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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001942 | Chr5 | 31943002 | 31947668 | + | tRNA-dihydrouridine(47) synthase [NAD(P)(+)]-like |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001942.m1 | 347 | 615 | PF01207.20 | Dus | Family | 169.1 | 1.30E-49 |
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>LITCHI001942.m1 ATGGCCGAGTCTGCCACTGAGCTCGGCGAACCTTCGCTTCTTTCTGCGGAGGAGGACCCC TCGAACTCTGTTGCAGCTCCTTCTCATCACAATCTGACGCCGGAGCAGCTCGTGGCCAAG GCCATAGCTCCTGTCAAAAAGGACTTCCTCCGTCCTCCGCCGTCCAGAACCAATCCGAAG AAGAAGACCAACGACGACGAGGACACTTCGGCGTCTGCGACGACAAGCTTAGTGACGGAG AAGAAATCGAAACGGCAACTCAAACGCGAGCGTCGTCAGAAACAAAAGTCTGCGCAAAAT ATTTGTCCGGAGATAGCGAAGAGTGGAGACGTTAGTTCATGTCATTATAAGGATAGTTGC CGTTTCAGTCATGACTTGGAAGGCTTTAAGGCGCAGAAACCAGATGATTTGGAGGGCGAA TGCCCATTTTTGAGTGATGAAGGTCCATGTCCGTATGGTTTGGCTTGCAGATTTTCTGGT ACGCATAAGAATGGTGTTGTTGGTGGGACGTTAAAAGTACAGAAGAAAAGCTGTGAGGTC AATGGGTTGAACAAAGATGTGCAGAAGCTTTTGTGGAAGAATAAAATGAAGTTTCCCAAG GCTGATGCTAAACTAAAGTCACTCGGGCTTTTGAATCTTGCTAAGTCAAAATTGAAAGTG GCGGAAGATAAGGAGGAAGGCAATGGAGTTGATTCAAATAATTCTAATGCTGCTGATAAA AATGGTTGCTCAAAAGGTGATGGTGCTTCAATTGATCAATCTGAGTGCTGTCCAAGTTTT CTGGAAGAGGATAATGTAGGTGAGACTTGTGCATCTGTTGAGCTCCGACCACTGAAGAAA GCAAAATCGGAACTTGTTGAAAATTGTTGCTTGGGTGAAGTGGATAATGGTGTGAGTGTC TTGGAGGAAGATTCTGGGAAAAGCTCTACAAGAACTGAGCTCGAGGCTGCTGTTGATGAT AATGTTATAGAAACTGATAAAAGCTTAAAAGTACATCCTCGTGAGAAGAAGCTTATTGAT TTTAGTGAAAAGCTGTATCTAGCCCCATTAACCACCGTTGGAAATCTTCCTTTCCGAAGG GTTTGTAAAGTACTGGGAGCTGATGTAACATGTGGTGAAATGGCAATGTGTACAAATCTT TTGCAGGGTCAAGCTTCAGAATGGGCTTTACTGAGGCGACATTCATCAGAAGATTTGTTT GGCGTACAGATATGTGGAGCATATCCAGACACTGTGGCATGCACTGTTGAACTTATTGAT CAGGAATGTACTGTGGACTTCATTGATATCAATATGGGATGCCCAATTGATATTGTTGTT AACAAAGGTGCTGGGTCATCTCTTCTTACAAAGCCAATGAGGATGAAAAGCGTGATTGAA GCAGCTTCTGGCACTGTGGACAAACCCATTACTATTAAGGTGCGGACTGGTTATTTTGAA GGGAAAAACCGAATTGATTCATTAATTGCTGACATAGGAAACTGGGGAGCCACTGCAGTG