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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001718 | Chr5 | 29884978 | 29888304 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001718.m1 | 10 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.80E-15 |
| LITCHI001718.m1 | 292 | 380 | PF02362.24 | B3 | Family | 49.2 | 4.10E-13 |
| LITCHI001718.m2 | 10 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.80E-15 |
| LITCHI001718.m2 | 292 | 380 | PF02362.24 | B3 | Family | 49.2 | 4.10E-13 |
| LITCHI001718.m3 | 10 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 55.6 | 4.10E-15 |
| LITCHI001718.m4 | 10 | 101 | PF02362.24 | B3 | Family | 55.1 | 5.70E-15 |
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>LITCHI001718.m1 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAAGGTCATTCTTGCTTCTATTCTTGAA GACAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTCGGGAATGAACTTTCGGTT TTTGCCACATTGACTGTTCGTAATGGTAGAGTTTGGCGCGTGGGGTTATCCTCAGGGGGG GGAAAGATTTGGTTTCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAAATTCAATACCCCTATAATTTCAAAGAGCCTAAAAATGAGCAGAAT TCGGTTCCCCACAACAAAATTGAGAATAAAGATTATAGGCAGATAAGTGGTTTTGCTAAT ACGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTAACAATTCAAGACTGGAACATGAATGGGAGAAT GAGATGCGGAGCAAGAAGCGAAAATGGGAAGAGCTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT GTGAGCCAATCTGAAAGGTGTAAACTACACAGTTCACAAGGAAATTTGCATCACAGGAAG CATTTGAATAGAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATCAGCTCAAGACAGGGAC GTTAAGGTTAAAAAAACCATAGTGAAGACAACCGCTCACAATGGGGAAGATGCACACCCA ACTCGAAACCAAGATGAGAAAGAGTTATTGGCATTACTTGCAAGCAAAGGAATTGCTTTG AGTAAAAATTATAGAGTTTCATCAGCAGAAGAAAGAGAAAGAATTTTCAATCTTGCAAAA TCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTTTTCCGGCAAAGTCATATCTGTAGC GATCGTGTGTATTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAACTATGTTACTCAAGGTGCTGAACGT ATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATTGGTTGGCAGAAAACT GCATGTCATACACATAAGGGGTGGAATGCATTCATAACTGAGATGAAAATAAAGGCAGAT GACATCTGTCTGTTTGAGCTAATCAGGATGGAGGACTTACAGCTTAAAGTTTCAGTGTTT TAG >LITCHI001718.m2 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAAGGTCATTCTTGCTTCTATTCTTGAA GACAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTCGGGAATGAACTTTCGGTT TTTGCCACATTGACTGTTCGTAATGGTAGAGTTTGGCGCGTGGGGTTATCCTCAGGGGGG GGAAAGATTTGGTTTCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAAATTCAATACCCCTATAATTTCAAAGAGCCTAAAAATGAGCAGAAT TCGGTTCCCCACAACAAAATTGAGAATAAAGATTATAGGCAGATAAGTGGTTTTGCTAAT ACGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTAACAATTCAAGACTGGAACATGAATGGGAGAAT GAGATGCGGAGCAAGAAGCGAAAATGGGAAGAGCTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT GTGAGCCAATCTGAAAGGTGTAAACTACACAGTTCACAAGGAAATTTGCATCACAGGAAG CATTTGAATAGAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATCAGCTCAAGACAGGGAC GTTAAGGTTAAAAAAACCATAGTGAAGACAACCGCTCACAATGGGGAAGATGCACACCCA ACTCGAAACCAAGATGAGAAAGAGTTATTGGCATTACTTGCAAGCAAAGGAATTGCTTTG AGTAAAAATTATAGAGTTTCATCAGCAGAAGAAAGAGAAAGAATTTTCAATCTTGCAAAA TCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTTTTCCGGCAAAGTCATATCTGTAGC GATCGTGTGTATTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAACTATGTTACTCAAGGTGCTGAACGT ATCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATTGGTTGGCAGAAAACT GCATGTCATACACATAAGGGGTGGAATGCATTCATAACTGAGATGAAAATAAAGGCAGAT GACATCTGTCTGTTTGAGCTAATCAGGATGGAGGACTTACAGCTTAAAGTTTCAGTGTTT TAG >LITCHI001718.m3 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAAGGTCATTCTTGCTTCTATTCTTGAA GACAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTCGGGAATGAACTTTCGGTT TTTGCCACATTGACTGTTCGTAATGGTAGAGTTTGGCGCGTGGGGTTATCCTCAGGGGGG GGAAAGATTTGGTTTCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAAATTCAATACCCCTATAATTTCAAAGAGCCTAAAAATGAGCAGAAT TCGGTTCCCCACAACAAAATTGAGAATAAAGATTATAGGCAGATAAGTGGTTTTGCTAAT ACGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTAACAATTCAAGACTGGAACATGAATGGGAGAAT GAGATGCGGAGCAAGAAGCGAAAATGGGAAGAGCTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT GTGAGCCAATCTGAAAGGTGTAAACTACACAGTTCACAAGGAAATTTGCATCACAGGAAG CATTTGAATAGAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATCAGCTCAAGACAGGGAC GTTAAGGTTAAAAAAACCATAGTGAAGACAACCGCTCACAATGGGGAAGATGCACACCCA ACTCGAAACCAAGGTAATAAGTGTGAGCTTAAAAACTCTATGCATCATGATCTTTGTACT CATAGATCCTTTTTTGTGTATAGTGACTGA >LITCHI001718.m4 ATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAAGGTCATTCTTGCTTCTATTCTTGAA GACAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTCGGGAATGAACTTTCGGTT TTTGCCACATTGACTGTTCGTAATGGTAGAGTTTGGCGCGTGGGGTTATCCTCAGGGGGG GGAAAGATTTGGTTTCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCGTGTT GGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTTTGAT ACGACGGCTTGTGAAATTCAATACCCCTATAATTTCAAAGAGCCTAAAAATGAGCAGAAT TCGGTTCCCCACAACAAAATTGAGAATAAAGATTATAGGCAGATAAGTGGTTTTGCTAAT ACGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTAACAATTCAAGACTGGAACATGAATGGGAGAAT GAGATGCGGAGCAAGAAGCGAAAATGGGAAGAGCTGGTGCAGATAAAAGAGACGAATCAT GTGAGCCAATCTGAAAGGTGTAAACTACACAGTTCACAAGGAAATTTGCATCACAGGAAG CATTTGAATAGAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATCAGCTCAAGACAGGGAC GTTAAGGTTAAAAAAACCATAGTGAAGACAACCGCTCACAATGGGGAAGATGCACACCCA ACTCGAAACCAAGATGAGAAAGAGTTATTGGCATTACTTGCAAGCAAAGGAATTGCTTTG AGTAAAAATTATAGAGTTTCATCAGCAGAAGAAAGAGAAAGAATTTTCAATCTTGCAAAA TCATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTTTTCCGGCAAAGTCATATCTGTAGC GATCGTGTGGTAAGCTTTTTAAATAAATGTGACCAACAGATTTTCATTTTCGCATTTGTT ATATGA
