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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001713 | Chr5 | 29827083 | 29830019 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001713.m1 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.30E-13 |
| LITCHI001713.m1 | 221 | 311 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.90E-15 |
| LITCHI001713.m1 | 445 | 532 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.30E-08 |
| LITCHI001713.m2 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.20E-13 |
| LITCHI001713.m2 | 209 | 299 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.70E-15 |
| LITCHI001713.m2 | 433 | 520 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.20E-08 |
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>LITCHI001713.m1 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGGTACTTCCTTTGAAACTCCAAACTTGAAGTGTCCTTATAATGCAGACTCATCA ACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGTGCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTT AGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCAAATGCATTTGAGCCATCTAATCCT TTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCTAGTATGTATATGCCAACATCCTTC TCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATTAAACTACAGCTTTCCGATGGGAAA CAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGAGCTACCTTAGGTCAAGGATGGCAT GCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGG TCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCATGTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTG AATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAACAAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCC AATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATACACAGCAAGAGATGTAAAATAGAA GAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGTGATGAGGATGAGCTTATAAAAGCT AGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAGAATGAAAGAAGTAAATTATATGAG CTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATTTCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGT ATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCTGCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAAT CCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTAGAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCA ACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCCAAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTC AATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTATGGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGA TTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAAGGAGATATCTGTATCTTTGAGCTG ATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTTTATGCGTCTACAAAGTAA >LITCHI001713.m2 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGATAATGCAGACTCATCAACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGT GCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTTAGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCA AATGCATTTGAGCCATCTAATCCTTTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCT AGTATGTATATGCCAACATCCTTCTCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATT AAACTACAGCTTTCCGATGGGAAACAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGA GCTACCTTAGGTCAAGGATGGCATGCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGAT GTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGGTCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCAT GTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTGAATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAAC AAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCCAATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATA CACAGCAAGAGATGTAAAATAGAAGAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGT GATGAGGATGAGCTTATAAAAGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAG AATGAAAGAAGTAAATTATATGAGCTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATT TCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGTATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCT GCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTA GAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCAACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCC AAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTCAATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTAT GGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGATTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAA GGAGATATCTGTATCTTTGAGCTGATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTT TATGCGTCTACAAAGTAA
