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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI003341Chr62169962221710243+Casein kinase 1-like protein HD16

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI003341.m1143383PF00069.28PkinaseDomain61.39.80E-17
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LITCHI003341.m4252352PF17667.4Pkinase_fungalDomain33.52.00E-08
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>LITCHI003341.m1
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GCGGGAACAGGTTTCACTCACCAGGTCTATGATATGTCAGCTGTCTTTCTGCACAAGGAT
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GGGAGTTCTTTGGTTGTTATGTCCAAAGGAACTCCTTACACTCAGCAGTCCTATAAAGTC
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GAACAGGTGGTGGAACTGGACTTTTTATACCCAAGTGAAGGCATACATCGACGATGGGAG
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GTACCTAGGCGTAAAATGGTGGATGAAACACAAGAAACTCTGCGTACTTCTGCCTTCCCA
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AATACTTTGAATGGGTGTTATGGAATTCCGTGGGTACATTACAAGGGCCGCCAAGGAGAT
TTCTATATTTTGGTCATGGACATGCTTGGCCCCAGTCTTTGGGATGTTTGGAATTCACTG
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GAAAAGCTTCACTTGAAGGGGTTTGTTCATGGAGATGTAAAGCCAGAAAACTTTTTACTT
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GATGGTCTATTTATTAGCTGTGTAGCGTCTGCATCTAATCTTTGGGCCCTAATCATGGAC
GCGGGAACAGGTTTCACTCACCAGGTCTATGATATGTCAGCTGTCTTTCTGCACAAGGAT
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GGGAGTTCTTTGGTTGTTATGTCCAAAGGTAGGCAACTATTTGCTCTGACTAAATACTAT
TGA
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CCTTGTGAGGTTCTTCCTGAGGCTGCTCCTTTGAGGGCTGCTGAACCTGCGTATAATCCA
GTGGAGGTGGTCGCAGATAAAGATATCGCCATGGAGGGTGGAAGTGCTGAGAAACTAATG
GGAGTTGAAGAAGAAGCAACCACTACCCCTGTTCCTGAGAGGGTTCAAGTCGGTAGTTCT
CCTGTATATAAGATTGAAAGGAAGTTAGGTAAGGGTGGTTTTGGCCAAGTTTATGTTGGA
AGAAGGGTACATGGTGGTAGCGATAGAACTGGACCGGATGCAATTGAGGTCGCCTTGAAG
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AATACTTTGAATGGGTGTTATGGAATTCCGTGGGTACATTACAAGGGCCGCCAAGGAGAT
TTCTATATTTTGGTCATGGACATGCTTGGCCCCAGTCTTTGGGATGTTTGGAATTCACTG
GGACAATCGATGTCACCAAATATGGTGGCCTGCATTGCGGTGGAAGCAATATCGATTCTT
GAAAAGCTTCACTTGAAGGGGTTTGTTCATGGAGATGTAAAGCCAGAAAACTTTTTACTT
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GGGAGTTCTTTGGTTGTTATGTCCAAAGGTAGGCAACTATTTGCTCTGACTAAATACTAT
TGA
>LITCHI003341.m4
