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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI002043 | Chr5 | 32911967 | 32916152 | + | Transcription factor ABORTED MICROSPORES |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI002043.m1 | 62 | 216 | PF14215.9 | bHLH-MYC_N | Family | 59.5 | 5.30E-16 |
| LITCHI002043.m1 | 417 | 461 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.6 | 4.10E-10 |
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>LITCHI002043.m1 ATGGATCTCTGCTTTTGTTTTCTACGCTTTTTCTCTCTCGTTTGTTTCTCCACTTTGCTT TTGTTTTTTCTGATTTGTTCTATCAGAAGAAGAAGAAGATATAAACATTTTAAGAATAAT AAGAAAACGTGGTATTATTATTTCTCAGGTTACAATATTGGCATGAGCAATATTGTCCAT AACCTAATGGAGAGACTGAGGCCACTTGTAGGCTTGAAAGGCTGGGACTACTGTGTTCTT TGGAAATTGAGTGATGATCAAAGGTTTATTGAGTGGATGGACTGTTGTTGTGCTGGAACT GACCAGAATATGATAAATGGAGGAGATGAAGAGCTTCATTTCCCAGTCTCTCCAGTTCTT CCTTGTAGAGATGTTGCACTTCATCAACATTCAAGGACCAAATCGTGTGAACTTCTAGCC CAACTTGCTTCTTCGATGCCTTTTGACACCGGGAACATATATGCACAAACCTTGTTATCA AACCAACCTAGATGGTTGAACTTCTCTAATAATACCTCAGATTCAGATGCTATGGAGGAA ACAATTTGGACTAGGGTTTTGATTCCAGTGATGGGAGGACTCCTCATTGAACTATTTGTT ACCAAAGAAGTACGTGTTCCTGAAGATCTTAATGTGATTGATTTTATCGCAGCCCAATGT AGCATATCATTTCATGATGATCAAGAAGATACCATGACCAATACAAATAACAACAATAAC ATAGACCAAAACGATCTTTATCCTCCACCAGTTTCCTCATCAACTGCATTAGATAATCTT GATCGTTTGCCTTATGACATCTCCTTTGATCGAATTCGCCTTAGTAATAGTACTAATACC GGCTCTCCAATGAATTTGTTGCACCAATTTTATAGTACCACAACTTCTGACCAAAACGAT AGAAACCAAAATGACCACCATGTCTTCTTTGAAGGGTCATCACATCCTGGTCATCATGAT CACAATTCATTCCTTTCTCATCATCATCTTGATAAGCCAATCAATATGATGAACTCATTG ATCAACTCTTCATCACAATGTGGGGTTCATCCAGAGAACATAGACGTGCAATACATGGAC CAGCATGATCAACAACAAGGGAACAATGTTAATGATAATGATAAGGACTCCTTTAATAAG CCTGAAAATGGACGGTCGGATTCGGCTTCGGATTGCAGTGATCAGATTGATGATGAAGAT GATAGCAAGTATAGGAGAAGAAACGGGAAAGGTCCTCATTCTAAAAACCTTGAGGCTGAG AGGAAGAGAAGGAAGAAGCTCAATGATAGACTCTATGCTCTTCGAGCTTTGGTTCCCAAT ATTTCAAAATTGGACAGGGCTTCAATCCTAGGGGATGCAATTGAGTTTGTGAAGGAATTA CAAAAGCAAGCAAAGGAGCTACAGGATGAGCTTGAAGAGCATTCGGACGATGATGGAGCC AAGAGTGGGGGCTTCAATAATGTCAACAGTAACAACAACAATGTCAAATCAGAGATTTTT AACCAAAATCGAACCACTTTTGCCTCTAAAACTGAACTTGATCATCACAAATCTCCAAAT GGGTTTCATTTGGGAGTTTCAGGTACTGGCAACAGTATCCCGAAACAGGACCTAGAAATC TCTAATGACAAGGCACAACAAATGGAGGCTCAAGTGGAAGTTGCTCAATTGGATGGAAAT GAGTTCTTTGTTAAGGTCTTTTGTGAGCATAAGCCTGGTGGGTTTGTGAGATTGATGGAA GCTTTGAATTCTTTGGGTTTGGAAGTCACAAATGCAAATGTGACCAGCTTCAGAGGCCTT GTCTCTAATGTTTTCAAAGTAGAGAAAAGAGATAGTGAGATGGTTCAAGCTGATCACGTG AGGGACTCATTGCTCGAGCTCATGCGAAACCCTAATTTGTCTAGAGGGTGGCCTGATCAG ATGGGAAAAGCTTCAGACAGCATCAATGGCAATGCGGATTATCATAACCATCACCACGAC CACCATCTTCATAATCATCATATGGCTACTCATCATCTTCACAATTAG
