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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001713 | Chr5 | 29827083 | 29830019 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001713.m1 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.30E-13 |
| LITCHI001713.m1 | 221 | 311 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.90E-15 |
| LITCHI001713.m1 | 445 | 532 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.30E-08 |
| LITCHI001713.m2 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.20E-13 |
| LITCHI001713.m2 | 209 | 299 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.70E-15 |
| LITCHI001713.m2 | 433 | 520 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.20E-08 |
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>LITCHI001713.m1 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGGTACTTCCTTTGAAACTCCAAACTTGAAGTGTCCTTATAATGCAGACTCATCA ACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGTGCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTT AGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCAAATGCATTTGAGCCATCTAATCCT TTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCTAGTATGTATATGCCAACATCCTTC TCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATTAAACTACAGCTTTCCGATGGGAAA CAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGAGCTACCTTAGGTCAAGGATGGCAT GCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGG TCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCATGTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTG AATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAACAAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCC AATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATACACAGCAAGAGATGTAAAATAGAA GAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGTGATGAGGATGAGCTTATAAAAGCT AGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAGAATGAAAGAAGTAAATTATATGAG CTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATTTCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGT ATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCTGCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAAT CCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTAGAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCA ACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCCAAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTC AATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTATGGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGA TTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAAGGAGATATCTGTATCTTTGAGCTG ATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTTTATGCGTCTACAAAGTAA >LITCHI001713.m2 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGATAATGCAGACTCATCAACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGT GCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTTAGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCA AATGCATTTGAGCCATCTAATCCTTTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCT AGTATGTATATGCCAACATCCTTCTCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATT AAACTACAGCTTTCCGATGGGAAACAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGA GCTACCTTAGGTCAAGGATGGCATGCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGAT GTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGGTCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCAT GTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTGAATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAAC AAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCCAATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATA CACAGCAAGAGATGTAAAATAGAAGAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGT GATGAGGATGAGCTTATAAAAGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAG AATGAAAGAAGTAAATTATATGAGCTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATT TCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGTATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCT GCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTA GAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCAACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCC AAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTCAATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTAT GGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGATTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAA GGAGATATCTGTATCTTTGAGCTGATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTT TATGCGTCTACAAAGTAA
