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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI003191 | Chr6 | 19813549 | 19816562 | - | UPF0481 protein At3g47200 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI003191.m1 | 1 | 71 | PF03140.18 | DUF247 | Family | 49.2 | 4.90E-13 |
LITCHI003191.m1 | 66 | 223 | PF03140.18 | DUF247 | Family | 125 | 4.90E-36 |
LITCHI003191.m1 | 219 | 255 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 40.9 | 1.50E-10 |
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>LITCHI003191.m1 ATGGTTCTATACAATGCAATTTTTATAATTGAACTGCTTCTGAGAAACTATGAGAAGACT GATGACTTTTTATTAAAGTCTCCACGAGTTGTGGATATAAGAAGAGACCTTTTATTACTC GAAAATCAGCTCCCATTCTTTGTTCTTAACCATTTATATACAAAAGCCTTCCCCAACAGG GAGAAAAATCAATCACTCTTTGTTCTTTTTCGCGAATATTTATGTGGAAGCAATGCTGAG TGCAAACCAACTACAGTAGGATCAGATGAAACTGGTACATATGTACCATGTGCAACAAAG TTGAATAAATCAGGACTGAAGTTCAGAGGCATTAACCATAAATCAATGCTTGACATAAGT TTGGAAACGAGAAAGCAATATGGGAAATGGTTTCCATGGTTTGAAGTAAATGAATTACAA ATCCCAACCATTATAATTCATGACGACACAGAATGCTCACTTCGAAACCTGATTGGTTTT GAGATGTTTCACTATCCAACAGAAACTCACATATGCCACTACGCTTTTCTGATGGATCGA CTAATTGAAACCGAGAAGGATGTGGATTTGCTTGTTGAAAAAGGGGTTATTATCAATCAT GTTGGCGATAATGAAGCAATAGCCAAGATCTTCAACAAACTTTGCTCAAATATCAACCCT CAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTGAAGGCAATCTTTGATGGGAAAGAT GTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGCCATTTTGTGTAG
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>LITCHI029035.m1 MGDLTDSLTPSTTTATPPSYSRPLPVREDCWSEEATSTLVDSWGRRYLELNRGNLRQKDW QDVADAVNALHAHSKKTHRTDVQCKNRIDTIKKKYKIEKARVTSSNGSLTSSWPFFERMD ALIGNSVKPSPNFSPNMSQSQSPPVAVPIKSYRKAISVNNNNNSNNNNSSPSLTPIQAVA LPQKRGYNNEGYYRNYSAVAAAAAAAESEEEEAEEEAEEEENDNEENLGVRRLAKAIERF GQVYERVEAEKLRQMVELEKQRMQFASDLEMQRLRMFTEMQVQLERNKRSKRSASNGCER LELSFG. >LITCHI029035.m2 MGDLTDSLTPSTTTATPPSYSRPLPVREDCWSEEATSTLVDSWGRRYLELNRGNLRQKDW QDVADAVNALHAHSKKTHRTDVQCKNRIDTIKKKYKIEKARVTSSNGSLTSSWPFFERMD ALIGNSVKPSPNFSPNMSQSQSPPVAVPIKSYRKAISVNNNNNSNNNNSSPSLTPIQAVA LPQKRGYNNEGYYRNYSAVAAAAAAAESEEEEAEEEAEEEENDNEENLGVRRLAKAIERF GQVYERVEAEKLRQMVELEKQRMQFASDLEMQRLRMFTEMQVQLERNKRSKRSASNDMDY LCTLSGMTGEMMFQSLAL. >LITCHI029035.m3 MGDLTDSLTPSTTTATPPSYSRPLPVREDCWSEEATSTLVDSWGRRYLELNRGNLRQKDW QDVADAVNALHAHSKKTHRTDVQCKNRIDTIKKKYKIEKARVTSSNGSLTSSWPFFERMD ALIGNSVKPSPNFSPNMSQSQSPPVAVPIKSYRKAISVNNNNNSNNNNSSPSLTPIQAVA LPQKRGYNNEGYYRNYSAVAAAAAAAESEEEEAEEEAEEEENDNEENLGVRRLAKAIERF GQVYERVEAEKLRQMVELEKQRMQFASDLEMQRLRMFTEMQVQLERNKRSKRSASNDIYS . >LITCHI029035.m4 MGDLTDSLTPSTTTATPPSYSRPLPVREDCWSEEATSTLVDSWGRRYLELNRGNLRQKDW QDVADAVNALHAHSKKTHRTDVQCKNRIDTIKKKYKIEKARVTSSNGSLTSSWPFFERMD ALIGNSVKPSPNFSPNMSQSQSPPVAVPIKSYRKAISVNNNNNSNNNNSSPSLTPIQAVA LPQKRGYNNEGYYRNYSAVAAAAAAAESEEEEAEEEAEEEENDNEENLGVRRLAKAIERF GQVYERVEAEKLRQMVELEKQRMQFASDLEMQRLRMFTEMQVQLERNKRSKRSASNGCER LELSFG.
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>LITCHI029035.m3 CCACCCTACATAAACAAAGCACAAAACTAAAAAACTGCCAATATTTTTTATTAATTTTTA TATTGGTTTTCCACGTTTTAGTTTTTATTAAAGCAAACTTACTTCCATCTCATTTTACAA CATGAAAATAATCTTCTTAACTCGCGGAAAAATCATAAAAGGCGAAAAACCAAATATAAA ATTGATTTTAAAAAATATACATAAATAATTCTTATTTGATCTAATACGAGCCTCAAGCCT CTCATGCAATCCCCGAAAATTCCAAGGACAACCGAAAAAATGAGGGTCGCAGTAGTAGCA GGTGATGGGCAGCATCGAGATAGAATAGTAGGGTTGTTTTTGTTTTGTTTGGTAATAGTT ACTAGTAAGAAACGTAACGTAATTGCCAGCTCTGACCGGTCCGTAGCCGAGCCGAATCCG ATGAGACCCAAGCGTCCAACCCTATGCTTACCCTTCACGCGCTTACCCACAACATCCCAT TCCCGGCGACCCCTTCAATTATTCCCCTTTCAACCTCTTCTTTCTTTCCACCCTCTCCCA ACCGGCGCGTCGTCATCGCTGCTCCCTCCCTTTCCATCTTATATTTTCTCTTATTCCAAT TCTGTCCCCTTCTCTCTTTTTCTCATCTTATCTTAAAAACGCCGATCATCCCCTTCCCTT CCCTTGGCTCGCGTTTTTGACCTAGAGACGATTCAATGGGCGATCTAACGGACTCGTTGA CGCCGTCAACCACCACGGCTACCCCGCCGTCTTACTCCCGTCCGTTGCCCGTCCGTGAGG ACTGCTGGAGCGAGGAGGCCACCTCCACTCTGGTTGACTCGTGGGGCCGCCGCTACCTGG AACTCAACCGTGGCAATCTCCGCCAGAAGGACTGGCAGGACGTGGCTGATGCCGTCAACG CCCTCCACGCTCACTCCAAAAAGACGCACCGCACCGACGTTCAATGCAAGAACCGGATCG 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