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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001714 | Chr5 | 29830796 | 29850156 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001714.m1 | 2 | 72 | PF02362.24 | B3 | Family | 39.9 | 3.20E-10 |
| LITCHI001714.m1 | 372 | 446 | PF02362.24 | B3 | Family | 57.2 | 1.30E-15 |
| LITCHI001714.m1 | 453 | 528 | PF02362.24 | B3 | Family | 51.9 | 5.70E-14 |
| LITCHI001714.m1 | 787 | 834 | PF02362.24 | B3 | Family | 31.2 | 1.60E-07 |
| LITCHI001714.m1 | 857 | 934 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.4 | 2.00E-14 |
| LITCHI001714.m1 | 1255 | 1345 | PF02362.24 | B3 | Family | 49.9 | 2.50E-13 |
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>LITCHI001714.m1 ATGTTTGTCAGGAAATATGGGGAAGGCCTTTCGGCTTTTGCTACTCTAACTGCTCCAAAT GGCCGAGTTTGGCGTGTGGGGTTGAGAAAACATGGGAGGAAGACTTGGTTTGATGAAGGT TGGCATGACTTCATAGAGTATCATTCCATCGCTGCTGGATACTTTTTGGTTTTCAAATAT GTTAAGGACTCAAACTTTCATGTCCTTGTATTTGATTTGTCTGCTTGTGAGATTACATAT CCATATAATCGTGAAGAACCTGAAAATATTGAGCGTGACCCAATACACCAGGATGAAATG GAAAGTGAGGATTCAGCTGGGTTCATCCATTCTAGAATGCCGAAACCAACTTCTAGCCCT TTGGCAAAAAGCTGTTCTGATAAATGGAAAGGTAAAAGGCCAAGTAGCAATATGGATACT GCTCCATTGCAGCAGAATCGACCTAAGCCTTGTATTGATTCTGCTCAAGGAATTAATAGG TACTGTAATTGTGCCACTTCCAGTGAGAGTCTAAAATTTGAGAATGATTATGTGGTGCAA ACCAATACATGTAAAATGGAAGAACCCGAGGGGGGAAATCAGTCAAATACTGTGGATGAA TCAAGGAGAGGTAACTTGAACAGAAAGGAAATGTATGATTCGCAAGGATCATTAAACCGC AAAAGGAATTTAGATGGAAATTGTAAGCATTCGTCTGCTAGAAGTCCATTAGTTCATTGC AACGATCTTAAATTGGATAGGACTAGATATAAGGCAATTGCAGATAATAATGCGGAGGAT GAGCATCCGAAAGAAGTTGTAGGCAATGAAAAAAAGGTTGCATACAAGGTTGTGTCTCCA TTAGATCATCACAAGGACCATAAAATTGATAGGACTGAAAATAGAGAAACCAAGGATGAT GGTGATGATGAGGAAGATGATGATGATGATAGGACTAAATTTGATGCACTCGAATTGATG ATTGCATTGGAAGACGCAGGTATTTCTTACTCTGGAAGGTATAGGTGCCTTTTAGCAGAA GAAAGAGAGAGAGCACTTAATGTTGTCAGATTGTTGAGGCCGAAAAATCCATCATTCATG GTTATTTTGCGGTCATATCACGCATTTGGTATTAAAAATTGTTTGTATGTGCCTACCAAA TTCGCGAACAACTATCTGAGTGGAGATGTTCATGTTAGGTTCATCAAACTACAAGCCTCT GACGGAAGAGAGTGGCCTGTACAAATTGTACGGAAACATAATGGTGTTAGTCTTAGAAAT GGATGGGCAGAATTCTCAAGGGACAAGAACCTGGAGGAAGGAGATATCTGTGTGTTTGAG CTTGTAAGGAGGGAGGACATTCTTTTGAAAATGTCAAAAATTCCTGAGAAGTTTGTAAGG ATATTTGGGGATGAACTCTCTACTGTAGTGACACTCACAGTTCCTAATGGTAGAGTTTGG CAAGTGAGGTTGATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGATGGTTGGCATAACTTT