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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001536 | Chr5 | 28235642 | 28237740 | - | Transcription factor MYB44 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001536.m1 | 5 | 51 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 58.1 | 8.10E-16 |
LITCHI001536.m1 | 8 | 65 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 55 | 7.80E-15 |
LITCHI001536.m1 | 59 | 101 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 55.5 | 5.10E-15 |
LITCHI001536.m1 | 60 | 120 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 41.5 | 1.30E-10 |
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>LITCHI001536.m1 ATGGATCGGGTCAAGGGACCATGGAGTCCGGAGGAGGACCAGTTGTTAGGGAAACTAGTG CAGCGGCATGGGGCGAGGAGCTGGTCTTTGATATCGAAGGCGATTCGAGGTCGGTCTGGG AAATCTTGCAGGCTGCGGTGGTGCAACCAGCTGTCTCCGGGGGTGGAGCACCGGGCGTTC ACGGCGGAGGAGGATGAGATCATTGTCAAAGCCCACGCCGAGTACGGCAACAAGTGGGTC ACTATAGCCCGCCTCTTGAACGGCCGTACAGACAACGCTGTCAAGAACCACTGGAACTCG ACTTTGAAGAGAAAACACGCCGGCTCCGTAGCGGAAGCGACGGCGTCTGAGGAAGACGAC GAGAGGGTTGCGTATCAAGAAAGGAAAAGGCCAAGGACGGTTTCGTATTCGGACGGTCAT TATTGTAGTCGATCCGGATCTGATGATAGTGATTCGGGTCTACCCGCGGTTCCTACTTTC AATGAATGTGGTCTGGTTGATGAAGCCGAAACACAAAATAACGGTGGTGGTCAGTTTAAT ATTTCAACCGAACTCACTTTGGGTCTACCGGGACCCAACTCGAACGGGTTTAAAAACCAA CAGTCGGGTTCGGAGAAACAAAGGAGTGAGTGCTGTAAAACGACGACGTTTGGGCTGGAG TTGTTGGCTGTGATGCAAGAAATGATAAAAAAAGAAGTGAAGAATTATATGGAGGCAGCG CGGAACGCTGGGATTAAACGTATAGGGATTAGCCAGCTTGATTGA
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>LITCHI001536.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCAATGCACCAATTGATTGAAAAGAAACACACCATCGTGAAGTTGGTTCCTCCAAATTTG TCTCCATGTAAACTAATAAGTTTGGTGATTACTAATCCATTTCTTTTGTCTTATGATTTT ATCTCCGTGCATACAAACTTTATACGTGTTTTTACAGTCATCTAAATTTTAGTAAAAGAT TTTGATAAATTAATTAAAATCTTAACTTATGACGTGATAATTGAATTCCGCTTATATATA GTAGGCGATTTATGATATTATTGATGTATATTCACATATAATGAAATCTATTTCCTTTCA AATCAAATAATAAATATTCCTATTCATATCTTAAATATATTTTAAAAATAAAAAATAGAA TTTTAAAACCATCAACTATGTTTGTAATTAGATTGTTGGTTTGGAAAACTCATTTTTCCA AAGATTTTATTACTCTTATTATCAACTTATTTAGTTTTATTATTATTATTATTATTTTGA AATAATCAAGTTTGTTTGTAAGTAGGTAGTAGTTTATTTAGTAGTTATTACAAGGGAAGG CATATATTGTAACCCAACTGAATTAATAATTCTTGCTTTAGTTTTTTGTTTTTGTGTTTT TGTTTTTTAAGTCTATATCGAATTAGGGATTGAGATTAATCACTAAAATTGTGGACTTTA ACCTCCATTACTAAGGTACATAAATAGATAAAAAAAATAATTTGTATTTCCCTTCTCAAG TAATCATGTCACACTACAAGTAAATGTGAATGTGACAAATAACAAAGATTTTTGACTTAA TTCAAAGCATTTTATTTTTTGGTTGCAATATTCCAGCTTATGCTCTGAGATATTCCATAA AGTGTTACTAGTTTCGGTGTATCTGTAGAATTGATTACGATGCCATATAGAATCAAATTC TATTTTCAATTTTCCACATGTTAATATTGTATAATTTATCACTTTCAAATGATTACTATT CAAAGATAAAACATCCTTTAAACTCAACTAATATAGAAGTAGATATCTCCCTAATTTATA TAATACTTAAATTTTGACATATCTTTTGAGCTGAAAACTGCAATATAGTCTATTTATTTT CATAAAAGAAAAAGAAACTTATATTAATATTATTTTTTACACATAAATCAATTCCATAAA CAATCACATACAATCCATTTTGAGTTAATTAGTTTTGTCCTGATTAAATTGAAATATTCA ATTAAGCAAGTTTGAATAAATTTTTTTTAATACCAGAAGTATTAAAACGATTCAAATTTG AAATATTATTAAATTAAATAAAAACATTATAGAACCTATTACTAAACAACTTAGATTATC