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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001940Chr53192057631925785+Protein BASIC PENTACYSTEINE4

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
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LITCHI001940.m91315PF06217.15GAGA_bindDomain345.45.80E-103
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CTCTCTCTCTCTTTCTGCCTTTTGTTGTTTATCCTTAACACCTGCGAAGCAATAGCGTTT
CTCTACAAGACGATGTCGTTTTACCCGTAGACTCATCCGTAAGTTTCCCTTTTTGTTTCG
ATCTCTATCTCCATTCCTTTCTCGTCAAAATCATATTTTTAGGTTTTTGAATGCTAAACT
AAAACCCTAGCTTTTAGTGAAAAATTCGAACTCATTTCGTAGCAGATTCGTAATTCCACT
TGTTTGTGTTCAAAAGGGTAGTTAATTCATTGAATTTCATGCTTAGATTAGCTTGAACAT
GTTCAAACCTAGTTTTTCCTATGTTAGGTAAGTGGGTTTTGTAAAGTTTTGTTTTTTCTG
AGGTGGTTTTCTAATTAGGGAAAGTGTATATGCTTGTGCAAGCGTTAGTGTTGATTGTGT
GTTAGTGTGGTATTAATACCATCAAGTAGTCTGCTTTGAGCTTGTTACGGAGAAAATGTG
TGGATAGTGTGGTCTAATGTGGGTTTTCATGTGAGGTGGTTCGTGTTGATTGTAGAGAAG
TGGAGTTTGTTTGAGAAGAATTTTGGGGTTGTAAGTGGGGGGAGAGTTTTGTTTGGAAGT
TTGAAGTGACTTTAGGCACTTAGTGAAAGCATGGAGCTTTTTGTGTTTATGAATGGTTTT
TGTTTGTTGCCTGATGAGTTTGTTAGAGTCTTATCTCATTACTTAGACACTTAGACTATC
GCCTAACAGCTTTACTTTTTGGGTTTAATGGTTGTTAACATTATAACAAAGCTTAATTTT
TCTAGGGGGTCCTGCGTTTGAATCTTTTCACAAGCAATTTGTTGTATCTGTATTTATTCT
ATAATATGCATTTGCAAATGGGCTCGATCCATGTGTCATGTCAGTCGGTTTGGCACGTGA
GAGGATATGTTAGAGAGTATTACATTATTACTTGGCTCCATATGTCAAGCAAGTTGGTCT
GACACATGAGATGAGTTAGAGCATCTCCAATGGTCTCATGGATTATGTTTTGAAAGAAAA
GTGACATGTCATCAATGTTAAGGGATTTGCTTCCTACATAGCGTAGGTATTATGTGATAA
ACATTCAAATTGAAAAATTGTTTTCCAATGCTTTTATGTATTTCCATTTAATGCTTTCAT
TTTTTCTTTAACTTTTAATTAGATTTGAAAATTAGAATTAATTAATTATTAATTTGCTAA
CATGACTGTCTAACACACTCTCTACAAATAAATGGTCATGTTGACAATGTCTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTGTGTGTCATCTCAGTTTGATATTAATGAGTGATAATTGCATTGGAGAAGA
TTATTTTAACTCAATGTTTATTCATCCTATATGATATGTAATTTTTTTTAAATTCATGAG
AGCATTAGAGATGTTGTTACAAAGCTTTTATATCACTAGTGCGTCCATAGGTCAAGCTAG
TCGATCTTGCACCTCAAGGGGTGTGGTTGAGAGCCTTATGTTATTAGTTGGCTTTTAATT
GAAAGGTTAAAACTTTTGAGCTAATGATTACTAACAGGGATACTGGGATTCGTATAAAAA
TTTGCATGGTGTTACAAGTAAGGCAAGTTGAGTGTAGGATTTTGTGGCAATGAAATGGGT
AGTAATTTAATATTGTGCGTATTTTGTATGGTGTTTTGTTAAATTTATGTGATCCAAAGA
AAATTTTGAGTAGTTTTCTTATGAACTGTTACCTGAATGGCGGAATGTGTAACAGACAAA
TATATGTTTTATACAAGTCAAGTTTTTTCGCCTATATTCCTTTCATTTAAAATATGGATA
TTTAGGTTGAGTGAGTCAAATGATTTCTAGTGTACGATATCGGCATTGGAAAATGAGATT
AGTTAGTAGTGTAGTAACCTGCTATTTAATTGTTTTGTAGTTCATTTGTCATATATATTG
