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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI002239Chr6374646382365;394528-GATA transcription factor 29

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI002239.m1190225PF00320.30GATADomain53.51.40E-14
LITCHI002239.m2190225PF00320.30GATADomain53.51.40E-14
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>LITCHI002239.m1
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>LITCHI002239.m2
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>LITCHI002239.m1
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>LITCHI002239.m2
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>LITCHI002239.m2
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GGTTACTATGCAATGCCACTTCATTTTTGCATTTTTGCATGGTGAATAATCATAATTAAG
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GATTTTGATGCGAAAAAATATCGAAAAATAGGGGTAATTCTTATGTTTCACCCCTATACT
TGAAATTTTTCAAAACTGTTTTACGGGTGACTTAAGTAAGAGATAGGGAGATGATCCAAG
TGAAAACGGAAGCCAAACAACCCATGGATTGGGCTATTTTATCAAAGGGGGTCTGAAAAT
GTCGACTTTTCATTCCAAGCCTTTGAAAATTTTACGGACTGCGTGGGGATGTTTCTAGGG
GTATATAAGTTAAGTTAAACTTTTGCAAAGAAACCGGAATTAGAAAGTCTCGATTAAGTT
AAAACCTAGAAAAGAAGTTTGTAGTAAAAAAAGGTATTGTAAGGAGTCGTTAATGTTAAA
AGCAATGTGTGTAACTTTGTGTAACACATTGTGACATATTTTAAGTAAGAATATGTTATG
CAGGTGACGCACAAACTAGTGGAGCAAAGGAGACTCATTAAGCCCTCTGGCAAGTTTGAA
AATCAAGTGTAAAAATTTGTTCAGGTACATCCATCGGGGGACGAAGTAAAAGAATTAACT
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TAGCAAGGACGACCTTACCCTAAAATTAGGGTTACCAAATGGTGATGGTGATCAAAATCA
AGAGCAATGGATTGATTTCATTCCCACTATGGTCCCATATGGTCAAGCCAATCTTAGCGG
TCATGATGATCAAATCTATACTCAGGGAATGAATGCTTACTATGGAATGGGTAATGTTGG
TAGACAAACTGTCCACAACAATGCCAACAACCTTTTATATGTATGGCAACCACGAAGGAT
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CTCTGTTTCCAATATAAGATGTACCAACTATAATTGCAATACCAATTATACTCCTATGTG
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TCTCCTTTTTATTTTATGACTTAAACTTTGGATAATTAAGTTGCCAGTGTAAAAGGTCAT
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>LITCHI002239.m1
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ACTACCGTTTGCGATGCAGTAAATTCCGCGCGTAGTTCTTGAAATATCTCAGTAGGGTCA
CAGTTGGTGTCAGTTGAAATCGCCACGTGATTCACTACATTAAGCGATATAGTTAGTCGT
CACGTGGTCACGTGGTTAGACTTTTGAAGGATACACATGATGCATTTAATAATAAAGTTT
TAATTTAAGCTTTATAAGTATCAAAACAAGCTATAAATACTTATATGATGATTTTCGTAT
TTATTATATTGATTAACTAACGAATTTTCTTTGTTATAGTGTAAAAATTTGTTCAGGTAC
ATCCATCGGGGGACGAAGTAAAAGAATTAACTCGTCAAAAATATAGATACAGCAAGTCTG
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GGGTTACCAAATGGTGATGGTGATCAAAATCAAGAGCAATGGATTGATTTCATTCCCACT
ATGGTCCCATATGGTCAAGCCAATCTTAGCGGTCATGATGATCAAATCTATACTCAGGGA
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AACCTTTTATATGTATGGCAACCACGAAGGATGGGATGCAATGCACAATACAATATGCAA
