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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001674 | Chr5 | 29446798 | 29453620 | - | CDPK-related kinase 5 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001674.m1 | 147 | 402 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116.7 | 1.10E-33 |
| LITCHI001674.m1 | 148 | 409 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 231.5 | 1.20E-68 |
| LITCHI001674.m1 | 223 | 298 | PF06293.17 | Kdo | Family | 24.9 | 1.20E-05 |
| LITCHI001674.m2 | 147 | 402 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 116.9 | 1.00E-33 |
| LITCHI001674.m2 | 148 | 409 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 231.7 | 1.10E-68 |
| LITCHI001674.m2 | 223 | 298 | PF06293.17 | Kdo | Family | 25 | 1.10E-05 |
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>LITCHI001674.m1 ATGGGAGTCTGCGCCTCCAAGCCACCCAAGCCCAACCCTTACGCTCCTCGCCACCCAAAT GACCATATTGCCCCTCTCTCTGTGCCCAACGACCCCGCCTCCGCCACCGGCGACGACTAC CCGCATTCCTCCTCCTCACCCTTCTTCCCTTTCTACACTCCCAGCCCCGCCTACCTGTGG AAGAACTCTCCTTCCACCGCCACCAGGACACCCGCTAAGACCTCCACCCCCCTCCGTATC TTCCGCCGGCCCTTCCCGCCTCCGTCTCCGGCCAAGCACATTCGGGCCGTGCTTAGACGA CGGCGGGCCAAGCAGAAGCCTGCTTCCAGGGCGGCGATCCCGGAGGCGGAGGAGATGGAG GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGGGGTGGAGCTGGATAAGAGGTTTGGGTTCTCT AAGGAGATAAAGAGTAAGTTGGAGGTGGGAGAGGAAGTTGGTCGAGGGCATTTTGGTTAT ACGTGTTTTGGTAGGTACAAGAAAGGTGAATTCAAAGGCCAACAAGTTGCTGTTAAAGTC ATCCCCAAAGCCAAGATGACAACAGCAATTGCGGTTGAGGATGTCAGAAGGGAGGTGAAA ATATTGCGAGCTTTGACCGGACACACCAATCTTGTAAAATTCTATGATGCATTTGAAGAC CATGAAAATGTCTATATTGTGATGGAGTTATGTGAAGGAGGGGAGCTTTTAGATAGAATA CTCTCCAGGGGTGGGAAATACTCTGAAGATGATGCAAAGGCAGTCTTGGTACAGATACTA AATGTTGTTGCTTTTTGTCATATCCAGGGCGTGGTGCATCGAGATCTTAAACCAGAGAAC TTTCTGTATACCTCCAAGGATGAGAACTCTCGGTTGAAAGCCATAGACTTTGGTTTATCC GACTTTGTTAGATCAGATGAAAGACTTAATGACATTGTGGGTAGTGCATACTATGTGGCC CCTGAAGTTCTACATAGATCTTATGGTTTAGAGGCTGATGTTTGGAGTATCGGCGTGATC