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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001705Chr52972884929732503+B3 domain-containing transcription factor VRN1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001705.m1695PF02362.24B3Family45.65.40E-12
LITCHI001705.m1251341PF02362.24B3Family64.28.50E-18
LITCHI001705.m2695PF02362.24B3Family45.46.30E-12
LITCHI001705.m2285375PF02362.24B3Family641.00E-17
LITCHI001705.m3250340PF02362.24B3Family64.28.40E-18
LITCHI001705.m4218308PF02362.24B3Family64.57.00E-18
LITCHI001705.m5216306PF02362.24B3Family64.57.00E-18
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>LITCHI001705.m1
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AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT
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TTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGG
TGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACATCTAAATGGGGTGTCAGGGTTC
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GATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTC
CGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG
>LITCHI001705.m2
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AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT
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TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG
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AAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAA
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ACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCT
TTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGGTGTATTATGTATTTGCCA
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GGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAG
GTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTCCGTGTCATGGAAGGTGCA
GGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG
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AGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTT
GAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGGTGT
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AAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGTCTGTATAGAGGAGGCAGA
GCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGAGAT
GTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTCCGT
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TCCAAATATAATAACAGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGGT
TATGATGGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCT
AACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTT
AGATTTTATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGA
GCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGA
CCATCTTACTTATATAGAGGGTGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACAT
CTAAATGGGGTGTCAGGGTTCATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTC
CGATGTCTGTATAGAGGAGGCAGAGCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTG
GAGAACAATTTGGGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTT
GTGCTGAAAGTTACTGTGTTCCGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCA
CATTAG
>LITCHI001705.m5
ATGGCTGCTACACTTACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCT
GACAACAAAGTCTGGTTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGT
GTTGGATACTTTTTGGTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTT
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GATCGGCTGACACTGAACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGT
TCCAAATATAATAACAGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGAT
GGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAAT
CCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTT
TATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATT
AATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCT
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GGGGTGTCAGGGTTCATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGT
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AATTTGGGGGAAGGAGATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTG
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>LITCHI022184.m1
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>LITCHI022184.m2
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YKTLQMQFYDIVQQEAKKPPTDSSNDHQEMEEPSDDLVSLSLGRSSSDSKKEEKNKTPCH
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PSCPVRKQVQRWAEDMSILITTYEGNHNHPLPVSATAMASTTSAAASMLLSGSSSSSSHL
GASASSTANLHGLNFYLSDSSKSRQFYLPNSSLSNHSHPTITLDLTTSSSSSHFGRFTTA
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>LITCHI022184.m1
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AAGCAAAGAAACCACCAACAGACTCATCTAATGATCACCAAGAAATGGAAGAACCATCTG
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TAGACTACAAATTCGAAGCATCTAAATCAGACGCAACTAAACCTTTGCCGAATCCGAGCC
CGGAGAACAGTTCAGAAGATCATGATCAGCCTAAGGAAGAAGCTGGGGAGACCTGGCCAC
CTAGTAAAGTTCTCAAGATTATGAGGAATGGAGAAGATGAAATTTTGCAACAAAACTCGG
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GCCAATGGAGGAAATATGGACAAAAAATTGCCAAAGGAAACCCGTGCCCTCGAGCTTACT
ATCGTTGCACTGTTGCTCCTTCATGTCCAGTGAGAAAACAGGTGCAAAGATGGGCCGAGG
ACATGTCCATTTTGATCACAACCTATGAAGGAAACCATAACCACCCACTTCCTGTCTCAG
CCACTGCTATGGCTTCCACCACTTCTGCAGCTGCTTCCATGCTGTTGTCTGGCTCGTCGT
CATCAAGCTCACACCTCGGTGCAAGTGCATCATCCACCGCTAATCTCCATGGACTCAACT
TCTATCTCTCCGATAGCTCGAAATCAAGGCAATTCTATCTGCCAAATTCTTCGTTATCAA
ATCATTCACACCCAACAATCACTCTTGACCTCACCACTTCCTCATCATCATCACATTTTG
GTAGGTTTACTACTGCCAATTATCCACCAAATCCAAGATACAACTCCTCCACAACAAGTC
TCAACTTTGGTTCCTCAGAATCCAATAACTCAATGCCATGGGGTAGTAGTGGTTTGTTAA
GCTATGGTGGTGGTACTACTCAACCCTACATTAAAAACCAAATTGGAACTCTAAACCTAG
GAAAACAACAAACGTTGATGGACAACATTATCTATCAGTCCTACATCCAAAAGAACAACC
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TTGGACAAAAACTTAAGTGGGTTGAGCAATTTCCGCTATCTTCTGGATACTCATCACAAG
CTGTATTGAAAGGTAACACTAACGGTTGTGCTTCAAGCTTCTTGAACAAATCATCTACCA
CAACGAATAATTCTCAGCCAGGAAGTCTGATTTTTCTGCAACCTGCATCGTTATCATTTT
CCAACTCTAGGAGTACTTCCTCGTCTCCCGGAGATAAGGAGCATAACCGATGAAGGATTT
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CGTAAATATATTTAGTCGTCTATCAGAAAGATTTTTCCTTGCATATGATGATTAGTCTAT
GAGTTACTTTCGTTTCAATGATGTATAAAGAAATTGTGCATGCAAATGGTGACAGATAGC
CAACTATATTTGGCAC
>LITCHI022184.m2
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CTACAAGGAATATTATAAAGTTATATTATAGAGAGAGAGTTGTAATATAGTAATTCGTTT
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AAATGAGTCAAATACTGTTGGCTCTCTTCTATAAAAGAATAGTACAATAAATTTTTGAGA
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AGATCTGATCCACACAGAAGTCGTGAAATCAACGAAGAGAATAGACTTGATTCTGCTCAT
CCTGATAAGGAAGAGAGTTCTGTTGTTAAGATTGGAAACAAAAGACCATACAAGGAGAAC
