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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001685 | Chr5 | 29568974 | 29576112 | - | Upstream activation factor subunit spp27 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001685.m1 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 61.8 | 4.60E-17 |
| LITCHI001685.m1 | 109 | 180 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 102.1 | 1.20E-29 |
| LITCHI001685.m1 | 262 | 333 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 101.4 | 1.90E-29 |
| LITCHI001685.m1 | 381 | 454 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 90 | 7.00E-26 |
| LITCHI001685.m2 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 62.3 | 3.40E-17 |
| LITCHI001685.m2 | 109 | 180 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 102.5 | 8.70E-30 |
| LITCHI001685.m2 | 247 | 318 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 101.9 | 1.40E-29 |
| LITCHI001685.m3 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 61.9 | 4.40E-17 |
| LITCHI001685.m3 | 109 | 180 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 102.1 | 1.20E-29 |
| LITCHI001685.m3 | 247 | 318 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 101.5 | 1.80E-29 |
| LITCHI001685.m3 | 366 | 439 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 90.1 | 6.70E-26 |
| LITCHI001685.m4 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 62.2 | 3.60E-17 |
| LITCHI001685.m4 | 109 | 180 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 102.4 | 9.30E-30 |
| LITCHI001685.m4 | 262 | 333 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 101.8 | 1.50E-29 |
| LITCHI001685.m5 | 2 | 55 | PF08766.14 | DEK_C | Domain | 62 | 4.20E-17 |
| LITCHI001685.m5 | 109 | 180 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 102.2 | 1.10E-29 |
| LITCHI001685.m5 | 247 | 318 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 101.6 | 1.70E-29 |
| LITCHI001685.m5 | 366 | 403 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 35.1 | 9.80E-09 |
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>LITCHI001685.m1 ATGGTGTCGGACTCGGACCTCGTGACGCGACTCCGCCAAATCCTCCGCACCTCCGACCTC CACACCGCCACTGCCGCCACCATCCGCCGCCAACTCGAGCTCGACTTCCACGTCGACTTA TCCCACCGAAAGGCCTTTGTCAGAGACCAAATCGACATTTTCCTCCAAACCCTCGACAAT GACCTAGAACCAGACAATCAAAACGACGCCGTTCAACAACAACACCAAGAAGACGAACAA GTACAAGAAGAAGAGACTGACAGCGAAATTGCAGAGTCAAAGAATGTGGATAAGGAAGTC AAGAGCGTGGGTGGCTTTAACAAATTATGTAGCCTTTCTCCAGAACTTCAAAAATTATGT GGAGTGCCTGAATTGGCTAGACCTGAGGTTGTGAAGAAAATGTGGGCTTATATTCGAGCA AATAGTTTGCAGGATCCAAAGAATAAGCGAAAAATCATATGTGACGAATCATTGCAAGCC CTTTTTCGTGTAAAATCTATTGACATGTTTAAAATGAATAAAGCTCTGACCAAGCATATT TGGCCTTTGAGTGCAGAAGATGGTACTTTCATACGATCTAATCTATTTTTCCAGCATTTG GATTATTATACCAATAAACCAGAGGAAAAAGAAGCAGATGAAGAAAACAAAGAAGTAGAA GAGGATGAAGAAGAAAACAAAGAGGAAGTAGAAGAGGAAAAGAATAAATTGCACGGACGG AAACAAAAAAGATCAACTAAGTTGGATAAACATGTCAAGAAAAGAGGAGGTGGCTTTACC AAATTGTGTAGTCTTTCTCCACAACTTCAAACATTACTCGGGGTGTCTGAATTGGCTAGA ACAGAGGTTGTAAAGAAACTTTGGATCTATATTCGGGAGAACAATTTGCAAGATCCAAAG GATAAGAGAAATATAATATGTGATGAATCCTTACATGCTCTCTTTCGTGTCAATTCTATC