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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001710 | Chr5 | 29799573 | 29803402 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001710.m1 | 71 | 158 | PF02362.24 | B3 | Family | 55.2 | 5.30E-15 |
| LITCHI001710.m1 | 312 | 402 | PF02362.24 | B3 | Family | 47.7 | 1.20E-12 |
| LITCHI001710.m1 | 536 | 623 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.6 | 1.90E-10 |
| LITCHI001710.m2 | 30 | 113 | PF02362.24 | B3 | Family | 56.9 | 1.60E-15 |
| LITCHI001710.m2 | 267 | 357 | PF02362.24 | B3 | Family | 47.9 | 1.00E-12 |
| LITCHI001710.m2 | 491 | 578 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.8 | 1.70E-10 |
| LITCHI001710.m3 | 3 | 79 | PF02362.24 | B3 | Family | 52.5 | 3.80E-14 |
| LITCHI001710.m3 | 233 | 323 | PF02362.24 | B3 | Family | 48 | 9.50E-13 |
| LITCHI001710.m3 | 457 | 544 | PF02362.24 | B3 | Family | 40.9 | 1.60E-10 |
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>LITCHI001710.m1 ATGAAGGAGAGCAAAAAGAAGTGTTTTTATACTTTTGTCACAGCAAACAACCATCTGGTT TTCTCGGCAACCAAACAATGGCTTCTAGTAGAAGAGCAGAACCCATGTCACCAAATTTTT TGGTCCAGACATCCCAGCATTTTTTCAAGATCATCCTTCCTGGTATCCTTGAAGACAAGA AACTGCTACATGCAAACAGATTTCAGTTTCATGTCCAGTAGTTTCTCAGCAAAGAAACTG GAAAGAATTCCAGAAACTTTTGTGAGGAAATTTGGGCATGAACTCTCTGATATTGTGACA CTCACGGTACCTAATGGTCGTACTTGGCGTGTGCAGTTGACAAAAGATGAGAAAAAGATT TGGTTTTATGATGGTTGGCATGACTTCGTCAAATATCATTCTATTTGTGCTGGATACTTT TTGGTTTTCAAATACAGGAAGAATTCAGATTTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGCT TGTGAAATTGATTATTCATATCTTTGTGGAGGACCAGAAGGTAATGAGCAAAACTCATTA CAACAGGATGAGATGGAAAGTGATGACTCCGTTGAGATAACGGGCTTCAGAACTCCAAAC TCACCTTGTAACTCCTTGGAAAACAAAGCTTTCGGTAAACGTCAAAGGTCTTACAACAAA GTGTATGCTCCTCAGTCACAACTTCGAAGAGAGAAACCTTCTGTTGGTTGTGTCAGGGGA ACGAATAGGAGTGGAAAATGGGGTGCTTCCTTTAGAACTTCAAAATTTAAGCATCCTAAT AATCTGGACACGTCAACTCAAGATGAACTTGGAGAAGAAATAAAAGTTTATGGAAGTTCT TCATCAATAAAGAGAACCGTGACAGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGCTGCCAAA GCGTATGAGCCTATTAATCCCTTCTGCAGGGTTGTCTTACGACCATCTTACTTAATTAGG 