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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI002195 | Chr5 | 34128272 | 34132785 | + | Calcium-dependent protein kinase 4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI002195.m1 | 97 | 355 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 243.3 | 3.10E-72 |
LITCHI002195.m1 | 99 | 349 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 85.7 | 3.40E-24 |
LITCHI002195.m1 | 386 | 429 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 24.2 | 2.30E-05 |
LITCHI002195.m1 | 403 | 429 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 30.6 | 1.50E-07 |
LITCHI002195.m1 | 403 | 463 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 44 | 2.40E-11 |
LITCHI002195.m1 | 403 | 429 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 25.3 | 8.50E-06 |
LITCHI002195.m1 | 403 | 425 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 23.2 | 3.50E-05 |
LITCHI002195.m1 | 418 | 465 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 32.2 | 7.50E-08 |
LITCHI002195.m1 | 439 | 459 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 14.5 | 0.02 |
LITCHI002195.m1 | 473 | 534 | PF13499.9 | EF-hand_7 | Domain | 50.6 | 2.20E-13 |
LITCHI002195.m1 | 475 | 497 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 26.2 | 4.10E-06 |
LITCHI002195.m1 | 476 | 501 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 28.4 | 7.60E-07 |
LITCHI002195.m1 | 476 | 500 | PF13405.9 | EF-hand_6 | Domain | 29.5 | 4.00E-07 |
LITCHI002195.m1 | 487 | 535 | PF13833.9 | EF-hand_8 | Domain | 30.3 | 2.90E-07 |
LITCHI002195.m1 | 509 | 535 | PF00036.35 | EF-hand_1 | Domain | 28 | 1.00E-06 |
LITCHI002195.m1 | 509 | 533 | PF13202.9 | EF-hand_5 | Domain | 15.5 | 0.0097 |
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>LITCHI002195.m1 ATGGGCAACACATGCCGTGGATCAAACAAAGGAAAATTCTATCAGGGCTACAATCAGCCC GAGGACCATTCCAAGCGTAACACGAACTCTGATCGTTCTAATTCTGATCATTCCTCATCT GTGAATTCCCAGCAAAGAGTTGCTCAAGATTTTTCCAAGCAAACCCCCAAGAAAGATAAC AATTCACCACTTGTTGGACCCAACAGAAGGGATACAATCATGAGGCGCGGCATTGATAGT CAGACTAATTATGTATTGGGTCACAAGACTGCAAACATCCGTGATCTTTACATGTTGGGT CGAAAATTAGGACAAGGACAATTTGGAACTACTTATTTATGTACTGAGATATCCACGGGT ATTGAGTATGCTTGCAAGTCGATATCAAAGAGGAAGTTGATTTCAAAGGAGGATGTGGAG GATGTTAGGAGGGAGATTCAGATAATGCATCATTTGGCTGGTCACAAGAATATTGTGACA ATTAAGGGTGCTTATGAAGATTCATTATATGTTCATATCGTGATGGAACTTTGTGGCGGT GGTGAGTTGTTTGATAGGATCATCCAGAGAGGACATTACAGTGAGAGGAGGGCTGCCGAG CTGACAAAGATTATTGTTGGGGTTGTTGAGGCTTGTCATTCACTTGGGGTCATGCATAGA GACCTAAAGCCTGAGAATTTTTTGCTGGTTAACAAAGATGATGATTTCTCTCTTAAAGCT ATTGACTTTGGGCTTTCAGTTTTCTTCAAACCAGGTCAAATATTCACTGATGTGGTTGGA AGTCCATACTATGTTGCGCCTGAGGTGCTTCTCAAGCACTATGGGCCAGAAGCTGATGTG TGGACGGCTGGGGTCATACTGTATATATTGCTAAGTGGAGTGCCACCATTTTGGGCAGAG