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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001710 | Chr5 | 29799573 | 29803402 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001710.m1 | 71 | 158 | PF02362.24 | B3 | Family | 55.2 | 5.30E-15 |
| LITCHI001710.m1 | 312 | 402 | PF02362.24 | B3 | Family | 47.7 | 1.20E-12 |
| LITCHI001710.m1 | 536 | 623 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.6 | 1.90E-10 |
| LITCHI001710.m2 | 30 | 113 | PF02362.24 | B3 | Family | 56.9 | 1.60E-15 |
| LITCHI001710.m2 | 267 | 357 | PF02362.24 | B3 | Family | 47.9 | 1.00E-12 |
| LITCHI001710.m2 | 491 | 578 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.8 | 1.70E-10 |
| LITCHI001710.m3 | 3 | 79 | PF02362.24 | B3 | Family | 52.5 | 3.80E-14 |
| LITCHI001710.m3 | 233 | 323 | PF02362.24 | B3 | Family | 48 | 9.50E-13 |
| LITCHI001710.m3 | 457 | 544 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.9 | 1.60E-10 |
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>LITCHI001710.m1 ATGAAGGAGAGCAAAAAGAAGTGTTTTTATACTTTTGTCACAGCAAACAACCATCTGGTT TTCTCGGCAACCAAACAATGGCTTCTAGTAGAAGAGCAGAACCCATGTCACCAAATTTTT TGGTCCAGACATCCCAGCATTTTTTCAAGATCATCCTTCCTGGTATCCTTGAAGACAAGA AACTGCTACATGCAAACAGATTTCAGTTTCATGTCCAGTAGTTTCTCAGCAAAGAAACTG GAAAGAATTCCAGAAACTTTTGTGAGGAAATTTGGGCATGAACTCTCTGATATTGTGACA CTCACGGTACCTAATGGTCGTACTTGGCGTGTGCAGTTGACAAAAGATGAGAAAAAGATT TGGTTTTATGATGGTTGGCATGACTTCGTCAAATATCATTCTATTTGTGCTGGATACTTT TTGGTTTTCAAATACAGGAAGAATTCAGATTTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGCT TGTGAAATTGATTATTCATATCTTTGTGGAGGACCAGAAGGTAATGAGCAAAACTCATTA CAACAGGATGAGATGGAAAGTGATGACTCCGTTGAGATAACGGGCTTCAGAACTCCAAAC TCACCTTGTAACTCCTTGGAAAACAAAGCTTTCGGTAAACGTCAAAGGTCTTACAACAAA GTGTATGCTCCTCAGTCACAACTTCGAAGAGAGAAACCTTCTGTTGGTTGTGTCAGGGGA ACGAATAGGAGTGGAAAATGGGGTGCTTCCTTTAGAACTTCAAAATTTAAGCATCCTAAT AATCTGGACACGTCAACTCAAGATGAACTTGGAGAAGAAATAAAAGTTTATGGAAGTTCT TCATCAATAAAGAGAACCGTGACAGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGCTGCCAAA GCGTATGAGCCTATTAATCCCTTCTGCAGGGTTGTCTTACGACCATCTTACTTAATTAGG 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ATGGCTTCTAGTAGAAGAGCAGAACCCATGTCACCAAATTTTTTGGTCCAGACATCCCAG CATTTTTTCAAGATCATCCTTCCTGGTATCCTTGAAGACAAGAAACTGAGAATTCCAGAA ACTTTTGTGAGGAAATTTGGGCATGAACTCTCTGATATTGTGACACTCACGGTACCTAAT GGTCGTACTTGGCGTGTGCAGTTGACAAAAGATGAGAAAAAGATTTGGTTTTATGATGGT TGGCATGACTTCGTCAAATATCATTCTATTTGTGCTGGATACTTTTTGGTTTTCAAATAC AGGAAGAATTCAGATTTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGCTTGTGAAATTGATTAT TCATATCTTTGTGGAGGACCAGAAGGTAATGAGCAAAACTCATTACAACAGGATGAGATG GAAAGTGATGACTCCGTTGAGATAACGGGCTTCAGAACTCCAAACTCACCTTGTAACTCC TTGGAAAACAAAGCTTTCGGTAAACGTCAAAGGTCTTACAACAAAGTGTATGCTCCTCAG