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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001911Chr53162754131629500+GATA transcription factor 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001911.m1250283PF00320.30GATADomain601.30E-16
LITCHI001911.m2250283PF00320.30GATADomain601.30E-16
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>LITCHI001911.m1
ATGGAGGCCAGCATGGAAGCAACTGCAGGACCGTTCAAATCAAGTTTGAGGAGAGAACTT
GCCACTCAAGAAGTGTTTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTT
CCATGCGAGGACTTCTCGGTTGATGATCTTCTCGACTTTTCTAATGGAGATTTTGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGCGAGAAGGATTCTTTATCTGATTCTTATTCT
TCACATGACTCTAGTATTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGAT
GCTTCTTATCATGAGTCTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTTGATGAAATT
GCAGAGCTTGAATGGGTGTCACAGGTCATGGACGATTCTTCACGTTCAGAGTCCTCTCTT
TTGTACCCTAATTATGCAGGAAACCGTTCTGAACTGGACCTGAAACCTGTAACGGTTGAA
CCGCCTTGTTTTCCTTTCTCAATTCCGTCCAAGAGAAGAACCAAACGTACCAGACGCACC
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GAGGTCGGATTGACCCATATGGTTCAAAGTTTTTGA
>LITCHI001911.m2
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GCCACTCAAGAAGTGTTTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTT
CCATGCGAGGACTTCTCGGTTGATGATCTTCTCGACTTTTCTAATGGAGATTTTGAAGAA
GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGCGAGAAGGATTCTTTATCTGATTCTTATTCT
TCACATGACTCTAGTATTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGAT
GCTTCTTATCATGAGTCTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTTGATGAAATT
GCAGAGCTTGAATGGGTGTCACAGGTCATGGACGATTCTTCACGTTCAGAGTCCTCTCTT
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CCGCCTTGTTTTCCTTTCTCAATTCCGTCCAAGAGAAGAACCAAACGTACCAGACGCACC
ACTGGTCGGGTCTGGTCGCTCGGTTTTCCGGTTCTTAATGACTCACCGGCGTCGTCCTCT
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GAGTGGTTGACCGGTGTTGAAGAACCGGCGGCGAAGAAACTTAAGAAGAAGTCTCCGGTT
CAACCCGGAGGCATGTTTCAGAGAAGGTGTAGTCACTGTCAAACTCAAAAGACTCCCCAG
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>LITCHI001911.m1
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>LITCHI001911.m2
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GTCTAATAGTGGTTTCAAAAACACAAAATATTTTGTGCACAGAAATGGAGGCCAGCATGG
AAGCAACTGCAGGACCGTTCAAATCAAGTTTGAGGAGAGAACTTGCCACTCAAGAAGTGT
TTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTTCCATGCGAGGACTTCT
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TTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGATGCTTCTTATCATGAGT
CTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTTGATGAAATTGCAGAGCTTGAATGGG
TGTCACAGGTCATGGACGATTCTTCACGTTCAGAGTCCTCTCTTTTGTACCCTAATTATG
CAGGAAACCGTTCTGAACTGGACCTGAAACCTGTAACGGTTGAACCGCCTTGTTTTCCTT
TCTCAATTCCGTCCAAGAGAAGAACCAAACGTACCAGACGCACCACTGGTCGGGTCTGGT
CGCTCGGTTTTCCGGTTCTTAATGACTCACCGGCGTCGTCCTCTGCTTCGTCCGGGTTGA
GTTCGACACCTTGTCTTGTCTTCCCTAACCCGGTTCAGATTAATGAGTGGTTGACCGGTG
TTGAAGAACCGGCGGCGAAGAAACTTAAGAAGAAGTCTCCGGTTCAACCCGGAGGCATGT
TTCAGAGAAGGTGTAGTCACTGTCAAACTCAAAAGACTCCCCAGTGGAGAACCGGTCCGC
AAGGTCCGAAAACGCTTTGTAATGCATGTGGGGTTCGGTATAAGTCCGGCCGGCTTTTTC
CGGAATATAGACCGGCTTGTAGCCCGACGTTTTCGAGGAACATGCACTCCAATAGTCACC
GGAAAGTGTTGGAGATGAGGAAGAAGAAGGAAATGGCCGGACCGGAGGTCGGATTGACCC
ATATGGTTCAAAGTTTTTGAAGGTTTTAGGGTAGAAGTAGGTGGATTGAAACCACCCAGG
GGGTTCAAACCGGTTGGACCGTTATAGGTTGGTTTTGATTGATAGGTGTGTAATTTTGAT
GATGATCAAGATATACTTAGTGGACATGTCACGGATTTGTAGGGAGGTTTTTCTTTTTCT
TTTTGTTCTTTAGTTATTTTTGTTGTACTTTTTAGAGTCAATTTTTCAATTTATTTGCAG
GACTAATGAGTAGAGATGAAATGTATAATTTAGATTAGCTTTAGTGTTTATTTTCTTATT
ATTAAGAGTCAGAATTCTATATATAAATTATGTTTCTCGACTTCTTAAACCTAGAAAATC
TGACCTTATCCCGCACATATTAATTAAATCCAAACGGGATTTAATTAGTTTTGGCTTTTC
TCTTAATACAAAATCTAACATACTACTTAATTCAAATGAGCAAATCTCTTTTAATAGTTG
TG
>LITCHI001911.m1
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ATTTTCTTCGAAATTGGCTGTAAGCCACCATCCATAAATAAAACACAAAGAGTGGAAAAA
GTAGATAATAATAAGACATCCCATTAACTCCGCACCAGTTTTCGTCCTCGAACCACCATT
CATTTCAGTGCTTCAATTCCAACAGAACTCTTCAAAATCTTAATCAGAAATGGAGGCCAG
CATGGAAGCAACTGCAGGACCGTTCAAATCAAGTTTGAGGAGAGAACTTGCCACTCAAGA
AGTGTTTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTTCCATGCGAGGA
CTTCTCGGTTGATGATCTTCTCGACTTTTCTAATGGAGATTTTGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGGCGAGAAGGATTCTTTATCTGATTCTTATTCTTCACATGACTC
TAGTATTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGATGCTTCTTATCA
TGAGTCTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTTGATGAAATTGCAGAGCTTGA
ATGGGTGTCACAGGTCATGGACGATTCTTCACGTTCAGAGTCCTCTCTTTTGTACCCTAA
TTATGCAGGAAACCGTTCTGAACTGGACCTGAAACCTGTAACGGTTGAACCGCCTTGTTT
TCCTTTCTCAATTCCGTCCAAGAGAAGAACCAAACGTACCAGACGCACCACTGGTCGGGT
CTGGTCGCTCGGTTTTCCGGTTCTTAATGACTCACCGGCGTCGTCCTCTGCTTCGTCCGG
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CATGTTTCAGAGAAGGTGTAGTCACTGTCAAACTCAAAAGACTCCCCAGTGGAGAACCGG
TCCGCAAGGTCCGAAAACGCTTTGTAATGCATGTGGGGTTCGGTATAAGTCCGGCCGGCT
TTTTCCGGAATATAGACCGGCTTGTAGCCCGACGTTTTCGAGGAACATGCACTCCAATAG
TCACCGGAAAGTGTTGGAGATGAGGAAGAAGAAGGAAATGGCCGGACCGGAGGTCGGATT
GACCCATATGGTTCAAAGTTTTTGAAGGTTTTAGGGTAGAAGTAGGTGGATTGAAACCAC