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ATGGCTTCTAGTAGAAGAGCAGAACCCATGTCACCAAATTTTTTGGTCCAGACATCCCAG CATTTTTTCAAGATCATCCTTCCTGGTATCCTTGAAGACAAGAAACTGAGAATTCCAGAA ACTTTTGTGAGGAAATTTGGGCATGAACTCTCTGATATTGTGACACTCACGGTACCTAAT GGTCGTACTTGGCGTGTGCAGTTGACAAAAGATGAGAAAAAGATTTGGTTTTATGATGGT TGGCATGACTTCGTCAAATATCATTCTATTTGTGCTGGATACTTTTTGGTTTTCAAATAC AGGAAGAATTCAGATTTTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGCTTGTGAAATTGATTAT TCATATCTTTGTGGAGGACCAGAAGGTAATGAGCAAAACTCATTACAACAGGATGAGATG GAAAGTGATGACTCCGTTGAGATAACGGGCTTCAGAACTCCAAACTCACCTTGTAACTCC TTGGAAAACAAAGCTTTCGGTAAACGTCAAAGGTCTTACAACAAAGTGTATGCTCCTCAG TCACAACTTCGAAGAGAGAAACCTTCTGTTGGTTGTGTCAGGGGAACGAATAGGAGTGGA AAATGGGGTGCTTCCTTTAGAACTTCAAAATTTAAGCATCCTAATAATCTGGACACGTCA ACTCAAGATGAACTTGGAGAAGAAATAAAAGTTTATGGAAGTTCTTCATCAATAAAGAGA ACCGTGACAGCTGTTGAAAGAGAAAGGGCACTTAATGCTGCCAAAGCGTATGAGCCTATT AATCCCTTCTGCAGGGTTGTCTTACGACCATCTTACTTAATTAGGAAGCCAAGTACTATG TATTTTCCATCCTACTTTGCTAAAAAGCACCTGAAGGGGTTTTCAGGATTCATTAGACTA CAAACTTCTGATGGGAAGCAAAGGCCTGTCCGATGTGTATGTAGGGGAGACAGTGCTACC 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>LITCHI001710.m1 MKESKKKCFYTFVTANNHLVFSATKQWLLVEEQNPCHQIFWSRHPSIFSRSSFLVSLKTR NCYMQTDFSFMSSSFSAKKLERIPETFVRKFGHELSDIVTLTVPNGRTWRVQLTKDEKKI WFYDGWHDFVKYHSICAGYFLVFKYRKNSDFHVLIFDKTACEIDYSYLCGGPEGNEQNSL QQDEMESDDSVEITGFRTPNSPCNSLENKAFGKRQRSYNKVYAPQSQLRREKPSVGCVRG TNRSGKWGASFRTSKFKHPNNLDTSTQDELGEEIKVYGSSSSIKRTVTAVERERALNAAK AYEPINPFCRVVLRPSYLIRKPSTMYFPSYFAKKHLKGFSGFIRLQTSDGKQRPVRCVCR GDSATLTQGWYEFALENNLEEGDVCVFEVLTLSDIVLKVTVFHVLESAEFANRLSSNFSQ GGNKFQRDVSSYKNPEFRLGVDIRSKRCKIEELDMINECDAVGDESELIKARHNAEAHSS AKENRRTEFYNLQLLASLKDQEIYVGRNFRYISTEERERASAAVRLLEPKHPSFMVILQP YNLQCRVVYVPSKFGDKYLSRDSKCIKLRDSSEREWPQRLIFRHGFCIKGLTSFNRDNNL DEGDVCIFELIKVEEPLLKVSVFCASTK. >LITCHI001710.m2 MASSRRAEPMSPNFLVQTSQHFFKIILPGILEDKKLRIPETFVRKFGHELSDIVTLTVPN GRTWRVQLTKDEKKIWFYDGWHDFVKYHSICAGYFLVFKYRKNSDFHVLIFDKTACEIDY SYLCGGPEGNEQNSLQQDEMESDDSVEITGFRTPNSPCNSLENKAFGKRQRSYNKVYAPQ SQLRREKPSVGCVRGTNRSGKWGASFRTSKFKHPNNLDTSTQDELGEEIKVYGSSSSIKR