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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003404 | Chr6 | 22636761 | 22642938 | + | Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003404.m1 | 29 | 58 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 20.7 | 0.00041 |
LITCHI003404.m1 | 154 | 213 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.6 | 2.70E-08 |
LITCHI003404.m1 | 246 | 305 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.4 | 1.10E-06 |
LITCHI003404.m1 | 481 | 747 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 72.6 | 3.60E-20 |
LITCHI003404.m1 | 483 | 747 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 77.6 | 1.00E-21 |
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>LITCHI003404.m1 ATGGCAAAAGCATTGTGTCATTCTGCTGTTTTGGTTGTTACTTTGGTTTTGGTTCAAATT AGTTATTCAGAGCAACTACAGTCCTCTCAGGCTCAGACCCTTGTTAGAATTAAAAGGCTT TTGAATTATCCAACTGTTTTGAAAAGCTGGAATAGCAGCACAGATTTCTGCAATATCGAA CCGAGCTCATCTTTAACTGTGGTATGCTATGAAGAAAGCATTACTCAGTTGCATATTGTT GGGGACAAGGGAGCTCATATGTTGCCTTTGAACTTTTCGATGGATTCCTTTATAACGACC CTCGTTAGCCTTCCAGACTTGAAAGTCCTCACACTGGTTTCTCTTGGTTTATGGGGGCCC TTGGCTGGTAAACTTACCCGTTTATCATCACTAGAGATACTTAATATGAGTTCCAATTAC CTTTATGGAGCCATCCCCCAGGAGCTTTCATCGTTTACTAGCCTCCAAACACTTATACTT GATGAAAACATGCTCTCTGGTCAATTACCAGATTGGTTGGGGTCACTACCGGTTTTGACA GTTTTGAGTTTAAGGAAAAACTTGTTCAATGGCACTTTGCCAAAGTCATTTAGTAATTTG GACAATCTCAGAGTTCTTGCTCTGTCACATAACCACTTTTACGGAGAAGTTCCCAATTTA GATGGTTTGACATACCTTCAAGAGCTTGATTTGGAAGATAATGCTCTTGGACCTCAGGTT CCTAAACTTGGCAATAAGTTAGTTAAATTGGTACTGAGCAAAAACAGATTTAGGTCTGGT ATTCCTGCTGAATTTAGCTCCTATTATCAGCTACAGCGACTAGATCTCTCGTCTAATAAA TTTGTAGGTCCATTCCAGCCTTCCTTGTTGTCCCTACCTTCTATTACTTATCTGAATATT TCAGATAACAAACTCACCGGGATGCTTTTTGACAACCTTTCTTGCAATGCTGGACTTGAA TTTGTGGATGTATCCTCAAATCTTTTGAGTGGACACCTACCAAATTGTCTACTTTCGGGT TCTAAGAACAGGGTTGTCCAGTATGCTAGGAATTGTTTAGCAACTGCTAATGAAAACCAA CATCCATCTTCCTTTTGTCAAAATGAAGCTTTGGCTGTGGGAATCATACCTCAGAGAAAG AAGAGCAAACAAGCTTCAAAAGCAGTACTTGTATCGGCTATATTTGGAGGGATCGTTGGA GGAATACTACTTGCTGGGCTAGTTTTCTTGCTTGCTCGGAAAGTGAATGCCAACAAGACA ATTAGATGGCCTCAAACAAGATCAATAGCAGAAAATGCTACAACTGCGTACACGTCAAAG TTTCTCTCAGATGCAAGGTATATATCTCAAACGATGAAGCTAGGTGCACTTGGCCTTCCA