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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001705 | Chr5 | 29728849 | 29732503 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001705.m1 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.6 | 5.40E-12 |
LITCHI001705.m1 | 251 | 341 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.50E-18 |
LITCHI001705.m2 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.4 | 6.30E-12 |
LITCHI001705.m2 | 285 | 375 | PF02362.24 | B3 | Family | 64 | 1.00E-17 |
LITCHI001705.m3 | 250 | 340 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.40E-18 |
LITCHI001705.m4 | 218 | 308 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
LITCHI001705.m5 | 216 | 306 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
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>LITCHI001705.m1 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGATGGAGGATCTCAAAAG GCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCT CAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCA GCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCA TTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGG TGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACATCTAAATGGGGTGTCAGGGTTC ATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGTCTGTATAGAGGAGGC AGAGCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGA GATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTC CGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG >LITCHI001705.m2 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGGTTATGGTAATTCTCAA GTTGGAAATCAATCTACTCGGGATATAGGTGTTCAGTTTGATATTGCTGAGCTTAAGAAT TCATTAAATGCATTGTATTCTCCAGATGGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGG AAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAA GAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTG ACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCT 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