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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001715 | Chr5 | 29860321 | 29863160 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001715.m1 | 30 | 105 | PF02362.24 | B3 | Family | 56.5 | 2.10E-15 |
| LITCHI001715.m1 | 282 | 365 | PF02362.24 | B3 | Family | 30.2 | 3.30E-07 |
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>LITCHI001715.m1 ATGATAGGATGTTGGATGGGAAATCAAAGGAAAGGGAAGAAGATGATCGACAGCCTAATG CTTAAGTCATCGCTTCGCTTTTTTACTGAAATTCCTAAAAAGTTTGCAAGGATATTTGGG GATGAACTTTCTACTGTAGCGACACTCACAGTTCCTAATGGTCGAGTTTGGCAAGTGAGG TTGATAAAAGACGGGAGAAAGATTTGGTTTACTGATGGTTGGCATGACTTTGTACAACAC AATTCAATCAGTACTGGGTACTTCTTGGTTTTCAAATATAGAAAAAATACAAACTTTAAA GTTCTTATCTTTGATATGACTGCTTGTGAGATACAATACCCCTACAATGGTAAAGAGCCA GAGAAAGACGAGCAGAACTCATTGCAGCAGGATGAAACTGAGGAAGAAGATTCTGTTGAG ATAATGGACTTTGCAACTCCAAACCCAACTTTTGACTACCTGAAGAGCAAAGCATATGCT AAATGTCCTAGCGCAATGCCATCACATCTGAATCAGGCTAAGACTCCTATTGGTTCTACT TCTGTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGCTGTGAGCCGCAAAACAAGAGGCCTAAATTGGAA GAACCAGCAGAATCACATACAGCAAATGCTGAAGGTATTGACTTAAAGTGCAAGAAAACT GCGTCTAAAGTTGGAACACATTCTTCGGATGAAGCAACAGAAATGGATGAAGATGAGTTT ATGGATTTACTTGAAGAAATGGGAATATGTGTTAATCAGAGATATAGAAGTCTTGCAGCT GAAGAAAGAGATAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTC ATGGTCATCTTGCGATCTGCTGACGTTAGTCTTCGTCGTGTGTATGTGCCTGCCGATTTT TCTCACAGGTATATAAGTAGGAATGACAAGGTTATCAAAGTACTGGATTGTGATGGAAGG AAGTGGTCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTT GCAAAGAATTTGGATGATGGAGATATATGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGGAACACGCTA AAAGTTTCAGTGTTGAAGACAGTGAAAAGTGAGCTGTAG
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>LITCHI001715.m1 MIGCWMGNQRKGKKMIDSLMLKSSLRFFTEIPKKFARIFGDELSTVATLTVPNGRVWQVR LIKDGRKIWFTDGWHDFVQHNSISTGYFLVFKYRKNTNFKVLIFDMTACEIQYPYNGKEP EKDEQNSLQQDETEEEDSVEIMDFATPNPTFDYLKSKAYAKCPSAMPSHLNQAKTPIGST SVSPKFKCGCEPQNKRPKLEEPAESHTANAEGIDLKCKKTASKVGTHSSDEATEMDEDEF MDLLEEMGICVNQRYRSLAAEERDRAIAAARLFKPKNPSFMVILRSADVSLRRVYVPADF SHRYISRNDKVIKVLDCDGRKWSMALAWMPRCFITKLGNFAKNLDDGDICVFELIRRNTL KVSVLKTVKSEL.
