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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001820 | Chr5 | 30675866 | 30677816 | + | Transcription factor RADIALIS |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001820.m1 | 13 | 58 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 27.2 | 3.50E-06 |
| LITCHI001820.m2 | 13 | 58 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 26.7 | 5.20E-06 |
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>LITCHI001820.m1 ATGGCATCAAGTTCAATGTCCTCCCGTGGCTCCAGTGGCCAGTGGACTGCCGAGCAGAAC AAGGCCTTCGAAAGGGCCCTGGCTGTGTTCGACAAGGACACCCCTGACCGCTGGCACAAT GTGGCCAGGGCTGTTGGTGGCAAAACTCCTGAGGAAGTCAAGAGGCACTATGAGGTCCTT GTTGAGGACATCAAGCATATTGAGTCAGGACAGGTGCCCTTCCCCAGGATGAAGAATTTG AAGCTCCATTGA >LITCHI001820.m2 ATGGCATCAAGTTCAATGTCCTCCCGTGGCTCCAGTGGCCAGTGGACTGCCGAGCAGAAC AAGGCCTTCGAAAGGGCCCTGGCTGTGTTCGACAAGGACACCCCTGACCGCTGGCACAAT GTGGCCAGGGCTGTTGGTGGCAAAACTCCTGAGGAAGTCAAGAGGCACTATGAGGTCCTT GTTGAGGACATCAAGCATATTGAGTCAGGACAGGTGCCCTTCCCCAGGTACAGGACCTCC GGAGGAAGTGGAAACATGGGTGACAGGATGAAGAATTTGAAGCTCCATTGA
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>LITCHI001820.m1 + Up_Stream_Len 2000 CCTAATCACTTAAGTTTTTAGGTATAATGGTTATCACCAGCTACAATTCATAATTTTAAA TATTATAGTTGGATCCTATTCAAATAACTTGAACTTTTAAATATAATGATTATTATAAGT TCCAATTCGTAATTTGTATCTTTTAGGATGTTACCATGGTAAACGTACAAAAACAAGACA AGTTAAAAACAACTGGGCCAGGAAAATATTCCATCACATTAACGTACACTAGTTGCCCAT GACTAACCAGATATCACCTCAGATATGATTGTAGATGTTTATCATTAATAGGTGAAAACT GAAATTGTGAAGATGATATGTAAGCCAGCCAAGCTCATGGTATCTGTTCAACCCAGATAA GTAAAACTTCAAAATTGCTTTTCCATTCGCGTAAGCAACAACCAAATACAGCAAATAAAA ACAATGATTTGTAACTATACTGGACTACAATCCAACAAGTGGGAGACCTCCATGGGGCCA ATCTTTTCGTTTTCGGATACCATCCTGAAATTTACAGCTAACAACAAAGATAAAAGATCA AACAAAGATATGTTTTGGTATGCATATATGGTGGTGGTACATTTTGTTAGTAAAGCTCAT TGAATGTCCTTCAAGCAAGTAGCATCCAATATTTTGTTTAGCATTATTGCTCTTACTTGT TTATCACATTTACTTTTGCCTCATTTGCATAATTAAGTGATCATTTTCCACCCTGACATG ATTATTAAAATCATCACTTGACACTTTTGTATACATAATATATATGCATCAACAATCATG TGGAACATGGTTTTTGTTCTCTGACGCTGATGCTTTTGTGATTTGATCAACTGACTATAA ACCAATCCATGTTTACTAAACGTGAACTGTCACCAATATAAATTAACTTGTTTACCAAAC TTTAATCAACGCAATTGACAGGACTCTCTTCAAACTATCATAATGTTGAATATGAAAGAA AATAGTACTCTATGAAATGTTAAGGTTTTGCCTAACAAAGACACCCTTCAACACAAAAAT CTGAGGAGTGGGGGTCCCAAATGCTAGAAGAGTAGGAGACACATGTTGACCAATTCCCTT GTAGTAACAAAACACACAACATTATCATTATACGGACTTCAATTAGCTGGCCGGATAAAA TGCTTTGAATTTTATTTAGGACAATAGTACATACAAATACAATATACGTGGATTGGGTGA