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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003227 | Chr6 | 20208421 | 20210692 | - | Upstream activation factor subunit UAF30 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003227.m1 | 69 | 140 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 98.1 | 2.00E-28 |
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>LITCHI003227.m1 ATGTCGTCAGCTGCGGCCAGGGTTTTCAACGGCTGCCGAGCCCTCTTGGCGCCTGCCAGG GCCGCCTCCACCTCCGCAGCCACCAAAAAGAAAGCAATCACAACCACAACCACAGCAGCA GCAGCAGCCAAAAAGCCGAGAGCCAAATCTCCACCCAAGGGCAGAGCACACACCCCCAAC CGAAGCGCTGGAATCTTCAAGGTCCTGCCCGTCTCTCCTGCTCTCGCCAACTTCGTAGGA GCCTCTGAAGCCTCCCGTGCCGAGTCCGTTCGCCAGATCTGGTCCTATATTAAGACCCAC AACCTCCAGAACCCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTTAAGGCAATC TTTGATGGAAAAGCTGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGTCATTTT GTGTAG
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>LITCHI017696.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGGAAGCTGGAAGCTAGAAACCCATCAAATGATAACGACTAAAAACCCTAAACAAATCC ATCGATGGCAACCCATCACACTTGCTCACACCCACCCATTAAACACATCTATCAAACATC AAACGACGGCAGATGGGGAAGAAGAAGAGGTCAAACATCAGCAAATGGGGAAGAAGAAGA GCAGTGGGTCGGTGATAGGGACGAAGAAAAAGTAAAGGTTGATAGTGTGTGTGTGTATGT GAGAGAGAGGGAAAGAGAGAGAGAGAGGGACAGGGGTGGCTGAAGCTAAGGGAAGAAATG AGATGTTTTTTTTTTAATCAGTTGATCTCCATTGGTTATTTTAAGATGAACAGTGGAGAT TCAATGAATTTTTTTATTTAAATTTAAAAATTAAATTTTTATTACTTTTTTAATCATTTA ATTTTTAAAATAAGGTTAAAAGACTAATTTACTAATTTTCCTCTCATTTAGTTAATTTTA ATAGAGAGTTGCTAATAGCAGGGGATAAATTGTAATGACATCGAAAAAAAATTTTCACTC GAATAAAAGTTTGAACTGAGTAACTAAATTGTAATTTATTCGATATAATAAATACAACGT CAGATATAATAAAATATAATCAATAATTTTATAATACAATCATTTATTTGTAATTATCAA ATATATTAATGTCAAATATACTATAGAACGTGTATATATATATATGTTTGCGCATGGGTC ACAAGTTTAAACATTTATATCTTTCAAAAAAAAAAAAAGTATATAAATTTATAGACTCAC TTTTTTGAGCTTTTTATGGGAGGAAGCCATGGCCCATGTTGGGTCCAGTCTCACCCGCTA ATTCTAATGATGATCATTTTCCAAAATTTAAAGTCGCGACAATACAATGAAGCACCAAAA ATCCCATACTTGTTTGAAGCACTTGATTTGATACTCGTAGATCACCTCTTCTTTCTAATA ATTCAGACTAAAATCTTTGGGAGCAGACAATACTATACCGTATCCCTATCTCTGCAATGA ACCAGAGTCCAGAAATAAGAAATACATTAGAAAATGAGCAGACATGGGTTCCGTCGGTCT GCCTTCGCTTTCTTATAGAGAACTAGCAAGTTGAATGTTTCTGCAAAATATAATATTAGT