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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001717 | Chr5 | 29874544 | 29882089 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001717.m1 | 12 | 102 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.2 | 1.10E-14 |
| LITCHI001717.m1 | 316 | 390 | PF02362.24 | B3 | Family | 52.6 | 3.70E-14 |
| LITCHI001717.m1 | 568 | 649 | PF02362.24 | B3 | Family | 30.5 | 2.60E-07 |
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>LITCHI001717.m1 ATGGCTTTCAGGAAGATGGTACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTATCCTTAAGTCAACT CTTGAAGACAAGAAACTGATAATTCCAGAAAATTTTGTAAGAATATTTGGGGATGAGCTC TCTGCTGTCGCGACACTCACAATGTCTAATGGTCAAGTTTGGCAAGTGAGGTTGACAAAA GCTGAGAGAAATATTTTGTTTGATGATGGTTGGCATGACTTTGTACAGTATCATTCAATA AATGTCGGATACTTTTTGGTTTTCAAATACAAGAAGAATTCAAATTTCAAAGTTCTTATT TTTGATCTGACTGCTTGTGAGATACAATGCCCCTGTAGTGAAGACACTGATGAGATGATG CATTTCACAACTCCAAAACCAGCTTCAAACTCCTTGAAAGCCAAAGCTTTTGATAAATGT CCAAGATCATCTAGCAAAGTGCAACCTCAGCCATCACAGCAGAATCCAGCTAAGTCTTCA TTTGCATCCCTTGGAACTCCAAAACTTAAGTGTGGCTATGACAAGAGACGTAAAATGGAA GAACCAGAGGAGAAAGATAAACCAACTGCTGAAGATAAAGATAAAGATGAGATGCTGATT TTACTTGAAGACATGGGAATATGTGTAAATAAGAACTTTGGAAGCATTGCAGCTGAAGAA AAAGAAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCAAAAAATCCTTCTTTCATGCTCA TATTGCGGTCTTCTGACATTCACAACCATCATTTTTATGTGCCAGTTGAGTTTGCTCGCA GGTATTTCAGTAGCCCCAGGTGTCTCAAAATGTTGGATTCTGAGGGAAGAAAGTGGCCTG TTGAAATCTCACGGACTTTCAACTTATGCTTTTGTAAGCAGCCTGTTGTCTCTTCAAGCC TTCAAATATAACATATATAATGCTAGAGGATTCATGCCACAGGAAATTCCTAAAAAGTTT GCAAGGATATTTGGGGATGAACTTTCTACTGTAGCGACACTCACAGTTCCTAATGGTCGA GTTTGGCAAGTGAGGTTGATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGATGGTTGGCAT GACTTTGTACAACACAATTCAATCAGTACTGGATACTTCTTGGTTTTCAAATATAGAAAA AATGCTAACTTTAAAGTTCTTATCTTTGATATGACTGCTTGTGAGATACAATACCCCTAC AATGGTAAAGAACCAGAGAATGACAAGCAGAACTCATTACAGCAGGATGAAACTGAGGAA GAAGATTCTGTTGAGATAATGGACTTCACAACTCCAAACCCAACTTTTGACTCCCTGAAG AACAAAGCATCTGCTAAATGTCCTAGCACAATTCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACT CCTATTGGTTCTGCTTCTGTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGCTGTGAGCCACAAAACAAG AGGCCTAAATCGGAAGAACCAGCAGAATCACATACAGCAAATGCTGAAGGTATTGACTTA AAGTGCAAGAAAACTGCGTCTAAAGTTGGAACACATTCTTCGGATGAAGCAACACAAATG GATGAAGATGAGTTTATGGATTTACTTGAAGAAATGGGAATATGTGTTAATCAGAGATAT AGAAGTCTTGCAGCTGAAGAAAGAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCT AAAAATCCTTCATTCATGGTCATCTTGCGATCTGCTGACATTAGTCTTCGTCGTGTGTAT GTGCCTGCCAATTTTTCTCACAGGTATATAAGTAGGAATGACAAGGTTATCAAAGTACTG GATTGTGATGGAAGGAAGTGGTCCATGACACTGGCCTGGAGGCCTCAATGTTTCATAAGA AAATTGGGAAATTTTGCAAATAAGTTGAATGATGGAGATATCTGTGTCTTTGAGCTTATT AGAAGGAACACGCTAAAAGTTTCAGTGTTGAAGACAGTGAAAATTCAATGA