AATCCTGAAGATGACACCAAGGTTTCTTTTGCTAGGGGACTCTTCCTGCACAAAGACCGA TAATGAGAGTATACGTGGATTGGGTGCACACCTGAAACTTTTTTTATATCTAGTACGGAC AGTGCACCAATATGTGTTGTTTGTAGGACATGGACCTACCGAAACTGCCCTGCAACAGGT AGAATAATATGAAAAACAGACAAATGCAATCTGCATAAAATCCTAACAGATAGAGATTCT GATTTTCACTTTGTTGCTTCATTGTCTGCTTCACATGCTCATCATCTTCAAAAATTTTAC CTCACACAACTCCATACACTAATCCACGTGAAGCTTTTTAGTGAAAAGTTTTTCTGGGTT TATCATAGTTATACTATTTCTAGAACTTGTTAAAGTCCAAATGGTTGTAAAACTTAAAAA GCTTTAACCTCAAATATGTATATATAAAGAAAGAAAAGGACTAAATTATATATTATTATT ATTTTTTCAAAGTTCTTGGGGAGAGACCGATTTTCCTAAATTGTTGCTCCTACTTTTTGT GGTTCCTAAGGAGACAAATCATTAAAATTCTACAAACTTTTTTGCAAGATTTCATTGCCA ACTGGCGCTACCCCACCACACCCTCTTCTATTCTGCTTATAAAGAGCAGCGATTGCCACC TCCTTTTGCACATATCACTTCCACCATCACCAACACCTTGACTACAAGTCTTTTCCTCTT TTGACTCTCTCTGCTTCCATAAAACCACCCTTCTTGCACTGAAAACTTCTTCAGTTACTT CTCCTCCAAGCTACACTCAA >LITCHI001820.m2 + Up_Stream_Len 2000 CCTAATCACTTAAGTTTTTAGGTATAATGGTTATCACCAGCTACAATTCATAATTTTAAA TATTATAGTTGGATCCTATTCAAATAACTTGAACTTTTAAATATAATGATTATTATAAGT TCCAATTCGTAATTTGTATCTTTTAGGATGTTACCATGGTAAACGTACAAAAACAAGACA AGTTAAAAACAACTGGGCCAGGAAAATATTCCATCACATTAACGTACACTAGTTGCCCAT GACTAACCAGATATCACCTCAGATATGATTGTAGATGTTTATCATTAATAGGTGAAAACT GAAATTGTGAAGATGATATGTAAGCCAGCCAAGCTCATGGTATCTGTTCAACCCAGATAA GTAAAACTTCAAAATTGCTTTTCCATTCGCGTAAGCAACAACCAAATACAGCAAATAAAA ACAATGATTTGTAACTATACTGGACTACAATCCAACAAGTGGGAGACCTCCATGGGGCCA ATCTTTTCGTTTTCGGATACCATCCTGAAATTTACAGCTAACAACAAAGATAAAAGATCA AACAAAGATATGTTTTGGTATGCATATATGGTGGTGGTACATTTTGTTAGTAAAGCTCAT TGAATGTCCTTCAAGCAAGTAGCATCCAATATTTTGTTTAGCATTATTGCTCTTACTTGT TTATCACATTTACTTTTGCCTCATTTGCATAATTAAGTGATCATTTTCCACCCTGACATG ATTATTAAAATCATCACTTGACACTTTTGTATACATAATATATATGCATCAACAATCATG TGGAACATGGTTTTTGTTCTCTGACGCTGATGCTTTTGTGATTTGATCAACTGACTATAA ACCAATCCATGTTTACTAAACGTGAACTGTCACCAATATAAATTAACTTGTTTACCAAAC TTTAATCAACGCAATTGACAGGACTCTCTTCAAACTATCATAATGTTGAATATGAAAGAA AATAGTACTCTATGAAATGTTAAGGTTTTGCCTAACAAAGACACCCTTCAACACAAAAAT CTGAGGAGTGGGGGTCCCAAATGCTAGAAGAGTAGGAGACACATGTTGACCAATTCCCTT GTAGTAACAAAACACACAACATTATCATTATACGGACTTCAATTAGCTGGCCGGATAAAA TGCTTTGAATTTTATTTAGGACAATAGTACATACAAATACAATATACGTGGATTGGGTGA AATCCTGAAGATGACACCAAGGTTTCTTTTGCTAGGGGACTCTTCCTGCACAAAGACCGA TAATGAGAGTATACGTGGATTGGGTGCACACCTGAAACTTTTTTTATATCTAGTACGGAC AGTGCACCAATATGTGTTGTTTGTAGGACATGGACCTACCGAAACTGCCCTGCAACAGGT AGAATAATATGAAAAACAGACAAATGCAATCTGCATAAAATCCTAACAGATAGAGATTCT GATTTTCACTTTGTTGCTTCATTGTCTGCTTCACATGCTCATCATCTTCAAAAATTTTAC