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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003207 | Chr6 | 20024878 | 20028202 | - | UPF0481 protein At3g47200 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003207.m1 | 17 | 373 | PF03140.18 | DUF247 | Family | 314 | 1.90E-93 |
LITCHI003207.m1 | 380 | 415 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 39 | 5.70E-10 |
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>LITCHI003207.m1 ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGAATATTTAATCTTAAC CCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGCAATCTTTGATGGGAAA GATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCATTATGTGTAG
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>LITCHI003207.m1 ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGAATATTTAATCTTAAC CCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGCAATCTTTGATGGGAAA GATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCATTATGTGTAGATCACT GACTTCTGTTCCTAATATGACTTTTAGGTGCATGAATTTGAATTACTGTCTCGACATGTA AATGGGCGAGCTCTCTTTACTTTTCTCCCAAATATTTTAGGGTGTGATTTTTCTAATATG ACATGAACCCTCAAAACAAAGGAAGTTTATTTGGTATTGTGCTTCCGCCAATACCAGCCT CACTTAACTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTTCCTTAGTACAGCCTAGCTCGTACATATGC CAGATAACATGATAAAACTGAATTAATGAAGACCTCTCATTCAATCATACCCACCTCGAA ATTTCTTTTATATTTTTGGGAAACCTTAGATGTTTGCAGAGATAAGAACAGCATGTAAAC ATCTTGTGCATTTCAATTACAAAGTTTATGATGATTGGATGGTGCCCTTTACGCGAATAT ATGTACAGTTTATATTACTTCCGATCTGGATAAAGTCGGAGTAGTCGCATTCCAATGTAG AGTCAGTAGTTCAGGTCATGAAAATTCCAATGTCACTAGATGAAATTGGTTTTTCATAAA AACGTTGTTGTAATACATGTGAAGCTTTTCTCCCCATTTGCATGACTCAATAGCAGAAGT TCTCCTGGTGTCCTAAAAGAGATGTTTGCTTCTTTAAGTTCTAGAAAACAAAATGAACAT GAAAGACTAGATAATGTAAAACAAACCTAAAGGTAAATAGGTCACCAAAAAAATGTCAAC ATTTCATAGATTAACCTATAAATAAATGGGCTATTTTCTAATTTTGTTCCAAGTATCTGA ATGCTGACTAGTCGAGGAGATTGTGTATCCATTTTTCTACAACAGTTGGAGAACCATACC ACGGTCTCAATGCATTGTCTGGGCTACTGGTGAGTGATAAACTCCATCTAAGCTTATGTT TAGTGCTCTTTCTAGATGCATAGATACTTCTGGTACAACTCCATCACCTCATACATCTGC TTGTCCACAGACCTGATAATGCAAGAAAACAGAAATAACTTTAAAGAGAACACAGAACTC AACTTTTACGAAAAATGGCATGATTTTTGTTAAATGTGTGCAAGAAGCCTGGGGAAGTGA CTTAACAACCTGCTTGTAACTTTGCCCAACTATGTGAGCACGATAAGTTGAAACTGATGT TGGATTGGTCTTATTGTTTACAATAGCAACCTCAGAAGTTGGTTGGTCAGTGTCGATGGC CATGACAGGATCAACATCAATATTTGAGTTTCCAAAGAAGTGAGCACCCCCAATGTACCT GCAATTTAC
