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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001705 | Chr5 | 29728849 | 29732503 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001705.m1 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.6 | 5.40E-12 |
| LITCHI001705.m1 | 251 | 341 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.50E-18 |
| LITCHI001705.m2 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.4 | 6.30E-12 |
| LITCHI001705.m2 | 285 | 375 | PF02362.24 | B3 | Family | 64 | 1.00E-17 |
| LITCHI001705.m3 | 250 | 340 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.40E-18 |
| LITCHI001705.m4 | 218 | 308 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
| LITCHI001705.m5 | 216 | 306 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
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>LITCHI001705.m1 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGATGGAGGATCTCAAAAG GCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCT CAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCA GCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCA TTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGG TGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACATCTAAATGGGGTGTCAGGGTTC ATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGTCTGTATAGAGGAGGC AGAGCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGA GATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTC CGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG >LITCHI001705.m2 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGGTTATGGTAATTCTCAA GTTGGAAATCAATCTACTCGGGATATAGGTGTTCAGTTTGATATTGCTGAGCTTAAGAAT TCATTAAATGCATTGTATTCTCCAGATGGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGG AAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAA GAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTG ACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCT 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>LITCHI026357.m1 MAGVGGNGKGRAGGGDQKGKAPSTDPHVHDDQSRKRTNINDALPTNNTDQCRQDGLYKAL WRACAGPRVYVPCVGDYVYYFLQGHLEQIEAYANHEIRAEMPVYNVPSKVLCEVVHVQLM AETGTDEVFAQITLQPKTKQDMQNLEDGSSAPLPPKTKVCSFSKKLTQSDTSTHGGFSVP KRKADECLPQLDMSKQPPAQELIATDLHGYEWRFRHIFRGQPKRHLLTSGWSIFVASKML NSGDLCIFLRGEHGELRIGIRRLIKRQNCASTTIISSHSMQHGILAGAFHAISTGTTFSV YYHPWTSPSEFIIPVDQCDKSTSIDYSVGTRIRMAFETEDFTEKRIAGTVVGIEDVDRIR WPGSEWRCLRVKWDALSDRIRCPERVSPWNVELIEGANRKPASFLHRQKRPRPDNLSFPG CSNGQYLLLFSVTRVLQGQKNNVTGVKESGPLEPLSFPYLVPQKSSDWGHVLMHDPFYPC HNGRVSIPSGIIVRSSGLPNYWPATYATNSVRNNAVLSRNISAPSGKSLNSSSKERRSLE SKNENESPLSQSHGGKKYMLFGVNLANTSPPELPLLQQATSNELESRCSGPPMSQSSISG PFQVSEPSNSVSDIPSGKQCKNCRLLKSCTKVIKYGTALGRSVDLSRFDGYEELVYELDQ MFDFNGTLIDGSSGWEITFIDDEGDMLLTGDHPWKEFLCAVRRMFICPKEDIDKLNPSSP NPTSV.
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>LITCHI026357.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTCACATTGTGATCAAAAGTTGGGGACAAGACAGAAATCTCCCTTAAATAAATATTTTA AGGATGCTATCAATTATGATCATTTAATTCTTCTTATCTTGTTTTGGCAAATATTCCAAA ACCGGAAGTCACTTTTAGCATATTCCGAGCCGTTACAGTACTTCATTTATATCAAATTCT TAATCCTTTTTTTTTTTTTTGAAATAAATCAAATTGTTAATCCTGTTGCTTCATATTTAT AAATGATTTTTTATAGGTGTTATTTTGAAAAATTGACCATTGTTTTCTTTCTCCTAAATT AATTTGTAAAAGATAAATATATAAATAAATTAAAAGTCAATTTATGCATACACACTATCT TTTAATAGAAATGGTTGAATATCTCTCTTAATCCGAAAAGATTAGAGGTTTAAATCTTAC CATTGTCGAATATATGGATAATTTTCTATGAATTTAATCACCTATTCCCTCATCATTAAA AAAAAAAAAAAAAACTTGATTTATAAATGCACACATTTTGTACAATATTTGCTTGAAAAA TAATTTTTGCAACTTATTTATACTAAAATAGATTTTTCTATCGATAAAAATACTATAAAT TGTGCATTACAAAAATTTAACTATATAATATATTTTTTTATTGAGAATCTTGTTGGTTGT GACTTATGGTTGAATGTGAAAATGAAGTATATTTATTTCTTTTAATCTTTGATTATCAAA TTATCTTAGAATTAAAATCAAGTATTTAGTATTGTTTATTTTGATTGATAATAGATCTTT AGTTTATAATCTTGTAAAATTCTTGTGATTTAAATTATAATTATTGTATTTTTTTTTAAA AAAATAGATCTTTTTATGCTTTTAATGACCTAATTCTTAATATATCATTATATTAATAAT AATTCAAATAAAAATTATAATCCATAGTTTTATATATATGCATGCACGTGCACACGTGTG CATGGGTGAGCGTGTGTATATTTTTTTAGTGATTTATTTATTTTGAAATATATATTATGA GGGTTAAGATTTACTATAATCTTCATTATACATTTGATAAATTTAATCATAGATAGAGAT TTGATTAAAAGAAAATTTTCTTAATTCATCCCAACATTAAATCGCAACTATGTCCCTGGC CAAAGACAACATTTATTGCAATTGACCCATCTTAATTTTTTTACTTTCTTGGATGTCTAT ATAAAATAAAAACGACAAATTAGAGTAACCATCCAAAGAAGTCTGGTCCAAATGATAATA AAACTATACCATCTATGGAGTTTCAAAAAAAAAATTATACCATCTATAGACTCTTTGGAG TTGAAAAACAGCACCATGAGCACATAATAAATTGACGACCCATGTCCTGCCCCAGTATTC AGACGAAACGCTTGATAGAGGTTGAGTGAGAAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTA TAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATTAAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGG CGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCATGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAA TATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACGACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAG AGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGAGATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAA ACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAACAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCA CACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTTGGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGA GAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAGAGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGC GGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTT TGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAG TTTTGTTGAGGTTTAGAGAG
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>LITCHI026357.m1 GenomeSequence - AAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTATAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATT AAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCA TGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAATATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACG ACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGA GATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAAACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAA CAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCACACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTT GGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAG AGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGCGGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTC TTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTTTGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGT CTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAGTTTTGTTGAGGTTTAGAGAGATGGCTGGTG TGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGATCAAAAAGGAAAAGCCCCAAGTA CTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACGTACCAACATTAACGATGCGTTGC CTACCAACAACACTGACCAATGTAATATGTCTTTTTTTTCACTACTTGTTATTTACTCAA TGTCTTGCTACTGGTTGACGACTTTGTGTTTCGAGTTATGATATCATGGAAGCAAGTAGC CATCAGTGCTTCAATCTCTCTTTTTCTCGTGCCTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAGGTGAA 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