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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001893 | Chr5 | 31467962 | 31469760 | + | B-box zinc finger protein 21 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001893.m1 | 5 | 41 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 25.7 | 1.00E-05 |
LITCHI001893.m1 | 54 | 93 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 31.4 | 1.70E-07 |
LITCHI001893.m2 | 5 | 41 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 26.5 | 5.90E-06 |
LITCHI001893.m2 | 54 | 93 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 32.6 | 6.90E-08 |
LITCHI001893.m3 | 5 | 41 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 26 | 8.10E-06 |
LITCHI001893.m3 | 54 | 93 | PF00643.27 | zf-B_box | Domain | 31.7 | 1.40E-07 |
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>LITCHI001893.m1 ATGAAGATTTGGTGTGACGTTTGTGACAAAGAGAAGGCCACTGTTTTTTGTTCAGCAGAT GAAGCTGCTCTTTGTGATGGATGTGATCGTAGAGTCCACCATGCAAACAAGCTTGCAAGC AAGCACTTGCGGTTCTCTCTTGTCAACCCTACTTGTAAAGAGTCACCTTTGTGTGACATC TGTCGGGAGAGAAGAGCACTGTTGTTTTGTCAAGAAGATAGAGCGATTCTATGCAGAGAA TGTGACCTGTCAATACACAAAGCCAATGAACATACAAAAAAACACAACAGATTTCTTCTC ACAGGAGTCAAGCTCTCTGCTTCCTTTTCTCTGTATCAATCCTCTTCTACTGATGCAACA GCAACTGTCGACGATAAGACTAGAACCATCCCATCACATTCTTCTGTCAAGAAAACAACT TCAGCTGTCTCTAATGAAATCTTGATTTTCTCGCAGTATTCAATCCCATCAGCTACTTAT GAGTACAACCATCTTGTCAGTGACGATGGTTCGGTTTCAACCAGCAGCTTCTCTGAGTAT TTGATGGAGAGTATACCTGGTTGGAGTGTAGAGGATCTTCTTGATGCCAACACTTCACCG ACCAATGTTTTCTGTAAGACTTATGATCAATTTTTACCATTTCTGGATCAAGATCTTGAA AGCAACGTGAAGTCTTGTTCATCAGAAGATTTGGGCATCTGGGAAGTTCCATTGAGTTGC CCTCAAGATGGAATTGTAAATGGATTCCATGCCTTCACCGAAGCGAAAAGCTCGAAACTT GCCCGGAAAAGGAGTGAGGATGGCTTCGCAGTGCCTCAGGTCAGCCACCCTCCATGTCAC AAGAGGACCAAACACACATTTGGTGCAAGTTAA >LITCHI001893.m2 ATGAAGATTTGGTGTGACGTTTGTGACAAAGAGAAGGCCACTGTTTTTTGTTCAGCAGAT GAAGCTGCTCTTTGTGATGGATGTGATCGTAGAGTCCACCATGCAAACAAGCTTGCAAGC AAGCACTTGCGGTTCTCTCTTGTCAACCCTACTTGTAAAGAGTCACCTTTGTGTGACATC TGTCGGGAGAGAAGAGCACTGTTGTTTTGTCAAGAAGATAGAGCGATTCTATGCAGAGAA TGTGACCTGTCAATACACAAAGCCAATGAACATACAAAAAAACACAACAGATTTCTTCTC ACAGGAGTCAAGCTCTCTGCTTCCTTTTCTCTGTATCAATCCTCTTCTACTGATGCAACA GCAACTGTCGACGATAAGACTAGAACCATCCCATCACATTCTTCTGTCAAGAAAACAACT TCAGCTGTCTCTAATGAAATCTTGATTTTCTCGCAGTATTCAATCCCATCAGCTACTTAT GAGTACAACCATCTTGTCAGTGACGATGGTTCGGTTTCAACCAGCAGCTTCTCTGAGTAT