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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001829Chr53079140330798753+Transcription factor bHLH63

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001829.m1253300PF00010.29HLHDomain26.74.30E-06
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>LITCHI001829.m1
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CAACGGGATCGTTTGAAGTGGCAGCAGCAGCAGCAGGTGGTTCAGGAGGAGGAGGAGGAG
GAGGAGGAGGAGGGTGGTGGTTATTTTAATGAGTTGACGGGTGTGTTTTCTGGGCCGAGT
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GGGAAGATTGCCTTGCCTGGTTTTGGATTTGGGCCTACTTTTGGAGCCAATTTTTCCATT
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>LITCHI001829.m1
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IHVRARRGQATDSHSLAERVRREKISERMKYLQDLVPGCNKITGKAGMLDEIINYVQSLQ
RQVEFLSMKLAAVNPRLDFNVDNFFAKEIFPVCPANFPTIGMSSEMTNPAYLQFNPVQQA
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>LITCHI020517.m2
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AATATAATATTCTAAGCCTTAGAAAACGGA
>LITCHI020517.m1
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GTAGAGCATGGACTATGGAGAAGAACAAGAACAGGAAGGAACATGAAGACAGTAATGAAG
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GACAGGACTGGGAGATTGACCCTTCTAAGCTTATCATCAAAGGAGCCATCGCTCGTGGCA
CTTTTGGCACTGTTCACAGAGGCGTCTATGATGGCCAAGATGTTGCTGTTAAACTTCTTG
ACTGTGGGGAAGAGGGCCACAGGTCTGAGGCTGAAATAGCTTCACTTAAAGCAGCTTTTG
CCCAAGAAGTTGCCGTTTGGCACAAGCTTGATCATCCTAATGTAACTAAGTTTATAGGGG
CGACAATGGGCTCACCAGAGCTACACATACTAACAGAAAATGGTCCAATTGACTTGCCAA
GCAGTGCTTGTTGTGTTGTTGTTGAGTATTGCCCTGGGGGTGCACTTAAATCTTATCTCA
TAAAGAACCGGAGAAGGAAGCTTGCTTTCAAAGTAGTTATTCAACTGGCACTAGATCTTG
CACGAGGGTAAAATTCTCATGCCTTATATTTACAATGTTTTCTATGTATTGTTTAGAGCT
ATCACATTTGACACTTCAACTTTCATGAGCATGCTGAAGTATGGTGTATGAAAGTAAAGT
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GCCTCAAATCCTCATGACATGACAGGAGAGACCGGAACCCTTGGTTATATGGCCCCAGAG
GTTCTCAATGGTAACCCATACAATAGAAAGTGTGATGTCTACAGTTTCGGTATCTGTTTG
TGGGAGATATACTGCTGTGACATGCCATATCCTGACCTCAGCTTCTCGGAAGTGACATCA
GCTGTTGTCCGCCAGAACTTGAGGCCGGAGATACCTCGCTGCTGCCCAAGCTCTCTTGCA
CTTGTAATGAAGCGATGCTGGGACGCCAACCCTGACAAACGACCTGAGATGGATGAAGTT
GTAACCATGTTGGAGGCCATCGACACATCCAAGGGTGGAGGCATGATCCCTGTTGATCAG
CCTCAGAGTTGTCTCTGTTTTTGCAGATATCGAGGACCCTAAAAAAAGGACTTGCCTTAT
GAGTTGAAGGAGCGATACATTTGAGTCGTGGAGAGCAAGTTCAGAAATCCAAGTTGTATT
TAAATCAATTGAAAGAATGGGATCAAAGAGCTGCAGAAATACAAAACTGTGGAAGCTATA
GGCTAGGAGGTCTGTGACATTTGTTTCTTTATTGAATAGCACTTTGTGAATCTTCTCGTT
CTTCGTTTTAAGAAAAGAGTTGCGGCATGGATTGGCTGGACACTTATTCTGTAAGGGAGC
TCTGATTACCAATTAATCAAATATAATCATGGAGTTCATCTATCCTACTTAGTGAATGCC
TTATCTGCCTATTGCAAACATTTTGTCATTAGCGTTTGTCAACTGAATGTAAATATTTAC
