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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001881Chr531364596;3136490231368698+Chromatin remodeling protein SHL

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001881.m122136PF01426.21BAHDomain83.21.40E-23
LITCHI001881.m1141189PF00628.32PHDDomain39.63.90E-10
LITCHI001881.m222136PF01426.21BAHDomain82.91.70E-23
LITCHI001881.m2141189PF00628.32PHDDomain39.44.40E-10
LITCHI001881.m322136PF01426.21BAHDomain84.36.30E-24
LITCHI001881.m422136PF01426.21BAHDomain84.36.30E-24
LITCHI001881.m53106PF01426.21BAHDomain69.72.00E-19
LITCHI001881.m5111159PF00628.32PHDDomain403.00E-10
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>LITCHI023299.m1
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GATCATGGTAATTGA
>LITCHI023299.m2
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GCTCATGAGCAAGGTGGTTCTTCTTGTTCATTAAACTTGGTCAGGTCTATGCCTGGAAAT
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CCTGAGAGGAAGGATATGTTAGGAAAGGGCCACATGCTAAGCAAGGCAAGAAAAGATGAT
GATGCCAAGAGCGAGATTCAATCTCTTGTCAAGCTCAACTTAAAGCTTTTAAGCAGAGAG
AAAAAATTAGAAATTGATAAATTCAAGGAAGTTGCGAGGCTTGCTACACATACCATCTTG
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GATCATGCCAACACCGCATCACGGAGCTCCTTGGCTCTGACCCTTTCCGGTCGAGTCTCA
TCCTCCAAAGCCTCAACCAACAATGGAGCCAACGTAACTGACTCTGGAATATTCTGA
>LITCHI023299.m3
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GTTGGATTGGGTGCCACTTTACCTGAAGGTGATTGGTTTTGCCATGATTGTACTATATTG
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CACTATGCTGACGTCATTGAAAACTCTGACGTGATGCCTGCAGCTAGCACATATGTTTCA
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AATAATACAGGTAAACCAACAGAATTGGGTGCGAGAACTTTAAATCATTGTCGAAATGTG
CAAAGACGTATACAAGCTCTACGTGAAAATTGGAATAAGTTGCAGAGGGGATCATTAAGC
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AAACACCCCTCCGTCTTAGAATATGCTTCAAAACAAGCTGCTGACACAAGTTCAAGTGTT
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AAACTCCAAGAGCAGAGTGAAAGTAAAGCAGTGAAATCTTCTGAGGGACTACCAACTCGT
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GATGCCAAGAGCGAGATTCAATCTCTTGTCAAGCTCAACTTAAAGCTTTTAAGCAGAGAG
AAAAAATTAGGTACCGTCATCATACATGAAGTATCTATATATACATTTATTTGCCATTGG
AAATTAAATTTCATTCTGGACTGTTTGTATCAAACTACTTTATGA
>LITCHI023299.m4
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GTTGGATTGGGTGCCACTTTACCTGAAGGTGATTGGTTTTGCCATGATTGTACTATATTG
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CACTATGCTGACGTCATTGAAAACTCTGACGTGATGCCTGCAGCTAGCACATATGTTTCA
ATTTTTGATATTGTACATGAAGAATTAAATAGCAGAAGATCTCATCAGGTAGCCTCTTCA
CTTTCAAATCGGCTGTCACCTCCTGTTGTCTCTGGAACAGGCTGTAGAAAAACAGATCAG
AATAATACAGGTAAACCAACAGAATTGGGTGCGAGAACTTTAAATCATTGTCGAAATGTG
CAAAGACGTATACAAGCTCTACGTGAAAATTGGAATAAGTTGCAGAGGGGATCATTAAGC
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AATCATGTTAATGGGGCAAGACCGGTGGCAGAACATGTATATGGAGCTTCATCAAGTGTT
GCTCATGAGCAAGGTGGTTCTTCTTGTTCATTAAACTTGGTCAGGTCTATGCCTGGAAAT