TTGATGGAGAGTATACCTGGTTGGAGTGTAGAGGATCTTCTTGATGCCAACACTTCACCG ACCAATGTTTTCTACTTATGA >LITCHI001893.m3 ATGAAGATTTGGTGTGACGTTTGTGACAAAGAGAAGGCCACTGTTTTTTGTTCAGCAGAT GAAGCTGCTCTTTGTGATGGATGTGATCGTAGAGTCCACCATGCAAACAAGCTTGCAAGC AAGCACTTGCGGTTCTCTCTTGTCAACCCTACTTGTAAAGAGTCACCTTTGTGTGACATC TGTCGGGAGAGAAGAGCACTGTTGTTTTGTCAAGAAGATAGAGCGATTCTATGCAGAGAA TGTGACCTGTCAATACACAAAGCCAATGAACATACAAAAAAACACAACAGATTTCTTCTC ACAGGAGTCAAGCTCTCTGCTTCCTTTTCTCTGTATCAATCCTCTTCTACTGATGCAACA GCAACTGTCGACGATAAGACTAGAACCATCCCATCACATTCTTCTGTCAAGAAAACAACT TCAGCTGTCTCTAATGAAATCTTGATTTTCTCGCAGTATTCAATCCCATCAGCTACTTAT GAGTACAACCATCTTGTCAGTGACGATGGTTCGGTTTCAACCAGCAGCTTCTCTGAGTAT TTGATGGAGAGTATACCTGGTTGGAGTGTAGAGGATCTTCTTGATGCCAACACTTCACCG ACCAATGTTTTCTGTAAGGTTTGCAGTGAACACACATCCAAAAGTGAAAAAGAGAAGCAT TTTGATGGCGTCATTTTTTGTGGACTAATGAGGGTCCTGTTTGGACTAATGTTGGGATAT GCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGCAGACTTATGA
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>LITCHI001893.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGCCATTATTTTCTTTTGTAGGGTGAAGGATTGATATCGAATGTGTGTTATATGCACAAA CTTTTTGGCTTGATTTAAGTCAATGAGTAACCCATATTGCTTTGGGAATTGTATAATTGT TCTTGATCTTGCAAATAACTTTATTTGGAATCACATTTTTAAAGTACACTTTTTTTAATT AAGTACTTGTACTTCTCTCGCGAACTTTCCCATACTTTGGAGTTTTTGAGGTGCAAATCT TCAAATCGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCGAACGTTCAATTCTATATGCCGTGAC GCCCATACTCCTCTTAAATTATAGATAATAGCAAAAAAAAAAGCAAAATCTTGTCATTTT CAGTGTAAGCATTACGATGATAATAAAAAAATTATATCTCCAGCAATGTTATAGTGAATT ATACAAATTTCAGGTTCAATTTTCACATTAACATTCAAATTTCACATATTATAAACATCA TTTATAATATTGATCAGAGAGATTAATTGCTACACTTAGTTTTTCTTTTCTTTTGTACTT TTATTTATTTTTTGTTTCCATCTCGTATTTTTAAGTCAAATTGAAGGCAGCTAGCTAGTT GGAATAGGATAACTTAGGTGAACATAATATCTTATTTTAAAATCTTTTTCCGAGAATTCA GGCCAATTATATATAGATACTTGTAGCTGGTGTGGGGACTCATAATGGTTGAGTGGTGAC ATTATGTCACTGCTTCCTGCTACAAAGCTTTAATTGAAGAGCTTCGATGGCAGACCATCC ATATATGAAATAGATTGAGATAAAATTGGCCAAAAAAGGAAGGTGCCGGAAGTCAAATCA AGATAAGCCAGAATCCAAAGCAATGGAAAAACCACCGTGGAAGTTCAGCTGTATTCTACA 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>LITCHI019609.m1 GenomeSequence + ATCAATCCATAACATGAGGAATCTTCTGCCAAGGTTCCTATAATAAAACCCCCTGTGGTT TTATTTTCTCACATGTAAAGCCACTCCTCTCTTCACTGCTCATTTCCACAACTTGAGTCC AAACCCTTTATATTTATTTTTTTCTCATTATAATAATATTAAACAAAATCCTCAATGGAG TCTCCGTGTTCCTGGCCGGAAAACTCAACCTCCGATCGAGCCAAAGCCGTCGAGGAGCTC