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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI002038Chr53283478432849230+SKP1-like protein 1A

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI002038.m161119PF03931.18Skp1_POZDomain91.62.80E-26
LITCHI002038.m1174213PF01466.22Skp1Domain73.68.90E-21
LITCHI002038.m1326433PF01426.21BAHDomain40.32.70E-10
LITCHI002038.m1639688PF08711.14Med26Domain43.62.40E-11
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ATGATGGCGATGACGAGCGACGAACGACAAGAAAGTGGCGAGTTTGCAACATTGAACGCG
AACGGCATGGTTAGGGTTTCAAAATCAAAAGGGTGCTCTGTTCTTTTTGGGTGGAATGAA
ACAGTCACTGAGCAGAAAATGATGTCGTTTGATGGCAAGATGACAATGGCTGCTCCGGCA
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GTCTCTATGAAATCGGCACCATTAGCTACATCAGTGAGTACAAACTTGAAAGATGGACAG
CCGAGGAATGCTGGTGGTGGTTCCTCCGATCTTCCTTCAACCCCATCCAAAGATGAGAAA
AGCAGCAGTTCCAGTCAGTCCCACAACAATAGTCAATCGTGTTCCAGTGACCATGCCAAA
GCTGGGGGATTCTCTGGGAAGGAGGATGCTAGGAGCTCTACTGCTGTTTCAATGACTATG
AGTAAAACCTCAGGTAGTTCGTCACGGTCTCGGAAAACAGCCAATGGCTTCCCTGGAACT
TCCCCAACTGGAGTTCATAGAGAAACTGGGTCAAATAGAAGTTCTTCCTGGCAGAGAAAT
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GTTGAGGGGAGCAATCACAAACTGATAGTGAAGATCACTAATCGAGGTCGTAGTCCAGCG
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GATGGGTCACGTGCTGTTCTCCCTGATGAGAAGGCATGCAGAACTGGTAATGATGCTAGG
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AAATTTCATGAAGCTTCTCTTGATGCTTTAATTGAAAGTTGCGTCAAATACTCTGAAGCT
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ATAACTGGAGATCCTGCCCCCCTGGATTTGCAACATACTGTGGATCCATGTCCCGAAAGC
AATGGCAACTCAAAAAAAGGAAAAACAACTGGGAAGGAGACCACCGATGGTGCAGGCAAA
GATCTTGAGGCAAAGACGAGCGGCAGAGTGGATGCAGATGGCATTCAAGATGCAAAACAA
AATGCGGGTGACTCTTTGTTGACTGAGGATAGGGTCTCTGAATCTGATGTGAAAGTTGAG
AATGGAACTGTTGAAGGGTCATCGTCAAACCAGTCTTCAGAAATCGGTGGTGAGGACAAG
AAAAATATGAATGAAAAATTGAACAGTTTCATGCAGACAGATCAAAATTCACCTCCCATG
ACTATGCGTTCTGAGTTTGTGAAGGGCACAGTTGAGGAAGTGCTGCTTTCTTCTCGTCCT
GGTAAAGATATGGCTTCAGAAAATGTTGATGTAGTGAAGTCTGAAAAGATCAATGAAGCT
GATGTCAGTAGTCTTGTTAACCAACGGGAGGAACAAAAGGATGACGCGAGAAGTAATGCT
CCTAAGACTTATGAGGATCACACTGTACCTTTGGTCTCAGTTGTTCCTAAGGATGAGCAC
