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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001711 | Chr5 | 29813681 | 29815487 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001711.m1 | 158 | 242 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.4 | 6.30E-12 |
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>LITCHI001711.m1 ATGTGGAGGATTCCAGAAACTTTTGTGAGGAAATTTGGGGATGAACTGATACTAAAGAAT TCGAAATTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGTTTGTGAAATTGATTATGCATATTTT TGTGGAGGATCAGAAGATACTGAGCAAAACTCATTGCACCCGGATGAGATGGAAAGTGAT GACTCGGTTGAGATAATGAGCTTCACAACTCCAAACTCACCTTCCAACTCCTTGAAAAAC AACGCGTACACTCCTCAATTGCAACTTAGAAGAGTTAAACCTTCTCTTGGTTCAGTCACG GGAACTAATAGGAGCCTAAAAGGTGGCGCGTCCTTTAAAACTCCAAAATTTAAGCATCCT AATAATACAGACACATCAACTCAAGATGACCTTGAAGAAGAGATAAAAGTTTATGGAAGT TCCGCATCAAGAAAGAGGACCCTGACGGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGTTACC AACACGTTTGAACCGTATTTTCCCTCCTCCTTTGCTAAGAAGCATCTGAGGGGGGTTTCA GGATTCATTGAAGTACAAACTTCTGATGGAAAGCAAAGGCCTGTCCAATGTATATACAGG AAAGGCAATGCTAAGCTCACTCAAGGTTGGCATCAATTTACATTGGACAATAACTTGGGG GAAGGAGACGTTAGTGTCTTTGAGGTGCTTAGGTGGAGTGATGTTGTGCTGAAAGTTACC GTGTTTCACGTCCTGCAAAGCGCAGAATTTGCAAACCGACTGTCTTCCAATTCTGATCTG GGAGGTGATGAGAGTGAGCTTGTAAACGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCCGAT AAAGAGAATGGAAGAACTGGATTTTTTAATCTTGAATTGTTGGCTTCACTTAAAGACAAG GAAATCTATGTTGGTAGGAATTTTAGATACATTTCAACAGAAGAAAGAGAGAGAGCATCA GCTGCTGTTAGATTGTTAAAGTCTAAACATCCTTCATTTATGGTTATCTTGCAGTCATAT AACCTAAAAAATGGTGAAGTGTTCTTTTTCCTCGCGCAGTATGTGCCGTCCAAATTTGGT AACAAATACTTGAGCAAAGATTCCCAATGTTTCAAACTATATGATTCTAATGGAAGAGAG TGA
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>LITCHI001711.m1 ATGTGGAGGATTCCAGAAACTTTTGTGAGGAAATTTGGGGATGAACTGATACTAAAGAAT TCGAAATTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGTTTGTGAAATTGATTATGCATATTTT TGTGGAGGATCAGAAGATACTGAGCAAAACTCATTGCACCCGGATGAGATGGAAAGTGAT GACTCGGTTGAGATAATGAGCTTCACAACTCCAAACTCACCTTCCAACTCCTTGAAAAAC AACGCGTACACTCCTCAATTGCAACTTAGAAGAGTTAAACCTTCTCTTGGTTCAGTCACG GGAACTAATAGGAGCCTAAAAGGTGGCGCGTCCTTTAAAACTCCAAAATTTAAGCATCCT AATAATACAGACACATCAACTCAAGATGACCTTGAAGAAGAGATAAAAGTTTATGGAAGT TCCGCATCAAGAAAGAGGACCCTGACGGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGTTACC AACACGTTTGAACCGTATTTTCCCTCCTCCTTTGCTAAGAAGCATCTGAGGGGGGTTTCA GGATTCATTGAAGTACAAACTTCTGATGGAAAGCAAAGGCCTGTCCAATGTATATACAGG AAAGGCAATGCTAAGCTCACTCAAGGTTGGCATCAATTTACATTGGACAATAACTTGGGG GAAGGAGACGTTAGTGTCTTTGAGGTGCTTAGGTGGAGTGATGTTGTGCTGAAAGTTACC GTGTTTCACGTCCTGCAAAGCGCAGAATTTGCAAACCGACTGTCTTCCAATTCTGATCTG GGAGGTGATGAGAGTGAGCTTGTAAACGCTAGACATAAAGTTGAGGCACATTCTTCCGAT AAAGAGAATGGAAGAACTGGATTTTTTAATCTTGAATTGTTGGCTTCACTTAAAGACAAG GAAATCTATGTTGGTAGGAATTTTAGATACATTTCAACAGAAGAAAGAGAGAGAGCATCA GCTGCTGTTAGATTGTTAAAGTCTAAACATCCTTCATTTATGGTTATCTTGCAGTCATAT AACCTAAAAAATGGTGAAGTGTTCTTTTTCCTCGCGCAGTATGTGCCGTCCAAATTTGGT AACAAATACTTGAGCAAAGATTCCCAATGTTTCAAACTATATGATTCTAATGGAAGAGAG TGA
