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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001687 | Chr5 | 29590738 | 29594781 | + | Serine/threonine-protein kinase SRK2E |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001687.m1 | 23 | 279 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 243.5 | 2.60E-72 |
LITCHI001687.m1 | 24 | 275 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 117.5 | 6.50E-34 |
LITCHI001687.m2 | 23 | 265 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 224.7 | 1.40E-66 |
LITCHI001687.m2 | 24 | 266 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 111.7 | 3.80E-32 |
LITCHI001687.m3 | 23 | 202 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 178.9 | 1.30E-52 |
LITCHI001687.m3 | 24 | 198 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89.3 | 2.60E-25 |
LITCHI001687.m4 | 23 | 202 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 178.9 | 1.30E-52 |
LITCHI001687.m4 | 24 | 198 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89.3 | 2.60E-25 |
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>LITCHI001687.m1 ATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCATGGACATACCGATCATGCACGACAGC GATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGGGAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATG AGAGACAAGCAGACTGATGAGCTTGTTGCTGTTAAGTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATT GATGAAAATGTTCAAAGGGAAATTATCAACCACCGATCACTAAGGCATCCTAACATTGTC AGATTCAAAGAGGTCATCTTAACACCAACCCATCTGGCTATTGTAATGGAATATGCATCT GGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCATATGCAATGCAGGACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGG TTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGAGTCAGTTACTGCCATTCAATGCAAGTATGCCAT CGGGACTTGAAATTGGAGAATACATTATTGGATGGAAGCCCATCTCCTCGTTTGAAGATT TGTGATTTTGGTTACTCTAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCAACTGTTGGT ACTCCTGCATACATAGCCCCCGAAGTGTTACTTAAGAAAGAATATGATGGCAAGATTGCA GATGTGTGGTCTTGTGGGGTAACCTTGTATGTTATGTTGGTGGGAGCATACCCCTTTGAG GATCCTGAGGAACCAAAGAACTTCCGCAAGACAATACACCGAATTCTGAATGTTCAATAC TCCATTCCCGATTATGTTCATATATCTCCTGAGTGCTGCCATCTGATCTCAAGGATTTTC GTAGCTGACCCTGCACAGAGGATAACCATTCCCGAGATAAGAAACCACGAGTGGTTTTTA AGGAACCTTCCTGCAGATCTCGTGGTTGAGAATCCAATGGACAATCAGTTTGAAGAACCT GATCAACCCATGCAAAGCATTGATGAAATCATGCAGATTATCGCTGAAGCCACCATACCT GCGGCTGGTACTCCTAGCCTCAACCAGTACTTGACTGGTAGCCTCGACATTGATGACGAA ATGGAAGAGGACCTAGAAACCGATCCTGATCTTGACATTGACAGCAGCGGGGAGATCATA TACGCAATGTGA >LITCHI001687.m2 ATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCATGGACATACCGATCATGCACGACAGC GATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGGGAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATG AGAGACAAGCAGACTGATGAGCTTGTTGCTGTTAAGTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATT GATGAAAATGTTCAAAGGGAAATTATCAACCACCGATCACTAAGGCATCCTAACATTGTC AGATTCAAAGAGGTCATCTTAACACCAACCCATCTGGCTATTGTAATGGAATATGCATCT GGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCATATGCAATGCAGGACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGG TTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGAGTCAGTTACTGCCATTCAATGCAAGTATGCCAT CGGGACTTGAAATTGGAGAATACATTATTGGATGGAAGCCCATCTCCTCGTTTGAAGATT TGTGATTTTGGTTACTCTAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCAACTGTTGGT ACTCCTGCATACATAGCCCCCGAAGTGTTACTTAAGAAAGAATATGATGGCAAGATTGCA