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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI002217 | Chr5 | 34226315 | 34241240 | + | Phototropin-2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI002217.m1 | 184 | 269 | PF13426.10 | PAS_9 | Domain | 39.2 | 7.60E-10 |
| LITCHI002217.m1 | 439 | 531 | PF13426.10 | PAS_9 | Domain | 74 | 1.10E-20 |
| LITCHI002217.m1 | 442 | 531 | PF00989.28 | PAS | Domain | 28.7 | 1.20E-06 |
| LITCHI002217.m1 | 443 | 528 | PF08447.15 | PAS_3 | Domain | 27.9 | 2.30E-06 |
| LITCHI002217.m1 | 619 | 904 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 202.6 | 7.70E-60 |
| LITCHI002217.m1 | 620 | 765 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 62.6 | 3.70E-17 |
| LITCHI002217.m1 | 808 | 860 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 23.2 | 4.00E-05 |
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>LITCHI002217.m1 ATGAACCAAGGGTCAGGATTAGCAAGTCATAATGAACTTGTAATGAGTGATGAGGAGGAA AATAGTACAGTTGGGACTGAAGTTGTAGTTATATTTATGATGTCAACAGGAAATGATGAG TGCACAAATAGGAAAGACAAGGGAAGATCAAGTCAGGAGGAGAATGGTGGAGTAAGAAAA GGTACACAAAAAGGCTTGGGGTCAAGTAGTAACAACAAGTGGATGGCATTTGAAAAAGAC AAGTGTGAGATGAGAATAGCTGATAGTAGTGAAAATAAGGAGAAGGGAATATTAACAGGA ACAAGTATAGCTGAAAGGACAGCAGAATGGGGACTAGTAGTGAAGTCAGACGTGGGAGAA GGTAGCTTCAAAGCAGTTGGTGTGAGGGCATCAGGAGAGGGTGATAGAAGCAAGAACTCA TCCGACAGATTTGCGGTAGACTCAAATAGAACATCAGAGGACTCCGAATCGGGAGCCTTT CCTAGAGTATCACAGGAGTTGAAGGCTGCTTTAGCTACTTTACAACAAACATTTGTGGTG TCTGATGCCACCAAACCAGACTGCCCTATCATGTACGCCAGCAGTGGATTTTTCAGCATG ACTGGTTACTCTTCCAGGGAAGGTGCGGAGACGGACAGAAAAGAAGTAGCCAAGATACGA GATGCAGTGAAGAACGGGAGAAGCTACTGCGGCAGGCTCCTCAACTACAAAAAGGATGGC ACTCCTTTCTGGAATCTTCTCACTGTCACTCCTATTAAAGATGATCATGGCAAGACCATC AAATTTATAGGAATGCAGGTTGAGGTCAACAAATATACTGAAGGTGTCAATGATAAGGCA TTACGCCCCAATGGATTGCCTAAGTCTTTGATCCGCTATGATGCCCGTCAAAAGGAGAAG GCTTTAGGTTCTATTACAGAGGTTGTCCAAACTGTGAGAAATCACAAACGGGCTATCAGT TATGATACCACTGCAAAGATTGAGGATTTTGCGCTCACCGAATCTGCTGACATTGGCAAC ATGACTACACCCACTAGACAAACACCTCAGTCCTATTCTCACAATGAAGCTGCTAAAAGT TCTAGAAAATCAGCACGCAGTTCCTTTATGGGGTTTAAGGGGAGATCTCTCAGCTTTGCA GCAAGGCAGGAACCACAACCAAGTATTGAACCTGAGGTTTTGATGACTAAAGAAACAGAA CGCACTGATAGTTGGGACCATGCTGAAAGAGAAAGGGATATCCGCCAAGGAATTGATCTA GCCACTACATTGGAACGCATTGAAAAAAATTTTGTTATCACAGATCCAAGAATTCCTGAT AATCCAATTATATTTGCCTCTGACAGCTTTCTTGAATTGACAGAATATACACGTGAAGAA ATTTTGGGAAGAAACTGTCGATTTCTTCAAGGACCTGAAACAGATCAATCAACTGTCTCA AAGATAAGAGATGCAATTAGAGAGCAAAGGGAAATTACTGTTCAGTTGATCAACTATACT