Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI003207Chr62002487820028202-UPF0481 protein At3g47200

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI003207.m117373PF03140.18DUF247Family3141.90E-93
LITCHI003207.m1380415PF02201.21SWIBDomain395.70E-10
Download   Copy
>LITCHI003207.m1
ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT
CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC
CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG
TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG
GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA
TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT
GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT
TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC
CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC
AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT
AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT
GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA
TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT
GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT
CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC
GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA
GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT
TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA
GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGAATATTTAATCTTAAC
CCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGCAATCTTTGATGGGAAA
GATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCATTATGTGTAG
Download   Copy
>LITCHI003207.m1
MENYFEEILEPGPDCCIYRVPQFLRNINEEAYAPQLISIGPLHYGKKELMGMENQKRRYW
SKFGQRVNAEKLNEFETYVKEQEQRIRDHYSVTSMLQSSEYVRMVLYDAIFIIELLLRNH
EKTDDFLLKSPRVVDIRRDLLLLENQLPFFVLNHLYTKAFPNREKNQSLFVLFLEYLCGS
NSGIYFGEHFSRVKHFIDFHRVILVECKPTTVGSDENGTYVPCATKLNKSGLKFRGINRK
SMLDISLETRKQYGKWFPWFEVNELQIPTIIIDDDTECSLRNLMAFEMFHYPTETHICNY
AFLMDRLIETEKDVDLLVEKGVIINHVGDNEAIAKIFNKLCSHIVLSKDSCYNDINKKIR
AHYRYSWNHAKAAQRIFNLNPQNKREIICDEKLKAIFDGKDVVGFLEIGKLLSRHYV.
Download   Copy
>LITCHI003207.m1
ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT
CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC
CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG
TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG
GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA
TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT
GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT
TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC
CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC
AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT
AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT
GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA
TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT
GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT
CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC
GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA
GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT
TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA
GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGAATATTTAATCTTAAC
CCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGCAATCTTTGATGGGAAA
GATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCATTATGTGTAGATCACT
GACTTCTGTTCCTAATATGACTTTTAGGTGCATGAATTTGAATTACTGTCTCGACATGTA
AATGGGCGAGCTCTCTTTACTTTTCTCCCAAATATTTTAGGGTGTGATTTTTCTAATATG
ACATGAACCCTCAAAACAAAGGAAGTTTATTTGGTATTGTGCTTCCGCCAATACCAGCCT
CACTTAACTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTTCCTTAGTACAGCCTAGCTCGTACATATGC
CAGATAACATGATAAAACTGAATTAATGAAGACCTCTCATTCAATCATACCCACCTCGAA
ATTTCTTTTATATTTTTGGGAAACCTTAGATGTTTGCAGAGATAAGAACAGCATGTAAAC
ATCTTGTGCATTTCAATTACAAAGTTTATGATGATTGGATGGTGCCCTTTACGCGAATAT
ATGTACAGTTTATATTACTTCCGATCTGGATAAAGTCGGAGTAGTCGCATTCCAATGTAG
AGTCAGTAGTTCAGGTCATGAAAATTCCAATGTCACTAGATGAAATTGGTTTTTCATAAA
AACGTTGTTGTAATACATGTGAAGCTTTTCTCCCCATTTGCATGACTCAATAGCAGAAGT
TCTCCTGGTGTCCTAAAAGAGATGTTTGCTTCTTTAAGTTCTAGAAAACAAAATGAACAT
GAAAGACTAGATAATGTAAAACAAACCTAAAGGTAAATAGGTCACCAAAAAAATGTCAAC
ATTTCATAGATTAACCTATAAATAAATGGGCTATTTTCTAATTTTGTTCCAAGTATCTGA
ATGCTGACTAGTCGAGGAGATTGTGTATCCATTTTTCTACAACAGTTGGAGAACCATACC
ACGGTCTCAATGCATTGTCTGGGCTACTGGTGAGTGATAAACTCCATCTAAGCTTATGTT
TAGTGCTCTTTCTAGATGCATAGATACTTCTGGTACAACTCCATCACCTCATACATCTGC
TTGTCCACAGACCTGATAATGCAAGAAAACAGAAATAACTTTAAAGAGAACACAGAACTC
AACTTTTACGAAAAATGGCATGATTTTTGTTAAATGTGTGCAAGAAGCCTGGGGAAGTGA
CTTAACAACCTGCTTGTAACTTTGCCCAACTATGTGAGCACGATAAGTTGAAACTGATGT
TGGATTGGTCTTATTGTTTACAATAGCAACCTCAGAAGTTGGTTGGTCAGTGTCGATGGC
CATGACAGGATCAACATCAATATTTGAGTTTCCAAAGAAGTGAGCACCCCCAATGTACCT
GCAATTTAC
Download   Copy
>LITCHI003207.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTGTATTTGACATGGTAATGTTTTATTAGTTGCAGTTTCTATAGTAATAGCTTTACAATG
AATAACATTCAATAACATTTGATAAAATTTATATATGAGATTTAGTTAGTCTTGTCGGTA
TGTTCATTGTGTGATGATTTATTAATACATCTTAGTTATAAAAATTATCAATGTGAACCA
TACCTTTGTTGTTAGATCAAACTTGAGACCAAACTTTAGAGGAAGTTAGTGTAATTTATT
GTGCCATAATAGTTAAAGAACATGTATCTTTAAATTAGAAAAATATTTGAAGTTCATCTG
GGATTTAACACTGAAATAATAGTGTTTTCTCTTATTAATGAATATTAATTACTTCTATTG
AAATAACTTATACTTAAAAGTGTATTTCAAAAAAGCACTTCCAAGATTATTTTTATCATT
TGGAGTAAGGATTTTCTGTTAATTTCTTATTTTTACTAAGCTTTTTACGAGGGGAATTTT
AGTTTGAATGATGTATGAGAGATAAAAAAAATATAACAATCTTGATTATCCATTATCTAT