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>LITCHI001717.m1 MAFRKMVQSSHFFKVILKSTLEDKKLIIPENFVRIFGDELSAVATLTMSNGQVWQVRLTK AERNILFDDGWHDFVQYHSINVGYFLVFKYKKNSNFKVLIFDLTACEIQCPCSEDTDEMM HFTTPKPASNSLKAKAFDKCPRSSSKVQPQPSQQNPAKSSFASLGTPKLKCGYDKRRKME EPEEKDKPTAEDKDKDEMLILLEDMGICVNKNFGSIAAEEKEEQLLLPDCSSQKILLSCS YCGLLTFTTIIFMCQLSLLAGISVAPGVSKCWILREESGLLKSHGLSTYAFVSSLLSLQA FKYNIYNARGFMPQEIPKKFARIFGDELSTVATLTVPNGRVWQVRLIKDGRKIWFNDGWH DFVQHNSISTGYFLVFKYRKNANFKVLIFDMTACEIQYPYNGKEPENDKQNSLQQDETEE EDSVEIMDFTTPNPTFDSLKNKASAKCPSTIPSHLNQAKTPIGSASVSPKFKCGCEPQNK RPKSEEPAESHTANAEGIDLKCKKTASKVGTHSSDEATQMDEDEFMDLLEEMGICVNQRY RSLAAEERERAIAAARLFKPKNPSFMVILRSADISLRRVYVPANFSHRYISRNDKVIKVL DCDGRKWSMTLAWRPQCFIRKLGNFANKLNDGDICVFELIRRNTLKVSVLKTVKIQ.
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>LITCHI001717.m1 AATTTTTTTTTTTTTCCTACTCTAGAAAGTACCTTATTTATAATATACAATTCTTGTAGT AGTAAGAATTCTAATCTCTATACAAATCCTATTTAAACTAAAACCATAAAAAGATGATAC TCAATCCTATTTATTATGCTTGTAACCAATAAAGTAATTAAAAAACCCTTTTGCATAAAA AAAATATTTTATGGTATATCTGCTTAACTTTTATTTCTAGCAAAAACTTATTTTCTAATT TAAATATTGCCAAACATGATTGCCAAACTAAAATTGTGTGAAGACACTAGAATAAATTGT AGTTGTAAAAACTCGGTTCCTGATCTAACATAAAATTTGCCTATGTCTTCACACAATGAT GTTCACTTTCCTTGTATCAGAAGTAGTCAACAGTTTGTCTTGAATTTGCTCAGACTGGGA AGAAGAACTTAGAGTTTCTCTGAACTAGGAATTACTCAACAAATGGCTTTCAGGAAGATG GTACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTATCCTTAAGTCAACTCTTGAAGACAAGAAACTG ATAATTCCAGAAAATTTTGTAAGAATATTTGGGGATGAGCTCTCTGCTGTCGCGACACTC ACAATGTCTAATGGTCAAGTTTGGCAAGTGAGGTTGACAAAAGCTGAGAGAAATATTTTG TTTGATGATGGTTGGCATGACTTTGTACAGTATCATTCAATAAATGTCGGATACTTTTTG GTTTTCAAATACAAGAAGAATTCAAATTTCAAAGTTCTTATTTTTGATCTGACTGCTTGT GAGATACAATGCCCCTGTAGTGAAGACACTGATGAGATGATGCATTTCACAACTCCAAAA CCAGCTTCAAACTCCTTGAAAGCCAAAGCTTTTGATAAATGTCCAAGATCATCTAGCAAA GTGCAACCTCAGCCATCACAGCAGAATCCAGCTAAGTCTTCATTTGCATCCCTTGGAACT CCAAAACTTAAGTGTGGCTATGACAAGAGACGTAAAATGGAAGAACCAGAGGAGAAAGAT AAACCAACTGCTGAAGATAAAGATAAAGATGAGATGCTGATTTTACTTGAAGACATGGGA ATATGTGTAAATAAGAACTTTGGAAGCATTGCAGCTGAAGAAAAAGAAGAGCAATTGCTG