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>LITCHI002043.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTATGTTGTTTTCTTGTATATATCTTTCGAAAGTAGACATTCTCTAATCCAGAAATTTGC AAATTACACCTCAACTTATTTTCATTCAAATATCAAATTTGTATCCAATATTTTTATATA CAGACGTTTGTATGCTCAGTATGGATTATTGATTATCCATACCAGGCAAGGAGTGACCAG TATGAATAAATGATTTTCTATTTTTTTAATAATAAAAATAAAATTATCCATATCGGGTCA GTGGTGCTTGGTATGGATAAGTGATTTTTATTTTTTTTAATAATAATCATAGATTTATCC ATACCGGGCATTAAATGTCCGAGATGGATAATTTATTAACCATACCAGGCCAACAGTGGC CCGACATGGATAAATGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTATAAACATAAATTTATC CATACCGAACATTAAAGGTCTAGTATGAATAATCAATTATCTATACCGGGCATACGGTTC CCAGTATGGATAAGTGACTTTTTATTTTTTTAATAATAAAACATAAATTTATCCATACCG GGCCTTTAATGCCAGGTATGGATAAGTCCATTTAATTTTTATTTTTTTAATTGTTATCAT GTTATTCATACCGAGCCTTTAGTGCCCGATATAGATAATCCGATTTCATTATACTGTTTT TTTGTATATATCCTTCGAAAATAGACATTCTCTAATCCAGAAATTTGCAAATTACACCTC AACTTATTTTCATTCAAATATCAAATTTGTATCCAATATTTTTATATACAGACATTTGTA TGCCCAGTATGGATAATTGATTATCCATACCGAGCAAGGAGTGACCGGTATGAATAAGTG ATTTTTTATTTTTTTAATAATAAAAATAAGATTATCCATACCAGGCCAGCGGTGCCTGAT ATGGATAAGTAGTTTTTTTTTTTTTTTTATTAATAATCATAGGTTTATCCATACCGGGCA TTGGATGTTCAGCATGGATAATTTATTAATCATATCGGGCCAACAGTGTTCGGTATGGAT AAATGATTTTTTTATTTTATTTTATTATAAACATAAGTTTATCCATACCGGACATTAAAG ACCCAGTATGGATAATCAATTATCCATATGGATAAACAGTGTCCAGTATGGATAAGTGAT TTTTATTTTTTTAATAATAAAATATAAATTTATCCATATCGGGCCTTTGGTATGGATAAG TCCATTTAATTTTTTTTTTTTTAATTACTATCGTATTATCCATACCAGGCCTTTAGTGCC TGGTATGGATAATCCGGTATCATTATGATGTTTTCTTGTATAGATCCTTTGAAAATAGAC ATTCTCTAATCCAAAAATTTGTAAATCACACCTCAACTTATTTTCATTTAAATATCAAAT TTGTATCCAATATTTGTATATACAGACGTTTGTATTACGGATTCTCTATGTTTACGTGTA AAGAGAAATCAATTACATAAGATGCTTATAATTTTCTGTCCCAAATTAAGTTAGCAGAGT AGTTGAGACATGAAAGAATAAATAACCAAAACGAATGAAAAACTTACAAGGTAGTTAGGG TTTTGTACGCCATCTTAGCTCATGCAATATGCTCCTCCCATCATCATTACAACTCACATA TATTAAAATAATATTTACTTTCTATATTAACCCCCCAGAAAAAATCTCTCTTTTCGTCAT GCAAGCACTGCACTTTACCTACCAAAGTAACAGCCCCAAGCTTCCAATATAAAAATAGAA ACATCCTTACAATTATATTATATATATTCAACTCATCAGTTGTTGTATCCCTTGTTTTCT TTCTACATGATCATCTTCAAATTGTTTCAAAACAATCTCTAAAATACTATAAGATATATC TACACGTGTACATATATATAATTTTCTATTTTCTGGGAATTTATGAGATGGGTGTGTTTT GAGATATGATGAGGTGGTGTTGGCTTATGTGGGGTTCTGGATGATGTCGCAGTTAACCAT TACTATCAACTGAAGTTTGT