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TCCTGCAACTTTTATCATCCCCACAACAACTCCATGATGAGTACCAATCATCATATGATG
CTGCCGCCACCACCATCGCAGGCCATGAAGGACTACACCCTTCTTGATCACGTCCCAATG
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GTTATGTATTTTGGCCAATGTTTTGACATATTTAATGTTTTATTTGGATTTAAAGTATGT
TCTTTAGTATAAATTTATCATGTTAAATGTTAAACTTTAGGTTGGATTATTAAATTTTAT
TTTATTTTATGGTTGATAGTATTGTTAGGATTTAGAAATTATATCATTTGTGTTTATTAG
ATAATACTAAAGAAAAACACTTCATGAAATTTTGTAAGATTTTTATTTATTTATTTATTT
TTTAAACTTGTTGCGGG
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>LITCHI002239.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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GGTAAATTATGATTATTATTTATTATTTTTATAAAAACGAATTATTATTTTAAACATAGA
ATGATGACTCACTCCACCTTGCTACCATATATGAGTTGTACCTTCCATACATGAAGACAC
TCCTTGCTTTTAAATTCTTGTAACTAGAGCTCAAATCTTTATTTTTTTATTTACATCACT
ACGCATCTAGTCTCTTTCATACCACAATTGATGTAAGTATCTCCCTTCATTTTCAATTTT
TCACCATCATTCTCCTCTACCACCTTCTTTTTTACATAAAATTTTCTCCAGATTTTATGT
TTTTACTTGGGGTGGTTAGATTAGAACACTCATTTCTCCTTTTACAGAAATTATTAATTT
TTATTTTTAATTTTTAGACGAAGATACTACAAGGTATGTCATCTAAAAGAGAAAATAGGG
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CTGTCTGTATTTGATGTTGATACAACAAAATCTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTT
TTTCTTCTCATTCTTGATCATGTTGATAGTAGCAAATGTGTGATTATCGGATGATCATTT
CTCTCATATGTTTGATCATATATCTCAACAAATCAGATCTATGGGTAGAAATTGATTTTA
GTGTGTGATAAAAAAAAAAAAAAATCCATCAGATTTTCTAAATAAATAATATTTAGATGT
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TGCGTCGCGATATAGATAAACCATGATAATAATTATGTATGTATATTTCAATTATTCTAA
GTATTATATATGTATATTTCAATTATTCTAAGTATTTAACAATTTAATTGGTTGAAAAAA
AAAAATTTAATGTATATTGTTAATATATGGAATGATGATCAGATACAGCAAGTCTGCAAG
ACAAATTAAAATTGTTGATC
>LITCHI002239.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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GCATCTCAATTTCAAATCTCATTTACATCAACATAATATGAATACTCTTGGAAAAATGAT
TTTTTTTTTTTTAATTTGAGTTTTTACTTGAATATATTTAGTTTGCAAACTACATTATTA
ATTAAAGAGTAAGACTAAACTCTCAAAATTAATTAAACAAATATATATTTTTTTCAAATT
TATACTTGAATAATGTGATATATGAGTTGTCAACATCATATTAATTATCATATTATCTTA
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CTGTCTGTATTTGATGTTGATACAACAAAATCTTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTT
TTTCTTCTCATTCTTGATCATGTTGATAGTAGCAAATGTGTGATTATCGGATGATCATTT
CTCTCATATGTTTGATCATATATCTCAACAAATCAGATCTATGGGTAGAAATTGATTTTA
GTGTGTGATAAAAAAAAAAAAAAATCCATCAGATTTTCTAAATAAATAATATTTAGATGT
ATCTAATCTGGCTTAACGTCGCTAATGATGGTCTTTGCAGTCCCTCGCATAGGAAGTGTG
ACAATTTTTCGTAGATCTGTCTCATTTTGTTTTTATCTATACATTTGTTATTTTGAGTTT
CGGCTAACATTTCTTACATGCCCACGGCCCACTTTTCTCTCTAAATAATAGTTTTTTATT
GCATTCAAATTTTTCTAACATAGACTTTTATCTTATATGAATTGACGGGATAAAAATTTA
ACTCTTCCATTAAATCTCAAAAAAACAACTCTATTTCAAAATAATAATAATAATAATAGT
AATAACTCAAAAGTTTTAAGTTAATTCATTTAATAAAGAATCCACTAGAATTTAAAAGCT
TGCGTCGCGATATAGATAAACCATGATAATAATTATGTATGTATATTTCAATTATTCTAA