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AATACTTTGAATGGGTGTTATGGAATTCCGTGGGTACATTACAAGGGCCGCCAAGGAGAT
TTCTATATTTTGGTCATGGACATGCTTGGCCCCAGTCTTTGGGATGTTTGGAATTCACTG
GGACAATCGATGTCACCAAATATGGTGGCCTGCATTGCGGTGGAAGCAATATCGATTCTT
GAAAAGCTTCACTTGAAGGGGTTTGTTCATGGAGATGTAAAGCCAGAAAACTTTTTACTT
GGTCAGCCTGGATCACCTGATGAGAAGAAGCTATATCTTATTGATCTTGGTTTGGCTTCT
AGATGGAAAGATGCATCATCCGGCCTACATGTTGACTATGATCAAAAGCCTGATGTGTTC
AGGGGAACAATAAGGTATGCAAGTGTACATGCACATTTAGGTCGAACTGGAAGTCGAAGG
GATGATCTCGAGTCATTGGCATACACTTTAATATTTCTTATAAAGGGGAAATTACCATGG
CAGGGTTATCAGGGGGACAACAAAAGTTTTCTCGTTTGTAAGAAAAAGATGGCCACTTCT
CCGGAGTTGATGTGTTGCTTTTGTCCTGCCCCATTTAAGCAGTTTCTTGAAGCTGTTACA
AATATGAAGTTTGATGAGGAACCCAATTATGCCAAATTGATATCATTTTTTGAAAGCCTG
ATTGAACCGTGCACATCATTGAGACCAATCAGAATTGAAGGAGCTCTTAAGGTTGGACAA
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TTAGGTAGTCCTGCTACTCAGTGGATTTCAGTTTACAATGCACGCCGTCCCATGAAGCAG
AGATATCACTACAATGTGGCTGACTCAAGGCTGCGTCAGCATGTAGAAAAGGGTAACGAA
GATGGTCTATTTATTAGCTGTGTAGCGTCTGCATCTAATCTTTGGGCCCTAATCATGGAC
GCGGGAACAGGTTTCACTCACCAGGTCTATGATATGTCAGCTGTCTTTCTGCACAAGGAT
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CGGACCGTTTGCTAA
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>LITCHI003341.m4
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TTCATCACCATAACCATCACACACATCACAACACAAACACACATTCATATTTCAGACACA
ACGCAACGCACATAAAAGCCTCATCTTCCAACCCAAATCTTCCTACCTATTAACAATCTC
AATCACTTTCTTTATCAACAACATTCCTGTCTCCTTCTCTCTTACATAAATATATATATA
TATATATCCTCTAAAATAAAAATTTTAAAAAAAATATCTACTTCTATAGACAACCATAAA
CAAAACGACCCTCCCTTTACTTTTCTTTTTAATTTTTTTTTTCTTTGTAGAAATGCATAC
AGTGATGATGATGAAGAGGATCTAACCAAGATCGGTCGTGGTTTTTTATGTTTTGATGGG
ATCGATCTGTGAGTATTTGCTTTTGTTGGTTTTGTGGGGTTATATTTTGTGAATATTGTT
TTCACTTTTTAGAGTTTGTTTGATGATCGGTTTGTTTCTTGCTTGTTTTTGATGATCGGA
GTATAGATTGTTTGTTTAGTGATGTTTTGAAGCATGAAAAACATAATTATATCTGAAGGG
ATATTTGGGGGACGGAGTGGAATGTAATTTGCATGGGCTGACGATGCCAGAATTGAGAAG
TGGAGCCCGTAGATCGAAGCGCCTTGATGATCTTCAGCCTCCTCCACAACCAGTCGATCA
AGTGGAGAATTGGTTACTGCCTGCTCAGAACAGGACTAGAAGGAGAGTTGGAGGTGGGAG
AGGAAGGGGTAATGCCGCAGCTGTAGGGAAGCCAGGAATACCCACAAGGCCAACTGCTGC
TGGTAGAGGCCGGGGCATTCGATTGATCAATTTAGATCCAGAGCCTTGTGAGGTTCTTCC
TGAGGCTGCTCCTTTGAGGGCTGCTGAACCTGCGTATAATCCAGTGGAGGTGGTCGCAGA
TAAAGATATCGCCATGGAGGGTGGAAGTGCTGAGAAACTAATGGGAGTTGAAGAAGAAGC
AACCACTACCCCTGTTCCTGAGAGGGTTCAAGTCGGTAGTTCTCCTGTATATAAGATTGA
