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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002341 | Chr6 | 2786772 | 2792301 | - | AP2-like ethylene-responsive transcription factor BBM2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002341.m1 | 332 | 390 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 45 | 1.00E-11 |
LITCHI002341.m1 | 434 | 484 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 34.3 | 2.40E-08 |
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>LITCHI002341.m1 ATGACCACCATGAACAACTGGTTAGGGTTCTCTCTCTCACCCCACCAACAACTCCCTTCA AACCCTGATCATCATCATCATCATCATCAGGATCACTCCCAAAACTCGGTCTCTCGCCTA GGCGGTAGCTTCAACTCCGATGAGCTCTCCGGCACGGTTGTTTCCGGAGAGTGCTTTGAT CTCTCCTCCGACAACACTCCAACCGCTTTTGGCATCCTTGAAGCCTTCAACAGAAACAAT CATCACTCACAAGATTGGAATATGAAGGGTTTGGAGATGAATCCAGATACAAACTACAAA ACCAACACAGATTTTCCTATGCTTATGACATGCAATAATAACACACAAAACCTTGATGAT CAACCCCAAGAGCCAAAGCTTGAGAACTTCCTTGGTGGCCGCTCGTTTTCTGACCATGAA CAGAAACTCCACAGTTGCAACACCATGTACAACAACGCTGCTGCCACCGGAGACTACATG TTCTCGGCCAACTGTTCTTTGCAACTTCCATCAGATGATGATCATCATCATAATCATCAC ACAATCACAAATGGAACAGCAAGCAATAGCAACAACAACGGAGGAGAAAGCAACACCACC ACCACCACTACTACTACCAACAACAATGGTTCTTCTTGCATTGGGTTGTCCATGATCAAG ACTTGGTTGAGGAACCAACCATCCCCAGCCGTTCAAGCGACGGCTTCAGAGGCGGCGGCA ACGGAGGCCAAGAACGTTTACAACAACACCACCAAAAACAACGGTTCGGCTCAGAGCTTG TCTCTTTCTATGAGCACTGGCTCTCACCAGTCTGCTGGTTCACCTCTTCCTCTTCTCACC TCCAATGGAGGCGGCAGCGGTGGAGAAAGCTCTTCATCTGATAACAATAAGCAGCAGAAG ACCACGGCCTCCGCGGCGGCCCTTGACACCCAAACCGGTGTCATTGAAACCGTGCCAAGG AAGTCTGTTGATACTTTTGGACAAAGAACTTCAATATATCGTGGTGTCACAAGACACAGA TGGACAGGTAGATATGAAGCCCATTTATGGGATAATAGTTGCAGAAGAGAAGGACAAACT CGCAAGGGAAGACAAGTCTATTTGGGAGGATACGACAAAGAAGAAAAAGCTGCAAGAGCT TATGATTTAGCAGCATTGAAATACTGGGGTACCACTACGACAACAAATTTCCCAATTAGC AATTATGAGAAAGAGTTGGAAGAAATGAAGCACATGACCAGGCAGGAGTATGTTGCTTCT CTTAGAAGGAAAAGTAGTGGATTTTCTAGAGGTGCATCCATTTATCGAGGTGTAACAAGA CATCATCAGCATGGAAGATGGCAAGCAAGGATTGGTAGAGTTGCAGGAAACAAGGACCTT TACTTGGGCACTTTCAGTACCCAAGAGGAAGCAGCAGAGGCATATGACATTGCAGCCATA AAATTTAGAGGACTCAATGCAGTGACCAACTTTGACATGAGTAGATATGATGTGAATAGC ATACTAGAGAGCAGTACACTGCCCATTGGTGGCGCGGCAAAGCGTTTGAAAGATGTGCAG CAGGCTGAAATGACACTAGATCATCATGGACAGAGAGGCAACGTGGTGGACGATTATGAG AACATGAGCTCACAGCTCACAGATCACCATGGATTTAGTGGCAGCAGCTACCATGCTTGG CCTTCCATCGCGGCAGCTGCAGCATTTCAACAGCCTGCTGCAGCAGCTGCCAACTTCAGC TTACACTTTCCATATAACACACAACGCGTTTGGTGCAAGCAAGAGCAGGATTCTGAGAGA