CCAGGGGGTTCAAACCGGTTGGACCGTTATAGGTTGGTTTTGATTGATAGGTGTGTAATT
TTGATGATGATCAAGATATACTTAGTGGACATGTCACGGATTTGTAGGGAGGTTTTTCTT
TTTCTTTTTGTTCTTTAGTTATTTTTGTTGTACTTTTTAGAGTCAATTTTTCAATTTATT
TGCAGGACTAATGAGTAGAGATGAAATGTATAATTTAGATTAGCTTTAGTGTTTATTTTC
TTATTATTAAGAGTCAGAATTCTATATATAAATTATGTTTCTCGACTTCTTAAACCTAGA
AAATCTGACCTTATCCCGCACATATTAATTAAATCCAAACGGGATTTAATTAGTTTTGGC
TTTTCTCTTAATACAAAATCTAACATACTACTTAATTCAAATGAGCAAATCTCTTTTAAT
AGTTGTG
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TTATTTATTTTTTATAGGGAAAAATGATTAAATTTAGAAAAAATTATTTACATTTTTATT
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GAAAATGAAATTAAAGTAAAATCATATTATTTTATGTTAAAAATTAGGTTTAATAATATT
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TGTTGGAAAATGGAAAAGGCTCAGAAAAGGACGGCGGTTTCGTGAGTAGTTCGCTTTTGA
ATAATCTTAGCGCCACGTTGGGCTGCTTTTGTCACAAAACTGTTTCGCAACCGCCGGACT
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GACTCTGGGAATCAGAAATCAGAGACAGGCTTGCAAATTGAAAATTGTAAGGTGCTGATT
TTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTGTGTGGTTTGATTGGAATTGACCAAACCATT
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GGTCCAAACAAGGCCAAACCATCAAGACCTCAAAATAGAATAGTCAGCTAATTTTAACCT
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ATAGGAGTGATGAAATTCCTGCAAAGTTCGTGTCTACAATATCGTGATGACGATCGAATT
TTATGCTGTTCATGAAATAGTCTAGCAAAAAGCTCATTTATTGTTACATCTTATTATTCC
TATCGATAAAAGAGCTCAAATTTCACCTTACATACAAAATAATATAAAGAGACTTTCATT
TATCATCAAATAATTATACAATAGCAAACATTCAAATGATTCGGCTTGTTGTTGAATTTA
TCTATGGTTATGCATCTCTTTACGTTAATGAATGATAAAATTCAAATCTCAACTTAATAA
CAAAAATAACTAACATTCTTTCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAAAATAACTAACATGTAGA
GACTTTTCATTTACTGTGAAGTAACTATCGAAAATAAGTATTCAATCCGTCCTTGTTATG
TTACTTGGTCATACTCTTAGTGCTAATAAAAAAAAAAAAAAAGACTTCCAATATTCTAAA
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TTCTAATAAGATATGAATAGTGCAAAAAAGATATTGATTTTCTTCGAAATTGGCTGTAAG
CCACCATCCATAAATAAAACACAAAGAGTGGAAAAAGTAGATAATAATAAGACATCCCAT
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GAACTCTTCAAAATCTTAATCAGGTAATAACCTTAACTAAACTCACAAAAATTTTTGTAT
GCATAGAACCTCTAAGTTTGTATGTATACATATTTGGTCTAATAGTGGTTTCAAAAACAC
AAAATATTTTGTGCACAGAA
>LITCHI001911.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TTATTTATTTTTTATAGGGAAAAATGATTAAATTTAGAAAAAATTATTTACATTTTTATT
TGGATTTCGAAAAGTACTTACGAGGTAATTTTATATAAGAGATATTATAAATATACTCGT
GAAAATGAAATTAAAGTAAAATCATATTATTTTATGTTAAAAATTAGGTTTAATAATATT
ATTTTTTATTTTAAGGATTCTTTGAGATTTTTTCCTTATATAGTATATAAATATTTATTT
ATTGAAAAATATCTCGTCTATTTATTACGTGGCGATCAATGGAGACCAGTAGTGATGCTA
