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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001881 | Chr5 | 31364596;31364902 | 31368698 | + | Chromatin remodeling protein SHL |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001881.m1 | 22 | 136 | PF01426.21 | BAH | Domain | 83.2 | 1.40E-23 |
LITCHI001881.m1 | 141 | 189 | PF00628.32 | PHD | Domain | 39.6 | 3.90E-10 |
LITCHI001881.m2 | 22 | 136 | PF01426.21 | BAH | Domain | 82.9 | 1.70E-23 |
LITCHI001881.m2 | 141 | 189 | PF00628.32 | PHD | Domain | 39.4 | 4.40E-10 |
LITCHI001881.m3 | 22 | 136 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.3 | 6.30E-24 |
LITCHI001881.m4 | 22 | 136 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.3 | 6.30E-24 |
LITCHI001881.m5 | 3 | 106 | PF01426.21 | BAH | Domain | 69.7 | 2.00E-19 |
LITCHI001881.m5 | 111 | 159 | PF00628.32 | PHD | Domain | 40 | 3.00E-10 |
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>LITCHI001881.m1 ATGGCCAAAGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAAC AAAACCATCAAACCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCC TACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCAC GTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCG AAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAG TGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTC TTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTG TATTGCAAATGTGAAATGCCGTACAATCCGGATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGC AGCGATTGGTTTCATCCTACTTGTATAAACATGACTGCTGAGGAAGCTAAAAGACTAGAT AACTTCTTGTGTGAAACTTGTTCCACCGAAGGTCAAAAGAACTTGCAGAATTCTCATACA ACTGCTAGACACTCGGATACCAAGGTGGATACAAAGCGACGCCGGAGGTGA >LITCHI001881.m2 ATGGCCAAAGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAAC AAAACCATCAAACCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCC TACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCAC GTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCG AAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAG TGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTC TTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTG TATTGCAAATGTGAAATGCCGTACAATCCGGATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGC AGCGATTGGTTTCATCCTACTTGTATAAACATGACTGCTGAGGAAGCTAAAAGACTAGAT AACTTCTTGTGTGAAACTTGTTCCACCGAAGGTCAAAAGAACTTGCAGAATTCTCATACA ACTGCTAGACACTCGGATACCAAGGTATTCCCGATTCCTGAATTCTTGAATGAGCTTGTT GTCTTTATGTATACAACAGTAGGTCCTCAATTGTAA >LITCHI001881.m3 ATGGCCAAAGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAAC AAAACCATCAAACCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCC TACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCAC GTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCG AAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAG TGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTC TTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTG TATTGCAAATGTGAAATGCCGTACAATCCGGATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGC AGCGATTGGTAA >LITCHI001881.m4 ATGGCCAAAGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAAC AAAACCATCAAACCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCC TACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCAC GTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCG AAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAG TGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTC TTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTG TATTGCAAATGTGAAATGCCGTACAATCCGGATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGC AGCGATTGGTAA >LITCHI001881.m5 ATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCCTACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCA GACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCACGTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCG ATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCGAAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGAC ATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAGTGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACC AAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTCTTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACC GGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTGTATTGCAAATGTGAAATGCCGTACAATCCG GATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGCAGCGATTGGTTTCATCCTACTTGTATAAAC ATGACTGCTGAGGAAGCTAAAAGACTAGATAACTTCTTGTGTGAAACTTGTTCCACCGAA GGTCAAAAGAACTTGCAGAATTCTCATACAACTGCTAGACACTCGGATACCAAGGTGGAT ACAAAGCGACGCCGGAGGTGA
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>LITCHI001881.m4 TCCACCATTCCTCTAAAAAAAATATATTTTATGTATACATTTTTAAAAATCCTACTTTCC TTAACCGACATCCAAACACAGCCTTACATTATTTAATATTTTAAAAATTCATGTCTGTTT AATCTCCTTTACTATTTGCTTCTGGTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGCTTTTCAATGGCCAA AGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAACAAAACCAT CAAACCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCCCTCGAAACCGTCCTACGTGGC GAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAACGTCAAGGTGCACGTGCGCTG GTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCAGTTCCATGGTTCGAAGGAGGT CTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACACCATCGAATCCAAGTGTACCGT CCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGGCAACGACGACTTCTTCTGCCG CTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGATCGCGTCGCCGTGTATTGCAA ATGTGAAATGCCGTACAATCCGGATGATTTAATGGTTCAGTGTGAAGGATGCAGCGATTG GTAAGTTGGTTGCTTTTTAAGGTTGTTGTTTTTATTGAATCGTTTTGTTATGTTTGTTTC AGGTATGTATATGTATTTTAATATTTCATGTGTTTTTTGGGATGTTCAAAACAAGTTATC TTGTGAATGATTTGGAGGATTTGAAGGTTATGAATTGGTTTTTCTTGTTTTCTTTTAATG CTATGGCTTGTGTTTTTGTGATTATGTTTGTGCATGTAGTAACTGATGTTAGGGCGTAGA TAGATGGCAACTTGCTATTCCACAACTAGTGGAAACATGATTCAGTTTTCCATTCCCATG 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