CAGTAAATATCTTTTCCCCTCTTTTTAATGCTGAATAGATTTTGTTCTTAGTGGAGAAAG
AAAATGTAGTTTCTTCTTTAGTAATTTATGACCTTATTTCTATTTAGCATCTGGGAAGAT
TTTTCCGTTTTTACAGGGCATAGTGCATCAACTTGCACTCTTGCTTAATTATTATCATAA
GTGACTATATATACAGTTCCATTACAATTGAAGTACTGACTCACTTTTTCCTTAATTGAA
GAAGTTTTTTAGCTCTGATGCCAACAAAATTAGTGGGTTGGCTGGAAATGCAACGAAATA
AGCCTGCTCAGAAAGGATCATTTGATTTTTTCTATTGTGACACTGACAACAGACAACAGG
ATAGAGATTGTGTATAGCCTCAATGCATTCCCTCTTTCATGGATACATGCTTTGCTGTCT
AGCCTAAATCAATACCGTCTTGCTGGTGCAACAGTGAAGTTTCTAAGAATCAAAGCTTGA
GATTGTTATTTTCTGTACCTCTGCGTGGAAGATCTAAGATGGATGATGGTGGGCAGAACG
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>LITCHI001940.m1
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>LITCHI001940.m2
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>LITCHI001940.m3
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>LITCHI001940.m4
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CGAGAACGGAATATAGCAATATCCGAAAAGAGGGAAGCGTTGGCTGCACGAGATCAGGCA
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GCCTTGGCAGCATTGCAGTACCGTGAAACTGGCATCAACTTCCCTATGGGTGGTGGAGTT
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TTTAATTCAGGGGATATGCACATAACTGATGCCCTCCCAATATCAATCATTGCTTCTGAA
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TCTGTATCACCACGAAAGGTGAAGAAAGTAAGTGAGGATTTGAATAAGAAAGTTGCTTCT
GAGGGGAAGAAGTTGAAGGCTGATTGGGATAGTCAGGACGGGGGATTAAACCTGGTTAAC
TTCGATGAATCAACGATGCCAGTGCCAGTTTGCTCATGCACAGGAAGTCCTCATCAATGC
TACAAATGGGGAAATGGAGGATGGCAGTCATCTTGTTGCACTACTACCCTGTCATCATAC
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CTTGATCTGAAGAACTACTGGGCCAGACATGGCACAAACCGTTACATTACCATCAAGTAG
TGCACAAATAATCTTTGATCCAGTATGTTTCCACTCTATGATCCTAAAATTCAACTGTTA
TGTTCTTTTATATTAGCAAATGTGGCTGAATTGCTTAAAAGCAAGATGGGGCTTATTGAT
AGAAAAGTTGATTCCCTTGCTTATTTGTTGACAGACCATTGTAATTTTTCTCAGAACATT
TCTCCCAGTAGAAGGGAAGTTTTGTAAACTTCTGTATTTTATTAATGTCTCAGATTCTGC
AACCTAGGCCGTATTTATCAAACAGTATCCTACACTAATTTGGATACTCTATTGATCTAA
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CAAGGTCAACAGGAATCTTGATTCATCCTCTATCATGCACTCTTCATTATCAGCAGCACA
GCCACCTACTTAGGCATTGCCGTGATCCTTAAATTGGTTGTGTATTCAGAATACCAACCT
GGATATCTTAACTTGTAATGTATTTAAATGTTATTCTAGAAACACTTATATTTGGTAACA
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TTGTCTATCATGATTTGATAGTAGAGAGTGTTTATTCAGTCCGTTAATATTATATATTCA
AGTGAACGTATGTTTCAAGAGAAAA
>LITCHI001940.m5
