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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001816Chr53063864830642524-"Transcription termination factor MTERF2, chloroplastic "

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001816.m1245324PF02536.17mTERFFamily26.23.90E-06
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>LITCHI001816.m1
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TGGATGGGTTATGTCATTAGCCGATGTCCTCAGTTGTTGTGTTGTGACATTGAAGAAGTG
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GTCTTTGATTATCCTAGGGTACTGGGGTTTTTCAGTCTGGAAGAGATGAACCAAAAGGTT
GCTTATCTGAAGGAGTTTGGTCTTTCTACTGAAGATGTTGGGAGATTACTAGCATTTAAG
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TACCTTGGAATTTCCCGAGATGGTATGAGGAGAATGCTTGTTATCAAACCCATTGTTTTC
TGCATTGATTTGGAGGCAACCATTGTTCCAAAGGTGCAATTTTTCCGGGATATAGGTGTT
CGAGATGATGGTGTTGCCAACATGCTCGTAAAGTTTCCTCCTTTACTAACATACAGCCTA
TACAAGAAAATTCGGCCAGTGGTCATATTCTTGATGACCAAAGCTGGAGTCAGCGAAAGG
GATATTGGGAAGTGTATAGCTTTGGGGCCAGAGCTTTTGGGATGCAGCATAGGAAATAAG
CTTGATGTTAATGTGAAATACTTTCTGTCTCTTGGCATAAAGCTTCAGCAATTGGGCGAG
ATGATTGCTGATTTTCCCATGTTACTGCGTTACAATATCGATCTCCTCCGCCCAAAGTAT
CGTTATCTACGAAGAACCATGGTCCGGCCTTTGCAGGATCTTATTGAGTTTCCAAGGTTT
TTCAGCTATTCTCTTGAAGATCGAATAATTCCGAGGTACAGAGTAATGGTAGAAAATAAT
ATTAACTTTAAACTACGTTACATGTTAAATTGTTCCGATGATGAATTTCATCAGAAGGTT
GCAGATAAGATTGAAAGACGCCAAAGATTTGAAGCTGGTCTTCTGAATGAAGATCTTATC
GATTCTCAGACCACCAATGCTTCCTTAGGGATTGGGGAAGTAGTTTGTTATCCTCATACT
GAGAATTTGTATTCCGAACCTGAAACCATTGATATATCCATGGGCAGGACAGAATTTGAT
CATTCTAGTACTGAGGATTCTTAA
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ATAGCTTTGGGGCCAGAGCTTTTGGGATGCAGCATAGGAAATAAGCTTGATGTTAATGTG
AAATACTTTCTGTCTCTTGGCATAAAGCTTCAGCAATTGGGCGAGATGATTGCTGATTTT
CCCATGTTACTGCGTTACAATATCGATCTCCTCCGCCCAAAGTATCGTTATCTACGAAGA
ACCATGGTCCGGCCTTTGCAGGATCTTATTGAGTTTCCAAGGTTTTTCAGCTATTCTCTT
GAAGATCGAATAATTCCGAGGTACAGAGTAATGGTAGAAAATAATATTAACTTTAAACTA
CGTTACATGTTAAATTGTTCCGATGATGAATTTCATCAGAAGGTTGCAGATAAGATTGAA
AGACGCCAAAGATTTGAAGCTGGTCTTCTGAATGAAGATCTTATCGATTCTCAGACCACC
AATGCTTCCTTAGGGATTGGGGAAGTAGTTTGTTATCCTCATACTGAGAATTTGTATTCC
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GATTCTTAA
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ATTCCCCACCGCCGCCACAACTCCAAGTCCGCCTCCCTCCTCCTCCGCCACCTCTCAAAC
