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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001820Chr53067586630677816+Transcription factor RADIALIS

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001820.m11358PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain27.23.50E-06
LITCHI001820.m21358PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain26.75.20E-06
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>LITCHI001820.m1
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AAGGCCTTCGAAAGGGCCCTGGCTGTGTTCGACAAGGACACCCCTGACCGCTGGCACAAT
GTGGCCAGGGCTGTTGGTGGCAAAACTCCTGAGGAAGTCAAGAGGCACTATGAGGTCCTT
GTTGAGGACATCAAGCATATTGAGTCAGGACAGGTGCCCTTCCCCAGGATGAAGAATTTG
AAGCTCCATTGA
>LITCHI001820.m2
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>LITCHI001820.m1
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VEDIKHIESGQVPFPRMKNLKLH.
>LITCHI001820.m2
MASSSMSSRGSSGQWTAEQNKAFERALAVFDKDTPDRWHNVARAVGGKTPEEVKRHYEVL
VEDIKHIESGQVPFPRYRTSGGSGNMGDRMKNLKLH.
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>LITCHI001820.m2
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>LITCHI001820.m1
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>LITCHI020107.m9 -  Up_Stream_Len 2000
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GTGGTAATAGTGTTCTGACTTACTATTTCTGGCCTGAACTATCAACTTTCCCTCTATGTC
TACAACCTCTTTTTGCATTT
>LITCHI020107.m4 -  Up_Stream_Len 2000
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ATAATTGAGAAGAGGGCAATTTTTTATACGGTTTCGGCTTCCTTATTATCATATAATTGG
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TCTTTTGAATTTTCTTGTACATGGTTTGTGCTCCTTGCATTTTGTGTATTTGTTTTGCTT
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TATGAGCTACTTGCATTGTTATGTTTGGTTTGGTATCCCTTGCCTGACTTTTGATTACAA
ATCCCCAGAGTTCTGCAGAG
>LITCHI020107.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI020107.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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GGGGCAAATGCGGCTGATTTTCTCATCCGTTTGATCGTGAATTTTTTTTTAAAAAAATTA
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>LITCHI020107.m1 -  Up_Stream_Len 2000
TTCTTTTAAAAATTATATTATTTAATAAATTGTTTGGATCTCCATAATCTATATGGACGG
TGGATATCCATTTCAAATAAATTAAAATTTTAAAAATTAAATAATTTTAAAATTTAATAA
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AACAACAACGAAAATATCATATCGCGAGTCGAGAGGAAAATTGGAGGAGTTATATTATAT
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GGGGCAAATGCGGCTGATTTTCTCATCCGTTTGATCGTGAATTTTTTTTTAAAAAAATTA
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>LITCHI020107.m8 -  Up_Stream_Len 2000
TCTCTCTACACACAGCTGCTTGTTTGTCGGTGTGAGATCTTGCAGCTCCTGCACTACGGA
GGTGGTTGGGAGATCCGAGACGTCTGATTGATTGCGCTTCAACAACAACGAAAATATCAT
ATCGCGAGTCGAGAGGAAAATTGGAGGAGTTATATTATATAGTTGGTGATTTTTATGTTA
GTTGTAGTTAATGGTGATGTTGTTGTGGTGTTGTTGAGAGAGTGTATGAGGAGAGGAATT
CGCTGGAATTTACGACTTTTCATTCGAAGCAGAGGTAGATGGGGCAAATGCGGCTGATTT
TCTCATCCGTTTGATCGTGAATTTTTTTTTAAAAAAATTAAAATTGAAATTGTCAAAGTC