ACATTTTAAATAATTTAATCAATAATAATTTTTAATAATAATAATGAATTATATCCAAAA TATAAATCAAGAAGACGTAGATTATACTAAAAGTAAGTTGCATTTTCTTTTTCACCTTTT TTTTTTTCAGAAGCAGGTCACGATAATTCCTAATTTCTGAGTTTATCAAAATAATGTCAG CTTGGAGACGCAACAATCAACATCACATAGTTCAAATAACAGTAGAACACGTCTGCTCCT TCCACTTAACAACCCACTTTACAAATAGACAAATCCAACTCCAACGTACCAACTGCCAAC CTAAACCGGAAGAAACCCACATGTGGTAGTAACCGACTAACCGTTAACTTCTTCTTATTT TTTATTTTTTATTTTTATTTTTGAACTCGTTAACTTCTCTAGTTTAAATTTTAAAATTAA AAGAAATAAAATATGGAAAGTGAACCTACAAGGAAACTCAACTGAACCGTTAAACTTAAC GGCTTTTGTTTTGAATAACTGGTCGTTTATTCGGTTGACAACTGTGAAGATATTAACGGA ATTAAGACCCCCCCGCTATATAATATAAACCCTCACCACCTTCTCTTCTCGTCTCACATT CACATTCGCTCTTTAATTCTTCTTTTTCTTGCTTTTTTCATTTTTTAAGTTACGAATTCG TTAGTTGTTTTGTTATCGTA
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>LITCHI001536.m1 GenomeSequence - TGCCAACCTAAACCGGAAGAAACCCACATGTGGTAGTAACCGACTAACCGTTAACTTCTT CTTATTTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTGAACTCGTTAACTTCTCTAGTTTAAATTTTA AAATTAAAAGAAATAAAATATGGAAAGTGAACCTACAAGGAAACTCAACTGAACCGTTAA ACTTAACGGCTTTTGTTTTGAATAACTGGTCGTTTATTCGGTTGACAACTGTGAAGATAT TAACGGAATTAAGACCCCCCCGCTATATAATATAAACCCTCACCACCTTCTCTTCTCGTC TCACATTCACATTCGCTCTTTAATTCTTCTTTTTCTTGCTTTTTTCATTTTTTAAGTTAC GAATTCGTTAGTTGTTTTGTTATCGTAATGGATCGGGTCAAGGGACCATGGAGTCCGGAG GAGGACCAGTTGTTAGGGAAACTAGTGCAGCGGCATGGGGCGAGGAGCTGGTCTTTGATA TCGAAGGCGATTCGAGGTCGGTCTGGGAAATCTTGCAGGCTGCGGTGGTGCAACCAGCTG TCTCCGGGGGTGGAGCACCGGGCGTTCACGGCGGAGGAGGATGAGATCATTGTCAAAGCC CACGCCGAGTACGGCAACAAGTGGGTCACTATAGCCCGCCTCTTGAACGGCCGTACAGAC AACGCTGTCAAGAACCACTGGAACTCGACTTTGAAGAGAAAACACGCCGGCTCCGTAGCG GAAGCGACGGCGTCTGAGGAAGACGACGAGAGGGTTGCGTATCAAGAAAGGAAAAGGCCA AGGACGGTTTCGTATTCGGACGGTCATTATTGTAGTCGATCCGGATCTGATGATAGTGAT TCGGGTCTACCCGCGGTTCCTACTTTCAATGAATGTGGTCTGGTTGATGAAGCCGAAACA CAAAATAACGGTGGTGGTCAGTTTAATATTTCAACCGAACTCACTTTGGGTCTACCGGGA CCCAACTCGAACGGGTTTAAAAACCAACAGTCGGGTTCGGAGAAACAAAGGAGTGAGTGC TGTAAAACGACGACGTTTGGGCTGGAGTTGTTGGCTGTGATGCAAGAAATGATAAAAAAA GAAGTGAAGAATTATATGGAGGCAGCGCGGAACGCTGGGATTAAACGTATAGGGATTAGC CAGCTTGATTGATTTAATTGATAGGTTAAGTAAAAGATTAAATCGTAATCAAAATTTTAA TTCAAATTAGAGGGACATTAAGGAAACAAAGTCAATTAGAGAAAAATGATCTTGTTTGTC CTTTTTATTTTTCTTGGATAATTTCGAGGCTTGTACAGAAATGGAAAGAACAAGTGAGGT TTATTAAATTTAAGCAAATGTTTTAATTTTTCAGCACGCTGTTTAAGCAATTACTGGTTT TATGTCTTGCACTGTCTGGTGCATATGATGAAATTTAATTATTTATACGAGATTGGATTA AATTAGATGAATTTTATAAAATTAATTTAAATGTTATCCTATGTTTGATGAAAATTAAGG TATGATAGAATTTAAATAAAAATTTTCAAGGATGTAAATGAAAATTTTCAGATATTTCAA AAGACGTAAATTTGTTCCATTTCCCCCACTGCCTTACAGCTTCTTCTTGAGTAGAATGCT TACCTTTACCACCACCCTCCTCCCTCTCTTATCACCATTCACTTCCTTTCCTTCCTCGCC CATAAGAGGTTGTCGCCACAAATGCCATCTCCGTATTAAACCCCCTCTCTCATTTCCCTT TAAACCCATTTAAAACCCACTCTCAAAAACTCCTTGAAACCATCGTTGTCGTTTCTAGCA AGTGCCTCAACCTTCACAACCACATCCTTACCTTTGTCTGTCGCAACAACCTCTTAGAAG CTGTCTTTTACACCCATTGCTTTGTCTACTCCATATGTCGCCTTATGATCTTCACAATGT CACCCTTCCTTGTCGGTCCAAGTACTTTGATGGCCAATAGAGACCAAAGCTGAGAAAGGA GATGAGAGAAGAGAGTGGTCTGGATGAGAAATAAAAGGTCGATGAAGAGATATGAGAGTT CACTTGTGTGTTGAGTAAGTTTGATTTCTCCCAGCCTAGCGGGATAAAATAGTGGTAGG