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AAGGCGCTGGAGATTCGACGGAAAGTGACGGCTGAGATTTTCATGCAGGCGATGAAGAAG
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AATGTTAGAGCTAAACATGTTATTCAGGACTCTAATGTCGTTCCACTTTTAAGGTGGTTG
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TACAAACACCCCCCGAAGCGACAACGACGACAGCGAGCAAAACGACGTCGTTGATGATAA
AATGATAATGAAGGCGCTGGAGATTCGACGGAAAGTGACGGCTGAGATTTTCATGCAGGC
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TTTCATCGACCATGTCATGATCAAAGCTGCCGCTTTGAAGAAGTCTCCCGACTTCTCCGA
TTCTACTTTCAATGTTAGAGCTAAACATGTTATTCAGGACTCTAATGTCGTTCCACTTTT
AAGGTATCAAACAATTGTAATTGTGTTTTTGTGTTTTTTGCGTGAAATTTTGAATCTTGT
TGTTGGGTTTTTGTTTTTGTGAAATGGGTATGTGTAAATTTCTTCAATTTGATGATAATG
TTGAATATATTGTAATTTTTTTGTTTTGGGGATTATGATGAAATTTTGAATCTTGTTATT
GGGTTTTTGTTTGTGTGAAATGGGTTTGTGTAAGTTTCTTTAATTTGATGATAATGTTGA
ACATATGAATGATTGAGGTTTATTTTATTTATTTTATTTTTTTAATAATAATATTGATGG
TTTGATGATTTGAGTTTCTATATAGGTGGTTGAAGCACCATCATTTGTCATATCCTAGGA
TTGCTAGGCTGATATGCATGTCGAAAGGGGATCTTGGGTTGATTAGACGTTTTGTTGAGT
GGTTGAAGTCGATTCATGTCAAGGGTGAGTTTCTAGGGGTTGTGTTTTCGAAGTCGGGAG
GTAACGTTTTGGAACGAAGCCTTGAAGAGTTGGATGAGATTGTGGATTATTTGGAGAGTA
AAGGAGTGAGGAGGGATTGGATGGGTTATGTCATTAGCCGATGTCCTCAGTTGTTGTGTT
GTGACATTGAAGAAGTGAAAACACGTGTGGCTTTTTACATGGATATGGGTATGAATGAAC
GAGATTTTGGCACGATGGTCTTTGATTATCCTAGGGTACTGGGGTTTTTCAGTCTGGAAG
AGATGAACCAAAAGGTTGCTTATCTGAAGGAGTTTGGTCTTTCTACTGAAGATGTTGGGA
GATTACTAGCATTTAAGCCACAATTGATGCGTTGTAGCATCAAAGAAAGATGGAAGCCCC
TTGTTAAGTATTTATACTACCTTGGAATTTCCCGAGATGGTATGAGGAGAATGCTTGTTA
TCAAACCCATTGTTTTCTGCATTGATTTGGAGGCAACCATTGTTCCAAAGGTGCAATTTT
TCCGGGATATAGGTGTTCGAGATGATGGTGTTGCCAACATGCTCGTAAAGTTTCCTCCTT
TACTAACATACAGCCTATACAAGAAAATTCGGCCAGTGGTCATATTCTTGATGACCAAAG
CTGGAGTCAGCGAAAGGGATATTGGGAAGTGTATAGCTTTGGGGCCAGAGCTTTTGGGAT
GCAGCATAGGAAATAAGCTTGATGTTAATGTGAAATACTTTCTGTCTCTTGGCATAAAGC
TTCAGCAATTGGGCGAGATGATTGCTGATTTTCCCATGTTACTGCGTTACAATATCGATC
TCCTCCGCCCAAAGTATCGTTATCTACGAAGAACCATGGTCCGGCCTTTGCAGGATCTTA
TTGAGTTTCCAAGGTTTTTCAGCTATTCTCTTGAAGATCGAATAATTCCGAGGTACAGAG
TAATGGTAGAAAATAATATTAACTTTAAACTACGTTACATGTTAAATTGTTCCGATGATG
AATTTCATCAGAAGGTTGCAGATAAGATTGAAAGACGCCAAAGATTTGAAGCTGGTCTTC
TGAATGAAGATCTTATCGATTCTCAGACCACCAATGCTTCCTTAGGGATTGGGGAAGTAG
