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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002317 | Chr6 | 1912276 | 1915467 | + | Shaggy-related protein kinase NtK-1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002317.m1 | 71 | 346 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 212.4 | 7.70E-63 |
LITCHI002317.m1 | 74 | 274 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89.4 | 2.40E-25 |
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>LITCHI002317.m1 ATGGCTTCTGTGGGCGTGGCACCAACTTCTTGTTTAAGAGAATCTAGTACTGTTGGTGTT GATAGGTTGCCTGAGGAGATGAATGACATGAAAATTAGGGATGACAAGGAAATGGAAGCA ACAGTTGTTGATGGTAATGGGACAGAGACAGGTCATATTATTGTGACAACCATTGGTGGT AGAAATGGTCAGCCAAAACAGACAATAAGCTACATGGCTGAACGCATTGTTGGACAAGGA TCTTTTGGAGTTGTCTTCCAGGCGAAGTGCTTAGAGACTGGTGAGACTGTGGCTATAAAA AAGGTTCTTCAGGATAAGAGGTATAAGAACCGTGAGCTGCAAACTATGCGTCTTCTTGAC CATCCGAATGTTGTTGCATTGAAGCACTGCTTCTTTTCAACAACCGAAAAGGATGAACTT TATCTTAATTTGGTTCTTGAGTACGTACCTGAAACTGTTCATCGCGTGATCAAACATTTT AACAAGTTGAACCAAAAGATGCCAATGATATATGTGAAACTTTATGCGTACCAGATCTTT AGGGCATTGTCTTATATTCATCGCACTATTGGAGTGTGTCATCGGGACATTAAACCTCAA AATCTTTTGGTAAATCCGCATACTCATCAGGTTAAACTATGTGATTTTGGAAGTGCAAAA GTGTTGGTAAAAGGGGAGCCGAACATATCTTATATCTGCTCCAGGTACTATAGAGCACCT GAGCTTATATTCGGGGCTACTGAGTACACCACTGCTATTGATATATGGTCTGCTGGTTGT GTTGTGGCTGAGCTTATGCTCGGAAAGCCGCTTTTTCCTGGTGACAGCGGAGTTGACCAG CTTGTTGAGATTATTAAGGTCTTGGGTACTCCTACAAGGGAGGAAATAAAATGCATGAAT CCCAACTATACTGAGTTCAAATTCCCCCAGATAAAAGCTCACCCCTGGCATAAGATATTC CCCAAACGGATGCCTCCAGAAGCTGTTGATTTGGTTTCAAGACTTCTACAATACTCTCCA AACTTACGTTGCACTGCTGTGAGTAAAGAAAATCCCTAG
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>LITCHI002317.m1 + Up_Stream_Len 2000 CATCAATATGGATAGTTTTCTTATTCTACGTAAGTAGTCCTCTCTTTTGCTTATGGTAGT AGGAATTCGGACTATATTTCAAAGTCTCATTTTAGTTGATTTCAACGATGTTCTGCTTTA GTGTTACTAGATAAAAAAAGTTCAGTTTTCCAATTTACTTTAATCCTTTTTTTTTTTTTA ATGATATAACTATAACCAGCACATTTTAACCATCACCAGCACACAAGAGCCCACAGCACA CCATCTCACCACACCAATGCATACATATATATATATATATATATATATATATAGGTATAT GTGTTTGTATGTCCCATTGTCCCATAACAAAAACAAAAACAAAAACAATTCACTTTTAGG GAGAGATAGAGAGGAATTGGCTTTCACAAAAACCAAAAAAAAATATTAAACATAAAAAAA AAGAAGAAAACAAAAGAGATCCATCACCATCCACCACCCATTCCCCTCTCTCTCTGCCTC TCTCTCTCTTGGACGCCCATCGTCTCTGCTTGTTTTGGGGGTTGATACGACGACGTTTTC CTTCCAGTTGGGAGATTTTCTTCTTCATATCCAGATTTTCCTCTCTCGATCGGTATACGT ATAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCAAATGGCCGTTTTTTATTTTTGATTTTTTTATTT