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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001540 | Chr5 | 28262250 | 28267852 | + | Receptor protein kinase-like protein At4g34220 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001540.m1 | 26 | 65 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 46.2 | 4.40E-12 |
LITCHI001540.m1 | 102 | 161 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 30.3 | 2.90E-07 |
LITCHI001540.m1 | 102 | 121 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.1 | 0.25 |
LITCHI001540.m1 | 125 | 161 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 27.7 | 2.80E-06 |
LITCHI001540.m1 | 218 | 238 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 13.9 | 0.067 |
LITCHI001540.m1 | 465 | 766 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 104.7 | 5.50E-30 |
LITCHI001540.m1 | 482 | 616 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 64.1 | 1.30E-17 |
LITCHI001540.m1 | 654 | 766 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 27.5 | 1.80E-06 |
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>LITCHI001540.m1 ATGAATGTCAGTAAAAGCAGTCTGGTTTTTTTGGTCTTCATTGTTGTTCTTGTTGTCCCT TCAGCACTGGCTCTAAACACAGATGGGGTTCTTTTGCTTTCATTCAAGTACTCAATCCTC AGTGACCCACTATCAGTCTTGGAAAGCTGGAACTATGATGATGCCACACCATGTTCATGG AATGGAGTGACCTGCACTCAAATTGGCAGCCTAGGCACAGGTGACATGTTCAGGGTCACC AGCTTGGTCCTCCCCAACAGTCAGCTTCTGGGGTCTGTCACTAAAGACCTGGGTTTCATT CAACACCTGCGCCATCTTGATCTCTCCGACAACTTCTTCAATGGGTCCCTGCCTGCTTCA ATCTTTAACGCCACTGAACTTGAGGTCCTCTTTCTCTCTAACAATGTCATCTCTGGTGAG TTGCCTGAACTAATTGGTCAAATGACAAGTCTACAGGTCTTGAATCTCTCTGACAATGCC TTGGCAGGAAAGTTACCTCAAAATCTGACTGCTTTGCACAATTTAACCGTTGTTTCTCTA AAGAGTAACTATTTTTCCGGTCAAATTCCAAGTGGATTCAGCTCAGTTGGAGTGTTAGAT CTGTCTTCAAACCTATTCAATGGGTCACTTCCAATGGATTTTGGTGGTGATAATTTGCGT TACTTGAACCTATCATACAACAAGTTTTCAGGGTTCATACCACCAGAATTTGCAAAAAGA ATCCCACAAAATGCCACCATTGATCTATCCTTCAACAACCTGACAGGAGCCATACCAGAG TCTCTGCCTCTGCTTCATCAGAGAACAGCATCATATTCTGGCAATCTTGAACTATGTGGG AAGCCATTGAAGAATCTCTGTTCAATACCATCAACTCTCTCTACACCACCAAACGTGTCG ACCATATCACCAGCCATTGCTGTGATTCCCAAAAGCATAGACTCAGTCCCTGTAGGTAAC TCACAGACATCAAACCAGCCTCAAAATCAGACCCCACAAAGTGGTCTAAAACCAGGGACA ATCGCGGCCATTGCTGTTGCAGACTTAGCAGGTATAGCCATTCTTGCACTGGCGATTCTG