AAGGAAGTTAGGTAAGGGTGGTTTTGGCCAAGTTTATGTTGGAAGAAGGGTACATGGTGG
TAGCGATAGAACTGGACCGGATGCAATTGAGGTCGCCTTGAAGTTTGAGCACCGAAACAG
CAAAGGTTGCAATTATGGGCCTCCTTATGAGTGGCAAGTCTACAATACTTTGAATGGGTG
TTATGGAATTCCGTGGGTACATTACAAGGGCCGCCAAGGAGATTTCTATATTTTGGTCAT
GGACATGCTTGGCCCCAGTCTTTGGGATGTTTGGAATTCACTGGGACAATCGATGTCACC
AAATATGGTGGCCTGCATTGCGGTGGAAGCAATATCGATTCTTGAAAAGCTTCACTTGAA
GGGGTTTGTTCATGGAGATGTAAAGCCAGAAAACTTTTTACTTGGTCAGCCTGGATCACC
TGATGAGAAGAAGCTATATCTTATTGATCTTGGTTTGGCTTCTAGATGGAAAGATGCATC
ATCCGGCCTACATGTTGACTATGATCAAAAGCCTGATGTGTTCAGGGGAACAATAAGGTA
TGCAAGTGTACATGCACATTTAGGTCGAACTGGAAGTCGAAGGGATGATCTCGAGTCATT
GGCATACACTTTAATATTTCTTATAAAGGGGAAATTACCATGGCAGGGTTATCAGGGGGA
CAACAAAAGTTTTCTCGTTTGTAAGAAAAAGATGGCCACTTCTCCGGAGTTGATGTGTTG
CTTTTGTCCTGCCCCATTTAAGCAGTTTCTTGAAGCTGTTACAAATATGAAGTTTGATGA
GGAACCCAATTATGCCAAATTGATATCATTTTTTGAAAGCCTGATTGAACCGTGCACATC
ATTGAGACCAATCAGAATTGAAGGAGCTCTTAAGGTTGGACAAAAACGTGGACGATTGCT
CATAAATCTGGAAGAGGATGAGCAACCAAAGAAAAAAGTACGGTTAGGTAGTCCTGCTAC
TCAGTGGATTTCAGTTTACAATGCACGCCGTCCCATGAAGCAGAGATATCACTACAATGT
GGCTGACTCAAGGCTGCGTCAGCATGTAGAAAAGGGTAACGAAGATGGTCTATTTATTAG
CTGTGTAGCGTCTGCATCTAATCTTTGGGCCCTAATCATGGACGCGGGAACAGGTTTCAC
TCACCAGGTCTATGATATGTCAGCTGTCTTTCTGCACAAGGATTGGATTATGGAACAGTG
GGAAAAGAATTACTATATTAGTTCTATTGCTGGTTCAAGTAATGGGAGTTCTTTGGTTGT
TATGTCCAAAGGAACTCCTTACACTCAGCAGTCCTATAAAGTCAGTGAATCTTTTCCTTT
TAAGTGGATAAATAAGAAGTGGAAAGAAGGGTTTCATGTCACATCCATGACGACTGCTGG
CAATCGCTGGGGTGTGGTAATGTCCAGGAACTCTGGATATTCTGAACAGGTGGTGGAACT
GGACTTTTTATACCCAAGTGAAGGCATACATCGACGATGGGAGAGTGGTTACAGGATAAC
ATCCATGGCTGCCACTACTGATCAAGCAGCCTTTATACTGAGTGTACCTAGGCGTAAAAT
GGTGGATGAAACACAAGAAACTCTGCGTACTTCTGCCTTCCCAAGCACCCATGTAAAGGA
AAAATGGTCCAAAAATCTCTACATTGCATCGATATGCTATGGACGGACCGTTTGCTAATT
TATGGAAGTCTACATGTGGAATTTCCCCAACATCATTTTGAAGTTCAAATTTTGCAAGCT
GAGAGGGTTACTTTCATACATAATTGCGGATGTGGGTGGTTTAGCTTTTGTCCTGCAAGT
TAAATGAAAGTCCAGGACTCTGATAAACAATCCTCATATATGAATGTAAAAAGGAAAAAT
GAAAACCAAAGAGAGACAGTACAAGCTGAAAAACAAAAAAGAAAAAAAAATCAATAGAAT
CGAGTGTTGGAAAGCATATATGTCCACAACCAACATGAGGAAGTGGGCAACAGTTGGTTT
GATAACATAAAAATATGTGATGGTAACCTGGCCGTTGCAGCCAAGTTGTGCTTTCTTGTC
TTAACTGTTGTTGTGCCTTAATTTATTATAAATGGAGAATAAGTAAATTCCATTACAGAT
TACCATCTTCTTTAATGTGTTTTTGTTTGGGACTGGTTCTAATATCAACCCAAGAAAGGA
AGTAAATTGGAGTGAAAATTGCTAAAATGAGCCTTCTAGAATGGTTTTTTTATTATTTTT
