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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001714 | Chr5 | 29830796 | 29850156 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001714.m1 | 2 | 72 | PF02362.24 | B3 | Family | 39.9 | 3.20E-10 |
LITCHI001714.m1 | 372 | 446 | PF02362.24 | B3 | Family | 57.2 | 1.30E-15 |
LITCHI001714.m1 | 453 | 528 | PF02362.24 | B3 | Family | 51.9 | 5.70E-14 |
LITCHI001714.m1 | 787 | 834 | PF02362.24 | B3 | Family | 31.2 | 1.60E-07 |
LITCHI001714.m1 | 857 | 934 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.4 | 2.00E-14 |
LITCHI001714.m1 | 1255 | 1345 | PF02362.24 | B3 | Family | 49.9 | 2.50E-13 |
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>LITCHI001714.m1 ATGTTTGTCAGGAAATATGGGGAAGGCCTTTCGGCTTTTGCTACTCTAACTGCTCCAAAT GGCCGAGTTTGGCGTGTGGGGTTGAGAAAACATGGGAGGAAGACTTGGTTTGATGAAGGT TGGCATGACTTCATAGAGTATCATTCCATCGCTGCTGGATACTTTTTGGTTTTCAAATAT GTTAAGGACTCAAACTTTCATGTCCTTGTATTTGATTTGTCTGCTTGTGAGATTACATAT CCATATAATCGTGAAGAACCTGAAAATATTGAGCGTGACCCAATACACCAGGATGAAATG GAAAGTGAGGATTCAGCTGGGTTCATCCATTCTAGAATGCCGAAACCAACTTCTAGCCCT TTGGCAAAAAGCTGTTCTGATAAATGGAAAGGTAAAAGGCCAAGTAGCAATATGGATACT GCTCCATTGCAGCAGAATCGACCTAAGCCTTGTATTGATTCTGCTCAAGGAATTAATAGG TACTGTAATTGTGCCACTTCCAGTGAGAGTCTAAAATTTGAGAATGATTATGTGGTGCAA ACCAATACATGTAAAATGGAAGAACCCGAGGGGGGAAATCAGTCAAATACTGTGGATGAA TCAAGGAGAGGTAACTTGAACAGAAAGGAAATGTATGATTCGCAAGGATCATTAAACCGC AAAAGGAATTTAGATGGAAATTGTAAGCATTCGTCTGCTAGAAGTCCATTAGTTCATTGC AACGATCTTAAATTGGATAGGACTAGATATAAGGCAATTGCAGATAATAATGCGGAGGAT GAGCATCCGAAAGAAGTTGTAGGCAATGAAAAAAAGGTTGCATACAAGGTTGTGTCTCCA TTAGATCATCACAAGGACCATAAAATTGATAGGACTGAAAATAGAGAAACCAAGGATGAT GGTGATGATGAGGAAGATGATGATGATGATAGGACTAAATTTGATGCACTCGAATTGATG ATTGCATTGGAAGACGCAGGTATTTCTTACTCTGGAAGGTATAGGTGCCTTTTAGCAGAA GAAAGAGAGAGAGCACTTAATGTTGTCAGATTGTTGAGGCCGAAAAATCCATCATTCATG GTTATTTTGCGGTCATATCACGCATTTGGTATTAAAAATTGTTTGTATGTGCCTACCAAA TTCGCGAACAACTATCTGAGTGGAGATGTTCATGTTAGGTTCATCAAACTACAAGCCTCT GACGGAAGAGAGTGGCCTGTACAAATTGTACGGAAACATAATGGTGTTAGTCTTAGAAAT GGATGGGCAGAATTCTCAAGGGACAAGAACCTGGAGGAAGGAGATATCTGTGTGTTTGAG CTTGTAAGGAGGGAGGACATTCTTTTGAAAATGTCAAAAATTCCTGAGAAGTTTGTAAGG ATATTTGGGGATGAACTCTCTACTGTAGTGACACTCACAGTTCCTAATGGTAGAGTTTGG CAAGTGAGGTTGATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGATGGTTGGCATAACTTT