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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001594 | Chr5 | 28755296 | 28762524 | + | Probable receptor-like protein kinase At1g49730 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001594.m1 | 26 | 165 | PF19160.3 | SPARK | Domain | 69.5 | 4.50E-19 |
LITCHI001594.m1 | 366 | 473 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 65.9 | 3.70E-18 |
LITCHI001594.m1 | 368 | 473 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 59.3 | 3.90E-16 |
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>LITCHI001594.m1 ATGGAGGAGGTGGTGGTGGGGCAGGCCCTTTTGTTGTTGGCTTTGCTTGGAATGCACCTT CCTTTCACATTAATGGCAGCTGATTGCCCCTTAGATTTGAGTGGATCAAACTTCACTCTA GTAGCTTCTCTGTGCTCTAATAAAGATGACAGAGGAAAGTGTTGCCGCTACATCAATGCT TTTGTTGCAGTTTCTATTGCTCGTTATGCCAATGCCACAAGCAATTTAGGGATTACTTCA GATGCGTCTGATGTTTGCCTCCGTTCCATATCACAAACTATGGAACTGTATGGAGTTCCA CGAAATGCCACAATTTTCTGTGGGTTTGGTACAAAAATTCCTGTCAGTTATGATTGTAGG GGTCGAACAACTGTCACGCAGATGCTGCAATCCCCAAAATTTGTGGATGTCTCAGAAAAT TGCAAAGTGCCACTTGCTGAAGAAAGTAAGTGCAGGAAGTGTGTTAATGCTGGAATCTTA TACCTCCGTAATCTGGTAGGAGCGGAAAATAACATAACCTTGAGCACCTGCCGCAGTGCA GCTTTTGCTTCACTATCAAGCCAACTTGATTATGCTTCAGCCATTGATATTGCTAGCTGC TTCTTTCATGTTCAAGGGCTTATCAGCCCTCCAGGACTTAACTCGGAAGGAGCAATCCCA AGTCTAATAGATGATGTTCCAGTTGCTGTATTGTATATTTTCACTCTTGATCTTATTGAT GATATCTTTTGTAATTTGATCATTTCAGAGCATTGCCCATCGTTGCCAGTCCCAGAGGCT GCTCCAAGTCCATTGACTGTTGCTAGCCCAAGCGAAGTTATCTTGGGCGCACATCATAAT GGAAACCACCATTCTTACCATCTGACACTAATTCCTGGCATTGGCATTGCAGTTACAGTT GTTGCTCTTATGATGTCGATAGTCCTGATAGTTCTTATTCGAAGGAAAAGCAAAGCGCTA GAGGATTCTGATAACATGGATAAGACTTCTTTGAAACCCTTGCCTCCTCCTCGGTCCATA CGAAAATTTCAAGAAGGTCCTACATCAGTGTTCCAAAATTTCAGCTACAAGCAGACTAAG AAGGCAACTGACAATTTTAACAATGTTATTGGACAAGGGGGGTTTGGTACTGTTTATAAA GCTCAATTTAGTGATGGCTCCCTTGTAGCAGTGAAGCGAATGAACATAGTTTCAGAGCAA GCTGAGCATGAATTCTGTAGAGAGATAGAGCTTCTTGCTAGATTGCATCATCGTCATCTA GTAGCTCTAAAAGGCTTCTGTGCGGAAAAACATGAGAGGTTTCTTATGTATGAATACAAT GCAAACGGAAGCTTAAAGGATCATCTTCATTGCCCTGGAAAAGCTCCTCTGAGTTGGCGT ACACGGATCCAAATTGCCATTGACGTGGCTAATGCTCTGGTTGCTGATTTTGGCCTTGCA CATGCTTCAAAAGATGGTTCCATTTGCTTTGAACCAGTAAATACTGATATCCGGGGAACT CCAGAGCTAGTGGATCCTCGTATAAAGGACTCCTTCGACCTAGATCAGCTTCAAACAGTT GTCACTATTGTGAAATGGTGCACCCAGAGAGAAGGGCAAGCTAGGCCATCGATCAAACAG GTCCTAAGACTGTTGTATGAGAGTTCAGACCCAATGCATAGTGGGTTTGTACAAGCTGTG GAAGAGGATGAGTATGAAGGAACCGATGGGAGGCCAAGGACTAGTAAAGGGAAAATGCAT AGGAGTGACCCAATGTTTTACAGCGGGGATGGAAGATATCTTGCTTCTTCATCAAGTACA TCGAGGTCATATTGTAGTCGAAGCTTTTTACTTGAAACTGGCTCACCTCAGTCTCCTCCC AATTTACTCTCTCTATGA
