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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001590 | Chr5 | 28710562 | 28714075 | + | Transcription factor bHLH95 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001590.m1 | 110 | 158 | PF00010.29 | HLH | Domain | 41 | 1.50E-10 |
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>LITCHI001590.m1 ATGCCTGAAGAAGGAGGAGTAGGTGGAGGAGGTCATGATGGTTTATTGATATGGGAAAAG TGTCCGTCATGGGAGGCATTGATTTCGGATAATTTAGGTGGTAGTAATGAAGAAATGGGA TTGGCAAGGAAAAAGCCGCCCATCCTGCAACTGCCTTCTAGCTCTAACAACTCTCTGGTG GCAGTGATGGAAAATACTAATCAAGTTGAAATAGAAATGGAAGTACCAAGTAGGAAGCGA GGTCGTGGAGGATGTGGCGGCAGTAGGGATGGAAAGGGAAGTGGTGGTGAGGTGAAAGAA GGAAAAGGTGGCGAATCAGAGCATGATCAGACGCATATTTTGACAGAGAGAGAGAGGAGA AAGAAAATGAAAACAATGTTTACCAAACTACATGCTAAGCTTCCTCAACTTCCCCAAAAG GCTGACAAGTCCAGCATTGTGGATGTAGCAGTAAATTACATCAGAGACCTACAGCATACT ATCCAGAAGCTAGAAAAGCAAAAGCTAGAGAGAAGCCAAGGTCTTGCAACTATTAGCGTG GGGACATCTTCAAGCACTGCTACACAGAATCTAGAATGGAACAACTCCAGGGAGGCATTT TTAGCTAGTCAAGTTTCTTCCAGTAAATCAGGCGCTGTTGAAGCGACCAATGTCAACTCA TCTACTGCTGTTTTGGCTCCACCACCTCCTGTGGTGTTTCAAACATGGTCTTCCTCTAAT GTTGTTCTAAATATTTGTGGAGATGAAGCTCAAATCAGCGTGTGCTCATTGAATAAGCCA GGGCTCTTCTCCACCATTTGCTATGTCTTGGAGAAGTATAATATTGATGTGGTGTATGCT CAAGCTTCTTCCGATTCTACTCGCAGAATGTTCATGATCCAAGCAAAAGTGAATAGAGAT TCTGATCAATCGACTGAGGCTGCTAATATTCCTGTGGAAGATATATATAAGCAAGCTGCA ACTGAGCTGATGATGTTGCTCTCATCTTGA
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>LITCHI001590.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTTCAAAATTATGCACAAAACACACACAACCAAAAATCTGTACAGGTAGATTATAATTGT TGCCCGAAAAATAACACCAATATATGGAGGTCTAATTTTCTCACCTAGAAAAACCTAATG AACTTAATTGTTTGGTTGATGAACGATCCAATCTATAATGTTAGAGAATGGCACTTGTTA AGGTTAAAAAAAGTTGTACCATGAGACGTTTGGGGTAAAGATGGAAGATCAAGCTAGTAT ACTAATACAAGGACTTTATAAGCTTATGAATAGAGAGCATATTAATTAGGAACATAAAGC ATGAAAATTAGATGAAAATAATATGAAGGTGATAGATAACATAACACCAACAGCCAAGAC TAATGAGAGAGAACCATCAGCCGAAGATATATTAGAAACTTTTCTTTTAGCTTTGTGAAG TTAGAAAATGATAAAAATTCATCGGTGATGTGTGAAATAAAGGCATTGAATCTATCACCC AAGTGGAAGAAGTTTCATTATTGGCAAGAAAAGTAAGGTGGAAATACCTTAGCTCAAGTG ATGTGTACATATTTACCCACGTAAGTTGTGAGAGATTAAACCCACCACGAGCATTTACCA TCATGTGTGGACAGGATTTAAAACTATATTACTCATAAATTAATGCTACAATATTTCTCT CTTTATACGACAATGCTTGAACTATAATTTAAAATTGAAAATATTTAAATTTTATTATTC CAAACCTTCTATATAATAATGGTTCATTTTATGGTGGTTTTTACCACAAATTCGAACTGG TAATGAGGAGAATGTTTTTGTTTATCTAACATGCATGCTCAACTCACCTAAGTAAATATC ATATGACATAAATAACCGATCATATGATAAAATCATGCTACTTAGCATCATTTTAGTGGG