GTACAACATAATTCAATCAGTACAGGGTCCTTCTTGGTTTTCAAATATAGAAAGAATTCA AACTTTAAAGTTCTTATCTTTGATATGACTGCATGCGAGATACAATACCCCTACAATGGT AAAGAACCAGAGAATGACAAGCAGAACTCATTGCACCAAGATGAATCTGAGGAAGAAGAT TCTGTTAAGATAATGGACTTCACAACTCCAAACCCAACTTTTGACTCCCTAAAGAACAAA TCTTCTGCTAAATGTCCTAGCACAATGCCATCACATCTGAATCGGGATAAGACTCCTTTT GGTTCTGCTTCTGTGAGTCCAAAATTTAAGTGTGGCAGTGGGCCGCAAAACAAGACACCC AAATTGGAAGAACCAGCGGAATCACATAACGCAAATGCTGAAGGTATTGACTTAAAGCGT AAGAAAACTGCATCTAAAGTTGGAACACATTCTTCGGATGAAGCAACAGAAATTGATGAA GATGAGTTTATGGATTTACTTGAAGTAATGGGAATATGTGTTAATTTGAGATTTAGAAGT CTTGCAGCTGAAGAAAAAGAGAGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAGGCCTAAAAAT CCTTCATTCATGGTCATCTTGCGGTCTTCTGACATTACTCTTCGTCATGTGTATGTGCCT GCCAGTTTTTCTCAAAAATATATAAGTAAGAATGACAAGGTTATCAAAGTACTGGATTCT GATGGAAGCAAGTGGTCCATGGCACTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTG GGAAATTTTGCAAAGAAGTTGGATGATGGAGATGTCTGTGTCTTTGAGCTTATTAGAAGG AACACACTAAAAGTTTCAGTGTTGAAGACTAAACGTAATGGTGTTAGTCATAGAAATGGA TGGGCAGAATTTTCAAGGGACAAAAACATGGAAGAAGGAGATATCTGTGTGTTTGAGCTT GTAAGAAGGGAGGACATTCGTTTGAAAGTGTCAGTATTTCATGAAACATTAGAACTGATT AAAACCACAATAGCAATCTCATCAAGCCTTTTCTTTGATCCAATTTCACTTGAAATTCCT AGAAAGTTTGCAAGGATATTTGAGGATGAACTCTCTACTGTAGTGACACTCACAGTTCCT AATGGTCGAGTTTGGCAAGTGAGGTTGATAAAAGATGGGAGAAAGATTTGGTTTAATGAT GGTTGGCATGACTTTGTACAACACAATTCAATCAGCATTGGGTACTTCTTGGTTTTCAAA TATAGAAAAAATACAAACTTTAAAGTTCTTATATTTGATACGACTGGTTGTGAGATACAA TACCCCTACAATGGTAAAGAACCAGAGAATGACAAGCAGATCTCATTACAGCAGGATGAA ACTGAGGAAGAAGTTTCTGTTAAGATAATGGACTTCGCAACTCCAAACCCAACTTTTGAC TCCCTGAAGAACAAAGCATCTGCTAAATGTCCTAGCACAATTCTACCACATCTGAATCAG GCTAAGACTCCTATTGGTTCTGCTTCTGTGAATGAAGATGAGTTTATGGATTTACTTGAA GAAATGGGAATATGTGTTAATCAGAGATATAGAAGTCTTGCAGCTGAAGAAAGAGATAGA GCAATTGCTGCTGCCAGATTGTTCAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTCATCTCACGA TCTGCTGACATTAGTCTTCGTCGTGTGTATGTGCCTGCCAATTTTTCTCACAGGTATATA AATAGGAATGAAAAAGTTATCAAAGTACTGGATTGTGATGGAAGGAAGTGGTCCATGGCA CTGGCTTGGATGCCTCGATGTTTTATAACAAAATTGGGAAATTTTGCAAAGACGTTGGAT GATGGAGACGTCAGTGTTTTTGAGCTTATTAGAAGGAACACGCTAAAAGTTTCAGTGTTG AAGACTGTGAAAAGTGAGCTGTACTATCGGTTTCTTCTTAAACTTTTGTTTACTAATATG ATCATTTTCAAGGAATGCAATCATGTGAGCCTTTCTTATATCAATTTTCAGTTCTTTTGG AATAGATCATCCAACATTATTTGGTTGATTGGAGAGGGTTCATGTCAATTTTTGTCAGAA GTTTCGGGCCATAACGTTCTGTCGTTGCTATACATGCCTCAAGTTTGTGACATGAAAAGT TACGTGCTAATTGTGATGTCAATGGTGGTATCAATCTGTGATACAAGATCACAAAGAACT