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CTCTCTCTCTCTTTCTGCCTTTTGTTGTTTATCCTTAACACCTGCGAAGCAATAGCGTTT
CTCTACAAGACGATGTCGTTTTACCCGTAGACTCATCCTTTTTTAGCTCTGATGCCAACA
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TTTTTCTATTGTGACACTGACAACAGACAACAGGATAGAGATTGTGTATAGCCTCAATGC
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TGCAACAGTGAAGTTTCTAAGAATCAAAGGTATAATATTTTGCTAGAAAATTCTGTATGT
GCCAATAGCTTATATTGGCTTAAACGTGCCACGTGACTTCTTTTTTGGATTTGAGAAATT
GCTTTCTTCTTATTGATTTACTTTTAGGGGAGGAAATGCACTCGGACTTAGCCCAATCTA
CATATCCTTTGTAAACTGCATTACTATTCGCCTCCCTTTCCCCACTCATTAAAATAAAAG
AGGTGTGAATCGATGGAGAAAGCATGTTCATTTTATGTGTCAAAACACCTTTTTGGATTC
TGGTTTGATCTTTGTTTGGCTTCCTTCTTCTTGGATTTGAACATCCATTTTATCAAATCT
ATTCTTCAATTGATTATGTCTGACATATGCTGTAAACGTTTCCTATTGCTGATAAAACAA
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CCATATTTCTAGAAGTCTGTATGAATTATAGCTTTTGGCCAGTTCATAGATGCCTTTAAT
TTTGCAAATCTTGTTGCATGACTGAAGAAGATCACTTCTCCAAGTAAAAGACGGTTTTTA
ATATTATAGTTGCCTGCTCCTTAGATTGGTTATCCTTGTAAGTTTTAAAGGTATGAAGTT
ATTTGTAATTTTTTCTTAAAAGAAGGAACTCTGCATTACCTTGTAAATGCAATATATATC
AATTTGATTTCTTAACTATGGATTTTTTTTAATGCATAATATTAAAATCATTTAAATAGA
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TTTGGCACCTATTTTGCTTTTTCACGACATTAATAAGTCCTTTACTCAACAGGTTGTTCT
TGCTTCATTTGAAATACTGCATTTGATTTTCTGTATTGGAAATGGAAGACAAGTGTATAT
GGATATGATGTTGATTTCCTAATTCTAAACTTCAAATATTGTGGAGCAGCTTGAGATTGT
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GGAGATATAAGATGGAATATTATAAAGGGGCTCATACGCCGTGGAATATGATGCCCCAGC
ATCAAATGAAGGAACCAAATAATGCCTTAGTGATGAATAAGAAGATTATGTCCATCCTTG
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TGGCTGCACGAGATCAGGCACTGGAGGAGCGAGATAAAGCCCTTGCTGAGCGTGATGATG
CCTTGATGGCGCGAGACAATGCCTTGGCAGCATTGCAGTACCGTGAAACTGGCATCAACT
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GGGGATTAAACCTGGTTAACTTCGATGAATCAACGATGCCAGTGCCAGTTTGCTCATGCA
CAGGAAGTCCTCATCAATGCTACAAATGGGGAAATGGAGGATGGCAGTCATCTTGTTGCA
CTACTACCCTGTCATCATACCCACTGCCACAGATGCCAAACAAGCGGCATGCTCGTGTGG
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>LITCHI001940.m6
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>LITCHI001940.m10
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>LITCHI018758.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TTATTTCATCCAGCAAATATGAATATTTATGCTCAGTTGTTTGTTTATTTTGTCTGAAAA
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CTCCACCTACCTCAACAGGTCAGATAATTAATATGAAGACCAAGTCAAGCCCTAGGTGGC
