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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001817 | Chr5 | 30643166 | 30648018 | - | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001817.m1 | 126 | 184 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29.3 | 5.60E-07 |
LITCHI001817.m1 | 149 | 206 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 40.9 | 1.40E-10 |
LITCHI001817.m1 | 150 | 170 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.4 | 2 |
LITCHI001817.m1 | 172 | 232 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32 | 8.00E-08 |
LITCHI001817.m1 | 173 | 195 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.6 | 0.81 |
LITCHI001817.m1 | 197 | 217 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.1 | 1.2 |
LITCHI001817.m1 | 268 | 329 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.1 | 1.90E-08 |
LITCHI001817.m1 | 318 | 338 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 11.9 | 0.31 |
LITCHI001817.m1 | 522 | 736 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 79.8 | 2.10E-22 |
LITCHI001817.m1 | 522 | 793 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 63.7 | 1.80E-17 |
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>LITCHI001817.m1 ATGGTGGATCAGAGAAGTGTGGTGGGTTGTGTATTTATCTTGTTGTTGTTATTTGAGTGT ACATTTGAGCAAGTAGTGCCAGTGAGTTCATTTGCTGAGAGAGTAACTCTACTTGAACTC AGATCGTCATTGGGACTAAGAGCCAGGGATTGGCCTATAAAAGCTGACCCTTGCTCTGTG TGGAAGGGTGTAAGATGTGACAATGGTAGTGTTGTTGGAATTAACATTTCTGGCTTTAGA AGGACTAGGATTGGTAAACAGAACCCACAATTTGCTGTTGATTCGCTTGTGAACTTGACG CATTTGGCCTCTTTCAATGCCTCAAGTTTCTTCCTGCCTGGCCTGATCCCGGATTGGTTG GGGCAGCGGTTATTGTTGCAAGTGCTGGATCTTCGGTCTTGTTCTGTGAGAGGTCAAATT CCCACGAGCCTTGGAAATTTGACTACTTTAACTAGACTGTATTTGTCTGATAATAATCTT ACTGGGGCAATTCCTTCAAGTTTGGGTCAATTATCAAACCTTTCGTTTCTTGATCTTTCC AAGAATTCGCTTACTGGAACCATTCCTGCTTCATTCGTGTCGCTGAAGAACCTGTCAAGT CTTGACATTTCATCGAATTTTCTAAATGGATTGATTCCTCCTGGCATTGGGACACTTTCT AGGCTTCAGTATTTCAATGTTTCGAACAATAACTTAGCTTCTTCGATTCCTTCGCAGCTT GGGAATCTTGATGAGTTGGTTGACCTTGATCTCAGCATGAATTCTTTGTCTGGATCAGTG CCACGGGATTTGAGAGGGTTGAGGAATTTGCAGAAGATGGTGATTGGTAACAATTCTCTA AGTGGGAATTTGCCTGCCGATTTTTTTCCGGCTCCTAGTCAGTTGCAGATTATTGTTTTA AGACACAATAACTTTACTGGTCCTCTTCCTAATGCGGTGTGGTCAATGACACAATTGCGT TTGCTCGACATTTCTAGCAATAACTTTACTGGTTTGCTTCCGAATTCTAGTTTGAATGCA