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>LITCHI003207.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTGTATTTGACATGGTAATGTTTTATTAGTTGCAGTTTCTATAGTAATAGCTTTACAATG AATAACATTCAATAACATTTGATAAAATTTATATATGAGATTTAGTTAGTCTTGTCGGTA TGTTCATTGTGTGATGATTTATTAATACATCTTAGTTATAAAAATTATCAATGTGAACCA TACCTTTGTTGTTAGATCAAACTTGAGACCAAACTTTAGAGGAAGTTAGTGTAATTTATT GTGCCATAATAGTTAAAGAACATGTATCTTTAAATTAGAAAAATATTTGAAGTTCATCTG GGATTTAACACTGAAATAATAGTGTTTTCTCTTATTAATGAATATTAATTACTTCTATTG AAATAACTTATACTTAAAAGTGTATTTCAAAAAAGCACTTCCAAGATTATTTTTATCATT TGGAGTAAGGATTTTCTGTTAATTTCTTATTTTTACTAAGCTTTTTACGAGGGGAATTTT AGTTTGAATGATGTATGAGAGATAAAAAAAATATAACAATCTTGATTATCCATTATCTAT GGGAGTAGGAATCTTCTCCTATCATTGTTTTTTACCTTCACTTTTTATGAGGGAAATTAG AGTTTGAGTTATGTACGAGAGGGAAAAAATGTAATAATCCTATCATCCATTATCATTTAT ATATACTAATATATCATTGGATTATAAAAAATTTAGGAAAAAAAAATAAGGAAAGGATTC TAGCTCAGGAATAGGTTAATACTACCTATTTATATATAAGCTAGGATCTTTTTCTAACAT TTAATTTTTTTCCTAGATCTTTTATAATTTAATGACACATCAACTTAAAAATAATGGATG GTTAGAATTATTACATCAGCTTAGGGGAGGATCTTAACTCTTTCCATAAGGTTGAAGCAA ATAAACATATGACATTGAGAGAGGGGAAGATAAAACTGTAGGAGGAACACTGGTTATGTT CAAACACACAACCTTCTGTGTCTCTCACCAAAATATTAGGTTTTTATATTGTTTGACCAA TTCTTCTTTTATTTTGTTTATGTTCTTTGTTTCTACAACTATAATTTTAGTGTACAATAA CACTTTTGTCTCTTAGGATGCATTATTAATGTAAATTATCTATCAATCAAAAATTAAGGT TCTAGTTAATTAATTGGTGACGCATCGGTTAACGATTTATCAATTACTCGGTAAGTACTA TTGATCGACGATCAAACTGGGTTAAACCTATAAAAATAAGAAGAAGGTAAAAAAATTTAT ATAGGATCAAAATACAATCATATGACTTGATCAATTGGTTTGATACTTTTGACCATTAGG ATTTAATAGCAACTTTGTAAAGGTAAGGAACATTTTCGTTGAGTTTTTAGAATTTCAATG GAGGTTCATATAATTATGGCCAAAATTTATATATTAGTGTAATTTCGTCAAAAATCAGGG AAAGTTTGTGTAATTGCCCCAATATATATATATATGCAAACATAAACACAAACGGTCCCC CCTCTTTCTCCCTCTCTATAAAACCACACAAACACTCACTCAGCGCCGCTCCACCCCTCT CTCTCTCTCGCAAACCGCTGGACAAGGTGCGTTCTTCTTCTTGTTGCTTTCTTCTTCCTT CCTTCTTATTTTTCTTCTTCTCAATATCTTACGTTCAGGTACGCCGCTGCCGCCGCCGCT GTGCTTTCCGCACCGCCTTATCTGCTTTGCTCGATCTGTCCGATCCGCTGCTTGTCTGGT ACGCCTCTTCGCCGATCTCTTTTTAGTTTGTTGACAAAACCAGTTAACTAAGAAGAGAAA TTGATGGAAATTTACGGTGCTTCATTATTTTAATTTTACTCTGAATATCTTCAGGTTAAC AAAGTAATCGATATACTTATATACTTCCTTTCCAATTGACCTTTAAATCACTATTCGAGC TTAAAAAACGAAAACTGAAACTCAAAGATGTCTTATACAGACTGATTCTATTTCTTTTAT TGGTCGCTAGGAACTTGGAG
