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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002202 | Chr5 | 34153282 | 34158892 | + | Transcription factor DUO1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002202.m1 | 12 | 57 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.5 | 2.10E-09 |
LITCHI002202.m1 | 15 | 74 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 43.3 | 3.50E-11 |
LITCHI002202.m1 | 68 | 107 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 39.3 | 5.90E-10 |
LITCHI002202.m1 | 70 | 109 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 24.2 | 3.30E-05 |
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>LITCHI002202.m1 ATGGAAGGGAAGAAGAGAGAGAAGAGTATTAGAAAGGGACCTTGGAAAGATGAGGAAGAT GAAGTGGTGATCAACCATGTCAAGAAATGTGGCCCCAGAGACTGGAGCTTCATTCGGTCC AAAGGTCTCTTGCAGAGAACAGGCAAGTCTTGTCGTCTTAGATGGGTCAACAAGCTTCGA CCCAACTTGAAAAATGGGTGCAAATTTTCACTGGAGGAAGAGAGGGTGGTGATAGAGTTG CAAGCACAGTTCGGTAACAAATGGGCAAAAATAGCCACGTATTTGCATGGCAGGACAGAT AATGATGTCAAGGATTTCTGGAGTAGTAGACAGATGAGGCTGGCTAGAATCTTGCAGAAT TCTACGGCCACCGCTCCTTCCAAATCACACAAACTGATTAACCGGGAAGTATCTTCTGGT TTCACTGATGTTCCTTCTTCAGAGATTCAGAACAAGTATTGCTGTTCTTCAATAGGGGAA AAGTCACCATCAAGGTTTCGATGTTGCTCATTGTCCAACTTTGACAGCTATGAAATGATT CAAATGGTGCCACTGCCAGATGTGGTTGCTCCCGAGTTGGTGCATTTTGATTCAAATCAT GCTCATCTTGAAGATCTCAGCCAACCCAAGAATGGTAATTATAGCACTGAGTCCCAGTTA CAAGTGCCACCGCCCAAATAA
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>LITCHI002202.m1 + Up_Stream_Len 2000 TACTTGGTGAATTCGCCCATGTCTTGATCCTTAGACCGTTCATGGTACCTGTCATGATGC TATCTTTTACAACAAGTCCCTTCACGTCTCCTTCATTTCGGTATCTTCCCAAGCTTCCAA CGCTAAAATTTGAAGATGCATATACAACAACAGGTGATATAAAACATTGGGAAATAATAA GATGGGAAGTGTGATTATGTGCAAGAAAACTTTCGGGGTTTAGAGAATTCAGGAGTACCT GATGCCATGACCTGGTCCACAAGTGATGCTAGTGACAGTGACCTGAGAGTTTCCTTGCCC AATTGAGATGCAGTCATCACCAGTACCAATGTGTGAACGCGAAAAATAGACACCAGAGCT CCGCTCAATGTGGATACCATCGGTGTTGGGACTATTTGCTGGAGCGGAGATTTTTATTTT ACTGCCTTTGAAGTTGTTGCATTCAACAAGAGCCAAGTGGAAGAACTTGCTGTCCAATGA AGTTATGCCTCGAACAACAGTCCTATTCATCACCACGAATTTCACATTCTGAATGGGGGG AAAAAGAAAGTTAACCTCATCAACATTTTAGTCCTAATCTGGCCACATACTACTTTTAAA ATCCGACAAAAAATATAGCTTATAAAGTGACAATTTGCGAATATATTAAAACAAAGTAAC ACTATGTTGAAGTGTAAATAATTATGGAACATACAGTTGGGAGAAGTTTGCAATTGAAGT CCGTGGGGCATCTATTGTAAGGCCATGCTTTGGCACCCTGGCCATCGAAGGTTCCTCCTC CAGTCAAGGTTAGTCCCTCCAACCATCCAAATTCGACCCATCCAGCACCGAAGCTATACT