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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001881Chr531364596;3136490231368698+Chromatin remodeling protein SHL

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001881.m122136PF01426.21BAHDomain83.21.40E-23
LITCHI001881.m1141189PF00628.32PHDDomain39.63.90E-10
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LITCHI001881.m2141189PF00628.32PHDDomain39.44.40E-10
LITCHI001881.m322136PF01426.21BAHDomain84.36.30E-24
LITCHI001881.m422136PF01426.21BAHDomain84.36.30E-24
LITCHI001881.m53106PF01426.21BAHDomain69.72.00E-19
LITCHI001881.m5111159PF00628.32PHDDomain403.00E-10
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>LITCHI001881.m1
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GTTTTAGGGAAACGAAAAAC
>LITCHI018520.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI018520.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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GTTTTAGGGAAACGAAAAAC
>LITCHI018520.m5 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI018520.m4 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI018520.m1 GenomeSequence - 
ACAGTACTCTCTCAAACATCACAACTTCCATGTACACATTACAATCATCATCATCATCAT
GTGGGCTCCACACTCGACTTGATTTTATCTCTTTATTGAAAAGATATCATCACAGCCATA
CACGTGACTCTGACCGTTTGCACTATCACTGATGGAAGCACAGAGACAGACAGACCAACT
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>LITCHI018520.m3 GenomeSequence - 
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ACCTGCATAACTCCACCTTCATCCAAACCACCTGCACATGAACTGTCAATGATTGAAATT
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TCATGTTCACATGCTCTGCTCAGGTTTTTTAATATGCTGCAATATCTCAAGGATTGAT
>LITCHI018520.m2 GenomeSequence - 
ACAGTACTCTCTCAAACATCACAACTTCCATGTACACATTACAATCATCATCATCATCAT
GTGGGCTCCACACTCGACTTGATTTTATCTCTTTATTGAAAAGATATCATCACAGCCATA
CACGTGACTCTGACCGTTTGCACTATCACTGATGGAAGCACAGAGACAGACAGACCAACT
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AAAGTGGTGAATCAAACATATTTTATCTAGCTACTTATATGATGGTATATATGAGTGAAT
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>LITCHI018520.m5 GenomeSequence - 
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GTGGTAGTGGATCAGAAAGAGATCAAACCAGAAGGCTGAGTTGAGAATGCTGTATACTCG
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ACCTGCATAACTCCACCTTCATCCAAACCACCTGCACATGAACTGTCAATGATTGAAATT
TAAAAGGAGTGGCATAAAATCATTCATGTCAGCCAACTAACTATAACTGGATTATACACT
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TCATGTTCACATGCTCTGCTCAGGTTTTTTAATATGCTGCAATATCTCAAGGATTGAT
>LITCHI018520.m4 GenomeSequence - 
ACAGTACTCTCTCAAACATCACAACTTCCATGTACACATTACAATCATCATCATCATCAT
GTGGGCTCCACACTCGACTTGATTTTATCTCTTTATTGAAAAGATATCATCACAGCCATA
CACGTGACTCTGACCGTTTGCACTATCACTGATGGAAGCACAGAGACAGACAGACCAACT
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TTTTTCTGTCTTTCTCTTGATAATATATACACATATATATTGTATTGTCAGGCGTAAGTG
ACTCTTGTATTGTATAGGTATTGAAAAAAAAGAGTTGTTTTAGGGAAACGAAAAACATGG
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ATATACCATTTATAAGTTATTTATTCGCTCAGTATGTGAGTTCTGTGTGTTAGTTTGAAT
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