TACCATCATCAGGATCTCCATCACCAACTCCAATTGGGAAGTAGTAGTACACACAATTTC TTCCAACCCTCATCAGTGTTGCACAATTTGATGAACATGCACGAGTCCTCTTCATTGGAA CACAGTTCAGGCTCCAACAATTCTGTGATTTGCAATGGGGATGGTGGTAGTAATGGAGGG TATGTGATTCCAATGGGGACAATTCTGGCCAATCATGATCATCATAATGGCTTTGGAGAT CATCATCGTCGTCATCAGAACATGTTCTCATCATCATCATCATCAACAGTTGCATCAGAT CCTTATCAAGCCAGGAACTTGTATTATCTATCACAACAACAACATCAACAACAATCATCA TCATCATCACCACCGCCGCCACCAGGATTGGTCAAGGCCAGTGCTAATAATGCTGCTACA TATCATGACCAAAGCTCAACATGCAACAACTCATGGGTGCCAACTGTGGTCCCAACACTG GCTTCTAGGGCTACCAACTTGGCTGCAGCTGCAGTTTACCATGGAGCTCCAAGCACTTTC ACTGTTTGGAATGACGCATGA
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>LITCHI002341.m1 CCAATTGTGATTTATGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGTTATATAAATAATCTTCATTTTTG CTTTGGAAGAGATGATATGTTTTTCTCTCTTCAAGTTTTATTTTTTTGACCTTTCCTCTT CTTCCTTGTTTGCTCTGCAAGTACTACTACTACTACTTCTTCATGGTTTCTGCTCTCTCA CTTCATTAGTTCATGCATGCACTTGTAATCTCTCTCATCTCTCTCTTTAGTTTCTCTTCA AACTAGATGACCACCATGAACAACTGGTTAGGGTTCTCTCTCTCACCCCACCAACAACTC CCTTCAAACCCTGATCATCATCATCATCATCATCAGGATCACTCCCAAAACTCGGTCTCT CGCCTAGGCGGTAGCTTCAACTCCGATGAGCTCTCCGGCACGGTTGTTTCCGGAGAGTGC TTTGATCTCTCCTCCGACAACACTCCAACCGCTTTTGGCATCCTTGAAGCCTTCAACAGA AACAATCATCACTCACAAGATTGGAATATGAAGGGTTTGGAGATGAATCCAGATACAAAC TACAAAACCAACACAGATTTTCCTATGCTTATGACATGCAATAATAACACACAAAACCTT GATGATCAACCCCAAGAGCCAAAGCTTGAGAACTTCCTTGGTGGCCGCTCGTTTTCTGAC CATGAACAGAAACTCCACAGTTGCAACACCATGTACAACAACGCTGCTGCCACCGGAGAC TACATGTTCTCGGCCAACTGTTCTTTGCAACTTCCATCAGATGATGATCATCATCATAAT CATCACACAATCACAAATGGAACAGCAAGCAATAGCAACAACAACGGAGGAGAAAGCAAC ACCACCACCACCACTACTACTACCAACAACAATGGTTCTTCTTGCATTGGGTTGTCCATG ATCAAGACTTGGTTGAGGAACCAACCATCCCCAGCCGTTCAAGCGACGGCTTCAGAGGCG GCGGCAACGGAGGCCAAGAACGTTTACAACAACACCACCAAAAACAACGGTTCGGCTCAG AGCTTGTCTCTTTCTATGAGCACTGGCTCTCACCAGTCTGCTGGTTCACCTCTTCCTCTT CTCACCTCCAATGGAGGCGGCAGCGGTGGAGAAAGCTCTTCATCTGATAACAATAAGCAG CAGAAGACCACGGCCTCCGCGGCGGCCCTTGACACCCAAACCGGTGTCATTGAAACCGTG CCAAGGAAGTCTGTTGATACTTTTGGACAAAGAACTTCAATATATCGTGGTGTCACAAGA CACAGATGGACAGGTAGATATGAAGCCCATTTATGGGATAATAGTTGCAGAAGAGAAGGA CAAACTCGCAAGGGAAGACAAGTCTATTTGGGAGGATACGACAAAGAAGAAAAAGCTGCA AGAGCTTATGATTTAGCAGCATTGAAATACTGGGGTACCACTACGACAACAAATTTCCCA ATTAGCAATTATGAGAAAGAGTTGGAAGAAATGAAGCACATGACCAGGCAGGAGTATGTT GCTTCTCTTAGAAGGAAAAGTAGTGGATTTTCTAGAGGTGCATCCATTTATCGAGGTGTA ACAAGACATCATCAGCATGGAAGATGGCAAGCAAGGATTGGTAGAGTTGCAGGAAACAAG