ATGGAGGAGAATGTGGAACCTAATGATCTTAAAGAGCAGCAGTGTACTGGCTTAACTTCT
GATGGATTGCCTACATTACAAGTGCAAGATACAGGGCAGCATGTGAGGCCTGCAGGAAGT
AAGTTGACTGGCTGCGAAGCAAACAAACTGGAGGAATCTGCTTCAATGACAGCTCATACT
TCTTTCCCTGCTGCAGGAGTGTCTGATACAGAAGCAAAAGTGGAATTTGATTTGAATGAA
GGTTTCACCGGGGATGATGGGAAGTATGGAGAGTCAAATAATTTGACAGCTCCAGGATGC
TCAACCACTGTTCAACAATTAATTAGTCCTTCACCTTTTGCTGTTTCTTCTGTGTCTGGT
AGCCTCCCTGCTTCCATTACAGTGGCTGCTGCTGCGAAAGGCCCTTTTGTTCCACCAGAA
GATCTCTTAAGGAGTAAAGGAGAACTTGGTTGGAAGGGATCAGCAGCAACAAGTGCATTT
CGGCGGGCAGAACCAAGAAAGGTTCTAGAGATGCCATTTGGTGCAACTAATAGTCCTCTT
TCTGATGCTACTTCTGGAAACCAGAATCGTCCTCCGTTGGATATTGACTTGAATGTACCA
GATGAGAGAGTCTTTGAGGATTTGGCTTTACGAAGCTCTGCTCAGGATACAGTTTCTATT
TCTGTGAGTACAGATAATCGTGATGTGTCGTGTGGTGAACTGGGCCCTACACCTGTACGG
TCTTCTGGTGGACTTGATCTTGATTTGAATAGAGTTGAGGAGCATACTGATATTGGTAAT
TATTCGTCAAGCAATGGTCATAGAACAGATGTCCCTCTTAAGCCTGTCATGTCCTCATCA
GGTGGACTATTTAATGATCAGGTTGGTGTCCGTAGGGACTTTGATTTGAATGATGGTCCT
GTTGTCGATGAGATGAGTGCTGAACCATCACTATTTAACCAGTACTCCAAAAGTGTACCA
TCCCAGCCACCTGTTTCTACCCTAAGAATGACCAACGTTGAAGCCGGGAACTTCTCCTCA
TGGTTTCCTAGAGGGAATACTTACTCAACCATCACAGTTCCATCAGTCTTGTCTGATAGA
GGAGAGCATCCTTTTCCAATTGTGGCATCAGGTGGGCCGCAAAGGATGTTAGCTCCTCCT
ACCGGTGGCCCTCCTTTTGGCCCTGATGTCTATAGGGGGTCAGTTTTATCATCGTCTCCT
GCAGTGCCCTTTCCATCTACACCATTTCAGTATCCTGTGTTCCCTTTTGGAGCTAGCTAT
CTTCCCTCGGCCACTTTTTCTGGTGGTTCGACAGCATACATGGATTCATCATCTGGTGGA
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CATTATCCAAGGCCTTTCATAGTTAGTCTCCCTGATGGTAGCAACAGTGCCAGTGCTGAG
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GTCGAAGGTAGAGATGAGACATCACCTCTTGTGCCAAGGCAACTGTCGGTTGCCCATTCA
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AAAGAACCTGAAGGAGGATGGGATGGCTACAAGCGACCTTCATGGCAATAA
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QLEGVLMVVGRQNEGGVSCVVCLCMDCVQLTRISNGNVFAGTCGLSLHVSSPILAAADAD
VSASSSASPSSSPNSSSFVSKDGRIISVGDCALFKPPQDSPPFIGIIRSVTAGKENKLRL
SVNWLYRPAEVKLGKGFLLEAAPNEIFYSFHKDEIPAASLLHPCKVAFLPKGVELPTGIG
SFVCRKVYDITNKCLWWLTDQDYINEHQEEVDQLLYKTRLEMHAAAPPGGRSPKSMNGPT
STSQLKPGSDSLQNSASFPSQVKGKKRERGDQVSEPVKRERSSKMDDGDAGHCRTESSLK
SEIAKITEKGGLVDYEGVEKLTQLMSSERNEKKIDLACRSMLADVVAMTDKFDCLNRFVQ