TTACGATTTGGGTCGTTTTTGGTCTCTCCTGTTGATTTAGATTCGTCGTGGGGTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTGGTTGGTTTCGGTTTATTTTGTGTAAAGTTTTGATTTTTATTTTTTT TGGTTCTGATTTAGGGTTTGTTGGAAAGTTTAGATCTTTTTGTGTTTTTCTTGTTTTGAT GGTTGGTATTTGATGTGGGCTGATGATGATTTTGATGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTG GTTATGATTTTGTAGGCATTTGTGTGTGTATATATGTACATGTGTGTGTGGGGTTGTGTG TTGATGGTTGAGTTGTTTGATGTGAAAATTGTGAAAGCATTTTTTTTGACCTGTGTGTGC ATGGAGAGCTGCTATGTTGATTGCTTTACACCTATATAAGAAAAGAAATTGATTGAAGAA ATTGTGTTGTGGGGTTTAGGTTATGTGCTGCCTGCTTTTAGGAAGCTTTGCTTTAGTTTA GATATGTATAAGTAGGATGGAGACTTTTTTACCAATAGTTTAACATCAAAGTGATTATGA GTTGTTTGTGGTTTGATGAAGAAGCTGTTGTGGCTGGTTTATTGGGCATGGAGAATGTAT CTCAAGTAGGACTGCAGCATGTAGAAAGTTATCGGTTTGGGAATTTTAGATCTTTTTGTG TTTTACTTGCTTTGATGATTGGTGTTGATTGAGTGTTGATGATGATTATGTGTGTTTTTC TTGCTTTCTGTGATTTTTTTTTTCTCTGGTTTCATTTTTTTGTACACATGTATGTGCAGA AATTTGTGTATGGTTATGCTTTTATGGTTGAGTTGTTTGATGTGAATTGTATAAAGCATT TCTTTTTTCCCTAGTTGATTTAAGTATGCATGGAGAGCTGTTATATTATTTATTTTACAC CTATGTAAGATGAAAAATTGATTGAAGAAACTGTGTTGTGGGATTTAGCTTATGTGTTTG CTTTTGGAGAAGCGTTGGTTAGTTTAGATATGTACAAATAAGATGGACTTTACCGATTGT TTAACATCATAGTGATTATGGGTTCTATTTGGTTTCATCAAAAAGCTTATGGGAGTAGAA TTTAAGCATATCAATTATGATATATCATTTGTACTGGGTTTTCTCTGGCATCGAGTGTGG GTCTAATGTAGGATGTGGTATGCATGGAGCGGCATACTGATTTAGGGGTGTGTGTGTATC TAATTTAAGTTGTGGCCTGTGCCGTGTGTTATGTAAGACATCTCAGTTGAGTTTTCTTGC CATTGTTTGGTTACAACAGGTAAATGCATGGTATCTTTGTGGTGAAAAATAACAAGACGG AGACACTTTCCGTCTAGTAA
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>LITCHI002317.m1 GenomeSequence + ATGGCTTCTGTGGGCGTGGCACCAACTTCTTGTTTAAGAGAATCTAGTACTGTTGGTGTT GATAGGTTGCCTGAGGAGATGAATGACATGAAAATTAGGGATGACAAGGTTTACATGTCA CTTGTTAAAATTTTTTTGCTTATTCATTAATTTCTTGATCTTTATATATAAGCAATTACT CATTGGTTGGCTTAAACTTGTAGGAAATGGAAGCAACAGTTGTTGATGGTAATGGGACAG AGACAGGTCATATTATTGTGACAACCATTGGTGGTAGAAATGGTCAGCCAAAACAGGTAT ATCTTTGTGTGGTTTTGTTTTTTCCCCATGTATTATCACTTTTTAATTTTGCAACTTTAA ATTGTTTGTGACCTTTTTTTTGCCTCTTTCTGTCGTTCATTTTCGGGTGGTAAGTTACAG TATATGCATCTGAGCTATTTATTGGCTGTCTATTGCCCATTATACTTGGCAAATACCACT TGTTTTAGAATTTTTTTTTCTGAATAATGACTGCTTTTCAATTATCTATGTGACAGACAC CTACAGCTTTACTTACTGAGTGAAAATCTATAATTACTTACCCGATCGTTTTATGAATTA ACATAACTTCGTTTATTTTGTTGTATACCTCTTTTGTTGCCTGCTTTGCAGCTATGTATT ATAAAAACAAAACAAGTTAATATAAGTTGAGAATTGAGTAAATGCTCTAGAGTAGTTGGA GTTTGAAGAGCAATCTTCGACTACAACTCCTCCTTCAATTACAAGGCTCTGATATATATA ATGAAATTGAGCCAACAAAGCTTCCATATGGTGCAATGAATTTTTACATGTGGAGATTTT