ACACAACAGGGAATATTTGATGCGGTGTTGAAGGGACATATTGACTTCGATTCAGACCCT TGGCCTTTAATTTCTGACAGTGCCAAAGACCTGATCCGGAAGATGTTGTGCTCTCAACCT TCGGACCGTTTGACTGCTCATGAAGTATTATGTCATCCTTGGATCTGTGAAAATGGTGTT GCTCCTGACAGATCTCTTGATCCAGCTGTACTTTCTCGTCTCAAACAGTTTTCTGCAATG AATAAATTGAAGAAGATGGCTTTACGGGTTATAGCTGAAAGCCTTTCTGAAGAGGAGATT GCTGGTTTGAGGGAAATGTTTAAGGCAATGGATACTGATAACAGTGGTGCAATTACATTT GATGAACTTAAAGCTGGTTTGCGAAGATATGGCTCTACCTTGAAGGACACAGAGATACGT GATCTTATGGATGCGGCTGATGTGGACAACAGTGGGACCATTGATTATGGGGAATTCATA GCTGCAACAGTTCACCTCAATAAATTAGAACGTGAGGAACATCTTGTGGCAGCATTCCAG TACTTTGACAAGGATGGAAGTGGTTATATTACGGTTGATGAGCTTCAGCAAGCTTGTACC GAACATAACATGACAGATGCTTTCCTTGAAGATATAATAAGAGAAGTTGATCAAAATAGT GATGGGAGAATTGATTATGGCGAGTTTGTTGCTATGATGCAAAAGGGCAACATGGGTATT GGAAGAAGAACTATGCGAAACAGTTTAAATATGAGCATGAGAGATGCACCTAGCGCTCAT TAG
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>LITCHI002195.m1 GenomeSequence + ATAATATGACATGGAGCATCAAATTTTTTAAAATTATCAATACACGTAACATACGACAGA TTACAAATATATGAATGATATAATACGTTAAAAAAAGAAACAAAACCAAAATTAAGCCCT TCCAACAAATAAAAAAAAAAACCATTCAAACTCACACGTCCAGCTTTTGTAACTGTGTCT AAATTTAGCGACTGGTAGGAGTTAGAATAGATTTGATCTCCGTGCAAGTAGCTACAACTT GCTGACCAATGGCCAAACAAACAAGGCTTCCAAACTAAGGCAACAACAAACCACTTCAAC ATCCTGACCCCACCTTTTATCTTTAATCCACCAATGTCTGTACAACACGTGACCACATCA ACCATCTAAACTGAGCCTCATGTTCTCAACCGGGAGTCACTCTCCCTCCACCACCACCGC CAAAATCACAACAAATGGTCAATGGTGATTTTTATTGATTGATCGGTTCCCGGGTTAACA TGTTTCCTTGGTTTTACTTTTTATTTGCTTGCTGCCTCACTCACTTCCTTGAAAACGTGC AAGTAGTAGCTGATAAAAAAAAAAACTAATAATAAAGTTTTCATTTTTATGTGGATATTT TAATAGCATATTGCGAATGATGATTATGATGCCGCGTATAAAGAAGAGAGAGAAAGAGAG AGTAAGCTGGTCAGCACTCCCCATCCGATGTTTCTTAGCAACAGCATACCAAAATAACTA CGAAGGAATCACAGCTTCTAATCTTTTATTTTTATTTTTGATTTAATAAAGAGAAGACCT TTTTAAACAGCTGTTTTTGTTATTGGATTATTTGAGATCCATTATCTTTTCTTTTCCCTT TTATCAAAATAAAAAACCTTTAATAGGAACCCTTTTCTTGTCTCAAAACCATTCCATTCT TTCCTTCTTTGTCTCCACACCCTCCTGGTAATAGATCCATTCTCTCTATTTCATCATGCG TATGCATTCAAGTTCATTTATTACGTGTTTTTGTTGTTGTTGTTACATTGCTCTGGATGG TTTGTTCATGACTGTTTGACTGGTAGATTGATAGTGCTTTATTGTTATTTTGTGCTAAGA TAGGTGTTAGATTGTTATTGCTCTTGATAGTTGTTAACTTGTCTTTGGAGATGGTGAAAG GTATCACCTTTCCTTGAAGAGGAAGGAACTTTATGTGTGATCTGATGTAGGATGCTTTGA TTCTTAGATTTGTTGATGGTCCTGCATATTCCTTTTGTTACATGTCAAGTTTTCTTATCT GGGGTGTTTTTGGTTTGTGATATGTGTCAGTGTAATTGATGAAATATCTGTTATTGGATG AGGAAAACGCCGCGGCAGAGGTAGAACCCTAATCGTTTCATGGGCAACACATGCCGTGGA TCAAACAAAGGAAAATTCTATCAGGGCTACAATCAGCCCGAGGACCATTCCAAGCGTAAC ACGAACTCTGATCGTTCTAATTCTGATCATTCCTCATCTGTGAATTCCCAGCAAAGAGTT GCTCAAGATTTTTCCAAGCAAACCCCCAAGAAAGATAACAATTCACCACTTGTTGGACCC AACAGAAGGGATACAATCATGAGGCGCGGCATTGATAGTCAGACTAATTATGTATTGGGT CACAAGACTGCAAACATCCGTGATCTTTACATGTTGGGTCGAAAATTAGGACAAGGACAA TTTGGAACTACTTATTTATGTACTGAGATATCCACGGGTATTGAGTATGCTTGCAAGTCG ATATCAAAGAGGAAGTTGATTTCAAAGGAGGATGTGGAGGATGTTAGGAGGGAGATTCAG ATAATGCATCATTTGGCTGGTCACAAGAATATTGTGACAATTAAGGGTGCTTATGAAGAT