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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001624 | Chr5 | 28996904 | 29001041 | + | Protein CHROMATIN REMODELING 25 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001624.m1 | 188 | 443 | PF00176.26 | SNF2-rel_dom | Domain | 168.1 | 2.30E-49 |
LITCHI001624.m1 | 211 | 364 | PF00270.32 | DEAD | Domain | 30.5 | 2.90E-07 |
LITCHI001624.m1 | 212 | 357 | PF04851.18 | ResIII | Family | 37.6 | 2.30E-09 |
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>LITCHI001624.m1 ATGGAAGAGGAAGAAGCTCTCTCAACTTCTGAGCCCACCGATTCAAGTGATGACTTCACA GTTGATCACAACGAAGACGACTATAATGACGACGATGACGACGACGAAGACGAAGACGAA TCTTCCGCGGCCGATTCTCCGCCGTCCGATGAGGACCGAAAGTCGAAGAACGTCGACGCT CTCGTGAGAGGCAGTCTTGTTGTGAAAAGACAGTCATTGCTCCCGCGAGTTCTTTCAGTG ACAGAAGGGGCGGCAGTTTGTAGGAAACCATTTAAGCCCCCGTGCTCTGTTGGGTACAAA GATGGGAACGAGCAGCTTGCTCGTCGTCTGTGGGCGCGCAAACGGTTTGTTCCCTGGGGT TCTTCGAGGCCAGCATTGGTTACAATAACAAATCGGTTAGATGTACCGAGAATTGTTGAG AACGATGTAGTTGAAGAAAATTTAACTTTGCCACCTGGGGTTGATCCTTTGGTGTTGTGG CAAGGTGAGGAATCTGAGGATGGTACTGGTAGTTCAGTGCCAATTTTGGTTGATCCATTG CTTGTTCGTTTCCTTCGACCACATCAAAGAGAAGGGGTTCAGTTCATGTTTGAATGTGTT TCGGGATTATGTAGTGCAAGTATATATGGATGCATTCTTGCTGATGATATGGGTTTGGGA AAGACGTTGCAGTCAATTGCATTACTCTATACTCTTCTACGTCAAGGGTTCGACGGGAAG CCAATGGTCAAAAAGGCCATCATTGTCACACCAACAAGTCTTGTAAGTAATTGGGAGGCT GAAATTAAGAAGTGGGTTGGAGAAAGAGTTGAGCTTATAGCTCTTTGTGAAAGCACCAGA GATGATGTTGTATCTGGAATTGACAATTTCACAAGTCCGCGCAGCCCTTTGCAGGTACTG ATTGTTTCATATGAAACATTTCGGATGCATTCTTCAAAATTTAGCCAAAGTGATTCTTGT GACCTTCTTATATGTGATGAGGCTCACAGGCTAAAAAATGATCAGACATTAACAAATCGG GCATTAGCTGCTCTCTCATGCAAACGTCGAATTTTACTATCTGGAACTCCAATGCAGAAT GACCTAGAAGAATTCTTTGCCATGGTTAACTTTACTAATCGTGGAATTTTGGGTGATGCT ACACATTTTCGTCGTTATTATGAGACGCCAATTGTATGTGGAAGAGAACCTACTGCTACT GAAGAAGAGAAGAAGCTAGGTTCTGAGCGCTCTGCAGAACTAAGTGCAAAAGTGAATCAG TTTATTTTGAGAAGGACTAATGCATTACTATCAAATCACCTGCCCCCAAAGGTATCACAC CTCGCTTGGTTCACATACCACTATATGTTGCTGTAG
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>LITCHI001624.m1 MEEEEALSTSEPTDSSDDFTVDHNEDDYNDDDDDDEDEDESSAADSPPSDEDRKSKNVDA LVRGSLVVKRQSLLPRVLSVTEGAAVCRKPFKPPCSVGYKDGNEQLARRLWARKRFVPWG SSRPALVTITNRLDVPRIVENDVVEENLTLPPGVDPLVLWQGEESEDGTGSSVPILVDPL LVRFLRPHQREGVQFMFECVSGLCSASIYGCILADDMGLGKTLQSIALLYTLLRQGFDGK PMVKKAIIVTPTSLVSNWEAEIKKWVGERVELIALCESTRDDVVSGIDNFTSPRSPLQVL IVSYETFRMHSSKFSQSDSCDLLICDEAHRLKNDQTLTNRALAALSCKRRILLSGTPMQN DLEEFFAMVNFTNRGILGDATHFRRYYETPIVCGREPTATEEEKKLGSERSAELSAKVNQ FILRRTNALLSNHLPPKVSHLAWFTYHYMLL.
