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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI002616 | Chr6 | 8886263 | 8897776 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein ZFN-like |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI002616.m1 | 50 | 75 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32 | 8.60E-08 |
| LITCHI002616.m1 | 53 | 74 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.8 | 0.0041 |
| LITCHI002616.m1 | 96 | 120 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.7 | 6.90E-10 |
| LITCHI002616.m1 | 99 | 119 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 18.9 | 0.0018 |
| LITCHI002616.m1 | 144 | 166 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.2 | 5.00E-10 |
| LITCHI002616.m1 | 145 | 165 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.5 | 0.0049 |
| LITCHI002616.m1 | 302 | 327 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.2 | 8.70E-09 |
| LITCHI002616.m1 | 306 | 326 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.1 | 0.0015 |
| LITCHI002616.m1 | 348 | 373 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.1 | 2.50E-10 |
| LITCHI002616.m1 | 352 | 372 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 16.8 | 0.0082 |
| LITCHI002616.m2 | 11 | 35 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.1 | 5.30E-10 |
| LITCHI002616.m2 | 14 | 34 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.2 | 0.0014 |
| LITCHI002616.m2 | 59 | 81 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.5 | 3.90E-10 |
| LITCHI002616.m2 | 60 | 80 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0038 |
| LITCHI002616.m2 | 217 | 242 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.6 | 6.70E-09 |
| LITCHI002616.m2 | 221 | 241 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.5 | 0.0012 |
| LITCHI002616.m2 | 263 | 288 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.5 | 1.90E-10 |
| LITCHI002616.m2 | 267 | 287 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.2 | 0.0063 |
| LITCHI002616.m3 | 50 | 75 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.4 | 6.70E-08 |
| LITCHI002616.m3 | 53 | 74 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 18.1 | 0.0033 |
| LITCHI002616.m3 | 96 | 120 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.1 | 5.40E-10 |
| LITCHI002616.m3 | 99 | 119 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.2 | 0.0014 |
| LITCHI002616.m3 | 144 | 166 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.5 | 3.90E-10 |
| LITCHI002616.m3 | 145 | 165 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.8 | 0.0039 |
| LITCHI002616.m3 | 302 | 327 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.6 | 6.80E-09 |
| LITCHI002616.m3 | 306 | 326 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.4 | 0.0012 |
| LITCHI002616.m4 | 22 | 47 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.5 | 6.10E-08 |
| LITCHI002616.m4 | 25 | 46 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 18.2 | 0.003 |
| LITCHI002616.m4 | 68 | 92 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.2 | 4.90E-10 |
| LITCHI002616.m4 | 71 | 91 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.3 | 0.0013 |
| LITCHI002616.m4 | 116 | 138 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.6 | 3.60E-10 |
| LITCHI002616.m4 | 117 | 137 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 18 | 0.0035 |