AATGTGACTGGTTCAGAATTGGATATGTCTGGGAACATGTTTTATGGAAGTCTCACACCA TTGCTTAGAAGATTCAGTTTTATCAATCTCACAGGAAATTATTTTCAAGGCAGGGTTCCA GAGTATGTGCATGATAATGCATCCCTTGATAGAAATTGTCTCCGAAATGTCTCTAACCAG AGGACTTCTACAGATTGTAGATCATTCTATGCAGCAAGAGGCCTGAGTTTTGATAATTTT GGACAACCAAATTCCACCGAACCTTCTGCACCAAAAGGTTCTGAGAAGAATAACCGAAAG ATAATTATATTGGCAGCAGCTTTGGGGGGAAGTCTTATTATTTTGGTGGTGCTAGTACTG CTGGTCCTATGTTGCCGTAAGAAGGGCACTACCAATCAAAGAGGGGTTGGTGTGGGACCA GTTCCTGCAGGATCCAGTCCTCCTCCACCACCTGGAATATCAATTGACTTTTCTATTCTA GGGGATTCATTTACTCATCAGCAGCTACTCCTGGCCACTGGTGATTTTAGTGATGCAAAC CTCATAAAACATGGTCACTCAGGAGATCTGTTCAGGGGTTTCTTAGAAGGTGGGATCTCT GTGGTCATCAAAAGAGTTGACTTGCAATCTGTTAGAAAGGAAGCATACCTATTGGAATTG GATGTCTTTAGTAAGATTTCTCATACAAGATTGGTTCCTCTCTTGGGACATTGCTTAGAT AATGAAAATGAGAAGTTCCTTGTTTACAAATATATGCCAAATGGAGATTTGTCAAGTTCC TTGCATCGGAAAACTGCTAATGAAGATGATTTGCAGTCATTGGATTGGATAACAAGATTG AAAATTGCAACAGGTGCTGCAGAAGGTCTATCTTATCTGCATCATGAATGTACGCCCCCA CTTGTTCACAGAGATGTTCAAGCAAGCAGTATACTTCTTGATGACAAATTTGAAGTACGG TTAGGGAGCCTGAGTGAGGTCTGTGTTCAAGAAGGTGAAACTCATCAAAGCAGGATAACG AGGTTCCTGCGGTTGCCACAGTCATCTGAACAAGGTTCTTCAGGTACAATAACATCAACA TGTGCCTACGATGTATACTGCTTTGGAAAGGTACTGCTTGAGCTGGTAACTGGTAGGTTG GGCATTAGTGCATCCAGTGATACTGAAATGAAGGAAACATTGGAACAGACGTTACCATAC ATCAGTATATATGACAAGGACCTTGTGACCAAGATTGTAGATCCATCTCTGATTGTGGAT GAGGATCTGCTAGAGGAAGTGTGGGCAATGGCCATTGTTGCCAGGTCTTGCCTCAATCCC AAGCCCTCAAGGCGACCCCTCATGAGGTACATCCTCAAGGCCTTGGAGAATCCTTTAAAG GTAGTAAGGGAAGAGACTGCAGGCTCTGCAAGGCTTAGAGCCACCTCATCAAGAGGGTCT TGGAATGCTGCTGTTTTCGGTAGTTGGCGCCACAGCTCGTCTGATGTAGCCGCCATCCCT GCAGGCTCCACTATAAAAGCAGAAGGAACTAGTAGTTTTAAACAATCAGGAACAACTGGT TCCCAGGGAAGTACACATAATGGTGTAGGTGAACATTCATCCTCACATAGACGGCATTCT AGAGATATATTCCCGGAACCATCTGACGTTCAAGAAATAGAGAGACAAGACCAGGACTAA
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>LITCHI001817.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTACATATAAATCTACATACAACGAATAGTAATTAAAAAATATTATTTTTATTTCTATTT TCACATTATATAAATTCACACCAATTAAAATAAAAATTTGTTAAACACATAAAAATTGAT TTCAGTATCATAGCAGTAAAATTAGTCAAATAGTCAATCTCATTAACCTCATAATAGTAT ATTTTATTTACATATTTAATAATGATTATTTTAAAAGTCATATCAATATAAACTGGTTGA TAATATAATATCCAATGTAATATACAAATTAAAATGATAATTATACTATTATACAAACGA AAATCTGTATCATTACAATAGAAATTCTTTCTAATTTTTTCATCTTCTATAATAAATAAA