ATGCAGCCAGATCACCGCAAGAAGGTCGTTTTATTTGCTTTGATTTTATTTTCTTTTTAA
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AATGAGGAACTCCACAAGCTGAGTTTGGGAAGGTCTCTTGTATTTCGGGGCAGAGGATGT
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AATTTACATGCATATTTTGTTCTATGTATATTTGTTTCCTTTTCTCTTTCCTGCGGATCG
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CTGAATTATTTTCTTTTTGCCCCTTGCATGTGGGGTCTTGTTATTTTATTGGTGATAAAA
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TACAATAAGTGATGTACTTTTAGTTGTTGTAGATACAGTTCACAACCTTGAAAGGGGTTT
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TTTTTCTTTTCCACAAAACTGCTGTACCTTATGTAATTGCATAAAAATTTAGGAATTCTA
CTAGGGATCATGCGATGGTTTTGATAAACAATTTGTAGACTGTATTTGTAGCAAAATGAA
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TATGAGCTACTTGCATTGTTATGTTTGGTTTGGTATCCCTTGCCTGACTTTTGATTACAA
ATCCCCAGAGTTCTGCAGAG
>LITCHI020107.m7 -  Up_Stream_Len 2000
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GGTCTTGTTATTTTATTGGTGATAAAATTGTTAAGTAGCTTCTGCATAGATATTTGCTAA
ACAAAGTTGTGTTTGTCGATGAGAGACTACAATAAGTGATGTACTTTTAGTTGTTGTAGA
TACAGTTCACAACCTTGAAAGGGGTTTATTGATTTTAAAATTTAGAATAGAGGATTTAAT
CTTTACTTTTTTTTTTTTCTTATGTACTTTTTCTTTTCCACAAAACTGCTGTACCTTATG
TAATTGCATAAAAATTTAGGAATTCTACTAGGGATCATGCGATGGTTTTGATAAACAATT
TGTAGACTGTATTTGTAGCAAAATGAAATTAAGAGGGACCATATTAACAGTTTTAGGTAA
ACATATAGAGGAATGACTATGTAGCAGGATGGAAATTTGGAGATGGCATTCCTCTGTTGG
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GTGCGTTGAAGTATATTCACACAGGTAATTCACCCTGTTTGAGTTGTCTTGTCACCTTAT
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ATAATGAATGTGACATACATTGTAGTACCAAAGATACTGCTACAGTATTTTTGAACTGTG
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>LITCHI020107.m4 GenomeSequence - 
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>LITCHI020107.m3 GenomeSequence - 
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>LITCHI020107.m2 GenomeSequence - 
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GGGACACCTTCATTAGATACAATTTCTCGGGTAGGCACATTATTCTTTTGTCCAACACTT
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GCTGAAGAGGTATTCTTCTTGTTAAACTGTGAACTGTTTTGCAGACTATTGTGTTTGTTG
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TCTTTGCTGCTTTTTAGTTTTGATCTAAAGGAGATGCATTAATGACTTGTGTATGCTTTG
TTCTAACTGTTTGTTTATGTATCTACCACAGTGCTGTTGATCAATTCAGAAAGCAGTTTG
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TTTACCGTTTCATGTCCATCAGCACGTTAGTATTGCTGTGATCATAACTTGTGGACCCCA
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>LITCHI020107.m8 GenomeSequence - 
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GGGACACCTTCATTAGATACAATTTCTCGGGTAGGCACATTATTCTTTTGTCCAACACTT
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TTTACCGTTTCATGTCCATCAGCACGTTAGTATTGCTGTGATCATAACTTGTGGACCCCA
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TGTCAAAGTAAGCAAGTTTGTTTTATATTTTGTAATTGTTCACAAATCCTGGTGGCACAG
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CTACAACCTAAAAAAGGATTAAATGAGAAAAGAAGGTAAAAAGTGTACTGTCTCTGATTG
