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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI003542Chr62430879624319713-Protein CHROMATIN REMODELING 20

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI003542.m1130304PF04851.18ResIIIFamily33.15.60E-08
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LITCHI003542.m272365PF00176.26SNF2-rel_domDomain189.19.60E-56
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LITCHI003542.m3289413PF00271.34Helicase_CDomain55.57.00E-15
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>LITCHI003542.m1
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CATGCCTTGCAGGATGGACCTGATATACTTGTTTGTGATGAGGCCCATATGATTAAGAAC
ACCAGGGCCGATACAACCCAAGCTTTGAAACAAGTGAAATGCCAAAGAAGGATTGCATTG
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GAAGGTTTTCTTGGAAGCAGCCACGAGTTTAGGAACCGCTTCCAGAATCCTATAGAAAAT
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TTGCCACCAAAAACTGTCTTTGTAGTAACTGTGAAGCTTTCTCCTTTACAAAGGAAATTA
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TTACTGCTTGAGATTTTAACCATGTGTTCTGACATGGGTGATAAGGCTTTGGTTTTTAGC
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AAAAAGGGGAAGTTTTGGAAAAAAGGAAAGGACTGGTACAGGTTAGATGGAAGAACAGAG
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TGTACTCTGATATCGACCAGAGCTGGATCATTAGGGATTAATCTTCATTCTGCAAACCGT
GTAATTATTGTTGATGGTTCTTGGAATCCAACATACGATCTTCAGGCCATATTTCGTGCT
TGGAGGTATGGACAAACAAAGCCAGTTTTCGCTTACCGATTGATGGCACATGGAACCATG
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GACGATGAAAACCCTGACCCTTTGACTGAACTCAGTCAAGTGAACGGACAGGGAAATGGT
CAAAATTCAACTTGCAAAAATGGAAGTCTTGGAAGCTGCCCTTCTGATAAATTAATGGAA
CGTTTGCTTGGCAAGCATCATCCAAGGTGGATTGCCAATTACCATGAACACGAGACGCTT
TTGCAAGAGAACGAAGAGGAAAGGCTTTCAAAGGAGGAGCAAGACATGGCTTGGGAAGTA
TATCAGAGATCATTAGAGTGGGAAGAAGTGCAGCGGGTTCCAATTGATGAATCTGCACTG
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CATTTACTGACCCTTAGAAGTCAAGGTACAAAACCTGGTTGTACTACTGTGTGCGGAGAA
TGTGCCCAGGAGATCCGGTGGGAGGATATGAACAGGGACGGCAAGCCAGCTAGGTGA
>LITCHI003542.m2
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TGTATTCTAGCTCATACAATGGGCCTTGGTAAAACTTTTCAGGTCATAGCTTTCTTATAC
ACTGCCATGAGAAATATTGATTTGGGATTGAGAAATGCACTTATCGTCACCCCTGTGAAT
GTGCTGCATAATTGGAGACAGGAGTTCCTGAAGTGGAGGCCATCAGAAGTGAAACCTCTC
CGTGTGTACATGCTGGAAGATGTATCAAGGGAAAGACGAGCGGAATTGTTAGCAAAGTGG