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>LITCHI001624.m1 CAAAGTAACATGACCCATTATTGTTTTTCGGATTCCATGTCAGCTTGAAGCACTGACTTG GCTTCCAGCTCAAACGTAACGTGTGTCTCCAAGCATACCAGTAGCTTCCGCTTATAATTC CAGGGATATTCGAATCCACCAACGGAGCAGTTAACACCTAGCAGCCAAACAGTCTCTCAA TTCTTAATAAAACTTTGACGTATTAGTATTATTTTTCTTTCGCGCCAATTTTGTGAATTT AAAAGCGAAGCTCCTTGTCTGATACCAATTCATCGTCCATGGAAGAGGAAGAAGCTCTCT CAACTTCTGAGCCCACCGATTCAAGTGATGACTTCACAGTTGATCACAACGAAGACGACT ATAATGACGACGATGACGACGACGAAGACGAAGACGAATCTTCCGCGGCCGATTCTCCGC CGTCCGATGAGGACCGAAAGTCGAAGAACGTCGACGCTCTCGTGAGAGGCAGTCTTGTTG TGAAAAGACAGTCATTGCTCCCGCGAGTTCTTTCAGTGACAGAAGGGGCGGCAGTTTGTA GGAAACCATTTAAGCCCCCGTGCTCTGTTGGGTACAAAGATGGGAACGAGCAGCTTGCTC GTCGTCTGTGGGCGCGCAAACGGTTTGTTCCCTGGGGTTCTTCGAGGCCAGCATTGGTTA CAATAACAAATCGGTTAGATGTACCGAGAATTGTTGAGAACGATGTAGTTGAAGAAAATT TAACTTTGCCACCTGGGGTTGATCCTTTGGTGTTGTGGCAAGGTGAGGAATCTGAGGATG GTACTGGTAGTTCAGTGCCAATTTTGGTTGATCCATTGCTTGTTCGTTTCCTTCGACCAC ATCAAAGAGAAGGGGTTCAGTTCATGTTTGAATGTGTTTCGGGATTATGTAGTGCAAGTA TATATGGATGCATTCTTGCTGATGATATGGGTTTGGGAAAGACGTTGCAGTCAATTGCAT TACTCTATACTCTTCTACGTCAAGGGTTCGACGGGAAGCCAATGGTCAAAAAGGCCATCA TTGTCACACCAACAAGTCTTGTAAGTAATTGGGAGGCTGAAATTAAGAAGTGGGTTGGAG AAAGAGTTGAGCTTATAGCTCTTTGTGAAAGCACCAGAGATGATGTTGTATCTGGAATTG ACAATTTCACAAGTCCGCGCAGCCCTTTGCAGGTACTGATTGTTTCATATGAAACATTTC GGATGCATTCTTCAAAATTTAGCCAAAGTGATTCTTGTGACCTTCTTATATGTGATGAGG CTCACAGGCTAAAAAATGATCAGACATTAACAAATCGGGCATTAGCTGCTCTCTCATGCA AACGTCGAATTTTACTATCTGGAACTCCAATGCAGAATGACCTAGAAGAATTCTTTGCCA TGGTTAACTTTACTAATCGTGGAATTTTGGGTGATGCTACACATTTTCGTCGTTATTATG AGACGCCAATTGTATGTGGAAGAGAACCTACTGCTACTGAAGAAGAGAAGAAGCTAGGTT CTGAGCGCTCTGCAGAACTAAGTGCAAAAGTGAATCAGTTTATTTTGAGAAGGACTAATG CATTACTATCAAATCACCTGCCCCCAAAGGTATCACACCTCGCTTGGTTCACATACCACT ATATGTTGCTGTAG
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>LITCHI001624.