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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001684Chr52955330529558304-Myb family transcription factor EFM

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001684.m1284335PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain29.47.20E-07
LITCHI001684.m2284332PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain25.11.70E-05
LITCHI001684.m5191242PF00249.34Myb_DNA-bindingDomain29.95.10E-07
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>LITCHI001684.m1
ATGGGTTCTGCTCCACCTGAACTGAGCTTGGATTTTAGACCAACAGCAGCGACAGCGACG
ACGGCAACGGCGACGAGTTGTGGGTTTGTGCCGAAGACGATTAGCGATTTGTTGAGGGAG
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>LITCHI001684.m2
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>LITCHI001684.m3
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>LITCHI001684.m4
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GATCACACCACTACTACTACTACCACTACTGATCCCATCTTGGATTCCAAACAAGACCCC
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TCAGGAGCCAGGGCATTTATGCCATTCAAGGCCTACACTGGCTTTGATAAGAAGGAGGAC
AAAGAGGAGTTGCCAGTCCATGGAGGGTTGTCTCTTGTTACTCCTGGAATCAAGAATCCG
AGGGATGATACAGGTTCAAGTGGCTCCAGGACTAGTTGTAGTAAATCGGTTTCGTCTTCT
GCTCCTAATATACAGTCAAGTATCAGGACAGCGCCACAGCCGCCGCAGCAACCCACTTCG
AGGAAACAGAGGAGGTGTTGGTCTCCTGAGTTGCATCGCCGGTTTGTCAATGCCTTGCAG
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>LITCHI001684.m5
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TGGAATACTGATCATCATCATGATCACACCACTACTACTACTACCACTACTGATCCCATC
TTGGATTCCAAACAAGACCCCACCATTAAAATTAAGAGAAATGAGGAGGAGAATCTATTC
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GGCTTTGATAAGAAGGAGGACAAAGAGGAGTTGCCAGTCCATGGAGGGTTGTCTCTTGTT
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AGTAAATCGGTTTCGTCTTCTGCTCCTAATATACAGTCAAGTATCAGGACAGCGCCACAG
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TACCGTCTTCATACGCGTAGATTACCACCCACTAATGCATCTGCTCCTGCAAACCAATCC
GTAGTTGTTTTGGGGAGTTTGTGGATGTCCCAAGATCAGTATGGTGACTCCTCAAAGGCA
AGCAGTTCTCAATCTGGTTCTCCTCAAGGGCCTCTACAGTTAACTGGGAACACTGGAGGG
ACCTCTACTACAGGAGGCGATAGCATGGAAGACGATGAAGATGCAAAATCTGAGGGCTAT
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>LITCHI009313.m1
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>LITCHI009313.m1
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AAAAATTCCTATCTTTCATAGTCGTTTCCTCCCTTCCCTCCCATCCTCTCTATCTTCTTA
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CCACCCCCCAAAAAAAAAAAAAATCAAATTTCCATTATGTCTCCGCCGCCTACGGTGGAC
GGAGACCGAGACAACAGCATGACTAGCGTAACAGAGTCACAGCGTTCTATTCCAACGCCG
TTCTTGACCAAAACCTATCAACTAGTCGACGATCACGCCATCGACGACGTCATCTCCTGG
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GAGAACGTGCAGTTGAGTAAGCAGTTGACGGAGATGAAGACTCTCTGCAGCAACATATTC
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TCGCAGTTGCGGTTGCAGCTAAATGGAGCGACTCAGGTGGTGGTGAAATCCGAGCCGTTG