ACAATTCATGGTCGATCACGTCAGCAACGTTATAGCAAGCTTGCAGATTGGGATTACATA TATCAGTGTGCCAGAAAGGCTCCCAATGATCTGCAAGTTCTGGGTAATGGTGATATTTAT TCATATTTAGACTGGAACAAACACAAGTCTGACTCCCCTGAGCTCACTTCCTGTATGATT GCTCGTGGAGGTCTAATTAAGCCTTGGATATTTACTGAAATAAAGGAACAGAGACACTGG GACATTAGTTCTGCAGAACGTTTTAACATTTTGAAGGATTTTGTACATTTTGGCCTTCAA CATTGGGGATCTGATAAGAAAGGGGTCGAGACAACTAGGCATTTCTTGTTGGAATGGCTT AGCTACACTTACAGATATATACCAGTTGGGCTTTTAGATGTCATCCCACAGCAACTGAAC TGGCGTCCACCCTCCTACTTTGGTCGTGATGACCTTGAGACATTAATGGCCTCTGATTCT GCAGCTGATTGGATTCGAATCTCTGAGATGTTACTTGGCAAGGTTCCCGATGGCTTTACA TTTGCACCAAAGCACAAATCCAATGCTTACGACCGCGCAGAAAATGGCTGA
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>LITCHI001942.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGTCATTTTGCTCACTATAACAGTCAGAATTTACTGTTTACTAACAGATTTAACAGAAGG GGGAAAATAGGATTTGTTCAAACTAGAGAGGAAAATTAGCTATTAGATCAAACAAGAAGG GAGAAATTGGGATTATTCCTAATTTTTATTGGTTTATATTTGAACTTATTGATTCACTTA AATGTGTGGTGACGGAGAGTCTTTATACAAACCACGTGTGAGAATTTTCAATATATGACT AAAATTGTTATGGTGGATGCAAGATGATCAAATGACAAAAGCAATAAATGTTGAATTGAA ATGATAATTATTTAAAAAGATAAGAGGAAGTGAACTCTCTATTATAGGTATAAAAAAAAT GCTAGTCATGTAGTCATGCAATTAAATGATATTCAAACTTCTGATTTAGTTTTATTAAAA TGACAATTTTCGCTGCCCTTGAAAAAAATGATAATTTTCCTTTCCATCGCCATATCAAAA AAGGAATAGAAAAGTAGAATATTTGTAAAATGATTGTTATGGTTTTCATTACCTTACATG CTTTTTAAAATTATTATTATTTTTTTTTAAAAAAATCACAACCTTTGAACCTAATGTGAA TGGAATTTGAACATAATATTTTTAGCTAATACCCAGTTGGTATACATTATCATAACAATA ATTTTCGACATCCCACTTTATATATTCTACTTGGATTCCAATTAATAATGTGATAATTCA TAAATAAAAACATACATAAATGAAATAACTTATTAATTTGTATTTATTCATTAATTAACA CGTTATTAATTGAGATGGAAGTAGAGTGCGACATAAAGGAATGTCCAGTACTACTATTAT CATATTATGCATTGATAGTCAAAATTTCTTAATTTTTCATGTGTTTAAAATGCAAACAAG AAGGTAAACTGTGGACAAGACATGTCACTTTTCACATTTCACTTTTATCAATTTGATTGT CTTCTCAATGAATCTGTAGCTGTGGCTCGTTCCGCTGCATTAAAACCGAGGTTCATCATG TGTCTCAATACTGCAGATGTTAGCAAGATGGAACGAACTTAAATGACGACTCAAATTACA AATTTGTAGATTCTATTGCGACTCCATGCTAGCGGTCACGAACATGTCAGGATGGCCGAG TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCTTCGAAAGAGGGCGTGGGTTCAAATCCCA CTTCTGACACATCCTTTTTTTGAGAGCCAAACACCTCGTTTCAGACTTCTTTCTTAAATT CTTTATGTTTTAACATTTCATTGCATTTTTAGCTAAAAAAGGTTCTTGAGTCCATCATCC TAACATTTTAGAAAATTTATGAAATTAATTCATTTATCCTCATCCACACTTAACGATTTT AAAGGTGACTTTGTATTTAGATAAATAAAACACAATGTTTCAAAAATAGTATGAATTTAT TTTTTCTTTCACCCGACACAAGATTAAATGATTAACGGGATCTATAAATACAGCCTTATT TGCGTGTGATTCGAATTACTACTCTTAGAATCAGAAGAGTCAACCCACATTTTAATAGAA AAATTTATCATATTTTATGGTCTTAATGAGTTTCGAATTTTGTCTTTGCCTGACAAATAA GGGTAAGTAGAGGTATCGTCATTTCGACAATTCATCAAACCCAGTGTGAAATTTATTTTT AATAAAAAAAATTAATTATTTATAATTTAAAATATAATTTTAATCTTTTTTAAAGAAATA ATTCTAATCGTGTTTAATTATATGAAATGAAATGCTACACAAACACAAAACTAACCAAAG AAAATTGAATTCATGATTTAAAAACATCAAAAAAAAGAGAAAAGTTAAAACGAAAGGGAG CAAAATGAAAATCTCCCAAGAATCTACTACAAACCCTTGATAACCCTCTCATCACTCCTC TCTTTTCTCTCAGCTCCAATCAGAACCACGAGGGCCACTGAGTCACGCTCCCGAGTTGCC GACAACTCGCCTCCACTCCA
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>LITCHI001942.m1 GenomeSequence + AAAAAGAGAAAAGTTAAAACGAAAGGGAGCAAAATGAAAATCTCCCAAGAATCTACTACA AACCCTTGATAACCCTCTCATCACTCCTCTCTTTTCTCTCAGCTCCAATCAGAACCACGA GGGCCACTGAGTCACGCTCCCGAGTTGCCGACAACTCGCCTCCACTCCAATGGCCGAGTC TGCCACTGAGCTCGGCGAACCTTCGCTTCTTTCTGCGGAGGAGGACCCCTCGAACTCTGT TGCAGCTCCTTCTCATCACAATCTGACGCCGGAGCAGCTCGTGGCCAAGGCCATAGCTCC TGTCAAAAAGGACTTCCTCCGTCCTCCGCCGTCCAGAACCAATCCGAAGAAGAAGACCAA CGACGACGAGGACACTTCGGCGTCTGCGACGACAAGCTTAGTGACGGAGAAGAAATCGAA ACGGCAACTCAAACGCGAGCGTCGTCAGGTTGTTGTTTAATTTCCTTCTCTAACATCTTC TATATGCGTGTTATTGATTTAAAGATTCGATTTTTAATTGATTTTGGTTAGGTTTAGAAA GAATTTAATCGATTTTGTGTCACACAATGGACGGTTGAGATTATTTGCCTATTGTATGGA TTGGACTAGCAAATTTGTCTACTACATTATTGGATGATTTTGGTGATATCAAAATGTTAG GTCAATTTAAGGTAGTGATTGTTGTCATAGTTTCAAAAGGAGAAAAATTTAAGATGGTTT TTAAAAAAATTTCGTTTTGCAGAAACAAAAGTCTGCGCAAAATATTTGTCCGGAGATAGC GAAGAGTGGAGACGTTAGTTCATGTCATTATAAGGATAGTTGCCGTTTCAGTCATGACTT GGAAGGCTTTAAGGCGCAGGTATTAGAAGAATGGATTTGTTTAGTTTGGTTTTTGAAGGT