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TCAAAGACACGTTGGAAAAGTCACCAAACAATTCCCACCATTGGATTCAAAACCATGTTG
TCAGATACTGGGATTCCAACCGTCAGATCTTCGACGCGAGAAATTTGGCGAGTGGGAACT
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GGCGGAATTAACGCGGCAAAGCAATCGAATTTTGGTAAATAAGGAGAAGTTCTGGGGCAG
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GACTCTGGGAATCAGAAATCAGAGACAGGCTTGCAAATTGAAAATTGTAAGGTGCTGATT
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GGTCCAAACAAGGCCAAACCATCAAGACCTCAAAATAGAATAGTCAGCTAATTTTAACCT
CTTTTTTTTCTTAAAAAGTTACTATCAATCTTAACCGAATAGTTGTACATCTTCTAATTC
ATAGGAGTGATGAAATTCCTGCAAAGTTCGTGTCTACAATATCGTGATGACGATCGAATT
TTATGCTGTTCATGAAATAGTCTAGCAAAAAGCTCATTTATTGTTACATCTTATTATTCC
TATCGATAAAAGAGCTCAAATTTCACCTTACATACAAAATAATATAAAGAGACTTTCATT
TATCATCAAATAATTATACAATAGCAAACATTCAAATGATTCGGCTTGTTGTTGAATTTA
TCTATGGTTATGCATCTCTTTACGTTAATGAATGATAAAATTCAAATCTCAACTTAATAA
CAAAAATAACTAACATTCTTTCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAAAATAACTAACATGTAGA
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TTACTTGGTCATACTCTTAGTGCTAATAAAAAAAAAAAAAAAGACTTCCAATATTCTAAA
ATATATTTTCAAAATTTTTTTGAAAAACGTTTGTTTTAATTTTTTTTAGTCAATTTAATT
TTCTAATAAGATATGAATAGTGCAAAAAAGATATTGATTTTCTTCGAAATTGGCTGTAAG
CCACCATCCATAAATAAAACACAAAGAGTGGAAAAAGTAGATAATAATAAGACATCCCAT
TAACTCCGCACCAGTTTTCGTCCTCGAACCACCATTCATTTCAGTGCTTCAATTCCAACA
GAACTCTTCAAAATCTTAATCAGGTAATAACCTTAACTAAACTCACAAAAATTTTTGTAT
GCATAGAACCTCTAAGTTTGTATGTATACATATTTGGTCTAATAGTGGTTTCAAAAACAC
AAAATATTTTGTGCACAGAA
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>LITCHI001911.m1 GenomeSequence + 
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TAATTTTTTTTAGTCAATTTAATTTTCTAATAAGATATGAATAGTGCAAAAAAGATATTG
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GTAGATAATAATAAGACATCCCATTAACTCCGCACCAGTTTTCGTCCTCGAACCACCATT
CATTTCAGTGCTTCAATTCCAACAGAACTCTTCAAAATCTTAATCAGGTAATAACCTTAA
CTAAACTCACAAAAATTTTTGTATGCATAGAACCTCTAAGTTTGTATGTATACATATTTG
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AAGCAACTGCAGGACCGTTCAAATCAAGTTTGAGGAGAGAACTTGCCACTCAAGAAGTGT
TTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTTCCATGCGAGGACTTCT
CGGTTGATGATCTTCTCGACTTTTCTAATGGAGATTTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGGCGAGAAGGATTCTTTATCTGATTCTTATTCTTCACATGACTCTAGTA
TTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGATGCTTCTTATCATGAGT
CTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTAACTTGAACATGCTGTTTTGCTTTTT
TTTGGTGTTTTGATGGTTGTTTTGGTTCATGATGATGAAAAGTGAGTACCCTTTTGTGGA