GTACAACATAATTCAATCAGTACAGGGTCCTTCTTGGTTTTCAAATATAGAAAGAATTCA AACTTTAAAGTTCTTATCTTTGATATGACTGCATGCGAGATACAATACCCCTACAATGGT AAAGAACCAGAGAATGACAAGCAGAACTCATTGCACCAAGATGAATCTGAGGAAGAAGAT TCTGTTAAGATAATGGACTTCACAACTCCAAACCCAACTTTTGACTCCCTAAAGAACAAA TCTTCTGCTAAATGTCCTAGCACAATGCCATCACATCTGAATCGGGATAAGACTCCTTTT GGTTCTGCTTCTGTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGCAGTGGGCCGCAAAACAAGACACCC AAATTGGAAGAACCAGCGGAATCACATAACGCAAATGCTGAAGGTATTGACTTAAAGCGT AAGAAAACTGCATCTAAAGTTGGAACACATTCTTCGGATGAAGCAACAGAAATTGATGAA GATGAGTTTATGGATTTACTTGAAGTAATGGGAATATGTGTTAATTTGAGATTTAGAAGT CTTGCAGCTGAAGAAAAAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAGGCCTAAAAAT CCTTCATTCATGGTCATCTTGCGGTCTTCTGACATTACTCTTCGTCATGTGTATGTGCCT GCCAGTTTTTCTCAAAAATATATAAGTAAGAATGACAAGGTTATCAAAGTACTGGATTCT GATGGAAGCAAGTGGTCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTG GGAAATTTTGCAAAGAAGTTGGATGATGGAGATGTCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGG AACACACTAAAAGTTTCAGTGTTGAAGACTAAACGTAATGGTGTTAGTCATAGAAATGGA TGGGCAGAATTTTCAAGGGACAAAAACATGGAAGAAGGAGATATCTGTGTGTTTGAGCTT GTAAGAAGGGAGGACATTCGTTTGAAAGTGTCAGTATTTCATGAAACATTAGAACTGATT AAAACCACAATAGCAATCTCATCAAGCCTTTTCTTTGATCCAATTTCACTTGAAATTCCT AGAAAGTTTGCAAGGATATTTGAGGATGAACTCTCTACTGTAGTGACACTCACAGTTCCT AATGGTCGAGTTTGGCAAGTGAGGTTGATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGAT GGTTGGCATGACTTTGTACAACACAATTCAATCAGCATTGGGTACTTCTTGGTTTTCAAA TATAGAAAAAATACAAACTTTAAAGTTCTTATATTTGATACGACTGGTTGTGAGATACAA TACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAGAATGACAAGCAGATCTCATTACAGCAGGATGAA ACTGAGGAAGAAGTTTCTGTTAAGATAATGGACTTCGCAACTCCAAACCCAACTTTTGAC TCCCTGAAGAACAAAGCATCTGCTAAATGTCCTAGCACAATTCTACCACATCTGAATCAG GCTAAGACTCCTATTGGTTCTGCTTCTGTGAATGAAGATGAGTTTATGGATTTACTTGAA GAAATGGGAATATGTGTTAATCAGAGATATAGAAGTCTTGCAGCTGAAGAAAGAGATAGA GCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTCATCTCACGA TCTGCTGACATTAGTCTTCGTCGTGTGTATGTGCCTGCCAATTTTTCTCACAGGTATATA AATAGGAATGAAAAAGTTATCAAAGTACTGGATTGTGATGGAAGGAAGTGGTCCATGGCA CTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTTGCAAAGACGTTGGAT GATGGAGACGTCAGTGTTTTTGAGCTTATTAGAAGGAACACGCTAAAAGTTTCAGTGTTG AAGACTGTGAAAAGTGAGCTGTACTATCGGTTTCTTCTTAAACTTTTGTTTACTAATATG ATCATTTTCAAGGAATGCAATCATGTGAGCCTTTCTTATATCAATTTTCAGTTCTTTTGG