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>LITCHI000761.m1 GGGACAGGATGCACCGTCTGTACAAACTTTATATATATTAATTAAAACTAGCAATTTAAA AGTGAAAGATGCAGTTAGCATACAGTATGTATATATATATTAATTAAAAAGAGATTCAAA CAGCACTAAGAACCCAAAAATATTCACCGGCTATTCGCATTCCTAGGAATAGAATCACAC CAGATCCGCATTTTGCTCCTCTTTGAATGTGTGCGTTCTTCATTATTATTATTATTTTTT TCCAATTTTTCTCTTTTTAACCTTTTTTTTTTGGTGGGCTGTCTGATTTTATTTCAGAAT CCAAATAAAGTATTTTTGTTAATGCATATGAGATTAAGCAAGACTTTTGGTCGGTTTTGT CTGGTTTCTTAGTTGGATACCCAACTTCATTGGTGTCCCCCAAACCGAAATTCAGACCAC GATAATCAGGCTCCTTGACAAGCACACATCCTTCAATTTTTATACAAAAAAGATTTTGTC TTTTGTTTGTAGTTATTGCGTTTTCCATATCAAAAACTGGTTTATCAAGTTTTTCTGGAT CTGGGGTCTGTTAGTTCAATCAAAAGCATCCTCATTTTGATTCATTTCACTCATTGCTTT GGTTTTTCACATGATTTGGGTATCTGGGTTGGTATTGGATCTTAGAGTTTTGAGATTTGG AGAGTTGAAACAATCATGGCATTTAACATTTGATCATTTGTAGGCTTTGATGGTGCAAAA AGTTTGAAACTTTTTGGAGAAAGATTGTGTTTTTTTATGGTGAATCACTTGACTGAATGA TACGGTTATGTGTCTGGAAACAGGAGGCTTTATTTTGTTGTAGGATTGATTATCTATACA TTGATAGGTAGATATGGGTTGCATTTGCTCGAAAGGGACTCGAGCAAACCAGTTTGTTGA GGAGCACAATGTGAAGGAGAAGAATTCGAAAAAGAAGTGCTCGAAAAAGTTGCCTTCTTT TAAGAGGGACAATGTGGCAGTGGCAGATGGGGCTGCCAATGATGCCACATTGCGGTTGAT ATATAATCAATCGGGGAATGGTTCTGCTGGGTCGGGAACTGGCTCCTCTGATGAGGGGGA GAAGAGGGACAAGGACAAGGACAAGCCGCGGCTGCAAAGGCGGGGGACAATGGATGTTGG GATGATTGGAGGTCATGTAACGCAACCTAGGATGAATAGGATCTCCAGTGTGAGCAATGG GGAGAGAGGTGCACAGGTTGTTGCTGGTTGGCCTTCTTGGTTGACCGCAGTGGCTGGAGA AGCCATCAATGGATGGGTGCCGCGGAAGGCTGATTCGTTTGAGAAGCTTGATAAGATTGG ACAAGGAACTTACAGCAGCGTGTACAAGGCTCGTGACTTGGGGAACAACAAAATAGTTGC ATTAAAGAAAGTGCGGTTTGCTAATATGGATCCAGAAAGTGTTCGTTTTATGGCGAGAGA AATCATTATTCTGCGTAGGCTTGATCACCCCAACGTCATGAAGCTTGAAGGTTTAATCAC ATCAAGGGTGTCTGGAAGTCTATATCTTATATTTGAATATATGGAGCATGACCTTGCGGG GCTGGCAGCAACACCTGGGATTAAGTTCACTGAGGCACAGATTAAATGTTACATGCAACA ACTGCTTCGTGGACTTGAACATTGCCACAATCGTGGTATTTTGCATCGTGACATTAAGGG ATCAAATCTTCTGATCAACTACAATGGCAATCTCAAGATTGGTGATTTTGGGTTGGCAAC TTTCTCCCGAGCTTATCAAAAACAGCCTCTAACAAGTCGGGTAGTGACTTTGTGGTACCG GCCACCTGAGCTTTTGCTTGGTTCTACAGACTATGGAGCTACTGTAGATTTGTGGAGCAC TGGTTGCATTCTCGCTGAATTGTTTGCTGGAAAGCCTATAATGCCCGGAAGAACAGAGGT AGAGCAACTGCATAAGATCTTCAAACTTTGTGGATCTCCATCCGAAGATTACTGGAAGAG GTCAAAATTGCCACATGCTACCATTTTCAAACCTCAACAACCTTACAAGCGCTGTGTAGC TGAGACATTCAAGGACTTGCCTTCATCAGCCTTGTCCCTGTTGGATGTCCTTTTGGCAAC AGAACCTGAGGGTCGTGGAACATCTTCTTCTGCACTTCAAAGTGAGTTTTTCACAACAAA GCCTCTTCCATGTGATCCATCTAGCTTGCCAAAGTATCCACCATGCAAGGAGTTTGACAT CAAGCTTCGAGATGAGGATGCAAGAAGGCAAAAAGCAGCTGGTGGTAAAGGACGTGGTCA