TCACAACTTCGAAGAGAGAAACCTTCTGTTGGTTGTGTCAGGGGAACGAATAGGAGTGGA AAATGGGGTGCTTCCTTTAGAACTTCAAAATTTAAGCATCCTAATAATCTGGACACGTCA ACTCAAGATGAACTTGGAGAAGAAATAAAAGTTTATGGAAGTTCTTCATCAATAAAGAGA ACCGTGACAGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGCTGCCAAAGCGTATGAGCCTATT AATCCCTTCTGCAGGGTTGTCTTACGACCATCTTACTTAATTAGGAAGCCAAGTACTATG TATTTTCCATCCTACTTTGCTAAAAAGCACCTGAAGGGGTTTTCAGGATTCATTAGACTA CAAACTTCTGATGGGAAGCAAAGGCCTGTCCGATGTGTATGTAGGGGAGACAGTGCTACC 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>LITCHI009025.m1 AAAACAGCCACCAATGGCATGGAAGCGAGTTCACATTGCAGCAAAAATAAAGCAGTCAAG ATAAAAGCATCACATGGGCAGATCTGTCTCACACTAGAGTTGATTCATTTTTTTTTTTGA TACACTACTCTGCCAAAGCATGTTTGCATTCCAACTCCAAATTCCATTATAAGTTTTTCT CTCATCAACCAAGAACATTACAATTGATCTAAAGTTACTTCTGATTAGCTAATATATATA TATATATATATTCTCTTTTTCATAATTAAGACTAGCCTTGGGTTCCACCCCCACCCCCAC AAAGTTCCCATCTACCTCCATCTTCTTGTCTTTGTATATGTATTCCCTCTAGACTACAAG TCCAACCCAGAAAAGAAAAGAGAACATTTTTCCATAAAAGCTGAACTGAATTTCCATTAA ATTTTACACTTTTCAATCTTTGGCACTCTACCTAGATCTTGTTTTTGTATAACCACTTGA AAGAATCAAACTTTGCATGAAATGAGAACCACCCACATGCTGAGACTAGTCTTTGGACTA ATTGCAGCAGCTGTTTCGATCATTGCAATACTAGTTTTCTTCTTCTACTACCGCAAAAGA GCTTTGAAAAGTGAGAAGAATGACTTGGAGAAGAACAATGAGCTGAGAAATGGAGAAGAG GAGAAGCAGAGAGAGGATCTGGTCACGTTCCAAGGAGGAGAAAACCTCACAATATGTGAC ATCCTTGATGCTCCTGGTGAAGTCATAGGTAAGTCCAACTATGGCACTTTGTACAAGGCC TTGTTGCAGAGGAGCTGTGCAGTGAGGTTGCTTAGGTTCTTGAGGCCGGTTTGTACTACT AGTGACAAAGAGTTTGGTGACTTGATTGAGTTGTTGGGGTGCATTAGGCATCCAAATTTG GTTCCTGTTCTGGGATTTTATGCTGGGCCGAGAGGTGAGAAGCTCCTTGTCCATCCATTT TACAATCGTGGAAATTTGGCTCAGTTTATCAGAGGTGGAAATGTTGAGTCTCACAAATGG AACATCATTTATAGGATCTCGGTTGGTATTGCCGAGGGATTGGATCATCTTCATACAGGG TTGCATAAGCCTGTTATTCATGGGAATCTTAAGTCGAAGAACATATTACTGGATCGCAAT TGCCAGCCGTTTGTCTCAGATTTTGGTCTACATTTTCTTTTGAATCCTACCACTGGGCAA GAAATGCTCGAAGTGTCAGCATCTGAGGGCTATAAAGCTCCTGAGCTTATCAAAATGAAG GATGCAAATGAAGAGACGGATATTTATAGTTATGGGGTAATCTTGCTTGAACTACTTTCT GGTAAAGAACCAATCAATGAGAACCCAACTCCAGATGAGGATTTTTATCTCCCAAATTTC ATGCGAAGTGCAGTTCTTGACCATAGGATTGCAGATTTGTACCATCCAGACCTGCTTTTA AGCAACAACAGTAGTCATGAATATCCAGTCACTGAAGAACGCATTCTCAAACTCTTTCAG CTTGCCATGGCTTGTTGTTCTCCTTCCCCTTCTCTTAGGCCAAACATAAAACAAGTCCTC CGGAAGCTCGAAGAAATCGGAAAATAG
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>LITCHI009025.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTGAAGGCAGAGTGTTGCTTCCATTTTTAGGTAGACTAATGTTGGTTAAATTTCTTGAA GTGTTGTGTTGTAGCAATCAAGCAATGTTGTTGTCGTCGTCGTTGTTTTTTTTTTTTTTT TGGATCAGCATAGGGTGTTGTCAGAATCAGTTGTATTTTGACTTTGAGATATAATTTGGA GATTAACTTGCAAAAGACAGGAAGAAGTAACTTGCCTGCATGAGAGAGCTACCTATATGC ATAGGGTAAATACCTATATAAGTGAAACTTAAGTGGGTTTAACCCATGATCTCTAACATG GTATTACTACTATGCCATAGCCTTTTTCTCAAGCAAGCAATATTTTAATATGGCCAACAA AGTGAAGATAAGTAGAGAAAATGGAACAATGAACGAAAGCTATTTCTATGGAATGATTTT