AATAGATCATCCAACATTATTTGGTTGATTGGAGAGGGTTCATGTCAATTTTTGTCAGAA GTTTCGGGCCATAACGTTCTGTCGTTGCTATACATGCCTCAAGTTTGTGACATGAAAAGT TACGTGCTAATTGTGATGTCAATGGTGGTATCAATCTGTGATACAAGATCACAAAGAACT ACTCAACAAATGGCTTTCAGAAAGATGGTACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTATCCTT AAGTCCACACTTGAAGACAAGAAACTGATAATTCCAGAAAAATTTGTAAGAATATTTGGG GATGAGCTCTCTGCTGTTGCGACACTCACAATGTCTAATGGTCGAGTTTGGCAAGTGGGG TTGACAAAAGCTGAGAGAAATATTTTGTTTGATGATGGTTGGCATGATTTTGTAGAGTAT CATTCAATAAATGTTGGATACTATTTGGTTTTCAAATACAAGAAGAATTCAAATTTCAAA GTTCTTATTTTTGATCCGACTGCTTGTGAGATACGATGCCCCTGTAGTGAAGACACTGAT GAGATGATGCATTTCACAACTCCAAAACCACCTTCAAACTCCTTGAAAAACAAGGCTTTT TATAAATGTCCAAGATCATCTAGCAAAGTGCAACCTCAGCCATCACAGCAGAATCGGGCT AAGCCTTCATTTGCATCCCTTGGAACTCCAAAACTTAAGTGTGGCTATGACAAGAGACGT AAAATGGAAGAACCAGAGGAGAAAGATAAACCAACTGCTGAAGGTATTGACATTAAGCTT AAAAGAACTGCATGCAAAGTTGGGGCACACTCTTCAGATAGAGCGAATAAAAAAACCAAA TGTGATAAAGATAAAGATGAGATGCTGATTTTACTTGAAGACATGGGAATATGTGTAAAT AAGAACTTTGGAAGCATTGCAGCTGAAGAGAAAGAAGGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTG TTCAAGCCTAACAATCCTTCTTTCATGCTTATATTGCGGTCTTCTGACATTCATAACCAT CATTTTTTTGCCAGCTCATCAGCCTTACACATGCTTAATTTGTTGTGGTCATGTTTGCTT GTGCAGTATGTGCCAGCTGAGTTTGCTCACAGGTATTTCAGTAGCCCCAGGTGTCTCAAA ATGTTGGATTCTGAGGGAAGAAAGTGGCCTGTTGAAATCTCATGGTCCCCTCTATGTTAT ATAACAAGGTTGGGAGGATTTTCAAAGAAGTTGGATGAAGGTGACATCTGTGTCTTTGAG CTTATTAGCCAGAAGAAACTGCAAATTTCAATACTAAAGCCTCTAAAGAGCGAATCCTAG
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>LITCHI000110.m1 - Up_Stream_Len 2000 GAAATATTCAGCGTGTGAAAACAAAATGGTAAAAGCACGTTTCTATGTTGGGCTTGTGGA CCCCATACATGTTTCTAAAAAGTACATTTTCACATTAAATTATATGAACTTTATCTACTT AAATTTTAACCAAACATTTTAAGAACTTCATTGCATGTTCTTTTGATTCTTCTTCTCCAA TTTATCCTCCAGAAATACCCCCCTGAGTTTGAATCTTAGCTGTATTTAGAATTGACTTTG ATCATAATTCTCTTTATTTCAGTCAATGATATTTATCAATTTATTTATGAAAGATAATTG AGACTGACTTTTTCTAAACATTTGATAGGATAATGCTTCAAAAAAATCTCATAATTCTCG TTATTAATTCCCATTGCTCCAAAAAAAATCCAAATTCTAATATGTTACCCCCACTTATTG CCCCTTTGATGAATGGCTACGTGGCCTGTGCTACTGGAAAAATTTTTGTGCTTATAACTC TTGAATCTTGATTTTAAGATTTGTAAATTGTTCTGTTACTACTGCAATCGGTATCTGACC TTTTACACATGATTTGAATGATTAAAGACCAAAAGACATAAAATGATGGCAACAGAAGTG TAACGTTATAAGCAATTGTGAGCAACTAAATTCTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTGAAATTAAAATAATAAAGGCAAATGTGTTGGCGGCTCCATGTTTATAGAAGCTTTCA