LRGLPVFDEWLQEVHKGKIGDSTSPKDGDKSVEDFLLVLLRALEKLPVNLNALQMCNIGK
SVNHLRTHKNLDIQRKARSLVDTWKKRVEAEMDAKSGSSQTVSWPARSRLSEAPHSGNRQ
TGGSSEVAIKSLVSQPATSKAASVKLVQGETATKSAFASSVSMKSAPLATSVSTNLKDGQ
PRNAGGGSSDLPSTPSKDEKSSSSSQSHNNSQSCSSDHAKAGGFSGKEDARSSTAVSMTM
SKTSGSSSRSRKTANGFPGTSPTGVHRETGSNRSSSWQRNSTSERLAQSSSTSEKALEPV
VEGSNHKLIVKITNRGRSPAQNSNGGSFDDPSVTNSRTSSPVLSDKQDQSDRNTKEKSDS
FRVNASSHDNKDAVAGTDEGDGSRAVLPDEKACRTGNDARKVVETSKDFSVSSGNENKAV
KFHEASLDALIESCVKYSEANASVPVGDDIGMNLLASVAAGEMSKSDTVSPTGSPERNTS
GNEQFCDDSDSKGKSFPRAEFSQVQSRSTEGDDNDHEKQNMDHKLWAQNADNKQEKPSRD
ITGDPAPLDLQHTVDPCPESNGNSKKGKTTGKETTDGAGKDLEAKTSGRVDADGIQDAKQ
NAGDSLLTEDRVSESDVKVENGTVEGSSSNQSSEIGGEDKKNMNEKLNSFMQTDQNSPPM
TMRSEFVKGTVEEVLLSSRPGKDMASENVDVVKSEKINEADVSSLVNQREEQKDDARSNA
PKTYEDHTVPLVSVVPKDEHMEENVEPNDLKEQQCTGLTSDGLPTLQVQDTGQHVRPAGS
KLTGCEANKLEESASMTAHTSFPAAGVSDTEAKVEFDLNEGFTGDDGKYGESNNLTAPGC
STTVQQLISPSPFAVSSVSGSLPASITVAAAAKGPFVPPEDLLRSKGELGWKGSAATSAF
RRAEPRKVLEMPFGATNSPLSDATSGNQNRPPLDIDLNVPDERVFEDLALRSSAQDTVSI
SVSTDNRDVSCGELGPTPVRSSGGLDLDLNRVEEHTDIGNYSSSNGHRTDVPLKPVMSSS
GGLFNDQVGVRRDFDLNDGPVVDEMSAEPSLFNQYSKSVPSQPPVSTLRMTNVEAGNFSS
WFPRGNTYSTITVPSVLSDRGEHPFPIVASGGPQRMLAPPTGGPPFGPDVYRGSVLSSSP
AVPFPSTPFQYPVFPFGASYLPSATFSGGSTAYMDSSSGGRVCFPTVNSQLIGPAGAVPS
HYPRPFIVSLPDGSNSASAESSWKWGRQGLDLNAGPGVPDVEGRDETSPLVPRQLSVAHS
QALADEQARMYQMAGGVLKRKEPEGGWDGYKRPSWQ.
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TCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTAGTTTCCAATCAAAACCCATCATGGCTCTGCTGCTCT
AGGAGACTCTTGAAAGCTTTCTCAGTTCATGAATGATGACGGTGATGACGACCGGTAGTG
AGAGGAGTGATGATGGCGATGACGAGCGACGAACGACAAGAAAGTGGCGAGTTTGCAACA
TTGAACGCGAACGGCATGGTTAGGGTTTCAAAATCAAAAGGGTGCTCTGTTCTTTTTGGG
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GCTCCGGCAAAGAAGCTAACTCTAAGGAGCTCCGACGGGGAGACATTTGAGGTGGACATG
GCGGTGGCGCTAGAGTCGCAGACGATCAAACACATGGTGGAGGACGACTGCGTCGACAAC
GTCATCCCTCTCCCCAACGTCACCAGCTCCATTCTCGCCAAAGTCATCGAGTACTGCAAG
CGACACATCAAGGAGTCATTGAGCTCCAAAGACAACTCGAAGGATGACTTCAATGACAGC
AAGACCGCCGTCGAGGAGGACGACATCAAGGCCTGGGATGCTGATTTCGTGAAAGTCGAT
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GATTTGACCTGCCAAACTGTTGCTAACGTGATCAAGGGCAAGACTCCGGAGGAGATTCGT
