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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001642 | Chr5 | 29169339 | 29171872;29172538;29173942 | - | B3 domain-containing protein Os01g0234100 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001642.m1 | 19 | 108 | PF02362.24 | B3 | Family | 50.8 | 1.30E-13 |
| LITCHI001642.m2 | 82 | 171 | PF02362.24 | B3 | Family | 50.4 | 1.70E-13 |
| LITCHI001642.m3 | 82 | 171 | PF02362.24 | B3 | Family | 50.4 | 1.70E-13 |
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>LITCHI001642.m1 ATGGAGCGAGCAAAGCAAGTTCAAGAAAATCTGGCACCAGAATTCCCTAGCCTAATAAAG TATATGCTTCAGTCTCACGTTACAAGAGGGTTTTGGCTGGGCCTTCCTTGTAAATTTTGT ATTGAGCATTTGCCAAGAGAGGACACGACTTTAATCTTGGAAGATGAAAATGGGGAAGAG TACAATACAAAATATCTTGCAGAAAAGATTGGCCTAAGTGGTGGATGGAGAGGATTTTCC ATTGCTCACAAGATAAGGGAGGGGGATGTTGCAATTTTTCAGCTAGTTAGCCCAACCAAA TTTAAGGTATACATTGTGAGATCCAGTGGTCCAGATGAAGTAGATGGAGCTCTTGGCCTT CTAAAATTAGTTCCTTGCTACAAACAATTGGACTGTGATCGTTCAGTGAAGGACATCAGT ATATGCAAAGAAGAGGAGGATGATAAGTACTGGGAGCCCCTTTTGCAGGACATTCCTCAA GAACATATTCAGCCTCAGCCCGTGTCAGATCATTCAGAAAATGAAAGCAAAGATCTTGGC TCTGAAGTGCTGGATGGGATCACACTCTCTGAATCTGTCATCGACTTCAAAGACGTGAAA AGTATTGACGATTTCAGCGTTGTAGTGAATGGTTTAGTCGTAACCTCAACACTCTCCAAA CACCTTCTCACCAAGTACTATGAGCTTTGTCGTAGTCAAAACTCGTTCCTTCATGACAGG CTTCTCGAGGATCTTAACAGTAGGCTAGCTGTTGGTATGATCTCTGAGACCATCAACATT GCCGATGCCATTAGAGCTTCCAAGCTTACCACCACCTCCCAAGACAATTTTGCCATCTGG GACAAAACTTTGGAAGCGTTTAGTATGATGGGGATGAAGGTTGGCTTCTTACAAGCTCGG CTGCAACAACTTATGAACCTCACTTCCAAGTCCAAGAGCAGTCATGAAGCTAGAATTGAA AGAGCACATGCTGAGCAGGAGAGGAAAATGCTGGAAGTGAAACTTTCGGAAGTGAAGAGT ATGATAAGTAAGCTTGATTTGGAGATTGAGACATTGGAGGGGAATGCTGATAGGTTTGAA CTTGTGTTCCAGGAAATGGCAAAGGCACCCTGGTGA >LITCHI001642.m2 ATGGCTGTTGTTTCAGAGAACAGAGATGTCCCTCTTCCTCCTCCAACCAAGGCTAAGAAG AGAAAGCCAACGAATAACATGTTAACTTGCAAGAAAGAAATACGCGATGATCAAGGGGAT TTCAAATGTGAAAAACGAAAGAGAACCACATTTGAAAACCTGTATGATGATGAAGTTAAG TTAGCTGTCATGGAGCGAGCAAAGCAAGTTCAAGAAAATCTGGCACCAGAATTCCCTAGC CTAATAAAGTATATGCTTCAGTCTCACGTTACAAGAGGGTTTTGGCTGGGCCTTCCTTGT AAATTTTGTATTGAGCATTTGCCAAGAGAGGACACGACTTTAATCTTGGAAGATGAAAAT GGGGAAGAGTACAATACAAAATATCTTGCAGAAAAGATTGGCCTAAGTGGTGGATGGAGA GGATTTTCCATTGCTCACAAGATAAGGGAGGGGGATGTTGCAATTTTTCAGCTAGTTAGC