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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003442 | Chr6 | 23077612 | 23081453 | + | Probable receptor-like protein kinase At2g42960 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003442.m1 | 35 | 184 | PF19160.3 | SPARK | Domain | 37.3 | 3.50E-09 |
LITCHI003442.m1 | 306 | 565 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 159.4 | 1.20E-46 |
LITCHI003442.m1 | 306 | 498 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 145.1 | 2.50E-42 |
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>LITCHI003442.m1 ATGAAAACAACGTATTATTCATCCACTTTTGTCTTCTTTTGCTTTTGTGCTTTCTTTTTC CATTCTTCATCTTCTGATTGTCCTTCACCAGATGATTCAGGTTGTGTGTTGAGATCGGAC CGTAACCACTATCAACCCTCCGGGGACTGCATTGGTCGTCACCGGAAGAAGGTCTACTAC TGGAAAAGCATCTCTTCAACTCTCTGTTGTGGAAACGCTCTCACCTTCTTCTCACAGGCA CTAGCTTTACGTGCACGTAACTCAACAGACGACAACATTTTCCTCCCGGAAGATCAGTGG AAGAACTGCACTGGCCCTTTCCGCATGCAGCCATCTGTCTCCGCCCTCGACTGTGGCCTC GACAGTTTCTTCCATGGCAACAGCAGCCAGTGTTCCAAGTTGACCCTCTCCGGCATCGGT CCCAATAAGGATTTCCAGGAAGCCTTGAATAATTGTTCCCGGCTCAACTCCTCATTTGAT CAAAATTGTGGGAACTGTACGTCTGCCGTGGTGGCCGCCAGGGATTCTTTGTTGGACGAA TTGAAAGTGAATGGAGATGATAATAATGAGAGAGCCATTTGTGGGATGGCCATTGTTGTT TCCATTGCGGCTGCCAATTTTGATAATGACTCCTCGGTAGATGATTTATTTAGTTGTTTG CGGTCCATGGATGTGTCTGATGGTGGTTATGTGAGAATTAAATATTCTGTGGCGAAAGCG ATAGTTGCGATATGTATAATCATTGTCACACTGATTCTGGTGCTTACTTTGGTAAAATAT CTGGGGAAGGGCAATAAAATGAGTTTCAAGCGCATGCCTCTTAAGCCCGGGAAAGAGATG ATCCCAAACACATGGTCAGGTCTGTATAGATTTTCCAAGGCTGAGATTGGGAATGCTATA ATTGCTGGTGGAAGGAAGAACCTGGGAAGAGGTAGTGCAGGCCAAGTTTACAAAGGCGTT TTGCCTAGTGGACAAGTCGTGGCCATCAAGCATATAAACAAGAGCAGTAATACTGACTCG TTTACTCGAGAAGTCGATGGTCTTTCAAGGATTCGCCATCCTAATCTTGTTTGTCTCTTT GGTTGCTGTGTCGAAGGCGGTGAGCATTATCTAGTTTATGAGTACTGCTCCGCTGGGAAT TTGGCGCAACATCTGCTAAGAAAGGACAGTGGTTTAACATGGGAGGATAGAGTTAAAATC TTGAGAAATTGTGCCCTTGCATTAAGGTATCTCCACCATTATATAGATGGCTGCATTGTT CATAGAGATATCAAGCTTACAAACATCCTATTGACCGAGGAACTGGAAGCCAAACTTTCG GATTTCGGGTTGGCAAAGATGCTAGGCATGGAGGAGAGCAAAGTATTTACAGATGTTAGG GGAACCATAGGCTATATGGATCCAGAGTACATGAGCAACGCCAAACTAACCTGTGCCAGT GACATCTATAGTTTTGGTATTGTTGCTCTTCAGCTTTTGTCAGGACAAAAGGTCATTGAG CTTGATCTTGATGCCAGAGATCAGCTCACAAGAAAGGCAAAAGATGTAAGCATGGGAAAA CGGCCATTGACAGATTTCGAAGACCCGCGGCTGGCTGGAAATATCATCAAGTCGGACTTT GAATCCCTCCTGCAAATTGCTGTTCTCTGTGTTGCTAAATCAAGCAAAGGCCGCCCCACA GTTGATGATGTCTTTGATGAGATAGAGAAAGCTTGGAAAAACACAATAGCTGAAACGAAT GCAAAGAGGGAAATGACAGCTTCATCAATGGCAACACCCTCTAGATCCTTCGAAGTGATG CCTGTTTGA
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>LITCHI003442.m1 MKTTYYSSTFVFFCFCAFFFHSSSSDCPSPDDSGCVLRSDRNHYQPSGDCIGRHRKKVYY WKSISSTLCCGNALTFFSQALALRARNSTDDNIFLPEDQWKNCTGPFRMQPSVSALDCGL DSFFHGNSSQCSKLTLSGIGPNKDFQEALNNCSRLNSSFDQNCGNCTSAVVAARDSLLDE LKVNGDDNNERAICGMAIVVSIAAANFDNDSSVDDLFSCLRSMDVSDGGYVRIKYSVAKA IVAICIIIVTLILVLTLVKYLGKGNKMSFKRMPLKPGKEMIPNTWSGLYRFSKAEIGNAI IAGGRKNLGRGSAGQVYKGVLPSGQVVAIKHINKSSNTDSFTREVDGLSRIRHPNLVCLF GCCVEGGEHYLVYEYCSAGNLAQHLLRKDSGLTWEDRVKILRNCALALRYLHHYIDGCIV HRDIKLTNILLTEELEAKLSDFGLAKMLGMEESKVFTDVRGTIGYMDPEYMSNAKLTCAS DIYSFGIVALQLLSGQKVIELDLDARDQLTRKAKDVSMGKRPLTDFEDPRLAGNIIKSDF ESLLQIAVLCVAKSSKGRPTVDDVFDEIEKAWKNTIAETNAKREMTASSMATPSRSFEVM PV.