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>LITCHI001711.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCTTTATCAAAATTAAAACATCTCTATCTTTTAGTTCCAATCAGTAAACATATATCTTTA CAAATATGTCATCAAACAGAAATTTAGGTGAGAAGTCTAAAAATACTCTACAAAGTGCTT CATATTCGAATGAAGAGGACCAATTCCTCTACCATGTATATCTTGATGTTTTCCAAAATC CAATTATAGGCACAAACTAATCTAGTCTTCAATTTTGATCTCGCATAGAGACTGAATATC ATATGACGTTACCGACGCATATCACTCAAGTTCGACTTAGAAGATCTTTGACAGCTCAAA TACAAGTAATCAATGCAATAATTAGTAAGTTAAGAGGATGCGTTCGACAAATCGAAAATT TGAATCCAAGTGATGCTTCTGAACAAAATATTGTAAGTATTTTCTAAATTTGAGTTATGC AGATTTTATGAAATTTCTTTTATTCTAATTTTGATCTCATTTTTTATAACTTTAATTTTT AGTTGCATTGTGTAGTTAAATCAAGCCAAAGCCTTATCAACACAAGATCCAAATTATAGT AAATGATTCAAATTTGATCATGTCTGGCCCCTCCTTAAAGATACAGAGAAATATTCTGAT ATTAATAGCATGCAAACTCTAGGCCATCGAAAGAAATATGACTACACTGAAGCATCACAA TTAGACTCTATCACGTCAAAGTCTGCAAGAGTGTGATAATTTAGTATTGATTTAAATACA GACTTTGAATTTAAAGAGCAAGTTAATGATATTAATGACAATAATGTTTCAACTGAGCAG CCTATTGGGAGGAACAAAGAAAAAATGAAAAAGAAACAAGGTGAGACGATGCTACAATAT TTTAAATCCATAAAAAAAGATAGTGAACAAATAATGAGTAAGTTTAATGAAACTCAGTTT ATGTTCCAAAAGAGTTATGAACTCCAACTATTATGGGTTCAAAATGAGGCAAAAAAATTA GAGTTACGAGAACGATGCGAAGAGAATAAAATTTTACTAAAGAATATGGATTCCATAAAA GATCCAATTCTATGTGATGTTTTTCGAAGTGAACAGAAGAGAATTTATGAAAAAAGGTCC CATGAGCAACAATTTTAAGGAGAAAGCGGATCATCCAATGCATTTGACAAGTATTTTGGT GGTTATGGAGGAAGTGGAGATGACCTTCCAAATTTCTAAATAGTTGTTTAGAAGTATTTA TATCAAGTATTTTATTTTTAAGTTATGTTATTATTATTTTTTTTTTTTTTTAATCATTTA TACTTAATTTAAGGTAATGGTAATGTTAATGTTATTGCTATTTAAAACATTATTGAGTTT TTGCATTAAAAATATTACAAATTCTATCAAGTAATTATTAAAATAATATTTTATATATAC ATTAAATTATTTAATTCATTTTATATTAATATATTACTTACAATATATATATTAAAAAAC GTAAAAATATATTAAAACATATTCAATATTATACTAATTTTAAAGATTTCAATGAAATAT TTTCAACTATATAACTTTTTTTATAATAATTTAATTTCTATTTATAATTATTAATCGAAT TATACAAATACATTAAACGTGGTAAATGAACTAAATGAAATAAAAATTATTGTAGTTATT ATAAGAAGGGTATTGTTGAAATTTTGAAAAGAAAAATAGGTGCACATGGGTCCAACACCA AATTTGGTGTTGTTTACAGTTTGACACCAATGTAACATCAAAATAGTGTGGGTACACGAA AATCAAGAAAAAATTTGGTGTTTTTGTTACAGTTTGACACCATAGTATGGGTGTACGAAA ATCAAGAAAAAATTTAGTATTTTTGCTACAGTTTGACACCTTACACCAATTTTTTTATTT TATTTTTCTTACACCTATATTATTTTGATGTTATATTAGATTGGTTTTCAGTACCAATAT CAATTTGGTGTCATGTTGGAGACTGCCTTATATTCGTATTTGTATAATTTTGAATAATTC ACCTGACTATTTCTTCATTG