ATTAATTGTAATGTTGTTTAACTATAGTGGTGATGTGGTGTTGTTAAATGTAGAAACCAG ATGATTTGGAGGGCGAATGCCCATTTTTGAGTGATGAAGGTCCATGTCCGTATGGTTTGG CTTGCAGATTTTCTGGTACGCATAAGAATGGTGTTGTTGGTGGGACGTTAAAAGTACAGA AGAAAAGCTGTGAGGTCAATGGGTTGAACAAAGATGTGCAGAAGCTTTTGTGGAAGAATA AAATGAAGTTTCCCAAGGCTGATGCTAAACTAAAGTCACTCGGGCTTTTGGTATGATAAT TTTTTTGTCTTTTGTGCCTTTTATGTACTGGTTTTTCTGTGTGTTAATCTGGTTCTATTG ATATTAAATCAAAGTGAGCATTGTGTTACATGTGTTGTTTATTTCTGTAATGATGAACAT CTTTATTTTATAATATCATGTGGCATTATTATTGAAGTTGGTATGATGATGCAGAATCTT GCTAAGTCAAAATTGAAAGTGGCGGAAGATAAGGAGGAAGGCAATGGAGTTGATTCAAAT AATTCTAATGCTGCTGATAAAAATGGTTGCTCAAAAGGTGATGGTGCTTCAATTGATCAA TCTGAGTGCTGTCCAAGTTTTCTGGAAGAGGATAATGTAGGTGAGACTTGTGCATCTGTT GAGCTCCGACCACTGAAGAAAGCAAAATCGGAACTTGTTGAAAATTGTTGCTTGGGTGAA GTGGATAATGGTTGGTTTTGTCCATATCAGTCTGGATTGTTAGTTCTTATGTTGTTTTGC ATCAATGATCTTTCTCACTTATCACTTATTTTACTGCAACAGGTGTGAGTGTCTTGGAGG AAGATTCTGGGAAAAGCTCTACAAGAACTGAGCTCGAGGCTGCTGTTGATGATAATGTTA TAGAAACTGATAAAAGCTTAAAAGTACATCCTCGTGAGAAGAAGCTTATTGATTTTAGTG AAAAGCTGTATCTAGCCCCATTAACCACCGTTGGAAATCTTCCTTTCCGAAGGGTTTGTA AAGTACTGGGAGCTGATGTAACATGTGGTGAAATGGCAATGTGTACAAATCTTTTGCAGG TATGTATATTGCTTTTTCCATTGGTATTTGCCTAACTTATGAGAGTTATCATTTCTGTTG ATGGTGATCCATTTTGTAATGTAATTATAAAGAAACAATTTTTCTTGTCATTTGATTTTT CTGCCCTTTTATTTTACAAAACACCATTTAAGTGTTTTGCATTTCAAATGGTGACTTTGA TTTCCTGTTTTTGGACTTTAAAGTATGTAATCATTTAGCTTTCACTAAATGGCAGAATTA TTTATTTTAGTGCCTATTTGGAATAATTAAGGCATAGCATACACTCTACAGGTTATCTAA GTATTCCTTTATATTGATACCATAGGATTACCGTATCTGGGATTAGTAATGTTTGCCACA TCATTGCTAGTGGAACTAGCATCCTATGATCTTTCTAGTTTTCTTCTTTTGTTCTTTCTT CTTCAGTAAGTGCTTGCACTGATCTGTAGTCGTGTTTTTTAGTTACTTGGCTTTTTCCTT TTTATTATATGCTGGTTCTATTTTATTATAGGCTGCATATGTGAAGTTTCATGTGACACT TTCTGACTGCATTTTGTTTTGAAAATAGGGTCAAGCTTCAGAATGGGCTTTACTGAGGCG ACATTCATCAGAAGATTTGTTTGGCGTACAGATATGTGGAGCATATCCAGACACTGTGGC ATGCACTGTTGAACTTATTGATCAGGAATGTACTGTGGACTTCATTGATATCAATATGGG ATGCCCAATTGATATTGTTGTTAACAAAGGTGCTGGGTCATCTCTTCTTACAAAGCCAAT GAGGATGAAAAGCGTGATTGAAGCAGCTTCTGGCACTGTGGACAAACCCATTACTATTAA