AATACATCAAAATTACTACCACAACTCAAATAAGAGCAGTTGAAATATATCCTCACTAAT CTTTAAAATTTAAAGATGCCCCCTAACACAAGAACAGATTACACTTTTGGTGCATTGACC ATCTTCATTTTTTCAAATTTTAAATTAAGAAAAAAATATCATTCAATATTATTTCTAAAA AAACATAAATATAATTTCTCTGAACCAAAACAATCATTTTCTTCAAAAATTAAAAAAACA GTAACCAACGAATATTTCAAGTACAACGAGAAGACCGACACCTACTACGTCTCTATAAAG GAGCAATCCGAGCCCACGTGGACCCCTAAGAAAAATTCAGAATATAAGTTCTTAGAAAAG TTCTTGGAAAGGCATCTGCTGTGTTAAATAACTTAAATGGGACAAATTTCCATTGTTTTC CAATTTCCATTCTAAATCTGTAATTTTTTTTGCTTAAGAAGAGTCAAGTGACATAAATTT ACCATTTTTTGTTTTTGGCTTCTCAAAACAATGAGAAAAAAAAAACAAAATGAAAAATCA AAAGGCCAATATTAACTACACCAACCCTCCTCATTTGGTTAAAAAAACTATCAAACAGAA ATCACTATTCAAACCCAGAAATAAATACACACAAACCAAAAAAAAAAAAAGGGACAAAAA TGACCACGCAAGACACTCAAGAGACTAGAGAGAGGGAGAGTTTTGATACGTACATTAAAA GTTGGAAAATTAAGTAGTTTATGTTCGAGCTTAGCTGGCAAAAGCGGCATAACCGGAGGT CAAACCTAACCGGCACCGGACCCTGGATCAACCCAGACCAGACCAGTCTCATTAGTGTCA GACCAAAGCAATCATCATCAAGTCACCGGTTCAGTCACTTGGCTTGGCTCTTTGTCTTTG CTTAAATTTTTACCAACTTTTTCTGCTATAAAGTTTTGATCATTTTGAACACCCATTTTT TTATTGTCAATAGAGAGAGAATTGTCAGCTCTTAAAAATCAAGTCTTTGCCTTTGCCTTC TTCTTCATTTTTTTTCCTTGATTTGTTTTTTCATTGTTTAGTACCAGAAAGGCAGCTTTG TTATTATTGATGACAGAGTGAGTCCACTTCACAGTTTTTTGACCACCATCTCTCTCTCTC TCTTTCTCTTCATTTTTTTTTAATTGATAGATCACAACACATTTTTATTTTTATTTTTTT TGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTCTCTCATTTGTCAACTGACGGATTTAGAGAGAGTAGG TAGAGGGAGAAGAGAGGAAAAGAAAAGAAGCAAAAGAAGAGTGAAAATAGATTGGTCTCC AACAGTTTTTGAGGAAGAAGAAAACCCCCAGAAATAAAAGAAAACAAAGGCTTATAGTTA CAAGGTAAGATTTTTTTTTTTTTTGTTTTAGTTTTCGTTTAAGTGAAAAGCGAAACTTGA GGGTGGTCTTTTATTGGAGGCCAAAAGGATGTGTTTTCGTCATCTGGGTATGTCTAATTC TATAAGATTACAATTGTTTCATTACATTGATAGTCAAATATAGCTGAGAGAATACATAGG TGGTTGATCAGAGGAAGAATATGAAGGATGATATTCTGAGTAGACTAGTGTTGCATGTTA AAGGGTGCGTGTAAAAAGCC
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>LITCHI001817.m1 GenomeSequence - ATGGTGGATCAGAGAAGTGTGGTGGGTTGTGTATTTATCTTGTTGTTGTTATTTGAGTGT ACATTTGAGCAAGTAGTGCCAGTGAGTTCATTTGCTGAGAGAGTAACTCTACTTGAACTC AGATCGTCATTGGGACTAAGAGCCAGGGATTGGCCTATAAAAGCTGACCCTTGCTCTGTG TGGAAGGGTGTAAGATGTGACAATGGTAGTGTTGTTGGAATTAACATTTCTGGCTTTAGA AGGACTAGGATTGGTAAACAGAACCCACAATTTGCTGTTGATTCGCTTGTGAACTTGACG CATTTGGCCTCTTTCAATGCCTCAAGTTTCTTCCTGCCTGGCCTGATCCCGGATTGGTTG GGGCAGCGGTTATTGTTGCAAGTGCTGGATCTTCGGTCTTGTTCTGTGAGAGGTCAAATT CCCACGAGCCTTGGAAATTTGACTACTTTAACTAGACTGTATTTGTCTGATAATAATCTT