AGAGCTAAGGGTGGTGTTTTTCTGATTGGCTATGCTGCCTTCCGGAACTTGTCTTTTGGA
AAGCGTGTCAAAGATCACCACATGGCTAGAGAAATTTGCCATGCCTTGCAGGATGGACCT
GATATACTTGTTTGTGATGAGGCCCATATGATTAAGAACACCAGGGCCGATACAACCCAA
GCTTTGAAACAAGTGAAATGCCAAAGAAGGATTGCATTGACTGGATCACCTCTTCAAAAT
AATCTCATGGAATACTATTGTATGGTTGACTTTGTAAGAGAAGGTTTTCTTGGAAGCAGC
CACGAGTTTAGGAACCGCTTCCAGAATCCTATAGAAAATGGTCAACATACCAACTCAACA
TCTGAAGATGTTAAAATTATGAATCAGAGGTCTCACATCCTATATGAACAATTGAAAGGA
TTTGTCCAGAGAATGGACATGAATGTGGTAAAGGAGGACTTGCCACCAAAAACTGTCTTT
GTAGTAACTGTGAAGCTTTCTCCTTTACAAAGGAAATTATACAAGAGATTTTTAGATGCT
CATGTATCATTGATAAGGAAGAGCTTTTTTGCTGGGTACCAGGCATTGGCTCAGATATGG
AACCATCCTGGAATCTTACAATTGACAAAAGAAGATAGGGGTCATCCAAGTCGCGAGGAT
GCTGAGGACAGCTCCAGTGATGAAAACATTGACTACAATGTGGTGGTGGGAGAGAAGCCA
AGGAATGTGAATGATGACGGTTTTTTCCAAAAGGATTGGTGGAATGATCTTTTGCATGAT
CATACCTACAAAGAGCTTGACTACAGTGGCAAAATGGTCTTACTGCTTGAGATTTTAACC
ATGTGTTCTGACATGGGTGATAAGGCTTTGGTTTTTAGCCAGAGCATACCAACTTTAGAC
CTCATAGAATTTTACCTTTCAAGATTACCTCGACCAGGAAAAAAGGGGAAGTTTTGGAAA
AAAGGAAAGGACTGGTACAGGTTAGATGGAAGAACAGAGAGCTCCGTAAGACAGAAGTTG
GTCGAAAGGTTCAATGAGCCCTTAAATAAAAGGGTAAAATGTACTCTGATATCGACCAGA
GCTGGATCATTAGGGATTAATCTTCATTCTGCAAACCGTGTAATTATTGTTGATGGTTCT
TGGAATCCAACATACGATCTTCAGGCCATATTTCGTGCTTGGAGGTATGGACAAACAAAG
CCAGTTTTCGCTTACCGATTGATGGCACATGGAACCATGGAAGAAAAGATATACAAGCGT
CAGGTGACAAAGGAAGGGCTTGCAGCAAGAGTAGTGGATAGACAACAAGTACATAGGACT
ATCTCTAAAGAAGAAATGCTACATCTCTTCGAGTTTGGTGACGATGAAAACCCTGACCCT
TTGACTGAACTCAGTCAAGTGAACGGACAGGGAAATGGTCAAAATTCAACTTGCAAAAAT
GGAAGTCTTGGAAGCTGCCCTTCTGATAAATTAATGGAACGTTTGCTTGGCAAGCATCAT
CCAAGGTGGATTGCCAATTACCATGAACACGAGACGCTTTTGCAAGAGAACGAAGAGGAA
AGGCTTTCAAAGGAGGAGCAAGACATGGCTTGGGAAGTATATCAGAGATCATTAGAGTGG
GAAGAAGTGCAGCGGGTTCCAATTGATGAATCTGCACTGGAGGGAAAGCCAGCTGCTGTG
CCAGATGTAGTTCCTCCTGAACCAGAGAGCAGCAATGTCATGCAACCCAGGGGCACTTAC
AGGAACCGTGTGGTGATGCGAAAATGCACTAAGCTTTCACATTTACTGACCCTTAGAAGT
CAAGGTACAAAACCTGGTTGTACTACTGTGTGCGGAGAATGTGCCCAGGAGATCCGGTGG
GAGGATATGAACAGGGACGGCAAGCCAGCTAGGTGA
>LITCHI003542.m3
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GATCACCACATGGCTAGAGAAATTTGCCATGCCTTGCAGGATGGACCTGATATACTTGTT
TGTGATGAGGCCCATATGATTAAGAACACCAGGGCCGATACAACCCAAGCTTTGAAACAA
GTGAAATGCCAAAGAAGGATTGCATTGACTGGATCACCTCTTCAAAATAATCTCATGGAA
TACTATTGTATGGTTGACTTTGTAAGAGAAGGTTTTCTTGGAAGCAGCCACGAGTTTAGG