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TGACAATAGTGATTATAATTTAAATATTATAACAATTTATTTTAAGCAATGCTGTTATTA
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GTTAATTCAATTCCCTTTTATATAATGTTTTTTTTTAAAAAAAAAATTCCCTTTTATTTA
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CCTTACTTTGCAATGCATAATTCGCCTTTTCAATGATCTTTCTGAAGTGTTCAAATTTAC
AAAAAGACTGCAATTTATATATTAAATTGGTTTTTATGTGTCGAAAACTAATTAGAATCT
TAAGTCGCTCTGTTAATGGCTTTGGCTTTCTAGTGTTTACTTTTAATCATAAATCAACTT
CCTGTTTGGAGGATACTTTCTCTGTGCAAGTTCTAGTTTGCTAGCAGGATTGTGAGGATA
CCGTCAAGTGTGATAAATGTTTGCATTACTTGTAATATCAAACAATAAAGATGATAAACT
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AAAATAATATTGCGTCACTGAGAGATCGTCGACCAGAAGAGGTATACAACAAGAATTCCA
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TGTTAGGTAATCAATCACACATTAATACTTCTAGTCACTGCATCTTTTGTTCCCCGTATT
CATTTAGCTTGTAATTGACCTTGCTACTTTCTTCAGCGAAACCAGGGAAAGTTGTGGGAC
CCGTTGTACCATATGAGAATACAAGTGTTATGAAAGATGCTTACAATCCGAGATCTTTTA
TCAGAAGCACAGTAGTTCCTCATGGTGTCCCTCCTGCTTATTGTTACCGTAAATCTACCA
CAGGAAAGCAGGAAAGACCGACTTCAGTGGATTCTGAAAGGGACTTGTCTTCGCAGATAA
AACAAGCCCCTCAATGTGGGATGGCAACCAAATTTGCACCAGACATAGCTATCGACATTG
ATTCCAATCCATTTTTTATGACACGGGCAGGAGTGAACAAAGTGGAGCATGTTGAGGACC
GGATTGCCATTGACACAAATTTGTTGCAGGGCAAAGCTCAGTATGGTGGGATTGGTGCTA
CCACTGCTGCTGCTACCGATGCCACCTATAGGAAGGTTGGAACTGTTCAGTATGGTATGA
CCAGGATGTATTGATGACAGAGTTAGAGGCAGTGCAGCAGATGCATATATACACCGAGGG
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ATGTTAAAAAAAAAATCTCTTTTATTTAATTAAGAGGCACATGAATATCTAGGGCTAAGT
CCTTACTTTGCAATGCATAATTCGCCTTTTCAATGATCTTTCTGAAGTGTTCAAATTTAC
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TAAGTCGCTCTGTTAATGGCTTTGGCTTTCTAGTGTTTACTTTTAATCATAAATCAACTT
CCTGTTTGGAGGATACTTTCTCTGTGCAAGTTCTAGTTTGCTAGCAGGATTGTGAGGATA
CCGTCAAGTGTGATAAATGTTTGCATTACTTGTAATATCAAACAATAAAGATGATAAACT
TTCTATCTGATGATTTCAGGTCAACAATTGTTCATTCAAACATAATTCCCCCCATGGAGC
AAAATAATATTGCGTCACTGAGAGATCGTCGACCAGAAGAGGTATACAACAAGAATTCCA
GAGAAACTGAAGCAATGCCTGCAAATCTGTCAAGGAGCATGCAGGCACCCCAGAGATTTC
TGTTAGGTAATCAATCACACATTAATACTTCTAGTCACTGCATCTTTTGTTCCCCGTATT
CATTTAGCTTGTAATTGACCTTGCTACTTTCTTCAGCGAAACCAGGGAAAGTTGTGGGAC
CCGTTGTACCATATGAGAATACAAGTGTTATGAAAGATGCTTACAATCCGAGATCTTTTA
TCAGAAGCACAGTAGTTCCTCATGGTGTCCCTCCTGCTTATTGTTACCGTAAATCTACCA
CAGGAAAGCAGGAAAGACCGACTTCAGTGGATTCTGAAAGGGACTTGTCTTCGCAGATAA
AACAAGCCCCTCAATGTGGGATGGCAACCAAATTTGCACCAGACATAGCTATCGACATTG
ATTCCAATCCATTTTTTATGACACGGGCAGGAGTGAACAAAGTGGAGCATGTTGAGGACC
GGATTGCCATTGACACAAATTTGTTGCAGGGCAAAGCTCAGTATGGTGGGATTGGTGCTA
CCACTGCTGCTGCTACCGATGCCACCTATAGGAAGGTTGGAACTGTTCAGTATGGTATGA
CCAGGATGTATTGATGACAGAGTTAGAGGCAGTGCAGCAGATGCATATATACACCGAGGG
ATTTGGACAAAAATCACAAAGGAGGTTTGACAGATAGAATATGTAAAAAGAGGCGAGGTT
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CAGACACATAAATGCAGATTTTATTTTACTTTTTATTGGTGGGTTGGGGTGGGAAGATTT
GGCCACATTTTCATTAAATTACTGGAAAGAAAAAAGAAAAAAAGAAGGAAATATAAGCAA
AGGTATTTAGTATACCAATTTCATAACTGTTGGAATCCTGATTAAGTGATAAAATTATAT
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