GTCCAAGGTCGTGACTGCGCTCTCCGGCTCCGCTGTCTCCTTAACAAACCATCATCATCA TCATCGGAGAACAACAACAATGATGTTGATGGGGGTGTCCAGAACCAGGATCTTGTGTTG AAGATACTCTCTTCATTCACCAACACACTCTCCATATTGACAAATGACGGTCGTGATCAT CATCGATATTATCAGTCCGATGAGGTCTCTCAGATTCAGACAAATGCTACACACTTCAGC TGGGAAGCAGCTCGCAAATCTGAAGATTCAGGAGAGAGTTGCAAGAGCACTTCAATTGTT AAAGATCGGAGAGGCTGCTATAAAAGAAGGTAATATTAATCATACAATTTTGCTACCTTA TTATTGATCTGGATAACATTACTCTAACTAATTTTTTTGATAATAATTTTTGGATTGATT GTAAAGATAGTTATTAAAATTTTTTTATAATCAATTATAAAGATAGTTATTAAAAATTTT TATAATCAATTTATGTATAATTATTGAGGACTCTCGTTTAATAACTTTATCTAAATTAGT AAAATAGCCAAACCTTAATCATACATATACTAATATTAATGATGATGATAATCTTATTAT AACAACCATCTTGTTGTTATGTGTTGTTATGTGATGTGGACTTGTTTTCTATGGATTTTT ATATAAGCAATTCGTTTTTTTATAAAAACGTTAACAAGTCTGAATCAGACAGTCTGTACC TGATAAAAAATCAATAAAAAAAATGTTATGGGTATGATAAACAGTTTTTTAAGGGTAATT TAGTAAGTTTGGAGGAAAACGGATGTTTTTTGATGTTTTACTATAGTAATTTCGTGTGTT TCCATTGGCTAGTAAGGATATTTAAACTATTTAGTTACAATTATGTCCCTTTATAAAAAT AGATCTAATTTATTATTTGTTCTTTGATGTATGCTTTAAGGACTGCTTTACTTTTGTTTA CTCGTTCAAGTTCTTACTGGAATTTGAGTTTTTCAGTGGAAATCTAAACATATATATGCA ATTTATGGATTGCAGAAAGTGTTCAGATTCATGGATCAACGACAGTCCTAACCTGGTAGA TGATGGCTATGCATGGAGAAAATATGGACAAAAAGTGATCCTCAATGCCAAGTACCCCAG GTAAATACAATACTACCAACTCACCAATGCATGAGAGCTAGCTCAAAAACATGTTACAAT TCATCTCTAATTTTTTCCTGTTTTCAAAAAATCGTTCAATTAATTGCTCTATATTTCATA TCTCAGATGGGAATTCTGTAAATTTTTTTTGTAAGGACAAGAAAGAATTTGATGTCGAAT TTCTTTGTATATATTTATGTTTCTTTTGAAAATGTAGACGGACTAGATCTCATTTGATCT GAATATGTTTTTCATGCCACCTAAGAGTTATGTTAAGAAGATGGAAAACCCTAATGGGTC CAGTTTTTGTTGTGTATAACGCAGGAACTACTTCAGGTGCACACACAAGCATGACCAGGG GTGTATGGCAACCAAGCAAGTGCAGAGAATTGAAGAAGATCCTCCGCTATACAGGACAAC ATATTCTGGTCGTCACACTTGCAAGAATTTGCTAAAAGCTTCTCAGCTTTTCATGGATTC CAGCAGGGATCACAACAACTCTCCAATGATCAGCTTCTGCGACAAAGAAACCGACATCAA CAACAGCAGCAACCCATTTCTCTCATCGTTCCCATTTATAAAACAGGAGTACAAGGATGA TCAGGAAATCATGCCAAATCATGATGATGATCACCATCATCATCATGATCTTATGACCCA CAACTACCAATCTGAATCGTCTGATCATTATCTACTCTCGCCTGATCATGATCACCAACT GACCACATATGACTCCGGGGTTGTTAACTCATCATCCTTGTCGTGTACGGACATGGGGGT GCTGGTTGTGGATTCTGTTGTCAACTTTGACGATGATGATGACTTATTGCATCAGGTTGA ATTCTAGATGGGCTGGATTTATAATTTTCTATTGTGTAGAAAGAATATGCTTTTCTGTTA GTTTCCTAGGAAACTGCTCTTGACTGTAGTATCTTTCCCTTACTGGTACTGTATGTTAAT TTGGATCAACGTTTCATTTTGTGTATATGCATTTACTGCTCACCATTCTCATCAATCTTA TCATATAAATCTATACCAAACTGATACGTCATGCTTTTTTGACCCTGGATTGAATGAAAT CTATAAAGTTATGTTCTGCT