AACCGCTTCCAGAATCCTATAGAAAATGGTCAACATACCAACTCAACATCTGAAGATGTT
AAAATTATGAATCAGAGGTCTCACATCCTATATGAACAATTGAAAGGATTTGTCCAGAGA
ATGGACATGAATGTGGTAAAGGAGGACTTGCCACCAAAAACTGTCTTTGTAGTAACTGTG
AAGCTTTCTCCTTTACAAAGGAAATTATACAAGAGATTTTTAGATGCTCATGTATCATTG
ATAAGGAAGAGCTTTTTTGCTGGGTACCAGGCATTGGCTCAGATATGGAACCATCCTGGA
ATCTTACAATTGACAAAAGAAGATAGGGGTCATCCAAGTCGCGAGGATGCTGAGGACAGC
TCCAGTGATGAAAACATTGACTACAATGTGGTGGTGGGAGAGAAGCCAAGGAATGTGAAT
GATGACGGTTTTTTCCAAAAGGATTGGTGGAATGATCTTTTGCATGATCATACCTACAAA
GAGCTTGACTACAGTGGCAAAATGGTCTTACTGCTTGAGATTTTAACCATGTGTTCTGAC
ATGGGTGATAAGGCTTTGGTTTTTAGCCAGAGCATACCAACTTTAGACCTCATAGAATTT
TACCTTTCAAGATTACCTCGACCAGGAAAAAAGGGGAAGTTTTGGAAAAAAGGAAAGGAC
TGGTACAGGTTAGATGGAAGAACAGAGAGCTCCGTAAGACAGAAGTTGGTCGAAAGGTTC
AATGAGCCCTTAAATAAAAGGGTAAAATGTACTCTGATATCGACCAGAGCTGGATCATTA
GGGATTAATCTTCATTCTGCAAACCGTGTAATTATTGTTGATGGTTCTTGGAATCCAACA
TACGATCTTCAGGCCATATTTCGTGCTTGGAGGTATGGACAAACAAAGCCAGTTTTCGCT
TACCGATTGATGGCACATGGAACCATGGAAGAAAAGATATACAAGCGTCAGGTGACAAAG
GAAGGGCTTGCAGCAAGAGTAGTGGATAGACAACAAGTACATAGGACTATCTCTAAAGAA
GAAATGCTACATCTCTTCGAGTTTGGTGACGATGAAAACCCTGACCCTTTGACTGAACTC
AGTCAAGTGAACGGACAGGGAAATGGTCAAAATTCAACTTGCAAAAATGGAAGTCTTGGA
AGCTGCCCTTCTGATAAATTAATGGAACGTTTGCTTGGCAAGCATCATCCAAGGTGGATT
GCCAATTACCATGAACACGAGACGCTTTTGCAAGAGAACGAAGAGGAAAGGCTTTCAAAG
GAGGAGCAAGACATGGCTTGGGAAGTATATCAGAGATCATTAGAGTGGGAAGAAGTGCAG
CGGGTTCCAATTGATGAATCTGCACTGGAGGGAAAGCCAGCTGCTGTGCCAGATGTAGTT
CCTCCTGAACCAGAGAGCAGCAATGTCATGCAACCCAGGGGCACTTACAGGAACCGTGTG
GTGATGCGAAAATGCACTAAGCTTTCACATTTACTGACCCTTAGAAGTCAAGGTACAAAA
CCTGGTTGTACTACTGTGTGCGGAGAATGTGCCCAGGAGATCCGGTGGGAGGATATGAAC
AGGGACGGCAAGCCAGCTAGGTGA
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>LITCHI003542.m1
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>LITCHI003542.m3
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>LITCHI006467.m1
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AGGCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGACGTTGCTATAGTTGTGGGAAGTCAGGGCATTT
GGCTAGAGAGTGTACTGAAGGAGCCGCCGCTGGCAGCGGAGGAGGCGGTTACGGGAGGTT
CGGAGGCGGCGGTGCTGGTGGCTCCACCTGCTTTAATTGTGGGAAGCCAGGACACTTCGC
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TGGTTAATTGATGAAGAAGAAAACAAAACAAAAGAAAAAAAGAAGAGAAATTTAGCAATA
GTAGTATATAGTTTGGACGAGTTGGAGTCGTTGGGCTTATATAACATTTTGGGGTATTTT