TTGGTGTATAAATCCAGATCTATTAAAACTTTTCTTGTGATATAGAAAATCAGCATCTTT GATCTAAAGAATGGAAATAAGGATAGAGTAATATTTTAATGATTACGCAGATGTTGAATA TCCGGATATTTTAAGCACACAAAAAACTTGTATTGTAAATACTAGCTATTTGGTCAGTGA AATTTTTTATAGTTCTATAAAAAGTTTAGAAATTTAAACTCACTCTAGATTTCAAAATTT TATATGATATATGAACTTAAATTAGTCAATTAATATCTTTCAAAAAATAGTAAATTAATG TATTTTTTTCAATTAAAAAGTTAATAGTGTAACAAATCTTTTTTAAATCCACATAAATTG ATGATTGGATATTGGAATCTAAATCTAAGTAACAAATTTAATAAAGTATATAATACCGCA CTAGATATAGTCTAGATACAATCATATTTACATCCAACTTTGCACAGGTTGTCAAAATAA ATAACTATTTTAAGAGAAGGAAACTGAAATTTTCGCTGGATTAAATAGATGTTGAAATTA CTTAACGCGCTCTTTCACGTGAAATATACAAAAGCAAACTTGCTTTACAGATACATATTA CAAAATTAATTGTACTTATTTGAGAGTCCATCATGAGCCTTTCACAAAGCGAAATATTAA AATCTCAATTTTAACCCTGACCATTCATACATATTTCAAAGAATGGCCATCGTACCGTTT CTCGCCAAATTAAGATTTTTAGTAATTTCAATAGAACTTTAGTATTTTCGTAAAATGCCA AATCGGATGATGAATCATCCCCTTGTTAGGCTAAGTTAAAACCAACAATACACATAGAAA TTTTGGTACAACGCGTCTAGCTACGACCTAGACATATATGTGTTTTAGTTGTAATGTAGA GTAACGGCATATGCTTATCATTGTATTTTGGTCTTTTCTGCTGAGCAGAATTATCTCTCT TACATTTTTGCCACCTTTTTAAACGCCTCCTTTTTAGCATTTTAATTCCTTGTGTCACCA TCCCTTTTCTTTCTCTTCTAATTCTCGTCAAATACATTTTTTCATTTGTTTGCTTGGTTG TTCGTTTAAGGTGTTCCACC
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>LITCHI001590.m1 GenomeSequence + ATGCCTGAAGAAGGAGGAGTAGGTGGAGGAGGTCATGATGGTTTATTGATATGGGAAAAG TGTCCGTCATGGGAGGCATTGATTTCGGATAATTTAGGTGGTAGTAATGAAGAAATGGGA TTGGCAAGGAAAAAGCCGCCCATCCTGCAACTGCCTTCTAGCTCTAACAACTCTCTGGTG GCAGTGATGGAAAATACTAATCAAGTTGAAATAGAAATGGAAGTACCAAGTAGGAAGCGA GGTCGTGGAGGATGTGGCGGCAGTAGGGATGGAAAGGGAAGTGGTGGTGAGGTGAAAGAA GGAAAAGGTGGCGAATCAGAGCATGATCAGACGCATATTTTGACAGAGAGAGAGAGGAGA AAGAAAATGAAAACAATGTTTACCAAACTACATGCTAAGCTTCCTCAACTTCCCCAAAAG GTATACATTTATATAAATAACCAAACATATGTTGTTTATTCAATTTATACATTTCTTCTG TTTTATCTTCTATTCGAATCTTGATAGCCTACTCAAGGATGAGTTTTCATTAGAAAAATA ACATACCATATTCGAAAAACAAAACTATATGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTAATTT TGTTTCCTTTATAGCCAGTTGTCAAGGAATTTTGGTGAGCTTTTGATAGTTTTTTTTCCC TTCATTGAAAATATTTCCTTCATTAACAATCATTGTAACAGCTAGAGGAATTACTATTAA ATAGAAGTTGGCACAATGATAATCCCTTCATACCCACATGACTAGTGACTATACTAATGA AATTATGGATTCAAATGAAAAATGTATATAATATTATAAAAATTTATGTTTCTTTCCTCC ATCTCCTCCTACTCATTTCAACCTTATTATTATTATTATGGGAAAGAGAATTGAATTTGA GTTCTCAACTTTTTGAGAGAGGTGTAGTGTCCAATTAGACTATGTTTGTAGCCACTTCAA TCTAATTATTGATTGCGATGTTTCTTCCTTTGGCTTATTTCAATCTGATTATTATTATTT GATTATTTTTTATTAGGGGAAAAAGGGGTTTGAATTTGAGATCTTAGCTTTTTCTAAGAG GTATGGTGTCCAACCAGCCTATGTCTGCAATCACTTCATTAATTGCACCTTGCTTAATTA