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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001713 | Chr5 | 29827083 | 29830019 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001713.m1 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.30E-13 |
| LITCHI001713.m1 | 221 | 311 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.90E-15 |
| LITCHI001713.m1 | 445 | 532 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.30E-08 |
| LITCHI001713.m2 | 21 | 112 | PF02362.24 | B3 | Family | 50 | 2.20E-13 |
| LITCHI001713.m2 | 209 | 299 | PF02362.24 | B3 | Family | 54.7 | 7.70E-15 |
| LITCHI001713.m2 | 433 | 520 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.5 | 3.20E-08 |
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>LITCHI001713.m1 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGGTACTTCCTTTGAAACTCCAAACTTGAAGTGTCCTTATAATGCAGACTCATCA ACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGTGCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTT AGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCAAATGCATTTGAGCCATCTAATCCT TTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCTAGTATGTATATGCCAACATCCTTC TCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATTAAACTACAGCTTTCCGATGGGAAA CAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGAGCTACCTTAGGTCAAGGATGGCAT GCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGG TCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCATGTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTG AATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAACAAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCC AATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATACACAGCAAGAGATGTAAAATAGAA GAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGTGATGAGGATGAGCTTATAAAAGCT AGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAGAATGAAAGAAGTAAATTATATGAG CTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATTTCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGT ATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCTGCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAAT CCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTAGAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCA ACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCCAAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTC AATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTATGGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGA TTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAAGGAGATATCTGTATCTTTGAGCTG ATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTTTATGCGTCTACAAAGTAA >LITCHI001713.m2 ATGGCTTTTAGCAGAAGAGAACCCTCTTCATCAAATTCTTTGACTGAGACACCCTTTCAT TTCTTCAAGGTTATACTTCCTACTAACCTTGAAGACAAGAAACTGATGATCCCGAAAAAG TTTGTGGAAAAGTTTGGGGTTGAACTTGCTGCTGTTGCAAAACTCACAGTACCTAATGGT TTTGCTTGGCATGTACGGTTGACAAAAGACGGGAAAAAGATGTGGTTTGATGATGGTTGG CATGACTTTGTCAAATATTTTTCAATCTGTGCTGGATATTTCTTGGTTTTCAGATATGGA AAGGATTCAAATTTTTATGTTCTTATATTTGACACAACTGCTTGCGAGATTCAATATCTC TGTCATTATGGAAGACCAGAAAATTGTCCAAGTTCCTCTAGCAAATTGCACACTCCACCA TTGCTGCTTAATAGACATAAGCATTCTTTTGGTCAGGCTCTAAAAATTAATAGGTCCAGA AAATGTGATAATGCAGACTCATCAACTCAATATGAAGATGAAGAAGAAGTAAAATGCTGT GCTCCCGAAAGAAAGAGAACAGTTAGGACTGATGAAAGAGAAAAGGCGATTGATGCAGCA AATGCATTTGAGCCATCTAATCCTTTCTGCAGGGTTGTCGTGCAACCATCTTACATTTCT AGTATGTATATGCCAACATCCTTCTCTCAAAAGCATTTGAATGGGGTCTCAGGATTCATT AAACTACAGCTTTCCGATGGGAAACAGTGGCCTGTTCGCTGTCGATTTAGAAGACACCGA GCTACCTTAGGTCAAGGATGGCATGCATTTATATCGGAGAATAATTTGAGGGAAGGAGAT GTTTGTGTCTTTGAGGTCCTTAGGTCGACTGACATTGTGTTGCAAGTTACTGTGTTTCAT GTCCTCGAAAGTGCAGAATGTGTGAATCGACTGTCTCCTGGTTCTGCAGTGGGAGGTAAC AAGTTCCAGAAATGTGTTGCTTCCAATGAGAATCCAAAATTTAGGCATGGTGTTGACATA CACAGCAAGAGATGTAAAATAGAAGAGCTGGATGTGATTGATAAAGTTGATGCTGTAGGT GATGAGGATGAGCTTATAAAAGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCAGACAAAGAG AATGAAAGAAGTAAATTATATGAGCTTGAGTTGTTGGGTTTACTTGAAGACATGGGAATT TCTGTTAGTAGGACTTTTAGATGTATTGCATCAGAAGAAAGAGAGAGAGCCACTGCTGCT GCCAGATTGTTTAAGCCTAAAAATCCTTCATTCATGGTTATTTTGCAGGCGCATAATCTA GAAAGCCATAGTCTGTCTGTGCCAACCGAATTTGGTAAGATGTGGTTGAGCAGAATTTCC AAATGTGTTAAAGTAAAGGATTTCAATGGAAGAGAGTGGCCTGTTATAACAGTGTGGTAT GGTGAGTGTTGTTATATAAAAGGATTGGCTGCACTTATAAGGGAGAAGAATTTGGATGAA GGAGATATCTGTATCTTTGAGCTGATAACGGTGAACGAACTTCTTAAAGTTTCAGTATTT TATGCGTCTACAAAGTAA
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>LITCHI024800.m1 ATGACAAGCTGCTCTTGTACTTTTTCCTCCATATTAACCTGTCTTTGTCCTTTTTGTCTA TCTCTCTCTCTCTCAATCTTGAATTCTTTCTCCCTTTATATTGACTTTGATCTCCTCTTT TTCATACACATCCCACAACATACTTTCAATCTTTGTGTGTGTAGTAGTGATATCATCATG TCTCCAGCATCTTCGTCAAGGTGGTGTCCAACACCAGAGCAGTTGATGATCCTAGAGGAA ATGTATAGAAGTGGGATTAGAACACCAAGCGCTTCTCAAATTCAACACATCACTGCCCAT CTTTCTTTCTATGGGAGGATTGAAGGCAAGAATGTGTTTTACTGGTTTCAAAACCACAAA GCTAGGGAGAGACAAAAGCTTAGAAGGAAGCTTGGAATACAACTTCAACGACGACAACAA CAACACTACTTCCCTCCTCACCAGTTTCATGAGTTCACTCAATCGAGCCCTCATTTGTTT CATTACTTTGGCTCTCCTGCTTCTCCATCGTTTCAACAACTTTCCTCATCCAACTCTACT AAATTTCTTCCTCTTCAGGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGATGTGAGGATGCTTCAACACAA ATGATGAATTACACGTGGAAGCTAGACATGCCAAGTGAAGGGGTTGAAACAGACAAGTCC TTGATGGGAATGTACGGCGGGCGTGATTGGATGATGATGATGGTGGATCTGCTGGCTCCA CCTCCACCACCACCGCCTTCTCCATGTTGTGCTGCAGCAGCTGCCTCTCGACCGCCTCTC AAAACCCTTGAACTCTTCCCCATCACAGCTACTAATCTCAAAGAAGAATGCAACCCCTCC AACTAATAATTAGCTATAGAATCCATCTCTCTACCTCTAAATGAGTCTTGTAACACCAAT AACTAATTACCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGGGTTCTTTCTAGCTTGTATTGCAATC TGTCTCAGTAACTCCGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGTCTTTTGAGTACTGTTATGC ATGTGTCTATGTAGGCTAGTCTGTAGACTGAGAAAGATCTAAATTGTCTAGTGATAACGA CAGTACTGGTTCTTCTTCTTCAACTGCTACAGTGCTACTATTTTTTATTGCTGTTTTTTA TTTTTCTATTTTTATATAACAATCTGC
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>LITCHI000426.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTACAACTACTTCTTAAATCATATATCTAAAGTACAAACCTTATTAACCATGAATTTATG ACAGTCTCATTCATATAAATCAAAAGATATGACTCAACAAATAAGAGTCTATAAAACACT TAGGATTAAGATCAATTCATATATGATTATCTGGTCAATAAATATGAATTTATTTGTTTA ACGAATATTAATAAAAATTTATTTTTATCATGGTCCAGTCCTATATAATATCTATTATTT AATATGCTTCCATTTAGTGTCGTCGCATGAACAATCTCGAATAAGATCATTATATCAAAT ACAAAATGGACTGCAGTTGTAGATTTACTACAACTAAAGTACCCAGCTTTGTTTACTTTC TATAAACTATTTAAATTATTGATCTCAAACTCAATTCTTTTATATATAATTTGGGACTGC ATAAGTAATCATTGATGTTACATGATATTCATATAAAGTGAACATTTCATAAATGCACAT AAATTGAATAAAAATATATTTTATTTATTATTATTTAAATATTTATAAATTACAAGCTTT TAGGACACAAATCCTAACACAGCTGAACATCACTCGATTTGGAAACCAAATTGTTGAAAG TCGATCTGGTTAACCTAAATCATCATGCAAAGATTTGGGTTGTCAAATACGATCAGAGCG ATCCAAATCATGTTTAACGACGACCTAGGCAACCAAGATATGATGTTTGGTGATGAAGAT TTTTGAATTTTTTTTTAAAAAATTATAATAGTAATGCTAATAAAAATAATAATATTATGT AATAATAATATAATAAAATTGATTAACCGTATCAAATATTTGACCTAAACCTGATTTTAA TGCTTCAAACCTACCTCAACCAGATTAATGTCTCGTCAGTTTGGGTCAAATCAAGATTCT TGTCCTCTCTAATGCTATTTTTGGAATATTAGATTTGAGACGGGTTTGAAATTTAAAATA TCTCAAACTCTTAAATACATATTTGGAGAGTAATGAGTGAGATTCCAAACTTAATCTCAA ACAAACTTCCTCAAATTCCCCTCTCAGGAAATGCTTATTCCCAACCAAAATAGTGAAATT TGATAGGTTTGAGAATGAACATTTTATCTCCATTTTTTTAAAAAAATTTTAAAGAATTTT AAAAAAAATTAATTTTAAGTATATTATAAAATATTTTCTTTAAAAAAATATATTTAAAAT ATTTAAATTAATTTTATTTCAATCTAATTCCAACCTACACAAAAGAGAGTATGATATAAT TTTAATATGATTTTAAGTTCTACTAAATATGAGACAGTAATTTTTCTATTAAATCCAATT CATTTCATTATATTCTAATTCTGCATGTTAAACGTAACGCAATTGAAATACGAGTTCGAT TGAGCCTAATGAGATAAACCACATTAAATAACTCCTACTATGATTTATTTAGGTAAGATG GGATTGGAAGCGGTGAAGCCAACCATTTTTACTAGAATTGGACATGCAAGAAAAGAAATC CCGTTGGTTGAAGACAAGGAAAGCTCATAGTGACTATATAGGGGTCCCCTTACCATATAG TATCCTCGATCCCCGAAAGATACACCTCTATAATTCCCTTTTAATCTTCTCTTCTTTTCT TCTGTTCTCTTCTCTCTCATTTTATCACAATTCACACGCAAACATTCCTCTCTCTCTGAA