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GATGCCAAGAGCGAGATTCAATCTCTTGTCAAGCTCAACTTAAAGCTTTTAAGCAGAGAG
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GATCATGCCAACACCGCATCACGGAGCTCCTTGGCTCTGACCCTTTCCGGTCGAGTCTCA
TCCTCCAAAGCCTCAACCAACAATGGAGCCAACGTAACTGACTCTGGAATATTCTGA
>LITCHI023299.m5
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GTTGGATTGGGTGCCACTTTACCTGAAGGTGATTGGTTTTGCCATGATTGTACTATATTG
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CACTATGCTGACGTCATTGAAAACTCTGACGTGATGCCTGCAGCTAGCACATATGTTTCA
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TTCACTTCCAGTGCCATTGAATCACATGGTGGCAGTAGTAGAAGACACAACAACAGTAAA
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AAACACCCCTCCGTCTTAGAATATGCTTCAAAACAAGCTGCTGACACAAGTTCAAGTGTT
AATATAGTGAAAAAACTACAATCTGGTGATTGTGATCTCAGAAGCATTCAAATGGAGAAG
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AATCATGTTAATGGGGCAAGACCGGTGGCAGAACATGTATATGGAGCTTCATCAAGTGTT
GCTCATGAGCAAGGTGGTTCTTCTTGTTCATTAAACTTGGTCAGGTCTATGCCTGGAAAT
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GATGCCAAGAGCGAGATTCAATCTCTTGTCAAGCTCAACTTAAAGCTTTTAAGCAGAGAG
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GATCATGGTAATTGA
>LITCHI023299.m6
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GTTGGATTGGGTGCCACTTTACCTGAAGGTGATTGGTTTTGCCATGATTGTACTATATTG
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CTTTCAAATCGGCTGTCACCTCCTGTTGTCTCTGGAACAGGCTGTAGAAAAACAGATCAG
AATAATACAGGTAAACCAACAGAATTGGGTGCGAGAACTTTAAATCATTGTCGAAATGTG
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AATATAGTGAAAAAACTACAATCTGGTGATTGTGATCTCAGAAGCATTCAAATGGAGAAG
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GCTCATGAGCAAGGTGGTTCTTCTTGTTCATTAAACTTGGTCAGGTCTATGCCTGGAAAT
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AAAAAATTAGGTACCGTCATCATACATGAAGTATCTATATATACATTTATTTGCCATTGG
AAATTAAATTTCATTCTGGACTGTTTGTATCAAACTACTTTATGA
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>LITCHI026884.m1
MIVKRHLKLETQDPRQCKIGEVTCYEDDEDYEYTYAANPRKRRRKDGDVCRPNSMHVEVD
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YDDSVLIVGDTDSSIGDDEDDNDGSLLQLKEKKFNGMRYVRDKLRFGSSNYYSLGEKGLG
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YKPEDFALGDLVWAKCGRTYPAWPAIVIDPILQAPEAVLRCCVPGALCVMFFGYSKNGTQ
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CDHCAKLNKSRQYCGICKKIWHHSDGGNWVCCDGCNVWVHAECDKIFGKHFKDLEKSDYY
CPDCKANLRFESSAEQWHPNVKPTESNGQMVLPDKVIVVCNNVEGAYIPKLHLVVCKCGS
CGPKQQTLSEWERHTGCRAKKWKYSVKVKGTMLTLEKWIAEFNAHGIDPVKLDKQKLLAF
TKEKYEPVYAKWTTERCAICRWVEDWDYNKIIICNRCQIAVHQECYGANDVQDYTSWVCR
ACETPDVEKQCCLCPVKGGALKPTDVETLWVHVTCAWFRPEVTFMNHEVMEPASGILRIP
ANSFLKSCIICKQAHGSCTQCCKCATYFHAMCASRAGYGMEVQSFEKNGKQIIRKLMYCA
IHRTPAPDAAVVVLAPTGVFSGGSMLRNQRGCFRGSRLISAKRTESPESSTAETNEFDPL
SAARCRVFKRSKNKGSGGEPVFHRPMGPIHHSLDAINSLTANKELDDHKVFTSFKERLCH
LQRTEKQRICFGKSGIHGWGLFARRNIQEGEMVVEYLGENVTQKVADLREARYRKEGKDC
YLFKISEEVVIDATDKGNIARLINHSCMPNCYARIMSMDGRECRIVLIAKTNVRAGDELT
YDYLFENDEKDELKVPCLCKAPNCRLFMN.
