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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001705 | Chr5 | 29728849 | 29732503 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001705.m1 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.6 | 5.40E-12 |
| LITCHI001705.m1 | 251 | 341 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.50E-18 |
| LITCHI001705.m2 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.4 | 6.30E-12 |
| LITCHI001705.m2 | 285 | 375 | PF02362.24 | B3 | Family | 64 | 1.00E-17 |
| LITCHI001705.m3 | 250 | 340 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.40E-18 |
| LITCHI001705.m4 | 218 | 308 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
| LITCHI001705.m5 | 216 | 306 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
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>LITCHI001705.m1 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGATGGAGGATCTCAAAAG GCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCT CAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCA GCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCA TTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGG TGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACATCTAAATGGGGTGTCAGGGTTC ATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGTCTGTATAGAGGAGGC AGAGCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGA GATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTC CGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG >LITCHI001705.m2 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGGTTATGGTAATTCTCAA GTTGGAAATCAATCTACTCGGGATATAGGTGTTCAGTTTGATATTGCTGAGCTTAAGAAT TCATTAAATGCATTGTATTCTCCAGATGGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGG AAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAA GAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTG ACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCT 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>LITCHI029775.m1 ATACGGAAAAAAAAAAGCCCAACCCATTACACAGAGTGAAAAATGTAATAATAATAATAA TCGGAGTTGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAAGAGTCGAGGGTTTAAGCACCAACTCTC TGTTGATGTGTGTCTGTGTTTGTCTGGCTAGTGGGTAGCTCAGAGATTTTAGTGGGGTTC AGTTAAGTTTATTAATGACAACTATATCATCCAAAAACATATGGATGAGGAGGCAACAAT GTCCTTGTGGAGACTGGAAATGTTATGTTTCGTATGAAGGAGATACTGAGGAGACATCAA TGGCATCTCAGTTGGTTAAAAATGAAACCAGTTCTTCATCTGAATCGATGGTTGCTCCGT ATGTGGGAATGGTGTTTAAGAGTGATGATGATGCGTTTGAGTATTACAGCAATTTTGCGA GGAAAAATGGGTTCTCGATTCGGAAAGAGAGGTCTAGGTTTAGTCCCCAATTGGGTATTT ATAAACGGGATTTTGTTTGTTATCGTTCGGGGTTTGCTCCTATGAGGAAGAAGCTTAGTG GAGAACACCACAGGGATAGGAAGTCAGTGCGGTGTGGATGTGATGCAAAGATGCACTTGT CAAAGGAAGTGGTTCAAGGGGTTACTCAATGGTTTGTTGTTCAGTTTAGTAATGTTCATA ATCATGAACTTTTGGAAGATGACCAAGTGAGGCTCTTGCCCGCATATAGGAAGATTCATG AAGCTGATCAAGAGAGAATTCTTTTGCTTTCTAAAGCTGGGTTTCCAATACATCGTATAG TGAAGGTGCTGGAGTTGGAGAAGGGGATTCAAGGTGGGCAGTTGCCTTTTCTGGAGAGGG