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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003556 | Chr6 | 24452504 | 24458825 | + | Protein PHR1-LIKE 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003556.m1 | 255 | 306 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 36.9 | 3.40E-09 |
LITCHI003556.m1 | 338 | 385 | PF14379.9 | Myb_CC_LHEQLE | Family | 77 | 7.40E-22 |
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>LITCHI003556.m1 ATGACGATATCGAGCAAGCACCCTGTGTCATCTGTTCAGGGATCAGGCACAAAGCAGTTA AGTACCTTGGGGGTGTCTGTCGCTATGTCTTCATCTTTTTCAGCTCTCTCTACACCTCTT GAAGAAAAGTATCCCAAATTGCCTGAAAGGGATCTTATGACAATCCCCATCAACCCATAT ACGTGTCCATCGGCTCCCACCTGTCTCTCTGTTGGGCACATGTTTTCAACACCTTCTGGA GTCCCAAATAATGTGTTTATTTCTTCTGTTTCACCTCAGGACAGGCATTCCCGAAATTCT CCATTCATTTCTGAGTCGCTAAGAGATAGAGTGCCATTGTCACCAGCACAATTTTCCCCC TCAGAAGTACGTTCTACAGGATCCATTAATCATCCTGGGGAAAGTAAGGATATATCTTGT TGTGTTGATCCATTTCAGGGATTTCTTGATTACCCTGAAAACATCCCTGGTCAGACTGGT CTGTCGCAAAGCAATACTGGTGATACCACATTTGACGATCATGCTAAGGGAAGCGAGTGG CAGAAGTGGGCAGAACAATTAATCTCTGTTGATGATGGGCTGGACCCAAATTGGAGTGAG ATTCTTGCTGATGTTAATGAAGCAGATGCCAGATCAGAGGTGCTAAAACCATCTAACAAT ATCTCAGTGCAACAAGCCATAAATAATCAGCAGCGAACTTTGCCAAATGATGAACCAAAT GCTGCTGCCAACCCATCCTCCTCAGCAGCTGTGACCAAATCTAGAATGCGCTGGACACAA GAACTTCATGAGGCATTTGTGGAGGCTGTCAATAAACTGGGTGGGAGTGAACGAGCTACA CCGAAGGGCGTCTTAAAGCTCATGAATGTTGAAGGGTTAACTATCTATCATGTTAAAAGC CACCTACAGAAGTATAGAACTGCTAGACACAAACCAGAGCCTTCAGAAGAAACATCAGAG AAAAATTTATCTTCTGAAGATATGAAGTCTCTGGGTTTGAAAAACAGTACAATGAGCATC ACTGAAGCATTGCGATTGCAGATGGAAGTTCAGAAACGGCTCCATGAACAACTTGAGATT CAGAGAACTTTGCAGTTGAGAATTGAAGAACAGGCCAAGTATCTTCAGCAGATGTTTGAG CAACAAAGAAAGATGGAGATTGATACGTCCAAGGCCTCATCATCCAACCCAAATGATAAC TCCGCTGCATTGTCAAAGCCAGAGCAGAATTCTTTCAAAAATGAAAAATCAGATGCTGCT GAGGTTAATGTAGCCAAAACAGATGCCACTACTGGTCAAGCCAACACTACACAACAAGAA AATTCTTGCAGTCCAAGCAGGAAACAGAAGGCACCACAAACCACAACTGCTGAGGGTCTT GTCATCGTCCTAGATGATTCTGACCACACAAACACAAAACGAGCAAGAACAAGTGAAGCA TCAGAACCTTCAGGCAAATCTGCATTAGAATAA
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>LITCHI003556.m1 MTISSKHPVSSVQGSGTKQLSTLGVSVAMSSSFSALSTPLEEKYPKLPERDLMTIPINPY TCPSAPTCLSVGHMFSTPSGVPNNVFISSVSPQDRHSRNSPFISESLRDRVPLSPAQFSP SEVRSTGSINHPGESKDISCCVDPFQGFLDYPENIPGQTGLSQSNTGDTTFDDHAKGSEW QKWAEQLISVDDGLDPNWSEILADVNEADARSEVLKPSNNISVQQAINNQQRTLPNDEPN AAANPSSSAAVTKSRMRWTQELHEAFVEAVNKLGGSERATPKGVLKLMNVEGLTIYHVKS HLQKYRTARHKPEPSEETSEKNLSSEDMKSLGLKNSTMSITEALRLQMEVQKRLHEQLEI QRTLQLRIEEQAKYLQQMFEQQRKMEIDTSKASSSNPNDNSAALSKPEQNSFKNEKSDAA EVNVAKTDATTGQANTTQQENSCSPSRKQKAPQTTTAEGLVIVLDDSDHTNTKRARTSEA SEPSGKSALE.
