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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001966 | Chr5 | 32208743 | 32211451 | - | Transcription factor bHLH121 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001966.m1 | 65 | 114 | PF00010.29 | HLH | Domain | 31.9 | 1.00E-07 |
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>LITCHI001966.m1 ATGGATCATCAGCTCAAAAACGACGTCGTTTTTGTCGAATCAGTGTCGGCGGCTCCACCT CCAAATCCGACGCTCATCGACTTCCGTCAGCCACAGCCGCCGCCTGATCCGCACGTCGCT TCCACTCGCTCACAACAACCTAAATCCAGTTGTCAAAGGAATGAAGGGGAAGTTAAGGAT TGCGTGGCGGCGAGAAAGATTCAGAAGGCTGACAGGGAGAAGTTGAGGAGGGATCGGCTT AACGAGCATTTTACTGAGCTGGGAAATGCATTTGATCCTGACAGGCCAAAAAATGACAAA GCCACTATTCTAGCTGATACAATTCAGTTGTTGAAGGATCTGACAGCTCAAGTTGACAAA CTTAAAGCGGAATATGCTACACTGACTGAAGAATCTCGTGAGTTGACTCAGGAGAAAAAT GACCTCCGAGAAGAGAAGGCATCCCTTAGATCTGATATTGAGAACCTCAATATTCAGTAT CAGCAGAGACTCAGGACTATCGGGTACCCATGGGGTACTATGGATCACTCAGTCATTATG GCCCCACCTTCATATCCTCTTCCAGTGCCAGTGGCAATGCCCCCTGGGCCGATTCCCATG CATCCATCCATGCAGCCTTACCCCATCTATGGAAATCAAAATGCCGGGGTCATTCCTAAC CCCTGCTCAACTTATGTTCCATACATGACTCCTAATACTCGGGTTGAACAACCGTCTATA CAATATGTATCTCCAGTTGTGCAGCCAGGCTGTAGGTCCCATGTTTCAGGCAAACTAGAT TCTGAAAACAAGTCTTCAGGGGAGAGCAAGATTGAGAAGAATGAAGATTCTAATGATGTA ATGACAGACCTGGAGTTGAAAACTCCTGGATCAACAACAGATCAGGATATCTCATCAGCA CAAAGAAAATCTAAGAAGTCCACAGGGAAGGTAAATAGTCTTAAGGAAGGAAGTTCTTCA AGTAGGTGTTCATCATCTCGTAGCATACAGGATAGCTCATCTGATAGTGTAGTTGGTAGC AGAAAGTCTGATGACCTAGAAGGTACAAAATAA
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>LITCHI001966.m1 MDHQLKNDVVFVESVSAAPPPNPTLIDFRQPQPPPDPHVASTRSQQPKSSCQRNEGEVKD CVAARKIQKADREKLRRDRLNEHFTELGNAFDPDRPKNDKATILADTIQLLKDLTAQVDK LKAEYATLTEESRELTQEKNDLREEKASLRSDIENLNIQYQQRLRTIGYPWGTMDHSVIM APPSYPLPVPVAMPPGPIPMHPSMQPYPIYGNQNAGVIPNPCSTYVPYMTPNTRVEQPSI QYVSPVVQPGCRSHVSGKLDSENKSSGESKIEKNEDSNDVMTDLELKTPGSTTDQDISSA QRKSKKSTGKVNSLKEGSSSSRCSSSRSIQDSSSDSVVGSRKSDDLEGTK.
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>LITCHI001966.m1 AAGACCGGGTTGGCCCTTGTCGGACGCCGACTTTGTCTTGAGCTCCTGGATTTTGCGGCG CTCCGCTTCTCTCTGCTTCTCCAATCTTCGGATCCTGACGGCGTCCTGGGCCGTGCCCAC GTACCCGTCTCCCATACCCGACATTTTCTTCGCTTCTTTCTCTCGACGAGATCGGAAAAA ACCGAGAGCTTTTTATTTTTGTTTTTTAAGGGGGGATGAAACGACGAAGTCTATTTATAC CCGGACCGTGTTGGTAATGTGGTGAATTGTAGGGATATAATCGTAAGTTCGTCAAATAAA ACGATGTCGTATTAATGTGGCGGGTGCCGTGTAGATAAGCTTTGGTAGCTTGCGCAGCGG AGTCAGATATAGAAAAAAGTACATCGATGGATCATCAGCTCAAAAACGACGTCGTTTTTG TCGAATCAGTGTCGGCGGCTCCACCTCCAAATCCGACGCTCATCGACTTCCGTCAGCCAC AGCCGCCGCCTGATCCGCACGTCGCTTCCACTCGCTCACAACAACCTAAATCCAGTTGTC AAAGGAATGAAGGGGAAGTTAAGGATTGCGTGGCGGCGAGAAAGATTCAGAAGGCTGACA