TGGACAAATTTGTTGTTGCCTTCAAATAACCCTGCTAGTTCATCCCAAGATTTGGACATT GGTGGAGGCATGCCCAAAAATCAGTGCCAGATAAAACAAAAGACAATATACAAAATTGTT ATAAGATCTCACCTTCATAAGAATGGTTATATTTGATACATTTTTGCATGGCCCTGAAAA CTTAATGGGACCTATCAAATATACCCCTTTAGGAATCACAAGACGTACTGCACCGCTAGT CCCACATGCCTGCTTCCATGCTGCTTTGAAGGCCTAAATGACATATTATTACGCATTGAT CAATTACTAGTATGTTGAGTACTAATCTGATAATTTCATTTGGAGAGTTATTCTGTCTAA AGAAAAATGAACGTTTAATCATTTTGTGGCACTATTCTCAAAAGCTTGAGCTTTGGGATA CAATATTGAGGCTTATTTTGACTATTAAGATGTTAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AATCCCACATTCAATTTAAATTTGAGACTAATTAGCACAATATTAGTTGGACAAAGAAAC ATTAGAAGGCACATATTGGTAGAGTAAAAAATTTTCAAATCATTTACTATAAGAAAGTAA TAATTGATTGAATCAAAATTTTGGGAGGGAGAGAGAGGGAGAGCAAACTCTGGTGTCATC AGTGGTGCCATCAGCTCTGGCACCAAAGCTCCTGACATTAAAGAGAAGAGATTTGCTTCC TTCTCCATGAGCTGTTGTGGTCTCTCTCGGTCTAGTAATAGCAACACCACCATTGAAAGA AAGAATGAAGAGCACCAAAAACAAAAACAGTTTGGTACCAAGTTGAAAGCTCATTTTGAC TGCTACCTATCTACTCTTTGTTTTCTGAAAATATGCAGCAGTTTAGAGTTGTGAGAGTGG TACTGGTCTATATGCTCATGTTGAGCAAACAAAAACCAGAAAGTGAATGAGTCACAAACA TTTTGAAATTTGAACAGGCAACTGAAAATGGCGGGGCTTTGAAGTTTTTATAACTGTCTT TTAACTCCCTCCCACTTGTAGTCCACGTAGTTGAACATCTGAGAAAAAATAGCGAATGTG TGGAGGTTGTGGGTGGTAACTGTCACTTCAAATAACAAAGAAAAAGCAGAGAAAGTGGGA GTAAAAAGAGAGAAAGTGAA
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>LITCHI002202.m1 GenomeSequence + GTAAGTGAGAGATGTTGGAGACTTACACATATGATGAGATTTTACATATGAATAATACAT AAACAAAATATGATTAAGGTAGTTTGTAAACATAGAAAATGAAGTGAGAGATACAAAAAT TGTATGTAATGTTTGTAGTTGGAAACTAAACTAAGACTAAGCACATGGTGGTGGGATTTG GGTGCCAAAGTATTTGGCTTCAACATTTTTACAAGAGGAAGTGGGGCGTTTCTCCCCTGA TGAAAGGTCTAAATGAACATTTTCAAGGTAGATGTTTTGGCATGGTATCCTTTTGCTGCA TTCTAGTGCCACTGCCACTGCTGAAGATGATGTCCCCCTTATGTTCTTGAAATATATGTC GCTTAGTTTTACTCGAGAAGGTGGCTGCATCAATCACACCTTATGAGTCTCCTAGAACGG CCGAGTATATGAATAAAACTTAAGATTTTAATGTGATTGTTGTGTTGGAACTTACACTGG TAGGGCACGAAGTAAATGGACAGTATTGTTGATCGATTATGATTGGATTTGTGACATTGT TCATGATAATGTTCTTGAATGTCATATTGGTGGCTGCACTGCTACTTGGTGAATTCGCCC ATGTCTTGATCCTTAGACCGTTCATGGTACCTGTCATGATGCTATCTTTTACAACAAGTC CCTTCACGTCTCCTTCATTTCGGTATCTTCCCAAGCTTCCAACGCTAAAATTTGAAGATG CATATACAACAACAGGTGATATAAAACATTGGGAAATAATAAGATGGGAAGTGTGATTAT GTGCAAGAAAACTTTCGGGGTTTAGAGAATTCAGGAGTACCTGATGCCATGACCTGGTCC ACAAGTGATGCTAGTGACAGTGACCTGAGAGTTTCCTTGCCCAATTGAGATGCAGTCATC 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