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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001817 | Chr5 | 30643166 | 30648018 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001817.m1 | 126 | 184 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.3 | 5.60E-07 |
LITCHI001817.m1 | 149 | 206 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.9 | 1.40E-10 |
LITCHI001817.m1 | 150 | 170 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.4 | 2 |
LITCHI001817.m1 | 172 | 232 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32 | 8.00E-08 |
LITCHI001817.m1 | 173 | 195 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.81 |
LITCHI001817.m1 | 197 | 217 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.1 | 1.2 |
LITCHI001817.m1 | 268 | 329 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.1 | 1.90E-08 |
LITCHI001817.m1 | 318 | 338 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.31 |
LITCHI001817.m1 | 522 | 736 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 79.8 | 2.10E-22 |
LITCHI001817.m1 | 522 | 793 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 63.7 | 1.80E-17 |
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>LITCHI001817.m1 ATGGTGGATCAGAGAAGTGTGGTGGGTTGTGTATTTATCTTGTTGTTGTTATTTGAGTGT ACATTTGAGCAAGTAGTGCCAGTGAGTTCATTTGCTGAGAGAGTAACTCTACTTGAACTC AGATCGTCATTGGGACTAAGAGCCAGGGATTGGCCTATAAAAGCTGACCCTTGCTCTGTG TGGAAGGGTGTAAGATGTGACAATGGTAGTGTTGTTGGAATTAACATTTCTGGCTTTAGA AGGACTAGGATTGGTAAACAGAACCCACAATTTGCTGTTGATTCGCTTGTGAACTTGACG CATTTGGCCTCTTTCAATGCCTCAAGTTTCTTCCTGCCTGGCCTGATCCCGGATTGGTTG GGGCAGCGGTTATTGTTGCAAGTGCTGGATCTTCGGTCTTGTTCTGTGAGAGGTCAAATT CCCACGAGCCTTGGAAATTTGACTACTTTAACTAGACTGTATTTGTCTGATAATAATCTT ACTGGGGCAATTCCTTCAAGTTTGGGTCAATTATCAAACCTTTCGTTTCTTGATCTTTCC AAGAATTCGCTTACTGGAACCATTCCTGCTTCATTCGTGTCGCTGAAGAACCTGTCAAGT CTTGACATTTCATCGAATTTTCTAAATGGATTGATTCCTCCTGGCATTGGGACACTTTCT AGGCTTCAGTATTTCAATGTTTCGAACAATAACTTAGCTTCTTCGATTCCTTCGCAGCTT GGGAATCTTGATGAGTTGGTTGACCTTGATCTCAGCATGAATTCTTTGTCTGGATCAGTG CCACGGGATTTGAGAGGGTTGAGGAATTTGCAGAAGATGGTGATTGGTAACAATTCTCTA AGTGGGAATTTGCCTGCCGATTTTTTTCCGGCTCCTAGTCAGTTGCAGATTATTGTTTTA AGACACAATAACTTTACTGGTCCTCTTCCTAATGCGGTGTGGTCAATGACACAATTGCGT TTGCTCGACATTTCTAGCAATAACTTTACTGGTTTGCTTCCGAATTCTAGTTTGAATGCA AATGTGACTGGTTCAGAATTGGATATGTCTGGGAACATGTTTTATGGAAGTCTCACACCA TTGCTTAGAAGATTCAGTTTTATCAATCTCACAGGAAATTATTTTCAAGGCAGGGTTCCA GAGTATGTGCATGATAATGCATCCCTTGATAGAAATTGTCTCCGAAATGTCTCTAACCAG AGGACTTCTACAGATTGTAGATCATTCTATGCAGCAAGAGGCCTGAGTTTTGATAATTTT GGACAACCAAATTCCACCGAACCTTCTGCACCAAAAGGTTCTGAGAAGAATAACCGAAAG ATAATTATATTGGCAGCAGCTTTGGGGGGAAGTCTTATTATTTTGGTGGTGCTAGTACTG CTGGTCCTATGTTGCCGTAAGAAGGGCACTACCAATCAAAGAGGGGTTGGTGTGGGACCA GTTCCTGCAGGATCCAGTCCTCCTCCACCACCTGGAATATCAATTGACTTTTCTATTCTA GGGGATTCATTTACTCATCAGCAGCTACTCCTGGCCACTGGTGATTTTAGTGATGCAAAC CTCATAAAACATGGTCACTCAGGAGATCTGTTCAGGGGTTTCTTAGAAGGTGGGATCTCT GTGGTCATCAAAAGAGTTGACTTGCAATCTGTTAGAAAGGAAGCATACCTATTGGAATTG GATGTCTTTAGTAAGATTTCTCATACAAGATTGGTTCCTCTCTTGGGACATTGCTTAGAT AATGAAAATGAGAAGTTCCTTGTTTACAAATATATGCCAAATGGAGATTTGTCAAGTTCC