ATGTGAGGAATTTTGTTCAAAACCGCAAAAAGATTGTTCAAGAAAATGATGATTTACTTA CTTCAAAAAGAGAGAATGACACAGTGGAACTTCTGGACATCTTCAAGGCTACAAAAGAGA CAGATCAAGAGTTTGTTTATGATTTTACCATGGATGAAAACCATAAAGTTGAAAACATTG CCTGGTCCTATGCCGATTCTGTTAATGCTTACAGCATGTTCAGTGATGTTGTTTATTTTG AGACTTCTTATCGGTCGATCACTTACGGTATGATTTTTGGAGCATGGATTGGGATTGACA ACAATGGCAGAATAATTTTATTTGGTTGTGCTCTGTTGCAGGATGAAACAGTCGGTTCCT TTGCTTGGGCTTTGCAGACCTTTGTTCGCTTTATGAAAGGAAGATGCCCAACGACAATTC TAACTGATCTTGACCCAGGGCTCAGGGATGCTATACAAAGTGAGTTACCAAGCACTAAAC ATGTGATGTCTATATACAATATCCTCTCAAAGCTGTCAAGTTGGTTCTTGCTTCCACTGG GATCGCAGTTTTCGGAATTCAAATCTGAGTTTGATGCATTATATCATGCGGAGAGTGCAG AGGATTTTGAACTTCGTTGGAGTCAAATGGTTTCCATGTTTGGGCTTGGTTCAGATAAGC ACATTGCGTTACTCTATTCTCTCCGGATGTCTTGGGCACTATCCTACACAAGAGGCTACA TTCTTGCCCAAATGGCTACAACTGCCTATTCAAAGTCTGTAGATGCTTTCTTGAAAGGAA TCTTCAGTGCACAAACATGTTTACGAAGCTTTTTTGAGCAGGTTGGCATCTCCAATAATT TACAAAATCAGCCACGTCAAGAGATGCCATTTACGCATATCAAGACATACATACCCATTG AAGAGCATGCTCGTAGAATTCTTACGCCTTTTGCCTTCAATGCATTTCAACATGAATTGA TGCTAGCTATGCAGTACGCTCCATCTGAAATGGCTAATGGTTCATATCTTGTACGCCACT TCAAGAAGATGGATGGGGAATGTCTTGTTTTATGGATGCCAGAAGATGAACAGATTCATT GTTCCTGTAAGGAATTTGAGTCTTCAGGAATACTTTGCAGGCATGCTCTACGTGTGTTCA TTGTAAAGAACTACTTTCAACTTCCTGAAAGATATTTTCCAAGTAGATGGCGGCAAGAAA GCTCTTTAGTCTGCTTTTATGATCAAGCTCCTCAACAAAACCATGACGAATGGTTTCAAG AGTTTCAATCCCTTACTAAAACTCTATTTACTGAATCATCAATTACAAGGGAGCGCTCTG ATTATATTCGCAGAGAACTAACAAAAGAACTCACAAGGATTCTCAATGAGGTTAGAGAGA TGCCTGAGAGTGATGCGCTTGCAATGGATTTTACTCTTTCACCAACCGAGTGATTTTGAG TGACTGACGCTATAGCTGGTGGCAAATGAAACCACAGGGTTGTCCGTCGATGAAATATGA TCAGATGATGATGATGATGCAAGGACTGGAATCAAAGTGCAGTCATAGGTAATATGATCT GAGGGACTACACAGATGGAAATGATGGAAGAAGGCCAATTTGTTGTTCTGTTACCAACAG GTTATTGTGGTTTCAGTCAAGAATACTTAGTAGAAGCTGCAAAATTTTGTGGATTGAGAT CAAATGAGCTTCTCTAGGGTGTTGTACTTTGTAAATGTTGAATGTTTTGTATATGTTTTC TCAAATAATGGATTCAATTCATCTTAATCTCGCCATTGCAATTGTAGATGCTTGTACAAC AGCTATTTTAAGCATCCATGTTGAATATTAAGTTTTAACAGAATAACCAGCTTCTAGCTT GCATCATTGGACTTGGATTTCAAGCAGTTCAGTTTTTATAAGATCACTACATGAAATCAT CCTTACTGTAATCATATATATATATATATA
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>LITCHI029775.m1 GenomeSequence - ATACGGAAAAAAAAAAGCCCAACCCATTACACAGAGTGAAAAATGTAATAATAATAATAA TCGGAGTTGAAGAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAAGAGTCGAGGGTTTAAGCACCAACTCTC TGTTGATGTGTGTCTGTGTTTGTCTGGTACGTAGTTTTTCACTTCCTTGCAGCTCATATC ATGTAGTCTCTAGCTTATACAACTTGGATTTACAAGCACTTGAACACTTGTTTTTACTTG TTTCTTAGTTTTATTGTAGTTGTGACTTAAATGCATAAAGCTCTTGAATTTTGGTGCCAT TTGCATGATTTGATTGTTAGCTCAAATGGGCATGCTCTTGTTTGGTTGTTTTATGTTGCT TTGTTAAAAATAATCCATTTTGATGTTTCTGTGGAACTTTTTTTTGAAGCTAATTGTTAC TTAAATGCATAAAGCTCTTAAATTTTGGTACCATTTGCATGATATGATTGTTAGCTCAAA TGGGTATGTTGTTGTTTAGCTGTTTGGTGCTGCTTTGTTAAAAATAATCCAATTTGACGT CTCCTTTGGATTTTTTTTTTTTTTTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTAATTGTA ACTTAAATGTATAAAGGTCTTAAATTTTGGTACCATTTGCATGATAGGATTGTTAGATCA ATGAATGTGTTGTTACTTGGTTGTTTTGTGTTGCATTGTTAAAAATTATCCAATTTGATG