GTGGGTTGGAAATTGGAATTGATGATTGATAGATGATAATACGAGGGAGAGGGAGGGTCT
CAGGTTTTGGTTTGGTTTGTTTGGAGAGTAGTTCTTTTAGTTTTGATACGTGTATGAGGT
GGTTCGGATATGGTTTTAATATGTTCTGTTTTTTCTTTAACCTTTTTGATTTGATTGGTT
TTGGTTACTTGGGTATATCTTTCTTATGGAATAGTTGTTATATCTCCAGGTGTGAATTCT
TGTTTTGGTTGTATGTGTGTTTTGGATATTTGGGTGTTTGTTGTATTATGTGTTAGTGGA
TTGGAATTTGGATGAGTGTTTGTGGTTGCTGATGTTGGTTTGTTGCAGTGGATGTTATTG
CGATGCTATATGTATATGGTAGGAGTTTGCATGGTGATCGTATAATGTGGATTACTTGAG
GCTTGTATAGCACGTGTAATCCTAGCAATCTTACTATATAGAAATCTAGGCTACGTAATT
GATAGGACTTTTTGTGAAGATTGTATCTTTGGATTACTTGATGTTGGTATAGCACGTTTA
ATCATAGCAACTTTATTATTTAGAAATCTACGCTATGTAATTGTTAGGACTGTTTAAGGA
GATTGTATCTTTGGATTGCTTGAGGCTTGTATAGCATGTGTAATGATAGCAACCAAACTA
TAAAAATAATAGGCTATGTGTTTGATAGGACATTGTATGGAGATTGTATGGCATGGACTA
CTTGAGGCTTGTATGGCACGTGTAATCATACCACCTAACTATAAAGAAATCTAGGTTATT
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TGTGTACTTATAACAACCTTACTATAATTAAATGTAGGCTAGGGAAAGCTGCTGGTTGTT
ACATGACTCAGGTAGTAATTTTTGTTGAGTCAAAAACGATTTCTTATTAAGACAAATCGG
ACTATTGGTCTGATGGGGAAGGAGATGATACTATGATACTGGATTTTAGAGTCCCTATAC
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CTGAACCCCGCAACATAATGTGAGCTGTGACTGATTTTTTACGTCCTTAGCTGCATTAGA
GGATTAGGCAATATTAGTTTATGAGCATTGAATAAGTGTTAATTTATGAACATTGATTTA
ATTTTCATTACAAGCTATGTTTTTGCCACATCTAGTCTTGCAGTCTTTTTTACTGTGTCC
TATCCAATCACAAGTCTCTTGTTATCAGGATCCGATCCTCTCTATGTTTGGACTTCGTAA
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TTAGAACTGTTGAAGCCTGGGTTTTGAGGTGAGAGATGGGTTAAGTTCTGGGTACTGTGA
CTTGTTCTGCTGAATATACTTGATTACAAATCAATCTTCAAGGTTCTGTAAATTACAGTT
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ATATGATAGGTAACGGCATTCTTCTTTAAATAATGAGAATCAAATTACTATTTGGCTAGT
AATTAGTAATCCTAAAACGTTCCCAGTTAAAATATTATTTCTAATCGCGAATGAAATTGA
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CCTTTTACATCTGTTTATGGTAGGTCTCGTGGGCCTGGTTAAGAAGTTTTGCTAACTGTA
GGACGTTGTAAGATCGACTTGAACCGATTTGGGTCCATTTGTATTTGTCCAATTGAACTT
TTAGGTTTGGGCTTGTGTTGGCCTTCAAACTAGCATAAATGGCTACAAGTACAACTGCTG
TCTTTCTTATGGCCCATCGAAGTTTCCAACCCAGTAACCTCGTGGGTTGTGAGGACATCA
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GTTTGACACCATTAATGACGAGTAGTTAAGTTAATTTATAATGTAAGAGAGTTTTTCTAC
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>LITCHI006467.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GTGCTATAATGACACACTACTAACATAATTTCTCCTTTCGTAGTAAAAATGATTGAGATA