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>LITCHI001713.m1 GTAAGTACAACAAGCACCTTCTTAATTTCTCTGGTAAACCAGAGGAATGGCTTTTAGCAG AAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCATTTCTTCAAGGTTAT ACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAGTTTGTGGAAAAGTT TGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGTTTTGCTTGGCATGT ACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGGCATGACTTTGTCAA ATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGAAAGGATTCAAATTT TTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTCTGTCATTATGGAAG ACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCATTGCTGCTTAATAG ACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGAAAATGTGGTACTTC CTTTGAAACTCCAAACTTGAAGTGTCCTTATAATGCAGACTCATCAACTCAATATGAAGA TGAAGAAGAAGTAAAATGCTGTGCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTTAGGACTGATGAAAG AGAAAAGGCGATTGATGCAGCAAATGCATTTGAGCCATCTAATCCTTTCTGCAGGGTTGT CGTGCAACCATCTTACATTTCTAGTATGTATATGCCAACATCCTTCTCTCAAAAGCATTT GAATGGGGTCTCAGGATTCATTAAACTACAGCTTTCCGATGGGAAACAGTGGCCTGTTCG CTGTCGATTTAGAAGACACCGAGCTACCTTAGGTCAAGGATGGCATGCATTTATATCGGA GAATAATTTGAGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGGTCGACTGACATTGT GTTGCAAGTTACTGTGTTTCATGTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTGAATCGACTGTCTCC TGGTTCTGCAGTGGGAGGTAACAAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCCAATGAGAATCCAAA ATTTAGGCATGGTGTTGACATACACAGCAAGAGATGTAAAATAGAAGAGCTGGATGTGAT TGATAAAGTTGATGCTGTAGGTGATGAGGATGAGCTTATAAAAGCTAGACATAAAGTTGA GGCACATTCTTCAGACAAAGAGAATGAAAGAAGTAAATTATATGAGCTTGAGTTGTTGGG TTTACTTGAAGACATGGGAATTTCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGTATTGCATCAGAAGA AAGAGAGAGAGCCACTGCTGCTGCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGT TATTTTGCAGGCGCATAATCTAGAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCAACCGAATTTGGTAA GATGTGGTTGAGCAGAATTTCCAAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTCAATGGAAGAGAGTG GCCTGTTATAACAGTGTGGTATGGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGATTGGCTGCACTTAT AAGGGAGAAGAATTTGGATGAAGGAGATATCTGTATCTTTGAGCTGATAACGGTGAACGA ACTTCTTAAAGTTTCAGTATTTTATGCGTCTACAAAGTAA >LITCHI001713.m2 GTAAGTACAACAAGCACCTTCTTAATTTCTCTGGTAAACCAGAGGAATGGCTTTTAGCAG AAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCATTTCTTCAAGGTTAT ACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAGTTTGTGGAAAAGTT TGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGTTTTGCTTGGCATGT ACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGGCATGACTTTGTCAA ATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGAAAGGATTCAAATTT TTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTCTGTCATTATGGAAG ACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCATTGCTGCTTAATAG ACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGAAAATGTGATAATGC AGACTCATCAACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGTGCTCCCGAAAGAAA GAGAACAGTTAGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCAAATGCATTTGAGCC ATCTAATCCTTTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCTAGTATGTATATGCC AACATCCTTCTCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATTAAACTACAGCTTTC CGATGGGAAACAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGAGCTACCTTAGGTCA AGGATGGCATGCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGA GGTCCTTAGGTCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCATGTCCTCGAAAGTGC AGAATGTGTGAATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAACAAGTTCCAGAAATG TGTTGCTTCCAATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATACACAGCAAGAGATG TAAAATAGAAGAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGTGATGAGGATGAGCT TATAAAAGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAGAATGAAAGAAGTAA ATTATATGAGCTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATTTCTGTTAGTAGGAC TTTTAGATGTATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCTGCCAGATTGTTTAA GCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTAGAAAGCCATAGTCT GTCTGTGCCAACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCCAAATGTGTTAAAGT AAAGGATTTCAATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTATGGTGAGTGTTGTTA TATAAAAGGATTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAAGGAGATATCTGTAT CTTTGAGCTGATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTTTATGCGTCTACAAA GTAA
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>LITCHI001713.m1 + Up_Stream_Len 2000 GGATCTTAAGGCTGCATTCAATAGAGCAGTTTCGAATAATATGTATACAAACTGGATGTT TCGGTTGAGAAAGCCTATTTTCGAAAAGTACAAATCTCCGGAAGATCACATTGCTCATCC ACCAAATAATGTGTCTCCAGTCGTATGGAAACTAATGGTTGACAAATGGACGGATGAAAA GTGGCAGGTAATATGTGGAAATAAACAAACTAATCTTCATATATATTTACACATTCTTAT ATATATTGATAAATTCTAAGACGGTATGTGTAGGACCTAAGCAAGAAAAACGCGAATAGT CAATCAAATGTGAAAATGCATCATACATAGGTTCAATTTCATTTGCAAAGTATAAATATG AACAGGTACTCACATACATACACATTCTTATATCATGAATGCTCACTGTTAAATCTTTGA CAAGAAAAACTCATGTTTAATTACTTTGTGGGTGTAGCTTAAAGAAAATGGAGTTGAACC TAGTCCAATTGAATGCTTTAAAAAGTTCAACATGTCAAATCCAAAGGGTGGTGGAGAGAA GTGCTGGACTACTGAGAAAGCAAAAGAATTGCATGTATGTATATAATGTCATATATACAT GTAATATATTTTTTCAAATTTTATTATGTAAGTGTACTTGTAATTATATGTTGTTACAAA TTATAATGCAGGAAAAAATGGAAACTAAGAAGAAATCAATTACTGCGAATCAAGATTCTG AAATAGATGAGTGGGATACATATCATGAAGTAGTTGGAGAAGCATCTCATGATCACATTC TTGGTATGGGAAGATGCATTAGGCTTGAGGATGTGTATGGTCCACAAGGAAGTTATAAGC GTGCTAGAGTTGATAGAACAGCAGCATTAGAAGTGAAGATTAAAAGTATGGAAGAAGAAA TGAAGCAAATGCGTGAGCTGATAAATGCATGGTCATGTTCATGATGTTTTCCAATTTTAA GCTGTAGCTTGAATCCCATGAAGGGGTTTTGGACTTGAATTGCAATCTCAAACAGCTATT TTCACATGGCAAGGACAATTATTTAGATCACTTTAGATAGTGTATCTTGTGACTTTGATT TTTATTATCCCTAGCAGTAGCTTTTAAAATGTTTAAAATATTCCAAAGCAATGAAAAAAT ATTGGATACTTAATTATAAATATTTAATATACGTATATTGGCACATCAATAGAGGTTATG CATGCGTGTTAAAATTACAAGCACTTGAAAACAGACTTTGGAAACATGCGTCAAAGAGAT GTCATCAAAGATCTACTACCAGCTGCAAAAGAATCTCTGTGAAACTGGTTAATTTTTTAA ATTATAATTTAATGTATATAGAGCCTATGCATGTTAAAAGAATCTGTTTTAAATTATAAA TTGATGTCACATATACAGGGCCTATGCATGTAAAAATTACAGCCACATTAGTATGCTTGG AGCATGTGTCAAAAAGACAAATCATGAAAGATGTACATAGAAACTAGGAGAACCAAAAAA GCTTCATTACGTCCTGTGTATATGTGTTCACCATCCTAAGTGACTTCGTGTAACTAAATG AGTTTTTCAAGTAATGATGATCCATTGTCTAAAATAGGGGTGTACGTTTTTGGATTAAGA TTGAATCAAGTTGAAAATCTTTTAACCTAATAAATTCTTCAATTCAATTCAAATTGGATT GATTTTTTCTTTTTTTTTGTTTTTTGAAAGAAGTTGAATTGAATTTAATGATTACAAAAA TATAAAAAATTTAATTGATAACTTTCATAATTTAAATAATTTAATTATAAATAAAAAAAT ATAAATAAATATTCAATGATTACGAGGAATGGCAAAATCTTGGATTTAAAAACTCCGAAT GAGAGCAGGCCAAAGTTCACCCAACGACAGTTGCTTTTTTTCTCGGGGTGTAAAATATCC AAACACTACAAAAATAAATAAAAGGTATACCTCTGTAAGTACAACAAGCACCTTCTTAAT TTCTCTGGTAAACCAGAGGA >LITCHI001713.m2 + Up_Stream_Len 2000 GGATCTTAAGGCTGCATTCAATAGAGCAGTTTCGAATAATATGTATACAAACTGGATGTT TCGGTTGAGAAAGCCTATTTTCGAAAAGTACAAATCTCCGGAAGATCACATTGCTCATCC ACCAAATAATGTGTCTCCAGTCGTATGGAAACTAATGGTTGACAAATGGACGGATGAAAA GTGGCAGGTAATATGTGGAAATAAACAAACTAATCTTCATATATATTTACACATTCTTAT ATATATTGATAAATTCTAAGACGGTATGTGTAGGACCTAAGCAAGAAAAACGCGAATAGT CAATCAAATGTGAAAATGCATCATACATAGGTTCAATTTCATTTGCAAAGTATAAATATG AACAGGTACTCACATACATACACATTCTTATATCATGAATGCTCACTGTTAAATCTTTGA CAAGAAAAACTCATGTTTAATTACTTTGTGGGTGTAGCTTAAAGAAAATGGAGTTGAACC TAGTCCAATTGAATGCTTTAAAAAGTTCAACATGTCAAATCCAAAGGGTGGTGGAGAGAA GTGCTGGACTACTGAGAAAGCAAAAGAATTGCATGTATGTATATAATGTCATATATACAT GTAATATATTTTTTCAAATTTTATTATGTAAGTGTACTTGTAATTATATGTTGTTACAAA TTATAATGCAGGAAAAAATGGAAACTAAGAAGAAATCAATTACTGCGAATCAAGATTCTG AAATAGATGAGTGGGATACATATCATGAAGTAGTTGGAGAAGCATCTCATGATCACATTC TTGGTATGGGAAGATGCATTAGGCTTGAGGATGTGTATGGTCCACAAGGAAGTTATAAGC GTGCTAGAGTTGATAGAACAGCAGCATTAGAAGTGAAGATTAAAAGTATGGAAGAAGAAA TGAAGCAAATGCGTGAGCTGATAAATGCATGGTCATGTTCATGATGTTTTCCAATTTTAA GCTGTAGCTTGAATCCCATGAAGGGGTTTTGGACTTGAATTGCAATCTCAAACAGCTATT TTCACATGGCAAGGACAATTATTTAGATCACTTTAGATAGTGTATCTTGTGACTTTGATT TTTATTATCCCTAGCAGTAGCTTTTAAAATGTTTAAAATATTCCAAAGCAATGAAAAAAT ATTGGATACTTAATTATAAATATTTAATATACGTATATTGGCACATCAATAGAGGTTATG CATGCGTGTTAAAATTACAAGCACTTGAAAACAGACTTTGGAAACATGCGTCAAAGAGAT GTCATCAAAGATCTACTACCAGCTGCAAAAGAATCTCTGTGAAACTGGTTAATTTTTTAA ATTATAATTTAATGTATATAGAGCCTATGCATGTTAAAAGAATCTGTTTTAAATTATAAA TTGATGTCACATATACAGGGCCTATGCATGTAAAAATTACAGCCACATTAGTATGCTTGG AGCATGTGTCAAAAAGACAAATCATGAAAGATGTACATAGAAACTAGGAGAACCAAAAAA GCTTCATTACGTCCTGTGTATATGTGTTCACCATCCTAAGTGACTTCGTGTAACTAAATG AGTTTTTCAAGTAATGATGATCCATTGTCTAAAATAGGGGTGTACGTTTTTGGATTAAGA TTGAATCAAGTTGAAAATCTTTTAACCTAATAAATTCTTCAATTCAATTCAAATTGGATT GATTTTTTCTTTTTTTTTGTTTTTTGAAAGAAGTTGAATTGAATTTAATGATTACAAAAA TATAAAAAATTTAATTGATAACTTTCATAATTTAAATAATTTAATTATAAATAAAAAAAT ATAAATAAATATTCAATGATTACGAGGAATGGCAAAATCTTGGATTTAAAAACTCCGAAT GAGAGCAGGCCAAAGTTCACCCAACGACAGTTGCTTTTTTTCTCGGGGTGTAAAATATCC AAACACTACAAAAATAAATAAAAGGTATACCTCTGTAAGTACAACAAGCACCTTCTTAAT TTCTCTGGTAAACCAGAGGA
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