ACTGGGGCAATTCCTTCAAGTTTGGGTCAATTATCAAACCTTTCGTTTCTTGATCTTTCC AAGAATTCGCTTACTGGAACCATTCCTGCTTCATTCGTGTCGCTGAAGAACCTGTCAAGT CTTGACATTTCATCGAATTTTCTAAATGGATTGATTCCTCCTGGCATTGGGACACTTTCT AGGCTTCAGTATTTCAATGTTTCGAACAATAACTTAGCTTCTTCGATTCCTTCGCAGCTT GGGAATCTTGATGAGTTGGTTGACCTTGATCTCAGCATGAATTCTTTGTCTGGATCAGTG CCACGGGATTTGAGAGGGTTGAGGAATTTGCAGAAGATGGTGATTGGTAACAATTCTCTA AGTGGGAATTTGCCTGCCGATTTTTTTCCGGCTCCTAGTCAGTTGCAGATTATTGTTTTA AGACACAATAACTTTACTGGTCCTCTTCCTAATGCGGTGTGGTCAATGACACAATTGCGT TTGCTCGACATTTCTAGCAATAACTTTACTGGTTTGCTTCCGAATTCTAGTTTGAATGCA AATGTGACTGGTTCAGAATTGGATATGTCTGGGAACATGTTTTATGGAAGTCTCACACCA TTGCTTAGAAGATTCAGTTTTATCAATCTCACAGGAAATTATTTTCAAGGCAGGGTTCCA GAGTATGTGCATGATAATGCATCCCTTGATAGAAATTGTCTCCGAAATGTCTCTAACCAG AGGACTTCTACAGATTGTAGATCATTCTATGCAGCAAGAGGCCTGAGTTTTGATAATTTT GGACAACCAAATTCCACCGAACCTTCTGCACCAAAAGGTTCTGAGAAGAATAACCGAAAG ATAATTATATTGGCAGCAGCTTTGGGGGGAAGTCTTATTATTTTGGTGGTGCTAGTACTG CTGGTCCTATGTTGCCGTAAGAAGGGCACTACCAATCAAAGAGGGGTTGGTGTGGGACCA GTTCCTGCAGGATCCAGTCCTCCTCCACCACCTGGAATATCAATTGACTTTTCTATTCTA GGGGATTCATTTACTCATCAGCAGCTACTCCTGGCCACTGGTGATTTTAGTGATGCAAAC CTCATAAAACATGGTCACTCAGGAGATCTGTTCAGGGGTTTCTTAGAAGGTGGGATCTCT GTGGTCATCAAAAGAGTTGACTTGCAATCTGTTAGAAAGGAAGCATACCTATTGGAATTG GATGTCTTTAGTAAGATTTCTCATACAAGATTGGTTCCTCTCTTGGGACATTGCTTAGAT AATGAAAATGAGAAGTTCCTTGTTTACAAATATATGCCAAATGGAGATTTGTCAAGTTCC TTGCATCGGAAAACTGCTAATGAAGATGATTTGCAGTCATTGGATTGGATAACAAGATTG AAAATTGCAACAGGTGCTGCAGAAGGTCTATCTTATCTGCATCATGAATGTACGCCCCCA CTTGTTCACAGGTACTTCCAGGACTTGTTTCTTAGTATTCTTCATGATTTAATTTCCTAG GGTTATGTTTATTAACTTGATGCTAGTTTTCTTGTTACTTCATAGTCATCATAGTGAGTC GAGTATTGTGTAGGTTTAATGTTGAACCTTCATTTTTTAAAGCCATTACCCTTTTTATTT TATAGCTCTTGGAGAAAAGACTGGAATCATGTAGTTTTGGTACAATGTCTGCTTCATAAC TCTTAATCAATCAAGTCAGTCTGAACTTCTAACATCATGCTTTTCTGTCTTTCAAGTTGT GTTCTTGTGTTTCTAAGCATCAGTAGAGGACTTGAAACTAGAAAGATACTGTTATGAACA TAGTTGAGGTTGAATGAGCAAAATTTTAGGTTGAAAGCTTGAGAAAATCACATGAAGTGC AGTATTTGTATATACAATATACACTAGGTACCTTTTTCTGTGAGAAATACTTTTTTTTTA AATAATTTTTTGAATTAGTTAGGGTAATTATTAGTTTAATGTGTGTGGGAAAGCCGCTGC TTTGGCTATTGTCTTGACTGTGCATTGAATTAATCCTGCACTAGTTACTGGAGGCAAAAT TAATATGATGTTAGTACTAACATGTTCAAGTTGGTGTCCTTGAAGAGATGTTCAAGCAAG CAGTATACTTCTTGATGACAAATTTGAAGTACGGTTAGGGAGCCTGAGTGAGGTCTGTGT TCAAGAAGGTGAAACTCATCAAAGCAGGATAACGAGGTTCCTGCGGTTGCCACAGTAAGT