GCATATATTCTTTTATGTGGTAGCCGTCCATTCTGGGCCCGCACCGAGTCTGGAATTTTT AGGGCAGTCTTGAAAGCTGATCCTAGTTTTGATGAGGGACCCTGGCCTTCATTATCCACA GAAGCTAAGGACTTTGTCAAACGCCTACTAAACAAGGACTCTCGAAAACGAATGACAGCT GCTCAGGCTCTAAGTCATCCTTGGATTCGAAATTATAACGGTGTAAAAGTACCTCTCGAT ATTTTAATATTCAAACTCATGAAGTCATATATGCGATCATCTTCTTTGCGTAAGGCTGCT TTAAAGGCCTTGTCTAAGACTTTAACCGTGGATGAACTCTTCTATTTGAAGGAGCAGTTT GCACTATTAGAGCCGGACAAAAACGGCAGCATAACCTTGGAGAGTATCAAGAAGGCTCTG ATGAAAAATGCAACAGATGTAATGAAGGAATCTCGCATTCCTGAATTTCTTTCCTCGTTA GATGCACTTCAATACAGAAGGATGGGTTTTGAAGAATTTTGTGCAGCTGCATTAAGTGTC CATCAGTTGGAGGCACTTGGTCGCTGGGAACAACATGCCCGTTGTGCATATGAGCTTTTT GAGAAGGATGGAAACAGGGCCATTGTCATTGAGGAACTTGCTTCAGAACTAGGGCTTGGC CCCTCCATCCCAGTTCATGCTGTTCTTCACGACTGGATAAGGCACACTGATGGGAAGCTA AGCTTTCTAGGGTTTGTCAAATTGTTGCATGGTGCATCCAGCCGGACCCTAGTAAAGCCA CATTGA >LITCHI001674.m2 ATGGGAGTCTGCGCCTCCAAGCCACCCAAGCCCAACCCTTACGCTCCTCGCCACCCAAAT GACCATATTGCCCCTCTCTCTGTGCCCAACGACCCCGCCTCCGCCACCGGCGACGACTAC CCGCATTCCTCCTCCTCACCCTTCTTCCCTTTCTACACTCCCAGCCCCGCCTACCTGTGG AAGAACTCTCCTTCCACCGCCACCAGGACACCCGCTAAGACCTCCACCCCCCTCCGTATC TTCCGCCGGCCCTTCCCGCCTCCGTCTCCGGCCAAGCACATTCGGGCCGTGCTTAGACGA CGGCGGGCCAAGCAGAAGCCTGCTTCCAGGGCGGCGATCCCGGAGGCGGAGGAGATGGAG GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGGGGTGGAGCTGGATAAGAGGTTTGGGTTCTCT AAGGAGATAAAGAGTAAGTTGGAGGTGGGAGAGGAAGTTGGTCGAGGGCATTTTGGTTAT ACGTGTTTTGGTAGGTACAAGAAAGGTGAATTCAAAGGCCAACAAGTTGCTGTTAAAGTC ATCCCCAAAGCCAAGATGACAACAGCAATTGCGGTTGAGGATGTCAGAAGGGAGGTGAAA ATATTGCGAGCTTTGACCGGACACACCAATCTTGTAAAATTCTATGATGCATTTGAAGAC CATGAAAATGTCTATATTGTGATGGAGTTATGTGAAGGAGGGGAGCTTTTAGATAGAATA CTCTCCAGGGGTGGGAAATACTCTGAAGATGATGCAAAGGCAGTCTTGGTACAGATACTA AATGTTGTTGCTTTTTGTCATATCCAGGGCGTGGTGCATCGAGATCTTAAACCAGAGAAC TTTCTGTATACCTCCAAGGATGAGAACTCTCGGTTGAAAGCCATAGACTTTGGTTTATCC GACTTTGTTAGATCAGATGAAAGACTTAATGACATTGTGGGTAGTGCATACTATGTGGCC CCTGAAGTTCTACATAGATCTTATGGTTTAGAGGCTGATGTTTGGAGTATCGGCGTGATC GCATATATTCTTTTATGTGGTAGCCGTCCATTCTGGGCCCGCACCGAGTCTGGAATTTTT