AGGACCTTCAACATCAGGAATGACTTCACTCCGGAGGAAGAAGAGCAGGGTTGGCAATTG
CGACGCGCGGCCATCGAATCAGAATCGAAATCGAAATCAATCGGGTGTTTCGGAGTGGGG
AAACGGAAACAATTGGAGGGCGTGTTGATGGTGGTTGGAAGGCAAAATGAAGGAGGAGTA
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GACGCTGACGTCTCCGCCTCCTCCTCCGCCTCTCCCTCTTCGTCTCCCAATTCGTCGTCT
TTCGTTTCCAAGGATGGACGTATAATCAGTGTAGGCGATTGCGCACTTTTCAAACCGCCC
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TTAAGGTTAAGTGTAAATTGGCTCTATCGACCTGCTGAAGTAAAACTTGGCAAAGGCTTC
CTGTTGGAGGCTGCGCCCAACGAAATATTCTATTCCTTTCATAAGGATGAGATTCCTGCT
GCTTCCTTACTTCATCCTTGTAAAGTTGCATTCCTTCCAAAAGGTGTTGAACTTCCGACA
GGCATTGGCTCTTTTGTGTGCCGGAAAGTATACGACATTACGAACAAGTGTTTATGGTGG
CTAACTGATCAAGATTATATTAATGAACATCAGGAAGAAGTAGATCAGCTATTGTATAAG
ACGCGTTTAGAAATGCATGCAGCAGCACCACCAGGTGGCCGTTCTCCAAAGTCTATGAAT
GGTCCAACGTCAACATCACAATTAAAACCTGGTTCTGATAGTTTGCAGAACAGTGCCTCT
TTTCCTTCCCAAGTTAAGGGAAAAAAAAGGGAGAGGGGAGATCAGGTCTCTGAGCCGGTT
AAACGAGAACGTTCTTCAAAAATGGACGACGGAGATGCTGGTCATTGTAGGACAGAAAGT
AGTTTAAAATCTGAGATTGCCAAAATAACAGAGAAAGGGGGACTCGTTGATTATGAGGGG
GTTGAGAAATTGACCCAGCTTATGTCGTCCGAAAGGAATGAGAAAAAAATAGACTTGGCT
TGCCGGTCAATGCTTGCTGATGTGGTGGCAATGACTGATAAGTTTGATTGCCTTAATCGA
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AAGATTGGTGATAGTACCAGCCCTAAGGATGGTGATAAATCGGTTGAAGACTTCCTCTTA
GTTTTACTTCGTGCTCTTGAAAAGCTGCCTGTAAATCTTAATGCCTTGCAAATGTGTAAC
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ACTTCCAAGGCTGCTTCAGTCAAACTTGTCCAGGGTGAAACAGCTACTAAATCTGCATTT
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ATGACTATGAGTAAAACCTCAGGTAGTTCGTCACGGTCTCGGAAAACAGCCAATGGCTTC
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GAGCCTGTGGTTGAGGGGAGCAATCACAAACTGATAGTGAAGATCACTAATCGAGGTCGT
AGTCCAGCGCAAAACAGCAACGGAGGATCTTTTGATGATCCTTCAGTCACAAACAGCAGA
ACATCTTCTCCTGTGCTTTCAGACAAGCAGGATCAAAGTGATCGTAACACCAAGGAAAAG
AGTGATTCATTTCGGGTTAATGCATCCTCCCATGATAACAAAGATGCAGTCGCAGGAACT
GACGAAGGAGATGGGTCACGTGCTGTTCTCCCTGATGAGAAGGCATGCAGAACTGGTAAT
GATGCTAGGAAAGTGGTTGAAACTTCAAAAGATTTTTCCGTATCATCAGGAAATGAAAAT
AAAGCTGTAAAATTTCATGAAGCTTCTCTTGATGCTTTAATTGAAAGTTGCGTCAAATAC
TCTGAAGCTAATGCATCTGTTCCAGTTGGAGATGATATTGGAATGAATCTGCTTGCAAGT