TVTAVERERALNAAKAYEPINPFCRVVLRPSYLIRKPSTMYFPSYFAKKHLKGFSGFIRL QTSDGKQRPVRCVCRGDSATLTQGWYEFALENNLEEGDVCVFEVLTLSDIVLKVTVFHVL ESAEFANRLSSNFSQGGNKFQRDVSSYKNPEFRLGVDIRSKRCKIEELDMINECDAVGDE SELIKARHNAEAHSSAKENRRTEFYNLQLLASLKDQEIYVGRNFRYISTEERERASAAVR LLEPKHPSFMVILQPYNLQCRVVYVPSKFGDKYLSRDSKCIKLRDSSEREWPQRLIFRHG FCIKGLTSFNRDNNLDEGDVCIFELIKVEEPLLKVSVFCASTK. >LITCHI001710.m3 MQRIPETFVRKFGHELSDIVTLTVPNGRTWRVQLTKDEKKIWFYDGWHDFVKYHSICAGY FLVFKYRKNSDFHVLIFDKTACEIDYSYLCGGPEGNEQNSLQQDEMESDDSVEITGFRTP NSPCNSLENKAFGKRQRSYNKVYAPQSQLRREKPSVGCVRGTNRSGKWGASFRTSKFKHP NNLDTSTQDELGEEIKVYGSSSSIKRTVTAVERERALNAAKAYEPINPFCRVVLRPSYLI RKPSTMYFPSYFAKKHLKGFSGFIRLQTSDGKQRPVRCVCRGDSATLTQGWYEFALENNL EEGDVCVFEVLTLSDIVLKVTVFHVLESAEFANRLSSNFSQGGNKFQRDVSSYKNPEFRL GVDIRSKRCKIEELDMINECDAVGDESELIKARHNAEAHSSAKENRRTEFYNLQLLASLK DQEIYVGRNFRYISTEERERASAAVRLLEPKHPSFMVILQPYNLQCRVVYVPSKFGDKYL SRDSKCIKLRDSSEREWPQRLIFRHGFCIKGLTSFNRDNNLDEGDVCIFELIKVEEPLLK VSVFCASTK.
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>LITCHI001710.m1 CAAAATTATACATGATGTTTTGTTCTTTTGAGAGGCAATACCGGACAAGATTCCCCCTCT TTAGTGCTTGTCTGATTGTCTGAAAAAGTTAACTGGATAGACTTTTAGTGCTTTTCACTT GGGGAAAAGTCAAAGCAAACATTCATCACATGAAGGAGAGCAAAAAGAAGTGTTTTTATA CTTTTGTCACAGCAAACAACCATCTGGTTTTCTCGGCAACCAAACAATGGCTTCTAGTAG AAGAGCAGAACCCATGTCACCAAATTTTTTGGTCCAGACATCCCAGCATTTTTTCAAGAT CATCCTTCCTGGTATCCTTGAAGACAAGAAACTGCTACATGCAAACAGATTTCAGTTTCA TGTCCAGTAGTTTCTCAGCAAAGAAACTGGAAAGAATTCCAGAAACTTTTGTGAGGAAAT TTGGGCATGAACTCTCTGATATTGTGACACTCACGGTACCTAATGGTCGTACTTGGCGTG TGCAGTTGACAAAAGATGAGAAAAAGATTTGGTTTTATGATGGTTGGCATGACTTCGTCA AATATCATTCTATTTGTGCTGGATACTTTTTGGTTTTCAAATACAGGAAGAATTCAGATT TTCATGTTCTTATATTTGATAAAACTGCTTGTGAAATTGATTATTCATATCTTTGTGGAG GACCAGAAGGTAATGAGCAAAACTCATTACAACAGGATGAGATGGAAAGTGATGACTCCG TTGAGATAACGGGCTTCAGAACTCCAAACTCACCTTGTAACTCCTTGGAAAACAAAGCTT TCGGTAAACGTCAAAGGTCTTACAACAAAGTGTATGCTCCTCAGTCACAACTTCGAAGAG AGAAACCTTCTGTTGGTTGTGTCAGGGGAACGAATAGGAGTGGAAAATGGGGTGCTTCCT TTAGAACTTCAAAATTTAAGCATCCTAATAATCTGGACACGTCAACTCAAGATGAACTTG 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