TCACCAAACAATTACTAACATTAACTGCATTTTTAATCATGCTATCACGTTGTAAGCTGT AACTAAAAATCGTACAGTCATCAATTTCATTGAATTCTTCTTAGCTAACGAGGTTGGTAC ATGACTTGATGTCTTGGTAATGAAAACTGAAAATTTTGTTGGGTATTAATATTTTTTAGG AAATTACCAGGAAACTTTTTGTGCTTTTTTACATATTAATGTATTTAAATAAGATAAATC AAATCGTTTATTTGAAGATTGATAGTTTCCAATAAGTGTTTTAAGTGTAGAGCATGATGT ATAAACACAAAATTTTGTTGGAATAAATTAAATTTTCGTGAAAATAAAAGAAAAAAAATT ATTTAGTCAAAAAGAAAAGTTTAAAGAAATTCCAATAGTTTTAATTCATTTTCAGCATAC AAATATTAAACATTTTAAGTAAAATATTGTATATGAAATGTTTTCAGTTGGAAACATTTT ATGTATGACACATAAAATGTTTTATAGGCTAAAAACGGATTGAAAACAAGTAAAATTTCA ATAGAGATAAAAAATGAATAATTTTTTCTTTTGAGTCAAAAACAAATTTCCATTTTTTAT TTGGAGATACTTCTTTTATAATTTTCACATTTACTTTTACTTATTTATAAATCAATAAAA CCAAATAGAGTTTTGAAGATCTTAACCATGTTCTATTTTATACTAATAACACAGATCTGA AAAGAAAAAAACTTTAAAATATGTACACATAAAAATAGATTTATCATATGAGCACCAACT TTATTTTTTAGAATTTTGATTTTTCAAAACTATAACATGATGTGATTGATAATGAAGAGG TATAATGAAAATTAATGTTAAAAAAAATCAAATTAATATTGATCACAACCCTTACCAAAC TCTGATGATGACCATAATAGTTTCGATCACGACAACAATTTTAACAAATTTTGATTATAG ATAATATCTAGAATGGTAAGAAGATAAGGACTCATGAGTAACTTTTACTCATGAATTAAC TTTTACTTCAAAATAAATCAAGTTGATGTAGTGTGAAAGAAAACCATACCAAAGTGTTTA AAACAGCCACCAATGGCATGGAAGCGAGTTCACATTGCAGCAAAAATAAAGCAGTCAAGA TAAAAGCATCACATGGGCAGATCTGTCTCACACTAGAGTTGATTCATTTTTTTTTTTGAT ACACTACTCTGCCAAAGCATGTTTGCATTCCAACTCCAAATTCCATTATAAGTTTTTCTC TCATCAACCAAGAACATTACAATTGATCTAAAGTTACTTCTGATTAGCTAATATATATAT ATATATATATTCTCTTTTTCATAATTAAGACTAGCCTTGGGTTCCACCCCCACCCCCACA AAGTTCCCATCTACCTCCATCTTCTTGTCTTTGTATATGTATTCCCTCTAGACTACAAGT CCAACCCAGAAAAGAAAAGAGAACATTTTTCCATAAAAGCTGAACTGAATTTCCATTAAA TTTTACACTTTTCAATCTTTGGCACTCTACCTAGATCTTGTTTTTGTATAACCACTTGAA AGAATCAAACTTTGCATGAA
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>LITCHI005774.m14 GenomeSequence - ACTTTTTGAAGCAACAGAAAAACAATAAATTACAAGACTGAGACAGGGCACACGACGCTG ACGTGTCATACAATCAATCGCAGACGACAGTCTTCTCATTTGTACAGGGGAAAAAAAAAA AAAGTGCAACGCAGCACCACTAATCCCTTCCGGTTATTCTTCAACAGCAGCTACTTCGTC TTGTCTTCTGCTCCACTGCGAGTCGCCTTTACGGACCTCTGTACGGTCAACCAACACTCG ATCACTCTCTCTTTCCAGCATTTTTACATTCCAGTAAACTTTTCCGAGAATTCGGCGATG ATAAGATAAGGTACGCGCTTTATTATTTTATTTTTCTTTTTTAATTTATTTGAGGATGTG TTGTCGTTTTCATCAACAGAGACCGAATCTGTTCTCTGTTCCAGCATCCATTTCCATATC CAAATCTCATTTTTTAACATAAAACGAAAAAAATCAAAGCAATTTCTTATTCCAAAAGAC CAGCTCAATTTGTCCACTTGACATCTTCTCTCTTGGCTCATTCGCGTGTGTTTGTGCTTC TCTATCTCTATATATAATATAATAACAATAGAGAGAGAGAGAGCGCTGCACAGAGGCTTA TATATTCTTGTCTTTGCAGGTTGCTTAGACCTCCTCTTTGCGACCTGCAACCGGTTTTTA TCTTGCGGTGGTTGTCCAACAACATAACACTAAGGTACGGATTTTTTTTTGGCTGATTAA TTATTTTGTGGAATTTTGTTTTAATTGAAGCCTCATGGATTCTAGAGATTAGTATGTGAA GTTGATTGTGGATTTGTTAAATCTTTTGTTGAATTTACAAATTTTGAAGCTGCTTGCTTT TGTTGTGTATAGAATAGTCTATAAGTTCCGGTGCTGAAATGAAAGCTAAAAATGTTATTG 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