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGTATTTGCATGTACCTATAATTAATCAAAACATTAGTGAGAGATCAATAAGATGAATGT TAATTTATATATGCATGATGAAATCTTTTGTTCTGTATTTACTAGTTGAACACCAGAACT GTGTTTGGTGAGTCATTGTTTTAGTAGAAGGCATGTAGGACCGGGATTACACACTTGGAA ACTTCTTGTCCAAATTTCTATTACTAGGGTCTTTAACTAATACTATGAAACTCAACTTCC AATAGCATCATCACAAACACTATTGGTATTGGTGTTAGATTATGATTTATTAAATTGACT ATTTTAATGCTAATTAGTTGGCTAGTCTATTACAAGAGAAAAAAAAAGTTTGTTTAGTTG TTTGTCATACTATTTTTTAACTAGGAATAATTTTTTTTTTTTCACTTACCTTTTCCACTA ATCTTTTTTTTTTTTTTGTTATTAGTCTACCTCATCATATCAGTTATGAGACAATTATAT GAAGATTTTTTTCTTGCTAACAATGTAATTTCAAATTTCATTGGTTGACCAACTTACCAT CAAACTGTAAGTGCTAAGAATATATAGAACATAAAGATTAAAGAAACAAAAAACGTGCTT TTTTTTTTTGAAAAAAAAAAGAGCATTTTTATAAAAGAATACTTATAATAAGACATTATA CAAAGTTTTTGTTACTTATCAAAAAATAAGGCATGATATCACATAAAGAAGAGACCAAAA TCTCTCTCTCTCTAGTTTTGTCGTGATATTTAATTTTTTCTCGTCGAAATTCCGCCATCA ATACTGCAACGATGTTGCAATAACTGAGAAGACTGGTTTCTAATTGATTCGACATCTAAT TTGACCGATGAGTAATACTAAATTTTTCAAATATTTTACTCAAATTCATATTCAAATGAT GTAGTATGTGACTTGTCAATATCCTATTAATTATCACATCATTCAAAAATTATAATATCT TTATAATTTATGTGTCACATCATTTGGACATGGATTTGGATAAAATATTTGGAAGTCTAA TATTATTTTTTAACCAATTCATGAGCAAAGATTTCTTTCTCTTTTTCTGTTTTTGGGTAT AAGAGATTCACAACGTTTATCGATTTTCCTTATGTCTGACTTCTTTGATTAGGGAAGTCT AGTCGGCGTTTGAGTGATGATGTGTCCTACTGACTCTAACTTTTTATGTTGACATGATAA GTCAGCCTTTGTGTCGACAGGGCAGACGAAATGAACATTATCATCAACGTGGCAAGATTA GTCATCATTTTTATCGATATGCCATGGTGGCCATCGTCAGTCACTAGTCCTGTTGACATG GCATGATGAGTTAGTAGTGCCATTGGCATGGCACAATTGGGTTAACAGTACTGTTGCGTG TAGCAGTGTAGCACAAACAAATAAACAATTTTAGTCGATATGATACAATGATCAATTATC TCATTCCGTGATACTTTGGTCTAGTATCTCATTAGTGTAATATCTTATGTTAGTAAATGT ATTATTGTTAACAATCAACATCCTATGATATAACAAATAACGATGTTATGTGATAAAAAG TTACCATCTTATGAAAGTAGTTATGATTAAATCTATAATGTTAAAAGATAGGTATAGAAT GAATTATGTTTTTAAATTTTAAATTTTTTAATTTTTTTAAACTTTCAATTTTTACGAACT TTTCCACAAGATAATTTGTTTGTTCCAACAATTTGATTCCAACAAAGTAACATGACCCAT TATTGTTTTTCGGATTCCATGTCAGCTTGAAGCACTGACTTGGCTTCCAGCTCAAACGTA ACGTGTGTCTCCAAGCATACCAGTAGCTTCCGCTTATAATTCCAGGGATATTCGAATCCA CCAACGGAGCAGTTAACACCTAGCAGCCAAACAGTCTCTCAATTCTTAATAAAACTTTGA CGTATTAGTATTATTTTTCTTTCGCGCCAATTTTGTGAATTTAAAAGCGAAGCTCCTTGT CTGATACCAATTCATCGTCC