TACGTGTACCAACTCAGGAAAAGAAAAGCAGGACGAAACCAAGACACCATAATCGCAAAC CATGAAAAGAAACTGCCCACTGAGACCATCACCAAAACAGAACAACATTCAGGAAAACCA ACAAAGTGGTCGTGTCTGACTATAAACGGCGGCGAGGAGAGCACATCAGAGGCCACTACA ATCTCTGACAGCGACCAAGACAACAACAGCAATCCAGAAGAAAACACCAACAGCCACAGA GGAGTACTGGTGACAGTCGATAGAGAGACGGAGCTGGACCTGGACACACTGTTCAAGGCG TCGGCGTATATACTGGGGACGAGTGGTTCGAACATTGTTTACAAGGCAGTGCTAGGGGAT GGGACTGCGCTTGCAGTGAGAAGAATAGGAGAGAGTGGTGTGGGGAAAATGAAGGAGTTT GAGAGCCAAGTGAGGGCCATTGCAAGGCTCAAGCATCCCAATTTGGTAAAGCTTCGTGGG TTTTACTGGGGACACGAAGAGAAGCTTCTCATCTATGACTATGTCTCCAATGGCAGCCTC GCTACTTCTGGTTACAGGAAAGCAGGTTCGTCGCCATGCCATCTAGCATTCGAAGTGAGG TTGAAGATAGCAAGAGGAGTAGCTCGAGGACTCTCCTACATTCACGAGAAAAAGCATGTG CATGGCAATATCAAACCAACCAATATCCTTTTAAACTCAGATATGGACCCTCTTATTAGT GATTTAGGTCTTGACCGCTTTGTCTCCAACAACTCATCTCATCACAAACCAAGCACCTCC GCACGCCTATTTGGAAGCCAAAGAAACACCGTCTCCACCGCCACCCGTGACGGCCCACTA GACCTCCACCACCACCCGACCACCTCTAGCCCTTACGCGCCTACCACCTCCTCCGGCAGC TCTATGTTGCCGTATCAGGCCCCAGAGTCACTACAAAACCTGAAGCCAAATCCTAAATGG GATGTGTATTCATTTGGTGTAGTTTTGCTTGAGCTTCTAATGGGAAGGGCGTTATCGGAA CGGGAATTGAGCCACTACGCTGCTGCCACGTGTTCGAGTTCGATAGAGGAGAAGTACCGG CTTTTGCGAATGGCTGATGTGGCAATTAGGGCTGATGTGGAGAGCAGGGAGGAGGCCTTG GTGATGTGTTTCAAGTTAGGGTTTAGTTGTGCTGCTTTTGCACCCCAAAAGAGACCTACC ATGAAAGAGGCACTGCAAATGCTAGAAAAGATCCCACTAAGTTGA
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>LITCHI001540.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTACCGATTCTATATGTATTAAATTTAAGACACTAAATT ATTAATCATTTCATCATATTATACATAATCGGTTTTAATTTAAACATGAAAAATTGTGTC ACTTGATTTCCCAATTAATCACCTTTTGTCATAATCCAGATTATAGATGTCATAAAATTT TATAAACTTCAAAAGTTTACTTCAGTGGGGGATTTTGATTCTTAAATCACGTGTTTGGGA TGGAACTTATGAAGGTTGGGAGGACCGTGGCCCCCCTGAAGTTTTTTCAGAAAAAATGTA TATATAAAATATAGATTTGTATTTATAAACATATATAATTAATTAAAAATATAAAAATCT TTCATAATCTTATATATGTAAATTTATCTCCTAAAAATTTATTGGATATTATAAAAAAAA AAAGGTATTAAGTTCGTCTCTAGTTTCAATTTTCAAATTCTGCCTTTGCACGGGTCACAA TATTATTCAATGACACACATAGACATGCATAGTTTCTCAATAATTTTATTTTTTTTTCGT GAACTTAGATCAGATTTATGAGGAAGTTTAACCAACATGTACTTTGTCCCCAAGGAGATT CTTTAATTGGTAGAACTTTTATAGTGAAAGTAGGAGGCCGTCTAATTATCGATACTTCTC AAGTCTTAACCGACCTTTATCAAGTAGATTTATATAAATTTGTGTTTGTGTATTAGATTC AATAGAGTGCCCGATGTGTGCTTAAAAAAAGTTCAACAATATAGTAATTTTTTACAAAAA TTTGGTTTTAGTCCTGTCCATTTTCATTTGGAGTCACGGGGAGCATCCAGATTTCACAAG