TGACATAGCTGATAACTATCACTGGTTGATCATTGATGGAAGTAGTGATTGCCTATTGAA
TATAATATTCTAAGCCTTAGAAAACGGA
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>LITCHI020517.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TAGCATTTAAGTTGATCACAAGAGATTTTTTGAACATTTCAATAAATACAGAAGAATTTT
TAGTATATCTATAAATTACATGAGATATTAGTTATTTCCAAATGGAGAAGAGATTTTGAT
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CTGCTGCTGTGCTGCTAGTACTCGTCATCAAATTAAAAGAAGAGGTTGAGAAGAGACGAA
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AACAACTAGTAATAGACATTTGCACCATTTTTAGAACTAGTAGGATAGATATATATATTT
GTATGTAATAATTATAGATTGATTGATTTGCTCAATCATCATCAACTCCAACACCAACCA
ACGTGTTTTCAGAGAAGAAA
>LITCHI020517.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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AAGAAATAGGGTGGTTGGTAATTCAAACTTAGGATTTTTTTTTTAATTAAAAAAAAAATT
CAAAGAAAGAAGGAAAAGTGAAAGGTACAAGTTGTAATTTGTGTAAGGGATAATCCCAAT
TGCCCCTAGTGTTTGATATAATCATTACTTTTCCCCCTATAATTTATAAAAATCATATTT
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ACTAAACTGCCCTTCAATAAAAAATAAAAATTAATTTTTTTATGAAATAAAATAAAAAAT
AAAAAAATGAAGATCCAATCTTCAATGTATCATGTCTTGTTCTTCTTCAATGAAGAACAT
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TTCAGAGTTTTGGTTTCTCTTTTCACATACACAATGCATATTTTTTAAAAAAAATCAACA
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AACACAACATCAAACATCTAAGAACAACAGACACCAATATCAACAAACACCACATCAATG
AACAATCTTCTTCTTCATTTTTCATCAACAAACATCACATCAATAACAACAAAACATCTA
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GATCATTGGGTTTCCTTCACCGGAGACCAAGTCTCTAGTGAAGGGGACCTAATGTTCTCC
ATACCGACGTCTGATTTCTGACGAAGAAAAAGATGGAAGATGGAAGATGGAAAGATGGAA
GAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAGAAGAAAAAAGCAAATGGATATGGTTGACTGAAGAAA
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AATTAATTTATTTTTCCAAAAATCTATTTTAATTTAATTAAAATAATAATTATTATTACT
ATAATTTTAATTTTGTTTTGACAATTTTGTCCTTCCTTATAATGGTCAAACATGAGTTTT
TAGCATTTAAGTTGATCACAAGAGATTTTTTGAACATTTCAATAAATACAGAAGAATTTT
TAGTATATCTATAAATTACATGAGATATTAGTTATTTCCAAATGGAGAAGAGATTTTGAT
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GTATGTAATAATTATAGATTGATTGATTTGCTCAATCATCATCAACTCCAACACCAACCA
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>LITCHI020517.m1 GenomeSequence - 
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AACAACAACTAGTAATAGACATTTGCACCATTTTTAGAACTAGTAGGATAGATATATATA
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GGATTTGCATTTTGGCCTACAATTGAAAGCTATAACTGAGTCAATTAGGAAAAAAAGGAA
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ATATTTGATTTTTAATTTCTTGTGGCGTGAGACGACAACAATTTCCATTGCTATGTCTAT
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ATTTTTCAGTGGCCAAACAGAGGAAAAATGTTTTTCTTCTTTTAGCAAATGATATCTTGT