GACCTTTACTTGGGCACTTTCAGTACCCAAGAGGAAGCAGCAGAGGCATATGACATTGCA GCCATAAAATTTAGAGGACTCAATGCAGTGACCAACTTTGACATGAGTAGATATGATGTG AATAGCATACTAGAGAGCAGTACACTGCCCATTGGTGGCGCGGCAAAGCGTTTGAAAGAT GTGCAGCAGGCTGAAATGACACTAGATCATCATGGACAGAGAGGCAACGTGGTGGACGAT TATGAGAACATGAGCTCACAGCTCACAGATCACCATGGATTTAGTGGCAGCAGCTACCAT GCTTGGCCTTCCATCGCGGCAGCTGCAGCATTTCAACAGCCTGCTGCAGCAGCTGCCAAC TTCAGCTTACACTTTCCATATAACACACAACGCGTTTGGTGCAAGCAAGAGCAGGATTCT GAGAGATACCATCATCAGGATCTCCATCACCAACTCCAATTGGGAAGTAGTAGTACACAC AATTTCTTCCAACCCTCATCAGTGTTGCACAATTTGATGAACATGCACGAGTCCTCTTCA TTGGAACACAGTTCAGGCTCCAACAATTCTGTGATTTGCAATGGGGATGGTGGTAGTAAT GGAGGGTATGTGATTCCAATGGGGACAATTCTGGCCAATCATGATCATCATAATGGCTTT GGAGATCATCATCGTCGTCATCAGAACATGTTCTCATCATCATCATCATCAACAGTTGCA TCAGATCCTTATCAAGCCAGGAACTTGTATTATCTATCACAACAACAACATCAACAACAA TCATCATCATCATCACCACCGCCGCCACCAGGATTGGTCAAGGCCAGTGCTAATAATGCT GCTACATATCATGACCAAAGCTCAACATGCAACAACTCATGGGTGCCAACTGTGGTCCCA ACACTGGCTTCTAGGGCTACCAACTTGGCTGCAGCTGCAGTTTACCATGGAGCTCCAAGC ACTTTCACTGTTTGGAATGACGCATGAATACAAAAACAAAAACAAAAACAAACATGAAGA TGTATGTACACAGCCCCGCTGATTTTCCTAATTTTTTAATATCTTTTAGTTTTTCATGAT TTTCCCTTTCTTCCTATATTGATATTGATTTACTAATTGCACTATGAGGAAGATGGGGTT CTTTTCTTTTGAAATGTTTATCTTCTAACTCTTTAGGCAACAAGGGGTCTAGTCTATATA TGTCTTTGAAGTTCAATTGTGGCATGCAAGAGGTTTGAACAAGTCTTACTTGCTATGAAT TTTGGGAACTTCATAGAATGAAAATGGATCCTCGGAAATTTTTTTCTTTACTTGTTTAAT CACATAACACCAGGCTTTGTAATTTTGAATAACATATACTTATGATACAAAGAATGGAAT TCTCCCT
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>LITCHI002341.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTTTGCTTTTGAAATTATTTTACAATCAACTACAAATTATTGGAACGTTTCTAAGTGGTT ATGTTATGTCATATTTTTTGAAATCTAAATTATGAACTGAAATTAAGTACGGATTCAATA TTTTACGGTTCATGTGAGATTTGATATCAGGATAAATAATTGAAGTATGAACATATGCAT CGAAGGTGTAAGTATGTAAACAACTGGGGAGAGAGAGAGAAAGGGAGAGTGATAAAGAGG GAAATGAATAGGGGTTGGTTGGGGGAATGGTAGGAGCAGATTACACTGACATGAAAAGAC TTGTGTCCAAATGGGCATGAATAAATGGGCGTGGAGAGGCGCTGCGTGTGGTTTTTTTTG TCACTCTCTTGTCAGATATATGTATCATCTTCTACAGGTGTTCTACAGCAAATAAAGAGT GCATTTGCATGATCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGGACTGCTA GTTTGATCTTGTTCCTCATATTTAGAGACTGATAGTTGAGTGAAAAGTCGCACTTAGCAC GTTGTGTTCATACCCTGGATGGTAGAAATTTAACAATCATTATAATTTTTTATTTCAAAG TCTCATTTTTTTAATTATTTCAATCATATATCATGGTAATAAAAAATATATAATGCATTA TTATTTTTTTAATTATTTCAATCATTATTGCAAGTGTTGTATGAGCTAAAAAAAAAAAGA ATGTGTTTGATGATATATATTCATCATTACAAATGACACAAACTTAGACTTTTTTTTTTC