GGTGCTCGGTAAATTTTGTATTTGTTTTTTGATTCAAACAACGTTGTCTGCATTAATTCC AGTCTAGCACATTTGCAGAAAAGTTTTGATACTCATTTTGTTGTTCTGAATTATCGGAAT CTTGCAGTAGTCAACTAATTATTCTGCTTTTGGGGAAAATCATGTCCTTAATTTTCCCTT TTTGCTTGTGATTCCAAATATATAGTTTAACCTTTTATGTCAAGCTTGTTATAGATGCAT AATGTTATATTCTTGTATTGCGCCAGGTGCGGACTGGTTATTTTGAAGGGAAAAACCGAA TTGATTCATTAATTGCTGACATAGGAAACTGGGGAGCCACTGCAGTGACAATTCATGGTC GATCACGTCAGCAACGTTATAGCAAGCTTGCAGATTGGGATTACATATATCAGTGTGCCA GAAAGGCTCCCAATGATCTGCAAGTTCTGGGTAATGGTGATATTTATTCATATTTAGACT GGAACAAACACAAGTCTGACTCCCCTGAGCTCACTTCCTGTATGATTGCTCGTGGAGGTC TAATTAAGGTGCATATATAATTCGCGCATGAACTTTTTGTTTAAGATATGAGATAAAAAT TCTTTGTAAACTTTTGAGGTCACAAATCTATTTCTTTGCATGCATGTTTCCTTGAAGTAG AGGTTTATAGTCTGATTAATATCTATCATATTTACAGCCTTGGATATTTACTGAAATAAA GGAACAGAGACACTGGGACATTAGTTCTGCAGAACGTTTTAACATTTTGAAGGATTTTGT ACATTTTGGCCTTCAACATTGGGGATCTGATAAGAAAGGTATGCAGTATTTTCTTACAAT CGAAGACATATCCAACTTCTACATGTTATCTTGTAGGAGGAACTGCTACTGTTCTATATG AATGCTATTACAATTGATTTTTAGTACGATGCCTAATTGCAAGCAACGGCCTCATTTAGC TTCCTCTTTTTGTTTATAAAATGCATTTCCCTCCTTTTCGAAATTAGTTTGAACTGTATT TCAGTAATTCGTGTTTGTGCTGGTTATAATAGTTGTGCAAATTGGAACTGTTTGAGATGT TCAGGAAGTTTATACCTGTTGACGAGTAGATTTGTTTTGGTTGTTTTTGGGCAGGGGTCG AGACAACTAGGCATTTCTTGTTGGAATGGCTTAGCTACACTTACAGATATATACCAGTTG GGCTTTTAGATGTCATCCCACAGCAACTGAACTGGCGTCCACCCTCCTACTTTGGTCGTG ATGACCTTGAGACATTAATGGCCTCTGATTCTGCAGCTGATTGGGTATGCTATGCTGCTA AATTTCTAATATAGCTCACTAGCACCAACACTAAGGTGCCTACTCAATTTAGTTCTCTAT TAAACTTTTTCCATCTGTGCAGATTCGAATCTCTGAGATGTTACTTGGCAAGGTTCCCGA TGGCTTTACATTTGCACCAAAGCACAAATCCAATGCTTACGACCGCGCAGAAAATGGCTG AGTATTGTGTAGTACATTAATATGGGCGACTTTGGTAATGCTGGAACCAGGTGATGCCCT TTTTAACGCATGTTAACGCAAATTCCGGCTGCTGCTTGGTATCATGGAAAGCAAACGAGA GTTGTGACATTTCATTTTAAGGTTTCTATTATTATTCAAGGTATGCATGGTGGCTGCCGC CGTGAATTTTGTAGCTGTTCACTTACTTTCCGTACACGTACATTTTTCTTTGAAATGGAA AGTCAAATGAGAATTATGAATAAAAATTATTATTAATGTTTATTTGCTCTAAAATGAATC GGTAATGAGAATGAAATTATAGGTCTTACATAAATTTGAGGTTGTGG