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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001711Chr52981368129815487+B3 domain-containing transcription factor VRN1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001711.m1158242PF02362.24B3Family45.46.30E-12
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>LITCHI001711.m1
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TCGAAATTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGTTTGTGAAATTGATTATGCATATTTT
TGTGGAGGATCAGAAGATACTGAGCAAAACTCATTGCACCCGGATGAGATGGAAAGTGAT
GACTCGGTTGAGATAATGAGCTTCACAACTCCAAACTCACCTTCCAACTCCTTGAAAAAC
AACGCGTACACTCCTCAATTGCAACTTAGAAGAGTTAAACCTTCTCTTGGTTCAGTCACG
GGAACTAATAGGAGCCTAAAAGGTGGCGCGTCCTTTAAAACTCCAAAATTTAAGCATCCT
AATAATACAGACACATCAACTCAAGATGACCTTGAAGAAGAGATAAAAGTTTATGGAAGT
TCCGCATCAAGAAAGAGGACCCTGACGGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGTTACC
AACACGTTTGAACCGTATTTTCCCTCCTCCTTTGCTAAGAAGCATCTGAGGGGGGTTTCA
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AACAAATACTTGAGCAAAGATTCCCAATGTTTCAAACTATATGATTCTAATGGAAGAGAG
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>LITCHI008344.m1
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>LITCHI008344.m1
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CTCAACGTAGAAGATTTGGAAGGGAAAGTTTGGCACTTTCGTTTGATTATCCGCAAAGGT
CAGTACAAGAAACCTATTGTTTCTTCTAGTTGGCGTAAATTCGTTACGACCAAAAAACTT
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ATGATCAAAGTGAAAAAACCGGTCAAGCTATTTAAGGTTGTTATGGGCTATCACCATTTG
TGA
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>LITCHI008344.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TCTATATATATATGTGTATATATATAAACTTTTCACTTGCTGCCATAATAAGGTCATATT
CATAGTCTCAGTGAATGAAAATTTTAAATATCTATACAGCTTTAGACAAATATTTAAATT
ATGAGTAAATTGATAACTCTTATATAAAATCCACAGGTAAAAAAGTCATAAAAGTACAGA
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TGACAAAAAAGTTTAAAAATAAAAAAATATGAGATGTGCATACGCTGTTCAATACGAAGT
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ATAGATTATTTTATTACCATTTTATAGCATTTGCTTTAATTTGGATTTTATAGGTTTTTT
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TTTGTTATACATTTTACCAAATGAAAGCTATTAAAAATAATATGGTAATAAAATTTAATA
ATTAATTACAAAATGCTATAATAGATAATAATTTCATTGCAATGCAAAAAGAATGCTATC
CTTTAGTGCTATAGAAACCAAGAATTGTTGTAGTGTATGCAAAAGTGATCATATTAATGA
TTACTTGATTCCTAAAATGTTAAGTACTGATCAACCGCTAAGTTACGGTAAACTTGAACT
TAACGTATGCTTACATCACTTGTTTGGTCCTAACACATGTTCATAAGATTGTGTGTACCA
ATTTTTCCTTCCGCACTTACTATATTTGTTTATCAAATAGAGAATCTTATTTAAGAAACT
AATTTTGGACTCATAGTATAAGAGATAAAAATTTACCGGCATAAGAGATCATACTAAATA
ATTATACACTTCCTAGTATTAAGTACCGAATAACTACTATATATGCTACATGTTTAATTA
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TAACAGTTGAAAATATCACGATTGAAGAAATGCAAATTGTGAAAAAAAATTTGCAAACCT
AATAGACCATAGCATATACTGTACAAATGCTGCTCATATATGAATCTGTTTTGTCTTTAA
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AAGTGACGGTTAGCGAAAGTCAATTGGTCTTAAATAATTCTACAAATGAAGACAAAATCA
GAATACTATTGCCTACAATGGTTATGATGCATCAAAACTTTCAACTTTCAAGGAATTAAA
ATCACAACAGAAGACATTCCAGCATTTAAACTATTCAAAAAAAAAAAAAAAGTGAGGATA
AATATGATCCCTCACTTTGTTTCTCGCTCATTCACCCTCTAATTCTCTCTCTCTTTTTCT
CTCTTTAATTACATCTCTCTAATCAGATGGAGATATGCTCAAAGAAACTAAGTAAAATAG
ATATCAAAGATCGATTGAAC
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>LITCHI003914.m2 GenomeSequence - 
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ATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAGTATTTCACGTGCGATCTTAA
ACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTTTCTTTTGGTTTCCTGAAGAA
GGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCAAACCCCCTCCAAAAAGCGAA
AAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATACACAAACACAGAGAGAGAGA
ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC
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GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA
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TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT
GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT
CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG
ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT
CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGTACTTGTTTTTCAATTCTCTACTAGT
TTAATTTTTGTTTCCTGATATATAATTTTTTTTTTTAGAATGATACTTACTAGTTTAGTT
GATAATATATGCGATAATCTCTTACAACTTTTACAGTTCAAGGATTTTCAAATTAAATAC
TAAACTAAATAGAAAAAATATTTTATACATTTTTTTAGGGTGATCAAGCATCAATAATTG
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AAGAGAAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCT
TCACATTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCAT