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AGATGCTTCAACGAGTTATGATCAAACGGTCATGAAATTAATTGTAAGCTGTGAATTAGT
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TTGGTTGAACAATTAAACAATATTTATGTTTTTGTCGTGGATATTTTTAGTCCAACCGCC
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>LITCHI009313.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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GTGACTAATGTTGTTAATTAATTTATAACTACCATATTAACGTAAATTGATTTATAGTTA
TCATATTAATTTTAAATAACGTATTGAAAATAATAATTATAAATAAGGTTTAACTATCTT
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CTCCATAATTTCCCTCCTCCACGAACCTTCTAGAAGGCCGGCCCCCACCCCCCAAAAAAA
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>LITCHI009313.m1 GenomeSequence - 
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TCCCATTCCTTCTACTCTCCATAATTTCCCTCCTCCACGAACCTTCTAGAAGGCCGGCCC
CCACCCCCCAAAAAAAAAAAAAATCAAATTTCCATTATGTCTCCGCCGCCTACGGTGGAC
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CCTCAGTACTTCAAACACAATAATTTCTCCAGTTTCGTTCGTCAGCTCAACACTTATGTA
ATCTATTATTCCTTTTTTTTTTTTATTCTAATATATGTCTATTAATATTTATTTGTTTAT
TCTTGTTTGAATTGTTGACGTGTTTGTTGTGATTTTATAATAGGGATTCAAAAAGGTCGT
ACCTGATAGGTGGGAGTTTTCGAACGATTGTTTTCGCAGAGGAGAGAAACAGCTCCTGCG
TGAAATTCAGCGGCGGAAGATTTCTCCGGTGTCAACGTCGGCTTCGCCGACTGTGACGGT
GGCGGTGCCGGTGGCGAGGCCGATTGTGTCGCCGTCGAATTCGGGTGAGGAGCAAGCGAT
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TCACACGTGCGTGGAAGTGATGGAAGAGAACGAGAAGCTGAGGAGAGAGAACGTGCAGTT
GAGTAAGCAGTTGACGGAGATGAAGACTCTCTGCAGCAACATATTCACTCTTATGACGAA
CTACGCCGGCGGCGGCACCCGGCCTTCGGAGGCGATGGATTTGTTGCCGGTTGAAGTGGC
GGAGGAGGAGGTCAATCCGAGGTTGTTCGGTGTGCCGATAGGCGCGAAGCGTGCGAGGGA
AGGCGACCGTGCTGCCGCCGCGGCGACGTCGTCGGAGGCGGAGGAGTCGCAGTTGCGGTT
GCAGCTAAATGGAGCGACTCAGGTGGTGGTGAAATCCGAGCCGTTGGATTGCCAGAGAAA
TGGCGGCGACGGTCATCACAATCAAGACACGCCGTGGCTGATACAAAGCCATCGACCGAA
TCAGAGGGTGTGTAATTGATTGATTACTAGGCCTTAGATTAGATTCAGATGCTTCAACGA
GTTATGATCAAACGGTCATGAAATTAATTGTAAGCTGTGAATTAGTGGTAGCGTCCGTGC
AATAACATGCATGTGCCGGACGGTGGTGCGTTACGTGATTTATTAATCTTCCGAGACCAA
CTTAAAGGAAGGTTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTGGTTTAAATTTTACTTTTGGGTAA
CAGAAACGTCATTTGAAAAAAAAAATGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAACTTTTGTCATG
TTACGAGCAGTTGTTGGTTGATGAAAAACGCGTTGATGTTAGAAGAAATTAATTTTTGAG
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TTAGAAAGGAAAAAAAAATATTCTCAAGATTATTATGGTTTATTGGGATTAATCTTTAGT
AACGGTATTAGGATATGTATTTTTGTATATTAAAATGGTTAATCGTAGAATAAAAGAACT
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ATTTGTTTCAGTGCAAATTATCTGTCAAGACATGGAGTTGACATTTGCGGCTAGAATTCA
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AAAAAAATAAAAAAATAAGAAAAACCTCCAACAATTTTGTACGAATTTTGACTATTGTAT
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TTATCTTGTCGCAACTTCCTCTTTATTAAAAATTGGCTCTCACAACACCTTTAAAAGATA
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TGAACAAGTCAAGGTTTGCGGCTGGCATACGGGTGCCTTTCAGGGTGGGCTTCACTTGCT
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