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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002226 | Chr5 | 34356395 | 34363465 | - | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002226.m1 | 80 | 171 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 117.6 | 3.30E-34 |
LITCHI002226.m1 | 292 | 385 | PF10551.12 | MULE | Domain | 98.5 | 2.40E-28 |
LITCHI002226.m1 | 560 | 606 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 42.3 | 4.60E-11 |
LITCHI002226.m1 | 863 | 954 | PF10551.12 | MULE | Domain | 79.6 | 1.90E-22 |
LITCHI002226.m1 | 1138 | 1178 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 44.2 | 1.10E-11 |
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>LITCHI002226.m1 ATGGATAGTGAGGTTCTAGAATTTGATATAGGTGTAGGAGGAACAAGTGGTGGTGGTGGG GAAGGAGATGAGGATATTATAGACATTGCACACCCTGTTGATGATGAGGACCTGGAAGAC AGCCCTCTTCCTGCTAGTGGTCCTGGCAGTGGCGAAATTTACCTGCCTGAGGGTGACTTG TTGGATCTCGAACCTTATGAGGGCATGGAATTTGAGTCTGAAGAGGCTGCCAAGGCCTTT TACAATTCTTATGCCCGTCGTGTTGGCTTCAGTACCCGTGTTAGTTCCTCTCGCCGTTCC AGGCGTGATGGAGCCATTATCCAACGCCAATTTGTTTGTGCTAAGGAGGGTTTTAGGAAT TTGAATGAGAAACGTACCAAGGATAGGGAGATCAAGCGGCCCCGCACTATTACTAGAGTC GGCTGCAAAGCCTCTTTATCTGTCAAGATGCAGGATTCTGGCAAATGGGTTGTGTCTGGT TTTGTCAAAGAACATAACCATGAGCTGGTCCCCCCAGACCAGGTTCATTGCCTTCGTTCT CACAGGCAAATCTCTGGTCCTGCTAAGACCTTGATTGATACCTTGCAAGCTGCTGGAATG GGCCCACGTAGGATTATGTCTGCCTTAATTAAGGAATATGGTGGAATTAGCAAGGTTGGA TTTACAGAGGTGGATTGTAGGAATTATATGAGAAATAATCGTCATAGGAGCTTAGAAGGA GACATTCAGCTCCTCCTGGATTATTTGAGGCAGATGCATTCAGAGAACCCCAATTTCTTT TATGCAGTGCAGGCCAATGAGGACCAGTCAACGAGCAACGTTTTCTGGGCTGATCCAAAG GCAAGGATGAATTATACTTACTTTGGGGATACTGTCACCTTTGACACCACGTACAGGTCC AATAGGTACCGCTTGCCCTTTGCTCCTTTCACTGGGGTAAACCATCATGGGCAGCCCGTG TTTTTTGGTTGTGCGTTCTTAATAAATGAATCTGAAGCTTCTTTTATTTGGTTGTTTAAG ACATGGCTTAGAGCAATGTCAGGTCGTCCCCCGGTGTCAATCACGACTGACCATGATGCA GTAATAAGGTCTGCTATCACTGAAGTTTTTCCAGAGACCCGACATCGTTTCTGCAAATGG CACATCTTCAAAAAGTGCCAAGAGAAGTTATCCCATGTGTTTCTCCAGCATCCAAATTTT