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>LITCHI003442.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAATGATAAGTTTGAAGAAAATTAAAAACTTATCTCTTTAATATTGTTGTTTAAATCTTG TTATAAATAATTCTTCATCATTCGAATATTTGCTTCTGATGCATTTTTTTTTAATATCTT TTTGAAATTAAAGAAATCTGCAAATATTGGGAAAAATGGAGAAGTTTAAGAGTTTGTGAT TGCAAAAGAGGAAAAGAATAATGTTGGATTTTAAAAATTTGGATAGTAGTGTCTTTAAAA CTTTTTATTTTTTTGGGTCATTAATTCTGGTAATTTTAATTTAAATTAAAACTGTCATTA ATAAAAAAGGTAATAATGTAGTGTAGAAAGATACTTGATTTATATGGATTGCCAATGGCA TCATTCTTGTACTTTATCCTTTAATCTTTAAATTATAACTTATAGAGTCATGCTAGAGCT ATGAAGTTTAATAGCATAAATAATATTTGTATTCAACAAGGATTACATTTCGGTATGTTA CTATTTCAAATTAAATTAAGTTTGTAGTTTCATGTTAAAAAAAAAAAACGAAAGAAGAGA GCTAAGACGCTAATTTGAATGACAGAAATAATCCTAACTTCCTACGCGGAAACATGTTAA TTTTCAATTGGCACAAACCATGCGGCGATTTGTTTGAAGATTAATAATTTATGATTAGCT CAAATGTTTATTAATTAAAAAATGGTGCATCGGAATTATAACAGATGAAGTAAATGTTCA ATCTCCCACCTTTATTTTAAGGTAGTTATGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAA TTATTTAAATAAGGTAGTTATGGTTTTGAAAATTCTTAATCATAGACATCCTCGCTTGTT TTTTTTTTTTTTGGGTAAACAAAAGACACTAAGTCTAAGTGTCTAACTTCTAATATAACG AGTTTATACAATTTTTTGTCTTTCTTGGTAAATATCATGTACTATAGTTCGATTCAGTGT AATATTTCATCTAACAACACGAGCAGAATCATGCCAGTAGGATTTAAACCCATAATATAG GGGTTTAGATAAATTTTCATGTTATTTGAAAAAAAATTGTATAAATAATTTTACAATTTT ATCTTTAAGTATGATGCCGATTTGGTTAGGACTGTTGGAATTCATGAAATCAAAAGTTTA CGGAATAAAAGTAATTTCCTCTATAGGAAGGAGGTCTTCCCACACTTAGTAATTTAATTA ATGTATGTAAGATTTAAATTCATATCATAAATGTGAAGGAGATATAAACCACTTAAGCTT ATAAAATTTTTGCACAAATAAAATTAGTTAAATTATTGTATCACAAGTGATCGTAAATTC AATACAACTCATTTTCTCATCGCTAATGTAATGCCTGAAAATTACGATTAGTCATTGAGA TGAATATAAAATGCAAACTTCCACACGTAACAGCTTAATATTGTGTTTTCAGATAGTCTG ATAATCCTACCATTGACATATATGATAATTATAAATATTCTTCGGTTAAGGAATACGAAT TTCAACAAAATAGGAATATATATTTATAAAATGAATTATATAATATTCTATGCGTAATTT AAATGCTTAATGTAAATATGTTAAATAATTGTGAGTCTAAGAGTTTCTAAACTAATTTAT AAAACATTTCATAGTTAATCGTGTGAACTGAATACAAAATCCACATAGGTTGATGTAAGT TTATTGGCTTAATATATAAAGAAATATTTAGACATAAGAGTTGATGAAACGATTAATTAT AATCGATAACTTCAAGACAAATTAGATAAGACGCAGCTAGCTGTAAGAACAAAGCTGGAA AACCATATAAAATAAGAATATCCGAATTTGATCGACATTCACAAGAAACAATGTGCCTAT AATTACAACACTCCATTCCTCCCTTTGAAAAAATTTCAGCTCTTGCTTAATTTGTTTTTC ATGCTTTGCAAAACATATATTCTTTTTTATTTTTTATTTTTCTCTAATGAGCTGAAACTT GCAAGGTCACAGAAGGGGAC