ATATAAAATCTCTATTCTTAATAATTCACGGAGAGATGTTTTTAAGTATTTACAGAATTA GATATCTTTCAATTATAAAAATGAATTCAATCTTCATCATAAATAAATAAGAACATACGT AGAGTAAAAAAATAGATATTCGAATTGCTTATGTAATACTTAATTTTAAAATTTTTATTA AATATCAACAAAATTATGATCATTCGGTGTCAATCTCTAGAATTGTTTTTGGAACTACAA TTTCTAAAATTTATTAGTCCTATAGTCATTCTGTAACACTATGTTCACCAAAATGCAATT TCCATTTTGTGAAAAGAAGAAAGATATTAGCTAGAATGAAGAGCCAATTGACTTCATAAT GACCAAAGCAGCATGCATTATTGATTGTCGTTGGCAAGCAGTCAGGGCGAAAGGTCAAGC TGAAACCGCGTTCAATTTTTAATATGGCGAAAGTACTTCACATTTTGCTATTTTGAAGTC ATTTATATATGCAGAAAAAAACTGCCAGTGGCCCACTTAGACTGCAGAAGGAAGGCATGA GAACTTCGTGCAGTCGACATTGACTGGGCTCTCTCTCTCACTCTGTGTCTTAACCACCAC GTAACAGACAAAGAAATTCCGATTATCTTTTAAAAATAATTTTAAACCAACAACGGAAGA GTCAAGACGAAGTCAAATTTCGAGATGTTCTTATCCATCTTTATAATGACCTTGTAGTAA CACAAACACATACGCACACCCACCAGTCAGTTGTTAAAGTTGTGTGTGGTAGTTCACAAA AATAGCTAAACAAGCTCCGCTCTTTACTGTCTTCTTTTGTGTTTAATTTGTTTGTTGGTG TGGATGAGATATCAGTGAGA
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>LITCHI005483.m1 GenomeSequence - TATGTCTCATATCATGAAGTTTGTCAATCAAAGTAAGCAAATGCTGCAAACCGAAGATGG AGCAGAAGGGATTCTCTTTCTCTTGAAGCCAGCCAAAAAGCCAAGACCAAACCTAGTACT TTTAATCAACCCTTTTAGGTGGACAACGCGTCTGACCGGGAACTTCGAAAGAAGAACATT GATGGGACGGTCGTTGGAACAATCTGCCATAGCTACAGTCCAAGATTCAAGTATTTGGGC TATGGCCCACTAGCAATTTGGTTTGGCCGATTAATTGGCGACATTGTTGGGGAAAGCTTA TTAATGTTGAATACAGTTTTTGCATTATGAAACGCAACTGCTCTTGTTGGTGTGAAAAGA CAAATAAAGAATCATCATATTTCTCCTTCACTTTTTCCTCCACAGTAGAAAATTTTCACA TTTATGTACATTGATGGAACTAATGCATTGATAAGAGTCATCGAGAGCTTTTAAATCCTG GAGCCACATGAAATTTCTACCCTCTTACAGTTTTATACAAAACTTTGAAACCATGGTACG TTACCATGGACATAATTAGTGTTTCTCACAAGATGATAAAAAGGGCTTGCTTTTCTTGCA TTAACAATCTGGTCTCTTCAAATTTTATAAACATTTGTACAGTATTGTTTGTCCTCTTTA CATATATATATGAATTAATGTAGTCATATATATATATGTATGATTTGATGGTTCTCTGTT TCTTCATATTTTGAATTTAAAGATTTATTTAGTGCATAATAATGAACCCTAGCCTACATG TTGAAAACTATCACCATCACTATCACTACAATCGCATTGTCTTTAAATCAGAAAAGTGGG AGAGAGTAAATGTGAGTAGAGAAAAAACTCGAGAGAAGGCCAACATGGATTGTATGTAGA AGAAGAGATCAAGAGCTTGAGAACCAGCATTTAGAGGGAGGAGTTTGGTGCGCTATTCTA TGCATCTCTCCTTCTTTGCCGGTTTTTTGTCTGCTTCATTCCCAAACACGCCAAAATCAA CATACAACACGTCGATTTCTTTTACCTCCACGTGCTCTCCCTCAAGCAAACAAACCCTTA TTTTGAAAAACCATTAGTTGGGCTATATATATACCTAGCCATAACATTTAACATTTCTTT AGAATTAATTGTCTTCCTTTGCTCGTCCCCACTTTATCTTCTAGCTCCAAGAATCCACCA