AAGAGTGGAAAAAAATTCTGGAATTTATTCCACTTACAACCGATGCGTGACCAGAAGGGA GAGCTTCAATACTTCATTGGTGTCCAACTTGATGGAAGTGATCATGTGGAACCCTTGCGG AATCGCCTGTCAGAGAGAACAGAGCAACAAAGTACAAAGTTGGTTAAAGCTACTGCAGAA AATGTTGATGAAGCTGTGCGGGAACTTCCTGATGCCAACTTGAGACCAGAAGACTTGTGG GCAATTCACTCTGAGCCTGTCTTCCCACGACCTCATAAAAAGAACAATTATTCTTGGATA GCAATACAAAAGATCACTGCACGTGGTGAAAAAATTGGGCTCCACCATTTCAAGCCAATC AAACCGTTGGGCTGTGGTGATACTGGCAGTGTTCATCTGGTGGAACTGCAAGGTAGCGGT GAATTGTATGCTATGAAGGCAATGGAAAAATCTGTCATGTTAAATCGTAACAAGGTTCAC CGAGCATGCGTTGAAAGGGAAATTATGTCGCTACTAGATCACCCTTTTCTTCCTGCACTG TATGCTTCCTTTCAGACTCCTACACACATTTGTTTGATAACAGACTTTTGTCCCGGTGGA GAGTTATTTGCATTGCTTGACAAGCAGCCTATGAAGATATTTAAAGAGGAATCTGCCAGG TTCTATGCTGCAGAGGTTGTCATTGGCTTGGAATATCTTCATTGTTTAGGAATAATTTAT CGGGACCTAAAGCCTGAAAATATTTTACTCAACAAAGATGGGCATGTTGTATTGACAGAC TTTGATTTATCCTTTATGGCATCCTGTAAACCACATATTATTAAGCATCCACCATCTAAT GGTAGGAGGAGATCTAGGAGTCAGCCACCACCAACATTTTTGGCAGAACCAGTTACACAG TCAAATTCATTTGTTGGAACTGAAGAATATATTGCTCCGGAAATTATTACGGGTGCAGGC CACAGCAGTGCCATTGATTGGTGGGCTCTTGGTATATTGTTGTATGAGATGCTTTATGGC CGTACACCTTTCAGAGGTAAAAATAGACAGAAGACATTTGGCAACATCTTGCGCAAAGAC CTCACTTTTCCAAGCAGCATTCCGGTGAGTCTAGCTGGGAGGCAGATAATCAACGCGTTG TTAAACAGAGACCCAGCATGCCGCTTAGGATCAAATACTGGTGCCAATGAAATCAAACAA CATCCTTTCTTCCGTGGAATTAATTGGCCTCTAATTCGCTGCATGAGCCCACCACCACTG AATGCACCTCTTAAATTAATTGGAAAAGATCTGAAAGCCAAGGATGTCAACTGGGAAGAT GATGGAGTGCTCATTAATTCAGTTGATATGGAGATTTTCTGA
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>LITCHI004092.m1 ATGGACACTACCAATGCATTTGCATATTTTCATGTTGGATTTCAAAGGCCTATCGTTTAT AGTTTTATCAGTCCATCACATTTCTTATTGGATGAACATTATGTTCCCAAGCTATTTGAA TTTTCATATGCTGAATGTATTCCTGAAGGAGAAACTCAAATAAAAGATACACATATTAGA GGAGTAATAGGGTTTATAGCACCTGAGCACTCTAGAGGTGTTCTTAGTGAGAAATGTGAT GTTTATGGTTTTGGTGCATTGCTACTCGAGCTTATGACTGGACAAAGCATAACTAACTTT TTAAGCGATCATGCCTTAAATACATCAAGCGAAAATAGGCCACAAATGCTTGATGAGTAC CGGGAGAAGCCAGATAAGACAGCATTTATTGTAAAGAATGGTGAGGTTTTGCTTGAGAAA TTGATTACTACTTTTGACGGTAAACGTAATCCTATTCGTAACTTTTCTTCTGAAGAGCTT ATGCAGGCAACAAACAATTACAACAAAGAAAATGTTGCCATAGATGATCGTTGTTACAAA TTGTACAAGGGGGTTTTACAAGACCGTCAAATTTCCGTTATGAAGTTTAAATCAAATAGT GATCATACATATGATGTTTGTATCAATCATATTGTGTTTGCATCACAAATGTGTCACAAA CATATTTTGAAGTTAATTGGGTGTTGCTTAGATACTCGAATTCCTGTTTTAGTTTTCGAA TCACTGGTTAAGTATGGAACTCTCAGGGATCATATACATAGTCATCATCAAACCCATTTC GAGTCTTTATCATGGAGACAAAGGTTAAAAATTACAATGGAAACTGCCAACGCATTTGCA TATCTTCATGTTGGATTTCAAAGGCCTATCGTTTATAGTTTTATCAGTCCATCACATTTC