TCATTATATGTTCATATCGTGATGGAACTTTGTGGCGGTGGTGAGTTGTTTGATAGGATC ATCCAGAGAGGACATTACAGTGAGAGGAGGGCTGCCGAGCTGACAAAGATTATTGTTGGG GTTGTTGAGGCTTGTCATTCACTTGGGGTCATGCATAGAGACCTAAAGCCTGAGAATTTT TTGCTGGTTAACAAAGATGATGATTTCTCTCTTAAAGCTATTGACTTTGGGCTTTCAGTT TTCTTCAAACCAGGTAAATAATACATCATTATGCTTCATGGTTTGTATCTTTAAAGAATT TTATATAAGTTAATCTATTGAAGAAGCGGAATGGTCCCCCTGTAACAGTTGTATGGCTTA TTTCTATATTTAGTTTTTTTTTTCCCTATTTTTGGCGATCAATTATGTATTGCTTGATCA AATTACTTACTTTTAATATTTGCATATGCATAAATTTGTTGGCTGCATTTACCATATTTG TATTCATATCAGTTAAATGAGTGATAGCTAAGAAAATCTTTAAAGTGAAACACTTGTGTT TCTATAATTAGTTTTTTTTTTTTTCCTATTTCGGCGATCAATTATGTATTGTTTAATCAA ATTACTTACTTTTAATACTTGCAGATGCATTTATTTGTTGGCTGCATTCACTGAATTTGT ATTCATATCAGTTAAATGAGTGATAGTGAAGAAAATCTTTGAAGTGAAACACTTGCTATA TTCCTGCACAAAGTTAATCCTTATACCTCCAGACATTTTCTTGCATAATTTTATATGTGG TTTCTACTTCAGGTCAAATATTCACTGATGTGGTTGGAAGTCCATACTATGTTGCGCCTG AGGTGCTTCTCAAGCACTATGGGCCAGAAGCTGATGTGTGGACGGCTGGGGTCATACTGT ATATATTGCTAAGTGGAGTGCCACCATTTTGGGCAGGTAGGCATGATATAGTATATAGCT AAAGGAATAATTTTCTCTCTCTGTGTGCACTGTAATGAAGTTTGTTTCCTTGGTGGAATT CAGAGACACAACAGGGAATATTTGATGCGGTGTTGAAGGGACATATTGACTTCGATTCAG ACCCTTGGCCTTTAATTTCTGACAGTGCCAAAGACCTGATCCGGAAGATGTTGTGCTCTC AACCTTCGGACCGTTTGACTGCTCATGAAGTATTATGTATGTTCCATACATTTTTCTGCT TAAGCATATTTTATGAATAAATTAGGAATATGCTCACTAAATTTGGTGCTTGTTACTATG TTATTGGTGCTCATACGATTGCTTAGTGGTCAGTAAATTATCTGAAAAATATATATAAAG AACTGAGTTAAATATTTTAACTGGACTCTCATTAATACTATATGCTTTTAAATGATTATT TATCTATCAGGTTACCTGTGAACCTGAAAGATTCTGCTTAAGTAGGAATTGATTGTATTT GTCAATGTAGCTTGCAATATTGGTTTGATGTTGCTTTATAAAAATATGCATGACGAAATT GAGTAACAAGTTTATCTCTCATTCATGTAGGTCATCCTTGGATCTGTGAAAATGGTGTTG CTCCTGACAGATCTCTTGATCCAGCTGTACTTTCTCGTCTCAAACAGTTTTCTGCAATGA ATAAATTGAAGAAGATGGCTTTACGGGTGAGTACAAGTCCATGCACTTGCTGCGTGGTTT GAGAATTTTTTGCCAAAGCACCAGTACATCATCCTCTCTTTTGTTACTCACTATACTTCT TTTGCACTATAGCTTTTGAATTGTAAAGCACATTGACATTTAATGTTGACTTTTTGCTAA GCATGTTCAAGTTATAGTCACTATCTTGAAACATTCTGTTTGCCTTTTTTAACCGTCAGG TTATAGCTGAAAGCCTTTCTGAAGAGGAGATTGCTGGTTTGAGGGAAATGTTTAAGGCAA TGGATACTGATAACAGTGGTGCAATTACATTTGATGAACTTAAAGCTGGTTTGCGAAGAT ATGGCTCTACCTTGAAGGACACAGAGATACGTGATCTTATGGATGCGGTAAGATGTGGGT GTGTGATTATTTTGTTATCCATTGTTTGATTGTTTTCTAATTGGCTGAGCTATTTTCATT GCTTTCAGGCTGATGTGGACAACAGTGGGACCATTGATTATGGGGAATTCATAGCTGCAA CAGTTCACCTCAATAAATTAGAACGTGAGGAACATCTTGTGGCAGCATTCCAGTACTTTG ACAAGGATGGAAGTGGTTATATTACGGTTGATGAGCTTCAGCAAGCTTGTACCGAACATA ACATGACAGATGCTTTCCTTGAAGATATAATAAGAGAAGTTGATCAAAATAGTGTAAGTC ATCTTAATTTGGTTATCAATCATTTTCTATTTATTTTCCCAAATTATAGACTTCCTTGCT TCATGCTTCAGTTATAATGAATCGTTTTCACTTTTATCTTCATTGTAATATATATATATA TATTTTGAATAATCTTCATTGTAATTTTTGTTGAGCAACCTTTTCTTTTCTTTCTGTTAA TCTATTATCAGGATGGGAGAATTGATTATGGCGAGTTTGTTGCTATGATGCAAAAGGGCA ACATGGGTATTGGAAGAAGAACTATGCGAAACAGTTTAAATATGAGCATGAGAGATGCAC CTAGCGCTCATTAG