GCTTATCGAACCTTTTCCTTGGAAGAGCTTGAAGCAGCTACGAACAACTTCGACACATCT GTTTTCATGGGTGAAGGTTCGCAAGGCCAGATGTATAGGGGTCGGCTGAAGGATGGTTCC TTTGTTGCCATTAGATGCCTTAAAATGAAGAAAAGTCACAGCACTTGGAATTTTATGCAC CATATAGAATTAATATCAAAACTCAGACATCGCCATTTGGTCAGTGCTCTTGGACACTGC TTTGAATGCTACTTGAATGATTCAAGCGTCAGCAGAATATTTCTTATCTTTGAATATGTT CCAAACGGCACACTACGAAGCAGGATATCCGAGGGACGTGCTCGCCAATCTCTTACTTGG ACACAACGTATAGCAGCTGCAATAGGGGTAGCAAAGGGCATCCAGTTTTTGCATACAGGG ATCGTGCCTGGTGTATATTCGAATAATCTGAAAATAACAGACATTCTATTAGATCAGAAC CTTGTTGCGAAAATTAGCAGTTATAATCTGCCTTTATTAACTGAGAATACAGGAGAGTCT GGTCATGGAACTGCATCTGGATCAGTAGATCCTACCACCAATGCAAGGGCAAAAGACGAA GAAAAGGTCGATGTCTATGACTTTGGATTAATTTTACTAGAAATAATTGTGGGGAGGCAA CTAAATTCCAGAAATGAACTGGATACTCTGATAGATCAGTTACAAGCCGCCATTGCAGCT GATGTAGCAGCTCGACGTAGCATGGTTGATCCAGCAGTTAACAAGTCATGCTTGGATCAA TCATTGAAGACAATGATGGAAATTTGCGTCAGGTGTCTGCATAAGAATCCAGTAGATAGA CCGTCTGTTGAGGACGTGCTATGGAATTTGCAGTTTGCTGCTCAAGTTCAGGATGCATGG CGGGGAGACTCCCAAAGCAGTGAAGGGTCTCCAATTTCACCTTCACAACCACGAGGGCTA CACCTTGGCCTTCGTTAG
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>LITCHI003404.m1 ATGGCAAAAGCATTGTGTCATTCTGCTGTTTTGGTTGTTACTTTGGTTTTGGTTCAAATT AGTTATTCAGAGCAACTACAGTCCTCTCAGGCTCAGACCCTTGTTAGAATTAAAAGGCTT TTGAATTATCCAACTGTTTTGAAAAGCTGGAATAGCAGCACAGATTTCTGCAATATCGAA CCGAGCTCATCTTTAACTGTGGTATGCTATGAAGAAAGCATTACTCAGTTGCATATTGTT GGGGACAAGGGAGCTCATATGTTGCCTTTGAACTTTTCGATGGATTCCTTTATAACGACC CTCGTTAGCCTTCCAGACTTGAAAGTCCTCACACTGGTTTCTCTTGGTTTATGGGGGCCC TTGGCTGGTAAACTTACCCGTTTATCATCACTAGAGATACTTAATATGAGTTCCAATTAC CTTTATGGAGCCATCCCCCAGGAGCTTTCATCGTTTACTAGCCTCCAAACACTTATACTT GATGAAAACATGCTCTCTGGTCAATTACCAGATTGGTTGGGGTCACTACCGGTTTTGACA GTTTTGAGTTTAAGGAAAAACTTGTTCAATGGCACTTTGCCAAAGTCATTTAGTAATTTG GACAATCTCAGAGTTCTTGCTCTGTCACATAACCACTTTTACGGAGAAGTTCCCAATTTA GATGGTTTGACATACCTTCAAGAGCTTGATTTGGAAGATAATGCTCTTGGACCTCAGGTT CCTAAACTTGGCAATAAGTTAGTTAAATTGGTACTGAGCAAAAACAGATTTAGGTCTGGT ATTCCTGCTGAATTTAGCTCCTATTATCAGCTACAGCGACTAGATCTCTCGTCTAATAAA TTTGTAGGTCCATTCCAGCCTTCCTTGTTGTCCCTACCTTCTATTACTTATCTGAATATT TCAGATAACAAACTCACCGGGATGCTTTTTGACAACCTTTCTTGCAATGCTGGACTTGAA TTTGTGGATGTATCCTCAAATCTTTTGAGTGGACACCTACCAAATTGTCTACTTTCGGGT TCTAAGAACAGGGTTGTCCAGTATGCTAGGAATTGTTTAGCAACTGCTAATGAAAACCAA CATCCATCTTCCTTTTGTCAAAATGAAGCTTTGGCTGTGGGAATCATACCTCAGAGAAAG