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AACTTATGGTTGATTCACATTTATTATCACACTTTTTTCAGTGACAAAAAGCTAAACAAC
TAAAACCACCAAAAATTGATTTGTTACTTGTGTGTTCTGGCTGGTGATAAAGTTGCCAAA
TGGGGGCTCATAGCATCAACTCACAAAACCCCATCTCTCTTGTTTTGGACTGCTAAATGA
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TTTTATTTAATTGGATCATGCATTTGATTTATTAAATTTCTTTTATGATGTGCAGTTGCT
TTAACTATCAAATTATGAGGCTTGTTTTTCTCCCTAAAGAAACTTTTGTGTTTCGAAACT
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GCTCAGTTAAACTTCTTGACTGTGGGGAAGAGGGCCACAGGTCTGAGGCTGAAATAGCTT
CACTTAAAGCAGCTTTTGCCCAAGAAGTTGCCGTTTGGCACAAGCTTGATCATCCTAATG
TAACTAAGGTAACATTCTTGACCTTCCTTTTTATTTTTTGTTCACCGTCCCTTGTAATTA
CAATGGACTGGAAGCTTTGAAAAAAGCGCTATCTGATAATTGTCTGGAGAAAAAGAATTA
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GAGTTCAACATATATATCTTTTCTTCAGACTTCATTGAAATAAAGTGGATTGAGCAAGGG
CATCACTGCTCAAAATGCTGGGTTGGCTGTTGCACCAAATATTTTCTGAAGTGGGCTTCT
TATTGATACAAAGTTTTAGGCTTGAGAACCTTGTCTCCGATTGAAAAAAGAATTGCTTAA
TTTTCTTGTGCAGTTTATAGGGGCGACAATGGGCTCACCAGAGCTACACATACTAACAGA
AAATGGTCCAATTGACTTGCCAAGCAGTGCTTGTTGTGTTGTTGTTGAGTATTGCCCTGG
GGGTGCACTTAAATCTTATCTCATAAAGAACCGGAGAAGGAAGCTTGCTTTCAAAGTAGT
TATTCAACTGGCACTAGATCTTGCACGAGGGTAAAATTCTCATGCCTTATATTTACAATG
TTTTCTATGTATTGTTTAGAGCTATCACATTTGACACTTCAACTTTCATGAGCATGCTGA
AGTATGGTGTATGAAAGTAAAGTGTGTAATTTGGATGGCTGAAGTTCTTTTGAAGACAGT
TTATAAGCTTGCATTCTCCATGTCCTAGGTTGAGCTATCTTCACTCTCAGAAAATCGTAC
ACAGAGATGTTAAAACAGAAAACATGCTTCTGGACAAGACACGTACTGTGAAGATTGCTG
ACTTTGGAGTTGCTCGCCTTGAAGCCTCAAATCCTCATGACATGACAGGAGAGACCGGAA
CCCTTGGTTATATGGCCCCAGAGGTAGACAATTGAGTATCTTTAACCAAACTTTGCAATG
GAGTCTTTCCAAATTGTATCCTGATCAATTAGATAGAAGCTGGACTTTCATCATAAAAAT
TGAATCAGAAGAAGCACATATGATTTAACCTGTTAAAATTTTAAACTTTGCTTGTAACTA
TGTTTCTTCCTGGACTGTAATACATCTGATATGTAGTCAACTAGTCATATACCAAAGTGA
TAATGGTTTGCCTTTGCCAAGGGACAAGATCCTCTCTTATCAAAGCAAGTCATGTATTAG
TATTTCGGTTCCTATTGACTTCAAGCATTCTTCTTTTCTGACAAGGGAAAGGACCTACTT
ATGAGACACATGGCTCCTTGTGGCAATTCTATATTATGAGTTTCACAAATATTTCAGAGG
AATGAAAAAGGGAGGGGTAAAAAAAGAAATGAAGGAAGAAAATAGCTGCAATATTTTAGC
CTCTTTGAGGGGTTAGCAAGTTGATGTTCTGAAAATAAAATTTGGATTAGTTAGATTGAT
TTTGCTCACTCTTTAACTTTAAGCATCTAACATGCATTATCCTTGCCTTCTCTCTGGTTA
GGCAATTGTTAACTCTATACAGATTCTTCATCTACTACACTGTGTGTCTAATCTGTTATC
AACGGATTTTGGAATGTGACAGGTTCTCAATGGTAACCCATACAATAGAAAGTGTGATGT
CTACAGTTTCGGTATCTGTTTGTGGGAGATATACTGCTGTGACATGCCATATCCTGACCT
CAGCTTCTCGGAAGTGACATCAGCTGTTGTCCGCCAGGTAGATATAATATTATCTCAGAT
GCTTCTTGTTTGGTTACAGAAAAAGCTATAAATTAAAGTGCCAGAAATATGAATGCATGC
TTGAATTCAGGCAGTTTATAATGGCGCTCAAACTTTATAATTTTATATGAAATGAATGGA
ACAGTTATTTTTAAGATTGTAAGGTTAAAAGGGAAACATGACTGTAAGTGAAACTACAGA
ACTTGAGGCCGGAGATACCTCGCTGCTGCCCAAGCTCTCTTGCACTTGTAATGAAGCGAT