AGGGCAGTCTTGAAAGCTGATCCTAGTTTTGATGAGGGACCCTGGCCTTCATTATCCACA GAAGCTAAGGACTTTGTCAAACGCCTACTAAACAAGGACTCTCGAAAACGAATGACAGCT GCTCAGGCTCTAAGTCATCCTTGGATTCGAAATTATAACGGTGTAAAAGTACCTCTCGAT ATTTTAATATTCAAACTCATGAAGTCATATATGCGATCATCTTCTTTGCGTAAGGCTGCT TTAAAGGCCTTGTCTAAGACTTTAACCGTGGATGAACTCTTCTATTTGAAGGAGCAGTTT GCACTATTAGAGCCGGACAAAAACGGCAGCATAACCTTGGAGAGTATCAAGAAGGCTCTG ATGAAAAATGCAACAGATGTAATGAAGGAATCTCGCATTCCTGAATTTCTTTCCTCGTTA GATGCACTTCAATACAGAAGGATGGGTTTTGAAGAATTTTGTGCAGCTGCATTAAGTGTC CATCAGTTGGAGGCACTTGGTCGCTGGGAACAACATGCCCGTTGTGCATATGAGCTTTTT GAGAAGGATGGAAACAGGGCCATTGTCATTGAGGAACTTGCTTCAGTAAGTTCAAACTTT TTTCGATGTTATACAATCTCTGAGACATTTTAA
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>LITCHI001674.m1 MGVCASKPPKPNPYAPRHPNDHIAPLSVPNDPASATGDDYPHSSSSPFFPFYTPSPAYLW KNSPSTATRTPAKTSTPLRIFRRPFPPPSPAKHIRAVLRRRRAKQKPASRAAIPEAEEME EEEEEEEEDGVELDKRFGFSKEIKSKLEVGEEVGRGHFGYTCFGRYKKGEFKGQQVAVKV IPKAKMTTAIAVEDVRREVKILRALTGHTNLVKFYDAFEDHENVYIVMELCEGGELLDRI LSRGGKYSEDDAKAVLVQILNVVAFCHIQGVVHRDLKPENFLYTSKDENSRLKAIDFGLS DFVRSDERLNDIVGSAYYVAPEVLHRSYGLEADVWSIGVIAYILLCGSRPFWARTESGIF RAVLKADPSFDEGPWPSLSTEAKDFVKRLLNKDSRKRMTAAQALSHPWIRNYNGVKVPLD ILIFKLMKSYMRSSSLRKAALKALSKTLTVDELFYLKEQFALLEPDKNGSITLESIKKAL MKNATDVMKESRIPEFLSSLDALQYRRMGFEEFCAAALSVHQLEALGRWEQHARCAYELF EKDGNRAIVIEELASELGLGPSIPVHAVLHDWIRHTDGKLSFLGFVKLLHGASSRTLVKP H. >LITCHI001674.m2 MGVCASKPPKPNPYAPRHPNDHIAPLSVPNDPASATGDDYPHSSSSPFFPFYTPSPAYLW KNSPSTATRTPAKTSTPLRIFRRPFPPPSPAKHIRAVLRRRRAKQKPASRAAIPEAEEME EEEEEEEEDGVELDKRFGFSKEIKSKLEVGEEVGRGHFGYTCFGRYKKGEFKGQQVAVKV IPKAKMTTAIAVEDVRREVKILRALTGHTNLVKFYDAFEDHENVYIVMELCEGGELLDRI LSRGGKYSEDDAKAVLVQILNVVAFCHIQGVVHRDLKPENFLYTSKDENSRLKAIDFGLS DFVRSDERLNDIVGSAYYVAPEVLHRSYGLEADVWSIGVIAYILLCGSRPFWARTESGIF RAVLKADPSFDEGPWPSLSTEAKDFVKRLLNKDSRKRMTAAQALSHPWIRNYNGVKVPLD ILIFKLMKSYMRSSSLRKAALKALSKTLTVDELFYLKEQFALLEPDKNGSITLESIKKAL MKNATDVMKESRIPEFLSSLDALQYRRMGFEEFCAAALSVHQLEALGRWEQHARCAYELF EKDGNRAIVIEELASVSSNFFRCYTISETF.