AATGATGAGAATCCATCTTCACCTAAACAAAAGCATCTATGCTCCACCAAGCAGGAACCT
GTTGTTCAAAAACCCACGACGGGACCTGATCACACAAGAGCATCTTCTTCAAGCCAAAAG
AAAGATCAGGATGATCAGCTAGAATCCGCTAGAGCCGAAATGGGTGAAGTAAGAGAAGAA
AATCAAAGGCTGAAGATGTACTTAGATAGAATAATGGAGGATTACAAGACTCTTCAAATG
CAATTCTATGACATTGTTCAACAAGAAGCAAAGAAACCACCAACAGACTCATCTAATGAT
CACCAAGAAATGGAAGAACCATCTGATGATCTTGTTTCTCTGAGCCTTGGAAGATCTTCA
AGTGATTCCAAAAAGGAAGAAAAGAACAAAACCCCTTGTCATCAAGGAAAAGATATCGAG
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GAAGAAGCTGGGGAGACCTGGCCACCTAGTAAAGTTCTCAAGATTATGAGGAATGGAGAA
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GATACTCCAACGATGAATGATGGTTGCCAATGGAGGAAATATGGACAAAAAATTGCCAAA
GGAAACCCGTGCCCTCGAGCTTACTATCGTTGCACTGTTGCTCCTTCATGTCCAGTGAGA
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CTGCAACCTGCATCGTTATCATTTTCCAACTCTAGGAGTACTTCCTCGTCTCCCGGAGAT
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TCCTTGCATATGATGATTAGTCTATGAGTTACTTTCGTTTCAATGATGTATAAAGAAATT
GTGCATGCAAATGGTGACAGATAGCCAACTATATTTGGCAC
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>LITCHI022184.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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TTATTAAGTGGATTAATTGCATAATTTTAATACATGTACAGGCATCACAAACTACCATTT
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CTGGTGCATAAAGTTTCATATTTATTTATAATATAGTGTTTTAATTACAATCCATTTTCA
GTATTTTAATGAGTTAATTTACCAGTTCATCGTCCAGTTCGCAACCATGTTAAATTATTA
TTATTATTCTTAAACACAAAGAGAAGATTTAATTGTATCACCAATACTGCAGAGAAATTT
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GATATTATATATTGCAACATAGGAACAGTTTTTTTTTTTTTGGGAGAGAAACATAGGAAC
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AGATTTAGTTCAAAATTAAAAAAAAAAAAAGGATTATTTATATAAGTTTTCTCCGTCAAA
ATTAGATCAAAGATAATACACCTAGAAATAGATGAGTACGAGGGATTAATTATTCAAATA
ATGATGTACCACTATTTTTTTTTTTTTTCGAAATACTATTTATTGTTGTTTGTCATAATA
TTGTCTTGCTTTATTAAATTTTTCGTTTGAAAAAAATCAAACTCCCTGCTGAGGTAATTA
AATCATTATTAATTAATGGATTAGAAGCCAAAAGCTAGTTGTAGTTATGTGAAACAGAGA
TATATATATTACAAAAATTTCCACGACCAACCATTATTTATTAATGTTATCTTAAGTAAA
CGTGTAGCACTCTTGTCCAATAAGAATCTCTCTAATTAATAATGGAAATTAATTTATAGT
TAATTTCAGACCCTTTCGTTCTTTTCACATTGGAGATTAATTCTATACAAACTTTGGCTC
CATCTAAACCAGAATGCCCAACGTGAATAAATAACAAAATCAATAGATTTATATAACAAA
ATCAATAGATTTATCTTCTTTTTATTTACAAAAACCTCTTACACCGAACTCGAATTAACC
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CTGAATTGTAGGACAAATGCTGAATAGGAGGGTCCCCTAGGCCTTGACCTCTTTTTTCTT
TTTAAGGAAGAGAAGACAAAAACCGATTTTCTTCTTAAACGAATTAATTAATAATAAAAT
AATAGAACACTTAAAAATATACATTAAAAAAAGTGTTTGCATATAAATATAATGGAGTGC
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GAATTTATCTACAATGAAACTGGATCCAAAAACCCTAGCTCAGCGCTGTCCTTGCCGAGA
AACTCCGGTCACCCAGGGTTACACGGAAGGGTGACAAAAAGCTTTGACCAGAACCAATAT
GCCCATGTGACTTTTGTCATACAAGAAACTTCAACGATGCTATTTAGTATTAGGTGGGGT
CCGTGCATTGCGGCTTGAAGCTCTCTTCTTTTCTCTTTCTTTGTAATCTTATGTGACATG
TTATCTAAAGGGTTGAAGTTGAATTCTTCTAGGTTTGTCTACAAGGAATATTATAAAGTT
ATATTATAGAGAGAGAGTTGTAATATAGTAATTCGTTTAGTGCAATTGGATTGGGCGCAG
TTGACATCGTGGTTATGTGTGCATTGAATGTTTTTTAAAAATGAGTCAAATACTGTTGGC
TCTCTTCTATAAAAGAATAGTACAATAAATTTTTGAGACGGTCCTGGCTTCAACAAGACG
AAAAAAAGGAGAAAAGAGCT
>LITCHI022184.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AGAGTTGTAATATAGTAATTCGTTTAGTGCAATTGGATTGGGCGCAGTTGACATCGTGGT
TATGTGTGCATTGAATGTTTTTTAAAAATGAGTCAAATACTGTTGGCTCTCTTCTATAAA