GTGGCTGCTGGAGAGATGTCCAAATCTGATACAGTTTCACCAACTGGTTCTCCAGAAAGA
AACACTTCTGGTAATGAGCAATTCTGTGATGACAGTGATTCAAAAGGGAAGTCATTTCCT
CGAGCAGAGTTTTCTCAAGTGCAGAGTCGCTCTACTGAAGGTGATGACAATGATCATGAA
AAGCAGAATATGGATCATAAGTTATGGGCTCAGAATGCTGACAATAAGCAAGAGAAACCT
TCAAGGGATATAACTGGAGATCCTGCCCCCCTGGATTTGCAACATACTGTGGATCCATGT
CCCGAAAGCAATGGCAACTCAAAAAAAGGAAAAACAACTGGGAAGGAGACCACCGATGGT
GCAGGCAAAGATCTTGAGGCAAAGACGAGCGGCAGAGTGGATGCAGATGGCATTCAAGAT
GCAAAACAAAATGCGGGTGACTCTTTGTTGACTGAGGATAGGGTCTCTGAATCTGATGTG
AAAGTTGAGAATGGAACTGTTGAAGGGTCATCGTCAAACCAGTCTTCAGAAATCGGTGGT
GAGGACAAGAAAAATATGAATGAAAAATTGAACAGTTTCATGCAGACAGATCAAAATTCA
CCTCCCATGACTATGCGTTCTGAGTTTGTGAAGGGCACAGTTGAGGAAGTGCTGCTTTCT
TCTCGTCCTGGTAAAGATATGGCTTCAGAAAATGTTGATGTAGTGAAGTCTGAAAAGATC
AATGAAGCTGATGTCAGTAGTCTTGTTAACCAACGGGAGGAACAAAAGGATGACGCGAGA
AGTAATGCTCCTAAGACTTATGAGGATCACACTGTACCTTTGGTCTCAGTTGTTCCTAAG
GATGAGCACATGGAGGAGAATGTGGAACCTAATGATCTTAAAGAGCAGCAGTGTACTGGC
TTAACTTCTGATGGATTGCCTACATTACAAGTGCAAGATACAGGGCAGCATGTGAGGCCT
GCAGGAAGTAAGTTGACTGGCTGCGAAGCAAACAAACTGGAGGAATCTGCTTCAATGACA
GCTCATACTTCTTTCCCTGCTGCAGGAGTGTCTGATACAGAAGCAAAAGTGGAATTTGAT
TTGAATGAAGGTTTCACCGGGGATGATGGGAAGTATGGAGAGTCAAATAATTTGACAGCT
CCAGGATGCTCAACCACTGTTCAACAATTAATTAGTCCTTCACCTTTTGCTGTTTCTTCT
GTGTCTGGTAGCCTCCCTGCTTCCATTACAGTGGCTGCTGCTGCGAAAGGCCCTTTTGTT
CCACCAGAAGATCTCTTAAGGAGTAAAGGAGAACTTGGTTGGAAGGGATCAGCAGCAACA
AGTGCATTTCGGCGGGCAGAACCAAGAAAGGTTCTAGAGATGCCATTTGGTGCAACTAAT
AGTCCTCTTTCTGATGCTACTTCTGGAAACCAGAATCGTCCTCCGTTGGATATTGACTTG
AATGTACCAGATGAGAGAGTCTTTGAGGATTTGGCTTTACGAAGCTCTGCTCAGGATACA
GTTTCTATTTCTGTGAGTACAGATAATCGTGATGTGTCGTGTGGTGAACTGGGCCCTACA
CCTGTACGGTCTTCTGGTGGACTTGATCTTGATTTGAATAGAGTTGAGGAGCATACTGAT
ATTGGTAATTATTCGTCAAGCAATGGTCATAGAACAGATGTCCCTCTTAAGCCTGTCATG
TCCTCATCAGGTGGACTATTTAATGATCAGGTTGGTGTCCGTAGGGACTTTGATTTGAAT
GATGGTCCTGTTGTCGATGAGATGAGTGCTGAACCATCACTATTTAACCAGTACTCCAAA
AGTGTACCATCCCAGCCACCTGTTTCTACCCTAAGAATGACCAACGTTGAAGCCGGGAAC
TTCTCCTCATGGTTTCCTAGAGGGAATACTTACTCAACCATCACAGTTCCATCAGTCTTG
TCTGATAGAGGAGAGCATCCTTTTCCAATTGTGGCATCAGGTGGGCCGCAAAGGATGTTA
GCTCCTCCTACCGGTGGCCCTCCTTTTGGCCCTGATGTCTATAGGGGGTCAGTTTTATCA