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>LITCHI002043.m1 GenomeSequence + CTCTTTTCGTCATGCAAGCACTGCACTTTACCTACCAAAGTAACAGCCCCAAGCTTCCAA TATAAAAATAGAAACATCCTTACAATTATATTATATATATTCAACTCATCAGTTGTTGTA TCCCTTGTTTTCTTTCTACATGATCATCTTCAAATTGTTTCAAAACAATCTCTAAAATAC TATAAGATATATCTACACGTGTACATATATATAATTTTCTATTTTCTGGGAATTTATGAG ATGGGTGTGTTTTGAGATATGATGAGGTGGTGTTGGCTTATGTGGGGTTCTGGATGATGT CGCAGTTAACCATTACTATCAACTGAAGTTTGTATGGATCTCTGCTTTTGTTTTCTACGC TTTTTCTCTCTCGTTTGTTTCTCCACTTTGCTTTTGTTTTTTCTGATTTGTTCTATCAGA AGAAGAAGAAGATATAAACATTTTAAGAATAATAAGAAAACGTGGTATTATTATTTCTCA GGTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATATATATGGTTTGATTTTTGTT CACATGTTATAATCAACAGTTTTGTTGTTTGTACTTTATGATGGATTCTTGTGTGAATTT TCAGATATTTATTGATATTTTTGTCAATTTATAACTAGTAGTACTACTATGATACCATTG TGGTTAACTTGAATTTCCACATTTGAATTCCATTTTATGACTCATTTAATATATTTTTCA GGTTACAATATTGGCATGAGCAATATTGTCCATAACCTAATGGAGAGACTGAGGCCACTT GTAGGCTTGAAAGGCTGGGACTACTGTGTTCTTTGGAAATTGAGTGATGATCAAAGGTTG TTGATGACAACTCCATGCATGATCAAATTAATATATCCATCTCTCTTTCTCTCTCACCTC TCAATTTTTTTTTTCACTAATTGTGATGATTTTTGTTTGATTAATTAGGTTTATTGAGTG GATGGACTGTTGTTGTGCTGGAACTGACCAGAATATGATAAATGGAGGAGATGAAGAGCT TCATTTCCCAGTCTCTCCAGTTCTTCCTTGTAGAGATGTTGCACTTCATCAACATTCAAG GACCAAATCGTGTGAACTTCTAGCCCAACTTGCTTCTTCGATGCCTTTTGACACCGGGTA AATATTAATTATATCTCTCCGTTTTATTCATTCATTTTTCGTCCATCATATATTTGTATT CATTACATTTTATTAGTTGAGGAGGCACCAATAAATTTAGAGATGCTTAATGTATTCATA ATTTTTGTAACTTTTTTATTATTATTATTTTTTTGCATTAAAATATAAACTAGCACTATA TAACACCATTTCAATATCTTTCCATTAATCTTTCTTTACTATTTCGTGTATTTAAACTTT TTAAATTCACTAATTTAGCTCATGATATATAATCAGGAACATATATGCACAAACCTTGTT ATCAAACCAACCTAGATGGTTGAACTTCTCTAATAATACCTCAGATTCAGATGCTATGGA GGTAAGTCAATTCCATGATAATTAATTTAAAAAAAAATCACGCAAATAGAATAAAGTTAA GTGCACTCTTTTTGCAGGAAACAATTTGGACTAGGGTTTTGATTCCAGTGATGGGAGGAC TCCTCATTGAACTATTTGTTACCAAAGAAGTACGTGTATATATATATATATATATATATA TATATACTCTTTTCTCTGCTTCAATGTTAGTTGATGATAATAATTAACTATCGAATATAA ATTAATACCAAATTCCCCTTGATTTAACAGGTTCCTGAAGATCTTAATGTGATTGATTTT ATCGCAGCCCAATGTAGCATATCATTTCATGATGATCAAGAAGATACCATGACCAATACA AATAACAACAATAACATAGACCAAAACGATCTTTATCCTCCACCAGTTTCCTCATCAACT GCATTAGATAATCTTGATCGTTTGCCTTATGACATCTCCTTTGATCGAATTCGCCTTAGT