GATGTGTGGTCTTGTGGGGTAACCTTGTATGTTATGTTGGTGGGAGCATACCCCTTTGAG GATCCTGAGGAACCAAAGAACTTCCGCAAGACAATACACCGAATTCTGAATGTTCAATAC TCCATTCCCGATTATGTTCATATATCTCCTGAGTGCTGCCATCTGATCTCAAGGATTTTC GTAGCTGACCCTGCACAGGTTAGCATGTTCTTTCACAACCCGAGTTTCGAAGCTTGTATC AATTGTTGCTATGCCTTCCAAGGACCCCCACCTTTAGTTGTTTAG >LITCHI001687.m3 ATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCATGGACATACCGATCATGCACGACAGC GATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGGGAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATG AGAGACAAGCAGACTGATGAGCTTGTTGCTGTTAAGTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATT GATGAAAATGTTCAAAGGGAAATTATCAACCACCGATCACTAAGGCATCCTAACATTGTC AGATTCAAAGAGGTCATCTTAACACCAACCCATCTGGCTATTGTAATGGAATATGCATCT GGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCATATGCAATGCAGGACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGG TTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGAGTCAGTTACTGCCATTCAATGCAAGTATGCCAT CGGGACTTGAAATTGGAGAATACATTATTGGATGGAAGCCCATCTCCTCGTTTGAAGATT TGTGATTTTGGTTACTCTAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCAACTGTTGGT ACTCCTGCATACATAGCCCCCGAAGTGTTACTTAAGAAAGAATATGATGGCAAGGTATTA GATTTCTACTTGTTTAAATCAGCTTATGTAAACTTGTTTTGA >LITCHI001687.m4 ATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCATGGACATACCGATCATGCACGACAGC GATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGGGAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATG AGAGACAAGCAGACTGATGAGCTTGTTGCTGTTAAGTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATT GATGAAAATGTTCAAAGGGAAATTATCAACCACCGATCACTAAGGCATCCTAACATTGTC AGATTCAAAGAGGTCATCTTAACACCAACCCATCTGGCTATTGTAATGGAATATGCATCT GGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCATATGCAATGCAGGACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGG TTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGAGTCAGTTACTGCCATTCAATGCAAGTATGCCAT CGGGACTTGAAATTGGAGAATACATTATTGGATGGAAGCCCATCTCCTCGTTTGAAGATT TGTGATTTTGGTTACTCTAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCAACTGTTGGT ACTCCTGCATACATAGCCCCCGAAGTGTTACTTAAGAAAGAATATGATGGCAAGGTATTA GATTTCTACTTGTTTAAATCAGCTTATGTAAACTTGTTTTGA
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>LITCHI001687.m4 CTCATCATCACTTTTCCTGCCATCAGAGGTTTTCGGATAAAACACAAGACGCAAACTCAG ACACAACACACAGCATAACAAACACATCAAGAACAGGTAGATATCTAGAGAGGGAAACCG CGTCCGTACATTCTAGAGAGAGAAATCGAAGCTCCCCTTCACGAGCTCTCTCTCCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTGCAACCCAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCA ATCTTTTCTTTGTTGGGGGACAGGTGAGGCCGCTTTTTCACGAGCAAAACCACATCATCG GTCTCTTTCTCAACCCACAAACCATCCAACGGCTCTCCTCTCGCCACCTCACCACCACCA CCGCTTCCCGATTATGCTCTTCTGCCCACCCATCTCTCCATAATGTGAACTCTTCTCTTG ATTTCCTCTCTTTCTTCCTTTTCTTTTTCGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGGAG AAGAAGACCTCCGCCTTTTAGTTCTCTTGTGTGTTTTTTTTTTTGTTTATAATATATATA TTGATAGAACGACACACAAACAAGAATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCAT GGACATACCGATCATGCACGACAGCGATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGG GAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATGAGAGACAAGCAGACTGATGAGCTTGTTGCTGTTAA GTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATTGATGAAAATGTTCAAAGGGAAATTATCAACCACCG ATCACTAAGGCATCCTAACATTGTCAGATTCAAAGAGGTCATCTTAACACCAACCCATCT GGCTATTGTAATGGAATATGCATCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCATATGCAATGCAGG ACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGGTTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGAGTCAGTTA 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TTTTCTTTTGGAGAAGAAGACCTCCGCCTTTTAGTTCTCTTGTGTGTTTTTTTTTTTGTT TATAATATATATATTGATAGAACGACACACAAACAAGAATGGATCGATCGGCCATCACGG TGGGACCAGGCATGGACATACCGATCATGCACGACAGCGATCGCTACGAGCTGGTTCGTG ATATTGGGTCAGGGAATTTTGGGGTTGCGAGGCTGATGAGAGACAAGCAGACTGATGAGC TTGTTGCTGTTAAGTACATCGAGAGAGGTGAGAAGATTGATGAAAATGTTCAAAGGGAAA TTATCAACCACCGATCACTAAGGCATCCTAACATTGTCAGATTCAAAGAGGTCATCTTAA CACCAACCCATCTGGCTATTGTAATGGAATATGCATCTGGAGGAGAGCTCTTTGAGCGCA TATGCAATGCAGGACGGTTCAGTGAGGATGAAGCACGGTTTTTCTTCCAACAACTTATAT CAGGAGTCAGTTACTGCCATTCAATGCAAGTATGCCATCGGGACTTGAAATTGGAGAATA CATTATTGGATGGAAGCCCATCTCCTCGTTTGAAGATTTGTGATTTTGGTTACTCTAAGT CTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCAACTGTTGGTACTCCTGCATACATAGCCCCCG AAGTGTTACTTAAGAAAGAATATGATGGCAAGATTGCAGATGTGTGGTCTTGTGGGGTAA CCTTGTATGTTATGTTGGTGGGAGCATACCCCTTTGAGGATCCTGAGGAACCAAAGAACT TCCGCAAGACAATACACCGAATTCTGAATGTTCAATACTCCATTCCCGATTATGTTCATA TATCTCCTGAGTGCTGCCATCTGATCTCAAGGATTTTCGTAGCTGACCCTGCACAGAGGA TAACCATTCCCGAGATAAGAAACCACGAGTGGTTTTTAAGGAACCTTCCTGCAGATCTCG TGGTTGAGAATCCAATGGACAATCAGTTTGAAGAACCTGATCAACCCATGCAAAGCATTG ATGAAATCATGCAGATTATCGCTGAAGCCACCATACCTGCGGCTGGTACTCCTAGCCTCA ACCAGTACTTGACTGGTAGCCTCGACATTGATGACGAAATGGAAGAGGACCTAGAAACCG ATCCTGATCTTGACATTGACAGCAGCGGGGAGATCATATACGCAATGTGATAATTTTGAG GTCGATGAACTGGGGAAGTTTTGATGGTCCATATTTGCAATGAAGGTTACATTTTCTCTG TGGGAACTTGGATTACTGGGGTGTGACGAATATTAGAAAGCTTGTCAGTAAATGTCTACA TGTCAATGTCAGCTTTGAATATCTACATATCTCTTGCATGTGGTTGTTTTCATCAGAATT ATCACCTGTTCTAGTGAAGTGATACTGTTTCCTGTATTCTATGTTGTTCCACTTTCAAGT GGCATTTATGTACCCCTTAATGTACTCTTTGTTACACGACAATAATGTAATAATAATGTC GTTAGTGGTTGTATTTTAATAAGTGTGCCAGTGTTTGATCATATTGTGTGCTAGAAATTT AGGCTATGTTATTATGTTTATGGAATCAATATGTTTTGCAAAATTACAGATTGTTAAAAG CCTTAAAAATGCCG >LITCHI001687.m3 CTCATCATCACTTTTCCTGCCATCAGAGGTTTTCGGATAAAACACAAGACGCAAACTCAG ACACAACACACAGCATAACAAACACATCAAGAACAGGTAGATATCTAGAGAGGGAAACCG CGTCCGTACATTCTAGAGAGAGAAATCGAAGCTCCCCTTCACGAGCTCTCTCTCCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTGCAACCCAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCA 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CCTGTTCTAGTGAAGTGATACTGTTTCCTGTATTCTATGTTGTTCCACTTTCAAGTGGCA TTTATGTACCCCTTAATGTACTCTTTGTTACACGACAATAATGTAATAATAATGTCGTTA GTGGTTGTATTTTAATAAGTGTGCCAGTGTTTGATCATATTGTGTGCTAGAAATTTAGGC TATGTTATTATGTTTATGGAATCAATATGTTTTGCAAAATTACAGATTGTTAAAAGCCTT AAAAATGCCG >LITCHI001687.m2 CTCATCATCACTTTTCCTGCCATCAGAGGTTTTCGGATAAAACACAAGACGCAAACTCAG ACACAACACACAGCATAACAAACACATCAAGAACAGGTAGATATCTAGAGAGGGAAACCG CGTCCGTACATTCTAGAGAGAGAAATCGAAGCTCCCCTTCACGAGCTCTCTCTCCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTGCAACCCAAAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCA ATCTTTTCTTTGTTGGGGGACAGGTGAGGCCGCTTTTTCACGAGCAAAACCACATCATCG GTCTCTTTCTCAACCCACAAACCATCCAACGGCTCTCCTCTCGCCACCTCACCACCACCA CCGCTTCCCGATTATGCTCTTCTGCCCACCCATCTCTCCATAATGTGAACTCTTCTCTTG ATTTCCTCTCTTTCTTCCTTTTCTTTTTCGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGGAG AAGAAGACCTCCGCCTTTTAGTTCTCTTGTGTGTTTTTTTTTTTGTTTATAATATATATA TTGATAGAACGACACACAAACAAGAATGGATCGATCGGCCATCACGGTGGGACCAGGCAT GGACATACCGATCATGCACGACAGCGATCGCTACGAGCTGGTTCGTGATATTGGGTCAGG 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