AATACAAAGACGATGATGCAACAATACAAAATTACGAAAATTAAAAGAAAATAAACAAAA TTGCAAGTTTTAACACCACAAAAGCAGTGGGGGAGTAAGAGTAGGTTGCAATTGTTGGAT TAATGAAACCATGGGTTTGAATCATCTCTCTGTGGTTCCCCTTCTAACTCTCTAATCTAT AATAATTTTTTATCATATCAATTATGATATGCTTTTATTTGGCTTAATAATATTTCCATA TGATTATATCCCATGTATTTACACTTATATAGATTATTTGGTGAGTGATTTGATTTTAAT GTAGCGGGTCTTATATCCAAGTCCCACAAAATTATGGATTTTCCCCAAAATGTTGTTGGT TGCCTCTACTTGATATGAGTTATTCTCTTTCATTTCTAAGAAGGTGTTTCTTAAGTCGCA CCACTAGAGTCATATCTTAATTAGTTTTAACTATCACTTAGACAAGCATGGAGATAAAAA AAATAATAATAATAAAACTAAAAGTCACAAAGAAGTAGTTGCACTGGAAAAATTAACCTA CGGTAAAAAAATGAAATTGTCAATAGAGAAACAGGAGGTTGGACAGGGGTTCTGATCTCA ACAAGGTGATGGGCTCCAACTCACTTGCGTGTCGTGTAGTAACAGACATTAGATTCCCGT CTGCTCACTCTTTCTAAATTTATGCACCAAAACTATGTTTTTTAACTAAAATCTAAAGTC AGCATTGGCAGAGGCAGTGAGTACAGTGGGCACCCCATTTTTTTTAGTCATTAGACTCAT TACTTATCTTGCCTTCACCTGTGTGCACCTCCATTCATTACAAGCTACAACCACTCCAAT TCTCTTTCTTCTACTGCTTCTGCTTTCTGCTCAAAAACTCTGTTTGTGTCATTCTTGCAA ACCCACCACCATAATTTCACTTGCAATTATTACCATCTCTTCGGTTTTCCTTTAAAAGTA CCATTTTCATTATATCAACAACAACCCAGTTAAAGTGTAGCTTTTGCCTTTTTCTACTTA CCTCTCTTGATCTGAAATATCTTCGTTGATTTGGTGACCAGAACAACCATAACTGCAGTA GGTCACCTTCTCTCTCTCTGACTCTTACTATGAATATGCAGTAGAGCTAAGGATTCAGAG TCAATCATCCAAAAGAAACC
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>LITCHI001540.m1 GenomeSequence + GCACTGGAAAAATTAACCTACGGTAAAAAAATGAAATTGTCAATAGAGAAACAGGAGGTT GGACAGGGGTTCTGATCTCAACAAGGTGATGGGCTCCAACTCACTTGCGTGTCGTGTAGT AACAGACATTAGATTCCCGTCTGCTCACTCTTTCTAAATTTATGCACCAAAACTATGTTT TTTAACTAAAATCTAAAGTCAGCATTGGCAGAGGCAGTGAGTACAGTGGGCACCCCATTT TTTTTAGTCATTAGACTCATTACTTATCTTGCCTTCACCTGTGTGCACCTCCATTCATTA CAAGCTACAACCACTCCAATTCTCTTTCTTCTACTGCTTCTGCTTTCTGCTCAAAAACTC TGTTTGTGTCATTCTTGCAAACCCACCACCATAATTTCACTTGCAATTATTACCATCTCT TCGGTTTTCCTTTAAAAGTACCATTTTCATTATATCAACAACAACCCAGTTAAAGTGTAG CTTTTGCCTTTTTCTACTTACCTCTCTTGATCTGAAATATCTTCGTTGATTTGGTGACCA GAACAACCATAACTGCAGTAGGTCACCTTCTCTCTCTCTGACTCTTACTATGAATATGCA GTAGAGCTAAGGATTCAGAGTCAATCATCCAAAAGAAACCATGAATGTCAGTAAAAGCAG TCTGGTTTTTTTGGTCTTCATTGTTGTTCTTGTTGTCCCTTCAGCACTGGCTCTAAACAC AGATGGGGTTCTTTTGCTTTCATTCAAGTACTCAATCCTCAGTGACCCACTATCAGTCTT GGAAAGCTGGAACTATGATGATGCCACACCATGTTCATGGAATGGAGTGACCTGCACTCA AATTGGCAGCCTAGGCACAGGTGACATGTTCAGGGTCACCAGCTTGGTCCTCCCCAACAG 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