TTGCATCGGAAAACTGCTAATGAAGATGATTTGCAGTCATTGGATTGGATAACAAGATTG AAAATTGCAACAGGTGCTGCAGAAGGTCTATCTTATCTGCATCATGAATGTACGCCCCCA CTTGTTCACAGAGATGTTCAAGCAAGCAGTATACTTCTTGATGACAAATTTGAAGTACGG TTAGGGAGCCTGAGTGAGGTCTGTGTTCAAGAAGGTGAAACTCATCAAAGCAGGATAACG AGGTTCCTGCGGTTGCCACAGTCATCTGAACAAGGTTCTTCAGGTACAATAACATCAACA TGTGCCTACGATGTATACTGCTTTGGAAAGGTACTGCTTGAGCTGGTAACTGGTAGGTTG GGCATTAGTGCATCCAGTGATACTGAAATGAAGGAAACATTGGAACAGACGTTACCATAC ATCAGTATATATGACAAGGACCTTGTGACCAAGATTGTAGATCCATCTCTGATTGTGGAT GAGGATCTGCTAGAGGAAGTGTGGGCAATGGCCATTGTTGCCAGGTCTTGCCTCAATCCC AAGCCCTCAAGGCGACCCCTCATGAGGTACATCCTCAAGGCCTTGGAGAATCCTTTAAAG GTAGTAAGGGAAGAGACTGCAGGCTCTGCAAGGCTTAGAGCCACCTCATCAAGAGGGTCT TGGAATGCTGCTGTTTTCGGTAGTTGGCGCCACAGCTCGTCTGATGTAGCCGCCATCCCT GCAGGCTCCACTATAAAAGCAGAAGGAACTAGTAGTTTTAAACAATCAGGAACAACTGGT TCCCAGGGAAGTACACATAATGGTGTAGGTGAACATTCATCCTCACATAGACGGCATTCT AGAGATATATTCCCGGAACCATCTGACGTTCAAGAAATAGAGAGACAAGACCAGGACTAA
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>LITCHI001817.m1 MVDQRSVVGCVFILLLLFECTFEQVVPVSSFAERVTLLELRSSLGLRARDWPIKADPCSV WKGVRCDNGSVVGINISGFRRTRIGKQNPQFAVDSLVNLTHLASFNASSFFLPGLIPDWL GQRLLLQVLDLRSCSVRGQIPTSLGNLTTLTRLYLSDNNLTGAIPSSLGQLSNLSFLDLS KNSLTGTIPASFVSLKNLSSLDISSNFLNGLIPPGIGTLSRLQYFNVSNNNLASSIPSQL GNLDELVDLDLSMNSLSGSVPRDLRGLRNLQKMVIGNNSLSGNLPADFFPAPSQLQIIVL RHNNFTGPLPNAVWSMTQLRLLDISSNNFTGLLPNSSLNANVTGSELDMSGNMFYGSLTP LLRRFSFINLTGNYFQGRVPEYVHDNASLDRNCLRNVSNQRTSTDCRSFYAARGLSFDNF GQPNSTEPSAPKGSEKNNRKIIILAAALGGSLIILVVLVLLVLCCRKKGTTNQRGVGVGP VPAGSSPPPPPGISIDFSILGDSFTHQQLLLATGDFSDANLIKHGHSGDLFRGFLEGGIS VVIKRVDLQSVRKEAYLLELDVFSKISHTRLVPLLGHCLDNENEKFLVYKYMPNGDLSSS LHRKTANEDDLQSLDWITRLKIATGAAEGLSYLHHECTPPLVHRDVQASSILLDDKFEVR LGSLSEVCVQEGETHQSRITRFLRLPQSSEQGSSGTITSTCAYDVYCFGKVLLELVTGRL GISASSDTEMKETLEQTLPYISIYDKDLVTKIVDPSLIVDEDLLEEVWAMAIVARSCLNP KPSRRPLMRYILKALENPLKVVREETAGSARLRATSSRGSWNAAVFGSWRHSSSDVAAIP AGSTIKAEGTSSFKQSGTTGSQGSTHNGVGEHSSSHRRHSRDIFPEPSDVQEIERQDQD.
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>LITCHI017299.m1 ATGGAAATTGAGCATATTATTTCATTGAGAATGGTGGGCGCTGTGTTTAGTCTACTGCTG TTTCTACAATCGCCTGGAATATTTGCCTCTGGAGTTGTGTTACAGTCAAAAATTTGTGGC GCTGATCACCTAGCCTACTGGAATTCTAATGGTATTGAATTGTATTACATAAACGGAAAT CTAGTAGACAAAGTTTCGTTCTGTAAGGCTCTACAATATCACTATGCAAATCGTTGCGTC TTCAGAGCCTATTTTCAAAGAGATTACTGTGGGTTGGACCTTTCGCTAGATGAGGTGCGC TTCAAGGGTGGAAGAAAAATTTTGCAAAAGGAGTCTGAAACCCGCCGTGATAGCAGTAAA CCTCGTCCTAGGGAGGAGATTGGTGGTCCAAAATCTCTTTCAATCACAGAAAAGGGCCTG ATAGCAGGTGGACTTCTGGTCATGTCTTGTGCTCTACTCTGCCCCTGCATTTATAAAAGA CGGAAAGCAACTGCCCATGCTGTTCTTTCCAAGGACCTAAATTCAACGGATTCTGTTTCC TCCTTTGATGTAATTTCGGCTTCAGAAAAGATTCCACCCAGTCCAGCTAGGATACCGCCC AGTCCAGCTAGGGTACCGCCTAGTCCAGCTAGGATACCGCCTAGTCCTTCTAGATTCACA ATGTCTCCGAAACTCAGTAGAATAGGATCAGTACATCTCACTATGAATCAAGCCCTCAGG GCTACTCGTAATTTCTCAGCATCACTACGGATAGGTGAAGGAGGCTTTGGAACTGTCTAC AAGGCCCAACTAGAAGATGGCCAGGTGGTGGCCATAAAACGAGCAAAGAAGGAAGACTTT GACAACCTGCAAACTGAATTCAGTAGTGAAGTTGAACTCCTATCCAAAATTGATCATCGG AATCTGGTGAAGCTACTTGGTTTTGTTGACAAAGGAAATGAGCGCCTTATCATAACAGAA 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