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>LITCHI003207.m1 GenomeSequence - ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGGTACTGCAATTTTACT TCTAATACAATCTGTTTGCATTGTTATGCAAGTCGTCTAGCTCCATAGACAAAGGTACTA CTTTATCTTTAGTATTTTGAACTGTGTGTTTTCATGATTTGTGTTTTTGAAATTTATGGT GTCATTAATGTAGCATGAATTTGATGTTATATCGTTTCTGTATTATGCATGTACAATGTA TTTCTAACTTGATATTTTATATATTATTAATTATTTGAGTTACTAGAAAGAACAAACAAA TCAAACGAATTATTTTGATTGAATTAAAGACTAATATTTGAACAATTTGAGATGATTTAT TGTGGAATTAATTAGGAAGGTGGTTTTTGTTCTTCACTCTACTTTCTGAATTCAAGCGCA ATTAGGATCTGTTAATCCTGAAAAAATATTACCTCAGAACAACTTTCAAAGCAACAACTT AATCAATACAACCATTTATGAATCTAAAGAGAAACTTTCTTAATTATTTTTCTCTTGCTC TTCAGAATATTTAATCTTGTTTGTGTAATAGTTAATTGTTTTGTTAAGCTTTGTTTAATA GTCATGTGCACTTAAATTAAGTATTTGTGAGTGTTGTGATTGTGTTTTGGTCAAAAGGGA TTGTTTCTGATGAGCTAATGCTTGCTGGTTTTGTATCGGTTTTGATGGTTGTGTTTTGTT TTGACAATCATTTAGTTCATATATATTACATATGGCTCTTAATTGAAGGTTCATGGAATT GATCTGTAATCAAGGAAATTATTAGTATACCAAAATTTGCGGTATTTTAACATGTTGATG CCTTTGGTTGCAGAACCCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGC AATCTTTGATGGGAAAGATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCA TTATGTGTAGATCACTGACTTCTGTTCCTAATATGACTTTTAGGTGCATGAATTTGAATT ACTGTCTCGACATGTAAATGGGCGAGCTCTCTTTACTTTTCTCCCAAATATTTTAGGGTG TGATTTTTCTAATATGACATGAACCCTCAAAACAAAGGAAGTTTATTTGGTATTGTGCTT CCGCCAATACCAGCCTCACTTAACTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTTCCTTAGTACAGCC TAGCTCGTACATATGCCAGATAACATGATAAAACTGAATTAATGAAGACCTCTCATTCAA TCATACCCACCTCGAAATTTCTTTTATATTTTTGGGAAACCTTAGATGTTTGCAGAGATA AGAACAGCATGTAAACATCTTGTGCATTTCAATTACAAAGTTTATGATGATTGGATGGTG CCCTTTACGCGAATATATGTACAGTTTATATTACTTCCGATCTGGATAAAGTCGGAGTAG TCGCATTCCAATGTAGAGTCAGTAGTTCAGGTCATGAAAATTCCAATGTCACTAGATGAA ATTGGTTTTTCATAAAAACGTTGTTGTAATACATGTGAAGCTTTTCTCCCCATTTGCATG ACTCAATAGCAGAAGTTCTCCTGGTGTCCTAAAAGAGATGTTTGCTTCTTTAAGTTCTAG AAAACAAAATGAACATGAAAGACTAGATAATGTAAAACAAACCTAAAGGTAAATAGGTCA CCAAAAAAATGTCAACATTTCATAGATTAACCTATAAATAAATGGGCTATTTTCTAATTT TGTTCCAAGTATCTGAATGCTGACTAGTCGAGGAGATTGTGTATCCATTTTTCTACAACA GTTGGAGAACCATACCACGGTCTCAATGCATTGTCTGGGCTACTGGTGAGTGATAAACTC CATCTAAGCTTATGTTTAGTGCTCTTTCTAGATGCATAGATACTTCTGGTACAACTCCAT CACCTCATACATCTGCTTGTCCACAGACCTGATAATGCAAGAAAACAGAAATAACTTTAA AGAGAACACAGAACTCAACTTTTACGAAAAATGGCATGATTTTTGTTAAATGTGTGCAAG AAGCCTGGGGAAGTGACTTAACAACCTGCTTGTAACTTTGCCCAACTATGTGAGCACGAT AAGTTGAAACTGATGTTGGATTGGTCTTATTGTTTACAATAGCAACCTCAGAAGTTGGTT GGTCAGTGTCGATGGCCATGACAGGATCAACATCAATATTTGAGTTTCCAAAGAAGTGAG CACCCCCAATGTACCTGCAATTTAC