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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002217 | Chr5 | 34226315 | 34241240 | + | Phototropin-2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002217.m1 | 184 | 269 | PF13426.10 | PAS_9 | Domain | 39.2 | 7.60E-10 |
LITCHI002217.m1 | 439 | 531 | PF13426.10 | PAS_9 | Domain | 74 | 1.10E-20 |
LITCHI002217.m1 | 442 | 531 | PF00989.28 | PAS | Domain | 28.7 | 1.20E-06 |
LITCHI002217.m1 | 443 | 528 | PF08447.15 | PAS_3 | Domain | 27.9 | 2.30E-06 |
LITCHI002217.m1 | 619 | 904 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 202.6 | 7.70E-60 |
LITCHI002217.m1 | 620 | 765 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 62.6 | 3.70E-17 |
LITCHI002217.m1 | 808 | 860 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 23.2 | 4.00E-05 |
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>LITCHI002217.m1 ATGAACCAAGGGTCAGGATTAGCAAGTCATAATGAACTTGTAATGAGTGATGAGGAGGAA AATAGTACAGTTGGGACTGAAGTTGTAGTTATATTTATGATGTCAACAGGAAATGATGAG TGCACAAATAGGAAAGACAAGGGAAGATCAAGTCAGGAGGAGAATGGTGGAGTAAGAAAA GGTACACAAAAAGGCTTGGGGTCAAGTAGTAACAACAAGTGGATGGCATTTGAAAAAGAC AAGTGTGAGATGAGAATAGCTGATAGTAGTGAAAATAAGGAGAAGGGAATATTAACAGGA ACAAGTATAGCTGAAAGGACAGCAGAATGGGGACTAGTAGTGAAGTCAGACGTGGGAGAA GGTAGCTTCAAAGCAGTTGGTGTGAGGGCATCAGGAGAGGGTGATAGAAGCAAGAACTCA TCCGACAGATTTGCGGTAGACTCAAATAGAACATCAGAGGACTCCGAATCGGGAGCCTTT CCTAGAGTATCACAGGAGTTGAAGGCTGCTTTAGCTACTTTACAACAAACATTTGTGGTG TCTGATGCCACCAAACCAGACTGCCCTATCATGTACGCCAGCAGTGGATTTTTCAGCATG ACTGGTTACTCTTCCAGGGAAGGTGCGGAGACGGACAGAAAAGAAGTAGCCAAGATACGA GATGCAGTGAAGAACGGGAGAAGCTACTGCGGCAGGCTCCTCAACTACAAAAAGGATGGC ACTCCTTTCTGGAATCTTCTCACTGTCACTCCTATTAAAGATGATCATGGCAAGACCATC AAATTTATAGGAATGCAGGTTGAGGTCAACAAATATACTGAAGGTGTCAATGATAAGGCA TTACGCCCCAATGGATTGCCTAAGTCTTTGATCCGCTATGATGCCCGTCAAAAGGAGAAG GCTTTAGGTTCTATTACAGAGGTTGTCCAAACTGTGAGAAATCACAAACGGGCTATCAGT TATGATACCACTGCAAAGATTGAGGATTTTGCGCTCACCGAATCTGCTGACATTGGCAAC ATGACTACACCCACTAGACAAACACCTCAGTCCTATTCTCACAATGAAGCTGCTAAAAGT TCTAGAAAATCAGCACGCAGTTCCTTTATGGGGTTTAAGGGGAGATCTCTCAGCTTTGCA GCAAGGCAGGAACCACAACCAAGTATTGAACCTGAGGTTTTGATGACTAAAGAAACAGAA CGCACTGATAGTTGGGACCATGCTGAAAGAGAAAGGGATATCCGCCAAGGAATTGATCTA GCCACTACATTGGAACGCATTGAAAAAAATTTTGTTATCACAGATCCAAGAATTCCTGAT AATCCAATTATATTTGCCTCTGACAGCTTTCTTGAATTGACAGAATATACACGTGAAGAA ATTTTGGGAAGAAACTGTCGATTTCTTCAAGGACCTGAAACAGATCAATCAACTGTCTCA AAGATAAGAGATGCAATTAGAGAGCAAAGGGAAATTACTGTTCAGTTGATCAACTATACT AAGAGTGGAAAAAAATTCTGGAATTTATTCCACTTACAACCGATGCGTGACCAGAAGGGA GAGCTTCAATACTTCATTGGTGTCCAACTTGATGGAAGTGATCATGTGGAACCCTTGCGG AATCGCCTGTCAGAGAGAACAGAGCAACAAAGTACAAAGTTGGTTAAAGCTACTGCAGAA AATGTTGATGAAGCTGTGCGGGAACTTCCTGATGCCAACTTGAGACCAGAAGACTTGTGG GCAATTCACTCTGAGCCTGTCTTCCCACGACCTCATAAAAAGAACAATTATTCTTGGATA GCAATACAAAAGATCACTGCACGTGGTGAAAAAATTGGGCTCCACCATTTCAAGCCAATC AAACCGTTGGGCTGTGGTGATACTGGCAGTGTTCATCTGGTGGAACTGCAAGGTAGCGGT GAATTGTATGCTATGAAGGCAATGGAAAAATCTGTCATGTTAAATCGTAACAAGGTTCAC CGAGCATGCGTTGAAAGGGAAATTATGTCGCTACTAGATCACCCTTTTCTTCCTGCACTG TATGCTTCCTTTCAGACTCCTACACACATTTGTTTGATAACAGACTTTTGTCCCGGTGGA GAGTTATTTGCATTGCTTGACAAGCAGCCTATGAAGATATTTAAAGAGGAATCTGCCAGG TTCTATGCTGCAGAGGTTGTCATTGGCTTGGAATATCTTCATTGTTTAGGAATAATTTAT CGGGACCTAAAGCCTGAAAATATTTTACTCAACAAAGATGGGCATGTTGTATTGACAGAC TTTGATTTATCCTTTATGGCATCCTGTAAACCACATATTATTAAGCATCCACCATCTAAT GGTAGGAGGAGATCTAGGAGTCAGCCACCACCAACATTTTTGGCAGAACCAGTTACACAG TCAAATTCATTTGTTGGAACTGAAGAATATATTGCTCCGGAAATTATTACGGGTGCAGGC CACAGCAGTGCCATTGATTGGTGGGCTCTTGGTATATTGTTGTATGAGATGCTTTATGGC CGTACACCTTTCAGAGGTAAAAATAGACAGAAGACATTTGGCAACATCTTGCGCAAAGAC CTCACTTTTCCAAGCAGCATTCCGGTGAGTCTAGCTGGGAGGCAGATAATCAACGCGTTG TTAAACAGAGACCCAGCATGCCGCTTAGGATCAAATACTGGTGCCAATGAAATCAAACAA CATCCTTTCTTCCGTGGAATTAATTGGCCTCTAATTCGCTGCATGAGCCCACCACCACTG AATGCACCTCTTAAATTAATTGGAAAAGATCTGAAAGCCAAGGATGTCAACTGGGAAGAT GATGGAGTGCTCATTAATTCAGTTGATATGGAGATTTTCTGA
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