GGAGAGTGGTCTTCAAAATTAGTGGTGTCGCTCTTGCTAGCAGTGGCCATAAGAATATTG
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TTGACCTCTTTGTCAAATGAAACTTGATCTTATCACGGATGTCCTTGAGCCTAACTTGAT
TTTCGTTGACTGTTAGGTGGCAATGTTGATTGCGAGAGAAGTTGCAACTGCCTGCCGCCT
TGGTGTACAGGTATTTGTTGCGACAAGACTGTTCTTTACTGCCTAAATTTTTGAAGTTGA
TGCAACATAATGTTTGTCTTGATATTTCAGGTGGCGATTGTTATTGGAGGTAGTAATTTC
TTTTGTGGAAATACATGGGTGACTGAAACAGGTTCAGATAGAAGTACTGCATACCAAATT
GGGTAATCTGTTTGATGTGAACAACATATTTTTTGCTTTCCTAAATTTTAAGGAATCTAT
CTTTTGAAGTACCTAAAGTCAACATGCAAGATGAAGCTTGAGTCATTTGTCTGTTTCTGA
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CCAATTCATCAGTAAAATAATGAAGTGTTCCTTTTAGGCGTTTACTTTCTATTTGTGAAA
GTAGTAATGTGATTAGAGTATTAGAATGATATTATTAAATAACACACTCGACTGTTATTG
TAGAAGTAACTTCTTGCTTGTGTACAAAATTCTGCGTTCTTATAGGTTTCCTTTTTCCGT
TTGATAAGTGAAGATAGAACAGAAAACTCCAAAGATGGAGGTGTAACCCTATTAAAGTAG
AATGTCTGCAAGAGTCTACTTAATTCTTTCTTATGTTTTTCTATTCATTCGAACAGAAAT
AAAAGATGTTCTCATCAAAAGATCTACAAGTATGGAAAGAAGCTGTCATTAGCATGAAAT
AGCATGAAACAGATATACAGAAAAATTTTAAGACTACCAACTTCTTATTTCTTCTACTTT
TTAACAATTTCAAATAAGTTTCTTTCAGATTTCATATCTTATTGATCATTACATGATGCA
TAACAGTCAAACAAGTTTTGGATGATTATTTGTTAGATGATAAGAGTTAAGGTTGAAATT
TTGTTTTAACTTCATAAAGAAGAACGCTGTCTTCATATTCATTGAGATGAAACAATAGTT
GTAATTTCTTCCAATGCTGTTTGTTGATTATGATATAGCTGATTAATGTATTGTGATTTT
GATGTATATTTTTGGTTATGATCTAAATAAGCTGTGTCTTTGCGTTTTGTGCCAGTATGA
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CAAAGGTACCAATGTTGATGGTGCCTATGACTGCCACTCCCGCGACAACAACACTACTTT
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CTCGGCCAATAGTTCCTGAGGCATTATCAGATTCTATAAGCTCTGACCATCTCTATTACC
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GACTTGCATGATGTTATAATTTAATTATTGATAGTTGATTGCTTTAGTGATAGTGTGCTC
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TGAGGTACTGGAATTTGATATAGAATAACATTTACAGAGTTTATTTACTCAGAAAAAAAA
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CCATCAACAAAGACGGAGCTCCAGTTTTGAGTTTCATCCGTCTCCAATAGCTAAGAGAGC
CCTATCCATCTCCAATAGAGAAGATAACACCAATATCTCTTCCTGCACATTTCATGATTA
TGTTGATCACTCAAAAGGTGATTTAGGAAAGGCAGTGCATGAAGTAAAGCAAAGTTTGCA
ATACAGAATTCATGAAACAAGTAATTTCCAAATTGTCTCTCAAATCCATGGATAGCACGA
TTTGGCCCTCCAATTCCTAATCGCAGCCATCTATTTCAACTTCTTTGAATCGAATTCTAG
CTTGAAACCGACTGCATTATTTGAGTATCAAACATCAACAGCTCCCTTTTAATAGAGATG
GAGATGGATGGTGAGCCGCTCCGTATCCATCCACAGAGTTGGAGATGAAGCTAGAGCAAC
GCTTTATCTCTGTGATGAAGGGAGCTCATGCGGGTGGATGGTGGGTTGACGATGATGGTG
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