ACACTGAAAAAAAAAAAAAACACAAAAAGAAAAGGAAAAAACAACAAATATTCTATCTCT CATAAACCACTCTGTTTTCATTTTCATCTTTCTCATTTTCAATAAACAATTTCAAGTTTT TCAACAAACAATTGTGTGTGTGTGTCTAAAAAACTCAGATTCTTTACTTTCCTTGAAATC TCTCCAAACTCAAATCCCCTCGTTTGAAATTCAAAAACCCCACTTGTTATCGCTCTCTCT TAGGGCTTTCTCTCTTCTTTGCATAAATCACTCTCTTCCCCACCCTCCTTGATTCATACA CATATTTTGTAACCAAAAAA >LITCHI000426.m2 - Up_Stream_Len 2000 TTACAACTACTTCTTAAATCATATATCTAAAGTACAAACCTTATTAACCATGAATTTATG ACAGTCTCATTCATATAAATCAAAAGATATGACTCAACAAATAAGAGTCTATAAAACACT TAGGATTAAGATCAATTCATATATGATTATCTGGTCAATAAATATGAATTTATTTGTTTA ACGAATATTAATAAAAATTTATTTTTATCATGGTCCAGTCCTATATAATATCTATTATTT AATATGCTTCCATTTAGTGTCGTCGCATGAACAATCTCGAATAAGATCATTATATCAAAT ACAAAATGGACTGCAGTTGTAGATTTACTACAACTAAAGTACCCAGCTTTGTTTACTTTC TATAAACTATTTAAATTATTGATCTCAAACTCAATTCTTTTATATATAATTTGGGACTGC ATAAGTAATCATTGATGTTACATGATATTCATATAAAGTGAACATTTCATAAATGCACAT AAATTGAATAAAAATATATTTTATTTATTATTATTTAAATATTTATAAATTACAAGCTTT TAGGACACAAATCCTAACACAGCTGAACATCACTCGATTTGGAAACCAAATTGTTGAAAG TCGATCTGGTTAACCTAAATCATCATGCAAAGATTTGGGTTGTCAAATACGATCAGAGCG ATCCAAATCATGTTTAACGACGACCTAGGCAACCAAGATATGATGTTTGGTGATGAAGAT TTTTGAATTTTTTTTTAAAAAATTATAATAGTAATGCTAATAAAAATAATAATATTATGT AATAATAATATAATAAAATTGATTAACCGTATCAAATATTTGACCTAAACCTGATTTTAA TGCTTCAAACCTACCTCAACCAGATTAATGTCTCGTCAGTTTGGGTCAAATCAAGATTCT TGTCCTCTCTAATGCTATTTTTGGAATATTAGATTTGAGACGGGTTTGAAATTTAAAATA TCTCAAACTCTTAAATACATATTTGGAGAGTAATGAGTGAGATTCCAAACTTAATCTCAA ACAAACTTCCTCAAATTCCCCTCTCAGGAAATGCTTATTCCCAACCAAAATAGTGAAATT TGATAGGTTTGAGAATGAACATTTTATCTCCATTTTTTTAAAAAAATTTTAAAGAATTTT AAAAAAAATTAATTTTAAGTATATTATAAAATATTTTCTTTAAAAAAATATATTTAAAAT ATTTAAATTAATTTTATTTCAATCTAATTCCAACCTACACAAAAGAGAGTATGATATAAT TTTAATATGATTTTAAGTTCTACTAAATATGAGACAGTAATTTTTCTATTAAATCCAATT CATTTCATTATATTCTAATTCTGCATGTTAAACGTAACGCAATTGAAATACGAGTTCGAT TGAGCCTAATGAGATAAACCACATTAAATAACTCCTACTATGATTTATTTAGGTAAGATG GGATTGGAAGCGGTGAAGCCAACCATTTTTACTAGAATTGGACATGCAAGAAAAGAAATC CCGTTGGTTGAAGACAAGGAAAGCTCATAGTGACTATATAGGGGTCCCCTTACCATATAG TATCCTCGATCCCCGAAAGATACACCTCTATAATTCCCTTTTAATCTTCTCTTCTTTTCT TCTGTTCTCTTCTCTCTCATTTTATCACAATTCACACGCAAACATTCCTCTCTCTCTGAA ACACTGAAAAAAAAAAAAAACACAAAAAGAAAAGGAAAAAACAACAAATATTCTATCTCT CATAAACCACTCTGTTTTCATTTTCATCTTTCTCATTTTCAATAAACAATTTCAAGTTTT TCAACAAACAATTGTGTGTGTGTGTCTAAAAAACTCAGATTCTTTACTTTCCTTGAAATC TCTCCAAACTCAAATCCCCTCGTTTGAAATTCAAAAACCCCACTTGTTATCGCTCTCTCT TAGGGCTTTCTCTCTTCTTTGCATAAATCACTCTCTTCCCCACCCTCCTTGATTCATACA CATATTTTGTAACCAAAAAA
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