ACACTCTAAATTGATTGTAACAAAATTAATTTCTCCTTCTGTAACATTTCTACATAAATA
ACCATGATCTAGAAATGTTAATCATCTTTTGAAGAAAAGTTGCTATAATGACACTAATAT
AATTTCACCTTTTTCAATCCTTGTTTTACCACATTAAGAAACTATTAAGATTATCCTATT
AATAGTTTATCCTACATCACATTTACAAGATCAAACATTTCTTTTAATCTTAACGTTTTT
GCCGGGCGTTTTCTAATTTAGTGACCGGTTAATTCCAGCTGAGCGTTTTCTAATCTAACG
AATGATTAATTCCAACCCTATCATACTTTTCTTTTGTTGAGATTATTTCAACAGTATCAC
GCAGTTTTGAATGATGAATTTTATATTTTTGTTAAAACAATTCTAATAGTATATATAATC
GATATCAGTCATAAATTGTTGATCATTAAATTGATTAAAAATCTTTTAAAAAATTATCCT
ACATAACTTTTGTGAGCACAAAAATCTCTCGTAAACTAAATTTTTTGCCCAGCTTTTTCT
AATCTAATGATAAAATAATTCAAATCATACACATTTTCATTACTATGTGTTTTATAACAG
TATCATATGTCTCTATTGTTGAGATTATTCCAACAATAATCAAACAATTTTTGTTGTGAC
TTCTATTTTTCCCTGAGATGATTTCAACAGTTTACTGATACCAATCCCAGAACCATTGAT
CATTCGACAACTAAAAACACCGTTGGGAAGATTATCCGGAGTGTTCAAAGTTCTCTCTCC
AATCCTTATCTTTCTTATTAGATTTTCCTAATCTAACTCGCACAATTCAAACTTAACCTT
CACATGAACATAAATAAAATTAAACTTTCGTTTATTTTTAGAAAAATTACACTTCTATAG
TTTATTTCTTCCTTTAACGAAAACAACTAAAAAGGAGAAAAACATCCTTAATACACGCAA
TTATATGCAGATATTCACATAATCACGTGATCAACAAAAATATCAATCAAAAAGCATACA
AACACAAACACCTCCCCCAAACCAAATCAAAGACGCCACAATAACCGTTCGATCAAAAAT
TCGAATCCGATCAACGAAGCCGAGGCAACTAAGTGACAACACTGACCGCTACACTATCAG
ACGTGGGCTGGGCCCCCACTTAAACAAAAACTCGGCTACACCAGTATCACTGCACCCAGC
CAATCAAAAGCTGACAAATTCTAAAATCAAAGTTTGAATTTTCTCCAATATTATTAATTT
TTTTAAGATAAATTTGAGTTAATTGAATTGCCTTTTTTTAAATAATAATAAATTGAATTA
TTTACCTATATTGCATTATTTATTATTTTTTTAGTCCAATTAGAATAAATTTATTATATA
TGATTATAATTAAATAAGTTAAATTATATTTACAATAATAAAATATATTTAGTTATTTAT
TAAATATAATAAAGATATAATAAATAATTTTCAGGAACAATCACATTTTATCTTGTCGAG
GATACCGATATTTAGATGGATTGTATGATATATATGTACTTGTAAAGTATATCAATATTT
TACTTCAAAAAAAAAGAAAAAAGTATCAATATTTTAGATGGATTGTATGATATATATATA
TATATATATGATGTGCCAGACTGTGAGTGGTCGAGTGCATCATCTTGGACGCACTCAAAA
TTTCCGCCCAATTAAATCGGGCTCCACGGCTGCTTATCAAGCACGAGACTACACCAGATC
ACTACAAACAAACAAACGCAAAAATCGTGAACTCGAAGAATTTGTAGTATATATACATAT
AAAGATGAAGAAGAAGCAGAGAATCGGTTTCAAGCTTGGATTAGGGTTTTTGATTTTTAG
CTTTTCTTGAAACCTTTTAATTTTATTTTTTTTTGGGTTTTCTCCCAAAAAAAAAAAATC
TAGAGAGAGAGAGAGATCAG
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>LITCHI006467.m1 GenomeSequence - 
TTTAGATGGATTGTATGATATATATGTACTTGTAAAGTATATCAATATTTTACTTCAAAA
AAAAAGAAAAAAGTATCAATATTTTAGATGGATTGTATGATATATATATATATATATATG
ATGTGCCAGACTGTGAGTGGTCGAGTGCATCATCTTGGACGCACTCAAAATTTCCGCCCA
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