TTCTTTCCTCTTTCCTACTCCCAGGGAATAAAACCACGTTTACAATCACAATACTTGTGC ATTGCATACCTCAAGATAACAAAATAAAAGTATCTACATATTTTTTAATATCTACATAGT GAAAATTGAACCCCTAACATAAAAATAAAATTACATTTACTTAATAAGAATTGAACCCCT AATACTTCAGTGAATGGAGAGGTTTCCAATTATTTGTAGTAAGAGTGCATAATGAAGATT GTTTTCTTTTGTAATTATTAATAACAAATTTGTACTTATTCAAGTAAAAGTATTAAAGAG TAGAGTACCGATTCATAATTGTGATATTCTAGCTAGCTTGAGTTTGATTATTAAATTACT ACTTAGGCAAATGATATGTTGTAAGAAGAATCATGATGATGTGGATGAAGATATCTTTGA ATTGAAGTTGGGAGGGTGAGTACACAAGCTTGTTTTGAGTCTAAGAAACCACATGTTCTC ATAGGTTCACACCCATGCGTTAGGCCTTGTAACCTCTGATCAAATATACCATTTTACTAT CAAAGGCATGAAGATCAGGCTCATCAACTTGCCTATATTTGGATTGCAAGACAAATCATC TTTTACACCATATAAATTATAATATAAAATTATATATAATAGCCCAACAAGGCTTGAATA TTTCATTCAAACTTTTTATTACTACCCTCGTGTACCTTTTTCATTCTTTTTTTATTCCTA ACAAGAAAATTTAGATTTAGAGAGAGAAAAAGAAACTCCCTTTTTTTTCGAAAGATATAT TAAAAAAAAAAAAGGAAACTTAAATTGAATGATTTGGTATGCGTGTAAAAGTACAATAAT ACCCCTTATATTTCAACCCACCACTTGCCTATCTTCTTATGTCTCTCTCTCATAAGGTGT ATCATGAAGATCATAGAAGATATCATTTTGAGTACTTGATTAAACAAGAAGTGCCCTAAA GTTAGAAGGGTGCCCCAATTGTGATTTATGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGTTATATAAAT AATCTTCATTTTTGCTTTGGAAGAGATGATATGTTTTTCTCTCTTCAAGTTTTATTTTTT TGACCTTTCCTCTTCTTCCTTGTTTGCTCTGCAAGTACTACTACTACTACTTCTTCATGG TTTCTGCTCTCTCACTTCATTAGTTCATGCATGCACTTGTAATCTCTCTCATCTCTCTCT TTAGTTTCTCTTCAAACTAG
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>LITCHI013047.m2 GenomeSequence + TCGCGGTTGTTGAAACTTGAAAATTTTCATCGAAAAATTTTTCAGAATCCAAATTCCAAT CTCGCTCTCACGATTTCGTCTTCAGCAGTCTTTGATTTGGGTAAAATTTTGATTCTTTTA CGATTTTTATGATTTTATTTGTCGCTGTTGTTTTCTTCATTTGATTTTTTTTCTTTTGTT CATTATTTTGCTCCTTTTTTTCTGGATTTCGCGTCATTCTCATCGTTTTATGTATTGGGT TGGTTTTTTTATTTATCTCTGGTTTAGGTTCTTTATATGATTATGATATTTTTATTGTCT TTTTTTTTTTTTTGGGGAATTTTTAAATAACAAGGATCATGAATTTTTTTTAGGGTTTGT TGTTTAGGTTTTTTAGATTCGGCTAATTGATTTTTATAGCTTTTAGATTTATTATAATTG GGTGATTTAGGTTTTTTTTATAGCGTCAATGAAATTCTGATTCATTTTCGTAATTAGGTG ATTTATTTTTTATTTTTTTTTTCATTCAAAGGGCAAGAATGCTCATTACTTGCTAATTCT TTTATGTAAGCCAAGAAGATGTGTATATCCTCAGTTGAATTATCTTTTTTCATGTGGTTT GTTTTGTTTGCTTATTGGCAGCATGTACTAATTAACTTGAATTGTTGAAGTGAGACAGGC TTGAGTTTTACACATGGGGAAGAGGAAGTCAAGGGCAAAGCCACCTCCTAAGAAGAGAAT GGACAAGCTTGATACTGTTTTTAGCTGTCCATTCTGCAACCATGGAACCGGTGTTGAATG TCGTATGTAAGTGGTCTACAGTCTACACTATCTGATTTGTTTTTAATATATTTACATGCT TTAAGAAACATATGTTTTAGTTGAGATTCATGTCGTCAACTGCATCCAAACATCTATTCT 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