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>LITCHI003914.m2 GenomeSequence - TCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAGAGAAAAATGAAAATATTCTA ATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAGTATTTCACGTGCGATCTTAA ACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTTTCTTTTGGTTTCCTGAAGAA GGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCAAACCCCCTCCAAAAAGCGAA AAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATACACAAACACAGAGAGAGAGA ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGTACTTGTTTTTCAATTCTCTACTAGT TTAATTTTTGTTTCCTGATATATAATTTTTTTTTTTAGAATGATACTTACTAGTTTAGTT GATAATATATGCGATAATCTCTTACAACTTTTACAGTTCAAGGATTTTCAAATTAAATAC TAAACTAAATAGAAAAAATATTTTATACATTTTTTTAGGGTGATCAAGCATCAATAATTG GAGGAGCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATA AAGAGAAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCT TCACATTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCAT CATCAACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCA TGACTACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGC AGACTCAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCA AAATAAGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACA TGCGCTTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTC TCAGTGTCAAGGTTAGTTAACCAAAGAGTTAGTCACTTTAATATCATTGTTTCGACTCTT ACCTTCTACCTTTTTATTTTTTATATTTAAACGATTATTAATACAGTACTAGTAAAACGT TTACAGACTCCTATAGTTAATACAGAGCAAGGATTCTTTGATAATCATTTTAAAGGAGGT TTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTAATAATTATTATTTTTTAATTTAATGCAGGTAGAGGA AGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTATCAGTTGCTAGGTAG GATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAGAATTCTTCAGTGATTTTTACTTTAATTTTACC CACTGTAATTTGGATCTCTTTTTTTACCTTCGTGAATGACCATTTGTGGGTACTTTTTAT TTTCCCCTCTAATTAGGTTGTACCTGAAATTGCTTTATGCAATTGATGTTATTTTTACAT TTGACATTACTGTAGAATTTGTTGTTTTGCTTTTTAGGAAATGGGTTGGTTGAGCTATTT GGCTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTTGTCATTAGTATCTTCTTCTTTTTAATTTACTTTTT TGGATTATGTGTTGTGTATGAGCCACAAATAGTTGCTTTGCTCTATTCAACCCATAAATA ATCTTTCCTCAATAATTAATGTGTGCAGTTGTATATTTATGAGATAATGTTGGAATATGT CAACGCAAAATTTCTTTGTGAATCTTTTGCTTGTGCTAATCTTTAGATAAGAAAAAACTA AGTTCGAGTGATATATGAGAGAAAAAAATAAATCAATTTTGATCGTCCATATTTTTTTAT GTTGATGTGTCATTAGATTATTAAAAGACCAATAAAAAAAGTAAGCAAAAAGTAGAGAAT TGCTCTGTTTATTTGTTAACCCTGGATTAACATATAGATTGATAAATACATCACTAAGTA ATCTGACATTGGGGTTTAGTTCTTTTGATGATGATCGATGACTCTTCATTGTCCTTGTAA ATGTACTCTATTATTCGTCATCTTAGATAATTTATAAGTTCGATATAGCTGGAAATCGAC CTTATATTTTATATGCCATATAAAACCAATACAAACCTTTCAAGT >LITCHI003914.m1 GenomeSequence - TCCATATTAGAGAATCCTATATATACATCTTTCTTTGAAGAGAAAAATGAAAATATTCTA ATAATTATTATGTGCTTCTACCTTTCAATAAATTCCATAGTATTTCACGTGCGATCTTAA ACTATAGAGTGTAGACAATTAATTAATTATTGATTTATTTTCTTTTGGTTTCCTGAAGAA