TGATTCGATAAGGAAAAACTCCAAAGAATCTAAGGCTGTGCCGGCTCCTGATGCCAATGC TGAGTTACCGGCATCTATTCAGAAGCGACAAAATCAGATTAATCCCAAAAGCAATAGTGA GACATACAATTGTGTGGAGGATGCTGGTACTGGCTTTCGTATTGAGCCTCCCAAAGGACA ACATAATGTTTACTTCAGTTCTGGTCAGTCAATGCACCCACAGGATGATGCTTTTAGAGG CTCAAATGGTGCATTTGGCTCACCTGAGTTGAGAAATCAGAGATCTTACATGCATCCTGG GGCAGGAGGGTTGTCTAGATTTTCCAACTCGGTTGCAGTTAGAGGCAATGCTCAATCTCA GCTTGATTGTAGCACAGAGAGTAGAGGGAATCCACCATGGCATGAGGACGCTGTCGGAAA GCATGATTGGTCTCAGCATTTGATGGGTGGCAGACCAAAGTCCTCACATAAGAAGAGCGA ACAGCCATTGGGAAAGCAGTCGACAGTGGATTACTTCCATAAGAAGAATCGGATTCATTA CTCTGGACCATTGCTGCCTCCAGGAGGAAACCTCGAGGAAATGCTCAAAGAGCATGAGCG ACAAATCCAGAACGCTGTCAGGAAAGCTCGTTTGGACAAGACCAAAAACAGTGGTGGTAA CGGACAAACACAGTCTCTTCTTAATTACGGGACAAACGGCAGGTGAATCTAGGAAGGAAG TTTATATATATATCTGCTTAAATTTTCATCCTGACGGTCCAGAAGTAATACATACCTTGT GAAAATCTGACTATTCTCATCATCACTAAGAGAAGCTTGGTAATAACAGGATTGTACATG AATTCTGCCATGATCTGAAAACGTGCTATGTAGTTCTAACCACACCATAGTGTTATTTTA GATGAGATTCAAAAGAGGTGGATAGGCAAAAGCAAATTAAACAAGTCCATTGCCAAGTGT ATGATAAGTCTGTGAGGTAATGGTCTTTGAGGTTGAGAAAACTATCAGATTCCTTGATTT TTTTTGAGCAGGAGGTCTCATTGGCATCGATTAGTCTGCTTAAAGCTATGCCTTTGTACA GCTGAAAATTTTATTTACATTACAATTAAATTCTACCATATTCTCTGTTTACATAGGCCA AGTGCTCTTCTACATAAGAGATACAGTACTTGAATGTAACTGATAACTGAGATCATGCAA ATGGGTCATCATTGAATAGAGAAACACAAAGTCTTTAATGGCATAGGCGCATGTTGGTCG TCTATCTAGTAAATATTTATTGTATTAAAAGGAAAAAACTTTCCTTTATCAAATTTAAAT GTACGTATATCTTTTTAGTTAATCTTGTCTATTTGTGTTTTTTTATCACATAAATGACAT TGTTCTATTGAATAGGTTTACATTGTACGATGAAACAACTTTTACATAGAGATATTTAAT ATTTTAAAGTACTGAACTACAGAGACTTTTGTGGGATAGGTGTGTAGTTATCTATCTGGT GGATATCCATTGTATTAAAAGGAAACATCCTTGGTTTGTTTTTATATCAAATTCAATTAT GCGAACATTTATATTGCAAAATCTTCTTTGTGTTTATATACATGGTAGTGCAATGTACCA ACCGGGG
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>LITCHI000761.m1 - Up_Stream_Len 2000 GCTTAAGTTATTATGAAAAATATCTCAGAATATTTTAAATAATATTATGTATGTTTGAGA AAAGTATATTTTGAGAATTTTATTTAAATTCAGGAATAGATTTCCATATATTTGCAAATG AAAATTGTTTGAGATATGAAATGAATGTAAATGAGATTTTTATAACACCAAAATTGTGCC CTCCTCTCTAACGGTTAAACAAATTACATTTGTATGAGTCCTAGATTCGCCTAGCATATG TATGACAGATATTGAGAGAGTTACTGAGTTACTAAGAGAGTTGTTGAGTCATCCAATATG TGTATGACAAATGTTATTCTTTGCTCTATATGTGTATTGAATATTTCTCTCATGTATGAC AAATTTTTATAAGTATTAGTTGGTGTAGATTTTCATATTACAGATGTTATATAGTGAGTT TGATCGATAAAGAAGTAGATTAACAGAACACTAGTTTTTTTAAAAAAAAGATTTCAGAAA AGTTACATAAATAATAGCATGTGATTATATTTTATAAAGTTATAAAAAAAATGATTCATA CAAATAATTATAGCTTTATTATGATATTATATTCAAATTTAGTTTTATTGTTCAAATATG AACGTGTATAAATCATTGAGAAATTACTTATTATTACCTAAAATATGTTATGTTTTATTT