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>LITCHI001674.m2 TCTTAACATGCAAGTCATGACTTTTATTAAACAGAACTATTAACTCCTAAATGAATGCAA ATATCCAGACTGCATATATTATAGTTTTTTTTTTAATTTTTTTCATGGCTGCATATATTA TAGTTGTTATAGTTTCAATCTTCATGTCTCTTTATAAGTTTTTTTTTTTCTCTAGAGATG ATAACTCCTATAAAAGGAGACGTCCACGAATTATGATTTTAATAGTACAGTTGTCATAAT TTCCATCTTTCCTTCTTCTTGTGTATTTTTAATTTTCAAAAACAAAAATTAAAAAAATAA TTAAAAATGAACCCCTAATCTCATATGCATGGCACGTGGCCAGCAAGACTTGTACAGCTC AGTTTCTTCAACTCTTTCATTCTCGTCCACCACCCACAACCTCACTTCACTTCTACTTGT ACTACTTCATATCTCTCTCTCTCTCTCTCACCGTCTCTGTGACTCATTTTCACTCACTAA CCCAGTAACCAATGGGAGTCTGCGCCTCCAAGCCACCCAAGCCCAACCCTTACGCTCCTC GCCACCCAAATGACCATATTGCCCCTCTCTCTGTGCCCAACGACCCCGCCTCCGCCACCG GCGACGACTACCCGCATTCCTCCTCCTCACCCTTCTTCCCTTTCTACACTCCCAGCCCCG CCTACCTGTGGAAGAACTCTCCTTCCACCGCCACCAGGACACCCGCTAAGACCTCCACCC CCCTCCGTATCTTCCGCCGGCCCTTCCCGCCTCCGTCTCCGGCCAAGCACATTCGGGCCG TGCTTAGACGACGGCGGGCCAAGCAGAAGCCTGCTTCCAGGGCGGCGATCCCGGAGGCGG AGGAGATGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGGGGTGGAGCTGGATAAGAGGT TTGGGTTCTCTAAGGAGATAAAGAGTAAGTTGGAGGTGGGAGAGGAAGTTGGTCGAGGGC 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>LITCHI001674.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTCGAATCCCTTTTCAAAATTTATTATTAACAATAGATATTATTAATCAAATGGGATCAT CTTACAAGCATCGGAATTTCTTGTGATTTTGACATGGGTCTCAGCTCTTATTAGTGGTCT AATGTTTGGTTACACCTAATCTTACCTAATCTGTGCATTAATGTTTACTCTTTATATTTA TCCTAACTGTACCTTTATATATAAGTAAAATTTAGAATCATATATATATATATATATATA TATAAACAAAGGGTCAAGTTGCATAATCAAAGTCTCAATAATTAAATTAATTTATATATG TCAGTTTTTTAATCAATATCACTGATAACAGAGATTTGGTCATTTAATCATTGTGGCATT GCACATGCAAAGCTTCTGATCAGTCAAGACATCATTTGTGAATATCTAAGTAATTAATTA AGTCCACGTAAAATTAATATAATAATATGTGTATTTTAATTTCAGCCTTTTAATCATCAA CCTTATAATTAGGATAAACTCTTTAACTTTATTATACTTCAATTGAAATATTAATATAAA ATTTATGTGTAAGTAGTCATTTATCTGATTTTAATGTATAGAATTTTTTTTTAAAAAAAA ATGAGCAAATTTTGGAATTAGTTTTCAAAAGAAATGGAAATTAAACTAATGGTTTCAAAT ATTTTTTAAAAAAATTACGATTAATAACAATTATATAAATTACAAGTAGTCTTAACTCAT TAATTATTCATAATTTGTGAAAAGGTAATAGCTAGTTCAATTGAAAAAAAGGGTTTAATA TTTATTTAGTTTTGGTAAATGGAGTAGTAATGTGTAAGCATTCTGTGTAGGGTAATTTAT TCTAATGGATTGCTTATTGCTTGTAACTTGTAAGTTGAATAAAAAAATGGATAAAAATTT