GAAGCAGACTTTCACAAATGTGTTAACTTGACCGAGTCAATTGAGGAATTTGAATCTTGC TGGTTGTCTCTGGTTGATAGGTATGAACTCAGGGATCATGAGTGGCTTCAAACAATCTAT GCTGCACGTGGACATTGGGTTCCTGTATATTTGCGGGACACTTTTTTCGCAGAAATGTCT ATCACTCAGCGAAGTGATAGCATGAATTCATACTTTGATGGATATGTGAATGCTTCAACC AATTTGAGTCAATTTTTCAAGCTGTATGAGAAAGCATTAGAGTCTCGAAATGAGAAAGAA GTGAAAGCAGATTATGATACAATGAACACTTCCCCAGTTTTAAAGACTCCATCTCCAATG GAGAGACAAGCATCCGAACTTTACACTAGAAAATTATTCATGAGGTTTCAAGAGGAGCTG GTTGGGACACTAACCTTCATGGCATCAAAAGCTGAGGATGATGGGGAGATCATTACATAT CAAGTAGCAAAATTTGGCGAGGATCATAAAGCTTACTATGTCAAATTCAATGTCTTAGAG ATGAAAGCCTCCTGTAGTTGCCAGATGTTTGAGTTTTCAGGTCTTTTGTGTAGACATGTA ATGGCAGTCTTTCGAGTGACCAATGTTCTTACTCTGCCAGCGCATTATATTTTGAAACGA TGGACAAGAAATGCCAAGAGCAGTGTTATATTGGAGGAACGTGCTAATGATATATATACC AATTATCTAGAATCTCATACAGTCCGATATAATACCCTACGGTATGAGGCCTTCAAATTC GTCGACGAAGGGGCAAGGTCTCTAGACACTTACAATGCAGCAATGGCTGCCCTGCAAGAG GCTGCAAAAAGAGTTGCACTGGCGGCAACAAAGAATGAGGGCCGAACTACCATGGTGAAT GGGCATATTAGGGGGACCCTTGCAAGTGATGCAAATCAGGCAAATAGTACAAGTGCAAAT CATCAAGGGATTTCCGGCCAACCTCTGTCTGAGGATGACATGGACAAAAGAATCCGAGAA CTTAACAATGACTTGGAATTTGCAAGTCGAAAGTGTGAGGTTTATCGGGCGAATCTGCTT TCAATTTTAAAAGACATTGAGGACCATAAGCTACAGTTGTCAATTAAGACCATGAGGAGA GAATGTATGCGGTCTATTGTGGGGGGCAATGAGCGTGGCCCATGTTTATTTTTGGAGTAC ATGAGTGCCGGCAGGCAGAGGACCCTCGGTGGTGGGGGTCAGCATGTATTGGACTATTTG AAACGAATGCAGGCAGAGAATCCTTCTTTCTTTTATGCAGTTCAGGGGGATAATGATCAC TCTGGTGGTAACATATTTTGGGTCGATGCAACATGTAGAATGACCTATTCTTACTTTGGA GACACTGTCACATTCGATACAATATACAAGACAGGACGCTTTAGAGTTCCATTTGCTTCA TTCACAGGAGTGAATCATCATGGTCAACCTGTATTGTTCGGGTGTGCCCTGATTCTCAAT GAATCCGAGTCATCATTTATTTGGCTGTTTCATACCTGGCTTCAAGCCATGTCTGGTTGC TGCCCTGTCTCTATCACAACAGACCCAGATCGGTCAATTCAGGTGGCTGTAGCACAAGTT CTTCCTGAAACCCGCCATCGTTTTTGTAAGTGGGGCATATTTAGGGAAACTCAAGAGAAA CTAGCTGATATATATCAATCTCATCCTACATTTGAAACTGAATTTAAGAAATGTATTAAT GAATCTGAGACGATTGATGAGTTTGAGTCTTCTTGGCATTCATTACTGGGAAGATACTAT GTCATGAATAATGAATGGCTTCAGTCAATGTACGTTGCTCGGCAACAGTGGGTTCCAGTT TATATGCGAGACACATTTTTCGGGGAGATCTCTAGTACTGACAAGAGTGGGGGAAACTTG TTTTTTGATGGGCACGTGAATGCATCGACCACCATACAGATGTTGATTAAACAGTATGAG