AGAATAGTACAATAAATTTTTGAGACGGTCCTGGCTTCAACAAGACGAAAAAAAGGAGAA
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AGAGAATAGACTTGATTCTGCTCATCCTGATAAGGAAGAGAGTTCTGTTGTTAAGGTGGA
GCTCTTTGTTTTTCTTGAATTCTATTTTTTTTTAATTTATATATATATATATATATATAT
ATACACACATATATATATCTGCTTGTTAATTCTTAGATAACCGCTAGTTATGAATTCATG
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TTTGTTTGACTATATTTTTTTTTTGCCGAAATTTACACCTACCATATGTATTCATTGCTT
CTTTTCACAACTTGAATACGAACATGTGTTTTTCATTTTTTTTTATTAATAATATAATAT
TTTCCTTTTCTTATAATTCAGATTGGAAACAAAAGACCATACAAGGAGAACAATGATGAG
AATCCATCTTCACCTAAACAAAAGCATCTATGCTCCACCAAGCAGGTAAAGAGATCGAAA
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GTATCAAAATTATGAATTCGTTATTCAATATAAAGAATAAATCTGATAACTAGGATCTTT
TCCAAAAAAAAAAAAATCTGATAACTAGGAAGAATTATCATGAAAAGATATTTTCCAATT
TGAACACGGTAGCTCCTAAAATGAAGATCACACAAACGTGCATCAATCAGCATCTGAAAT
AGTTTTACAAGAGAAGGACTTGTTGCAACTTGCAACACTGTATGTACCAACAAAGAAAAG
AGAGAAAAATCGGTAGGACCTTTATAAACTTGTATTCGAGAAAGTAGCACTGGTCCAAGT
CATTGCAATAGGCTTAAGATTTGACCACAAGTACAAGATAATTAAGAATCGAAAGCTAAC
AACCATGACAATTCAAAATTAGGGCTTTGTCTCCACAAATTAGTGCTACAGGTAAAAGGT
TTTATTTGTTTGATTGTTGATGGTATTTATCAAACTGGGTTTACACAGTTTCTTCCACTA
ATTAATGTCAGAATCTTAGCTGTCTTTTGGTGGTTGATTTTAATTTAAACTATGATGCAG
GAACCTGTTGTTCAAAAACCCACGACGGGACCTGATCACACAAGAGCATCTTCTTCAAGC
CAAAAGAAAGATCAGGTTAGGACTTCTTTATCTTTTGGTAATTTAACTAGATTGCATATT
GTATGAGAATTATCATCTTCAACATGAGGTTGGAATTTTTTTTCATTTTTAAATATTTCT
TTTAACAACATATGCATTTATCGAAAAATAAATTTGTTTCTAATCCGGACCTGTTTTTCT
GTTCTTTTCATATGTTGCATTTTAGATTAATGAATTATTATCAACAATTAATCTGTGAGA
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ATTTTGTTCATAAAATAAATATTAATATAGTAACTTCAAAAAAAAATTCATTTTTCGCGG
TTATTAGTCATATTTAGTAAAATTAGTTTACTTATTCTTTGTTGATATAGGATGATCAGC
TAGAATCCGCTAGAGCCGAA
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>LITCHI022184.m2 GenomeSequence - 
CTTTGTAATCTTATGTGACATGTTATCTAAAGGGTTGAAGTTGAATTCTTCTAGGTTTGT
CTACAAGGAATATTATAAAGTTATATTATAGAGAGAGAGTTGTAATATAGTAATTCGTTT
AGTGCAATTGGATTGGGCGCAGTTGACATCGTGGTTATGTGTGCATTGAATGTTTTTTAA
AAATGAGTCAAATACTGTTGGCTCTCTTCTATAAAAGAATAGTACAATAAATTTTTGAGA
CGGTCCTGGCTTCAACAAGACGAAAAAAAGGAGAAAAGAGCTATGGAGGATGTTTTGAGA
AGATCTGATCCACACAGAAGTCGTGAAATCAACGAAGAGAATAGACTTGATTCTGCTCAT
CCTGATAAGGAAGAGAGTTCTGTTGTTAAGGTGGAGCTCTTTGTTTTTCTTGAATTCTAT
TTTTTTTTAATTTATATATATATATATATATATATATACACACATATATATATCTGCTTG
TTAATTCTTAGATAACCGCTAGTTATGAATTCATGAAAAATATATGTAAATCTCTTCACT
ACAACGTATATTTTTTTCTTTTGTCTATTGCATGCTTGGTTTCATCTTGCATATCCAAAG
AAAGATAACCTCTCAAAAATTAATATCATCATTCAACTATAAAGTTTCCAGTTATGGCAT
GCTGATAAACAAACATGAAAACATGAACTAGTACTTGGAGATTTGTTGTATATAGTTTTC
TTTTCAAAGGATCAATTCTATGTAATAGATCTTGTTTTGTTTGACTATATTTTTTTTTTG
CCGAAATTTACACCTACCATATGTATTCATTGCTTCTTTTCACAACTTGAATACGAACAT
GTGTTTTTCATTTTTTTTTATTAATAATATAATATTTTCCTTTTCTTATAATTCAGATTG
GAAACAAAAGACCATACAAGGAGAACAATGATGAGAATCCATCTTCACCTAAACAAAAGC
ATCTATGCTCCACCAAGCAGGTAAAGAGATCGAAACTCCATGAGTGAGAGTATGTATATA
CATAAATAGCTAGCTTTTTACTTATATATACGTTTGTATCAAAATTATGAATTCGTTATT
CAATATAAAGAATAAATCTGATAACTAGGATCTTTTCCAAAAAAAAAAAAATCTGATAAC
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GATCACACAAACGTGCATCAATCAGCATCTGAAATAGTTTTACAAGAGAAGGACTTGTTG
CAACTTGCAACACTGTATGTACCAACAAAGAAAAGAGAGAAAAATCGGTAGGACCTTTAT
AAACTTGTATTCGAGAAAGTAGCACTGGTCCAAGTCATTGCAATAGGCTTAAGATTTGAC
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