GCTGGGACGCCAACCCTGACAAACGACCTGAGATGGATGAAGTTGTAACCATGTTGGAGG
CCATCGACACATCCAAGGGTGGAGGCATGATCCCTGTTGATCAGCCTCAGAGTTGTCTCT
GTTTTTGCAGATATCGAGGACCCTAAAAAAAGGACTTGCCTTATGAGTTGAAGGAGCGAT
ACATTTGAGTCGTGGAGAGCAAGTTCAGAAATCCAAGTTGTATTTAAATCAATTGAAAGA
ATGGGATCAAAGAGCTGCAGAAATACAAAACTGTGGAAGCTATAGGCTAGGAGGTCTGTG
ACATTTGTTTCTTTATTGAATAGCACTTTGTGAATCTTCTCGTTCTTCGTTTTAAGAAAA
GAGTTGCGGCATGGATTGGCTGGACACTTATTCTGTAAGGGAGCTCTGATTACCAATTAA
TCAAATATAATCATGGAGTTCATCTATCCTACTTAGTGAATGCCTTATCTGCCTATTGCA
AACATTTTGTCATTAGCGTTTGTCAACTGAATGTAAATATTTACTGACATAGCTGATAAC
TATCACTGGTTGATCATTGATGGAAGTAGTGATTGCCTATTGAATATAATATTCTAAGCC
TTAGAAAACGGA
>LITCHI020517.m2 GenomeSequence - 
TTTTAGTATATCTATAAATTACATGAGATATTAGTTATTTCCAAATGGAGAAGAGATTTT
GATTATTTTATTAAATTATAGGGAAGGAAATGAGATTATCCCTTTAGATAGAGTACTACG
AACAACATACGAGGCAAAGCGAAGTGTTGGAAAGAGAGAAGAAGACAACAAAAAAAAAAA
GGAAGGTGCATTGACCGTGAATCCCATAAAATAACAAACAACTAGCACCAGACAAGAGGG
CTGCTGCTGCTGTGCTGCTAGTACTCGTCATCAAATTAAAAGAAGAGGTTGAGAAGAGAC
GAAGTGGGTAAGAAACACACGTCGTCTTCAGGCAAATCCATGTGCCCACATGCCTCTTTT
TTACTTACTCTTAGATAGCTAGCTACATACATCCATACATACATAACATTACCCCCTACA
TACAGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTACAGCTACTGCTACATG
AACAACAACTAGTAATAGACATTTGCACCATTTTTAGAACTAGTAGGATAGATATATATA
TTTGTATGTAATAATTATAGATTGATTGATTTGCTCAATCATCATCAACTCCAACACCAA
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ATGTGAGAGCAGATCAGATAGATCTGAAGAGATTGGATGAGCAGTTACAGAGGCATCTAA
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AGGGTCATCAACAGAGTCATCATAGACCACCCACCATCAACACAGGTCGAAGTGTGGCCA
GACAGGACTGGGAGATTGACCCTTCTAAGCTTATCATCAAAGGAGCCATCGCTCGTGGCA
CTTTTGGCACTGTTCACAGAGGCGTCTATGATGGCCAAGATGTTGCTGGTATTCTCTATT
CATTTTCTGGGTTGATGTCTGCGCATTATTATTATTATTTTACAAGAAAGTAGTCATTTT
GTTCAAGAAACAATGTTCATTTTGTTGGTTGCATTGGTTGTTTGCATGGCATGGCAGCAG
CATGTATTGGATTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCCCATTTTTAGCAAATATTTATAAAGT
GGATTTGCATTTTGGCCTACAATTGAAAGCTATAACTGAGTCAATTAGGAAAAAAAGGAA
AAAATAATACATGATGAGGTTGAATTTCTATGCTTTTTTGGTTGATTTTTGAATTAACAG
AAACTGGGCTTATTGGTAGCTGTTAAAGCTAAGTTTTTCTGCAGACTTAGACCTAATAGT
ACCAAAAACTGTTGCTCATTGGCAGTTTATATGTATTATTAGTAGTCGTTTCCTGTTTCA
GCTGTAAATTAGTGGATATAGATTTTTTTTAGGGGATCTGCTGCTTTACTTTTGCTTCAG
TTTCTGCCTCAAATTCATATTGAAGTATTCCAATTACTTGCTGATATTGAAAATTTTATG
ATATTTGATTTTTAATTTCTTGTGGCGTGAGACGACAACAATTTCCATTGCTATGTCTAT
TATCTGTTTGGATTTTCATTTTGAGAAGTTTACTTTTTTTTTTTATTCCATATGCTTCAG
ATTTTTCAGTGGCCAAACAGAGGAAAAATGTTTTTCTTCTTTTAGCAAATGATATCTTGT
GATAGATCCTTATAGATCTCTTCTTTTGAATCCGTGATTCACGAGATTGGTTGGGTTGGT
AGTTAGCCACGGTAACTTCAATATTGTTATATTCTTTTTCCTGAACTTTCATGTGTCCTC
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