AAAGCTGTAGCAAGTTGGCATGAAAAGGAGTTAAAAGCAGATTTTGATACTACAAACACT ACGCCTGTTCTGAAGACACCATCTCCTATGGAAAAACAAGCAGCAAACCTCTATACAAGA AGAATATTCATTAAATTCCAAGAGGAATTGGTTGAGACCCTTGCTAATCCTGCAACTAGG GTTGACGACTCAGGAACCATAACCACTTATCGCGTGGCCAAATTCGGGGAAGATCACAAA GCACGAACTGTCAGTTTCAATTCTTTTGAGATGAAAGCTAGCTGCAGCTGCCAAATGTTT GAATACTCTGGAATAATTTGTAGGCACATACTAGCAGTTTTTAGAGCAAAAAATGTTCTT ACATTGCCTTCTCAATATGTATTAAAGCGATGGACAAGAAATGCCAAGACTGGAGCTGCG GAAGACGAGCAGGCATCAGATTTGCCAAACAACACTCGAGAGTCTTTAACAGTTAGGTAT AACAATCTACGTCAAGATGCAATCAAATATGTAGAAGAAGGGGCAAAATCCATTCACATC TATAATGTGGCAATGGATGCTTTACGAGAAGCAGTCAGTAAGGTGACTGCTGCAAAGAAT CAAGGTTCTGGACCCACACATGGCAGGACTTTGTCCAATGGAGCTAGCCAAGAGCTGCCA GCAGCTGAAGGAACTCAAGCCCAAGCATATCAATCTGTGTTAAATCCCTTTTTTCTCTTC TATTGA
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>LITCHI002226.m1 - Up_Stream_Len 2000 TATCTAACAAAAACTCATATGTTGATGTTCAATCCATTGTTCACAGTACCTATTTTAGAC ACCACAAATAGAATCGCTTACAAAATTCAAAGCACAAAGTCAATAATCTTAACAATCACA TCAAAGTGTTTATGCTACAAAAAACCCACTATGAACAACATTACAGTTTTGTTTGTTCAT TTAACATGCATTCATGCATACGATAACAAAAGGGACAATTATTTTATTTGTAATTTCTTT GGCCAATATACTTTGTTGATGTCTTAATTTTAACATCCCACAAACCCATCCAAGAACACT AAACAAAAATTAACACAAACTCTTTGATGTTCATGACTCCTTATTTAAGAGGAGTTATAG ATTCATATGGTGATTATTTGGATTAACTATAGTTCTGTAATACAATGTATAGAAATGAAT GACATAACCCTCAAGCTTGTTGGATTATATTTAAGGAAAATCTTCATAATAAAGGCTAAC TAATGCATGTTTACTTGATAGTTTAATGAAGATTAGCTAAAAATTTCCCATTATTTTTTC CTAAACGATTGATTACTCATGTTACCTATATTTTAAAGTGGGGTTTCTACTTTTCCAGTT GCATCAAACTAGCAATAATGATATTAGAACCATGTGGATTTGAGATGCTCTAGTCATTAA TTAATTAAACAACCATAAAAGTATAACTTGAATGCTCCACAACAGTTGAGTATTTAAAGA TGCTCAAAAGATGGTGTATCAACTTTAAAGGAAAGTGGAAAAAAAAAATAAAAATCTAAG AGCAGTTTGTCCCCTCACAACAATACATTCACATTATAAACACATTACCAAAAACAACTA CCAATATAATTTAACATTCACATTCTAATCATACCTACAAAACCACACACAAAATAGACC AAACAGCCAAAACCCACTTTCAAAATCCTAACCTTGGTTCATATTACCATATTCGGATAC TCAAAGTAAGTAAAGTTAGTCAAATAAACTTACCAGTTGGAGAGAAGAAGAGAGTTAGTT GTGGTTGCAGTTCTTTCACAATCCAAAAAATGAGAGATGTTGGGAACAAGCTAACTGATT