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>LITCHI003442.m1 GenomeSequence + TTGCAAGGTCACAGAAGGGGACATGAAAACAACGTATTATTCATCCACTTTTGTCTTCTT TTGCTTTTGTGCTTTCTTTTTCCATTCTTCATCTTCTGATTGTCCTTCACCAGATGATTC AGGTTATTATTATTATTATTATTAATGTCATTAACTATTATCATAGTTTTCATATTAATT TCATATGATAATAAGTTTGCATACATAGAAAGATCTCTAACAAGCATCCGTGATATATCT ACAGGTTGTGTGTTGAGATCGGACCGTAACCACTATCAACCCTCCGGGGACTGCATTGGT CGTCACCGGAAGAAGGTCTACTACTGGAAAAGCATCTCTTCAACTCTCTGTTGTGGAAAC GCTCTCACCTTCTTCTCACAGGCACTAGCTTTACGTGCACGTAACTCAACAGACGACAAC ATTTTCCTCCCGGAAGATCAGTGGAAGAACTGCACTGGCCCTTTCCGCATGCAGCCATCT GTCTCCGCCCTCGACTGTGGCCTCGACAGTTTCTTCCATGGCAACAGCAGCCAGTGTTCC AAGTTGACCCTCTCCGGCATCGGTCCCAATAAGGATTTCCAGGAAGCCTTGAATAATTGT TCCCGGCTCAACTCCTCATTTGATCAAAATTGTGGGAACTGTACGTCTGCCGTGGTGGCC GCCAGGGATTCTTTGTTGGACGAATTGAAAGTGAATGGAGATGATAATAATGAGAGAGCC ATTTGTGGGATGGCCATTGTTGTTTCCATTGCGGCTGCCAATTTTGATAATGACTCCTCG GTAGATGATTTATTTAGTTGTTTGCGGTCCATGGATGTGTCTGGTAAGTTCTATAACTAA TAAATAATTTTCAGATGCAGGATCCCAGATATAATTTATATCTGGAAAAGTTTCCATTGA AATATGGAAGCTTTTGAACATGTTGATAAAATTATTTGTATCTTGCCTTTGGATAACTGC TCCTGATCTTACTTTTCATTGTTTGTTAACAGATGGTGGTTATGTGAGAATTAAATGTAA GTGGAACTACTTCGTTTTCTCTAATAATTTTTCCGGTATCATGCTACTATACAGGTTCAA TATAGAGACATGCATATGATTGATCGATAGCCATTGGATCATGATCCAAGGATTTATAAA ATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTTCCATATTATGCCTCCAAAAGTATTTGAATTG ATTTTTTTGTCTTTTCACAATACTTGATACTCACAGAAATGATTTAGCTTATCAGATTCT GTGGCGAAAGCGATAGTTGCGATATGTATAATCATTGTCACACTGATTCTGGTGCTTACT TTGGTAAAATATCTGGGGAAGGGCAATAAAATGAGTTTCAAGCGCATGCCTCTTAAGCCC GGGAAAGAGATGATCCCAAACACATGGTCAGGTCTGTATAGATTTTCCAAGGCTGAGATT GGGAATGCTATAATTGCTGGTGGAAGGAAGAACCTGGGAAGAGGTAGTGCAGGCCAAGTT TACAAAGGCGTTTTGCCTAGTGGACAAGTCGTGGCCATCAAGCATATAAACAAGAGCAGT AATACTGACTCGTTTACTCGAGAAGTCGATGGTCTTTCAAGGATTCGCCATCCTAATCTT GTTTGTCTCTTTGGTTGCTGTGTCGAAGGCGGTGAGCATTATCTAGTTTATGAGTACTGC TCCGCTGGGAATTTGGCGCAACATCTGCTAAGTAATATTTTTTTTGCCTATGTTGTCACT TGGAATCCTCTTCAAGTTGAAAAGCATGTATATTTGCTAATGCGCATTCATGCATGTCTC