CCAACCAAATTTAAGGTATACATTGTGAGATCCAGTGGTCCAGATGAAGTAGATGGAGCT CTTGGCCTTCTAAAATTAGTTCCTTGCTACAAACAATTGGACTGTGATCGTTCAGTGAAG GACATCAGTATATGCAAAGAAGAGGAGGATGATAAGTACTGGGAGCCCCTTTTGCAGGAC ATTCCTCAAGAACATATTCAGCCTCAGCCCGTGTCAGATCATTCAGAAAATGAAAGCAAA GATCTTGGCTCTGAAGTGCTGGATGGGATCACACTCTCTGAATCTGTCATCGACTTCAAA GACGTGAAAAGTATTGACGATTTCAGCGTTGTAGTGAATGGTTTAGTCGTAACCTCAACA CTCTCCAAACACCTTCTCACCAAGTACTATGAGCTTTGTCGTAGTCAAAACTCGTTCCTT CATGACAGGCTTCTCGAGGATCTTAACAGTAGGCTAGCTGTTGGTATGATCTCTGAGACC ATCAACATTGCCGATGCCATTAGAGCTTCCAAGCTTACCACCACCTCCCAAGACAATTTT GCCATCTGGGACAAAACTTTGGAAGCGTTTAGTATGATGGGGATGAAGGTTGGCTTCTTA CAAGCTCGGCTGCAACAACTTATGAACCTCACTTCCAAGTCCAAGAGCAGTCATGAAGCT AGAATTGAAAGAGCACATGCTGAGCAGGAGAGGAAAATGCTGGAAGTGAAACTTTCGGAA GTGAAGAGTATGATAAGTAAGCTTGATTTGGAGATTGAGACATTGGAGGGGAATGCTGAT AGGTTTGAACTTGTGTTCCAGGAAATGGCAAAGGCACCCTGGTGA >LITCHI001642.m3 ATGGCTGTTGTTTCAGAGAACAGAGATGTCCCTCTTCCTCCTCCAACCAAGGCTAAGAAG AGAAAGCCAACGAATAACATGTTAACTTGCAAGAAAGAAATACGCGATGATCAAGGGGAT TTCAAATGTGAAAAACGAAAGAGAACCACATTTGAAAACCTGTATGATGATGAAGTTAAG TTAGCTGTCATGGAGCGAGCAAAGCAAGTTCAAGAAAATCTGGCACCAGAATTCCCTAGC CTAATAAAGTATATGCTTCAGTCTCACGTTACAAGAGGGTTTTGGCTGGGCCTTCCTTGT AAATTTTGTATTGAGCATTTGCCAAGAGAGGACACGACTTTAATCTTGGAAGATGAAAAT GGGGAAGAGTACAATACAAAATATCTTGCAGAAAAGATTGGCCTAAGTGGTGGATGGAGA GGATTTTCCATTGCTCACAAGATAAGGGAGGGGGATGTTGCAATTTTTCAGCTAGTTAGC CCAACCAAATTTAAGGTATACATTGTGAGATCCAGTGGTCCAGATGAAGTAGATGGAGCT CTTGGCCTTCTAAAATTAGTTCCTTGCTACAAACAATTGGACTGTGATCGTTCAGTGAAG GACATCAGTATATGCAAAGAAGAGGAGGATGATAAGTACTGGGAGCCCCTTTTGCAGGAC ATTCCTCAAGAACATATTCAGCCTCAGCCCGTGTCAGATCATTCAGAAAATGAAAGCAAA GATCTTGGCTCTGAAGTGCTGGATGGGATCACACTCTCTGAATCTGTCATCGACTTCAAA GACGTGAAAAGTATTGACGATTTCAGCGTTGTAGTGAATGGTTTAGTCGTAACCTCAACA CTCTCCAAACACCTTCTCACCAAGTACTATGAGCTTTGTCGTAGTCAAAACTCGTTCCTT CATGACAGGCTTCTCGAGGATCTTAACAGTAGGCTAGCTGTTGGTATGATCTCTGAGACC ATCAACATTGCCGATGCCATTAGAGCTTCCAAGCTTACCACCACCTCCCAAGACAATTTT GCCATCTGGGACAAAACTTTGGAAGCGTTTAGTATGATGGGGATGAAGGTTGGCTTCTTA CAAGCTCGGCTGCAACAACTTATGAACCTCACTTCCAAGTCCAAGAGCAGTCATGAAGCT AGAATTGAAAGAGCACATGCTGAGCAGGAGAGGAAAATGCTGGAAGTGAAACTTTCGGAA GTGAAGAGTATGATAAGTAAGCTTGATTTGGAGATTGAGACATTGGAGGGGAATGCTGAT AGGTTTGAACTTGTGTTCCAGGAAATGGCAAAGGCACCCTGGTGA