CTGCCAGATTGTTCAAGCCAAAAAATCCTTCTTTCATGCTCATATTGCGGTCTTCTGACA TTCACAACCATCATTTTTATGTGCCAGTTGAGTTTGCTCGCAGGTATTTCAGTAGCCCCA GGTGTCTCAAAATGTTGGATTCTGAGGGAAGAAAGTGGCCTGTTGAAATCTCACGGACTT TCAACTTATGCTTTTGTAAGCAGCCTGTTGTCTCTTCAAGCCTTCAAATATAACATATAT AATGCTAGAGGATTCATGCCACAGGAAATTCCTAAAAAGTTTGCAAGGATATTTGGGGAT GAACTTTCTACTGTAGCGACACTCACAGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCAAGTGAGGTTG ATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGATGGTTGGCATGACTTTGTACAACACAAT TCAATCAGTACTGGATACTTCTTGGTTTTCAAATATAGAAAAAATGCTAACTTTAAAGTT CTTATCTTTGATATGACTGCTTGTGAGATACAATACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAG AATGACAAGCAGAACTCATTACAGCAGGATGAAACTGAGGAAGAAGATTCTGTTGAGATA ATGGACTTCACAACTCCAAACCCAACTTTTGACTCCCTGAAGAACAAAGCATCTGCTAAA TGTCCTAGCACAATTCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACTCCTATTGGTTCTGCTTCT GTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGCTGTGAGCCACAAAACAAGAGGCCTAAATCGGAAGAA CCAGCAGAATCACATACAGCAAATGCTGAAGGTATTGACTTAAAGTGCAAGAAAACTGCG TCTAAAGTTGGAACACATTCTTCGGATGAAGCAACACAAATGGATGAAGATGAGTTTATG GATTTACTTGAAGAAATGGGAATATGTGTTAATCAGAGATATAGAAGTCTTGCAGCTGAA GAAAGAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATG GTCATCTTGCGATCTGCTGACATTAGTCTTCGTCGTGTGTATGTGCCTGCCAATTTTTCT CACAGGTATATAAGTAGGAATGACAAGGTTATCAAAGTACTGGATTGTGATGGAAGGAAG TGGTCCATGACACTGGCCTGGAGGCCTCAATGTTTCATAAGAAAATTGGGAAATTTTGCA AATAAGTTGAATGATGGAGATATCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGGAACACGCTAAAA GTTTCAGTGTTGAAGACAGTGAAAATTCAATGA
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>LITCHI001717.m1 + Up_Stream_Len 2000 GATGAAAAAGTGGAGATCGACAATGGGAAGAAGAAGAGGAGGAGGAGTTAAAAATAAAAT TATTTTTTTAAGCTTATTTTATTAATATTAAGTTTATAAAAAATATTTTAATTTATTTTT TTAATATTTATAATTCAAGTGCATTATAGTCATTTTGTTATTTGACCAGGGTGGCTGTTA AAATTAATAGTTTTTGATTGGGAGTGGGTAGCCAAATTGTAATAAATAGATAAAATTTAC TCCACCAATAAATTGTTTCCAAACAGGTAGCCAATTTGTAATTTACTCTAACTGTAAATT AATTTTAAGAAATAAGAGGTTTTAAAGATAATATAAATTTTAGAAGTAGATAATGTGTAA ACTACTGCAAAACATTTTATTGCTATATAAACAACTTAAAAATCATGTTCACAATTAATG TTAAACATAAATATAGTTTTTAGAATATCCAAAAGTTCATAAACTAATATATATACATCA TGAATGAATTTACTTATCTTGATTAAGCACAAATTCACAAAATAGGCTCAATGATCGCAT AAACCTATACAATTATAGAATGAATATAATTACAATTTTATCATCATAATAATTTTTCTT GGACAAATTTAACCTTGTTATAATAAATTGGAAATTCTATCCTTTTTGTGTCCAATTTTC AGCTCTGACACTGTCACACTAAACCTTTTTTAATTAACTCTCTAGATCTCCAATCAACTT GAAATTTTATATGGACATTACAGACACATTAATCCACCTCAGTAAAAAAATTTCACAATA