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TTCACGTTCAGAGTCCTCTCTTTTGTACCCTAATTATGCAGGAAACCGTTCTGAACTGGA
CCTGAAACCTGTAACGGTTGAACCGCCTTGTTTTCCTTTCTCAATTCCGTCCAAGAGAAG
AACCAAACGTACCAGACGCACCACTGGTCGGGTCTGGTCGCTCGGTTTTCCGGTTCTTAA
TGACTCACCGGCGTCGTCCTCTGCTTCGTCCGGGTTGAGTTCGACACCTTGTCTTGTCTT
CCCTAACCCGGTTCAGATTAATGAGTGGTTGACCGGTGTTGAAGAACCGGCGGCGAAGAA
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TCAAACTCAAAAGACTCCCCAGTGGAGAACCGGTCCGCAAGGTCCGAAAACGCTTTGTAA
TGCATGTGGGGTTCGGTATAAGTCCGGCCGGCTTTTTCCGGAATATAGACCGGCTTGTAG
CCCGACGTTTTCGAGGAACATGCACTCCAATAGTCACCGGAAAGTGTTGGAGATGAGGAA
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GTTTTAGGGTAGAAGTAGGTGGATTGAAACCACCCAGGGGGTTCAAACCGGTTGGACCGT
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GACATGTCACGGATTTGTAGGGAGGTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTCTTTAGTTATTTTTG
TTGTACTTTTTAGAGTCAATTTTTCAATTTATTTGCAGGACTAATGAGTAGAGATGAAAT
GTATAATTTAGATTAGCTTTAGTGTTTATTTTCTTATTATTAAGAGTCAGAATTCTATAT
ATAAATTATGTTTCTCGACTTCTTAAACCTAGAAAATCTGACCTTATCCCGCACATATTA
ATTAAATCCAAACGGGATTTAATTAGTTTTGGCTTTTCTCTTAATACAAAATCTAACATA
CTACTTAATTCAAATGAGCAAATCTCTTTTAATAGTTGTG
>LITCHI001911.m2 GenomeSequence + 
AAAAAAGACTTCCAATATTCTAAAATATATTTTCAAAATTTTTTTGAAAAACGTTTGTTT
TAATTTTTTTTAGTCAATTTAATTTTCTAATAAGATATGAATAGTGCAAAAAAGATATTG
ATTTTCTTCGAAATTGGCTGTAAGCCACCATCCATAAATAAAACACAAAGAGTGGAAAAA
GTAGATAATAATAAGACATCCCATTAACTCCGCACCAGTTTTCGTCCTCGAACCACCATT
CATTTCAGTGCTTCAATTCCAACAGAACTCTTCAAAATCTTAATCAGGTAATAACCTTAA
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GTCTAATAGTGGTTTCAAAAACACAAAATATTTTGTGCACAGAAATGGAGGCCAGCATGG
AAGCAACTGCAGGACCGTTCAAATCAAGTTTGAGGAGAGAACTTGCCACTCAAGAAGTGT
TTTTGGACGACCTGCTGTGTGCCACTGGGATTTCTGGTGTACTTCCATGCGAGGACTTCT
CGGTTGATGATCTTCTCGACTTTTCTAATGGAGATTTTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGAAGGCGAGAAGGATTCTTTATCTGATTCTTATTCTTCACATGACTCTAGTA
TTGATGTTGATGATAATAACTCCAACTCTAGCAGTACTTTTGATGCTTCTTATCATGAGT
CTTTTCTCACCAGTGAAATATTCGTCGAACCGGTAACTTGAACATGCTGTTTTGCTTTTT
TTTGGTGTTTTGATGGTTGTTTTGGTTCATGATGATGAAAAGTGAGTACCCTTTTGTGGA
TTCTTTACAGGTTGATGAAATTGCAGAGCTTGAATGGGTGTCACAGGTCATGGACGATTC
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GTTTTAGGGTAGAAGTAGGTGGATTGAAACCACCCAGGGGGTTCAAACCGGTTGGACCGT
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GTATAATTTAGATTAGCTTTAGTGTTTATTTTCTTATTATTAAGAGTCAGAATTCTATAT
ATAAATTATGTTTCTCGACTTCTTAAACCTAGAAAATCTGACCTTATCCCGCACATATTA
ATTAAATCCAAACGGGATTTAATTAGTTTTGGCTTTTCTCTTAATACAAAATCTAACATA
CTACTTAATTCAAATGAGCAAATCTCTTTTAATAGTTGTG