AAAAACCAAAATTCCTCTCTCTGACTCTCTCACTCATCGATACAAATAACCATGCAGCAT AACCCTACCTTCACATACATATCATCAAGTACTACTACTGAGAGTGCTTGTTTGGAAGCT GATCATGATCGTCATCATCATCATCGTCAAGAAGATGAGGATTCTATTATTCTTTCTCTT GGGCCTCCTGGTCAGTATGTCTCCAATCACCACTCCTCCTCAACCCCAACTCAACAACAG ATATCTACGGAAAGTGGTGTAACTATAGCTCTTCATGCAGGTCCACCACCAACCACTGAA GCCGCAACTACCAACTCTTCTAATATTGGTAATCTAGTTCAAGGACTACAGTACTGGATT CCTTCACCAGAACAAATCCTTGTTGGCCCAACACAGTTCTCTTGTGCTGTCTGCAACAAA ACATTCAATAGATACAACAATATGCAGGTCTCCACAATAACAACAATAAGTACAACAGTA GTTTACTACTGAATTTTTTGTATATATATGTAGCTTAATTATGTTGGTTTCTCCTTGTTT AATTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTGGTTTTATGCATAGATGATCCTTTTGCTAATAA TTACATATAATTTTGTTAATTACTGTCTTGTACAATTGTCTATGTAGATGCATATGTGGG GGCATGGTTCACAGTACAGGAAGGGACCAGAGTCACTACGAGGGACAAAAACAGCATCTT CGATGCTAAGACTGCCTTGTTATTGCTGCACTGAGGGTTGTAAGAACAACATAAACCACC CAAGATCAAGACCGCTCAAGGATTTCAGGACACTACAAACACATTACAAGAGAAAGCATG GAACCAAGCCATTTAAGTGCAGAAAATGCGGGAAGCCATTTGCTGTTAGAGGGGATTGGA GAACTCATGAGAAGAACTGTGGAAAGCTTTGGTTTTGTATATGCGGGTCCGATTTTAAGC ACAAGAGGTCCCTCAAAGACCACGTTCGAGCCTTTGGAGATGGCCATGCACCTCATACTT TAGAGATGTGTGAAATTGAAGTAGAAGAAGAGGAGGAAGAAGTCGAGGAAGAAGAATAAG GTGGAATTAACAATGAGGAGGATGAAAATGGAGTGAGTGCTTTCTCACTGTTTTGTTCTA ATAATTAAAGAATTGATTAGAAAATGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGGATGAGGACAAACAATACAGTGAAAGCCAAGGTTGTATGCATTTAATGTTTAAAGTG CCAGTTCGATTATGTAATATCAAAGGACCTGTTGGTTATACCTTTGTTGCAAAAAATGTG CACACATACACAAATTTACATTCACATGGAAGAGAGAGAGGGAGGGATAGAGTTACTTAC AATTTGCCATAATTTAAAAAGGTGGTCAAGTAAATTCAGTGATGACTGCAGAGGGGAGCA GACATGCAGACATGTACAGTGGAGTCACAGATTCTACTGTTCAAAATAGCTTTACAATTG CCATACATAGCGCGGACTCGTTCTTTCTCTCTCTCTTTGGTTATACTCAAGTCTCTCTGA GCTTCGACTACCACTACAAACACTTTGATCGAGCACTTGTCAGTAAGTGTAACAAGGGAC CACTGATTTTTTACTGTTTTTGGGGTTTCACCCAAGGAGCTGCCTTTTTCCTTTTCAGAC TATCTACAATCAGACATTGCCATGCATTTTCAGACCCCCTTTAATCCTCTTAATTTACAG TTTTAATCTCCATGTCTCCTTCCTCTCTATTTATTATCTCTTCGCCTTTTTTGTTTTCTC TTCTTATCACTCTTGCACTGTTACTGTCCGTGATCTATTATTCATTTTTGTCTCAACGCT GCTCCTCCCACCATCTTTATACCTACCGTTATTATTATTATTCATCTTTAGAGATTTAGA GTAATGTGTTTCATTATTATTAATATTATTGATATTATAATTTTTTGCTTGAAGG >LITCHI005483.m2 GenomeSequence - 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