CTCACACAACTCCATACACTAATCCACGTGAAGCTTTTTAGTGAAAAGTTTTTCTGGGTT TATCATAGTTATACTATTTCTAGAACTTGTTAAAGTCCAAATGGTTGTAAAACTTAAAAA GCTTTAACCTCAAATATGTATATATAAAGAAAGAAAAGGACTAAATTATATATTATTATT ATTTTTTCAAAGTTCTTGGGGAGAGACCGATTTTCCTAAATTGTTGCTCCTACTTTTTGT GGTTCCTAAGGAGACAAATCATTAAAATTCTACAAACTTTTTTGCAAGATTTCATTGCCA ACTGGCGCTACCCCACCACACCCTCTTCTATTCTGCTTATAAAGAGCAGCGATTGCCACC TCCTTTTGCACATATCACTTCCACCATCACCAACACCTTGACTACAAGTCTTTTCCTCTT TTGACTCTCTCTGCTTCCATAAAACCACCCTTCTTGCACTGAAAACTTCTTCAGTTACTT CTCCTCCAAGCTACACTCAA
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>LITCHI001820.m1 GenomeSequence + ATGCTCATCATCTTCAAAAATTTTACCTCACACAACTCCATACACTAATCCACGTGAAGC TTTTTAGTGAAAAGTTTTTCTGGGTTTATCATAGTTATACTATTTCTAGAACTTGTTAAA GTCCAAATGGTTGTAAAACTTAAAAAGCTTTAACCTCAAATATGTATATATAAAGAAAGA AAAGGACTAAATTATATATTATTATTATTTTTTCAAAGTTCTTGGGGAGAGACCGATTTT CCTAAATTGTTGCTCCTACTTTTTGTGGTTCCTAAGGAGACAAATCATTAAAATTCTACA AACTTTTTTGCAAGATTTCATTGCCAACTGGCGCTACCCCACCACACCCTCTTCTATTCT GCTTATAAAGAGCAGCGATTGCCACCTCCTTTTGCACATATCACTTCCACCATCACCAAC ACCTTGACTACAAGTCTTTTCCTCTTTTGACTCTCTCTGCTTCCATAAAACCACCCTTCT TGCACTGAAAACTTCTTCAGTTACTTCTCCTCCAAGCTACACTCAAATGGCATCAAGTTC AATGTCCTCCCGTGGCTCCAGTGGCCAGTGGACTGCCGAGCAGAACAAGGCCTTCGAAAG GGCCCTGGCTGTGTTCGACAAGGACACCCCTGACCGCTGGCACAATGTGGCCAGGGCTGT TGGTGGCAAAACTCCTGAGGAAGTCAAGAGGCACTATGAGGTCCTTGTTGAGGACATCAA GCATATTGAGTCAGGACAGGTGCCCTTCCCCAGGTACAGGACCTCCGGAGGAAGTGGAAA CATGGGTGACAGGTAGTTTTTAGTATTATTATCACTATCACCAACCTCAAAAAGATTATT ATATATCACAAAACTTTATATTTTCTTCAACAAAATTGTCACAAGTACTAGACCTCTTAC GTTTTGACTTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTCCACTATAAACTTTTCATGCCTCAATTA CAGGTAGCTCAAAAAAAATCTTGTAAAGTTTGTTTCTTTTACACATTCTCTCACCGATCC CCCTTTAGTTGGAAGTTTTGTTTGGTTAGTGTTGTTTTCTTTTGCTTAAATTGGTTATCA ATAAAGAATTCTGAAACCGACTTGAATTGATTCACGATCATATTCGATTTGATTTTTTTT TTTTAAAGTTATTTTTTAAATCATATTTATAACGATTGATCTCGTTAAATTGCACATCCC ACCCCTAACGAACATAGCCATAATTGCTAAAACCCAAATCCACGCACATGACATCAACAA ATCTACGTAACTCCAACCACATCCATGAACTCCTCCTGACGAATTACAAAAAAGCAAAAA AAAAAAATCCAAAATCATCGTACACGTCTAATTTTCAAAAATTTTGACCCCACAAGCACT TTTTCACGTGGCTTCAATCATTAATTGATATTCCACTAGCAGCTATACTATCCAATCAAA AAATATTTTCAAGTAAAACATCACCACAGAATTTTCATGCTGACAATAATTAAATTTGTA ACGTTTAAACTATAAACTTCCGTATCTGATCAACTCTATATTATTCCAAAAGTAACATAA ATTTACCCCTTCTTTTTTTTTTTTCAGGATGAAGAATTTGAAGCTCCATTGATTTTCAAC AACTAAAATCTGCAGTATCATAAAATAAAGATCCTCAACTTCGTGGACTGGTAGTTGTAG