| LITCHI002616.m4 | 274 | 299 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.7 | 6.20E-09 |
| LITCHI002616.m4 | 278 | 298 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.6 | 0.0011 |
| LITCHI002616.m5 | 46 | 68 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.40E-10 |
| LITCHI002616.m5 | 47 | 67 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0036 |
| LITCHI002616.m5 | 204 | 229 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.7 | 6.30E-09 |
| LITCHI002616.m5 | 208 | 228 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.5 | 0.0011 |
| LITCHI002616.m5 | 250 | 275 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.5 | 1.90E-10 |
| LITCHI002616.m5 | 254 | 274 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.2 | 0.006 |
| LITCHI002616.m6 | 46 | 68 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.40E-10 |
| LITCHI002616.m6 | 47 | 67 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0036 |
| LITCHI002616.m6 | 204 | 229 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.7 | 6.30E-09 |
| LITCHI002616.m6 | 208 | 228 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.5 | 0.0011 |
| LITCHI002616.m6 | 250 | 275 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.5 | 1.90E-10 |
| LITCHI002616.m6 | 254 | 274 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.2 | 0.006 |
| LITCHI002616.m7 | 46 | 68 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.40E-10 |
| LITCHI002616.m7 | 47 | 67 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0036 |
| LITCHI002616.m7 | 204 | 229 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.7 | 6.30E-09 |
| LITCHI002616.m7 | 208 | 228 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.5 | 0.0011 |
| LITCHI002616.m7 | 250 | 275 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.5 | 1.90E-10 |
| LITCHI002616.m7 | 254 | 274 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.2 | 0.006 |
| LITCHI002616.m8 | 46 | 68 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.40E-10 |
| LITCHI002616.m8 | 47 | 67 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.9 | 0.0036 |
| LITCHI002616.m8 | 204 | 229 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 35.7 | 6.30E-09 |
| LITCHI002616.m8 | 208 | 228 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.5 | 0.0011 |
| LITCHI002616.m8 | 250 | 275 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 40.5 | 1.90E-10 |
| LITCHI002616.m8 | 254 | 274 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 17.2 | 0.006 |
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GTTGGATTTTATGCATTGCAGAGGGAAAATGTATTTCCTGAGAGACCTGGCCAGCCTGAA TGCCAGTTTTATATGAAGACTGGAGATTGTAAGTTTGGTTCAGTTTGCAGGTTCCATCAT CCAAGAGAAAGACTAATTCCTGTTCCAGACTGTGTCTTGAGCCCCATAGGCCTCCCTTTA CGTCCGGGAGAACCTCTCTGCATATTTTATTCTCGTTATGGTATATGCAAGTTTGGTCCA AGTTGCAAATTTGATCACCCTATGGAAATTTTCACATACAATCCTGCTGCATCATCTTCA GCTGATGCCCCAGTTCGACGCTTTTTGGGGTCATCATCTGGAACTGCTGCATTAACATTA TCATCGGAAGGGCTTGTTGAAGCAGGTTCAGGAAAGCCCAGGCGACTTTCATTGTCGGAG ACTAGGCAGATGCCTTCTGGTGATGACAATATTGACGCGGAGGGATAA >LITCHI002616.m3 ATGGAGTTTGAAGCCATGTCTCGTGGAACTACTTCTGTCTCCCCTGACGGACCCTCGCTT TCGTCGTCCTTGAATCAAGATGCAATGTGGCAAATGAACTTGAGAACAAATGAAGCAGTG GAATCTGGACCCTACCCTGAGCGTAAAGGAGAACCCGATTGTTCTTATTATATCAGAACG GGCCTTTGTAGATTTGGGGCAACTTGTCGATTTAATCATCCTCCCAACAGGAAGCTGGCT ATTGCTCAAGCAAGAATGAAGGGAGAGTTTCCAGAAAGAATAGGGCAACCTGAATGCCAG