AAAAATATTTTTAAAAAAATTATATCCATTCATTAAGTATTAACGTTCACTCTTTTAGAA AACTCATTCGAGTATCCATCGCAGGTTCATGTAGATTATGTCAGATTGTGAAAAAGGTCA TATGATGATAATAAAATACATCATTATTATATTTAATTAGAGACATTTTTACATCAATGT ATATTATTTTTAATTAATGAGATTTTTTACATCAAATATTTTATGAATATTATTATAAAT ATTTTCGATTTGTTGAAATTATATTTATAAATTAACGGGATTTACGATAGTTTTCTTTAA GGTTTTTCAGACTTTCTAGATTTCAAGTAGAAAAATCAAAGTTTTCATGGCAATCTCCTC GACTCAAAAGAAAAGTCAGGATATGTTCCTTCAATTTTTACAGGATTCTTCTAGATTTGA AAGAAGAGTTGAAATAGGTCTCCTTGTGTATCTTCTACTGTCAGTACGATCTTACCCTTA AATTGTTGGGACAGGATGCACCGTCTGTACAAACTTTATATATATTAATTAAAACTAGCA ATTTAAAAGTGAAAGATGCAGTTAGCATACAGTATGTATATATATATTAATTAAAAAGAG ATTCAAACAGCACTAAGAACCCAAAAATATTCACCGGCTATTCGCATTCCTAGGAATAGA ATCACACCAGATCCGCATTTTGCTCCTCTTTGAATGTGTGCGTTCTTCATTATTATTATT ATTTTTTTCCAATTTTTCTCTTTTTAACCTTTTTTTTTTGGTGGGCTGTCTGATTTTATT TCAGAATCCAAATAAAGTATTTTTGTTAATGCATATGAGATTAAGCAAGACTTTTGGTCG GTTTTGTCTGGTTTCTTAGTTGGATACCCAACTTCATTGGTGTCCCCCAAACCGAAATTC AGACCACGATAATCAGGCTCCTTGACAAGCACACATCCTTCAATTTTTATACAAAAAAGA TTTTGTCTTTTGTTTGTAGTTATTGCGTTTTCCATATCAAAAACTGGTTTATCAAGTTTT TCTGGATCTGGGGTCTGTTAGTTCAATCAAAAGCATCCTCATTTTGATTCATTTCACTCA TTGCTTTGGTTTTTCACATGATTTGGGTATCTGGGTTGGTATTGGATCTTAGAGTTTTGA GATTTGGAGAGTTGAAACAATCATGGCATTTAACATTTGATCATTTGTAGGCTTTGATGG TGCAAAAAGTTTGAAACTTTTTGGAGAAAGATTGTGTTTTTTTATGGTGAATCACTTGAC TGAATGATACGGTTATGTGTCTGGAAACAGGAGGCTTTATTTTGTTGTAGGATTGATTAT CTATACATTGATAGGTAGAT
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>LITCHI000761.m1 GenomeSequence - GGGACAGGATGCACCGTCTGTACAAACTTTATATATATTAATTAAAACTAGCAATTTAAA AGTGAAAGATGCAGTTAGCATACAGTATGTATATATATATTAATTAAAAAGAGATTCAAA CAGCACTAAGAACCCAAAAATATTCACCGGCTATTCGCATTCCTAGGAATAGAATCACAC CAGATCCGCATTTTGCTCCTCTTTGAATGTGTGCGTTCTTCATTATTATTATTATTTTTT TCCAATTTTTCTCTTTTTAACCTTTTTTTTTTGGTGGGCTGTCTGATTTTATTTCAGAAT CCAAATAAAGTATTTTTGTTAATGCATATGAGATTAAGCAAGACTTTTGGTCGGTTTTGT CTGGTTTCTTAGTTGGATACCCAACTTCATTGGTGTCCCCCAAACCGAAATTCAGACCAC GATAATCAGGCTCCTTGACAAGCACACATCCTTCAATTTTTATACAAAAAAGATTTTGTC TTTTGTTTGTAGTTATTGCGTTTTCCATATCAAAAACTGGTTTATCAAGTTTTTCTGGAT CTGGGGTCTGTTAGTTCAATCAAAAGCATCCTCATTTTGATTCATTTCACTCATTGCTTT GGTTTTTCACATGATTTGGGTATCTGGGTTGGTATTGGATCTTAGAGTTTTGAGATTTGG AGAGTTGAAACAATCATGGCATTTAACATTTGATCATTTGTAGGCTTTGATGGTGCAAAA AGTTTGAAACTTTTTGGAGAAAGATTGTGTTTTTTTATGGTGAATCACTTGACTGAATGA TACGGTTATGTGTCTGGAAACAGGAGGCTTTATTTTGTTGTAGGATTGATTATCTATACA TTGATAGGTAGATATGGGTTGCATTTGCTCGAAAGGGACTCGAGCAAACCAGTTTGTTGA 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