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TGACTACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGC
AGACTCAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCA
AAATAAGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACA
TGCGCTTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTC
TCAGTGTCAAGGTTAGTTAACCAAAGAGTTAGTCACTTTAATATCATTGTTTCGACTCTT
ACCTTCTACCTTTTTATTTTTTATATTTAAACGATTATTAATACAGTACTAGTAAAACGT
TTACAGACTCCTATAGTTAATACAGAGCAAGGATTCTTTGATAATCATTTTAAAGGAGGT
TTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTAATAATTATTATTTTTTAATTTAATGCAGGTAGAGGA
AGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTATCAGTTGCTAGGTAG
GATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAGAATTCTTCAGTGATTTTTACTTTAATTTTACC
CACTGTAATTTGGATCTCTTTTTTTACCTTCGTGAATGACCATTTGTGGGTACTTTTTAT
TTTCCCCTCTAATTAGGTTGTACCTGAAATTGCTTTATGCAATTGATGTTATTTTTACAT
TTGACATTACTGTAGAATTTGTTGTTTTGCTTTTTAGGAAATGGGTTGGTTGAGCTATTT
GGCTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTTGTCATTAGTATCTTCTTCTTTTTAATTTACTTTTT
TGGATTATGTGTTGTGTATGAGCCACAAATAGTTGCTTTGCTCTATTCAACCCATAAATA
ATCTTTCCTCAATAATTAATGTGTGCAGTTGTATATTTATGAGATAATGTTGGAATATGT
CAACGCAAAATTTCTTTGTGAATCTTTTGCTTGTGCTAATCTTTAGATAAGAAAAAACTA
AGTTCGAGTGATATATGAGAGAAAAAAATAAATCAATTTTGATCGTCCATATTTTTTTAT
GTTGATGTGTCATTAGATTATTAAAAGACCAATAAAAAAAGTAAGCAAAAAGTAGAGAAT
TGCTCTGTTTATTTGTTAACCCTGGATTAACATATAGATTGATAAATACATCACTAAGTA
ATCTGACATTGGGGTTTAGTTCTTTTGATGATGATCGATGACTCTTCATTGTCCTTGTAA
ATGTACTCTATTATTCGTCATCTTAGATAATTTATAAGTTCGATATAGCTGGAAATCGAC
CTTATATTTTATATGCCATATAAAACCAATACAAACCTTTCAAGT
>LITCHI003914.m1 GenomeSequence - 
TCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAGAGAAAAATGAAAATATTCTA
ATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAGTATTTCACGTGCGATCTTAA
ACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTTTCTTTTGGTTTCCTGAAGAA
GGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCAAACCCCCTCCAAAAAGCGAA
AAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATACACAAACACAGAGAGAGAGA
ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC
TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA
GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA
GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC
TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT
GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT
CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG
ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT
CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGTACTTGTTTTTCAATTCTCTACTAGT
TTAATTTTTGTTTCCTGATATATAATTTTTTTTTTTAGAATGATACTTACTAGTTTAGTT
GATAATATATGCGATAATCTCTTACAACTTTTACAGTTCAAGGATTTTCAAATTAAATAC
TAAACTAAATAGAAAAAATATTTTATACATTTTTTTAGGGTGATCAAGCATCAATAATTG
GAGGAGCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATA
AAGAGAAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCT
TCACATTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCAT
CATCAACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCA
TGACTACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGC
AGACTCAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCA
AAATAAGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACA
TGCGCTTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTC
TCAGTGTCAAGGTTAGTTAACCAAAGAGTTAGTCACTTTAATATCATTGTTTCGACTCTT
ACCTTCTACCTTTTTATTTTTTATATTTAAACGATTATTAATACAGTACTAGTAAAACGT
TTACAGACTCCTATAGTTAATACAGAGCAAGGATTCTTTGATAATCATTTTAAAGGAGGT
TTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTAATAATTATTATTTTTTAATTTAATGCAGGTAGAGGA
AGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTATCAGTTGCTAGGTAG
GATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAGAATTCTTCAGTGATTTTTACTTTAATTTTACC
CACTGTAATTTGGATCTCTTTTTTTACCTTCGTGAATGACCATTTGTGGGTACTTTTTAT
TTTCCCCTCTAATTAGGTTGTACCTGAAATTGCTTTATGCAATTGATGTTATTTTTACAT
TTGACATTACTGTAGAATTTGTTGTTTTGCTTTTTAGGAAATGGGTTGGTTGAGCTATTT
GGCTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTTGTCATTAGTATCTTCTTCTTTTTAATTTACTTTTT
TGGATTATGTGTTGTGTATGAGCCACAAATAGTTGCTTTGCTCTATTCAACCCATAAATA
ATCTTTCCTCAATAATTAATGTGTGCAGTTGTATATTTATGAGATAATGTTGGAATATGT
CAACGCAAAATTTCTTTGTGAATCTTTTGCTTGTGCTAATCTTTAGATAAGAAAAAACTA
AGTTCGAGTGATATATGAGAGAAAAAAATAAATCAATTTTGATCGTCCATATTTTTTTAT
GTTGATGTGTCATTAGATTATTAAAAGACCAATAAAAAAAGTAAGCAAAAAGTAGAGAAT
TGCTCTGTTTATTTGTTAACCCTGGATTAACATATAGATTGATAAATACATCACTAAGTA
ATCTGACATTGGGGTTTAGTTCTTTTGATGATGATCGATGACTCTTCATTGTCCTTGTAA
ATGTACTCTATTATTCGTCATCTTAGATAATTTATAAGTTCGATATAGCTGGAAATCGAC
CTTATATTTTATATGCCATATAAAACCAATACAAACCTTTCAAGT