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>LITCHI001642.m3 - Up_Stream_Len 2000 TTGTAATCTAATTTATTGAGGTCTTAAATTTTTAAAATATATATATAGGGTAATTTCAGT AGAAAATAAAATAATAGAGTTGTATTTTCAAGACAAGATTGAAACTAACTGTTTAAGGGC AAATTGTATAAACATGCTAATGTTTCATAAAATTATATAAATATGAAAATTTGAATATAA ACATTATTGAGATTTCAAAAATTTTACAGTCATATCTTTGCCGTAGATATCTTTCATCAT GATTTTCAATGGTTAAAAATAAAATTTTGCATACAATAAATGATGCAAAAAATGTATGGA TACAATAAATATTTTATTATAAGGAAGTGCATTTAATTAATAATTTTAACATGGAAACTG TGTGAGCCATTTATTTACCAATATCATTACAGTCAATTTCTCTACAACCTTTTGATGTTC TCTTTTATATCAGTGAAAAATAATAGAGATCCTCAAAACTTGGCCTATAGTCTCCCAAAA AACAAATAGCAAATCCTTTAAAGTTTAATTTCAAGTTTATTTCAAAGACTCAGAACCTGA TTTTATATTGATAAATAGGATGCCTTGAAGCGAAGGTGATAGTGTTTTGAACTTAACAAA CTTATTGGTAAGTTTTCTATTTAAAGTTGTTGCTTGTTTAATATTTTTTTTGATATTTTA GCTTAATATACTTTTTTTTTTTAATAATCTAGAAATCGTCTGAAACCACTTATCAAATTC AAGTAGTTTGATGCAATATGAATTTCAATGAAAAAAATTAGGGTTATATGTTTTTTCTAT AAAGAGTTGTCGTTTACATATATAAATAAAATTATAGTTTCTCTATTTTGGGTTTATATT GGTAACATTATCCATTTATATTTTTTAATATACTAACTTTTTCTTAAAAAAGAAAAAAAT CTTTGATTTGCTGATAACCATGAGCCTTGTTTATATGAAATAATTAGGGCTTTGCAAATA AAATTTGGGAATTTTTCATAGGGTTGTTGATGAGGGCATTTTAAATAGTTGTATAGAGTT TTAAAATTCCTATTTTCAATTACAAGTTCAAAGATTTTGAATAAAAGTTGTGTTGTTAAA TGTTGAAATTTCGTATTTTCAAAAATTAAAATTGCTATTTGTCATTTCCTAATCTTAACT TGTGTTTTTAGATATAGACGAACATTTTAAGAAATTTAATAGTTAATAGACAATCGATTT ATTTTATGACAACTAATAGAATGGTTAAACCTGTGATTTTATCTTATGACAACTAATCTA ATGATTAAACTTGTGGTTTTGTAAACAAAATTTGGAAATTGTTTAGAGCTAATAAAAAAC TCTGAAAAGAGAATATAAACAGTCAATAAATAAATTTAATAAAAAGAAAACGAAGTGAAC TCATTGCCTATTTATGTTCTCTTATCAAATAATTATGATAACTAATAAAATAATAAAACC TAGATTTGCTTTCAGCAAGTCTAAAATTCAAATCTTTATGGGCACTCATATTAGCTAAAA TCATAGTTTACTCTTTTTTAAAGATTATAGGGTTTGACGAAGACTCCAGTTTCAAACTAA TATTCATTATAAATTATTAAAAAAAAATCCTTTTTTTTCCTAATAAAAGTAGTTAATTTA TGCCTTTAAGGTACACATTTTGGAACCTCACCCAAAACTTTCATATATGTATAATTTTCC AAAATCAGGGTCTTCATGTAATTTATCCTTTTTTCTTAAAGAAAAAAAAACAGTGGGTGT GTTTTTACTATTATCTCCCTGTAAAACTGTAGGAACAAATTTGAAAAATGCATAAATAAA GCATACAGTACAGAGGTGACATTCGGCCTCTCCTTCTGGCCAAGTGACCACTAACTGCAA TCAAGGTACAAACAACTTTCAAATGATTTTTATTATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTTCATGTTCAATCCATCTTTTACAACGTTTTAAATGAAAGCCGAACACATTTT TGAAAACAGCTCCTGTAGCC >LITCHI001642.m2 - 