ATCCGGGACTGTTAACTTGGGTAACAAATTATTCATTTCAGCCTTTTAAAAACTGTCCAA AAAATTTTACCCTGATAACAGTACACTATAAGAATTTTAATAAATTCTGTAGTGGCTCAA AAATCACAAAATTTAATATTCTAACAGAAGACATATTAATCCATCTCCAGTAAAAATTTC ACATTAATCCAGGACTGCTGACTTGGGTAACAAATTACTCGTTTCAGTATTTTGAAAACT GTCCCGAAAATTTTACCCTGATAACAGTATACTATAAGAATTTTAATAAATTCTGTAGTC GCTCAAAAATCACGAAATTTTATATGCTAACAGAAGACATACTAATCTATCTAAATATTA AATTTTAAATTTTCCAGCTGTGTAGCTAAACTAAATAATTTCTCAAAGTTGACTAATTCT CAAAACAGAATATTTCAGCAGTACTTAATTTTGAAAATTTTGTATGCTCATCATTAACAT AATTTAATCCCTCTCCAAAATCATCTAAATCAATCTCCTAACACCAGTAATGCATACTTT CTTAAATTAAAACTCACTTGATTCAAAAAGAAACAACTACATGCTTCAATATATTCATCA TTCTAGAAGTGAAATCAATGACCTATGAGATATAATCTAAATCTTGAACAAAATTATATA AAGAAGAGATTTACCTAAAACCTCTTTGATTCTTGAGACTCTGTTGATTAAATTTGTTGG AGAAGAAATTTTTTTTTTTTTCCTACTCTAGAAAGTACCTTATTTATAATATACAATTCT TGTAGTAGTAAGAATTCTAATCTCTATACAAATCCTATTTAAACTAAAACCATAAAAAGA TGATACTCAATCCTATTTATTATGCTTGTAACCAATAAAGTAATTAAAAAACCCTTTTGC ATAAAAAAAATATTTTATGGTATATCTGCTTAACTTTTATTTCTAGCAAAAACTTATTTT CTAATTTAAATATTGCCAAACATGATTGCCAAACTAAAATTGTGTGAAGACATAGGTTTT AGTTTAAATAGATTTGTATAGAGACTAGAATAAATTGTAGTTGTAAAAACTCGGTTCCTG ATCTAACATAAAATTTGCCTATGTCTTCACACAATGATGTTCACTTTCCTTGTATCAGAA GTAGTCAACAGTTTGTCTTGAATTTGCTCAGACTGGGAAGAAGAACTTAGAGTTTCTCTG AACTAGGAATTACTCAACAA
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>LITCHI001717.m1 GenomeSequence + AATTTTTTTTTTTTTCCTACTCTAGAAAGTACCTTATTTATAATATACAATTCTTGTAGT AGTAAGAATTCTAATCTCTATACAAATCCTATTTAAACTAAAACCATAAAAAGATGATAC TCAATCCTATTTATTATGCTTGTAACCAATAAAGTAATTAAAAAACCCTTTTGCATAAAA AAAATATTTTATGGTATATCTGCTTAACTTTTATTTCTAGCAAAAACTTATTTTCTAATT TAAATATTGCCAAACATGATTGCCAAACTAAAATTGTGTGAAGACATAGGTTTTAGTTTA AATAGATTTGTATAGAGACTAGAATAAATTGTAGTTGTAAAAACTCGGTTCCTGATCTAA CATAAAATTTGCCTATGTCTTCACACAATGATGTTCACTTTCCTTGTATCAGAAGTAGTC AACAGTTTGTCTTGAATTTGCTCAGACTGGGAAGAAGAACTTAGAGTTTCTCTGAACTAG GAATTACTCAACAAATGGCTTTCAGGAAGATGGTACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTA TCCTTAAGTCAACTCTTGAAGACAAGAAACTGGTAATCTTCATAACTTTTCATACATTCT TGCTTTTCAAGATGCTACCGGTTAAAGAAACATAGATATCATATCTTGTGGTCTGTAGGT ATAAGAATATGGTTTTATTTGCACGCATTTTGAATGCTAATTGTCGTAGCAATGGCTCTA TATGATCTGTTGAACAGGTTCTGTCACTTAAAACGCATATTAGGCTTTTAATTTCCTATG AAAAACTACAAAATGATTATTTCATGTTAAATTTTTTATCAAAATTTTATGTTTTTACAC CTTTAGCATGCGATTAGGCTCATTTCTATATGAGAAGAGACTCACTTGATTAATAGAGTA 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