TTTGTTATCCTCATACTGAGAATTTGTATTCCGAACCTGAAACCATTGATATATCCATGG
GCAGGACAGAATTTGATCATTCTAGTACTGAGGATTCTTAAAGCTGCTTATCACAGTGAG
CTAGTAGTTTCCTCTTTGCTTATCACTGTGAGCTAGTAGTTTCCTCTTTGTACACTTCAT
TTTTCCGATGCATATAGCTTCTATTTTCTGTTTCAACAGGAGGCAATCATGTACTTAATA
TGGTATAATCAACATGTACATTTGTGTTCAAAGAAATGGAATTTTTGCACTAATAATATA
TGTTATTCAGTTATTAAA
>LITCHI001816.m2
CCGAGATTTGAACTCGGGTTACTGGATTCAGAGTCCAATGTCCTAACCACTAGACCATGG
AACCTTTTGTGCCGGGTTGTCTCCGTTGATCTAAATATTGTTATTACTAAAAACAATTGA
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ACACAAAAACATGCTGTCAACTCCGCCGTACCACCACCACCTCCCGCTTCTCCCCCTCCG
CCGCACCACCGCCACGGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTCCCCACCACCAACAAACTACCCC
ACAAAACTCCATTCCCCACCGCCGCCACAACTCCAAGTCCGCCTCCCTCCTCCTCCGCCA
CCTCTCAAACCAGCAACAGCTCAACCTCAACGACCAGCAGCATGACGTCATCCCACCGGA
AGACAAAATCAGAGTCCTCGAAATGTCGCTCGTGGCCAAAAGGCCCCCACAATTCCCGGG
GTCCATCTACGACGCCAACGCCTCTCTATCAGAGCCTCTCCAAAACCTCTTCAAAAGCCC
TACAAACACCCCCCGAAGCGACAACGACGACAGCGAGCAAAACGACGTCGTTGATGATAA
AATGATAATGAAGGCGCTGGAGATTCGACGGAAAGTGACGGCTGAGATTTTCATGCAGGC
GATGAAGAAGAACAAATTTGGAATCACGTATTCGACAAATGTCACTAACAGATTGGCTGA
TTTCATCGACCATGTCATGATCAAAGCTGCCGCTTTGAAGAAGTCTCCCGACTTCTCCGA
TTCTACTTTCAATGTTAGAGCTAAACATGTTATTCAGGACTCTAATGTCGTTCCACTTTT
AAGGTGGTTGAAGCACCATCATTTGTCATATCCTAGGATTGCTAGGCTGATATGCATGTC
GAAAGGGGATCTTGGGTTGATTAGACGTTTTGTTGAGTGGTTGAAGTCGATTCATGTCAA
GGGTGAGTTTCTAGGGGTTGTGTTTTCGAAGTCGGGAGGTAACGTTTTGGAACGAAGCCT
TGAAGAGTTGGATGAGATTGTGGATTATTTGGAGAGTAAAGGAGTGAGGAGGGATTGGAT
GGGTTATGTCATTAGCCGATGTCCTCAGTTGTTGTGTTGTGACATTGAAGAAGTGAAAAC
ACGTGTGGCTTTTTACATGGATATGGGTATGAATGAACGAGATTTTGGCACGATGGTCTT
TGATTATCCTAGGGTACTGGGGTTTTTCAGTCTGGAAGAGATGAACCAAAAGGTTGCTTA
TCTGAAGGAGTTTGGTCTTTCTACTGAAGATGTTGGGAGATTACTAGCATTTAAGCCACA
ATTGATGCGTTGTAGCATCAAAGAAAGATGGAAGCCCCTTGTTAAGTATTTATACTACCT
TGGAATTTCCCGAGATGGTATGAGGAGAATGCTTGTTATCAAACCCATTGTTTTCTGCAT
TGATTTGGAGGCAACCATTGTTCCAAAGGTGCAATTTTTCCGGGATATAGGTGTTCGAGA
TGATGGTGTTGCCAACATGCTCGTAAAGTTTCCTCCTTTACTAACATACAGCCTATACAA
GAAAATTCGGCCAGTGGTCTGTTCTTTTCCATCTATGTTTTTCCTTTTCCATTGCATAGT
TTACAGTGTTACTCTTTCTGCAATTTTGCATCTCCCTAAAGTATGTTGAGACAGTCATAT
CATTCTATAATTTGGTGTGTGGTAAGATGGAATGTTTAGTATCTCTTTGGATCTTCAAAA
AATAAGGGAACTATATGTTATAAATATATGTAAGAGGCAAACATGATATCTGATCAGTTT