ACTCAACAAATGGCTTTCAGAAAGATGGTACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTATCCTT AAGTCCACACTTGAAGACAAGAAACTGATAATTCCAGAAAAATTTGTAAGAATATTTGGG GATGAGCTCTCTGCTGTTGCGACACTCACAATGTCTAATGGTCGAGTTTGGCAAGTGGGG TTGACAAAAGCTGAGAGAAATATTTTGTTTGATGATGGTTGGCATGATTTTGTAGAGTAT CATTCAATAAATGTTGGATACTATTTGGTTTTCAAATACAAGAAGAATTCAAATTTCAAA GTTCTTATTTTTGATCCGACTGCTTGTGAGATACGATGCCCCTGTAGTGAAGACACTGAT GAGATGATGCATTTCACAACTCCAAAACCACCTTCAAACTCCTTGAAAAACAAGGCTTTT TATAAATGTCCAAGATCATCTAGCAAAGTGCAACCTCAGCCATCACAGCAGAATCGGGCT AAGCCTTCATTTGCATCCCTTGGAACTCCAAAACTTAAGTGTGGCTATGACAAGAGACGT AAAATGGAAGAACCAGAGGAGAAAGATAAACCAACTGCTGAAGGTATTGACATTAAGCTT AAAAGAACTGCATGCAAAGTTGGGGCACACTCTTCAGATAGAGCGAATAAAAAAACCAAA TGTGATAAAGATAAAGATGAGATGCTGATTTTACTTGAAGACATGGGAATATGTGTAAAT AAGAACTTTGGAAGCATTGCAGCTGAAGAGAAAGAAGGAGCAATTGCTGCTGCCAGATTG TTCAAGCCTAACAATCCTTCTTTCATGCTTATATTGCGGTCTTCTGACATTCATAACCAT CATTTTTTTGCCAGCTCATCAGCCTTACACATGCTTAATTTGTTGTGGTCATGTTTGCTT GTGCAGTATGTGCCAGCTGAGTTTGCTCACAGGTATTTCAGTAGCCCCAGGTGTCTCAAA ATGTTGGATTCTGAGGGAAGAAAGTGGCCTGTTGAAATCTCATGGTCCCCTCTATGTTAT ATAACAAGGTTGGGAGGATTTTCAAAGAAGTTGGATGAAGGTGACATCTGTGTCTTTGAG CTTATTAGCCAGAAGAAACTGCAAATTTCAATACTAAAGCCTCTAAAGAGCGAATCCTAG
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GGTTTCTTCTTAAACTTTTGTTTACTAATATGATCATTTTCAAGGAATGCAATCATGTGA GCCTTTCTTATATCAATTTTCAGTTCTTTTGGAATAGATCATCCAACATTATTTGGTTGA TTGGAGAGGGTTCATGTCAATTTTTGTCAGAAGTTTCGGGCCATAACGTTCTGTCGTTGC TATACATGCCTCAAGTTTGTGACATGAAAAGTTACGTGCTAATTGTGATGTCAATGGTGG TATCAATCTGTGATACAAGATCACAAAGAACTACTCAACAAATGGCTTTCAGAAAGATGG TACAATCCTCACATTTTTTCAAGGTTATCCTTAAGTCCACACTTGAAGACAAGAAACTGA TAATTCCAGAAAAATTTGTAAGAATATTTGGGGATGAGCTCTCTGCTGTTGCGACACTCA CAATGTCTAATGGTCGAGTTTGGCAAGTGGGGTTGACAAAAGCTGAGAGAAATATTTTGT TTGATGATGGTTGGCATGATTTTGTAGAGTATCATTCAATAAATGTTGGATACTATTTGG TTTTCAAATACAAGAAGAATTCAAATTTCAAAGTTCTTATTTTTGATCCGACTGCTTGTG AGATACGATGCCCCTGTAGTGAAGACACTGATGAGATGATGCATTTCACAACTCCAAAAC CACCTTCAAACTCCTTGAAAAACAAGGCTTTTTATAAATGTCCAAGATCATCTAGCAAAG TGCAACCTCAGCCATCACAGCAGAATCGGGCTAAGCCTTCATTTGCATCCCTTGGAACTC CAAAACTTAAGTGTGGCTATGACAAGAGACGTAAAATGGAAGAACCAGAGGAGAAAGATA AACCAACTGCTGAAGGTATTGACATTAAGCTTAAAAGAACTGCATGCAAAGTTGGGGCAC ACTCTTCAGATAGAGCGAATAAAAAAACCAAATGTGATAAAGATAAAGATGAGATGCTGA 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