GGGCCTTTAAAAAGCTCATTTCTCCATCCAAAAACAACCAAACCCCCTCCAAAAAGCGAA AAAAAAAAAATCTCTTCTTCAAGTTAGAGAGATACACATACACAAACACAGAGAGAGAGA ATGGCACTGGAAGCAGTAGTGTACCAGCAAGATTTCTTGAACTACAATGGAAAAGAGCTC TACAACATGCTAGGAGGCAACTGGGGTTATGATCAATTTGGCCTAGAGAAACTAGAAGAA GAAGATCATCATTATCATCATCATCACCATCATCATCATCATTTTCTTGACAACCAAACA GACCAAAATAGTATCCTTCTTCATGGAGATCATCACCACCACTGGAGTCATCATGACCTC TCTTCATCACCACCACCACCACTGCCTAATTCAATGGTGCCTACTGCACATAATTTCAAT GAGCCACTTAACCACCTCTCTGATCAGCCTCCTCCTCCAACTACTACTACCACTACTCGT CCCAAACGACGCCGGTCCAAGAGCAGGAAGAACAAAGAAGAGATTGAGAACCAGAGAATG ACTCACATTGCTGTGGAGCGAAATCGAAGAAAACAAATGAATGATTATCTCTCCGTTCTT CGATCTCTAATGCCTGAATCCTACGTTCAAAGGGTACTTGTTTTTCAATTCTCTACTAGT TTAATTTTTGTTTCCTGATATATAATTTTTTTTTTTAGAATGATACTTACTAGTTTAGTT GATAATATATGCGATAATCTCTTACAACTTTTACAGTTCAAGGATTTTCAAATTAAATAC TAAACTAAATAGAAAAAATATTTTATACATTTTTTTAGGGTGATCAAGCATCAATAATTG GAGGAGCTATTAATTTCGTGAAAGAGCTAGAACATCGTCTGCAATTACTTGGAACACATA AAGAGAAGAAGGAAAAATCCGAAAATGGGTTGGAATCATCGCTACCGTTTGATGAGTTCT TCACATTTCCACAGTACTCAACCACTTCATCATCATCATCCTCAGCATCAACATCATCAT CATCAACATCAGCAGCAACCGGGTGTGAGAACTCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCA TGACTACTGAGTCCTCAACAACGAGTAGCTCTACTGACCATCATCATCAGAGCCTTATGC AGACTCAATCCGCCATAGCTGATATAGAAGTGACCATGGTGGAGAGCCACGCTAATCTCA AAATAAGATCCAAAAGGCGGTCCAAGCAGCTCCTCAAACTGGTTTCTGGCTTGCATAACA TGCGCTTCACAATCTTGCACCTCAATGTCACTACAGTTGATGAAACCGTTCTCTATTCTC TCAGTGTCAAGGTTAGTTAACCAAAGAGTTAGTCACTTTAATATCATTGTTTCGACTCTT ACCTTCTACCTTTTTATTTTTTATATTTAAACGATTATTAATACAGTACTAGTAAAACGT TTACAGACTCCTATAGTTAATACAGAGCAAGGATTCTTTGATAATCATTTTAAAGGAGGT TTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTAATAATTATTATTTTTTAATTTAATGCAGGTAGAGGA AGACTGTAGTCTGACTTCAGTGGATGACATTGCCACAGCCGTGTATCAGTTGCTAGGTAG GATTCAAGAAGATGCTCCCTTGAATTAGAATTCTTCAGTGATTTTTACTTTAATTTTACC CACTGTAATTTGGATCTCTTTTTTTACCTTCGTGAATGACCATTTGTGGGTACTTTTTAT TTTCCCCTCTAATTAGGTTGTACCTGAAATTGCTTTATGCAATTGATGTTATTTTTACAT TTGACATTACTGTAGAATTTGTTGTTTTGCTTTTTAGGAAATGGGTTGGTTGAGCTATTT GGCTCTCTCTTTCTCTCTCATTTTTGTCATTAGTATCTTCTTCTTTTTAATTTACTTTTT TGGATTATGTGTTGTGTATGAGCCACAAATAGTTGCTTTGCTCTATTCAACCCATAAATA ATCTTTCCTCAATAATTAATGTGTGCAGTTGTATATTTATGAGATAATGTTGGAATATGT CAACGCAAAATTTCTTTGTGAATCTTTTGCTTGTGCTAATCTTTAGATAAGAAAAAACTA AGTTCGAGTGATATATGAGAGAAAAAAATAAATCAATTTTGATCGTCCATATTTTTTTAT GTTGATGTGTCATTAGATTATTAAAAGACCAATAAAAAAAGTAAGCAAAAAGTAGAGAAT TGCTCTGTTTATTTGTTAACCCTGGATTAACATATAGATTGATAAATACATCACTAAGTA ATCTGACATTGGGGTTTAGTTCTTTTGATGATGATCGATGACTCTTCATTGTCCTTGTAA ATGTACTCTATTATTCGTCATCTTAGATAATTTATAAGTTCGATATAGCTGGAAATCGAC CTTATATTTTATATGCCATATAAAACCAATACAAACCTTTCAAGT