AAGAGCAAACAAGCTTCAAAAGCAGTACTTGTATCGGCTATATTTGGAGGGATCGTTGGA GGAATACTACTTGCTGGGCTAGTTTTCTTGCTTGCTCGGAAAGTGAATGCCAACAAGACA ATTAGATGGCCTCAAACAAGATCAATAGCAGAAAATGCTACAACTGCGTACACGTCAAAG TTTCTCTCAGATGCAAGGTATATATCTCAAACGATGAAGCTAGGTGCACTTGGCCTTCCA GCTTATCGAACCTTTTCCTTGGAAGAGCTTGAAGCAGCTACGAACAACTTCGACACATCT GTTTTCATGGGTGAAGGTTCGCAAGGCCAGATGTATAGGGGTCGGCTGAAGGATGGTTCC TTTGTTGCCATTAGATGCCTTAAAATGAAGAAAAGTCACAGCACTTGGAATTTTATGCAC CATATAGAATTAATATCAAAACTCAGACATCGCCATTTGGTCAGTGCTCTTGGACACTGC TTTGAATGCTACTTGAATGATTCAAGCGTCAGCAGAATATTTCTTATCTTTGAATATGTT CCAAACGGCACACTACGAAGCAGGATATCCGAGGGACGTGCTCGCCAATCTCTTACTTGG ACACAACGTATAGCAGCTGCAATAGGGGTAGCAAAGGGCATCCAGTTTTTGCATACAGGG ATCGTGCCTGGTGTATATTCGAATAATCTGAAAATAACAGACATTCTATTAGATCAGAAC CTTGTTGCGAAAATTAGCAGTTATAATCTGCCTTTATTAACTGAGAATACAGGAGAGTCT GGTCATGGAACTGCATCTGGATCAGTAGATCCTACCACCAATGCAAGGGCAAAAGACGAA GAAAAGGTCGATGTCTATGACTTTGGATTAATTTTACTAGAAATAATTGTGGGGAGGCAA CTAAATTCCAGAAATGAACTGGATACTCTGATAGATCAGTTACAAGCCGCCATTGCAGCT GATGTAGCAGCTCGACGTAGCATGGTTGATCCAGCAGTTAACAAGTCATGCTTGGATCAA TCATTGAAGACAATGATGGAAATTTGCGTCAGGTGTCTGCATAAGAATCCAGTAGATAGA CCGTCTGTTGAGGACGTGCTATGGAATTTGCAGTTTGCTGCTCAAGTTCAGGATGCATGG CGGGGAGACTCCCAAAGCAGTGAAGGGTCTCCAATTTCACCTTCACAACCACGAGGGCTA CACCTTGGCCTTCGTTAGCAGATATAACGAGGAGGGAAAGGTAAAGAACTCGAGTCAACG GAATAATACTAAATGTTCGGATTCATGCTTCATCCTTCGCAGCATGCTGATCATGGTGAA AGATCTGCTATCCACTTCACTCTCCCCCTACCTCATCCTTCTTTTGTCATGTGATCCATT TGTTTTGAAATTGCAGAATCAGCTGTCTATACCAATTTTCAGACAGACAAAATCCTAACC AGCAACTATTATCATATGAATTGATGCTTGTTTCTAATCATCCACAGTTGCTCTCTCTGT CTCACTGAATGATGGATCAATGGTTGCAGATCATGTATCCCCTGAATTGTTTATGTGTCA CATTCATATTTCACGTTGTTGGTAATCTTTACTCTTTTCAGGGGTATCAAGTGTTCTGCA CCCATTGATCTGTATTCAAGTTGTGAGGTGCAGCTGGAAGGATTAGTGTACAAAGTTGTT TTGGTACTACAAGCAGATCTTAAATGTTACCCTTGTCCAATTTTCTTGGCAGGAACTGTT TTATTCATTTTTCATTTTCATTTTGTGTGGATTGAAATCCAAACTTAGGGAAGTATGAGA ATTTTATATATTTTGTCCATATCATGTGGTATGCTGTGGTGGGCACGGTACATCCATTTC ATTTAAGTTTTTCTCTTCTAAAAGTGTTTCTAATAGATTTTTTAATCTATTTTAAAGTTT ATAACCAAAACTGAGAGAGAGAATTTTTTAAAATTGAAATAGTTTAAATACAAATAAAAT ATCTTATTCTTCTATAGGCAATTGTTTCATCTAAACTCACATGCCCTTAAATATGATATG GTAAAATTCAGATTTTATTTGACAAGAAAATCTTCTGATGACGCTTTATTTGGGAGGATT