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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003533 | Chr6 | 24165777 | 24176484 | + | Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003533.m1 | 28 | 65 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 27.4 | 3.40E-06 |
LITCHI003533.m1 | 28 | 43 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 11.2 | 0.35 |
LITCHI003533.m1 | 29 | 88 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.9 | 3.70E-07 |
LITCHI003533.m1 | 53 | 112 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.1 | 1.60E-07 |
LITCHI003533.m1 | 149 | 208 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.1 | 6.70E-07 |
LITCHI003533.m1 | 220 | 280 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 37.2 | 2.00E-09 |
LITCHI003533.m1 | 246 | 267 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.9 |
LITCHI003533.m1 | 267 | 283 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.5 | 1.2 |
LITCHI003533.m1 | 269 | 328 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 41.1 | 1.20E-10 |
LITCHI003533.m1 | 269 | 290 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.5 | 0.19 |
LITCHI003533.m1 | 294 | 314 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.4 | 1.9 |
LITCHI003533.m1 | 448 | 717 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 162.8 | 1.10E-47 |
LITCHI003533.m1 | 449 | 721 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 152.2 | 1.70E-44 |
LITCHI003533.m2 | 28 | 73 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 25.1 | 1.80E-05 |
LITCHI003533.m2 | 269 | 328 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.6 | 9.30E-07 |
LITCHI003533.m2 | 292 | 307 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 10.7 | 0.49 |
LITCHI003533.m2 | 293 | 352 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.5 | 1.10E-06 |
LITCHI003533.m2 | 317 | 376 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.8 | 2.00E-07 |
LITCHI003533.m2 | 413 | 472 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.6 | 9.90E-07 |
LITCHI003533.m2 | 484 | 544 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 36.6 | 3.00E-09 |
LITCHI003533.m2 | 510 | 531 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10 | 1.3 |
LITCHI003533.m2 | 531 | 547 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9 | 1.7 |
LITCHI003533.m2 | 533 | 592 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.6 | 1.70E-10 |
LITCHI003533.m2 | 533 | 554 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.1 | 0.27 |
LITCHI003533.m2 | 712 | 981 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 162 | 1.90E-47 |
LITCHI003533.m2 | 713 | 985 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 151.4 | 3.00E-44 |
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>LITCHI003533.m1 ATGGGTTTGAAGGTGAAATCCCAGCAGAGTTTGGCAATCTCACCAACCTTAGGAAAGATT CCACCAGAGCTTGGCAACATTACATCCCTGGAGTTCTTGGATCTTTCTGATAATCAAATC ACAGGAGTGATACCAGTGGAGTTAGCAGAACTGAAGAATTTGCAGCTCCTGAATTTGATG TGCAATCAACTGACTGGTTTCATACCAGACAAGCTTGGTGACTTGACTAAACTAGAGGTA CTTGAGCTGTGGAAGAACTCTCTGACAGGCTCTCTGCCAGGAAAACTTGGGCAAAACTCA CACTTACAATGGTTAGACGTATCGTCAAACTCGTTGTCAGGTGAGATTCCACCAGGTCTG TGTGGCTCTGGCAATCTTACTAAGCTGATGCTCTTCAACAATTCCTTCTCTGGTACGCTC CCAATGAGTTTATCAACTTGCAAATCATTAGTTCGTGTTCGATTGCAAAACAACCTTATA TCTGGAACAATTCCTGTTGGTTTTGGAAGTCTGCCTATACTTCAAAGGCTGGAATTGGCA GACAACAATCTCACAGGCCAAATTCCACAAGACATTTCATTTTCCACATCAATTTCTTTC ATTGATGTTTCCTGGAACCACCTTGAATCATCTCTCCCATCTACCATTCTCACCATTCCA AATCTTCAAACCTTCATGGCTTCCCACAATAACTTCCAAGGCAAGATTCCAAGCCAGTTT CAGGACTACCCATCACTTTCAGTACTTGATCTCTCAAGCAACAGTCTCTCTGGAGAAATC CCTGAGAGCATTGCTTCTTGCGAAAAGCTAGTCACTCTAAACCTGAGAAACAACCAGCTA ACCGGAGAGATCCCAAGATCAATCGCCAAAATGCCTACATTAGCCGTTCTTGACCTCTCC AACAACTCTCTGGCAGGCAAAATTCCTGACAATTTTGGAACCTTACCAGCCCTGGAAATG 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>LITCHI003533.m2 GTCAGAAGTTAATTATAGCCTAAAAACATATATAGCATATTATTTCATATTAAATATACA AGATAGATGCAAGGAGACAACTCACTTTCCCTGTAATGTTCAAAAACATGAACAGAAGAT GTCAATAATAATATTAATAAAGAAGTATTACTGGTTCCTTTTAATCTCCATCTTGGGTTG ACCGTATATGATTAATATAATAATGTGACAAAGCATAATCAGCAATCAATTAAAACACAT TCTCTCCATGTTCTAGTGTCTGGGAGATTTGTAATAAGTCCAAACCTTTACAGTCATTAA GTGCCAGACAATTAGCTGGTGCAGATCCCAAGATCCCACGAACTGTTTTGTTTAACTAAT CTTAATTGCTGTTACATGTCACAAACTAACTCATAAGCTGTTCTGTCACTCTTATATTGA CTTTCCTGTCAGCTTCTGGCATGCCTCTTTGTTCCTGATAGCCAAAAATGAGATTTAACT AAGTGGAAGAGACTTAGCTAGCTAGAACAACACAATGCAAACCCAGTTGTTGTTTCTTTG CTGTTGCATTGGTTTTTCTCTTGTTTTTGTTGAGGGAGCTGAAGGTAGAGCGAATGATGA TGAGTTATCAGTCTTGTTGTCAATAAAAGATAAACTCATTGATCCACAGAATGTTCTTAG AGATTGGAAAATGCCAAGCAATGTGGCAGAGAACAGATTGCTGCATTGTAAGTGGACAGG AGTTTGGTGCAATTCTAGAGGCTTTGTGGAGAAGCTTGACCTGTCCAACATGAACCTGAG CGGCAGTGTATCAGACAGCATTCAAGGATTGAGGAGTTTGTCTTCTCTCAACATTTGCTG TAATGGGTTTGCTTCATCATTGCCAAAATCTCTGTCCAATCTCACTGCATTGAAGAGCAT TGATGTAAGTCAAAATGACTTCATCGGCAGCTTCCCAACTGGCCTTGGAAGGGCCTCAGG 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