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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003405 | Chr6 | 22643163 | 22645241 | - | LOB domain-containing protein 20 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003405.m1 | 43 | 141 | PF03195.17 | LOB | Family | 127.8 | 2.10E-37 |
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>LITCHI003405.m1 ATGGCGGAGCCAAACAATGATGCCACATCCGAAGCCCCGCGAAGGGGTACGGGGAAGCGT GCCGCCGCCACCACCACCAACGTGCCAGTGGAGGTGGTGGAGCCGGTGTCAGCTCCGGCT GCTTCTCCTTGTGGGGCATGTAAGTTCCTGAGGAGGAAGTGCATAAGTGGGTGCATATTT GCTCCCCACTTCGGCTCCGACCAAGGAGCTGCTCGGTTCGCGGCAGTGCACAAGGTATTT GGTGCTAGTAATGTGTCCAAGCTGTTGTTGCACATCCCCGTCAACCGCCGCCATGATGCG GTGGTCACTATCTCCTATGAAGCTCAGGCCAGGCTCTCCGACCCCGTTTACGGTTGTGTC TCCACCATACTTGCTTTGCAACAACAGGTGGCCAGCCTGCAAGCAGAGCTGGCAATGGTG GAAACTCAACTGATGAACAGTAGATTTGCCATGGCAAATGCCCTTCAAAACTCTCAGCAA CACCTGCAACAGCCACAACATCCGCAACATGTTGCAGTGTTGCAGCCAGCATACTCAAAC AGCTCTTCAGCCTCCACCAGCTTCATGAACAACATGAGCAGTTTCCCTTCCAACTTCGAC CTTGTAGCTGACACTGCCGTGCCTTCTTCTCAGAGCTTGGAGCCTCTTCAGATGTCACAG CCTGCTCAAGATGACGAGGATGACGAAGAGGAGAGTCGAATTCCCGTCGGTTTCGCAAAC CATATAATTCACAGGAGATGA
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>LITCHI003405.m1 - Up_Stream_Len 2000 CACCTCATTCATTTTGGTGTTTATAGATGCTTAAATAGTCTTAGATTTTGGGTTCGAGTA TTCTGATCTTATGCATTCAACATCTGCTCATCGTTTGCAATTTTATTTTCTTAGTTGCCA TCTTTTTCTGCACCTTTTTGCCATTGTATTGGCTTAATTATACATTAACGTCATAACTGA AGTCCTCTTGAATAATTATACATTAACGCCATAACTGAAACATATTTTAGTGTCTACTTT GGATATTTATAAAATGCTCTTTATTTCTATAGAAACTGTTTCTAAACTTAGCTTGTTCCC AATAATGTTTACTTGAATAGGTGAATTGTTGACAACAAAAGAAGCAAGAAGGCGGCAACA AATCTATGATGAACGTGCATCTCATGTTGGAGTTTCATCTGCCCTTTTAGTCATCAGGGA GCATCTTCCTTCTGGAAAGGCATGTTTGAGGATGAACATTGATGCCACTAGAGTTGGAAA CGTAGCTCGATTCATTAACCATTCTTGCGATGGTGGTAATCTCTCTACAATGCTAGTGAG AAGCTCAGGAGCTTTGCTACCTCGTCTCTGCTTCTTCGCTTCAAAAGACATAAAAGAAGG CGAGGAGCTCACGTTCAGCTATGGGGAAATCAGGGTCAGTTCAAAGGGCTTACCATGTTT TTGTGGAAGTGCTGCTTGTTTTGGAATTTTGCCATCAGAGCATACTTGATCTCACAGACG TTATGTTTGAATTCTTTTAGTAGAAAGTACTCTAGTCTTCTTGTGAGTGGAATTTGATGT CAAAATCCTAAGAGATTTCACCAACTAACTTCGCGTTGTCTAGTTCCGAATGACTTTCAA CATAACAAAAATCCGACTAATGTGGAGAAAAATTTGGTAGGCTAACACACCCTATTACTT GTGCCGATGTTGACTTAAATCATACAACTTGCTACATGTACATTGTATTGGATGAAAGAG AACTAGAATCTGAAGTTTTTGTTACAGCAAAGACAACCAGATAATCTTTATATATATTGG TTCTTGGTTTGGATTTAACTCTCACTATCTTAAATTGGTACGAGGCGTGTAAGAAACAAT CCTGTTTGTAAGGGTGCAAGCTGGCCATTCACATTGCTAACCGAAGACCACTTTTTCACC TTTAAAATTTATGTGGATTCATGATTCAACAATGGTCAGAATTCCTTCTTCTCAATAATC TTCATTGAGATGCATTTTCAATACTCTAAAAGGGCTTTTAATGAATTTCAAATTTTCTTT TTAAACAAATTAGAATATCCAATTGAAACAAAAGAGAAAATGAACAACAATCAATGCAAG TCTAGTTGGATATAAGCTAGTAGTAGCGTTCCACACGCCACGGGCAGCACAAATCTTGTG CCTGTCCATCAACATACCCTTCTTCTTCCTCTTCTTTCTTGCATGCAAAACCCACCACAC CATGTAACTTAACCATTCTCAACTTTATTATTATTATATTTACATTTCCTAACTCCATCA