GCTTACCATCAAAACTAAAAATCTATTTGTTGTTTTACAAAAGCCAAAAATACAAAAAAT ACTAATACAAAAATGTCAAAATTTGTTTTTAGCTACATATTTAAAAATATTTTGTTTTCA ACCCCTCATACAAATTAATTACACCATATATCCACTTTTACCCAAATTACCCCCACCTAG TTTATTCTCCACCCTCCATTGTTTATGTTATGAGATCTTTGATTTTCTTTATTGATTGTT TGAGTTTTGTTGGGATTTCTTGAAGCTTTTCTGTGATTTTTTTTTTTTTGATTTTTTTGA TTTTTTATTTTTTGTAAGTTGGATGTTAAATATTGATGTTTTTAGTTAGGTTTGGTTAAA TTTAGTTGGATTTGGCTTGAAAATGAATATTTCCGATGAGATACAATGTCAAGGACAATA ACTAGGTAGAATTGGTTTTTAAGTGAACTTCAAAATTGGTCCCATTAAAACTCAATTAGT AAACATATTTTACATTTGAGGGTGGCTTAAAAACTAATATCAGTCAGATTTTATATTTTG AGGGTAGTTTGATAAACTTGGGTATAAAATGAATATAGTTTGTTTGAGAAGCTAAAAACA AATTTTTATAAAAAAAAATGAGTAAAAACGAAAATTTTCATCTATTTTCAAGTAAAAGTG AAATTTTCCCTTTACAAAAATACCCAACATTCAGCATTTACATTACGCAATAAATATTTT CTTACCATAAAACCCTTGATTAAATTTTTTGCTTATGCAATATAGTGTACATTGAGACGT TCATACGAATGTGTAATTAACTAAATTATTTCTTCTATTGCAGCATCTTTCTTAGTTTTT GGATAAATGATCTCTTTTCTTTCATTGATTTAATTCACAACCTATTTAATCCCTTTGCTT TAATTAGTAATACCTTATTTATTTGTTGCAATTCTCGAATTAGTTTCCCTAGATGGGTAC CTATTAGCTTGCATTTCAGGTGTTGAATTTTGTTTTGGTCCAAATAACTACTAAAAATTG TTGACTAGCTCCAAAATACCAACATAACACAAATGTTTATTATAAGGAAAATGGCAAAAA AAAAAAAAAAAAGTTGTTGTCCAAAATCAGAGGCAAATATTGGGCGCTAGGTTAAACTGT TTATATTTCTCTAAAAATGATTAACTATATATCTCTTTTATATTTGGTATATATAGTTTC CAAATACATTAGTTCAGTTACATATTTATTAATTGAATTAACTTTGTGCAGGCTGACAAG TCCAGCATTGTGGATGTAGCAGTAAATTACATCAGAGACCTACAGCATACTATCCAGAAG CTAGAAAAGCAAAAGCTAGAGAGAAGCCAAGGTCTTGCAACTATTAGCGTGGGGACATCT TCAAGCACTGCTACACAGAATCTAGAATGGAACAACTCCAGGGAGGCATTTTTAGCTAGT CAAGTTTCTTCCAGTAAATCAGGCGCTGTTGAAGCGACCAATGTCAACTCATCTACTGCT GTTTTGGCTCCACCACCTCCTGTGGTGTTTCAAACATGGTCTTCCTCTAATGTTGTTCTA AATATTTGTGGAGATGAAGCTCAAATCAGCGTGTGCTCATTGAATAAGCCAGGGCTCTTC TCCACCATTTGCTATGTCTTGGAGAAGTATAATATTGATGTGGTGTATGCTCAAGCTTCT TCCGATTCTACTCGCAGAATGTTCATGATCCAAGCAAAAGTAAGATTGTTTTACTACATT TCTAAATAAATTTTGGTATTCAAGCAAACCTAATAGCACAAGTGGTTTTGCATCTTGTCA TCAACCTTATGGTGGATGTTCAAGTTTTTAAAGCACACTGTCCAAGTTTTGTTTGAGTAG GTTTTTCTTATTCATTGCGGGAGTAATTATCTTATCAGAGTAACTAAGCAAACTGTACAA ATAATTATTGATTTCAGTAGATCGGAATAAATATCTTATGCATCCTTTGTCATAATAGCT GCTAGAATAACTATTATTAATATTACGAAGTTCAAATATGATCAAACCCAGACTTCTTAA ACTAGGCTTTGTAAGTAAAACAAAATCTTGAAAGGGACAGTAAAATAAGAGTCTTCTAGT TCTAGCTAGGATTTTCAACACCAATCAATGTGGCTATCTCAGAGTTTCAAATTATTTCTT CACTTACACTGTCTATATTTTTGTAATAAAAAGTTGTCTCATAAATTCTATTTAAATTAA TTGGGTGTATTGTTCAGGTGAATAGAGATTCTGATCAATCGACTGAGGCTGCTAATATTC CTGTGGAAGATATATATAAGCAAGCTGCAACTGAGCTGATGATGTTGCTCTCATCTTGAG GATTATATAGGCCTGCAACTCAAATCCTAGCTGA