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>LITCHI003556.m1 ATTCGTTTCATCGTATTAGTTGAGAGATAGTCCTATAAAAGTTTTTTTTTAATATTAAAA ATGTCATCATGATTAGATCATAATGATATCATAATAACTTTAGATGTGTAATGTGTTAGG AATTTTTTTAGACTTCCATAATTAAATAACGTATCAGCGAGAATGATTAGGATTATTATA TATATTTTTCCTCCCGTCTATGGTTTACACTCCAATTTTTCTTATAATAATCGCTGGTGA TGTTGGAGATTGGAACAAGACGGTTTCATGGTAAATTTTATTACTTTTTAATTATTTTAA TGAAATAGAAGAGAGACAAAAGAAGCCAAATACGTATGCTCGTAAAAGACTGTTGTTTGT AAACATTGATGTTGAAATCGAGACGACAAAACCAATCAAAGCCACCAAGAATTTTCCTCC ATTTTAAGCCATCTTGTCTCCTCAAACTCGGTGTTTATCCAATCATCACCTTCTCACCGT CCACACTCTTGATTTTCACGTACTTTTGAGAATGTCATGCTCTGATGTAACACTGGCCCC TTCGAATTAGCAATTCACGCTTAAGAAGCTCTATTTAACAGATCTTCTCACCACAGATTA AGTTCCGAGCCAGAGATTGTGTAGCTGACGATGGTTGGGAGTTCCTATTTATGACGATAT CGAGCAAGCACCCTGTGTCATCTGTTCAGGGATCAGGCACAAAGCAGTTAAGTACCTTGG GGGTGTCTGTCGCTATGTCTTCATCTTTTTCAGCTCTCTCTACACCTCTTGAAGAAAAGT ATCCCAAATTGCCTGAAAGGGATCTTATGACAATCCCCATCAACCCATATACGTGTCCAT CGGCTCCCACCTGTCTCTCTGTTGGGCACATGTTTTCAACACCTTCTGGAGTCCCAAATA ATGTGTTTATTTCTTCTGTTTCACCTCAGGACAGGCATTCCCGAAATTCTCCATTCATTT CTGAGTCGCTAAGAGATAGAGTGCCATTGTCACCAGCACAATTTTCCCCCTCAGAAGTAC GTTCTACAGGATCCATTAATCATCCTGGGGAAAGTAAGGATATATCTTGTTGTGTTGATC CATTTCAGGGATTTCTTGATTACCCTGAAAACATCCCTGGTCAGACTGGTCTGTCGCAAA GCAATACTGGTGATACCACATTTGACGATCATGCTAAGGGAAGCGAGTGGCAGAAGTGGG CAGAACAATTAATCTCTGTTGATGATGGGCTGGACCCAAATTGGAGTGAGATTCTTGCTG ATGTTAATGAAGCAGATGCCAGATCAGAGGTGCTAAAACCATCTAACAATATCTCAGTGC AACAAGCCATAAATAATCAGCAGCGAACTTTGCCAAATGATGAACCAAATGCTGCTGCCA ACCCATCCTCCTCAGCAGCTGTGACCAAATCTAGAATGCGCTGGACACAAGAACTTCATG AGGCATTTGTGGAGGCTGTCAATAAACTGGGTGGGAGTGAACGAGCTACACCGAAGGGCG TCTTAAAGCTCATGAATGTTGAAGGGTTAACTATCTATCATGTTAAAAGCCACCTACAGA AGTATAGAACTGCTAGACACAAACCAGAGCCTTCAGAAGAAACATCAGAGAAAAATTTAT CTTCTGAAGATATGAAGTCTCTGGGTTTGAAAAACAGTACAATGAGCATCACTGAAGCAT TGCGATTGCAGATGGAAGTTCAGAAACGGCTCCATGAACAACTTGAGATTCAGAGAACTT TGCAGTTGAGAATTGAAGAACAGGCCAAGTATCTTCAGCAGATGTTTGAGCAACAAAGAA AGATGGAGATTGATACGTCCAAGGCCTCATCATCCAACCCAAATGATAACTCCGCTGCAT TGTCAAAGCCAGAGCAGAATTCTTTCAAAAATGAAAAATCAGATGCTGCTGAGGTTAATG