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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001705 | Chr5 | 29728849 | 29732503 | + | B3 domain-containing transcription factor VRN1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001705.m1 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.6 | 5.40E-12 |
| LITCHI001705.m1 | 251 | 341 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.50E-18 |
| LITCHI001705.m2 | 6 | 95 | PF02362.24 | B3 | Family | 45.4 | 6.30E-12 |
| LITCHI001705.m2 | 285 | 375 | PF02362.24 | B3 | Family | 64 | 1.00E-17 |
| LITCHI001705.m3 | 250 | 340 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.2 | 8.40E-18 |
| LITCHI001705.m4 | 218 | 308 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
| LITCHI001705.m5 | 216 | 306 | PF02362.24 | B3 | Family | 64.5 | 7.00E-18 |
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>LITCHI001705.m1 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGATGGAGGATCTCAAAAG GCTAAGAAAGCTGGGAGGAAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCT CAGTATCATCAACATGAAGAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCA GCAAGAAAGAGGACTGTGACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCA TTTGAGCCAATTAATCCTTTCTGTAGAGTTGTCCTGCGACCATCTTACTTATATAGAGGG TGTATTATGTATTTGCCATCCTGCTTTGCTGAAAAACATCTAAATGGGGTGTCAGGGTTC ATTAAGCTACAGCTTTCTGATGGGAAGCAATGGCCTGTCCGATGTCTGTATAGAGGAGGC AGAGCTAAGTTCAGTCAAGGATGGTATGAATTTACATTGGAGAACAATTTGGGGGAAGGA GATGTTTGTGTCTTTGAGGTGATTAGATCGAGGGAATTTGTGCTGAAAGTTACTGTGTTC CGTGTCATGGAAGGTGCAGGATTCATGAACAGATTGTCACATTAG >LITCHI001705.m2 ATGCCTCGTCCGTGTTTTCACAAGCTGATTATCTCCTCCACCATCCAGGAGCGAAAACTG AGGATTCCAGAAAATTTCATCAAGAGATTCAAGCATGACCTTACCATGGCTGCTACACTT ACTGTCCCCAATGGTAGTGTTTCACGTGTAGGATTGAGAAGAGCTGACAACAAAGTCTGG TTCTATGACGGTTGGCAGGAATTTATGGAACGCTACTCTATTAGTGTTGGATACTTTTTG GTATTCAGATATCAAGGGAATTCGGCTTTTAATGTTTACATATTTAATTTGCCTTCTTCT GAGATCAATTATCAATCTAATGCACTCGGTAGTACTGTAGCGGCCAATCATAGCAGACAA TACCATATATTTGCAGAGATGGAAGATGATGACTCTGAATATGCAGATCGGCTGACACTG AACAAAAATGTCAATTCTTCTGGGCTGCAGAACTTGTTCAGTGGTTCCAAATATAATAAC AGTGCAAGTTATGCCAGTGAAGGAAACTTACATCAATTTAGAGGTTATGGTAATTCTCAA GTTGGAAATCAATCTACTCGGGATATAGGTGTTCAGTTTGATATTGCTGAGCTTAAGAAT TCATTAAATGCATTGTATTCTCCAGATGGAGGATCTCAAAAGGCTAAGAAAGCTGGGAGG