TTATTGGATGAACATTATGTTCCCAAGCTATTTGAATTTTCATATGCTGAATGTATTCCT GAAGGAGAAACTCAAATAAAAGATACACATATTAGAGGAGTAATAGGGTTTATAGCACCT GAGCACTCTGGAGGTGTTCTTAGTGAGAAATGTGATGTTTATGGTTTTGGTGCATTGCTA CTCGAGCTTATGACTGGACGAAGCATAACTGACTTTTTAAGCGATCATGCCTTAGATAGT ATCAGTTGTGAGACGAAATATGAAGAGTACTTTAAACTCAAAAGCGGAGTTGAAACAAAG GAAAGAAAGGGTGAAAGCAGTGAAAGCAATACTGAAACAAAGTATGAACATTGGTTGTGG AACTTTGTGAAGAAAATAAATGAAGATGATAGGTTTATTGAGGTAGTAGATCCCATAATT GTTCGAGATGGGCTAAGTCCAGCAACAGAACAGCAAATGAAAGTCTTTGTGGAGCTCGCG GTTAAATGCCTGTCACTTTCACCAGAAGATAGGCCAACAATGATTGATGTGGCCAAAAAA CTTAGGCAACTTTATACCATGAAGTACTGCTGCTTAAAATTATCAAACAAAGATAGGGAG AAGGGAGAGAGGAAAGCAATTTTGAAGAGGGATGGGGAATTGCTACTGGAAGAGTTGATT GCTTCTTTTAAGCGTAAATACAATCGTTCAATTCGTATATTCTCCGCTACTGAACTCAAG TTAGCAACAAACAATTACAACTACCCGCTTAGTTTTAAGAAAAATGATGAATGTTATAAG TTGTACAAGGGTTATTTGAAAGATCGTTCAATTTGTGTTATGAAGTTTAACAACGAGTGG GATGCATATCACCTTTGTTACAATAACATCGTATATGCATTACACATGAACCACAGGAAT GTTGTGAAGTTAATTGGATGCTGCATAAAAACTCGAATTCCTATCTTGGTGTTCGAAGGA GTAGGGTATGGAACACTAGCTGATCGTATTCATTACCGACGTCAACCCATTTTTGATCGC CTGTCATGGACGAAGAGGTTAAATATCGCAATGGAAATATCTAATGCGGTGTCATATCTC CATGTCGGATTCTCAAAGCCTATTCTTTCTAGAAATATTAAAATATCAAAGATATTGTTC GACGAACAAGGTCTTGTCAAGTTATCTGATTTTACACAAGCTACATTCATTCCAAAAGGT AAAACTCACGTAAACGATGGGGTGAAAGAAACAATGAGATATGTCGCACCTGAGCATGCT ATGACGGGTAATTTTAATGAGAAGTGTGATGTTTACACTTTTGGTATGATACTACTTCAG CTTTTGATTGGAGAGGAAACAGTGGAATCCAGTGACTATGAGCATCTAATTTTACGGGAA CGTTTGGAGAAAATAATTGAAAATAATAAGTTCAACGAGATAGTAGATCCCTTAGTTCTT GAAGATGGAGTATGTCTTACCAAAAAAAAGCAACTTAAAGATTTCATTAGTCTTGCCTTG AAATGTACCTCTGAATCAGCTGAAGATAGACCAACAATGGTTGATGTAGCTCAACAAATC AGAAAAATATGTAAACCTAACAGCTAA
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>LITCHI004092.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAGTTTGTAAAATTGTTGCAAATTGAATTATAGTTTGCCAATTATATCAGCTTTGTATCC GGAGAAATAGAAGCAGACAACTTGATCAAATTAATTTAAGCCAGACATGTAAACATCCGT GATGCAAAAGTTGACCAATTAGGCAATTACTTCTAGAAAGTTTCATGGTTGACCTTGAAG AATATCAAGAAACTCCATTTCTGATGTATATATATACATGTCTATTTTAGTTTAAATTCC AACTCTTAATCTTTATACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCCTTTACAATTTGGGAAG TTGTGAACTTTAATTTTTTAATTGATATGTGGTGTTACAAGTTGTTGGTAGAAACACGTT AATACTATCCTATTTTTTAATTAACCAATATATCCAATTGACTCGAAGTTACTTCTAATT AAGCATATTTCTCCTTCACATTAGATAATGAACTTTGTATATCAATCATCATAATTCTCT TTGTTAAAAAGAGAGTATTTGTTGGTGTTAATGTTCAGATATTAAAAGAATTGTAACGAG AATTGTCTATTTTTTTTCTTTTTAATTAGTACTACTTTGTGATATAGTTACTCAAATTGA ATAATAGCTTTATACTTATGAACTATGCTGGATAGTGGTCAAAGTTTTGAATTTTCAACA