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>LITCHI001624.m1 GenomeSequence + CAAAGTAACATGACCCATTATTGTTTTTCGGATTCCATGTCAGCTTGAAGCACTGACTTG GCTTCCAGCTCAAACGTAACGTGTGTCTCCAAGCATACCAGTAGCTTCCGCTTATAATTC CAGGGATATTCGAATCCACCAACGGAGCAGTTAACACCTAGCAGCCAAACAGTCTCTCAA TTCTTAATAAAACTTTGACGTATTAGTATTATTTTTCTTTCGCGCCAATTTTGTGAATTT AAAAGCGAAGCTCCTTGTCTGATACCAATTCATCGTCCATGGAAGAGGAAGAAGCTCTCT CAACTTCTGAGCCCACCGATTCAAGTGATGACTTCACAGTTGATCACAACGAAGACGACT ATAATGACGACGATGACGACGACGAAGACGAAGACGAATCTTCCGCGGCCGATTCTCCGC CGTCCGATGAGGACCGAAAGTCGAAGAACGTCGACGCTCTCGTGAGGTGAGACTTATCGC TTCCTCTATCAAACAAAGGAAATTATAATTCAGCGAACAATATAGTTTTGCTCACTAATC GCTTGCTTTTATGATTTATCTTTAACATATATGCCGATTTAGGGTTTCGATGACTTCAAA ATCGAATAGTTTGAATACTTAGGATAAATTGGTTTACAAGTTATTATTATAGGTGCACAA ATCACTAGAGTGGATGATTTTAGTTTTTCTAGGGCTTCAAAATAGTAAAAATTATTGATT GATAATTTAGGGTTTTAGATTCGTGTAATTGTGCTTTTGTTGTTCTCGTCATAGTAAAAT TTTTCGATGAGTGGCCTGTATTAGTAATATTAAGAGCATTGAAAATTGGTTTTTTATGAT TTATCAGAGGCAGTCTTGTTGTGAAAAGACAGTCATTGCTCCCGCGAGTTCTTTCAGTGA CAGAAGGGGCGGCAGTTTGTAGGAAACCATTTAAGCCCCCGTGCTCTGTTGGGTACAAAG ATGGGAACGAGCAGCTTGCTCGTCGTCTGTGGGCGCGCAAACGGTTTGTTCCCTGGGGTT CTTCGAGGCCAGCATTGGTTACAATAACAAATCGGTTAGATGTACCGAGAATTGTTGAGA ACGATGTAGTTGAAGAAAATTTAACTTTGCCACCTGGGGTTGATCCTTTGGTGTTGTGGC AAGGTGAGGAATCTGAGGATGGTACTGGTAGTTCAGTGCCAATTTTGGTTGATCCATTGC TTGTTCGTTTCCTTCGACCACATCAAAGGTATTGTTTATGATATCAAGTCTGTAATGTGG ATGTTGATGCCTGCCTCGTAGTGTTTTATATGTAGTTTATGTGATATATAATTCATGATT GGACCTGTTCAATATTTATTGAGAGTGCCAACACCAGTTTGAACGTATTTTCCTGATCTA TGCATTCTTCATTCGATATTGTTAATATCCAAAACTATTAACAAATATTGAAAGAGCATT CATATCCACAGAAGTAGAGATTTAAGGTTGATTTTTTTGTTTTTTACCAACAGAATTTGA TACTTTTAGATAAAGCAGTTCAGAGTTTAGAATATCATTTTATTTATATCATGTTTTCAT TTCCCTGTGATTTGCTTTGATTGTTATGAACATATTTTACCTTGAAATGCAGAGAAGGGG TTCAGTTCATGTTTGAATGTGTTTCGGGATTATGTAGTGCAAGTATATATGGATGCATTC TTGCTGATGATATGGGGTAAGTATCTCATTTTTTTGGTGACAACCTCTGATGTTGAGTTT GCAGATTTCTTTTTCTTTTTTCTCCAGTTATGTTGTACTGTTTTTGGTCATGTCCTTAGG ATTGTTGTTTTTGGTCATATCTTCAAGGTTGTTATTGGTCTTACATTTGCAGTTTGGGAA AGACGTTGCAGTCAATTGCATTACTCTATACTCTTCTACGTCAAGGGTTCGACGGGAAGC CAATGGTCAAAAAGGCCATCATTGTCACACCAACAAGTCTTGTAAGTAATTGGGAGGCTG AAATTAAGAAGTGGGTTGGAGAAAGAGTTGAGCTTATAGCTCTTTGTGAAAGCACCAGAG ATGATGTTGTATCTGGAATTGACAATTTCACAAGTCCGCGCAGCCCTTTGCAGGTGCATC TCTGCGGCTATTTCTGGCAGTTTTCTGGAAATTTGCACTAATTACTCATACTACAGGTAC