AAAAAGCGGAAGCTTGATCCTAACAATCCAGACACATCAGCTCAGTATCATCAACATGAA GAAGATGTAGAAATGCGCTTTAGATTTTATGAGAGTGCTTCAGCAAGAAAGAGGACTGTG ACAGCTGAAGAAAGAGAGCGAGCAATTAATGCAGCCAAAGCATTTGAGCCAATTAATCCT 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>LITCHI018330.m1 ATGCCTCGTCTAGTCACAGTTTTGATCCTCCTGTTCTTGTCTTTTGAGACTTCGACGAGT TCCCAGAACTTGTTGAGAAGAGAATCTTATCTGTCTGTTGAAGACAGTTCACGCGTGTTG ACTTCCCCAGACAAGACATTCACTTGTGGCTTCTACAGTCTTGATGGCGAAAATGCATAC TGGTTCTCCATCTGGTACACCAACTCCAGAGACAGGACTGTTGTCTGGATGGCCAACCGT GACAGGCCTGTCAATGGTCAGGGCTCCAGACTCTCTCTACGTGGAAATGGTGCAATGGTT TTGACTGACGTTGATGGGACTATCATTTGGATGACCAACACCACCTCTACCAAGGCTGAT AGAGCTGAGCTTTTGGACTCTGGAAACCTTATTTTGAAGGACATGCAAGGTAAGATTTTG TGGCAAAGCTTTGATTTTCCGACTGATACACTGCTTCCTAGTCAATATATTTCAAAGGGT GTCAAGCTGGTTTCTAGTCTAGGAAGTGGGAATTTTGGTTCTGGGTATTTTAGTTTCTAT TTTGATAATGATAATGTCATGAGGTTGATGTATGATGGCCCTGATACTTCAAGTGTGTAT TGGCCGAATCCTGATTTTAGTGTGTTTCAAAATGAAAGAACATCGTACAACAATAGTCGA ATTGCTGTGTTAGATGATGAGGGCAGGTTTTTATCTAGTGATAGATTGCAATTCAGTGCT ACTGACACGGGGTTTGGGATTAAAAGAAGGTTGACTATGGATTATGACGGGAATCTAAGG CTTTATAGCTTGAATAACGATAGGGGTTCATGGATGATTTCGTGGGAAGCTCTTAGGCAG CAGTGTAACGTGCATGGGATATGTGGTAGAAATGGGATTTGTGTTTATACACCAGAGCCA AAGTGTTCTTGCCCTCCCTGGTATGAGGTTTCGGAACGTGGTAATTGGAACAAAGGCTGC AAGCCTAAGTTCAATAGAACTTGTTCCAATGCTCAGCAGGTGAAATTCATCAAGGTTTCA CATGTCGATTTCTATGGCTATGATCTTAATTTCAGTACGTCTATATCAATGGACTCTTGT ATGAAATTATGCTTGGATGATTGCCGGTGTGAAGCATTTAGTTATAGGCTAACGGGGCAG GGGCTTTGTTTCACGAAAAATGTGCTTTTCAATGGCTTACAGACTCCAAGCTTTCCGGGT GACATATATGTAAAATTGCCAGTGGATGTGGAGGCATCAGAACCTGCTAGTCTCGTTGGC ACCAATCTTGTGTGCCCCACTAGTGCCTCTAAAATTGTGATAGGATCTTCATCTATGCAT GACACTACTGTTAAGAGAGTAAGATGGGCTTACCTCTATGGCTTTGCAATTGCTATTGGT GCAATTGAAGTTATCTTATTTGTATTTGGATGGTGGTACCTCTTCAGAAGACATGACGTG CCATCCTTTTTGGAAGATGGATATTGTGCAATATCAAGTCAGTTCAGGAGATTCAGCTAT GTTGAACTCAAAAAGGCAACAAATAATTTCAGAGAAGAGGTTGGTAGAGGAGCATCCGGG GCTGTCTATAAGGGTGTTTTGGATGATGATAGGGCGGTACAAGCAGAGTCGAAGGGGTTG CTAAGATTAAGCCTTGGAAACTTCTTTGCTGTTGAAAAAGAGAACAGTTCAGTGGTATGG TCAACTGACACATTCACAGTTGCAGATGTGGAAGCTCAGCTTCTTGAAACAGGCAATCTC GTTTTGGTCGACAAAGCAAAAAGGATCATCTGGGGAAGTTTTGATTCCCCCACTGACACA CTCCTACCATTTCAGCCACTCACCAAGGACACATCCTTGGTCTCTAAGAGAAACCAACAT ACACACTTATCAGGACACTATCAGTGGAGATTTGATGATAATAATGTTCTAAATCTCATC TATGATGGTCCTCTAGTATCAAGTGTCTACTGGCCGGATACAAACACTCCCATGTTTGAA