TTAAAATTAAAGCATTTTTAGTCTATTTTATAGTGTTTAATTAGAATTGAGAGAGAGATT TTTGTTTTTTTGAAAAAACAAAGAAATTTGAAAATAATATAAATACAATAAAAGAAGTTT TTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAGAAGACTTTTAAATATATATATATTTAAATAACTACATT TTAAAAGTGAGAAAATAAAAAATTACCTCCTAAAAAAGGAAAAAAATATTTTTTAACTAC AAACAAAATTTCAATAATTTTAAACCACCTAAAGACATTAATCTGCTCAAATACTCCCAA CCCCATCTTCTTCCTCCTTAATTCTCCATCTTCTTGTCCCCATTGATTAAATGTGTCATT CTCCAACTTAAATAAATCTATTCATACTAGTTGTAACATTATATATTTTTATGTGATTTG GTGATTGTTGAACATTGAGTGAAAATTAATTTTGGTAATTAATGCACATTTCCATAAGAA AGGAAAAGGATGTAATTCTAGATTGATGGGCAGTTGGTAATTATTAAAATGCGGTTGCCG GTTCGAGTGCTGCTATCAAGGATCACCAAGGTAACATTGTGGCACCAACTGCTAATTAGT GTGTGCACGATGCTTTAGTCCTGAGACGGGTGAGTTACTGCTCACCAGCACTTAGAGAAG GCCTCATGTTGGCTTGCTCCCTATATCTGCAAGTTTGTGGAGACGGATGCTTCAAATGTA GCTTCGGAAATTAACTCGCATAGTTTATCTCGTGGAGAAGTTAGTATTCCAGTTGATGAT GTCAAGCCCTTTGTAAGGATGTTCGTGTTTGTTTGTGTTAGGTCATTTCCAAAAACTGAC TCATTATCTGACTTCTTTAGTTCTATTAATTTAAAAAGTTGATTGTTAATAAAATGTCAC TTTAAATTGTATATTTAATTAAAAACACATTACACTGTTTTAGAATGGGTTTTTTAGCAA TTTCTAATTTTTGGGAGAAAACTTTTCTTCCCAAAAATATGTAAATTTAAGGAAATCACT TTGAAATCAGACTTTTATTAAGAAATGTACATCCAACATCATTTTATCTCTCTC
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>LITCHI003404.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTTGAGAGACGACTTTGGAATCAGATCACGCCAAACTTTCTTTAATACTACCCTGTTATA CCTTGCAAGTGAATGCAATAGAATGCACCACCATGCATAGCCCATAAGGCACAAACCCAG TGGACGTATGGCCATGGTAGATTCTTGGGTGGGGTGATGTTATCAGAAAGACACCTCTTA TTTAATAATTGTCAAATCAAACATCATTGAAATCGAAAGGCACCAAATCTAATTGTCAAT TGAAATGAAAGAGAGCAATTTGCTATCTATTACTAACTTTTTTTCATAGGCGCCAAAAAC AACCGACCATAATGGGGGTCCACGTTTCAAATCGACAACACCATCGAAAGCCAAAGCTCA CCTGACCCAGAAAGTGAAAGCTTACATTCCAGTCTCTTCCACATCCTCCTAACTTTTGTT TTCCATATAATATCATTTCCTTCCACACCATATTTATGTTGACAAATCAAATAATATTAA ATTTATACTAAATTAAGCGGATTTGCATTGATCAAATTTATATAACTTTGTAAAATTGAT TCTGTAAAGTTACTATATATAATTAACTGTTGAATATGTATAATCAAATATTAAATATGT GTGCAACTACTTAACAGTTGAGTTATTTGCAGCTAAAAGAACAAATAAATGCAATATATA TTATTTTTGATAAATTAATATAAGTAAGATATACGCTTACATATGTCTCTTGATGTGTTA CTGCGGTGGCAGCCACACCACTCGTGAGCTTGCCGGTCACGAGTTCAACACTCATACCAT TAACAAGGGTGGCTAGTTTTCTCCTACTTTTATATGTGGATTGTTTTTTCACTTATGTGT GAATTGCTTTAGTTGTGTTATGTCGGTTTAAGTAATAAAAATTAAAAAAAGAAAGAAGAA AAGATATATGCTTACATAAAGTTGCATGACCAAATCTGTTTGCATGAAATAAAGAAACAA