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>LITCHI001594.m1 + Up_Stream_Len 2000 AATGTTTAACTTATATATATATATACACAAACCACTGCCTACTGTGGTTTAGTGGTAGTG AACATTTATTCTAATTTGATAATAACCCAAAATTGAGTGAAAAATTACTTCAATATCCAT CAATCTATTTTTACTTAATCCAAAAGTGGAAAAAAAGAAGAAGCATAAATTCAAAATAAT TATATAAATAACACCTTTGATTGAGTGAAAATGGATGAATAAATGTTAAATAACATTTTT AAGTCAACATTTAAAGTGTAACCTGCCCCATATTCAGATATATTTACATACACACATATA TGCATATAAAATCATTTTGTTTTTCTCCTTTGTCACAAAACGACTGAAAAAAAAACAATA CTTCTTGACCCAAACACCCTCAGTAGTAAATAAGCCACTAAACTGGTGATTTATGTATAA ATATTTTATTTAAAATTATTGACAATTCTGTCTCACCTTATAAAACATCAAATTAAGGTA AAATTAGTTATAAATTAATTTGATCTGTTTTGGTGGCAATAAAATAGTTTTATCTTTCTT ATATATCTTACATTCAATCTTTTTTATTTCGGTATCAATTATTTATTTTCAGCTTTTAAA TGGGGTTCAGATTTCTTCAAGACACAAAAGTACACAAAAGTTAATATCCTATAATTCTGA ATAGGTATGATTGTAACTTTTATTTATTTATCCATACATATACTTTAGCCATACAACTTT AGTCTTATTCTGCCTCTAATAAAAGTATTTAACTTTCATCATTAATAACATAGACTATAT ATTAATGATTTTTTCAAGTAAAAAGATGGCAAATTATATCAAGTTTTACTACAGAAAGAA GGCATATTATATACTAATAAATAAAAACAAAAGAAAGGTTAATTACACACACTCAGTCCA CAAGTAAAACATAGGGTGGAATATGCTATGGATTTTTCTTGCAACTAATAAACATTGTTG TTTTGCCCGTTGTCTCTTATCCCACTCCATGTGCGCCACCAAATTTCTTCTCTGCATTAA TTCTTTTTCTAATTTTACACTTGACTGTTAGCTAAATTACTATGAATTTAATTTATAGAA CACATAAATGAGTTACATCCCAATTTGACAATGTCTTATTTCATTACGCATTATATGACT TATTACGTATTAATAAATTAAATAGTATATTAAAAACTAAAATATATATTAGAATGTAAA CTGAATTACTATATATTTAAAATTGAAAATAAGATGCACAGTTTCGTATTATTAAAATAG TGTTTTTCTTAGCCTGACAGAAATTTGAAGAAAATTTTTTTTTTTTTTTTGAAAGAGAAG AACAATTCTATATATAGAATTTATATATAAACAAATTTAACATATGTTCTTATTTTTTTT CAAGAAATAAAGCGAAACATTGTTAGTCAAAAACAATAATTGAACTTTCATCAAAGTTAA ATGCTAATAACTCTTTTTAGTTAAATATATATAATTTTTTCATATTTTGGTAAATTATAA ATGTGAAAAAAAATTCATTTTAAATTTTATAATCAATATTTTTCATTCCAAAGATGACAT AATGAGATCACTGAAAACACATAAAAAGTGGACCTAAAGTCCATAATGTGAGCTTGGTGG GTCCACGTCCCCACTTCACAGTCTGGTCTTCTGCTACGGATGTTGCATTAATTTATTAAA AATCACAAATTAGTTTAAGAAAGAAACATTGGCTTTCTCAACCAAAAAAAAAGCATTGGA CACCACTTTCACTTCATTGCAAGAGTCAAAACCCCACAACACACAAACACACGACTCACG ATTGTCACAAACACATACACAGGTCTTTCTGAGTCAGAGCCTGTGTTGTGTGCTTCTTGC TGTTGTTCTGTCACTAGACACAATATCACACGCGTGTTCTGCTCCTTCCAACACCAACCC CACCTCCATTTCCTTTGTCTCCTTGTCAGCTGAGCTGTTTTTCTTCCTTCATCTTTCACT AGTTTTAAAGACTCTTCACT
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>LITCHI001594.m1 GenomeSequence + GAAACATTGGCTTTCTCAACCAAAAAAAAAGCATTGGACACCACTTTCACTTCATTGCAA GAGTCAAAACCCCACAACACACAAACACACGACTCACGATTGTCACAAACACATACACAG GTCTTTCTGAGTCAGAGCCTGTGTTGTGTGCTTCTTGCTGTTGTTCTGTCACTAGACACA ATATCACACGCGTGTTCTGCTCCTTCCAACACCAACCCCACCTCCATTTCCTTTGTCTCC TTGTCAGCTGAGCTGTTTTTCTTCCTTCATCTTTCACTAGTTTTAAAGACTCTTCACTAT GGAGGAGGTGGTGGTGGGGCAGGCCCTTTTGTTGTTGGCTTTGCTTGGAATGCACCTTCC TTTCACATTAATGGCAGCTGGTTAGTTCATAGGTCATGGTCTTGTGTTTGCTATTTCTTT ATTTTAGCTTTGTTTTGATCTTGGATTCTTGCCCTTTGTTTCAAAATAGCAGCAGAAGAA GAAGCATATGCTTTTGTGTTGGTTTTGTCTCATTATTAGTAGGAGGCAAAAGTGGTGCTA TTGAAATGGGTTTGATTGCTAGTTTCATCATGCTCTTGGTTTCTGTTTTAATGTACATTC TTTGGCTCTTGGATTTTATTGGCTAGGTAGTTATCTGAGATATATTAGATGAAAAAAATG GAAAATAGTGGTTTGGCTTATTGTGTTTTAAATACCACTATATGCACATTTGGACTTAGC TTAATGTGCAATTTGTAATGATTTGTGTTAATTTGCAACTGGGATTGTGTTTTTTGTATG AACGTTATTTTTTTTCTTTTTTGGTAAATATGGCTTCTTTGATTTGGTATAGGTTTGGAT TCATGAAAATACTTCCAAACAGGGTGCAGTTAATGTGTATTTCCAAATTTACACTAACTG 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