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>LITCHI009406.m1 GenomeSequence + CCTTTAAATTTTTTCTAAATGAAATAATAATAAAAATAACAATGGTTGTAAATGTACAGT TTTTGGACAGACTGAATCCTTCAACACATGTGAAATCAAAGCGCTTGAACAACGCGTGGA CGCAAACACATCCCGACAAGATAAGGTATAAAATTGGGTAAAAACAAAGAGTACTTTACA TCCCCTAACAAGATCACCGTTCAATGAGTTGAATCAAACCAACAATCACCCGATCAACAA AAAACCAAGGGCTGTGATTGAAAACACCAAACATACAATAACATACACGAGCATATATTA ACATTTACTACGCATTAAAATAAACAAGACCAGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAAAAAGACAAGTTGTAACTCGTTAACTTGTAAACTGCTCTTTCTCTCCCTTAAATTCAT GAGAATCATCTTATAACAAGAGAAAGAGAAAAATACCCTCTCTCTCTCTGTCTGTGTTTC TCTCTAAATTTTGTTTTTTGTTTTTTTAATGTCTGTTGATTGCTTCTTGTTCTCTCAAAA TTGAAGCTCTTCAGGTTTTTCGGTTCTCTTTGTTGGCTTTTGTATGTGTTTTGTCTGAAA CCCGGAGAGAATGTCATCCGGGTTTTCGGGTGGTGGTCCGGACTACTACGCGGCAGCTCT CGCCGGCAGATCCATGAATGTTGTTGTTAATAACGGGAACGCTTCACAGCCCTCTTATCA TCATCAAAGGATGCAGCCGGGCATTTTCATGGACACCTCCTCGTCGCCTACAGCAGCGGC GGTGGCAGCTTCTCAGATCACGAACCGGGTCGGCCCGAATTGGATCGGGAAACGGACTTT CAACGATTTCCACCCACAACAACTTCAACCTCAGTTTCAACAACTACAACAACAAAATCA GGCTCCCAACAGCTTATATCTTCGGTCAGTGAAGCCGCGGACTTGTCAGAATCTCTCTCC AATCTCTCCATTACCTCCGGTGGATTTATATAACTCTTTACCAAACCGATACGGGTTCCA AAACACTCTGCTTCAACAACAACAACAACAAATACTAAAACAACAGTTACGTCCTCAACA ACAACAAAACCAACCGGTCGGGTTTGTTTCTGGTTCGGTGAACCAAATAAACCCGTATTT AAACAAACAAGTTATTGAGGTTGCAGGTCAGGACTCGGAAAAGAAGATGTTGAAGGAGTT GGAGAAACAGCTTTTCGACGATAACGATGATGATGATGGAGATGCGGTTTCCGTTATAAC AAACATGAACAGTGAGTGGGGCGAGACAATACAAAATCTCATGAGTCCGAGTCCGAAACC GGTTTCTCCGATATCTCCTTCTCCAACGACGTCGTCTTCTTCTTCTTCGTCGTCCGTGGC TTCTCCGGCCACGAGCTGTTCGAAACAGACGGTGATAGAACTGGCGACGGCGGTTTCCGA GGCGAGAAACGACGTCGCGGCAGAGATCTTAAATCGGCTGAGTCAGGCGTCGAGTTCGAG AGGGAGTTCGGAGCAGAGGTTGATGGAGTATATGAGTTCGGCGTTGAAATCGAGGATGAA TATGGTGGAGAGCCCGGCGCCAGTGGGCGAGTTATTCACTCAGCAACACGCTGAGTCGAC TCAGTCTCTGTATGATTTGTCTCCATGTTTCAAGCTCGGTTTCATGGCTGCCAATCTGGC AATTCTTGATGCTACTAGTGATTGCAACAATTTTCACGTAGTGGATTTTGATATAGGACA AGGTGGACAGTACATGAATCTCCTCTATGCGCTGGGGAAGAGGCCGAACGGGAAGCCATC CGCCGTCAGCATCACGGCGGTGGCCGACAATGGCGGAGGAGAAGAGAGGTTGAGCTTCGT AGCTGATCTGTTGACAGAAGTCGCCGAGAGAGTTGGTGTTTGTTTGAATTTCAAAGTAGT GACTTCATTAAAACTCGGCGATCTGAGTCGTGCCTCATTGGGTTGTGACGCGGACGAGCC ACTCGTTGTGAATTTCGCGTACAAGTTGTTTAGAATGCCTGACGAGAGCGTTTCGACGGA GAATCCGCGTGACGATCTCCTCCGGCGCGTGAAGGCGTTGTCGCCGCGCGTGGTGACATT AGTGGAGCAAGAGATGAATACGAATACGGCGCCGTTTTTGCACCGCGTGAGCGAGGCATG GGGTTACTATGGCGCGTTGCTTGAATCGATCGAGTCCGCGTCGAAGGACCATCAGGACCG AGTCAAGGTTGAGGAGGGACTGGGTCGTAAACTCGCTAACTCAGTTGCATGCGAAGGCAG AGACCGAGTCGAGAGATGCGAGGTGTTTGGGAAGTGGAGGGCCCGCATGAGCATGGCTGG TTTCCAGTTAAAACCAATGAGTCAGACAATCGCCGAGTCCATGCGGGCCAGACTCAATCC GCTTAATCGGGTCAACCCGGGTTTCACCGTTAAAGAAGAAAACGGAGGCGTGTGTTTCGG CTGGTTGGGTCGGACTCTCACCGTCGCGTCTGCTTGGCGTTAACTTCACTCTGTCTCTAT CTCTCTAATTTAATATTATTAATTGTTATATTTTTAATGTTTTCCTGAGAAAATTAAAAA GGGGAAAAAAAAAAATCCACCAAACGAAGTAATAAAGGCGTGTTTGGATTTGACGAAATT CTCGCTCTTTTTTTTTTTCTTTTGCATTTATTACTATTAGCGTGAGTACGTGGATTTTTG ATTTTATGAGAATTGAATTGTTTGGTGTGGTGTGTGCCCTCACATTACCAACAATGGGGG GCTCCACGAGTCAGATTATTTTTAATCAACAATTCGATCCGACGGGACAGATGGCGGGTT CTGATTGGGCAATTCGTACAACGCCGCATTCTTTGAGAGGAGAGATATGCACAACTAAGA TTATGTTGATGATACATGATAGGGTAGGGGATTCACGTGTACTTGTTTTTTGAGATTTTT GGTTTGTGTAAGGTTGAATTTGTTCACCAAACATGGTATTGTGTTTCTTTCTAAAGAATA TGTGGCTTGAAACTTGTCAACCCATGCATAATTATTTGTACATGTACATTTCTTCCCTAA TGTATCGCAATTCGCTAAGTCCTTAGTGGTACAATCTTTTATTTTAAAATATCGTTAACG TATATTACTTGTAATAGGTGCAACAATTACGACGGTTTACTGGTATATACCTTACATTTC ATGATGAAA