GTATTATATATGTATATTTCAATTATTCTAAGTATTTAACAATTTAATTGGTTGAAAAAA
AAAAATTTAATGTATATTGTTAATATATGGAATGATGATCAGATACAGCAAGTCTGCAAG
ACAAATTAAAATTGTTGATC
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>LITCHI006667.m1 GenomeSequence + 
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CCATTTTTTTTTCATTTTTTATTAATTTCTACAAAAAGTAAGAGAAATCAGATTATAATT
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CGTTGATCGGTATTTGCATCGTAGTTTGTCTTTTTGATTCTCCAAGGAAAAAAAAAAAAA
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GCTGGTATGGTAGGTGGGTAAAGAAGAAAAAGAATTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATCTG
GTTGACTGGTAGCTAAGAGATAGAGATTAGAGAGATAGAGAGAGAGAGACCAAACCAAAA
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GAAGTAGTCCAAGATAAATGCTCTAGATTTGCCCTTTTTTGTCCCGTAGTTTGATGTCAA
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TTACTTATTTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATCAATTCAATTTTCTAGATGCCGCTCGACT
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CTCCTCCCAAATCCACTACCAAGAAGAAACGCAACCTCCCTGGAATGCCTGGTACAAATT
CATAAACTTTTTTTGGCTTTTTTTCTTGTTTTTGTTTTTTGATTGATTTTTTTTTTTTCA
GATCCAGATGCGGAGGTGATCGCTTTGTCGCCAAAAACCCTGATGGCAACAAACAGGTTT
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GGACATAATCTACCGTGGAAGCTGAGACAGAGATCGAACAAGGAAGTGAAGAAGAGAGTC
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TGCGCCAAGAAATACGCCGTCCAGTCTGATTGGAAGGCTCACTCTAAGGTCTGTGGCTCC
AGAGAGTACAAATGCGATTGTGGTGCTCTCTTTGCAAGGTATTTTTTTGATTTTCAATTG
ATTTCATCTTTTTATCATTTTTTTGTTTTTATATATTTTGACTTATTGTAATTCATTTTT
TTAAAATCAGGAGGGACAGCTTTATCACCCACAGAGCCTTTTGTGATGTATTGACAGAAG
CTACTGTGAGAGTTCAGGGTCAGCCGGAAAATCCCAAACTGCCGGAGGGAAATCCGGTAT
CAGAATCCGACCCGAAAGTTCAGGCCGTTGTTGATTCTTCTACTACTACGACACCAGTTG
CTGCTGTTCCAGCACCGGTTTCAACTCCACCAGTGGTTTCTCAGACAGCAAGTGTTTTAT
CTTCTTCAGTTCTTCCTAATTCAGGTAAAGTTTAATATTAGAACCCAAAAGTGGAAAACT
GTCGATTTTTTGGTTTTGGATGGTTTTGTCGGATTTGGGTTTTTTTTTCTCCTTTTTGTT
TAAATAAACAAACTACAAAAATATTTGTTATTCTCTCTCTCATTCTTAGTTCTGGATCTT
GTATTGTAGCAGTTTTTGTCTGGTACTGATGTTTGTTGTTATTTGGATTGTATTATTATT
ACCATACAGTGGAGTCAAAATGATCTATAGGATGTTAAAATCAAGTGAGACAAATAAGGC
CTTGTAAGTGTTGGAGCAATTAATTTTCTTTTAGTACATTTTTGAGATTCAATTTTTTGC
AATCTTGATGAGCTACTTGAAGTGGATTCAAAAGCTGAAAAAGGAAGAAAAGAGAGATGG
TTTAGAGAAAGAGAACCATGATTGAATCTGCTTTTTATTGTAAAGTTGTTTATAAAGAAA
AGTTCGAACTTTCCATGTACATATGTTTAAAGAAGTGGGTTGATTGAAAGTGAACCATTA
TTGATACCACTTGTATGTTTTAAACTTTTCCTCTTGAATTTTGTATGCAGAAATGCCAGA
AAGTTCCACACAAGTTATCGAAGAAGCACAAGCTACACCAGCAGCAGTTGCATCAACTGC
TGGATTAAATGGATGTTTAAATGGGAGCTGCAGCAGCATCAGCAGTAGTGCTAGTGGCAG
TGGAAGTACTAGTAGTAGCGTTTTCGCCAGCTTATTTGCTTCTACAACTGCATCGGTGAG
TTTACAACCTTCGCATACTGCAGTGTTTACTGATGTAATCACAACTACAACACGGGCTGA
TCGCACTGCTGAGCTTGCGTCTTCTTCATCGACGGATCCTATTTCCTTGTGCCTCTCAAC
CAACCATGGTTCATCACTTTTTGGAACTGGAGGGCAAGATCGCAGACAATACGTGCCGCC