AATAGTACTAATACCGGCTCTCCAATGAATTTGTTGCACCAATTTTATAGTACCACAACT TCTGACCAAAACGATAGAAACCAAAATGACCACCATGTCTTCTTTGAAGGGTCATCACAT CCTGGTCATCATGATCACAATTCATTCCTTTCTCATCATCATCTTGATAAGCCAATCAAT ATGATGAACTCATTGATCAACTCTTCATCACAATGTGGGGTTCATCCAGAGAACATAGAC GTGCAATACATGGACCAGCATGATCAACAACAAGGGAACAATGTTAATGATAATGATAAG GACTCCTTTAATAAGCCTGAAAATGGACGGTCGGATTCGGCTTCGGATTGCAGTGATCAG ATTGATGATGAAGATGATAGCAAGTATAGGAGAAGAAACGGGAAAGGTCCTCATTCTAAA AACCTTGAGGCTGAGAGGAAGAGAAGGAAGAAGCTCAATGATAGACTCTATGCTCTTCGA GCTTTGGTTCCCAATATTTCAAAAGTAAATTTTCATCTTTCAATTTCTCTCTCAAGTTTG TGATTATATATATATATATAGATATAGATATATATTGTATGCAAGTGTATTCGTATATGT ACAATAATAGGTGGAAGTGATTTTATAATAAATATGTTTTATTTGATATAGATTTAAATT ATACGTGAATGTCAAGTCCTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTATTTAAATTTAATAATAGA GTTTAATATATTTTTTATAAATAAATAAAATTGTTTTTTCTTTTTTATGTGCTTTAAGTG TGGTTTAATAAAAGTACATTTATTTGAAAGTGCTTTTTAAAAAGCTTCCAAATGCATGCG TCCTAGCTTGTTGATGTAAATATATATGATGTTTGGGCTTGTTGTATGATCAGTTGGACA GGGCTTCAATCCTAGGGGATGCAATTGAGTTTGTGAAGGAATTACAAAAGCAAGCAAAGG AGCTACAGGATGAGCTTGAAGAGCATTCGGACGATGATGGAGCCAAGAGTGGGGGCTTCA ATAATGTCAACAGTAACAACAACAATGTCAAATCAGAGATTTTTAACCAAAATCGAACCA CTTTTGCCTCTAAAACTGAACTTGATCATCACAAATCTCCAAATGGGTTTCATTTGGGAG TTTCAGGTACTGGCAACAGTATCCCGAAACAGGACCTAGAAATCTCTAATGACAAGGCAC AACAAATGGAGGTATACTTAATCAACTGTTTTTTTTTTCTTCTATACTTGAGTTCAAATT TAAAATTTAAAATTTTAATATATAAGTGCACATGTTAAGAGAAAACTATTGTATGATTAA ATTCAAGTCTTATCGGTTAACGGTATTTTCTTAAGATGTGGTTAGGGCATATATACACTA ACATAAATCTATGCATTCTATAGATTTTCTATGAAATTTTGATCAATGGAATAATTTTAT AGGCTCAAGTGGAAGTTGCTCAATTGGATGGAAATGAGTTCTTTGTTAAGGTCTTTTGTG AGCATAAGCCTGGTGGGTTTGTGAGATTGATGGAAGCTTTGAATTCTTTGGGTTTGGAAG TCACAAATGCAAATGTGACCAGCTTCAGAGGCCTTGTCTCTAATGTTTTCAAAGTAGAGG TAATTAAGAGTTAAGATATCTATGTTGAGCAAAATTTATATTCCTTACAAGTTGATTATA ATTAAACAAGTCATGACTTCTACAAATTTTTGGTTTGTAGAAAAGAGATAGTGAGATGGT TCAAGCTGATCACGTGAGGGACTCATTGCTCGAGCTCATGCGAAACCCTAATTTGTCTAG AGGGTGGCCTGATCAGATGGGAAAAGCTTCAGACAGCATCAATGGCAATGCGGATTATCA TAACCATCACCACGACCACCATCTTCATAATCATCATATGGCTACTCATCATCTTCACAA TTAGATAATTAACTTCTTAGAGTTTAAGATACTTGAAAAATAAATTGACTGTTTAATTAT CATTTGCGTTTATGTATGATTGTGCTCAGTACTTAATACAATATTTTATATGCTAGTTTG ATAAATAGGGACAGGAATAAATTGTGGTGTTCAATGTCAATTAGTTACTTCTTTATCCAA ATTTGTATACATACATACATATATATATAATCCTTTAAATGAGGATGATGTGTCGTTACA TTTAGGAGTTTTCTCCTTTGTACCATCGTAAGTTTTAAAATTAGGA