GGGAGTAGGAATCTTCTCCTATCATTGTTTTTTACCTTCACTTTTTATGAGGGAAATTAG
AGTTTGAGTTATGTACGAGAGGGAAAAAATGTAATAATCCTATCATCCATTATCATTTAT
ATATACTAATATATCATTGGATTATAAAAAATTTAGGAAAAAAAAATAAGGAAAGGATTC
TAGCTCAGGAATAGGTTAATACTACCTATTTATATATAAGCTAGGATCTTTTTCTAACAT
TTAATTTTTTTCCTAGATCTTTTATAATTTAATGACACATCAACTTAAAAATAATGGATG
GTTAGAATTATTACATCAGCTTAGGGGAGGATCTTAACTCTTTCCATAAGGTTGAAGCAA
ATAAACATATGACATTGAGAGAGGGGAAGATAAAACTGTAGGAGGAACACTGGTTATGTT
CAAACACACAACCTTCTGTGTCTCTCACCAAAATATTAGGTTTTTATATTGTTTGACCAA
TTCTTCTTTTATTTTGTTTATGTTCTTTGTTTCTACAACTATAATTTTAGTGTACAATAA
CACTTTTGTCTCTTAGGATGCATTATTAATGTAAATTATCTATCAATCAAAAATTAAGGT
TCTAGTTAATTAATTGGTGACGCATCGGTTAACGATTTATCAATTACTCGGTAAGTACTA
TTGATCGACGATCAAACTGGGTTAAACCTATAAAAATAAGAAGAAGGTAAAAAAATTTAT
ATAGGATCAAAATACAATCATATGACTTGATCAATTGGTTTGATACTTTTGACCATTAGG
ATTTAATAGCAACTTTGTAAAGGTAAGGAACATTTTCGTTGAGTTTTTAGAATTTCAATG
GAGGTTCATATAATTATGGCCAAAATTTATATATTAGTGTAATTTCGTCAAAAATCAGGG
AAAGTTTGTGTAATTGCCCCAATATATATATATATGCAAACATAAACACAAACGGTCCCC
CCTCTTTCTCCCTCTCTATAAAACCACACAAACACTCACTCAGCGCCGCTCCACCCCTCT
CTCTCTCTCGCAAACCGCTGGACAAGGTGCGTTCTTCTTCTTGTTGCTTTCTTCTTCCTT
CCTTCTTATTTTTCTTCTTCTCAATATCTTACGTTCAGGTACGCCGCTGCCGCCGCCGCT
GTGCTTTCCGCACCGCCTTATCTGCTTTGCTCGATCTGTCCGATCCGCTGCTTGTCTGGT
ACGCCTCTTCGCCGATCTCTTTTTAGTTTGTTGACAAAACCAGTTAACTAAGAAGAGAAA
TTGATGGAAATTTACGGTGCTTCATTATTTTAATTTTACTCTGAATATCTTCAGGTTAAC
AAAGTAATCGATATACTTATATACTTCCTTTCCAATTGACCTTTAAATCACTATTCGAGC
TTAAAAAACGAAAACTGAAACTCAAAGATGTCTTATACAGACTGATTCTATTTCTTTTAT
TGGTCGCTAGGAACTTGGAG
Download   Copy
>LITCHI003207.m1 GenomeSequence - 
ATGGAAAACTATTTTGAGGAAATTTTGGAGCCCGGGCCTGATTGTTGCATATATAGGGTT
CCTCAATTTCTTCGCAATATAAATGAAGAAGCTTATGCTCCCCAGTTAATTTCAATAGGC
CCTCTTCATTATGGCAAAAAAGAACTGATGGGGATGGAAAACCAGAAGAGAAGATATTGG
TCAAAATTTGGCCAACGTGTAAATGCAGAGAAATTGAATGAATTCGAGACTTATGTCAAG
GAGCAAGAGCAACGCATCCGTGATCACTATTCAGTAACTTCTATGCTCCAAAGCTCAGAA
TATGTAAGAATGGTTCTATACGATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACCAT
GAGAAGACTGATGACTTCTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTT
TTATTACTCGAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTC
CCCAACAGGGAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCTCGAATATTTATGTGGAAGC
AATTCTGGTATCTATTTTGGGGAGCATTTTTCGCGAGTTAAACATTTTATTGACTTTCAT
AGAGTTATCCTTGTAGAGTGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAAATGGTACATAT
GTACCTTGTGCAACAAAGTTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCGTAAA
TCAATGCTTGACATAAGTTTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTT
GAAGTAAATGAATTACAAATCCCAACCATTATAATTGATGACGACACAGAATGCTCACTT
CGAAACCTGATGGCTTTTGAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCAACTAC
GCTTTTCTGATGGATCGACTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAA
GGGGTTATTATCAATCATGTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTT
TGCTCACATATCGTACTTAGTAAGGATTCTTGTTATAATGATATTAATAAGAAGATCAGA
GCACACTATAGGTATTCATGGAACCATGCCAAGGCTGCTCAGAGGTACTGCAATTTTACT
TCTAATACAATCTGTTTGCATTGTTATGCAAGTCGTCTAGCTCCATAGACAAAGGTACTA
CTTTATCTTTAGTATTTTGAACTGTGTGTTTTCATGATTTGTGTTTTTGAAATTTATGGT
GTCATTAATGTAGCATGAATTTGATGTTATATCGTTTCTGTATTATGCATGTACAATGTA
TTTCTAACTTGATATTTTATATATTATTAATTATTTGAGTTACTAGAAAGAACAAACAAA
TCAAACGAATTATTTTGATTGAATTAAAGACTAATATTTGAACAATTTGAGATGATTTAT
TGTGGAATTAATTAGGAAGGTGGTTTTTGTTCTTCACTCTACTTTCTGAATTCAAGCGCA
ATTAGGATCTGTTAATCCTGAAAAAATATTACCTCAGAACAACTTTCAAAGCAACAACTT
AATCAATACAACCATTTATGAATCTAAAGAGAAACTTTCTTAATTATTTTTCTCTTGCTC
TTCAGAATATTTAATCTTGTTTGTGTAATAGTTAATTGTTTTGTTAAGCTTTGTTTAATA
GTCATGTGCACTTAAATTAAGTATTTGTGAGTGTTGTGATTGTGTTTTGGTCAAAAGGGA
TTGTTTCTGATGAGCTAATGCTTGCTGGTTTTGTATCGGTTTTGATGGTTGTGTTTTGTT
TTGACAATCATTTAGTTCATATATATTACATATGGCTCTTAATTGAAGGTTCATGGAATT
GATCTGTAATCAAGGAAATTATTAGTATACCAAAATTTGCGGTATTTTAACATGTTGATG
CCTTTGGTTGCAGAACCCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGC
AATCTTTGATGGGAAAGATGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCA
TTATGTGTAGATCACTGACTTCTGTTCCTAATATGACTTTTAGGTGCATGAATTTGAATT
ACTGTCTCGACATGTAAATGGGCGAGCTCTCTTTACTTTTCTCCCAAATATTTTAGGGTG
TGATTTTTCTAATATGACATGAACCCTCAAAACAAAGGAAGTTTATTTGGTATTGTGCTT
CCGCCAATACCAGCCTCACTTAACTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTTCCTTAGTACAGCC
TAGCTCGTACATATGCCAGATAACATGATAAAACTGAATTAATGAAGACCTCTCATTCAA
TCATACCCACCTCGAAATTTCTTTTATATTTTTGGGAAACCTTAGATGTTTGCAGAGATA
AGAACAGCATGTAAACATCTTGTGCATTTCAATTACAAAGTTTATGATGATTGGATGGTG
CCCTTTACGCGAATATATGTACAGTTTATATTACTTCCGATCTGGATAAAGTCGGAGTAG
TCGCATTCCAATGTAGAGTCAGTAGTTCAGGTCATGAAAATTCCAATGTCACTAGATGAA
ATTGGTTTTTCATAAAAACGTTGTTGTAATACATGTGAAGCTTTTCTCCCCATTTGCATG
ACTCAATAGCAGAAGTTCTCCTGGTGTCCTAAAAGAGATGTTTGCTTCTTTAAGTTCTAG
AAAACAAAATGAACATGAAAGACTAGATAATGTAAAACAAACCTAAAGGTAAATAGGTCA
CCAAAAAAATGTCAACATTTCATAGATTAACCTATAAATAAATGGGCTATTTTCTAATTT
TGTTCCAAGTATCTGAATGCTGACTAGTCGAGGAGATTGTGTATCCATTTTTCTACAACA
GTTGGAGAACCATACCACGGTCTCAATGCATTGTCTGGGCTACTGGTGAGTGATAAACTC
CATCTAAGCTTATGTTTAGTGCTCTTTCTAGATGCATAGATACTTCTGGTACAACTCCAT
CACCTCATACATCTGCTTGTCCACAGACCTGATAATGCAAGAAAACAGAAATAACTTTAA
AGAGAACACAGAACTCAACTTTTACGAAAAATGGCATGATTTTTGTTAAATGTGTGCAAG
AAGCCTGGGGAAGTGACTTAACAACCTGCTTGTAACTTTGCCCAACTATGTGAGCACGAT
AAGTTGAAACTGATGTTGGATTGGTCTTATTGTTTACAATAGCAACCTCAGAAGTTGGTT
GGTCAGTGTCGATGGCCATGACAGGATCAACATCAATATTTGAGTTTCCAAAGAAGTGAG
CACCCCCAATGTACCTGCAATTTAC