TACTAGACGTAATGCAAGAATCACATAGAGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTGTTT TTGCTGCAATTGTATGTTGAAGGAGAGACATTGAATCTTTGATTAATGGCTCTTCCTCAC TTGTTTTTAACTGTGTAAGAATCAAACTAGATTCATATAAAACTATGAAATATTATTAGC TAATTGTTTATTTTGTCTATTTTATGAATCGAATTGGAAATTGGAAAAAATGATGATGTG AACAAGGAGGAAATATATGAGAAAAGTGGCT >LITCHI001820.m2 GenomeSequence + ATGCTCATCATCTTCAAAAATTTTACCTCACACAACTCCATACACTAATCCACGTGAAGC TTTTTAGTGAAAAGTTTTTCTGGGTTTATCATAGTTATACTATTTCTAGAACTTGTTAAA GTCCAAATGGTTGTAAAACTTAAAAAGCTTTAACCTCAAATATGTATATATAAAGAAAGA AAAGGACTAAATTATATATTATTATTATTTTTTCAAAGTTCTTGGGGAGAGACCGATTTT CCTAAATTGTTGCTCCTACTTTTTGTGGTTCCTAAGGAGACAAATCATTAAAATTCTACA AACTTTTTTGCAAGATTTCATTGCCAACTGGCGCTACCCCACCACACCCTCTTCTATTCT GCTTATAAAGAGCAGCGATTGCCACCTCCTTTTGCACATATCACTTCCACCATCACCAAC ACCTTGACTACAAGTCTTTTCCTCTTTTGACTCTCTCTGCTTCCATAAAACCACCCTTCT TGCACTGAAAACTTCTTCAGTTACTTCTCCTCCAAGCTACACTCAAATGGCATCAAGTTC AATGTCCTCCCGTGGCTCCAGTGGCCAGTGGACTGCCGAGCAGAACAAGGCCTTCGAAAG GGCCCTGGCTGTGTTCGACAAGGACACCCCTGACCGCTGGCACAATGTGGCCAGGGCTGT TGGTGGCAAAACTCCTGAGGAAGTCAAGAGGCACTATGAGGTCCTTGTTGAGGACATCAA GCATATTGAGTCAGGACAGGTGCCCTTCCCCAGGTACAGGACCTCCGGAGGAAGTGGAAA CATGGGTGACAGGTAGTTTTTAGTATTATTATCACTATCACCAACCTCAAAAAGATTATT ATATATCACAAAACTTTATATTTTCTTCAACAAAATTGTCACAAGTACTAGACCTCTTAC GTTTTGACTTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTCCACTATAAACTTTTCATGCCTCAATTA CAGGTAGCTCAAAAAAAATCTTGTAAAGTTTGTTTCTTTTACACATTCTCTCACCGATCC CCCTTTAGTTGGAAGTTTTGTTTGGTTAGTGTTGTTTTCTTTTGCTTAAATTGGTTATCA ATAAAGAATTCTGAAACCGACTTGAATTGATTCACGATCATATTCGATTTGATTTTTTTT TTTTAAAGTTATTTTTTAAATCATATTTATAACGATTGATCTCGTTAAATTGCACATCCC ACCCCTAACGAACATAGCCATAATTGCTAAAACCCAAATCCACGCACATGACATCAACAA ATCTACGTAACTCCAACCACATCCATGAACTCCTCCTGACGAATTACAAAAAAGCAAAAA AAAAAAATCCAAAATCATCGTACACGTCTAATTTTCAAAAATTTTGACCCCACAAGCACT TTTTCACGTGGCTTCAATCATTAATTGATATTCCACTAGCAGCTATACTATCCAATCAAA AAATATTTTCAAGTAAAACATCACCACAGAATTTTCATGCTGACAATAATTAAATTTGTA ACGTTTAAACTATAAACTTCCGTATCTGATCAACTCTATATTATTCCAAAAGTAACATAA ATTTACCCCTTCTTTTTTTTTTTTCAGGATGAAGAATTTGAAGCTCCATTGATTTTCAAC AACTAAAATCTGCAGTATCATAAAATAAAGATCCTCAACTTCGTGGACTGGTAGTTGTAG TACTAGACGTAATGCAAGAATCACATAGAGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTGTTT TTGCTGCAATTGTATGTTGAAGGAGAGACATTGAATCTTTGATTAATGGCTCTTCCTCAC TTGTTTTTAACTGTGTAAGAATCAAACTAGATTCATATAAAACTATGAAATATTATTAGC TAATTGTTTATTTTGTCTATTTTATGAATCGAATTGGAAATTGGAAAAAATGATGATGTG AACAAGGAGGAAATATATGAGAAAAGTGGCT