CCTTCTTTTGTTGGGCAAGGGAAAAGAGAAGAGAGGTTGGGTGTGGGAAGTGAGAAGAGA GCAAGATGTGGAAAGTGACGAAATAGAGAGCTTTTGGGTATGAGTGTACTGCACAAGAAA ACAATGCATTATTTTTGGGTGGCAGCTATCATTAAGGGCATTTTTGTCCATTAAAGGTTT TTTTTGTAAGAATCTCATAAAGAGGTTGTTTTTCAACTTGACCTTCCAAAGAGGGTTATT TTGGGCATTTTCTCATAATAAAATGATGATATATGGTCTGTCCAGAGAACAATAGTAAAA ATTTGATAAAAAGTGACACATTACCATATTAAAATGATGATAAATGGAATATGGACTGTC CACAGAACAATAGTAAAATTTTGGTACAGCGACATATTACCGCACATATATATATATATA TATATATATATATTTTAACCAGACATGTTACCATATCTGGTTGACAAAAACAGATCTATC TTAACAAAAAAAAAAAATAAATAAAATGTCTATCTTAGAATGAAAATCAGACGGCTGATT TGATGGGCACGGTCAAAACTCAATACACGAGAACCCACCTTCCAGTCCATCAACGCTCGC TCTTCCTACACAACAAAAACTCTCCTTTGTTTCCTAAATTCAATCGACTCAACCCAACCC AAATACAATTCTCTCCCAACAATTCCCAATCTAATATCATTCTTCTAGGGTTTTCCTCCT CAAGTTGAAACCCTAGACTCTTGTTGTCTCTGATTTTACTTTCGAATGGTTTGTGGCTTG TCAATCAATTGCTGGGCTGAGCAGTGAACATCCACCAGACTGTGTAAAATGGTCAGTTGT TTCGTTTACTTGCCTGTTAACTTTTTATAGGTAAAAAGGTTTCGATTTTCATATCTCCAC TAGACTGTTAGAGGAGGGGG
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>LITCHI002226.m1 GenomeSequence - TATATATATATATATATATATATTTTAACCAGACATGTTACCATATCTGGTTGACAAAAA CAGATCTATCTTAACAAAAAAAAAAAATAAATAAAATGTCTATCTTAGAATGAAAATCAG ACGGCTGATTTGATGGGCACGGTCAAAACTCAATACACGAGAACCCACCTTCCAGTCCAT CAACGCTCGCTCTTCCTACACAACAAAAACTCTCCTTTGTTTCCTAAATTCAATCGACTC AACCCAACCCAAATACAATTCTCTCCCAACAATTCCCAATCTAATATCATTCTTCTAGGG TTTTCCTCCTCAAGTTGAAACCCTAGACTCTTGTTGTCTCTGATTTTACTTTCGAATGGT TTGTGGCTTGTCAATCAATTGCTGGGCTGAGCAGTGAACATCCACCAGACTGTGTAAAAT GGTCAGTTGTTTCGTTTACTTGCCTGTTAACTTTTTATAGGTAAAAAGGTTTCGATTTTC ATATCTCCACTAGACTGTTAGAGGAGGGGGATGGATAGTGAGGTTCTAGAATTTGATATA GGTGTAGGAGGAACAAGTGGTGGTGGTGGGGAAGGAGATGAGGATATTATAGACATTGCA CACCCTGTTGATGATGAGGACCTGGAAGACAGCCCTCTTCCTGCTAGTGGTCCTGGCAGT GGCGAAATTTACCTGCCTGAGGGTGACTTGTTGGATCTCGAACCTTATGAGGGCATGGAA TTTGAGTCTGAAGAGGCTGCCAAGGCCTTTTACAATTCTTATGCCCGTCGTGTTGGCTTC AGTACCCGTGTTAGTTCCTCTCGCCGTTCCAGGCGTGATGGAGCCATTATCCAACGCCAA TTTGTTTGTGCTAAGGAGGGTTTTAGGAATTTGAATGAGAAACGTACCAAGGATAGGGAG 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