TCGTCTCCTGCAGTGCCCTTTCCATCTACACCATTTCAGTATCCTGTGTTCCCTTTTGGA
GCTAGCTATCTTCCCTCGGCCACTTTTTCTGGTGGTTCGACAGCATACATGGATTCATCA
TCTGGTGGAAGGGTATGCTTCCCAACAGTCAATTCACAATTAATAGGACCTGCTGGTGCA
GTCCCTTCTCATTATCCAAGGCCTTTCATAGTTAGTCTCCCTGATGGTAGCAACAGTGCC
AGTGCTGAGAGCAGTTGGAAATGGGGAAGACAGGGTCTAGACTTAAATGCAGGGCCTGGA
GTCCCAGACGTCGAAGGTAGAGATGAGACATCACCTCTTGTGCCAAGGCAACTGTCGGTT
GCCCATTCACAGGCCCTAGCCGATGAACAAGCAAGAATGTATCAGATGGCAGGTGGTGTT
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CTAACTTCCGGAGGGCAGAGGTCATCTAACTTGTCGTATTGGAGGTCTGGTGGTGGTGGT
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AATTTGTTCAGGGGTGGTGCAGGTCCCATGCTATAAAAAAGAGACCGACATGGCGACGTC
AATCTCTGTTTAGATTGAAATCTGTAGCAAAAAATTGAATGGGAAGCCATTAGACTTGTA
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ACCTCAATTCAATTCCCATTTATTTTTTATTACATTTGATCAGATCCAAGATGAAAATGA
ACCAAATTTGTCACACATCAGAAAAATAGGCCCCTAATGATGTGCATACAAAATATGTAT
GGCCAAAAACTCACTTTGCTCCTTTGTAGTCAATTTCATGTTCACATACTTATAGCTGGC
AGCATTACACACTAAATCATTATACTTATAAGCTTCTAATTGTCGCTGTACTTAGTGGTA
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CATAATTTGTGGGTTTCTCTCGTCATGCATGTGGGTTGCACTCCTACTCGATGTGAGTTA
TTCTCTCTCATTTGAGAACTATTCCTCGGGTGATATTCCAGGGTCATATCTAAATCAAGT
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TAGAGTTATATCTCTTTTTGTCTTGATTGCTCGCTAAATTAGGTACTAGTTATCAAAAAA
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TCGTAAATAATGCAACATATGGTAAAAATTGCACTTCTGGCACTTCGACCTTGGCACATA
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CTACACCCAGTGGTAGCGTTTGTTTTTTCTTTTCTATGTGAGGGCAGTCCTTCCACCTAT
GTGTGGGTCATTTACTCTCGTATGAGAGCTGTTTTTTAAATCGTGTCATCAATGTTTAAT
CATGTTTGATTCCGGTTGTTTTCTGGATCAATCTCAGTAATGTAATGTAATTATTTAAAA
AAAAAAAGTGACCCTTCTACCAATTTCAATGAGAATCAAGTCGATATAAGTAACACTGTA
TTGTTTAAATTTATCCAAACCCCAAATTTGTCG
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CATCAAATATTATTAGGGAATGCTATGGTCCTGTTGATAGAAATCACGAGCTCAGTCCCA
TGAATTAATTCCATTTCTAGAATTTCTCAATAAATATGTTACAATTAGGTACTACCACAA
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ATATATCAATGTTTCAGAATTTATTACTCACTACTCGACCGGCAATCCAGTGAATTTAAT
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