TAGCCAAAACAGATGCCACTACTGGTCAAGCCAACACTACACAACAAGAAAATTCTTGCA GTCCAAGCAGGAAACAGAAGGCACCACAAACCACAACTGCTGAGGGTCTTGTCATCGTCC TAGATGATTCTGACCACACAAACACAAAACGAGCAAGAACAAGTGAAGCATCAGAACCTT CAGGCAAATCTGCATTAGAATAAACAACTTATAGAATCAACATTGCTGCTCCTGGTGATA ATGTGATAAGTCAGGATAGGTAGGATGCTTTTCATTTACAAATATTACTATTTCGATTAA ATGCAGGAGTTTACGACAGTAGAGACCTTTACTATATGTGGGCAAAATACATCAGAAGTG ACACAGTTGTTTTCTTTCTTCAAAGATTTGAAGACTTAGTATTTAATCTTATCTTTCAAT GTTAAATTTAAGACCTGTTTCAATCTGGGATTGAATATGAAGTGAAAACTGGCAGTAGAA GAAGCTGGATTTGCTGTGTATATATTTGCATTGTTGATGACTAGATTCTTCTTGTTATGG AATAACGGTTCAAGTTTGTTGTGTATATATCTGCATTGTTGATGACTAGATTATTCTTAC TCGTTATTGAATAATGGTTAGGGTAATGTTACCATTAACATCCTCCATTAGTGATATGTT GAACATCTTCCTGGAAGCAAATTTTTATCAAATCCAAAAGTTCTATATATTAAATTTAAT GATTGTCTTGGCCATTTCTTCCACCAAATCTCA
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>LITCHI003556.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTATATTTTTTTGTTGATTTTTTTTTCATTTATTTTTTCAATTGATTCGTTTCATCGT ATTAGTTGAGAGATAGTCCTATAAAAGTTTTTTTTTAATATTAAAAATGTCATCATGATT AGATCATAATGATATCATAATAACTTTAGATGTGTAATGTGTTAGGAATTTTTTTAGACT TCCATAATTAAATAACGTATCAGCGAGAATGATTAGGATTATTATATATATTTTTCCTCC CGTCTATGGTTTACACTCCAATTTTTCTTATAATAATCGCTGGTGATGTTGGAGATTGGA ACAAGACGGTTTCATGGTAAATTTTATTACTTTTTAATTATTTTAATGAAATAGAAGAGA GACAAAAGAAGCCAAATACGTATGCTCGTAAAAGACTGTTGTTTGTAAACATTGATGTTG AAATCGAGACGACAAAACCAATCAAAGCCACCAAGAATTTTCCTCCATTTTAAGCCATCT TGTCTCCTCAAACTCGGTGTTTATCCAATCATCACCTTCTCACCGTCCACACTCTTGATT TTCACGTACTTTTGAGTAAGTTTTCATCTTTTTTCAATACCCATCTCGAGTTTCTCGGTT TCAATTCTGTGTAGTAAGATTGTATGTTGTTTTTGTTACATCATATCTGCAATACCCTGG TTTTGTTTTGGCTTGTTTTGATGGATTTTGGTGTTTATTTGATTGTTTATGAGCTGGGTT GTGTTTTGTTTTTGATGAAGTATAGGCTTTGATGTTTTTTGTGTTGTGGGGTTGGTGTTT TTTTGTTAAATCTTTGGGGTATCTATATGTTTTGTGGATAATCTTGTGTTTTGATGCATT TTTGGTGGCTAGATTGAGAGTAGTTTTTGTTATTGGAATTGTTTTGATGGTGGAGATATA TCATTTTCTGTAAAGTTGTGATTTTGATGATTGGAAGTTGATGGTTATTCATTGTATGGT GAATTTGTTGTGTTTTTATGCTCATGTTCTAAAACTTTCTGAGTTTGAGGAGTTTATGTG AAGAATTGAGGTTTTAATTTGGTTGTTTATTGTTGTCTCATTGTTTAATGATTGGCTTGA