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Up_Stream_Len 2000 AATAGTTAATAGACAATCGATTTATTTTATGACAACTAATAGAATGGTTAAACCTGTGAT TTTATCTTATGACAACTAATCTAATGATTAAACTTGTGGTTTTGTAAACAAAATTTGGAA ATTGTTTAGAGCTAATAAAAAACTCTGAAAAGAGAATATAAACAGTCAATAAATAAATTT AATAAAAAGAAAACGAAGTGAACTCATTGCCTATTTATGTTCTCTTATCAAATAATTATG ATAACTAATAAAATAATAAAACCTAGATTTGCTTTCAGCAAGTCTAAAATTCAAATCTTT ATGGGCACTCATATTAGCTAAAATCATAGTTTACTCTTTTTTAAAGATTATAGGGTTTGA CGAAGACTCCAGTTTCAAACTAATATTCATTATAAATTATTAAAAAAAAATCCTTTTTTT TCCTAATAAAAGTAGTTAATTTATGCCTTTAAGGTACACATTTTGGAACCTCACCCAAAA CTTTCATATATGTATAATTTTCCAAAATCAGGGTCTTCATGTAATTTATCCTTTTTTCTT AAAGAAAAAAAAACAGTGGGTGTGTTTTTACTATTATCTCCCTGTAAAACTGTAGGAACA AATTTGAAAAATGCATAAATAAAGCATACAGTACAGAGGTGACATTCGGCCTCTCCTTCT GGCCAAGTGACCACTAACTGCAATCAAGGTACAAACAACTTTCAAATGATTTTTATTATA TATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGTTCAATCCATCTTTTACAACGTTT TAAATGAAAGCCGAACACATTTTTGAAAACAGCTCCTGTAGCCATGGCTGTTGTTTCAGA GAACAGAGATGTCCCTCTTCCTCCTCCAACCAAGGTCTCTTCATTCTTCATTTCTTTCCT TACTTTATAGTTCATCATACATGTTATGATCTGGGTTTGGTCACTTTTCACAGGCTAAGA AGAGAAAGCCAACGAATAACATGTTAACTTGCAAGAAAGTGAGCACTACTTTGCTTCTAT ACAGTTTCAGTGTTATTCTGTCTTTTATTTTTTCTTTTTTAGTTGTTTTGATGTTTCCTG AAGCAGAACACGTAAATATGACATAAAAGTGGGCTTATAGTTTATGATTTTAAATTTGAA AATGAATAAGGAAATGGTGAAATTGTATGCTATTTTGTAATGGAATGTTTTCAGAAACAG TGGAGACAATTTTCATGTTTTCAGGGTTAGACATAAAAAATTGGAAAAGCCACCAAATAA AGATTCAAGGTATGTAAAAAGTAAAAAGATTGTTTTATTGTACTTTTCATGTCTATATAT TCCTTCCCCCCCTTTTTTTTTGATATACCATGTGTATATATTTCTGTACAAACAAGAATG CTCTCATGCAGTGATAGACAGAAACTGATATATATATATATATATATATATATATATATA TGGCATTGGCAGCAGTTATTATATATTGTAACTTGCTGCTGAAAGTAAAGGTGACGTAGT AGAGGCCAACCTGAGTTTGCAAACCAAGTCTTATACCATTCACTAGAAATGAGTTGCATC ACTTGCTACTACTACCTGGGAACAGATTTCATGAAATACTCAATTACAAGATATCTTTTT CATTTTCATTTTCCTGATAATAATAGCAAAACATTTTTTTCATGTCATGCTGTTTTGTTG TTTCTCTGGAGTAGTTTTAAGATTAATATGCAATGAGGCCAACGATTAGTTTTAAGATTC AATTTGTTTTTAGTGTCTGGCTGCTTTGAATGTTGGGATAGGATTAACAAAACTAATGGA AAATTTTTGTGAAATTTTGGACAGGAAATACGCGATGATCAAGGGGATTTCAAATGGTTA GTGAACTTTATTGAATGTATATTTAGTCACTTTTTGGTATATGTTAAATTGAATAGTCGT GTAATTATATTTGCTTTAGTGAAAAACGAAAGAGAACCACATTTGAAAACCTGTATGATG ATGAAGTTAAGTTAGCTGTC
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