AGAGTGAAAGAGAAGAATAAAGAGTTCTGTTCTTGAAGAATCTTTCTTTTGCCTTTTTTA ATTTTTAATTTTTTTTTGTTTTATAATCACTTTGGACCTGGAAAAAGCTCAAAACAACTA GGAAGATTACGCTACATTTGAAGAAACCATAACCAGTCCATTAGTGTTTCTAAATATTAT CATATTTCACATGGTGAAAATAAACAGCAAATGTCTGTTTCTAGAAATTCTGTTTGTTTA CAAGTTTTCTTGAGGACCCGTGTCACTCATTTGTCCTGGTCTGTGCAGAGAAGCTGAAAA GGAACCTCTTATGTGTCAGTAGGATTTAGTGTGTTGTCCTATTAACAGGAGGTTGAATTG AATGTATGGTTGATATGTTCTTGTAGTTTCATGAAGTTGGGAGGTCAAAAACTAGATTTA TACTACGTTTTATCTTTTTCTTTTCTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTTCATTTTGATCAACT GAAGAAAGTGTGAAGTGGGTTTGGAATTTTTTTGTTTGTATGTTGTGCAGCACTTGCTTG GGGGAATATCTTTATTTCAAAGATAGCATGATTTGGTTGAGATGGTTTCAAGTGACTTAT TGAAGTCTAAGGTATAATTGATCACCAAGCTGTGGACTTAAATTGGCTGTATCTTCTTCC CTTTGTAAATTTCAATCTCTACCTCTCAACAAGTAAGCTTCCTTTTATTTTCCTTCTTTT TTCCTTTTTCAATTTTTTTACAAGTCTCTCTTTTGTTGTGTAGTATGAAAACAATCAAAT GTGTGCAGAATTCATCTATGGTTTGCTTGAAACCCTTAATGATGTGTGTGTGTGTGTGTT TTATTTTTTCTAAATTTTTTGGGTAATGTTTAAATGTTTTGATCTGTGATTTATTCCAAT TGTTTATATATGGTTATGTTTGCAGAACTTGTGTTGGTCTTGTTCTGGACATGAGCTTCG TTATTTGAGAAGCTAGACATTTGTGTTAAAGCTCTATACAACTTCTGAGATTTTCTCTGG TGCTTATTCTCTAACCATAG
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>LITCHI003404.m1 GenomeSequence + ATGGCAAAAGCATTGTGTCATTCTGCTGTTTTGGTTGTTACTTTGGTTTTGGTTCAAATT AGTTATTCAGAGCAACTACAGTCCTCTCAGGCTCAGACCCTTGTTAGAATTAAAAGGCTT TTGAATTATCCAACTGTTTTGAAAAGCTGGAATAGCAGCACAGATTTCTGCAATATCGAA CCGAGCTCATCTTTAACTGTGGTATGCTATGAAGAAAGCATTACTCAGTTGCATATTGTT GGGGACAAGGGAGCTCATATGTTGCCTTTGAACTTTTCGATGGATTCCTTTATAACGACC CTCGTTAGCCTTCCAGACTTGAAAGTCCTCACACTGGTTTCTCTTGGTTTATGGGGGCCC TTGGCTGGTAAACTTACCCGTTTATCATCACTAGAGATACTTAATATGAGTTCCAATTAC CTTTATGGAGCCATCCCCCAGGAGCTTTCATCGTTTACTAGCCTCCAAACACTTATACTT GATGAAAACATGCTCTCTGGTCAATTACCAGATTGGTTGGGGTCACTACCGGTTTTGACA GTTTTGAGTTTAAGGAAAAACTTGTTCAATGGCACTTTGCCAAAGTCATTTAGTAATTTG GACAATCTCAGAGTTCTTGCTCTGTCACATAACCACTTTTACGGAGAAGTTCCCAATTTA GATGGTTTGACATACCTTCAAGAGCTTGATTTGGAAGATAATGCTCTTGGACCTCAGGTT CCTAAACTTGGCAATAAGTTAGTTAAATTGGTACTGAGCAAAAACAGATTTAGGTCTGGT ATTCCTGCTGAATTTAGCTCCTATTATCAGCTACAGCGACTAGATCTCTCGTCTAATAAA TTTGTAGGTCCATTCCAGCCTTCCTTGTTGTCCCTACCTTCTATTACTTATCTGAATATT 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