TCTACTTTCGATTTTTTTTTTTTTCAGGCTAGTGGGTAGCTCAGAGATTTTAGTGGGGTT CAGTTAAGTTTATTAATGACAACTATATCATCCAAAAACATATGGATGAGGAGGCAACAA TGTCCTTGTGGAGACTGGAAATGTTATGTTTCGTATGAAGGAGATACTGAGGAGACATCA ATGGCATCTCAGTTGGTTAAAAATGAAACCAGTTCTTCATCTGAATCGATGGTTGCTCCG TATGTGGGAATGGTGTTTAAGAGTGATGATGATGCGTTTGAGTATTACAGCAATTTTGCG AGGAAAAATGGGTTCTCGATTCGGAAAGAGAGGTCTAGGTTTAGTCCCCAATTGGGTATT TATAAACGGGATTTTGTTTGTTATCGTTCGGGGTTTGCTCCTATGAGGAAGAAGCTTAGT GGAGAACACCACAGGGATAGGAAGTCAGTGCGGTGTGGATGTGATGCAAAGATGCACTTG TCAAAGGAAGTGGTTCAAGGGGTTACTCAATGGTTTGTTGTTCAGTTTAGTAATGTTCAT AATCATGAACTTTTGGAAGATGACCAAGTGAGGCTCTTGCCCGCATATAGGAAGATTCAT GAAGCTGATCAAGAGAGAATTCTTTTGCTTTCTAAAGCTGGGTTTCCAATACATCGTATA GTGAAGGTGCTGGAGTTGGAGAAGGGGATTCAAGGTGGGCAGTTGCCTTTTCTGGAGAGG GATGTGAGGAATTTTGTTCAAAACCGCAAAAAGATTGTTCAAGAAAATGATGATTTACTT ACTTCAAAAAGAGAGAATGACACAGTGGAACTTCTGGACATCTTCAAGGCTACAAAAGAG ACAGATCAAGAGTTTGTTTATGATTTTACCATGGATGAAAACCATAAAGTTGAAAACATT GCCTGGTCCTATGCCGATTCTGTTAATGCTTACAGCATGTTCAGTGATGTTGTTTATTTT GAGACTTCTTATCGGTCGATCACTTACGGTATGATTTTTGGAGCATGGATTGGGATTGAC AACAATGGCAGAATAATTTTATTTGGTTGTGCTCTGTTGCAGGATGAAACAGTCGGTTCC TTTGCTTGGGCTTTGCAGGTTTACTGCTAAGGACTCTTTTATCAGGTTTAAAACAAGCTT CATACATCTTTCATGTTGTGAATTCTATCTTTGTCTTTCTGATGCAGACCTTTGTTCGCT TTATGAAAGGAAGATGCCCAACGACAATTCTAACTGATCTTGACCCAGGGCTCAGGGATG CTATACAAAGTGAGTTACCAAGCACTAAACATGTGATGTCTATATACAATATCCTCTCAA AGCTGTCAAGTTGGTTCTTGCTTCCACTGGGATCGCAGTTTTCGGAATTCAAATCTGAGT TTGATGCATTATATCATGCGGAGAGTGCAGAGGATTTTGAACTTCGTTGGAGTCAAATGG TTTCCATGTTTGGGCTTGGTTCAGATAAGCACATTGCGTTACTCTATTCTCTCCGGATGT CTTGGGCACTATCCTACACAAGAGGCTACATTCTTGCCCAAATGGCTACAACTGCCTATT CAAAGTCTGTAGATGCTTTCTTGAAAGGAATCTTCAGTGCACAAACATGTTTACGAAGCT TTTTTGAGCAGGTATACTAGTTACATTTATTGTCCTGATATCGTTGGATGTATTTTTGAT GAGTTGATTGTTTATAGTTTTGCTTGGATTTCTTGTAGGTTGGCATCTCCAATAATTTAC AAAATCAGCCACGTCAAGAGATGCCATTTACGCATATCAAGACATACATACCCATTGAAG AGCATGCTCGTAGAATTCTTACGCCTTTTGCCTTCAATGCATTTCAACATGAATTGATGC TAGCTATGCAGTACGCTCCATCTGAAATGGCTAATGGTTCATATCTTGTACGCCACTTCA AGAAGATGGATGGGGAATGTCTTGTTTTATGGATGCCAGAAGATGAACAGATTCATTGTT CCTGTAAGGAATTTGAGTCTTCAGGAATACTTTGCAGGCATGCTCTACGTGTGTTCATTG TAAAGAACTACTTTCAACTTCCTGAAAGATATTTTCCAAGTAGATGGCGGCAAGAAAGCT CTTTAGTCTGCTTTTATGATCAAGCTCCTCAACAAAACCATGACGAATGGTTTCAAGAGT TTCAATCCCTTACTAAAACTCTATTTACTGAATCATCAATTACAAGGGAGCGCTCTGATT ATATTCGCAGAGAACTAACAAAAGAACTCACAAGGATTCTCAATGAGGTTAGAGAGATGC CTGAGAGTGATGCGCTTGCAATGGATTTTACTCTTTCACCAACCGAGTGATTTTGAGTGA CTGACGCTATAGCTGGTGGCAAATGAAACCACAGGGTTGTCCGTCGATGAAATATGATCA GATGATGATGATGATGCAAGGACTGGAATCAAAGTGCAGTCATAGGTAATATGATCTGAG GGACTACACAGATGGAAATGATGGAAGAAGGCCAATTTGTTGTTCTGTTACCAACAGGTT ATTGTGGTTTCAGTCAAGAATACTTAGTAGAAGCTGCAAAATTTTGTGGATTGAGATCAA ATGAGCTTCTCTAGGGTGTTGTACTTTGTAAATGTTGAATGTTTTGTATATGTTTTCTCA AATAATGGATTCAATTCATCTTAATCTCGCCATTGCAATTGTAGATGCTTGTACAACAGC TATTTTAAGCATCCATGTTGAATATTAAGTTTTAACAGAATAACCAGCTTCTAGCTTGCA TCATTGGACTTGGATTTCAAGCAGTTCAGTTTTTATAAGATCACTACATGAAATCATCCT TACTGTAATCATATATATATATATATA