TAACCATAGTCAAGTCTACGGTATATCAGTGGTCCAAAGCATTAAACAAGTCAAATATAT ATATATATTCTTTGGTGATGCAAATTTTCATTATAAACTCTAATGACCTTGAATTACATG TAGACCATACAACATAGAAGAAAAAGAAAGCTTTAATTGGGCCAATTGAATTTTTTAGCT AGTCCTGAAACTTACCCAAGAGGCCGACCACGTGCAAGAAAAAGAAGATCAATTGCACCA AGGTTTATCTGAAAAACCTACGAAAATGGAAAATAATATCACTTAATTCTATTTTTTAAC ATAGAAAATGAGTGATTTCACATCAATTTCACTTTCAAGAGGTATTTTTATAATATCTCA TATATATTAATTTTCTTCTCAAAACAAATTAATTTTATAAGTATTAATTCCTTAACTATC ATCTTAAGTACATATTTCTTTTATATAGTAAATGGTTCATGAATTTCGTTATACTTTTTA AAATTAAAGACAGTTTAAAATTAGATGGTCCTAATTTAAGGGGATGATATATCGTGGTTT ATATATACTTCTAAGACACTACATTTCTGGTTTATCTTTGTCTCTGCTTCAGATTATATT CCAATACTAAAGCTTGATCTTTCTCTCAAACTCAGAGCTTTGGTAATTTCTTCTTCTTGA TACTTGAATCAGCTGGTCATCCATCCGTAGGTACTATTCTACAGGAACTCTAATATACTA TGGTTTATTAATGTATATGTTTCCCTTTCACCCTTATACAACAGTGATAAATAATTTTAT TTTTAAGGAATTAATTATCTGTCAATTAAGTCAATCAAAATTAAAGTTTGGTCTCTATAT TGTAGTCTCACTTTCGATTTTTTTTTTCTTTTGAAATGTTGTCTCACTTTAGAATTAATT ATATAATATTGGTATAGAGAATATATATGAGTTTTTTGGTTTGTATATTTTCATTATGCT TCATGTTTCATGCTTGGATTAAGACAAATCATTTTATGGATTTTATTTTGTGAATAGGTT TACTAAATGATTCCTTTTTGGAAAAATGAGTACCGGGAGAAGCCAGATAAGACAGCATTT ATTGTGAAGAATGGTGAAGTTTTGCTTGAAAAATTGATTACTACTTTTGAAGGTAAACGT AATCCTATTCGTAACTTTTCTTTGCATCACAAATGTGTCACAAACATATTTTGAAGTTAA TTGGGTGTTGCTTAGATACTCGAATTCCTATTTTGGTTTTCGAATCAATGGTTAAGTATT GAACTCTCAGGGATCATATACATAATCATCATCAACCCCATTTTGAGGCTTTATCATGGA GACAAAGGTTAAAAACTACA
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>LITCHI004092.m1 GenomeSequence + ATGGACACTACCAATGCATTTGCATATTTTCATGTTGGATTTCAAAGGCCTATCGTTTAT AGTTTTATCAGTCCATCACATTTCTTATTGGATGAACATTATGTTCCCAAGCTATTTGAA TTTTCATATGCTGAATGTATTCCTGAAGGAGAAACTCAAATAAAAGATACACATATTAGA GGAGTAATAGGGTTTATAGCACCTGAGCACTCTAGAGGTGTTCTTAGTGAGAAATGTGAT GTTTATGGTTTTGGTGCATTGCTACTCGAGCTTATGACTGGACAAAGCATAACTAACTTT TTAAGCGATCATGCCTTAAATAGTATCAGTTGTGAGATGAAATATGAAGAGTACTGTAAA CTCAAAAGCAAAGTTGAAACAAAGGAAAGTGTTGTGGGTATATTTGGGACCGCATAAATG GGCTAGTAAAATCTCAAGGCATTAATCCAATGGATTGACCCAGTAAACGAAAGTCTAGAA TGCCAACACTCAACTCGTAGGAACGAGCTCTCAGTTTGCCGCTATTTTCAAGTCACTATT TAGCTATGGTCAAAGCTACTTTATACTCAGCTCGAAATCATCCAATGCAAGTCTCAGCTC GCAACTCAAAGTACTCATTAATAGAATTTTTTCATAAAGGCAACAACTCAAATTGATGAA AAGTCAACTCAGAATTGGCAATAAATTCAAATTCTTATGTCAATGGAATCTATCCCGGAT ATGGTGGAATCTATCCCTGATATGGTGAAAATCGATTTTAAAAGTGTAATTAATGTAAGA TTCTTTCCCATTTCACTTATACTTAAATTGTAACATCCCACATTACAAATAGGGATCAAA ATTCATTGTAAACAGATGAAAACAATAAGAGAAAATTGAGAAAATGATGCTTTTTGGGAA 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