TACTACCTGAAAACAGGAACTTGCAAGTTTGGAGCCACATGCAAGTTTCATCATCCTAGA GACAAAGCTGGGATTGCAGGAAGAGTCTCATTAAATATTTTGGGCTACCCACTTCGCCCG AATGAGATTGAATGTGCTTATTATTTAAGAACCGGACAATGCAAGTTTGGAGATACATGT 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CTGCAGAATGAGATTGAATGTGCTTATTATTTAAGAACCGGACAATGCAAGTTTGGAGAT ACATGTAAATTTCACCATCCTCAACCAACCAACATGATGGTTTCGTTGCGTGGCTCCCCT GTTTATCCTACTGTTCAGTCTCCAACTACGCCGGGTCAACAGTCTTATCCTGGAGGAGTT ACAAACTGGTCTAGAGCATCTTTTATTCCGAGCCCACGATGGCAAGCTCCTTCAAGTTAT ACACCATTGATTTTACCTCAGGGAGTGGTATCAGTTCCAGGTTGGAACACATATAGTGGT CAGCTGGCATCTGTTTCTTCTTCAGAGAACCTGCAACAAGCAGTGGGAAGCAGTCAAATT TATGGAGCCTCACGCCAAAGCGAATTAGGGACTGCAGGATCTGAAGGGACGTATTCTACA TTCCGTTCTGGTTCTGTCCCTGTTGGATTTTATGCATTGCAGAGGGAAAATGTATTTCCT GAGAGACCTGGCCAGCCTGAATGCCAGTTTTATATGAAGACTGGAGATTGTAAGTTTGGT TCAGTTTGCAGGTTCCATCATCCAAGAGAAAGACTAATTCCTGTTCCAGACTGTGTCTTG AGCCCCATAGGCCTCCCTTTACGTCCGGGAGAACCTCTCTGCATATTTTATTCTCGTTAT GGTATATGCAAGTTTGGTCCAAGTTGCAAATTTGATCACCCTATGGAAATTTTCACATAC AATCCTGCTGCATCATCTTCAGCTGATGCCCCAGTTCGACGCTTTTTGGGGTCATCATCT GGAACTGCTGCATTAACATTATCATCGGAAGGGCTTGTTGAAGCAGGTTCAGGAAAGCCC AGGCGACTTTCATTGTCGGAGACTAGGCAGATGCCTTCTGGTGATGACAATATTGACGCG GAGGGATAA >LITCHI002616.m7 ATGTTGTATTTCTATAAGCGTCTGTCTGTTCCTGTTACATGGATTTCTTATTTGTTGAAG TTCTTGTTTTTGAAGTTGGATTGTATTTTTATATTCTTATTTTGTTATTTTCTGTATTCT CTGCAGAATGAGATTGAATGTGCTTATTATTTAAGAACCGGACAATGCAAGTTTGGAGAT ACATGTAAATTTCACCATCCTCAACCAACCAACATGATGGTTTCGTTGCGTGGCTCCCCT GTTTATCCTACTGTTCAGTCTCCAACTACGCCGGGTCAACAGTCTTATCCTGGAGGAGTT ACAAACTGGTCTAGAGCATCTTTTATTCCGAGCCCACGATGGCAAGCTCCTTCAAGTTAT ACACCATTGATTTTACCTCAGGGAGTGGTATCAGTTCCAGGTTGGAACACATATAGTGGT CAGCTGGCATCTGTTTCTTCTTCAGAGAACCTGCAACAAGCAGTGGGAAGCAGTCAAATT TATGGAGCCTCACGCCAAAGCGAATTAGGGACTGCAGGATCTGAAGGGACGTATTCTACA TTCCGTTCTGGTTCTGTCCCTGTTGGATTTTATGCATTGCAGAGGGAAAATGTATTTCCT GAGAGACCTGGCCAGCCTGAATGCCAGTTTTATATGAAGACTGGAGATTGTAAGTTTGGT TCAGTTTGCAGGTTCCATCATCCAAGAGAAAGACTAATTCCTGTTCCAGACTGTGTCTTG AGCCCCATAGGCCTCCCTTTACGTCCGGGAGAACCTCTCTGCATATTTTATTCTCGTTAT GGTATATGCAAGTTTGGTCCAAGTTGCAAATTTGATCACCCTATGGAAATTTTCACATAC AATCCTGCTGCATCATCTTCAGCTGATGCCCCAGTTCGACGCTTTTTGGGGTCATCATCT GGAACTGCTGCATTAACATTATCATCGGAAGGGCTTGTTGAAGCAGGTTCAGGAAAGCCC 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>LITCHI002616.m5 TGAGAAAAGGAGGGCTGTCTGGTTTGGATGGTTGGTTTTTATTCTTCTACTTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTTCTGTTTTATTTTGTGGAGAGGAGCAGAGA ACGCTCTCTCTCTATATTTCTCTCTCTGTCTCTCGTTTTTTATTTTTGAATATAATTATT AATTTTTATTGATTTATTTTTCATTTTTATTTTCTCTGTTAAAAAATAAATAACTACAAA TAAATAAATAAATAATAATCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTTTCCCTGTGTCTCGGTCTC TCTCGCTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGGTTTGATTGTTATCTGGAGAAAT TGGCGGCAATGGTGGTTGAGGCGGAGAGCGGCAGAGTGAGGGAGTGGTGATGGACTACGA AGAATGGAGTTTGAAGCCATGTCTCGTGGAACTACTTCTGTCTCCCCTGACGGACCCTCG CTTTCGTCGTCCTTGAATCAAGATGCAATGTGGCAAATGAACTTGAGAACAAATGAAGCA GTGGAATCTGGACCCTACCCTGAGCGTAAAGGAGAACCCGATTGTTCTTATTATATCAGA ACGGGCCTTTGTAGATTTGGGGCAACTTGTCGATTTAATCATCCTCCCAACAGGAAGCTG GTATACACTGCAGCATGTTTGGACAAATTCTTAACTGGAGAGCAAATAATATATGAATGA GATAATATTAGTACTTTGTTAGTCAGGTCCTTTGTTGCATCTATTTGAATCTTAATTAGC ATATACTCGATGCAGTAGGTTGGGGGTCTAGGTAAATTTTGGCTCTATGGTGGTGCTTCA TATAAATTATTCTACGGAAGCTTTTTGATTTCCTTTATGAAAATAATATCAATCTAACCT GAATCGTTTATGAAAATAATATCAATCTAATTTGAATCAATTCAAAGATACTTTATTATT 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