ATTATGGAATTTGTGGTATGTAATTAATTTATTTCCTTTTAATGGGATTTATATGTTTAA AATTATAGACAATAAGCTACATGGCTGAACGCATTGTTGGACAAGGATCTTTTGGAGTTG TCTTCCAGGTTAGTGTTTATATTATCGTTCTGTAAGTGGCAGGGAATAATGTGTTAGTGT TTCATACTATTTTGTGATAACTGCCATTTGTCTATCTTTTGTAATTTTAGGCGAAGTGCT TAGAGACTGGTGAGACTGTGGCTATAAAAAAGGTTCTTCAGGATAAGAGGTATAAGAACC GTGAGCTGCAAACTATGCGTCTTCTTGACCATCCGAATGTTGTTGCATTGAAGCACTGCT TCTTTTCAACAACCGAAAAGGATGAACTTTATCTTAATTTGGTTCTTGAGTACGTACCTG AAACTGTTCATCGCGTGATCAAACATTTTAACAAGTTGAACCAAAAGATGCCAATGATAT ATGTGAAACTTTATGCGTACCAGGTATGGGGTTGATCATTTGTTTTTTTTTTTTTTCCCT TCTCCCCTGTGGCTATGCTGCATTTGATTCATTCAGTTATTTTCTTCTGATTTCTCTCTC TATTTTTCTATTCTCTATTCTATAATTTTGCATTTGGCTGTTAAAAACCAATATTTCTTT TAAATATGGGGGCTGTATCTGCTTGATACAATTCTTTATATGAAGTTAATATTTGGGTTA CTAATATACTTTTGATTTTCTGCAGATCTTTAGGGCATTGTCTTATATTCATCGCACTAT TGGAGTGTGTCATCGGGACATTAAACCTCAAAATCTTTTGGTATGTTTACACTTTTATTT TTATATTTACCTCTGATTTGATTGGTTATATTGGTCCGACAGAAAGGATCGTAGTATTAA TTTTTTCAAGTTTGAACCAAAAGATTTTTGGGTTCTACTGTAATTTTCTTAGATACTAAA TATTTGATGAGTTAAGGGGATCTAGAACTTTTTCATGACATGATATTTTATATCTGATTC AAATAACAGAGCTCCAGTTTGTATGAACTACACACTAATTTTTTTTGGTTTGATGATCAA TATCTTTGTGATACTGATACAGTCCTATAATTTAATAACCAACTCAATCTTATAGTTCTA CTTTTATGGTGCAGGTAAATCCGCATACTCATCAGGTTAAACTATGTGATTTTGGAAGTG CAAAAGTGTTGGTACGTTTTGTTATTTATCATGTTTATAGTGTCTGCTTGAAATTATTTT GAGTTTGATTTAAGTTGGTATTACGGTATTCTTTTGCATGATCTTGACAGGTAAAAGGGG AGCCGAACATATCTTATATCTGCTCCAGGTACTATAGAGCACCTGAGCTTATATTCGGGG CTACTGAGTACACCACTGCTATTGATATATGGTCTGCTGGTTGTGTTGTGGCTGAGCTTA TGCTCGGAAAGGTAGGAGGTTTTTGGACATGAGGTTTATTGATATTTTGGTCTGTAAAGC TTGTATTAAATTAATTAATTCAATTCCTGTTTGATTTCAGCCGCTTTTTCCTGGTGACAG CGGAGTTGACCAGCTTGTTGAGATTATTAAGGTAATTGTAGCATCTTAAAGTTTTCCTTA ATAAGTACTGCAATTTCATTATGTTAAATAATTACCTTACCAAGTGGATTTTTTAACTTG TGGAGAAAAAGATCTTATATCAATCTGATTGCCCTGTTGTTGGAATGATGTCATCTTTTT AATAATAAAAAGGGATTCCTTGATATGATTTTTGAGGATGGAATGATAGAATCAAGAGTT CGTTACTTTACAGGTGCATTAAATCATGCAGATTGTTTGACTTGAAGGTTTTTTAGTGTT GTGGATATATTATTTGGTTGTCAATTATTCACTTGGAAGATGCCCATGTCTGTGGTGGAG TAATAATTGGATTCTTAACCATATTGGATTTGATATCCACGCTTCTCATTATCGTGCAAG GATGTTTGCTTTCAATTTTTGTTTCTGCATATACTAAATTGCCCTTTCTAAATGTTAAGC AATTTGATTGTTTTGACAGGTCTTGGGTACTCCTACAAGGGAGGAAATAAAATGCATGAA TCCCAACTATACTGAGTTCAAATTCCCCCAGATAAAAGCTCACCCCTGGCATAAGGTATT AGGAATTATCAGACCATATGTTGTGTGGATTAAGAAGTAAATGACTAATGTTCATATAAC ATTTCCTGATTATGTTTTTGTCAACAGATATTCCCCAAACGGATGCCTCCAGAAGCTGTT GATTTGGTTTCAAGACTTCTACAATACTCTCCAAACTTACGTTGCACTGCTGTGAGTAAA GAAAATCCCTAG