AACGGCAGAACGCCTTACAACAGTACCAGAGTAGCAGTTCTAAATGCGAGAGGAACTTTC CAATCAAGTGACAATTTCAGATTCAATGCATCTGATTCCGGAGTTGGTCCCAAGAGGCGC TTAACATTAGATTATGATGGGATGTTGAGATTGTATAGCCTCGATGAGTCAACAAGGCTA TGGAAAATCTCATGGATGCCTGCTGGCCTAGACAATTGCTTAGTGCATGGGTTGTGTGGT GTGAATGGTGTATGCATTTACAATCCGCAACCTACTTGCACTTGCCCTTATGGTTTCGAG ATCAATGATCCTTTGGACTGGTCCAAGGGGTGCTCTCCTTCATTTAATCTGACTTGTGAT CCGAATGAATCTGACTTTCTGGAGCTCCAGAACACTGACTACTATGGATATGACTTGGGC ATCTGGAAAAGTGGCATTTCCTTGAAGGACTGCAAGAATCGATGCCTAAATGATTGCAGA TGCAGGGGGTTTACCTATATAACAGACGGTGAAGGACTATGTTTTCCAAAAGGCATTCTC CTGAATGGTTATAGAATGCCAAGTAAAAGCTCCATTATGCATATAAGGATTCCCAAAGGA ATGATAAACTCTTCGGCAGAACTGGTGAAGTTATGGACATATGACTTGAACTGTTCTTCC GAGGAAATTGTTCTAGAAGATGAGAGCAGTAAGGGAGAAAAAACCAGTAAGAACGGTTAC ATGAAATACTTAATAGCATTTGTGGGTTCCTTTGCAGTCCTTGAAATAGTATTGATTGGT TTAGGATGGTGGTTTTTCTTCAGAAAACATGTTAATGAGGAACTGATTAATATGGGTTAC ACTGTGTTAGCTATGGGATTCAAACGTTTTACTTATGCAGAGCTGAAGCAGGCAACGAGG AACTTCAACAAAGAGATAGGAAAAGGGGGCTTTGGAACGGTCTACAGAGGGATTCTTGAT GATAAAAGAATTGTAGCTGTGAAGAGACTAGAAGGCATTTTGCAAGGAGATGCAGAATTC TGGGCAGAAGTGAGCATCATAGGGAGGATCAATCACAGGAATTTGGTGAAATTGTGGGGT TTCTATGATCGTGATGCAAGGCCTCAGATGAGCAAGGTTGTCGAGCTTCTATCCGGATAT GATGAGTCAACACCATCAAGCCCGGATCATGAGACAATCATGGTTTTATTATAG
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>LITCHI018330.m1 GenomeSequence - ATGCCTCGTCTAGTCACAGTTTTGATCCTCCTGTTCTTGTCTTTTGAGACTTCGACGAGT TCCCAGAACTTGTTGAGAAGAGAATCTTATCTGTCTGTTGAAGACAGTTCACGCGTGTTG ACTTCCCCAGACAAGACATTCACTTGTGGCTTCTACAGTCTTGATGGCGAAAATGCATAC TGGTTCTCCATCTGGTACACCAACTCCAGAGACAGGACTGTTGTCTGGATGGCCAACCGT GACAGGCCTGTCAATGGTCAGGGCTCCAGACTCTCTCTACGTGGAAATGGTGCAATGGTT TTGACTGACGTTGATGGGACTATCATTTGGATGACCAACACCACCTCTACCAAGGCTGAT AGAGCTGAGCTTTTGGACTCTGGAAACCTTATTTTGAAGGACATGCAAGGTAAGATTTTG TGGCAAAGCTTTGATTTTCCGACTGATACACTGCTTCCTAGTCAATATATTTCAAAGGGT GTCAAGCTGGTTTCTAGTCTAGGAAGTGGGAATTTTGGTTCTGGGTATTTTAGTTTCTAT TTTGATAATGATAATGTCATGAGGTTGATGTATGATGGCCCTGATACTTCAAGTGTGTAT TGGCCGAATCCTGATTTTAGTGTGTTTCAAAATGAAAGAACATCGTACAACAATAGTCGA ATTGCTGTGTTAGATGATGAGGGCAGGTTTTTATCTAGTGATAGATTGCAATTCAGTGCT ACTGACACGGGGTTTGGGATTAAAAGAAGGTTGACTATGGATTATGACGGGAATCTAAGG CTTTATAGCTTGAATAACGATAGGGGTTCATGGATGATTTCGTGGGAAGCTCTTAGGCAG CAGTGTAACGTGCATGGGATATGTGGTAGAAATGGGATTTGTGTTTATACACCAGAGCCA 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