TGATTGTTTCATATGAAACATTTCGGATGCATTCTTCAAAATTTAGCCAAAGTGATTCTT GTGACCTTCTTATATGTGATGAGGCTCACAGGCTAAAAAATGATCAGACATTAACAAATC GGGTATGACATGCAATGTAAATTTTCCTTGCTTTAATTTTTAAGGATAATCTTCTTGTTT GTTTGTCTTCTGAGCGTTTTTGTGGCTCAGGCATTAGCTGCTCTCTCATGCAAACGTCGA ATTTTACTATCTGGAACTCCAATGCAGGTGATAAGCATTTGCAATTTAGTTTTCACGTCT CTTGAAAGTAAGTTCCTTTTTGAATTTCACCTTTGTTCCTCTACATTGAACTTTGCAGAA TGACCTAGAAGAATTCTTTGCCATGGTTAACTTTACTAATCGTGGAATTTTGGGTGATGC TACACATTTTCGTCGTTATTATGAGGTGAGCCACTCCTTAAGATTAGGAATACTATCTAT TGATGGCAAATCTGAATTTATTTGATTAAATTTAATCATTTTCCTTAATTTTGGGGGAAC AGTGGACGTTGGCATTTACTTCAATTATTACCATTCTTTAAACTGTAATCCTTTATTGCC TTTGGGTTGCTAAGTGAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAATGATGCAGTTGCAATTAACTGA ATACCTATTCTTTTGATGTGAAAACTTAGATATGAACATGGCAATTGGCATATACCAATG AATATGACAGATTACATTTAAGATTTGTTGTTGCATAGCAAAAGCCAGGGCCTTTTTGCA AATCCTCAATTCTTCACTGCATCTCTATGTGTTTAATTGTTGTAAGTGATGAAATTGTGG TTATGCTTATTTCCAAGACATTGTGACTGGATACACTTGCATTTGTGAGGTGGGTGGTGG CCGACAGGTATGTAGCCTGCCACCAATACTGTCAAAATATGCTTACCTCAAGTTATTGTC CTGTTGAAGAAAAAATCTTATATGACAGTGTTGTTTACCAGTACTCATATATATATATAT ATATATTTCATCAACCTCTACTATTTTCCAGTTTTCTATTGTCTTTTTCGTCTTCTTTAT ACTGCAGTTAGGAATTTAAAATTCCCCATTCAAAATAAGTAGTATTGTCTATTGGGATAG TACAAGGGGTGTCAGACTCTGACATTCTTGTCACTGTCTTGCTAATCCGCTTAGAGAATA AGCTAAAAGGTAAACTTATTAACATATGGTCTTGATTTTTCCTTGCTTCAAAATTTTATG ATGCAAAGAAAAAATCAGCACAGATTTTTTTTTTTACTATAACAATTTTTTTATCATCTA GGTTAGTACTTATGCTTGTTAGCGGGGTTTTTAAATCCCCTTGGCTTTATTGATATTATT GTGCCACAAACCAATCAAGCAATAACATTGTGCTGAATTCTTTACGATGTGCAATTTGGG AATGTCATTTTAGATGTGATCTGTTTTTTATATTATTTTGTGCTAGTCATAAAAGTACAT TTTTGTCCTCTTTGTTATTTGTCTGTATCAGTCTATTGAGACATGTTTATTCTGTAAATG TTCTGTAACCCAATTGTGAAGACGCCAATTGTATGTGGAAGAGAACCTACTGCTACTGAA GAAGAGAAGAAGCTAGGTTCTGAGCGCTCTGCAGAACTAAGTGCAAAAGTGAATCAGGTG ATTTATTGATTTGTTTGATTATTGTATAAGCAATTAGCGTCTTTCACTACTTAATACTTT TGATTTTATGTTGTCAAGTAACATCTCCATAACAGAAAACTCCAATTTGTAGAAGCTGAT GACTTTTATCAAATAAGGAAGAACTGCTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTGTTTTCACTTTT GACTTTTAATTTATGCTTGCAGTTTATTTTGAGAAGGACTAATGCATTACTATCAAATCA CCTGCCCCCAAAGGTATCACACCTCGCTTGGTTCACATACCACTATATGTTGCTGTAG