ATATGGAGTTTAATTCTTTTGGCTTGAATGTGGAGTTTAGTTCTTTTGTTAAAATAAAGA AAGAAATGAAAAAAGGACTGATTGTCGAACTGGACATGGATAGTTATTGATTCGATATAT AACAGTGCCTAATTCTAGCAGTGCAACTTTGCTCTAGTCTAGCTGTGAGGTACTTTTGAA TGGTTTGGTTTCTGTCGATTATGTTTGTAGCGCAAACATCAGCTTCTTGTTCTAGAGATT GTAGTGTTTGGCTGATAAATTATGGTTGAATAAGGGACGTCCAAAGTGGCTTTTAATATT TAGTAAAAGTTAGTAGCATCCAGTTACATAAGATGTTGAAGTTCTGTTTATTGTTAGGAG CAGTTAAATGAGAATTTTAGAATTTGTTGATTGGTTCATTTTTATTTAGTATACATTTCA TTAGCATACATGTGAAACATAGATGCGATTTAAACTGAATTTGCTGCTTTAAGTATTCTG CTTGATATTTAATATAGAGAATGTAGGAGATATCAAATTCTGTAGTTTTATTTTTCTACG CAATCATGTTGGTATCCTCAAGTACCAAAAAAGTCTCTGCTAATTGTCTAATATAAGTGG TTTACTTCACATACAACGAAGTAACTAAATATAATCTCTGAAGGGTTAAATCTTGAGAAA TTGTTTATTGGAAGTATGAAGAGAATTTAGTAAATTGATATCTTCTTCAAATAGAGTTGT TTTCACCATCTGTTCTTCCATATTTGTTGATTGCCTCCTTCAATATCCTTTTGTGGCAGG AATGTCATGCTCTGATGTAACACTGGCCCCTTCGAATTAGCAATTCACGCTTAAGAAGCT CTATTTAACAGATCTTCTCACCACAGATTAAGTTCCGAGCCAGAGATTGTGTAGCTGACG ATGGTTGGGAGTTCCTATTT
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>LITCHI003556.m1 GenomeSequence + ATTCGTTTCATCGTATTAGTTGAGAGATAGTCCTATAAAAGTTTTTTTTTAATATTAAAA ATGTCATCATGATTAGATCATAATGATATCATAATAACTTTAGATGTGTAATGTGTTAGG AATTTTTTTAGACTTCCATAATTAAATAACGTATCAGCGAGAATGATTAGGATTATTATA TATATTTTTCCTCCCGTCTATGGTTTACACTCCAATTTTTCTTATAATAATCGCTGGTGA TGTTGGAGATTGGAACAAGACGGTTTCATGGTAAATTTTATTACTTTTTAATTATTTTAA TGAAATAGAAGAGAGACAAAAGAAGCCAAATACGTATGCTCGTAAAAGACTGTTGTTTGT AAACATTGATGTTGAAATCGAGACGACAAAACCAATCAAAGCCACCAAGAATTTTCCTCC ATTTTAAGCCATCTTGTCTCCTCAAACTCGGTGTTTATCCAATCATCACCTTCTCACCGT CCACACTCTTGATTTTCACGTACTTTTGAGTAAGTTTTCATCTTTTTTCAATACCCATCT CGAGTTTCTCGGTTTCAATTCTGTGTAGTAAGATTGTATGTTGTTTTTGTTACATCATAT CTGCAATACCCTGGTTTTGTTTTGGCTTGTTTTGATGGATTTTGGTGTTTATTTGATTGT TTATGAGCTGGGTTGTGTTTTGTTTTTGATGAAGTATAGGCTTTGATGTTTTTTGTGTTG TGGGGTTGGTGTTTTTTTGTTAAATCTTTGGGGTATCTATATGTTTTGTGGATAATCTTG TGTTTTGATGCATTTTTGGTGGCTAGATTGAGAGTAGTTTTTGTTATTGGAATTGTTTTG ATGGTGGAGATATATCATTTTCTGTAAAGTTGTGATTTTGATGATTGGAAGTTGATGGTT 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