CTAATTTATTAATTTAATTTAATTATTCTCAACTTTATTATTATTATTGTATATATTTAC ATTTCCTAACTCCATTAATTTGTTAATTTAATACTATTCCCACCCCTCACACTCTTCCCT CTCTCTCTCGCCCACCCTCCAACTCCTTTCTCCTTTTCTCTCTCACACATACACTTTACT CTCATGTATTTACATACACATCTACAACCACCTAAATTTAGTATATATCTAAATTTCTGA TTAGTTCGTTACGTATAATAAAAATCATATCAGTAAAGAATTCAAGTCGGTGCATATACA TATCTACATCTATAATATTCATAACCTTTTAAGGAAAAGAAATACATATTAAAAAAAGCT TGCCACATTGATTTTGCTACCCTTCACGCGACTAACGTGCCATCTTGCAACAGTTAGGCC ATATAAGCACCAACTCCACCACCTTTCTCTCCTGTTCTCTCTCAAAACTTTCCGTCAACC TTATACCCAGCTATATCTAA
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>LITCHI003405.m1 GenomeSequence - ATGGCGGAGCCAAACAATGATGCCACATCCGAAGCCCCGCGAAGGGGTACGGGGAAGCGT GCCGCCGCCACCACCACCAACGTGCCAGTGGAGGTGGTGGAGCCGGTGTCAGCTCCGGCT GCTTCTCCTTGTGGGGCATGTAAGTTCCTGAGGAGGAAGTGCATAAGTGGGTGCATATTT GCTCCCCACTTCGGCTCCGACCAAGGAGCTGCTCGGTTCGCGGCAGTGCACAAGGTATTT GGTGCTAGTAATGTGTCCAAGCTGTTGTTGCACATCCCCGTCAACCGCCGCCATGATGCG GTGGTCACTATCTCCTATGAAGCTCAGGCCAGGCTCTCCGACCCCGTTTACGGTTGTGTC TCCACCATACTTGCTTTGCAACAACAGGTTTGTAACGTAAAGGAATGTAACGTAACGTAA CGTTTATATATATATATATATATATATAATTTTATATCTAAATATTAAGACCAAAACTAG ATAGTAGTTGCCAGCCGACATGTTTGTTGTTTTCTTGTAAGTTTTGATTTTTAATGGAAA TGAATTTAGTACGATATGAAGCTGATTTGAGTATGAACAGGAAGATATGGTTAATTTTCT ACCGCCATATAGTTGATAGTTCCCTAATGATTATCATCTGGAATAGAAATAATTATTTGC TCCATAGTGGTCTCAATTTTGAGGATTTATGCCTATTCAAAATCTAAATAGCGGATTGTA TAATTAAGATAACTAACCATGTGATATATAGTTTTTATGGATATGTATGGGTGAACCTTC TTATTTAATAAAACATATGTGATTTATGATGTATTCCTTCGAATATGTTCCAAGTGTTCT TTATAAGTATCTATTGTAATATTATTGAGATTTATTTGAAAAAGTATCAAAGAGAAAATA CATTTTTGGGTTTCCTTTCATTTCTGGAAAGTAGTTTTACCCGTTTACAACAAATATTAT ATGTATTTTTACTATGGATTGGACGAGGTTTGTCATACACAATCAAATTGGATTTGGTAG TCTTTGGTAATTTCGAAATAAAAGCATTTCAACAACATTAAATAATTAATATTAAGGTTT ATTGAATGAGATCATGTGTAACTAATATTCTACATTTTTGGGTATAAATAAAATAAAGTA ATGATGTATATTATTTTTCGTTCTTTTTCTTCTCTTACTTTATTTCAATTATATTTTATT TTTTAAACCTTTTCTTATAGTAACACAATTCAATGGATATATACTATTCAATATAGTTTT TTAGTCATGATATTTTTATTTTTAAGCCGATTCATTTAGTTTTATAATATTATAAAATAT ATTTAATACCGTTACAAGAGGTGGTAGAAGATACAGACCTTAAAAAATTTTTGGACGTCA TGATCATAAAATCACTTTGTATTGTTGATGTCACATATTTTGACCCATTAATATTCACAA GTTAAAATATGCAGGTGGCCAGCCTGCAAGCAGAGCTGGCAATGGTGGAAACTCAACTGA TGAACAGTAGATTTGCCATGGCAAATGCCCTTCAAAACTCTCAGCAACACCTGCAACAGC CACAACATCCGCAACATGTTGCAGTGTTGCAGCCAGCATACTCAAACAGCTCTTCAGCCT CCACCAGCTTCATGAACAACATGAGCAGTTTCCCTTCCAACTTCGACCTTGTAGCTGACA CTGCCGTGCCTTCTTCTCAGAGCTTGGAGCCTCTTCAGATGTCACAGCCTGCTCAAGATG ACGAGGATGACGAAGAGGAGAGTCGAATTCCCGTCGGTTTCGCAAACCATATAATTCACA GGAGATGAACTTGAGATATGAGATGGTCTCTCTTTTTCTTTAGTTTTCTCTAAAGTAATA ATGTTTTATATGTTTCGATGCTACACAGTTTGACTGTCAGCGTATTTGACGTAGAACTAT CGTTTGCTATATTAAGTTTGAAACGAAATCTGAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGG TTCCTTCAAAATGCATGTTTGCAGTTTGACAAATCGAAATTCGATTTTGTTAGTATCACT GGTTAATTATAAGTTTCTTTTATTTATTTTATTGAGAAA