AACATGTTTAAAATGAATAAAGCCCTCTCAAGACACATATGGCCACTGGATGAGGAAGAT GTTCCAGCCAAATCTACAATGAAGGGGAAGCAGTCCAAGCAGGTGGGAGAAGATACCGAT GACGATGAGACAAACCAGAAAGAAAAACGGCAGAAGAAAGGATGTTCCGGTTTTCTTGCT CCCCTTGCACTTTCAGATGCTTTAGTGAAATTTTTTGGGACTGGTGAAAATGCATTGTCC CGAGCTGATGTTGTCAAGAGAATGTGGGAGTACATAAAACAGAATGATCTGCAGGATCCA TCTGATAAGAGGAGAATCATATGTGATGATAAGTTAAAAGAACTTTTTGAGGTTGACTCC TTCCTTGGCTTCTCGGTCACAAAGCTTCTAACTGCTCATTTCATCAAGATGTAA >LITCHI001685.m2 ATGGTGTCGGACTCGGACCTCGTGACGCGACTCCGCCAAATCCTCCGCACCTCCGACCTC CACACCGCCACTGCCGCCACCATCCGCCGCCAACTCGAGCTCGACTTCCACGTCGACTTA TCCCACCGAAAGGCCTTTGTCAGAGACCAAATCGACATTTTCCTCCAAACCCTCGACAAT GACCTAGAACCAGACAATCAAAACGACGCCGTTCAACAACAACACCAAGAAGACGAACAA GTACAAGAAGAAGAGACTGACAGCGAAATTGCAGAGTCAAAGAATGTGGATAAGGAAGTC AAGAGCGTGGGTGGCTTTAACAAATTATGTAGCCTTTCTCCAGAACTTCAAAAATTATGT GGAGTGCCTGAATTGGCTAGACCTGAGGTTGTGAAGAAAATGTGGGCTTATATTCGAGCA AATAGTTTGCAGGATCCAAAGAATAAGCGAAAAATCATATGTGACGAATCATTGCAAGCC CTTTTTCGTGTAAAATCTATTGACATGTTTAAAATGAATAAAGCTCTGACCAAGCATATT 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>LITCHI001685.m4 ATGGTGTCGGACTCGGACCTCGTGACGCGACTCCGCCAAATCCTCCGCACCTCCGACCTC CACACCGCCACTGCCGCCACCATCCGCCGCCAACTCGAGCTCGACTTCCACGTCGACTTA TCCCACCGAAAGGCCTTTGTCAGAGACCAAATCGACATTTTCCTCCAAACCCTCGACAAT GACCTAGAACCAGACAATCAAAACGACGCCGTTCAACAACAACACCAAGAAGACGAACAA GTACAAGAAGAAGAGACTGACAGCGAAATTGCAGAGTCAAAGAATGTGGATAAGGAAGTC AAGAGCGTGGGTGGCTTTAACAAATTATGTAGCCTTTCTCCAGAACTTCAAAAATTATGT GGAGTGCCTGAATTGGCTAGACCTGAGGTTGTGAAGAAAATGTGGGCTTATATTCGAGCA AATAGTTTGCAGGATCCAAAGAATAAGCGAAAAATCATATGTGACGAATCATTGCAAGCC CTTTTTCGTGTAAAATCTATTGACATGTTTAAAATGAATAAAGCTCTGACCAAGCATATT TGGCCTTTGAGTGCAGAAGATGGTACTTTCATACGATCTAATCTATTTTTCCAGCATTTG GATTATTATACCAATAAACCAGAGGAAAAAGAAGCAGATGAAGAAAACAAAGAAGTAGAA GAGGATGAAGAAGAAAACAAAGAGGAAGTAGAAGAGGAAAAGAATAAATTGCACGGACGG AAACAAAAAAGATCAACTAAGTTGGATAAACATGTCAAGAAAAGAGGAGGTGGCTTTACC AAATTGTGTAGTCTTTCTCCACAACTTCAAACATTACTCGGGGTGTCTGAATTGGCTAGA ACAGAGGTTGTAAAGAAACTTTGGATCTATATTCGGGAGAACAATTTGCAAGATCCAAAG GATAAGAGAAATATAATATGTGATGAATCCTTACATGCTCTCTTTCGTGTCAATTCTATC AACATGTTTAAAATGAATAAAGCCCTCTCAAGACACATATGGCCACTGGATGAGGAAGAT GTTCCAGCCAAATCTACAATGAAGGGGAAGCAGTCCAAGCAGGTGGGAGAAGGTGAGATT GGTTACTTCAAGCCTACAGGCTATCAACTTGCTGGGTCTGTTATTTTGTGTCTACACCAC ATCCTTGCACACATTTGA >LITCHI001685.m5 ATGGTGTCGGACTCGGACCTCGTGACGCGACTCCGCCAAATCCTCCGCACCTCCGACCTC CACACCGCCACTGCCGCCACCATCCGCCGCCAACTCGAGCTCGACTTCCACGTCGACTTA TCCCACCGAAAGGCCTTTGTCAGAGACCAAATCGACATTTTCCTCCAAACCCTCGACAAT GACCTAGAACCAGACAATCAAAACGACGCCGTTCAACAACAACACCAAGAAGACGAACAA GTACAAGAAGAAGAGACTGACAGCGAAATTGCAGAGTCAAAGAATGTGGATAAGGAAGTC AAGAGCGTGGGTGGCTTTAACAAATTATGTAGCCTTTCTCCAGAACTTCAAAAATTATGT GGAGTGCCTGAATTGGCTAGACCTGAGGTTGTGAAGAAAATGTGGGCTTATATTCGAGCA AATAGTTTGCAGGATCCAAAGAATAAGCGAAAAATCATATGTGACGAATCATTGCAAGCC CTTTTTCGTGTAAAATCTATTGACATGTTTAAAATGAATAAAGCTCTGACCAAGCATATT TGGCCTTTGAGTGCAGAAGATGATACCAATAAACCAGAGGAAAAAGAAGCAGATGAAGAA AACAAAGAAGTAGAAGAGGATGAAGAAGAAAACAAAGAGGAAGTAGAAGAGGAAAAGAAT AAATTGCACGGACGGAAACAAAAAAGATCAACTAAGTTGGATAAACATGTCAAGAAAAGA 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