TATGCTGTGCAGGAAAGGACAGTGGTTTAACATGGGAGGATAGAGTTAAAATCTTGAGAA ATTGTGCCCTTGCATTAAGGTATCTCCACCATTATATAGATGGCTGCATTGTTCATAGAG ATATCAAGGTAAGAATCATATATGTTAGGAATATCATCAAAATAACCTTTGAAAAATCAA AATAATGTCAGACTACCCCCGATTTGAAAATATTACCAAAAAGTAACTTTTTGATTAATA TGAAAGAGCAATATGATAAATGGATTTTAATAAATGAATTCATTATCAATTAAATTAAAC TAGTTATTAATTAAGTGAGCCTCATCATCGCCGTCCATCGCAACTCCAGCATAATTAACT ATCCATCCTACATCATCATCATCGCTCATCGCCACCGCTGACCCACCAAACTCGGCCAGC ACAACCATCAATCTGTCATCATCAAGCCCTCATCACCACCGTTCATTCATCACAACTCCA TCATAATCGTCCATCCTTCATCATCTCCACCACTATCAACTTCATCCCCCATCACCCCTC ATTACCACCCAGAGAGATAGGAGAAAGCATCTCAATTTCTTTCTAGTGGAGTACATGGTT GCTTTATCACCTCCATTAGGGAAGAGATTGCAGCTTACAATCTCGTTCCAATGGAGAAGA TCGTCATTAGAACGAGATCTGACAGCCAAGAAGGGGATGGAAAAAAAAGGAATAGATTTG ATGTTGAATAGGGGAAAAAAAGTAAAAGAACAGTTGTTGTCCTGTCTTCTAATGATGCAT ACATGATTCGTACAGCTTACAAACATCCTATTGACCGAGGAACTGGAAGCCAAACTTTCG GATTTCGGGTTGGCAAAGATGCTAGGCATGGAGGAGAGCAAAGTATTTACAGATGTTAGG GGAACCATAGGCTATATGGATCCAGAGTACATGAGCAACGCCAAACTAACCTGTGCCAGT GACATCTATAGTTTTGGTATTGTTGCTCTTCAGCTTTTGTCAGGACAAAAGGTCATTGAG CTTGATCTTGATGCCAGAGATCAGCTCACAAGAAAGGTACATATACAACTCTGATTTTCT CAGTTGCTTTCAAAACAAACTCTATGAGCAATCAAATTTCAATTTTATGTAGGCAAAAGA TGTAAGCATGGGAAAACGGCCATTGACAGATTTCGAAGACCCGCGGCTGGCTGGAAATAT CATCAAGTCGGACTTTGAATCCCTCCTGCAAATTGCTGTTCTCTGTGTTGCTAAATCAAG CAAAGGCCGCCCCACAGTTGATGATGTCTTTGATGAGATAGAGAAAGCTTGGAAAAACAC AATAGCTGAAACGGTCTGTTTATTATTGCATATATATATACACGGAAACTCTTTTGGTTC AAATTAATCATTGTAGATTATATGTATGTATGTATGAATGTATGTATGTATAAAACATGT TCTATGCTTTTCTTATTATGCAGAATGCAAAGAGGGAAATGACAGCTTCATCAATGGCAA CACCCTCTAGATCCTTCGAAGTGATGCCTGTTTGAGTTTTTCTACTGAGTTTGAAGTTGG ATTGAGAGAAAGTTTTGGGTGTATATATAATATATATACCTTGTTTATAGATGTTATGCA AACAAGTATACTATAGCGTCTGGTTAGGAAATAAGGATGGCTGTGATGTTTGATTGGTGG AAGATAATCAAATCACCATCTTGTTTTGTGAATATTCCTTATAATGATTGTGAATGCATC CCTTATATATCCTTGCAATGAGTGAAGTGAAATCAAACCCTGAACCAGAGAGAAGAGAAT TCTTTGATCAGATGTGCAAATCGGACTGTTTTCTAATTTGAACTTTCACTTGAACACATG TCAAGTTTGTAATTGATCGTCAATTGAATGAAAAGAGCAACAATGTAGGAATAGCTAGAT ATCGTGATAAAACTTAATTAGTTGTCACATTTATCATTCATTGTGAGGAGGAAAGTTCGC TTTGGATTATAGCTTCATAGAGCAAGGTTGGGGATATTGGAAATCTTTTATGAGATCGAG TG