ACTAAAAGTAGATAGAAATGGAATTTTGAATTATTATGTATATCTCAACAAATATCATTT TCTACAAAAGCTTCACATTGAAACTTCTTAGCTGACGGTGTAAAACATGACCAACTTTAT ATAAAATAAATGTCTCCATCAGCAAAAACACTCCATCGCTAGTCACTTTCGCAACTTCAA ACCTCTCCATCTCTAACTCACCGGCCAACTAATTGAAAAAAAATAAAATTACAATAACTT CATTTGCTTGATTAGGTGTGCATCCTAATCTCATTGACAATAAAATTTTAAATCATATTT TAATTTATGAAAATGGATAAATTTATTTTTGATCAAAATTTTTGTTAAAAAATGTCAATC TTTATTTATCCTAAACTTAATCGTTTTTAACATATTTAAATTCAGTTAAACATTTTATAT ACGATAAATATTATGCAAACTAAAAATGAAAATAAAAAATTGAAGTTTGGTTTGAGTAAA AATATTATGATTATTATTATTATTACTTTTATCTCTTAGAATTTATTTTTGGGTCATTTT AATAATCTTCACTTATAAAAATAAGGTACCTAAATTATTCTAATAATGATTGATTTCAAA CTCTGGCTCTCTTAACATGCAAGTCATGACTTTTATTAAACAGAACTATTAACTCCTAAA TGAATGCAAATATCCAGACTGCATATATTATAGTTTTTTTTTTAATTTTTTTCATGGCTG CATATATTATAGTTGTTATAGTTTCAATCTTCATGTCTCTTTATAAGTTTTTTTTTTTCT CTAGAGATGATAACTCCTATAAAAGGAGACGTCCACGAATTATGATTTTAATAGTACAGT TGTCATAATTTCCATCTTTCCTTCTTCTTGTGTATTTTTAATTTTCAAAAACAAAAATTA AAAAAATAATTAAAAATGAACCCCTAATCTCATATGCATGGCACGTGGCCAGCAAGACTT GTACAGCTCAGTTTCTTCAACTCTTTCATTCTCGTCCACCACCCACAACCTCACTTCACT TCTACTTGTACTACTTCATATCTCTCTCTCTCTCTCTCACCGTCTCTGTGACTCATTTTC ACTCACTAACCCAGTAACCA >LITCHI001674.m2 - Up_Stream_Len 2000 CTCGAATCCCTTTTCAAAATTTATTATTAACAATAGATATTATTAATCAAATGGGATCAT CTTACAAGCATCGGAATTTCTTGTGATTTTGACATGGGTCTCAGCTCTTATTAGTGGTCT AATGTTTGGTTACACCTAATCTTACCTAATCTGTGCATTAATGTTTACTCTTTATATTTA TCCTAACTGTACCTTTATATATAAGTAAAATTTAGAATCATATATATATATATATATATA TATAAACAAAGGGTCAAGTTGCATAATCAAAGTCTCAATAATTAAATTAATTTATATATG TCAGTTTTTTAATCAATATCACTGATAACAGAGATTTGGTCATTTAATCATTGTGGCATT GCACATGCAAAGCTTCTGATCAGTCAAGACATCATTTGTGAATATCTAAGTAATTAATTA AGTCCACGTAAAATTAATATAATAATATGTGTATTTTAATTTCAGCCTTTTAATCATCAA CCTTATAATTAGGATAAACTCTTTAACTTTATTATACTTCAATTGAAATATTAATATAAA ATTTATGTGTAAGTAGTCATTTATCTGATTTTAATGTATAGAATTTTTTTTTAAAAAAAA ATGAGCAAATTTTGGAATTAGTTTTCAAAAGAAATGGAAATTAAACTAATGGTTTCAAAT ATTTTTTAAAAAAATTACGATTAATAACAATTATATAAATTACAAGTAGTCTTAACTCAT TAATTATTCATAATTTGTGAAAAGGTAATAGCTAGTTCAATTGAAAAAAAGGGTTTAATA TTTATTTAGTTTTGGTAAATGGAGTAGTAATGTGTAAGCATTCTGTGTAGGGTAATTTAT TCTAATGGATTGCTTATTGCTTGTAACTTGTAAGTTGAATAAAAAAATGGATAAAAATTT ACTAAAAGTAGATAGAAATGGAATTTTGAATTATTATGTATATCTCAACAAATATCATTT