GTTTTATTGGATGGTGTTCTTGGTTAAGATGCTTTAAACACTGTTTCATGTTTTATACTG CTTCTGGTGTTAGCATAGTACTGATTTTGTTGCTTCTGTCTTTGTGACTAGATTTCCTGA GTTTGCATTCAATTTTTGTCATTTGCATTGAGTATGAATTTTCGGTGGTTGGTCATGTAG AATGAGTATTCATTTGTATGCTTATGCTAATTACATTATTTAATGCAACCTTAAAAAAAT TCCATGGGTATCTGCTTCCTGTAGTTTCATTGAAACTTCTTGCATGAATATTGTGACTTG TAGTGATGTAAATTCTGATAGTGTCGATGGCTGTAGGCATATTCAGGAGCCAAGTTTTGT ATAATTGGAAGTATTACAAAATTAGTTTCATCGTATTAAGCTTAGTTTGATTTTAATTTA TTGCCTCCACTAGTGGTTCGAATAACTACTAGTTTCAAACTATATCTGCTTGTTTTATTT GTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTATTTTTGCCCATAATTTGTTTGGTTATGCTTTACCAAG TTTTGTTTACCCATTTTGGTTGATCTATGTTGTAATCATTGTTTTATCTTACTATGTGCA GGTCATCTGAACAAGGTTCTTCAGGTATGTTTAGATTTAATTTTAAGGTTTCACCTCAGA TTTTCAATTTCAACTCTTTTTTCCCCTTGGCTACTAATTTAAGGTGTGTTTTTGGATGAA ATAAAACATGAAAATTACTATGTTATTAGATACCGATCCTCTCAAAAACATTTTTCTTCA CGCCACATCAAGCATTTTGTACTGCTTTAGATGTTTGGAGTCTCTTATTACCCTTCTCAT GGTCCTAAGTTCTTAACAGTCATTCTTCAAAATTGTCCTCTTAAGAACTTTAATTGCTTG GCTTCCACTAAAGTGAATTTTTCCTTTTTCAGCTGTCCCAAATTGGAACAATTTATTTGG AGATGCCTTTTGTAAAAGGCAAATTAGAAATTAATATTTCCATCATTTGAATGCTGTTTC TGATATGTGTTTGTCATTGGAAACTGGCCAGGTACAATAACATCAACATGTGCCTACGAT GTATACTGCTTTGGAAAGGTACTGCTTGAGCTGGTAACTGGTAGGTTGGGCATTAGTGCA TCCAGTGATACTGAAATGAAGGAAACATTGGAACAGACGTTACCATACATCAGTATATAT GACAAGGACCTTGTGACCAAGATTGTAGATCCATCTCTGATTGTGGATGAGGATCTGCTA GAGGAAGTGTGGGCAATGGCCATTGTTGCCAGGTCTTGCCTCAATCCCAAGCCCTCAAGG CGACCCCTCATGAGGTACATCCTCAAGGCCTTGGAGAATCCTTTAAAGGTAGTAAGGGAA GAGACTGCAGGCTCTGCAAGGCTTAGAGCCACCTCATCAAGAGGGTCTTGGAATGCTGCT GTTTTCGGTAGTTGGCGCCACAGCTCGTCTGATGTAGCCGCCATCCCTGCAGGCTCCACT ATAAAAGCAGAAGGAACTAGTAGTTTTAAACAATCAGGAACAACTGGTTCCCAGGGAAGT ACACATAATGGTGTAGGTGAACATTCATCCTCACATAGACGGCATTCTAGAGATATATTC CCGGAACCATCTGACGTTCAAGAAATAGAGAGACAAGACCAGGACTAATAGAAAAAGTTT GATTGTTATTGATTCTTTGTTAATAATACAGCAGGCTTCCCATTCGATTGCCTGCTTGTT GGTAGTATGTCGGCCAGCAATTCTCTGGAGGTAACTTGCATTTCAAGTCATTCTTGTATT TATCTGGGGTTGTTTCAGGAGGCAAATATCTTCAATGATCAAAAATGGATGATTTTCGAA ACTTGTATGAAGATCTTGTCTCAGGGAAGAGAGGTTTCAATTTGTGAATAAGTCTCTAGA TATATTGAAATTCAGGTAAGAGAAAAGGGTGCCATGGTAGTTTTGTTGTTATTTGTTTGA AAGCTTGTTTCTTTTGGGTGAAAACAAGCTACAATTTTTTATGTGTAGTTGATGGTTGGT TGGTTGGTTGTTGTTTGTGGGTTCTATTTTGTGCCTTGTATATTTATTTCTTCATTGAAA ATGAGATTCTAATGTCAATTCAAAAGAGCAGCAATAAAAGAGACATGAACAAT