTCCTCTCTTGTTTAGAAATCAAAAACATTCATTT TGTTTTTGTTTTTTTTTACTTAAAAAGAGTGGTCCAATCCGGTCTCTCCCACAAAGTTTG TCAGTTTCTTCTTCCCCTCTGAAGCAAAAAAAAATAAAAAACAGTTATCACCAATGGAGA AGCAGCTCCAGCTGCCACACCACCACCTCCCTCTTCCGCTGCTTCTTCTGCCAACAAAAC GGTGCGTCGTTTTGTAGTCTCTCCCCCCTCTCTCTCTCTGTGCAAAATGTGGATGTCGTC TGCGTGATCTATCCATCTATCTCTCCTTGGATCGCTCTCGCTCTGTCAGGAAAGGGTTTA AATTCGACCTCTCACATGGAGCAGTATGAAATATTGGAGCAAATTGGGAAGGGATCTTTC GGTTCAGCTCTTCTCGTGAGGCATAAACATGAAAAGAAGAGGTAAGAATAATGTGTAAAA TGGCTTCTGTTTACTTATTGTTTTGTTGCTTTGGAGGATTTTGTGATGAGAATGATAGTT TAGTACAATGTTGTGATTTTCTTTCGATTTTGCTCTCTTGTGTTGTTTCTGTTTGTGCGT TTAAGGTATGTGTTGAAAAAAATACGTCTTGCCCGCCAAACTGATAGGTCGCGGAGATCT GCACATCAGGAGATGGAGCTCATTTCAAGAATACGAAATCCATTTATTGTGGAATACAAA 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