TCTACAAAAGCTTCACATTGAAACTTCTTAGCTGACGGTGTAAAACATGACCAACTTTAT ATAAAATAAATGTCTCCATCAGCAAAAACACTCCATCGCTAGTCACTTTCGCAACTTCAA ACCTCTCCATCTCTAACTCACCGGCCAACTAATTGAAAAAAAATAAAATTACAATAACTT CATTTGCTTGATTAGGTGTGCATCCTAATCTCATTGACAATAAAATTTTAAATCATATTT TAATTTATGAAAATGGATAAATTTATTTTTGATCAAAATTTTTGTTAAAAAATGTCAATC TTTATTTATCCTAAACTTAATCGTTTTTAACATATTTAAATTCAGTTAAACATTTTATAT ACGATAAATATTATGCAAACTAAAAATGAAAATAAAAAATTGAAGTTTGGTTTGAGTAAA AATATTATGATTATTATTATTATTACTTTTATCTCTTAGAATTTATTTTTGGGTCATTTT AATAATCTTCACTTATAAAAATAAGGTACCTAAATTATTCTAATAATGATTGATTTCAAA CTCTGGCTCTCTTAACATGCAAGTCATGACTTTTATTAAACAGAACTATTAACTCCTAAA TGAATGCAAATATCCAGACTGCATATATTATAGTTTTTTTTTTAATTTTTTTCATGGCTG CATATATTATAGTTGTTATAGTTTCAATCTTCATGTCTCTTTATAAGTTTTTTTTTTTCT CTAGAGATGATAACTCCTATAAAAGGAGACGTCCACGAATTATGATTTTAATAGTACAGT TGTCATAATTTCCATCTTTCCTTCTTCTTGTGTATTTTTAATTTTCAAAAACAAAAATTA AAAAAATAATTAAAAATGAACCCCTAATCTCATATGCATGGCACGTGGCCAGCAAGACTT GTACAGCTCAGTTTCTTCAACTCTTTCATTCTCGTCCACCACCCACAACCTCACTTCACT TCTACTTGTACTACTTCATATCTCTCTCTCTCTCTCTCACCGTCTCTGTGACTCATTTTC ACTCACTAACCCAGTAACCA
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>LITCHI001674.m1 GenomeSequence - TCTTAACATGCAAGTCATGACTTTTATTAAACAGAACTATTAACTCCTAAATGAATGCAA ATATCCAGACTGCATATATTATAGTTTTTTTTTTAATTTTTTTCATGGCTGCATATATTA TAGTTGTTATAGTTTCAATCTTCATGTCTCTTTATAAGTTTTTTTTTTTCTCTAGAGATG ATAACTCCTATAAAAGGAGACGTCCACGAATTATGATTTTAATAGTACAGTTGTCATAAT TTCCATCTTTCCTTCTTCTTGTGTATTTTTAATTTTCAAAAACAAAAATTAAAAAAATAA TTAAAAATGAACCCCTAATCTCATATGCATGGCACGTGGCCAGCAAGACTTGTACAGCTC AGTTTCTTCAACTCTTTCATTCTCGTCCACCACCCACAACCTCACTTCACTTCTACTTGT ACTACTTCATATCTCTCTCTCTCTCTCTCACCGTCTCTGTGACTCATTTTCACTCACTAA CCCAGTAACCAATGGGAGTCTGCGCCTCCAAGCCACCCAAGCCCAACCCTTACGCTCCTC GCCACCCAAATGACCATATTGCCCCTCTCTCTGTGCCCAACGACCCCGCCTCCGCCACCG GCGACGACTACCCGCATTCCTCCTCCTCACCCTTCTTCCCTTTCTACACTCCCAGCCCCG CCTACCTGTGGAAGAACTCTCCTTCCACCGCCACCAGGACACCCGCTAAGACCTCCACCC CCCTCCGTATCTTCCGCCGGCCCTTCCCGCCTCCGTCTCCGGCCAAGCACATTCGGGCCG TGCTTAGACGACGGCGGGCCAAGCAGAAGCCTGCTTCCAGGGCGGCGATCCCGGAGGCGG AGGAGATGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGATGGGGTGGAGCTGGATAAGAGGT 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