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>LITCHI026884.m1
GCGCCTGTCACGTCGCAATTTTCAAGCGCCTCCCTCCTTCTCCAAATCTTTGGAGCCAAA
ACACGTCACCTTATATTTAATCCTTTTAATAATATTTTAAAATAAATATAAATATAATAA
CTAATCGTATCAAACTTAAATATTTCCAAAAATATATGAGGAGTGTGCGTCTGTTTAGAA
TTCGACCGCCGTTGCACAAACAGATCCCTGTCTTCTACAAAAACTCGAAATTCCCATCTG
TCAACTGCATTGATTTTCTTGAAATTTTTTTGTTGCTTATCGGGGAAAAGCGATTCTCAG
TATCTTTACTCTCAATTCGAAGATCGTAATTTACAAATTGCCTTATTTAGTTATTTTTTT
TAAGGAAAAAAATAACAGAAACTTGCGGCGTTCGTCAGTTTTCTGTGATTGTGGCTCCAA
TTAACTGGGGTTCTGATTGGGATTCACAATTGAATGGTACGTGGAATTTAAAGTAGAAAG
TGTAACCAGTTTTGTTTTTTTGATATCGTAAGCATATATACTCTGCTTGTTGGATGTGAA
AAATTAGGGTTTGGTTTAAAGGGCTAAAATAGAAGATGATAGTAAAACGACATCTGAAAC
TCGAAACACAGGATCCAAGGCAGTGCAAGATTGGAGAAGTGACGTGTTACGAAGACGACG
AAGACTACGAGTACACGTACGCGGCAAATCCGAGAAAGCGGAGAAGAAAAGATGGCGATG
TCTGTCGTCCAAATTCAATGCATGTTGAAGTCGACGAATTTAGCAGCGGTTCAGGTTCTT
GGATTAGCGAGGACGCCGCTTGTTGGGCCTTGGAATTGGAGTCCAACTCTAAGAGTTTTA
AATTCAACAGGAGAGACAAGAATCGGAGCTCAAACAAATTTCGGCGTCCTAGATTGAAAC
CTTTGAAAGGAAGAACTCAAATGCTTCCTTCGAAATACGATGACTCGGTTCTCATTGTAG
GTGACACGGATTCAAGCATTGGCGACGATGAGGATGACAATGACGGTTCACTTTTGCAAT
TGAAAGAGAAAAAATTTAATGGGATGCGTTATGTGAGGGATAAGTTAAGATTTGGAAGCT
CAAATTATTACTCATTAGGAGAAAAAGGGTTGGGTTACCTAGATTACAATGATTTTGATC
CTAGAGAGTATTTGGTTTCGCGTAGCAGTGTTATGCCAGCACATAGTAAACTGAATTCTT
TGCCATTGGTTGATAATAAACAGTATATGTCTGCTTTTAGTTCTAGGAGCGTAGAGAGAT
TGACAAAAGAGAAAGGTAAAAAGAGGAAGGATGTATATAAGCCGGAGGATTTTGCATTGG
GTGATTTGGTGTGGGCTAAGTGTGGGAGGACATATCCGGCTTGGCCAGCCATCGTTATTG
ATCCCATTTTGCAAGCCCCTGAAGCTGTTTTGAGATGTTGTGTTCCTGGTGCTCTTTGTG
TCATGTTTTTTGGCTACTCAAAGAATGGAACGCAAAGGGACTACGGGTGGGTGAAACAAG
GGATGATATTCCCCTTTGCTGAATTCATGGATAGATTTCAGGAGCCAACGCAGTTGTACA
AGAGCAAACTGAGTGGCTTTCAGGTGGCACTCGAAGAGGCGATTTTAGCAGAAAATGGTT
TTTTGGATGCAAGCCTAGGGATTGAACAAGTTGGTAATCCAGAAGCTCATTCCAGTATAG
TCCAAGTGGCCACCTGTTCGAGTCAGAATATGGAATTTTACTCTCAGAACCAGAGTGCAT
GTTATAAGGATGCAGGGGCTTGTGATGGTTGCGGTTTAATTCGACCTTGCAAAGTGAGGA
AATTGAATGATTCAATATCTGAAACCCAGTTTCTATGCGATCATTGTGCTAAGTTAAATA
AATCGAGACAGTATTGTGGCATATGCAAGAAAATTTGGCACCATTCTGATGGTGGGAATT
GGGTATGTTGTGATGGCTGTAATGTTTGGGTGCATGCTGAATGTGACAAAATTTTTGGAA
AACATTTTAAGGATCTGGAGAAAAGTGATTATTATTGTCCTGATTGCAAAGCAAATCTTA
GATTTGAATCATCAGCAGAGCAATGGCATCCAAATGTCAAGCCTACAGAAAGTAATGGAC
AAATGGTGCTGCCTGACAAAGTAATTGTAGTATGCAACAACGTGGAAGGAGCATATATTC
CAAAACTTCATTTAGTTGTGTGCAAGTGTGGTTCATGCGGGCCAAAGCAGCAAACACTTA
GTGAATGGGAACGCCACACTGGATGCAGAGCCAAAAAGTGGAAGTATAGTGTAAAAGTCA
AGGGAACAATGCTTACGCTGGAAAAATGGATTGCTGAGTTCAATGCACATGGTATAGATC
CAGTGAAGCTAGATAAGCAAAAGTTACTTGCTTTTACAAAAGAGAAATATGAGCCGGTTT
ATGCAAAATGGACAACAGAAAGATGTGCTATCTGTAGATGGGTTGAAGATTGGGACTACA
ACAAAATTATTATCTGCAACAGGTGCCAAATAGCTGTGCATCAAGAATGCTATGGGGCTA
ATGATGTCCAAGATTATACTTCATGGGTTTGTAGAGCGTGTGAAACACCTGATGTTGAGA
AGCAGTGTTGCCTCTGTCCTGTAAAAGGTGGTGCTTTGAAGCCAACTGATGTTGAGACGC
TTTGGGTTCATGTTACATGTGCTTGGTTCCGGCCTGAAGTCACTTTCATGAATCATGAGG
TCATGGAACCTGCATCCGGAATTCTTAGAATTCCCGCAAATTCGTTTCTGAAGAGTTGCA
TAATCTGTAAGCAAGCTCATGGTTCATGCACTCAATGTTGCAAGTGTGCCACGTATTTCC
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