CCAATTATTGGGTAAAATTAAAGTTGCTATATTTCAGGAGTAGCCTGCTTATCAATTTAG GAAAATAAAATAAAAATAATTAATTGCTGCGTTGGCCCTACCAATATCCATTCTTTCAGG CCAAAATCAAGAAAGGTTAGGGGGCCACTGCGATGCAGCGTATCCAGACGACATGGCAAT GAGCGCGTGAAAAATCGACTTTTTGAAGGCGTTGTGTGTTAAGATAATCCTAGACATGTT TCAAGCTTGACTTATCTATTCAAACAAGTAGAAGAGAATATAATTTCAGTGAGGGCTCCA CCAGTCACAACCATATGACTATACTGCATCACGATACGGCCATAATCCAAAAGAAAGAGC AAAAGTTCGGCCTTTTGAAGTCATTGTCTGTTAAGAGAAAATCGACTATCAAGCTTCAAG CCTAGAGTGGAAGAGAATTTAATTTCACTGGGGGTTACCCAAAAATGTATATATGTATAC TTGTAATTTATGATACTAGTAAAAATGCATGAAAACACTTTTTAGATTTTTAATTAATTA TGGCTTTTAAGAGAATATTGTGTAGGGGATGAGGCTGATTACAAGCACAGCAGTCGTGCA TAAGTTGATGACATAATTTGATAAGATATTTGAGTTTATTAATTTAACGAAATTTTTATT TAGTTTATAATTATAGCAGTCTAGTTTACTACAGCAGTGTCATTAAATATTTTTAAAATG ATTAAATTTTTTAATCAGACAACTTAAAAATCAAACTATAATAAAAAAAATAACCAATCA TACAGGAGATTAAGTCACGTGCACCGAATGTAGAACAGAATTCTATGTGCAAAGTCTGCA GGCAATTTCTGCCCCATATTTTGCAGTCAGGAGTTTCGGGCGGCGAGGGCAACCACCGAA CTACAAGTGTCCTTTTCTCAAGTGTGCTTAATCATCACACAACTGAAACTTGAAGACCAG TGAAAAAGCAAAGGCGACTGAAAAAATCCAAATTTGGAGCCTGCTTTTTATCGCAATAAT TAATTATTCAACGACAATCAATTATTGAATAAGATCCACCTGCGCTGTCTATTTCAAAAA AAAAAAAAAAAAATCTGCCATCTTTTTCAAAAGAAGTATAAAGATCCATCTGCTATCGTC GTTTTGTTATTATTAACACGAATGGCAAACGATAAGAGCAAGGGGTCCCACCGCGCATCC AAAAGCCCTAGCGATGGCATTCACATCCAAGTTTCGGGGGGTTAGGTCACACCAACCTTT TCGGAGACATCTATGTATGC
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>LITCHI022365.m1 GenomeSequence - GGCAGTGAAAAAGTACATGCAAATTCATTATGTATTAAATGATAACATGAAACACATATC AAATAATAGCAATAGGAGGTCAAAAAGCAGAAATTGTGTGTATAAGTTGAGTGACTTTTT CCTCAATTGCGACCTTTACAAAAAAAAAAAAAAAACCCATTAAGATTCCCTGGTTTTCTG GGACCCATTAATATTCCATTGAAACAATATTGTAGACCGGGGGAGGTTTCGTGTGATATT TCTCATCCCGTATTTTTGACTGTGTATAGACCAACCACAGTGTCACCCTCAATGGATCTA TCAATCTCTATATAAAATCAGTTATCTTCACCTCAAGAGTTTGAAGCCAAAACCTACACA GTCTCTTTGATTCTTCTTGTGAACTGATCATCACCATCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCT CTGTCTGGGTTTGAAGCCTTCCTCTTCGAAAACCTTATTGTTTTTTTTGTCTTGCGGTGG GTCAAGAAAGATGAAGAGAAGTGAGGAGTCCTCAAAACTAGATCGAAAAACCATAGAAAG AAATCGTAGAAACCACATGAAAGCTTTATGTTTCAAGCTTGCTTCTCTCGTTCCTTCTCA CCAGTTCCAAACCTCCAAGGTACTACTAATACTATTACACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTAATTTCTCTAATATAAACTACAAAATATTATTCTAAAATTTC CTTATATTATACCGCTGATCAAATGGAAGAAACTCAATTGAAGTCACAATTTTGATCATG CTATGTATAATAACATTTTTGGTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAATCATCAAAACAA AGAGATAATAAGTAACGATATTTGCTTTATTGATTTTTTATTTTACACTTTCTTGTGGCC TGTCGGCTCTTTTATGAATCAGCAGCAGTGACTAATATTAATTTCATGGTACTGCTGGTC TCGTCAAAATCATTGGTGCAGTTTGACAACGAATGGACAGTATGAAATATGAATAATGTG GTTCTTAAATTTTTCCCATTAATAAAAATATGATCCAAAGACACTTCTTGTGCAATCTTA TACACATATTCAAGACAATAAATGAGAATTTGGAAACATAAACAACAACAACCAAAAAAA AAAAATACATTTTCATTATGTTATTAATGGCAACGTTCCATCTAGTAGGTCTTTTCCCTT TTCAGCTACAGGCACATGCATCCCTGCATTAAATTGTATGCTGAGAAAATGAAAATTATG TAGGTCTTTGTGAGGAAGGTTCACTCCGAATTAACTTTCCCCCTTGTAAATTTGGATTTC CTGAGATGAACAACAAATCTGATGAATACGGCTAGTAAATTATTCTACTGAAAAATTAGA TCTGATATCAATATACACATGTATCTTCTCATTACAAATTAATGTGTAGTGTTTTCCTTT TAACATATACTATAAAGGTGTAGATTACATAATACCATCCTGTAAATTGTACAAGCTTTG TTAAGTTGTGAGGTTAAGTATAATTTGTCTTCAAATAGTTGCAAACTGTTTTATGTTTGA GTTTAATCAACTCTTGTCTTGGATTTTATATTCTATTTATATGATCATGAATCATGAGAA GTAGTGATATTTTTTTTAGATATTGTTATTCGAGTTCCATATTTTAAAGTGTAGATCCTA ACATTGTATACAAATTTTTTTTCAGGATATAATATCTCAACAAGACCAACTAGATCAAGC TGCCGCCTATATAAAGCAACTCAGAGAAAGAATAGACAAATTGAAGGGGATAAAGGAAAA GGCAATGAAGCCAACAATTCCCACTACTTGTAACATAATGGATAATAGAATGAATTTTGA CTTCAAATTGCCTGTGTTTGAATTAAGAGACTTGGGTTCTAGCATTGAAGTAATTATTAT AAGTGGGTTGCAAAGAAACTTCCTCTTGTATGAAGTCATAAGCATTCTAGAGGAAGAAGG TGCTGAAGTTGTCAGTGCCAGCTTTTCTACTGTAGGTGATAAGGTCTTCCATACCCTTCA CGCTCAGGTAAAAAATATTCAGATCCTGTTAACTGGTATTCTAATTAATTTCCTCCGGTC ATGCAATATTTAATCTTTTTATTTAATAAATTTTTGTAGGTTAAAATTTCTAGGGTTGGA GTAGAGACATCAAGGGTATGCGAGAGATTGCACGAATTGGTGTATTGAGGTTACGGTGCT GTTGGAAGAGGATTAAAGCTACATATATAAACAAAATAATGGAGGAAAATTCACGTTTGC ATCTGGTCGGTAATTTGATGATGAAGATAAATATGTGGATTGGATTTCGGTTCTTGAATG TAAATGTATAATTAAAGCCTAGTCCGACAATGATGTATTGAGTACCATGTCACTATTTAA TATATTAGCGTATCTATTGTGCTTTCCAATTTCTTCGACATTTTGGTTCATGTTTCAATT AGGGCTAGGCATTTACATGTTTGGTTCGGCTCCTATTGGAATCGAACATGAATCGATATT TTTTTATCAGTTCTCATATACGGAACCAAACATGCACACTTTGAGGGCTAGTATCGACCA GACCTAAACAAACACATATTCCGTACAGATAGATTCAGTTCTCCCCAAGGGCCTGTATAG GCCTGGGCCAAAACACAAAAGGCCCAGTTAATAAATTTCAAACTTTGATGTGACAACGTT CCAACCAGGACCCTACAAACTTCATCCAGTGGCTGTCAAGCAAGGGGAAATATATAGAGA AGCTTCTATATTAAAAAGCTACCAGTTATCGGTGGGGAACACTTTGAAATTCATTCACTC AGTTGTCAAACACAGAGAGATATATGGAGAAGCTCCCATGTTAAGAAGATACCAGTTTTC GATGTGGGACACTTGTTTAGCTGGTTTCAAATTAACTAAC >LITCHI022365.m2 GenomeSequence - 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