GGGAGAAGTTGAGGAGGGATCGGCTTAACGAGCATTTTACTGAGCTGGGAAATGCATTTG ATCCTGACAGGCCAAAAAATGACAAAGCCACTATTCTAGCTGATACAATTCAGTTGTTGA AGGATCTGACAGCTCAAGTTGACAAACTTAAAGCGGAATATGCTACACTGACTGAAGAAT CTCGTGAGTTGACTCAGGAGAAAAATGACCTCCGAGAAGAGAAGGCATCCCTTAGATCTG ATATTGAGAACCTCAATATTCAGTATCAGCAGAGACTCAGGACTATCGGGTACCCATGGG GTACTATGGATCACTCAGTCATTATGGCCCCACCTTCATATCCTCTTCCAGTGCCAGTGG CAATGCCCCCTGGGCCGATTCCCATGCATCCATCCATGCAGCCTTACCCCATCTATGGAA ATCAAAATGCCGGGGTCATTCCTAACCCCTGCTCAACTTATGTTCCATACATGACTCCTA ATACTCGGGTTGAACAACCGTCTATACAATATGTATCTCCAGTTGTGCAGCCAGGCTGTA GGTCCCATGTTTCAGGCAAACTAGATTCTGAAAACAAGTCTTCAGGGGAGAGCAAGATTG AGAAGAATGAAGATTCTAATGATGTAATGACAGACCTGGAGTTGAAAACTCCTGGATCAA CAACAGATCAGGATATCTCATCAGCACAAAGAAAATCTAAGAAGTCCACAGGGAAGGTAA ATAGTCTTAAGGAAGGAAGTTCTTCAAGTAGGTGTTCATCATCTCGTAGCATACAGGATA GCTCATCTGATAGTGTAGTTGGTAGCAGAAAGTCTGATGACCTAGAAGGTACAAAATAA
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>LITCHI001966.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAGTTACAGTTACTATAGAATGAGCTTCCATATGCTGGACTTCAGATTTGCCCATGTGCT GAGTAGATAATGTTATTTAAAGATATCCTTTGCACTGCCTATGTTAATGCAGGTAACACT GCTACATGTACTACAGTTGGGCCATCAAACTAAGTAATCGACCAAAAGATATTTAAGAAA TAGAAGTACCAGAGTCTCTACAAAAAAAATAAAAATTAAAAAATACATAGATTAGTAAAA TATCTTGCACTGTGGGAAATCCAAGGATCATAGTTTAATCCACTCCACATCAAAACCTGA GCTATTTCTCATCTGGTTCTGGCCATCATAGACACAAACTATTCTTCTGTGCCAAGAAAA ACTTTTAACACACCCATAGCACACCAAATCCAGGAATAGTGTAAGTGTGTAACCAATAAA AAGTTGCAAACTCTTAGTATTACTATTTTTATTCAGGACAACTAACGGTTTCAAACCAAA AATCAATGCCAGATTGCCAGTACAAAAATTGTTGATACTAAGGGCTTCAAATAATCTTGT GGAGGATTCAAACCCAAAGAAGAGAACAATTGACAACAATTTAATTCATAACCTAAATCG ATGTTCAAAGCACAATACACGTCCTAACAAGTAGGATGACAAAATAAACCCACAGACTAC TAAATATGATCATAACCTGCTCCTATCTCACTCCAAATGTAGACAAAATCTCCTCTCAAG GAGGCCAAAGACCCTACTATACTACCACTCACAACTGCCTCAAATAAGCTCAAAAACCAC TTAGCCTATAGTATTCACGTGATGGCATAAACCAACAATCATATTTCAAAACATTATGTT ACAGCTTCCTTAAACCACCAAATGACCATAATCAAATGAGAAGCTTTGCATAATCATACA ACACACAATTTATAAAATCTCTAGAATTCCTAACATTAAAAAATCATCATATAACAGCAT ATCAAATCATTTCCACAACAATTAAAATAATAATTAAGAACGAAAACACTCCCTACTTTC ACCGTACTCCTCTTCACTTTCGCTCTCTATATCCTCAGCAAATGACAACCGCGAATTCCC CTTGATCTTCCGCTTTTTACGCTTCTGCAATTGCAACTCCTCCTCCCTACAATCCAATAC AATAACACATTAACAAAAACAAGTCCAAAAAATATAAATAAACACTATTCCTATATATAT ATATAAACACATAGTTTTCCAAACTTTACACTAAAAAATTCAATCTTTTCTAAAGAAAAC AAACTCACTCTTGTTGTAGCTTTTGAAGCTTCTCCTTCTCTTCCTCTTCGATCTTGTTTC GAATATTAACTCTCTAAACAAACAAACAAACAAAAAAATCACATCAAAATCGTCACAAAC CAAAAACTTCTTTAATTGAAAAATAATAAAAAAGCAACGAAATGATCTCCTATACCTTCT CAACATATTGCTCTCTGGTCACCAGACCCACAGTCTCCTTCTTGAACGCAGTCTCCAGAA TCTGCAACAACAAACAAAAATCACTTAAAAAACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAA ATGAAACCCTAGACAGAGAATTCAGACCTCGGAAGTACTTGACCCGAACTGTAGAAGACC GGGTTGGCCCTTGTCGGACGCCGACTTTGTCTTGAGCTCCTGGATTTTGCGGCGCTCCGC TTCTCTCTGCTTCTCCAATCTTCGGATCCTGACGGCGTCCTGGGCCGTGCCCACGTACCC GTCTCCCATACCCGACATTTTCTTCGCTTCTTTCTCTCGACGAGATCGGAAAAAACCGAG AGCTTTTTATTTTTGTTTTTTAAGGGGGGATGAAACGACGAAGTCTATTTATACCCGGAC CGTGTTGGTAATGTGGTGAATTGTAGGGATATAATCGTAAGTTCGTCAAATAAAACGATG TCGTATTAATGTGGCGGGTGCCGTGTAGATAAGCTTTGGTAGCTTGCGCAGCGGAGTCAG ATATAGAAAAAAGTACATCG
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>LITCHI025400.m1 GenomeSequence + GGACAACAAATTAGCTGCACTGTAGTCTCTCCTTTTGTAAATGGACCCCAAGGTTCTTTA ACATTCTTTTCTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCAACATTTTCTTGCGAGAAACA TAAAAGCAGAAACACACCCCTATGTTTTTTGCTACCAATCACTCGCATTCTTATTTAGCT AGCTCCACAACTAAAGAGCTATTAGACCCTCTCTATCATGGCAAATCATATCAACATTGA AAATGATGCCCATCATGACTCCTCCTCTTCCACGTCCTCCTCCACCACCACCACCGCCTC GTCCTCCACCACCACCACCACTTCAAGTTGTAACATCGCTCATCAAGAAGGCTCAAGAAA AGCTGAAGAAGACCATGTTCATGGTGGTAACGATGACCATGATCATCAAAACAGGAAAAA GAAAGTGAAGAGAAACCATCATGACAATGGAAAACACCCCACGTATAGAGGAGTGCGTAT GCGTAGTTGGGGCAAATGGGTCTCTGAAATTCGTGAGCCGAGAAAGAAATCAAGAATATG GCTTGGAACCTACCCTAATGCAGAAATGGCAGCTCGAGCTCACGACGTAGCTGCTCTAGC CATCAAAGGCCGCTCAGCTTACCTCAACTTCCCCGAACTGGCTCACGAACTTCCCAGACC CGCCACCACCTCTCCCAAGGACATCCAAGCAGCCGCCGCCCAAGCAGCAGCTGCATTTCA AGTTAGAGCTGATAATCAAGCTGAAGCCGAGCCAGCTCGAGCCGAGCATCCGGTTTCGTG TTCTTCTAATAATAATAATAATACGCAAGAATCTACAAGCAGCGCTACTTTTACTTCAGT TTGTGGTGGTAGTGATGATGATGACACGTTGTTTGATCTGCCTGATCTCTTCATCAACGG 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CCCTAGTTGGTCGAGGAGGTTATGGGCAGGTTTATAAAGGCATTCTGTTTGATAATACAG TTGTTGCCATAAAGCGTGCAGAAGAAGGTTCTTTACAAGGCCAAAAAGAATTTTTGACCG AGATAAAGTTGCTGTCCAGGTTACATCACCGAAACTTGGTTTCACTGGTGGGATATTGTG ATGAAGAAGGCGAGCAGGTAATTCTTGCAAAGTGTCATAATTGATGCAGCGATGGTGGTT GTTGTATAAGTGATGTCTGAAGGAAGAATTAGCTAGCTAGACATCTAAAATTGCTGCAAT CTTGATATTAACTTGTGTGCTTTTGCAGATGCTGGTTTACGAGTTCATGCCTAATGGCAC CTTGAGGGACTGGCTTTCTGGTATTATAGTCTCCTGGCTTGAATTCTTCTTGACATTTTA TCATTACTTCGTTGCTCAGCATGCATCTGGATTGTTTGTTAAGAATATGTTATTTTATTT GGTTTGTGATTTGTTCAATTTTTCTTGGCTCAAGAAACCGATGCTTAAATGGTCACTACA ATATGCAGCTAAAGGTAAAGAAAGCCTGAATTTTGGCATGAGAATACGCATTGCACTGGA TTCAGCTAGGGGAATTCTTTACCTCCATACAGATGCTAATCCGCCAGTATTCCACTGTGA TATCAAAGCTAGCAACATACTTCTGGACTCCAAGCTTAATGCTAAAGTTGCTGATTTTGG ACTCTCCCGGCTTGCTCCTGTCATGGATGAGGACGGAGCTGTGCCAACTCATATATCCAC AATCGTGAAAGGAACACCGGTAAGTCTCAATCCATTTCGTTATGTTACATGTTCAAGAAT CACACAAATCATTTTAATCCAAATTTGGACATTGTTCCTCTTCAATCCTCACTCATTAAT GATTTTCATTCTTAATGTTAACTCTCGTGTTCTATTATCATATAATGCAGGGCTACCTCG 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