TATTTTTTATATTTACATGTAATATTAAAGTTTGAGGAAAAACCATTAAAAACTTCGCAC
TTCTCGTTTTTTCCAACATTTTATGCAACAAAACAAGAAAAATTATTGTAGTTGGTGAGT
GATGTAGTTGACACCATTCCTCTAT
>LITCHI003341.m3
AGAAAAGAGAGAGACTCACGCCCACATGTAACACCACCCCCCACCTCCACCACCTTCAAA
TTCATCACCATAACCATCACACACATCACAACACAAACACACATTCATATTTCAGACACA
ACGCAACGCACATAAAAGCCTCATCTTCCAACCCAAATCTTCCTACCTATTAACAATCTC
AATCACTTTCTTTATCAACAACATTCCTGTCTCCTTCTCTCTTACATAAATATATATATA
TATATATCCTCTAAAATAAAAATTTTAAAAAAAATATCTACTTCTATAGACAACCATAAA
CAAAACGACCCTCCCTTTACTTTTCTTTTTAATTTTTTTTTTCTTTGTAGAAATGCATAC
AGTGATGATGATGAAGAGGATCTAACCAAGATCGGTCGTGGTTTTTTATGTTTTGATGGG
ATCGATCTAATTATATCTGAAGGGATATTTGGGGGACGGAGTGGAATGTAATTTGCATGG
GCTGACGATGCCAGAATTGAGAAGTGGAGCCCGTAGATCGAAGCGCCTTGATGATCTTCA
GCCTCCTCCACAACCAGTCGATCAAGTGGAGAATTGGTTACTGCCTGCTCAGAACAGGAC
TAGAAGGAGAGTTGGAGGTGGGAGAGGAAGGGGTAATGCCGCAGCTGTAGGGAAGCCAGG
AATACCCACAAGGCCAACTGCTGCTGGTAGAGGCCGGGGCATTCGATTGATCAATTTAGA
TCCAGAGCCTTGTGAGGTTCTTCCTGAGGCTGCTCCTTTGAGGGCTGCTGAACCTGCGTA
TAATCCAGTGGAGGTGGTCGCAGATAAAGATATCGCCATGGAGGGTGGAAGTGCTGAGAA
ACTAATGGGAGTTGAAGAAGAAGCAACCACTACCCCTGTTCCTGAGAGGGTTCAAGTCGG
TAGTTCTCCTGTATATAAGATTGAAAGGAAGTTAGGTAAGGGTGGTTTTGGCCAAGTTTA
TGTTGGAAGAAGGGTACATGGTGGTAGCGATAGAACTGGACCGGATGCAATTGAGGTCGC
CTTGAAGTTTGAGCACCGAAACAGCAAAGGTTGCAATTATGGGCCTCCTTATGAGTGGCA
AGTCTACAATACTTTGAATGGGTGTTATGGAATTCCGTGGGTACATTACAAGGGCCGCCA
AGGAGATTTCTATATTTTGGTCATGGACATGCTTGGCCCCAGTCTTTGGGATGTTTGGAA
TTCACTGGGACAATCGATGTCACCAAATATGGTGGCCTGCATTGCGGTGGAAGCAATATC
GATTCTTGAAAAGCTTCACTTGAAGGGGTTTGTTCATGGAGATGTAAAGCCAGAAAACTT
TTTACTTGGTCAGCCTGGATCACCTGATGAGAAGAAGCTATATCTTATTGATCTTGGTTT
GGCTTCTAGATGGAAAGATGCATCATCCGGCCTACATGTTGACTATGATCAAAAGCCTGA
TGTGTTCAGGGGAACAATAAGGTATGCAAGTGTACATGCACATTTAGGTCGAACTGGAAG
TCGAAGGGATGATCTCGAGTCATTGGCATACACTTTAATATTTCTTATAAAGGGGAAATT
ACCATGGCAGGGTTATCAGGGGGACAACAAAAGTTTTCTCGTTTGTAAGAAAAAGATGGC
CACTTCTCCGGAGTTGATGTGTTGCTTTTGTCCTGCCCCATTTAAGCAGTTTCTTGAAGC
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>LITCHI003341.m1
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GAAAAATTATTGTAGTTGGTGAGTGATGTAGTTGACACCATTCCTCTAT
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>LITCHI006336.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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AAAAACTCTTTTCTCTCTTC
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