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CGTCTTAAACTTTTGTTCACTTATATGATATGGTTTAATATCTTCTATTGGCAATAGGTA GGACATAATATTTAAATCATGATATACATTTAAGAGCACCTATATGATCTGATCTTGTGT GTGGATTGGTTCAACATATGTCTTCATTTACTTGCTTTTGCTATATATATATATATATGT ATATTACTTGAAATCTTCTGTGTGTTAGTGCTTTAAGAAGGCAGGGACAATCTAGCATGA TTATTATGACATGAGAGATTATGATCCAGATGAAGTGAAGTAATATTGTAGCTTTGAATT TAGAATCAAAAGAGCAGCACTCCAAGTCATGGTGAGGCTAATGTAAGAATATCTAGGCTT ATAGTGAAAATCATCTTTAATTTGGCACCCACTAAATGGTTAGTATTTGCTGCTATTAGA AGTCAACTACAGGTGATTAGGATGTTTGTGTATTGTATTTTTG >LITCHI001718.m3 GTGGACTGCTTCTTCTAATGCCTAGTCTCTTGACGTTCAAAAATAAGTCTATTCATCAGC TCAAAACCGAGGCTATCTCAATGTGTTAATGTTTTTCACAAAAGGGTACTGGTAAAATGT GAGCCAACCTCACACTCCATTCATCATGTTGAACCCATTTTGGTATGCACCAAGAACAAG ACAAGTGTGCATTTGGGACCACAACTAGTACAAAAACAGAGTCCTACCAGCTTCAAAGCA GAGAGCAGCAAAACATAAGCATCACTTACAGGATTTGGCAAGCATATCTCTATTGTACAA ACCATATCAAACTTTTCTCAGTCTTTGTGTTGACTACCAGAAAAACATTAGACAAGATGG CCTCTCTCATTGTCTATCTATAAAACCGTGAGAGAGAGAAAGATGGCCTATTCATCAAAG TGGTAATGCACTCTTTTTGTTTCAGTTTTCCTCAAGTGGCTTCTTGTATGGCTGTATTTA TTGATATTTGTTTTTATTGTCTGTTTCATGTATGCATGCTATTATGCTAAAGGGATTTGG AAGAAGCAACTGGTTTTTATATACCTCTCTGCAACAACAACAAGAAGTTTGGCGTTAGAA GTCTATGGAGATGGCGGACACACCCCAACACTTTTTCAAGGTCATTCTTGCTTCTATTCT TGAAGACAAGAAACTGAGGATTCCAGAGAAGTTTGTGAGGAAATTCGGGAATGAACTTTC GGTTTTTGCCACATTGACTGTTCGTAATGGTAGAGTTTGGCGCGTGGGGTTATCCTCAGG GGGGGGAAAGATTTGGTTTCTTGATGGTTGGAATGATTTCGTAGAATATCATTCAATTCG TGTTGGATACTTCTTGGTATTCAAGTATGAAAAGAATTCAAAATTTCATGTTCTTATCTT TGATACGACGGCTTGTGAAATTCAATACCCCTATAATTTCAAAGAGCCTAAAAATGAGCA GAATTCGGTTCCCCACAACAAAATTGAGAATAAAGATTATAGGCAGATAAGTGGTTTTGC TAATACGAATCACAGGGGTGCTGCTAATCTTAACAATTCAAGACTGGAACATGAATGGGA GAATGAGATGCGGAGCAAGAAGCGAAAATGGGAAGAGCTGGTGCAGATAAAAGAGACGAA TCATGTGAGCCAATCTGAAAGGTGTAAACTACACAGTTCACAAGGAAATTTGCATCACAG GAAGCATTTGAATAGAAATGCTGAAATTTTGTATGCACCAAGTCCATCAGCTCAAGACAG GGACGTTAAGGTTAAAAAAACCATAGTGAAGACAACCGCTCACAATGGGGAAGATGCACA CCCAACTCGAAACCAAGGTAATAAGTGTGAGCTTAAAAACTCTATGCATCATGATCTTTG TACTCATAGATCCTTTTTTGTGTATAGTGACTGAAAATTTATTTATGTTTTAATCCAATT CCGAATTTGCAGATGAGAAAGAGTTATTGGCATTACTTGCAAGCAAAGGAATTGCTTTGA GTAAAAATTATAGAGTTTCATCAGCAGAAGAAAGAGAAAGAATTTTCAATCTTGCAAAAT CATTGAAGCCTAAATATCCTTCTTTTATGATTTTTTTCCGGCAAAGTCATATCTGTAGCG ATCGTGTGTATTTGCCAGCTAAATTTGTTGCCAACTATGTTACTCAAGGTGCTGAACGTA TCATTATACAAGTTTCAGATGGAAGAGAGTGGCCTGTTCAAATTGGTTGGCAGAAAACTG CATGTCATACACATAAGGGGTGGAATGCATTCATAACTGAGATGAAAATAAAGGCAGATG ACATCTGTCTGTTTGAGCTAATCAGGATGGAGGACTTACAGCTTAAAGTTTCAGTGTTTT AGGGTCTGAAAGATAACATAACAGATTAGAATGCTCTTTAGTTAGTAATCGTTTGACACG AGTAACTAATGTTTTATCTTGTATAGGTTTCGTCTTAAACTTTTGTTCACTTATATGATA TGGTTTAATATCTTCTATTGGCAATAGGTAGGACATAATATTTAAATCATGATATACATT TAAGAGCACCTATATGATCTGATCTTGTGTGTGGATTGGTTCAACATATGTCTTCATTTA CTTGCTTTTGCTATATATATATATATATGTATATTACTTGAAATCTTCTGTGTGTTAGTG CTTTAAGAAGGCAGGGACAATCTAGCATGATTATTATGACATGAGAGATTATGATCCAGA TGAAGTGAAGTAATATTGTAGCTTTGAATTTAGAATCAAAAGAGCAGCACTCCAAGTCAT GGTGAGGCTAATGTAAGAATATCTAGGCTTATAGTGAAAATCATCTTTAATTTGGCACCC ACTAAATGGTTAGTATTTGCTGCTATTAGAAGTCAACTACAGGTGATTAGGATGTTTGTG TATTGTATTTTTG 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