ACCACAGCCATCTCTTTCTGCCACCGCACTACTACAAAAGGCTGCTCAAATGGGTGCGAC
AGCTTCTAATGCTTCGTTGCTTCGTGGCTTGGGGATAGTCCCATCTTCATCGTCCTCTCA
GCAGGACAGTATGCATTGGGGTCATGGGCAATTAGATTCTGAGAATGCGTCCATTCTACC
GGGGCTTGGACTTGGGCTGCCGAGTGATGGAGGTTCTGGATTGAAGGAATTAATGATGGG
AGGAACAGCTCCAGGGTTTGGTCCTAAGCAGACTACCCTTGATTTTCTTGGACTAGGGAT
GGCTGCTGGTGGCACACCCCTATCTGCTCTTATCCCATCTATTGGAAATGGGCTTGATTT
GGCTGCGGCTACATCTTCTTATGGAGGTGGGGAAATCTCTGGCAAAGACATAGGACGTAG
CTCGTGACATGTACGAGAGAAGGATTATGCATACTTCTCCATTGAGAATTATAATGCGAT
TGTAAGGTAGAAAAGGAATGTCGTAGTAGAAGAATATTAAACATCAAGTCATCACTGGCA
GTTGGGTAATTTTGACAGTTCTGCTGCCTCTCCTTATGGCTTTTGGGCTGTAAGCTGCAG
CTGTTCTTGGTCATGTAAAACTTGTAGTAAAGCTAAAACCAGATACCCTTTTCTTCCTCA
GATGTGTAGTGGGAGTCTCTAAATTATAAGTACATATATTTTGCACTCAAAAGTACTGGA
TGGATTTGGAAGATTGCTCAAGCCGGAGAAGGGAACATCAATTGATCAACCCTCAGGTCT
GTGATTGGTTTGGTCACTTGTTGAATGAATGTGGTCCATCACTGAATTCGTTGTGTTAGG
TTTATGATAAAGCTTAAAATCATGGAACAACACGGAGGGAATTCTATTTGTATAATTCCA
GGCATAAATTAGTATATAGTTTAAATTAGTAGTTGTGAAGATTAAGTTTGCGGTTGTTAG
GTCCAGTTAAACATTGTGCTGTCATGTTAGTATATCAGAAATCAATTTAAATTGAATGTA
ATGTTTATTTCGATTAATCTGTTTGAAATTCCTCATTTCTTTGGTGTTAAAGTTCTTGTG
ATTACCTTGGTTTTGGTTTTATCAGGTAGACATATATATTTAGTGAAAATAGTGAGAAAA
GTCTCTAATTTTTTCATTTTCTTGTTTGAAACTCATTCAACGTGAAATTTTCATTTTAAA
ACTTTTGGGGTTG
>LITCHI006667.m2 GenomeSequence + 
CATCAAGCCCCCTGATTAATTTGACCTTTTCAACCTTTTTAACCAAAAACTGACTAAACA
CCATTTTTTTTTCATTTTTTATTAATTTCTACAAAAAGTAAGAGAAATCAGATTATAATT
TATGAAGCTAAAGAACCAACCACTTTCACTTCATCAAAATTCTCTTGGTGTATCTTTTTT
CATCTTATACCATCTTCTCTGTGTTTCAGCTGTCGATCGAGTCAGTAAATTATAGATAAA
CGTTGATCGGTATTTGCATCGTAGTTTGTCTTTTTGATTCTCCAAGGAAAAAAAAAAAAA
AAAACTTGAAAGCTGATTTACAGTCTTGGGGTTAATCATTTGATTTCTTCGGGTAACGTG
AGAGACTGATCTGTTAGATAGAGAGAGAGATAGAGAAAAAAAGAAGAAGAAGAAAATAGA
GCTGGTATGGTAGGTGGGTAAAGAAGAAAAAGAATTAAAAAAAAAGAAAAAAAAAATCTG
GTTGACTGGTAGCTAAGAGATAGAGATTAGAGAGATAGAGAGAGAGAGACCAAACCAAAA
CTAAAACCAAATGATACAACCCCTAGAGGTAGAGGAGTTAAATTAATAAAAATAAAATAA
TACAGTAACTCAAAAATAAAAAATTAAATAAAATAACTTTTGTCTTCAAAAGTCTCTTTA
GAAGTAGTCCAAGATAAATGCTCTAGATTTGCCCTTTTTTGTCCCGTAGTTTGATGTCAA
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TTACTTATTTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATCAATTCAATTTTCTAGATGCCGCTCGACT
TGGATAATTCCTCCACCGCTTCCGGTGAAGCCAGCCTCTCTTCTTCCGGGAACCAGAACC
CTCCTCCCAAATCCACTACCAAGAAGAAACGCAACCTCCCTGGAATGCCTGGTACAAATT
CATAAACTTTTTTTGGCTTTTTTTCTTGTTTTTGTTTTTTGATTGATTTTTTTTTTTTCA
GATCCAGATGCGGAGGTGATCGCTTTGTCGCCAAAAACCCTGATGGCAACAAACAGGTTT
GTGTGTGAAATCTGCAACAAGGGGTTCCAGAGGGACCAGAACTTGCAGCTACATCGAAGG
GGACATAATCTACCGTGGAAGCTGAGACAGAGATCGAACAAGGAAGTGAAGAAGAGAGTC
TACGTGTGTCCTGAACCGACTTGTGTCCACCACCACCCTTCTAGAGCTCTCGGTGATCTT
ACAGGGATCAAGAAACACTTCTGCAGGAAGCACGGTGAGAAGAAGTGGAAATGCGACAAG
TGCGCCAAGAAATACGCCGTCCAGTCTGATTGGAAGGCTCACTCTAAGGTCTGTGGCTCC
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