TTTTCCCGTCTGATTTTTTCGGAGATCTGAAGAGAGACGCAATCCTATGTATCACATTTG
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TTTAGAATCATTATATATCTAAGTGTCGTTTATTAAATGTTATATAGGATGTGTTTTGAC
CTGCAGAACAATATCAGCTTTATCATAAACTGTGAATTTGGAATATCATACAGGTCATAT
TCTTGATGACCAAAGCTGGAGTCAGCGAAAGGGATATTGGGAAGTGTATAGCTTTGGGGC
CAGAGCTTTTGGGATGCAGCATAGGAAATAAGCTTGATGTTAATGTGAAATACTTTCTGT
CTCTTGGCATAAAGCTTCAGCAATTGGGCGAGATGATTGCTGATTTTCCCATGTTACTGC
GTTACAATATCGATCTCCTCCGCCCAAAGTATCGTTATCTACGAAGAACCATGGTCCGGC
CTTTGCAGGATCTTATTGAGTTTCCAAGGTTTTTCAGCTATTCTCTTGAAGATCGAATAA
TTCCGAGGTTGCAGATAAGATTGAAAGACGCCAAAGATTTGAAGCTGGTCTTCTGAATGA
AGATCTTATCGATTCTCAGACCACCAATGCTTCCTTAGGGATTGGGGAAGTAGTTTGTTA
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>LITCHI001816.m5
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>LITCHI001816.m4
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CAAGAGGTTAATAGTCTCATTGTTTTATTAACGTTCAATCAAACATAAGAAAATTCTTAT
CCTAATTTTGTTTATTTCTG
>LITCHI011999.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI011999.m2 GenomeSequence + 
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GAGAACCAATACCTTCTTCGCCAAGATCAGCAGTCCTTGATTGAACTCAACAAGCCTGAG
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ATTTCAAACCCCAGAGACTGTGAGAGTGGGAGCGAGAGTTTGAGGTACCAAGCTGCTGCT
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TTGCGGGGAGAGATGAATTTTTGGGGCTATGAAAAATAATGCTAGTACTAGTACTCTCTT
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TACAAAATTTCAATGGTTTAAATTAAACCATATGTGAAAGAAAACC
>LITCHI011999.m1 GenomeSequence + 
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GTAGAGTTCCATTTCCAAATACTTGCTTTTTACGATATCTTTAACCATCTCCACCGCCGT
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GTTCCAGAAGTTTGACATGGAGGTCATTACAGAGGTGGACCTGAACAAGATGGAGCCTTG
GGAGTTGCAAGGTAATTAATTAAGATGTTTGATTACATATTTTGCATTTTTTTGAAAAGA
ATTACATACTTTGCGTTATTAACTCATCATTATCTAATTAAGGGTTTTTTTTTTTTTTTT
GTTAATTATAATGTGAGCTTGATTAATTAGCTAACCAACATGAAAATTCAGTCACTTAAG
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GTATGCATGTATGTGAGAGAGAGAGAGAGATTAGGTAGGACACAATGATTTTCATACTTT
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GCCCTTCTATGTCTAAACTTGGTTGAAATTTTAAAAATATTGTGACATATAAACACTATT
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